The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
|
sequence length |
63
|
structure length |
63
|
Chain Sequence |
EVTIKVNLIFADGKIQTAEFKGTFEEATAEAYRYAALLAKVNGEWTADLEDGGNHMNIKFAGK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Evidence for plasticity and structural mimicry at the immunoglobulin light chain-protein L interface
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Fab, light chain
|
| molecule tags |
Immune system
|
| source organism |
Finegoldia magna
|
| total genus |
18
|
| structure length |
63
|
| sequence length |
63
|
| chains with identical sequence |
F
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-08-20 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2QSD A; 3FIL A; 1HZ6 A; 2ONQ A; 1XF5 L; 2LHE A; 3UI3 A; 2I2Y A; 1HEZ E; 2EEL A; 4OZC A; 5BMG A; 2KWD A; 4KGS A; 2JSV X; 1K53 A; 1GB1 A; 1MI0 A; 1K50 A; 5JXV A; 2GI9 A; 3GB1 A; 2J52 A; 2ZW1 A; 1JML A; 2LGI A; 2JXT A; 1K51 A; 1KH0 A; 2LUM A; 2K0P A; 2ZW0 A; 2KQ4 X; 5BMI A; 1IGC A; 1MHX A; 2GB1 A; 4IOI E; 1YNT E; 1IGD A; 1IBX B; 5HG2 A; 4KGT A; 4OZB A; 2IGG A; 4HJG E; 2NMQ A; 4IKG A; 2IGH A; 2RMM A; 2ON8 A; 2I38 A; 3FIL B; 3V3X A; 2PLP A; 1MPE A; 2IGD A; 1GB4 A; 1YMH E; 2RPV A; 1XCQ L; 1F2R I; 1UWX A; 1MVK A; 5BMH A; 1MHH E; 2JU6 X; 2JZP A; 1Q10 A; 4KGR A; 1ZXH A; 1PGB A; 5HFY A; 1F2R C; 2N7J A; 1IBX A; 1FCL A; 4WH4 A; 2LHD A; 2JWU A; 5HI1 A; 1P7E A; 4OZA A; 1K52 A; 2N9L A; 4GLS C; 1D4B A; 1PGX A; 4MAC A; 2QMT A; 2J53 A; 2N9K A; 1C9F A; 2KAC A; 1EM7 A; 1P7F A; 1QKZ A; 4D2K A; 1XCT L; 4HKZ E; 1HZ5 A; 3MP9 A; 2PTL A; 5HHD G; 1FCC C; 1FD6 A; 2KDM A; 2KN4 A; 2OED A; 2PW9 A; 1PGA A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1C1Y B; 2QSD A; 2C60 A; 2LRW A; 3FIL A; 2VZK D; 4MJS B; 2I2Y A; 2H89 B; 1ET6 A; 1RWS A; 3DWG C; 3VHT C; 4GB9 A; 3EHV A; 3LXF A; 4IUM B; 4XWW A; 3EFC A; 4WWN A; 1NI3 A; 1WI0 A; 1S1Q B; 2J52 A; 1QIL A; 2KMA A; 3H7S A; 1FNV A; 3VRB