The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
29
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sequence length |
136
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structure length |
125
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Chain Sequence |
MIAGPEALLDRPSVNNSQLVVSVAGTVEGTNQDISLKFFEIDLTSRAMPHKLEKADLLKAIQEQLIANVHSNDDYFEVIDFASDATITDRNGKVYFADKDGSVTLPTQPVQEFLLSGHVRVRPYK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Effects of deletion of streptokinase residues 48-59 on plasminogen activation.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Plasminogen
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| molecule tags |
Hydrolase/blood clotting
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| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
29
|
| structure length |
125
|
| sequence length |
136
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-03-06 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1C4P A; 1BML C; 1L4D B; 1QQR A; 1L4Z B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1XCT L; 4WWP A; 3NY5 A; 3Q3M C; 2IZV B; 5LNK 1; 3KUD B; 3NUH B; 1BXT A; 2CR5 A; 5E6O A; 2L7R A; 3B2G A; 3ENE A; 1YMH E; 4IC7 B; 2GRI A; 3BVZ A; 2LEK A; 3NVZ A; 4HPP A; 2GBK A; 2QDF A; 3KUZ A; 4MGK E; 1L5P A; 2QC8 A; 1P7E A; 3EC8 A; 3AH7 A; 3R8B A; 3GB1 A; 3JW0 X; 4KKJ A; 4RFB A; 4A3P A; 3KVF B; 3ZTD A; 4ICU A; 4KDL B; 4ICV A; 2WU5 B; 1IUE A; 1B1Z A; 4KGR A; 1OGW A; 5BYR A; 4KZ0 A; 3V3X A; 4CQN A; 4FJZ A; 2EKI A; 2LGX A; 3N9Y C; 2KNB A; 3DBH I; 1WJ4 A; 1SE4 A; 2KD0 A; 1P0R A; 2FE8 A; 2K22 A; 2M19 A; 4ZDV A; 2WU2 B; 4F7Z A; 1L4Z B; 2PMV A; 2QMT A; 3GS2 A; 4ZRK A; 5DCN A; 5CHV C; 4ZOH C; 2BQQ A; 3RI7 C; 2FIF A; 5KHQ A; 3W9C B; 1N6Z A; 4RM9 A; 2FCM A; 2ACZ B; 3N32 A; 5IKC M; 2HJ1 A; 2AQ2 B; 2FID A; 2LXA A; 4IOI E; 4ARI A; 2D3A A; 2ZVN A; 4HJG E; 3MTN B; 1IP9 A; 3AE5 B; 2JF5 A; 3IAS 1; 2O6V B; 1M4V A; 4NZL B; 1TIF A; 2KDB A; 3UI3 A; 2IPK D; 4EZL A; 2N9K A; 2WXO A; 2V4I B; 3KYD D; 5G2N A; 2J52 A; 4ACF A; 1ZGU B; 4A8X C; 2HTM E; 3HRD