The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
63
|
structure length |
63
|
Chain Sequence |
EVTIKVNLIFADGKIQTAEFKGTFEEATAEAYRYAALLAKVNGEWTADLEDGGNHMNIKFAGK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Evidence for plasticity and structural mimicry at the immunoglobulin light chain-protein L interface
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Fab, light chain
|
| molecule tags |
Immune system
|
| source organism |
Finegoldia magna
|
| total genus |
18
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| structure length |
63
|
| sequence length |
63
|
| chains with identical sequence |
F
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-08-20 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2ON8 A; 2N7J A; 2I38 A; 1KH0 A; 1PGA A; 2N9K A; 5BMI A; 5HHD G; 3FIL A; 1Q10 A; 1XCT L; 1IBX B; 1YMH E; 2J53 A; 2GI9 A; 1FCL A; 4OZA A; 1XCQ L; 4HKZ E; 5HFY A; 1MHH E; 1EM7 A; 5JXV A; 4KGT A; 2JSV X; 2ZW0 A; 2RPV A; 1XF5 L; 1UWX A; 3MP9 A; 2OED A; 1F2R C; 2N9L A; 3V3X A; 2KAC A; 1IGC A; 2I2Y A; 1P7F A; 2IGH A; 2K0P A; 1ZXH A; 4OZC A; 2QMT A; 1IBX A; 2JWU A; 1P7E A; 2RMM A; 1QKZ A; 4IOI E; 2LHE A; 2IGD A; 1C9F A; 2KDM A; 2IGG A; 2PLP A; 2GB1 A; 2EEL A; 4D2K A; 2KWD A; 2J52 A; 1HZ5 A; 1K51 A; 4OZB A; 3UI3 A; 2QSD A; 5HI1 A; 4WH4 A; 2KN4 A; 1IGD A; 2KQ4 X; 1MVK A; 2ONQ A; 1MHX A; 5BMH A; 1GB4 A; 2ZW1 A; 1PGB A; 4MAC A; 2LHD A; 4IKG A; 3FIL B; 4KGS A; 1K50 A; 1HEZ E; 1D4B A; 2JXT A; 2LGI A; 2NMQ A; 5HG2 A; 5BMG A; 1YNT E; 1F2R I; 1JML A; 3GB1 A; 1FCC C; 1MPE A; 4KGR A; 1HZ6 A; 2JZP A; 1PGX A; 2JU6 X; 2PTL A; 1GB1 A; 1FD6 A; 4HJG E; 4GLS C; 1MI0 A; 1K53 A; 2PW9 A; 1K52 A; 2LUM A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3EA6 A; 3KW5 B; 5HHD G; 2IO0 B; 5C3J B; 3VUX A; 2KHW B; 2PVO D; 3SFD B; 2LXA A; 4W9H A; 2RSU A; 3ALB A; 2KDI A; 2Q5W D; 3H7S A; 2RDB C; 4ACF A; 3IG3 A; 2N7E A; 1TKG A; 2L76 A; 1J8C A; 2K8C A; 3APC A; 3P4P B; 3A9K B; 2OED A; 1N62 A; 2WLB A; 4CQN A; 4AUQ C; 1WGG A; 2VZK D; 1LQB A; 