B; 5MPO A; 1D6E C; 2NPT A; 3N9Y C; 3O65 B; 3M63 B; 1G6J A; 4KGT A; 4HPP A; 4G50 A; 2LJ5 A; 3DBR I; 3Q3M C; 3PGE A; 3P4Q B; 2SAK A; 1XLO A; 5LXH A; 1A70 A; 4LLG M; 4KSK C; 4RMA A; 3ETR A; 3I9V 1; 2M1M A; 2KYW A; 3AU5 A; 3S2A A; 4JWS C; 1WX7 A; 2M4N A; 3PZ7 A; 3DVN U; 1SE9 A; 3QAR A; 4CQN A; 1WMH A; 4ZHO A; 4KSL C; 4XE0 A; 3MC0 B; 4US8 A; 3FC4 A; 2V4I B; 3A33 B; 3MJW A; 1R7S A; 4AJW A; 3K9P B; 3AN1 A; 5CHV C; 1ESF A; 3A9K A; 2M19 A; 3B2G A; 4OZA A; 4GLS C; 1VRA B; 2Z0E B; 3ML9 A; 4FJY A; 1GJZ A; 5EE1 A; 3H7P A; 1P3Q U; 3EUB 2; 2YEP B; 1TKE A; 4MT5 A; 3U8Z A; 1Z2M A; 2D07 B; 2KDE B; 4DK5 A; 3AE5 B; 1FD6 A; 2N7E A; 4GDK B; 3ZQ4 A; 2PE6 B; 4GIV A; 3MJ5 A; 1L0V B; 2EEL A; 1C79 A; 1R4M I; 3PZ8 A; 1V97 A; 1XQQ A; 2KAJ A; 5E6O A; 1TGZ B; 1P1A A; 2Z0D B; 4X57 B; 3APD A; 1F1H A; 4KIK A; 4G11 A; 1YN3 A; 4C4V A; 4GDL A; 3HVD A; 4JLC A; 1KTK A; 2WP9 B; 2QHO A; 2KKC A; 2KJ6 A; 1L0X B; 3EC8 A; 1IGC A; 1DYQ A; 1N61 A; 1WZ0 A; 3P4S B; 4GXB A; 3VTU A; 4TUU A; 1UNS A; 2DZJ A; 2V0G A; 4DDI D; 1P0R A; 1QOA A; 3QA8 A; 3I57 A; 1I4H A; 1YQB A; 2WX1 A; 1WXA A; 4P7I A; 4W9D A; 1WY8 A; 3RFZ B; 4TV3 A; 3CMM B; 4BKS A; 3ZJV A; 1F0Z A; 2FIF A; 3BWU D; 4N59 A; 1L0Y B; 4YWG G; 2RDG A; 3ZXV A; 2WLB A; 1AN8 A; 3M3J A; 1RYJ A; 3CF6 E; 4EUT A; 1M4V A; 1QOG A; 1I35 A; 3BIN A; 2JZP A; 1V5O A; 1WYG A; 3WAP A; 5EE0 A; 3CIR B; 3ZO5 B; 3ZJT A; 1TJE A; 5D3D A; 4AJY B; 4FJV B; 1J7A A; 1I4X A; 3PPA A; 1E7U A; 4FLH A; 1TYG B; 3L10 B; 3LB8 C; 2NVU I; 4DXF A; 1F52 A; 1WJU A; 3NUH B; 1WJ4 A; 4LNO A; 2A4Z A; 2D3A A; 2C7M B; 4HVB A; 3PRE A; 3VH4 B; 4PK1 A; 2JT4 B; 4GGQ A; 1QKZ A; 3AE6 B; 1I4Q A; 3ZNI D; 5BYQ A; 2FCQ A; 2FCM A; 2IDY A; 4W9C A; 2K8C A; 2W3S A; 5GMV A; 4K3B A; 3VUY A; 2RR9 A; 1CJE A; 4C7Z A; 4XX5 A; 3URY A; 3V05 A; 3U4E G; 3J9C A; 4P16 A; 4B6W A; 1YQ4 B; 5C2T B; 2WDT B; 2K6D B; 2MP2 B; 4LDT B; 4KVG B; 1WSP A; 3B0A A; 3FKY A; 4LNF A; 4FA6 A; 4E3C A; 2LGI A; 2JWZ A; 4TSS A; 1FXT B; 