D; 1JQ4 A; 4GB9 A; 3EA6 A; 2GOW A; 4MJS A; 2J0M A; 1V1O A; 3RNB C; 3MJ5 A; 3TBL D; 5AZF A; 1J8C A; 1GPX A; 4KKI A; 2O2V B; 1OEY A; 5BMI A; 5C2T B; 3AEG B; 3K9P B; 1XXG A; 3ZQ4 A; 2LFI A; 3DWM A; 3W1Y A; 3U4E G; 5AZH A; 1JWM D; 1KFY B; 2KX3 A; 3FKY A; 3AMZ A; 1MHH E; 2QSD A; 2ZEQ A; 3WAP A; 4ARC A; 1RYJ A; 3WA0 A; 1UGJ A; 3C0R B; 4RNA A; 2CHX A; 1R4N B; 2GLS A; 1ENF A; 4AUQ C; 3Q3N C; 3IT6 B; 1EUV B; 4R3D A; 1E7P B; 2LRU A; 3RD2 A; 4TKN A; 3N1Y C; 3DDC B; 4EE2 A; 4XWW A; 4W9E A; 1LFD A; 2J7Q B; 5IO9 A; 4TQ0 A; 4OZA A; 4HPL B; 2D3C A; 4L1B A; 1WIA A; 1V49 A; 2M17 A; 1D4B A; 4LTU A; 4NQL B; 2FCS A; 2W9N A; 1UWX A; 2AL3 A; 5H92 C; 4ANV A; 1LXD A; 3TEZ A; 2X38 A; 2CU1 A; 2QJL A; 3JVZ X; 1ZXH A; 3ABV B; 3OG5 A; 3HIZ A; 4M8N A; 3FC4 A; 4AQ7 A; 3JSV B; 3HVZ A; 4E71 A; 3ZUN A; 3TEY A; 3GOE A; 1WFY A; 1FXT B; 4GXB A; 1T0Y A; 1S1Q B; 3AE8 B; 4FHK A; 3DCG A; 1CQV A; 2Z8L A; 4X57 B; 2R61 A; 2DZM A; 3ZVV A; 1I35 A; 4WH4 A; 4JWU C; 4HRS A; 1E90 A; 2PTL A; 3HVD A; 3A9K B; 4RMA A; 4DHJ D; 1KF6 B; 1V2Y A; 5IAA C; 1FCL A; 2QHO A; 2YEP B; 3B1L X; 1T5X D; 3AE1 B; 1QKZ A; 1MVK A; 3P63 A; 4WQO B; 2DAJ A; 1HEZ E; 3L13 A; 1RAX A; 3LJ3 A; 3OAW A; 1ZKH A; 4BKS A; 2AWT A; 3HK0 A; 3TSS A; 2KQS A; 2C60 A; 3WAL A; 3S2A A; 2GMI C; 3KW5 B; 2DLB A; 3ML9 A; 1SJH D; 1V97 A; 3PS6 A; 4HXD A; 2JZZ A; 1QQR A; 2GB1 A; 1SSN A; 1VZ6 A; 2FUG 1; 1BUI C; 2GI9 A; 2IGG A; 2XEW A; 4FLH A; 2PE9 A; 4J3O D; 2L32 A; 2NTS A; 2MBQ A; 2BYE A; 3RFZ B; 3U7D A; 1I42 A; 1YNT E; 3V6C B; 3L10 B; 4ZRQ A; 1OQY A; 4XYC A; 1L0Y B; 4C4V A; 3K9O B; 4K81 A; 4A20 A; 4NJC A; 4EFO A; 1K51 A; 2KJH B; 3R2T A; 2CHW A; 3QQ8 B; 5C23 A; 4Q2J A; 5EE9 A; 2R2Q A; 2JZP A; 4JQW C; 4CHK A; 2JPH A; 1C4A A; 4W9I A; 1L4D B; 2ZJD A; 3DVG X; 2VH2 A; 5EE3 A; 4YSZ B; 3ONS A; 1E8W A; 1EO6 A; 1N5X A; 1TGZ B; 1FRR A; 3DOW A; 4M0W B; 3GZN B; 3RZW C; 3PLU A; 5C1Z A; 1FPY A; 3BWU D; 2BKF A; 3DPD A; 2AEH A; 2JXT A; 2JUO A; 2AL6 A; 3DBS A; 2KTR A; 3EEC A; 3Q3O C; 4C00 A; 4P16 A; 3ZJT A; 2YVC A; 1NYR A; 4B0M A; 1NDD A; 3APF A; 2BTE A; 1UGM A; 2KMC A; 1FNW A; 3LB8 C; 