2KQS A; 2K1F A; 2PPH A; 1I42 A; 4USA A; 2MLB A; 2Y3A A; 3RT3 B; 4O1N A; 4IDI A; 2KFK B; 4JPS A; 3AB5 A; 2EKE C; 1V8C A; 2LWP A; 2CS4 A; 3P4R B; 4BBN C; 2JY6 A; 1E7V A; 2KMC A; 3I9V 1; 2J52 A; 4LNK A; 1K51 A; 3ZYY X; 2M19 A; 2O6V A; 4IM3 A; 2MJE A; 3GS2 A; 5GMV A; 3B0A A; 2LGX A; 1FEH A; 1NI2 A; 2X8X X; 3DBR I; 3TJP A; 3EEC A; 1JRO A; 3A9J A; 4MDK E; 2ASQ A; 1I4X A; 1EWC A; 4IWO A; 2MJD A; 5G55 A; 4G0N B; 2ZW1 A; 4M8M A; 1STE A; 4HPM B; 5BYR A; 1GAQ B; 2W54 A; 2L1A A; 3V6C B; 2NMQ A; 2BQQ A; 1Q5W B; 2RDG A; 2QJL A; 2L3Z A; 4WQO B; 2JYE A; 3NHE B; 3ML8 A; 2D07 B; 2I38 A; 2ZCC A; 4RGN A; 2CJO A; 1WXS A; 1WJU A; 1QF6 A; 2ZJD A; 1WZ0 A; 1AAR A; 2HTM E; 1H4R A; 3U8Z A; 1T6B X; 2O2V B; 5DPT A; 5IKC M; 4DK5 A; 5IN7 A; 3P63 A; 1QOB A; 2KDE B; 4KGT A; 1UGJ A; 1NVI D; 1XF5 L; 5LNK 1; 2MWS B; 1JQ4 A; 4I6N B; 1ENF A; 2DYB A; 2IO3 B; 1WSP A; 1E10 A; 4RMA A; 1YX6 B; 2J7Q B; 2LVO A; 4MGZ E; 4MJS A; 2V9H A; 3AEC B; 1K8R B; 4URK A; 1JWB D; 1UBQ A; 1YJJ A; 1YQ4 B; 4ZHP A; 2JYT A; 4PYU A; 2AQ2 B; 1Q0W B; 1WY8 A; 2BYV E; 1WE6 A; 2LEK A; 2ZNV B; 1JRP A; 4Q2J A; 2D3G A; 3B08 A; 3HRD D; 4LNF A; 2N9X A; 2C60 A; 2KN4 A; 2PVG C; 2LZ6 A; 2REX A; 1E8X A; 1T0Q C; 3QWZ B; 2I1J A; 4ZRP A; 2UWQ A; 2ZVN A; 2YLM A; 4QAY A; 1AWD A; 1TKE A; 1HEZ E; 1SB3 C; 1VD2 A; 3AEA B; 3APD A; 4MSQ B; 2BW2 A; 1LM8 B; 4NQL B; 4EZL A; 2NBW B; 2WDV B; 4TQ0 A; 1M4V A; 3T3O A; 3AE9 B; 2JRH A; 1PGX A; 4YXD B; 3HHM A; 3VDZ A; 3PZD A; 1ZE3 D; 5CHV C; 2HE7 A; 2KO3 A; 4YSY B; 2N7J A; 2WXG A; 1WI0 A; 2LAS A; 1Q10 A; 1Z5S B; 4X57 B; 2J0M A; 4KX6 B; 2Y5B B; 4XGA B; 4BVU C; 3HK0 A; 2MW5 A; 3BYY B; 4L23 A; 3LB8 C; 4R3D A; 1QT9 A; 2WS3 B; 1JW9 D; 1OEY J; 1JRU A; 1RRB A; 1F9J A; 3NUH B; 3VQI A; 2MJ3 A; 4FJZ A; 2OOB B; 2WDT B; 1ZXH A; 1ROE A; 1FRD A; 4ARI A; 2FCM A; 2Z0D B; 4M02 A; 4WIP A; 4YL8 A; 3T3N A; 2JWU A; 4IG7 B; 1JWA D; 2JF5 A; 1C9F A; 2G9H D; 3J9C A; 4ARC A; 3HIZ A; 2GB1 A; 3PZ7 A; 4GDL A; 4KVG B; 2DYO A; 2AX5 A; 1QOF A; 3DBH I; 4ZDV A; 5FK9 C; 4RNA A; 3QK0 A; 3RZW C; 4RM9 A; 1SF0 A; 3JW0 X; 5H8Y E; 4ZOH C; 1UEL A; 3AEE B; 3RNG C; 2LHD A; 5I4D A; 3MTN B; 2G3Q B; 2L52 A; 4W9C A; 2D3C A; 4AJY B; 4F1S A; 4A90 A; 3TCA A; 4G11 A; 4HRO A; 3P42 A; 3CMM B; 2GBK A; 3P2B A; 3QJZ A; 4B6W A; 2K8H A; 1MPE A; 2FIF A; 4LNI A; 2JU6 X; 3DBL B; 4RM8 A; 4YSX B; 3GZN B; 2J42 A; 2PW9 A; 3UQB A; 3OAW A; 5C23 A; 3V62 A; 4RGT A; 5BMI A; 3DVN U; 2KX0 A; 3IHP C; 3PGE A; 2CR5 A; 2IO1 B; 2TSS A; 2OJR A; 3RI7 C; 3W5V B; 2NVU I; 4HKZ E; 2I1K A; 2N1W A; 1GUA B; 3B2F A; 3IT4 B; 4KV2 A; 4AQ7 A; 2DYM A; 2K8B A; 4ZYN A; 4TV3 A; 3AE3 B; 2O6V B; 4RFB A; 3KWL A; 1P7F A; 3W5U B; 4P1B C; 2AL3 A; 1ZDX A; 2ZZP B; 4W9J A; 3AH7 A; 1JWU D; 1SSN A; 1OEY A; 4NAW B; 3DDC B; 3VXW A; 1KFY B; 4PK1 A; 2KK8 A; 5E6P A; 1OQR A; 3H9D A; 2IGG A; 4CO7 A; 3SHQ A; 3W1S C; 1C78 A; 1ZXI A; 2EKI A; 3KQ4 A; 4G50 A; 3W2D A; 1MFW A; 2RPQ A; 5AZH A; 1N63 A; 1CJE A; 2XBB C; 3PRZ A; 1GC7 A; 3KLS X; 4IM2 A; 1WX7 A; 2D10 A; 1RFK A; 3W1S A; 3NG0 A; 3KWV A; 3IFW B; 3VAW A; 4BKG A; 4DDG D; 2UU7 A; 4GSW A; 4CHK A; 2PMV A; 3Q8E A; 1UF0 A; 1CMX B; 2BYT A; 2JZP A; 1PFD A; 3CST A; 2K9X A; 1BML C; 1WF9 A; 3ZNZ B; 4DHZ B; 1K52 A; 4MJS B; 3OG5 A; 3C0R B; 4PS7 A; 1WR6 E; 3WAN A; 2MH7 A; 1KM7 A; 2WXI A; 1TYG B; 1E0Z A; 1L0V B; 2H88 B; 2LJI A; 2J53 A; 1SIF A; 3APF A; 3NJT A; 3ZDM C; 5HFY A; 1EM7 A; 1V1O A; 2KAJ A; 2Z0E B; 2WYQ A; 2KTF A; 4GN1 A; 1N5X A; 2AQ1 B; 3BYT B; 3DWG C; 2JZ3 B; 5L95 C; 2BS3 B; 2QIE B; 2RGF A; 2I2Y A; 4DHZ E; 2KD0 A; 3ABV B; 3ZNG C; 2ZCB A; 4J3O D; 1V5T A; 1RFA A; 1Y8R C; 1GNU A; 3VR9 B; 2L0F A; 3ZJV A; 2HD5 B; 4RF1 A; 3EGR A; 2LVP A; 2HTH A; 2KDM A; 2E3T A; 4ANV A; 2L0T A; 1T0R C; 4D2K A; 1P3Q U; 1GG3 A; 2EMT A; 4NY0 A; 1ZKH A; 1Z2M A; 1NDD A; 2FCQ A; 2KWV B; 2M8S A; 3V6E B; 4ICU A; 2ICI A; 1WE7 A; 4L2Y A; 1IGD A; 2KAN A; 2LGY A; 3W1Y A; 3QAR A; 1KTK A; 3AV8 A; 2KTR A; 4N58 A; 1TBE A; 1FNU A; 1WGR A; 2GLS A; 4BKS D; 3DBH B; 4M00 A; 3X0W A; 1LFD A; 1C1Y B; 4IW0 A; 4C7Z A; 1J0G A; 2JXT A; 5G2N A; 2MBH A; 2KJ6 A; 4FJY A; 5BMG A; 1WM3 A; 2GBM A; 1F2R I; 3PTF C; 3RNE