1L7Y A; 2C5L C; 3NRZ A; 4ZRJ A; 2WQY B; 3EUB 2; 2O6V D; 4P6V F; 4PYZ A; 2V3S A; 1KLU D; 2N9E B; 4KGT A; 1ZXI A; 2WXI A; 2QIL A; 3P2B A; 1FD6 A; 3A9J A; 4OVU A; 2W3R A; 2BPS A; 3RNA C; 4RF1 A; 1HE8 A; 4B95 A; 1VR9 A; 1WYW B; 2GBM A; 2KMM A; 3PZ8 A; 2M4N A; 4W9D A; 3I57 A; 3WAN A; 3FIL A; 4AOF A; 3A4S C; 1N61 A; 1R4N I; 2FUH B; 1J7A A; 4BAX A; 2M8S A; 2E6X A; 1UH6 A; 3V61 A; 1N60 A; 2DBY A; 2LVP A; 4WJO A; 1F2R C; 3RNG C; 1RRB A; 1I4Q A; 3B08 A; 5L95 C; 1DYQ A; 2M1M A; 1H8C A; 1XLO A; 1JRO A; 1YN5 A; 1Z5S B; 4W9F A; 3PHW B; 2I38 A; 4MH8 A; 1TS4 A; 4MDK E; 3BZD B; 4S17 A; 4IM2 A; 1HZ5 A; 3IT4 B; 1JRP A; 3AEB B; 1XLP A; 2BWE S; 1CZP A; 1JWB D; 3VFK A; 1PGA A; 1E10 A; 3ZRF A; 2N0S B; 1WY8 A; 4MEM A; 3VVW B; 2WXN A; 2MX2 A; 1AW7 A; 5BMG A; 4W9C A; 3VR8 B; 1JWA D; 2JY6 A; 2LHE A; 3ZO5 B; 3M95 A; 4RH6 A; 2IO3 B; 4G0N B; 5J18 A; 1P7F A; 2KQ7 A; 2BF8 B; 1I4R A; 4IWQ A; 1UBQ A; 2IBI B; 2LHD A; 2WXK A; 2G45 B; 3H7S A; 1JWS D; 1RLF A; 1E0Z A; 1GB4 A; 2HTH A; 3U7Z A; 1E8X A; 1M94 A; 4YWG G; 2KDF B; 2NMQ A; 3OWE B; 4HKQ A; 4ZRI A; 1MJD A; 2DZI A; 1WGD A; 2FBW B; 4RF0 A; 3AEE B; 4EUT A; 3HM6 X; 1FIQ A; 4KVG B; 5DPW A; 5BYQ A; 3WCQ A; 5CHF A; 2REX A; 4WAF A; 2DAF A; 2PKO A; 2NBV B; 2L83 A; 2MWS B; 2M0A A; 3PT2 B; 1WF9 A; 2FNJ B; 3PV1 A; 3VRA B; 2LUM A; 4FJV B; 4HKZ E; 4BBN C; 4HVB A; 3ZIM A; 3W1S C; 3N1Z C; 3UIN B; 2OJW A; 3Q8C A; 4TUU A; 3VRB B; 2L8J A; 1E8Z A; 4DHJ B; 2LI5 A; 4AJW A; 1TJE A; 2NBU A; 4MSQ B; 3TCA A; 2RMM A; 3SFE B; 3PVL A; 1NYQ A; 1L6V A; 5BMH A; 1SE9 A; 2UWQ A; 3MHS D; 1XQQ A; 1QOF A; 4ITK A; 1N5W A; 2LGD A; 2BYT A; 4TSS A; 1JW9 D; 2J4X A; 2WP9 B; 2KVZ A; 1WX9 A; 3Q2A C; 2ZZP B; 4EZJ A; 2IO0 B; 2ZCC A; 2X8X X; 3R3M A; 4BBN F; 1ZDX A; 2BYF A; 1OQR A; 2K6D B; 1IGD A; 3P4P B; 2KXJ A; 3DVG Y; 1WZ3 A; 1I7H A; 1WMH A; 2IDY A; 3GZN I; 3OJ3 A; 2LWP A; 2KC2 A; 5JXV A; 1YX6 B; 4WJQ A; 1ZUD 2; 4LNN A; 2JSV X; 2PIA A; 1XCQ L; 4JWS C; 4XC2 A; 4MT5 A; 2DYB A; 3NS8 A; 4O1N A; 1KRH A; 1GC6 A; 2AX5 A; 2G9H D; 1BT0 A; 1MHX A; 3AI5 A; 3H7P A; 3J9C A; 2W82 A; 1E6E B; 1V5O A; 1NI2 A; 1K50 A; 