C; 2W82 A; 1P1A A; 1XD3 B; 2H89 B; 4K7W A; 1P0R A; 2N9P C; 3RD2 A; 3MHS D; 2QIL A; 1C77 A; 4TKN A; 3WIM A; 3QCA A; 2FNJ B; 1TY0 A; 2D2Q A; 2ON8 A; 3MJ5 A; 5DPW A; 5AEK B; 3V61 A; 2NBU A; 3TIX A; 4F8C B; 4DQO C; 3R8B A; 2WXL A; 2JWZ A; 1UWM A; 1CQV A; 3D32 A; 4YWG G; 5JXV A; 1A70 A; 1L2N A; 4EE2 A; 2GMI C; 1V1P A; 3ENE A; 1QIL A; 2G45 B; 4GDL B; 4WJQ A; 1E7U A; 2KFJ A; 4ANU A; 1YIW A; 1SIJ A; 5DCN A; 4US9 A; 4W9F A; 3VR8 B; 4AWJ A; 3IT6 B; 2NCN A; 2QCZ A; 1IYF A; 3DPD A; 4IC7 B; 2D3B A; 3H8H A; 4W9I A; 1SJE D; 3KH0 A; 3SR6 A; 1T5X D; 1E90 A; 1E8W A; 1WR1 A; 4LJP B; 3T8M A; 4A20 A; 1AYF A; 2KYW A; 5E6J A; 2MHJ A; 1C4A A; 2MA9 B; 4OZB A; 1WJ4 A; 4KDI C; 2ACZ B; 3UI3 A; 4NAM A; 4WWP A; 5EE1 A; 2KDB A; 5E6N A; 1XO3 A; 1F1H A; 4GXB A; 1R4M B; 4GU2 A; 2IYD B; 3AMZ A; 2LD9 A; 2K3U A; 1MVK A; 2N0S B; 2GBN A; 1WJN A; 1MHX A; 5JH5 C; 5BMH A; 2YVC A; 4NZL B; 2CHX A; 5G5G A; 4HEA 1; 3SDL C; 1PGB A; 3MFG A; 1V86 A; 4ANW A; 2O6V D; 3AU5 A; 3AED B; 1D4B A; 2MP2 B; 5AZF A; 3I3T B; 2FCS A; 4ANX A; 4BFR A; 1IP9 A; 1YNT E; 1SE3 A; 3FKY A; 1I4R A; 2LUE A; 3GB1 A; 4P16 A; 1FCC C; 2IY0 B; 3U7Z A; 4KGR A; 3TEY A; 4NJ7 A; 4AOF A; 1ZUD 2; 1NEK B; 2LJ5 A; 3GE3 C; 1T0Y A; 4HDO A; 4EKU A; 3AEG B; 2FBW B; 3DHI C; 4A8X C; 2NBV B; 3H7P A; 3NZU A; 2LVQ A; 2PEA A; 1XCT L; 2KLG A; 1IPG A; 1SXT A; 5EE3 A; 3RMK C; 4ASW C; 4XWW A; 2KLC A; 3ZW3 A; 4ZRJ A; 4HCP B; 3OJ3 A; 2FUG 1; 4C7Y A; 2W55 A; 3Q3F A; 2A5U A; 2BYF A; 1OFF A; 2EMS A; 3N1Z C; 1SE2 A; 3NVZ A; 1V6E A; 1KJT A; 4KIK B; 3V3X A; 1GPX A; 3SU8 X; 2MEK A; 1UH6 A; 3ZNH B; 1FRR A; 4XYC A; 5IAA C; 3AEF B; 2WX1 A; 3U7D A; 3AE4 B; 2IND C; 3QA8 A; 3M95 A; 4HK2 A; 4RGO S; 4M8N A; 4WUR A; 4GIV A; 2JRI B; 3PV1 A; 4LDT B; 2KWD A; 2QEJ C; 4A55 A; 4A3P A; 2DZM A; 2BTE A; 1VZ8 A; 4ZRQ A; 5D94 A; 2M56 B; 1OTR B; 1SJH D; 1FMA D; 2DZJ A; 2ONQ A; 1EUV B; 1UD7 A; 2FID A; 4MAC A; 1ET6 A; 3TSS A; 1K50 A; 2XEW A; 4G3X B; 2JX5 A; 1TJE A; 2BGF A; 5FKA C; 2KKC A; 1RLF A; 1HA5 A; 3WCQ A; 3BWU D; 4HWI B; 1XXG A; 2WXP A; 3BY4 B; 1TGZ B; 4B95 A; 3WAL A; 3DCG A; 2LGS A; 4OVU A; 4HPL B; 3WA0 A; 1VDV A; 1R4N B; 1FD6 A; 4C00 A; 4LLG M; 4AP4 C; 2WXN A; 1J7B A; 4YTN B; 5IA7 A; 1UZX B; 2WWZ A; 3RCZ A; 1JWS D; 2MCN B; 1TIF A; 4BAX A; 1GOZ A; 3AEB B; 1NI3 A; 3Q8F A; 3IVF A; 1YX5 B; 2GI9 A; 2M0X A; 3Q3N C; 1XT9 B; 2WXQ A; 4XX5 A; 1WGK A; 3EFU A; 5D2M B; 4W9D A; 2IO2 B; 4HKQ A; 2N9L A; 3ZQ4 A; 1L6V A; 2WXF A; 3KUZ A; 4WAA A; 4BOS C; 3Q3J A; 2N4F A; 2IGH A; 2NPT A; 3L0W B; 4PYZ A; 4JQW C; 1PDX A; 1Q1O A; 2BKR B; 2KTR B; 5J17 A; 4LK0 M; 3SEB A; 1PYW D; 2LFI A; 4C4V A; 3U52 E; 1WXQ A; 4XWT A; 2K6Q A; 2KXJ A; 3RNA C; 3RNC C; 1RAX A; 2FE8 A; 4GB9 A; 1U4A A; 3A4R A; 1HTO A; 3URY A; 3IBE A; 1XEE A; 4GDK A; 1KRH A; 4B0M A; 2KNB A; 2HJ1 A; 1ACC A; 4C80 A; 3CIR B; 2NR2 A; 5G5H A; 3DVG X; 4OW0 A; 2HJ8 A; 1BT0 A; 5D3D A; 4RGM A; 3U4E G; 2BS4 B; 2INC C; 1R7S A; 4NJC A; 4MEL A; 3O13 A; 3R3M A; 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2KT7 A; 2C7N B; 4EZJ A; 3ZNI D; 4S0R A; 3PPA A; 4GOC A; 2OHF A; 2IY1 B; 1OQY A; 1E7P B; 3GP7 A; 3AE8 B; 2K25 A; 1YOV B; 4NQK E; 2WU5 B; 3O65 B; 1WGH A; 1FO4 A; 3PHX B; 1EWY C; 3VHT C; 1V97 A; 2BB5 A; 4FXC A; 5IP4 D; 2WXJ A; 3M62 B; 5EDS A; 3WAO A; 2BYE A; 4IWP A; 5D7G A; 3ZKJ C; 2JSV X; 1ZGU B; 2RPV A; 2WXR A; 3UQA A; 4MM3 A; 3MP9 A; 5J2R A; 1FNV A; 3NZS A; 1F2R C; 3B1L X; 3E9S A; 1D5Z C; 3AE5 B; 1QZE A; 4EFO A; 1V80 A; 3A1Q A; 1IUE A; 1H8C A; 2UYZ B; 4LNN A; 3W9C B; 3N30 A; 1EU3 A; 4AJW A; 1QKZ A; 4RF0 A; 3VH4 B; 3M3J A; 1TS3 A; 3R2I A; 4FHK A; 2KC2 A; 3HM6 X; 5JZE B; 4W9G A; 1XLQ A; 5TSS A; 3L08 A; 1ESF A; 3RN9 C; 4K3C A; 3LDZ E; 3VUW A; 1LGR A; 3ZXR A; 3ZGZ A; 2KN5 A; 1YN3 A; 2NTT A; 3ZLZ A; 1I4H A; 3EC8 A; 5IOI A; 4J6I A; 4XDD A; 2B3A A; 2K22 A; 1BUI C; 3ZRC A; 4BZA A; 1WRD B; 1TS2 A; 1WXV A; 1L0X B; 2AWT A; 1ET9 A; 4IM0 A; 1BXT A; 4B9K A; 1QLB B; 4GLS C; 2MX2 A; 4FLH A; 2LUM A; 4KSK C; 3QC8 B; 1PGA A; 4HRS A; 2KC1 A; 3FIL A; 3NY5 A; 4HVB A; 3GE8 C; 3C8Y A; 3V60 A; 1FCL A; 2RD0 A; 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