1TYG B; 1N62 A; 4EKU A; 4MM3 B; 1AYF A; 1WGR A; 3CSF A; 1IBX A; 3AE7 B; 3SR6 A; 2OHF A; 2HJ8 A; 1TS2 A; 2BKR B; 2JXX A; 2KWV B; 4P1C C; 3QAQ A; 1GOZ A; 2Q5W D; 1VRA B; 2NVU I; 3Q8A A; 1WGK A; 4G11 A; 2IO2 B; 5FK9 C; 2CJO A; 1EF1 A; 4E3C A; 1QIL A; 4USA A; 2ASQ A; 1FRD A; 3Q14 C; 3A33 B; 1EU4 A; 5JHB A; 1J7B A; 2DEN B; 3PGE A; 4URK A; 3DHG C; 4FJY A; 4BFR A; 2JWU A; 1YD8 U; 1Q1O A; 2KWD A; 1C3T A; 3VTU A; 1AWD A; 1WXM A; 3PTF C; 4KV2 A; 1SXT A; 2W3S A; 5HFY A; 3APC A; 1V6E A; 4HRO A; 2KJ6 A; 2XK5 B; 2A4Z A; 3MHZ A; 1HTO A; 3Q8E A; 4M8M A; 4XZ4 A; 1KLV A; 3N3K B; 3NJT A; 4L23 A; 2VH1 A; 3AE9 B; 1T0S C; 1WGH A; 1WM2 A; 2N1V A; 2LVO A; 2KDE B; 3P4S B; 4WIP A; 1TY0 A; 5CHW A; 4NAW B; 3B9J A; 2KAN A; 3U30 A; 4GMV A; 3R7R A; 4II3 B; 1ISN A; 3O13 A; 4LK0 M; 2XNA C; 5AUK A; 2ZCB A; 4OZC A; 5JZE B; 3I3T B; 3PZ7 A; 4N58 A; 1TY2 A; 2D07 B; 1TZ1 A; 1CMX B; 1KTK A; 1WM3 A; 1D5Z C; 1LO5 D; 2OED A; 2D5G A; 1XLQ A; 3OLM D; 2ZNV C; 4YTM B; 2AQ1 B; 2INN E; 2RPV A; 3NZS A; 2MBO A; 1OTR B; 2KLG A; 3NVW A; 5TSS A; 1QOA A; 4IWO A; 4YTN B; 2WDR B; 2LUE A; 2FCQ A; 3QC8 B; 3IXS A; 2RSU A; 4WAA A; 3BII D; 4MGY E; 1DOX A; 3PSE B; 2NPT A; 2MP2 A; 3QJZ A; 4IDI A; 1Z2M A; 4XX5 A; 2KFJ A; 2WXH A; 1C77 A; 2GBR A; 4FBJ B; 1JAL A; 3DBL I; 3VQI A; 3H6N A; 3CMM B; 3ZXR A; 2PJH A; 2KLC A; 2NBW B; 3A1Q B; 2D2Q A; 3UQB A; 2JWZ A; 1UZX B; 4YXD B; 3SU8 X; 2K9X A; 4IWP A; 3NZU A; 2KKC A; 1IYF A; 1F2R I; 1WH3 A; 1YQ3 B; 2K8C A; 3GE8 C; 4JL9 A; 2DZJ A; 1XT9 B; 2LAS A; 3Q8F A; 1V1P A; 4REZ A; 1TKE A; 1WRD B; 1XLN A; 2IGH A; 3R7Q A; 4ZYS A; 4PS8 A; 3MC8 A; 1WRI A; 1JWU D; 1R4M B; 2KFK A; 3URY A; 2MH7 A; 1WSP A; 3KWL A; 1PYW D; 3JYU A; 2L0T A; 3IAM 1; 1NI3 A; 5D6J B; 2SAK A; 1Q5W B; 3EHV A; 1MG4 A; 3BYT B; 1U4A A; 4KSK C; 3RUL A; 1NVI D; 3CIR B; 2DX5 B; 3VTV A; 5C3J B; 2WX1 A; 2DHZ A; 2K5P A; 4RCO A; 4OZB A; 3SDL C; 4I6L B; 3ML8 A; 4KIK A; 3EFU A; 4OW0 A; 3Q3F A; 3RPF C; 1A70 A; 2V1Y A; 3ZNH B; 2HDE A; 4GIV A; 2PW9 A; 3R2I A; 1WE6 A; 1QZE A; 4L2Y A; 2WXG A; 5EDS A; 1JML A; 3AE4 B; 2GBJ A; 4LNF A; 2KYW A; 2K25 A; 4YSX B; 2NR2 A; 2KVR A; 2ZNV B; 2C7N B; 1E7V A; 2DWQ A; 2KTF A; 4G50 A; 3UF8 A; 2WXR A; 3AE2 B; 3ZXV A; 4GDL B; 1WJU A; 1D5X C; 1V8C A; 1J7C A; 1J19 A; 3ZW3 A; 1HTQ A; 2RDH A; 3GP7 A; 2Y5P A; 3DBR B; 1RM6 C; 2L52 A; 3PRP B; 3H7P B; 1PDX A; 2KO3 A; 3QCA A; 4GLS C; 4A3O A; 4IKG A; 2UYZ B; 1WXS A; 1ZW7 A; 1LQB A; 3IBE A; 1XD3 B; 5IA7 A; 3TEW A; 3IG3 A; 3NHE B; 2WLB A; 2AYO B; 4XDD A; 2IY1 B; 1JCK B; 2WXJ A; 3PZD A; 3N30 A; 3RZF A; 3NVY A; 2O6V A; 3H1U A; 1H4R A; 1NEN B; 1QOG A; 3RN9 C; 3UQA A; 2MBE A; 2VRR B; 3M63 B; 1QF6 A; 3M3J A; 3W1S A; 2BT6 A; 4BKT A; 4CYE A; 2JQR B; 2KZR A; 3NVV A; 5GMV A; 1PUT A; 3UIP B; 1TS3 A; 3W2D A; 2KMA A; 4KGS A; 1F1H A; 2DYO A; 1TS5 A; 3U52 E; 5BYS A; 4KZC A; 4WUR A; 5D7G A; 2RDB C; 1SB3 C; 2JRI B; 4NQK E; 1PGB A; 2WHI A; 4QAY A; 1V86 A; 4KSL C; 1ZDV A; 2WGS A; 5L83 A; 4DHZ E; 2BGF A; 5DPT A; 1MI0 A; 2L0F A; 1UF0 A; 2BVC A; 2H89 B; 3DVN V; 3HUI A; 4OHJ A; 4XDC A; 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5BO4 B; 4FUL A; 4IM0 A; 2G4D B; 1VLB A; 4A9A A; 1Y56 A; 4BOS C; 4BVU C; 1CK1 A; 4RGO S; 3BK1 A; 5KHO A; 2V3P A; 1L0V B; 1FCC C; 2K39 A; 3TUO A; 4PYU A; 4NPN A; 1C4P A; 3CWI A; 5IP4 D; 4KX6 B; 2E3T A; 4W9K A; 3V05 A; 2LRW A; 5I4D A; 2V9H A; 1YN4 A; 1V1P B; 1FXI A; 3LDZ E; 2Y5B B; 3H9D A; 2K1F A; 2WXF A; 3V60 A; 1VZ8 A; 5HG2 A; 2MCN B; 2KFK B; 1P9D U; 2VZK B; 2BBC A; 1OQQ A; 3X0W A; 3I9V 1; 2MSE D; 2Z0D B; 2J0K A; 2KT7 A; 3DBR I; 5LLI A; 2RR9 A; 2LD9 A; 5CX3 A; 3IFW B; 2GBN A; 2WXQ A; 1MG8 A; 1UD7 A; 4LNO A; 2R2O A; 4JLC A; 2MA9 B; 2ONQ A; 2CJN A; 2W54 A; 1T3Q A; 4ZHP A; 2IGD A; 2KDM A; 1C1Y B; 3VR9 B; 3T3N A; 2NCN A; 5HI1 A; 4B6W A; 3TJP A; 2PE6 B; 3TIX A; 2D3B A; 4C4V B; 5MPO A; 3M62 B; 3GE3 C; 3WIM A; 1KLG D; 2BB5 A; 1YJJ A; 1SE2 A; 4DXG A; 2C9W B; 4ANW A; 2D10 A; 4WQM A; 2INC C; 2SEB D; 3VUX A; 1ZP0 B; 1D6E C; 1MPE A; 3L17 A; 3VUY A; 1V9J A; 4MAC A; 3LYY A; 2N9P C; 1JRU A; 4CO7 A; 1K8R B; 4IG7 B; 4XWT A; 2N1W A; 3W5V B; 5H8Y E; 3RCZ A; 2CS4 A; 1PFD A; 4H2A A; 2K8B A; 3Q3J A; 1WYG A; 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