2LUM A; 2LMC A; 2W55 A; 4ANX A; 1IPG A; 2L0T A; 3DBL B; 2KTF A; 3ZJU A; 1C77 A; 1WR6 E; 1XXG A; 3BII D; 3WA0 A; 4C80 A; 3WAL A; 1RM6 C; 3KUD B; 1MG8 A; 4DHZ B; 1T5X D; 3O13 A; 2WU5 B; 4NJ6 A; 5AUK A; 2AQ3 B; 3DQV A; 2AYO B; 5LNK 1; 4OVZ A; 3UIO B; 3IT6 B; 1ZUD 2; 1N60 A; 2G4D B; 1E8W A; 1V1P B; 3P4R B; 3EGR A; 3W9C B; 1YOV B; 1F2R C; 2QIE B; 2W82 A; 3RPF C; 3A4S C; 1FRR A; 1XO3 A; 3UF8 A; 2HE7 A; 3N3K B; 2V3N A; 5BYR A; 2UU7 A; 2BGF A; 1D4B A; 1R4N I; 5FR3 A; 4C00 A; 4CO7 A; 4NNJ B; 2KDF B; 1RLF A; 1WJN A; 1I4G A; 5AZH A; 4NJ7 A; 2WX0 A; 2TSS A; 2NTS A; 2WS3 B; 2Y5C A; 1ZPS A; 3SD5 A; 4WIP A; 1P7F A; 1SE2 A; 3P42 A; 2NPT B; 4IDI A; 2G1E A; 4HJK A; 4BKS D; 2RGF A; 4A6Q A; 2PTL A; 5HHD G; 4WJP A; 3PRP B; 5H92 C; 2M0X A; 1V9J A; 4JQW C; 3PLU A; 4A8X C; 2SEB D; 3EEC A; 5EDS A; 2BYV E; 2KLG A; 2BB5 A; 4YT0 B; 2HJ1 A; 4W9H A; 3TEX A; 1SF0 A; 2BYT A; 4HK2 A; 1EO6 A; 1ENF A; 4RGT A; 2AEH A; 2JYE A; 3A4R A; 2AQ2 B; 4NAM A; 2KK8 A; 3DBS A; 4JWU C; 3DWM A; 4NQK E; 3P63 A; 3AEE B; 3RUI B; 3U52 E; 2LWP A; 3GP7 A; 4MH0 E; 4NPN A; 3DBH I; 1VDV A; 4DHJ B; 1E9M A; 2RPQ A; 5TR5 A; 3ML8 A; 3V3X A; 1C76 A; 2HD5 B; 3KUC B; 1L7Y A; 4HCP B; 2BF8 B; 3H7P B; 1E0Z A; 4E71 A; 3T3N A; 3PHW B; 1VJK A; 4HKQ A; 3UGB B; 4HCN B; 3PV1 A; 1L5P A; 2CHW A; 2CU1 A; 4USA A; 3QIJ A; 2E3T A; 3P1M A; 2JPH A; 2LFI A; 1D3Z A; 4A55 A; 2NTT A; 3IBE A; 2QC8 A; 3Q3J A; 3AEC B; 3M95 A; 4RM9 A; 3BVG A; 5AEK B; 3NG0 A; 2LVP A; 2N9L A; 2LRU A; 2ZVO A; 3ENE A; 2WYQ A; 4KIK B; 1D5M C; 2XN9 C; 1UZX B; 1PYW D; 2WXK A; 1JWU D; 4WQO B; 1BML C; 1FFV A; 1HE8 A; 1JW9 D; 2KN5 A; 4P1B C; 2ZZP B; 4ARI A; 1T0R C; 3AE9 B; 3OJ3 A; 1VR9 A; 2KQS A; 4W9L A; 2PEA A; 2I1J A; 2MW5 A; 3Q8E A; 2DX5 B; 3UI3 A; 2LI5 A; 4B9K A; 2WGS A; 3W1S A; 4ZYS A; 1N62 A; 4GOC A; 2JRI B; 3PT2 B; 2MBE A; 1MI0 A; 3CSF A; 3R7Q A; 4K7W A; 4R3D A; 1JWS D; 4P6V F; 1T3Q A; 2J4X A; 1GPX A; 1MHX A; 4EZK A; 2M0A A; 2L52 A; 2BYF A; 3V61 A; 4URK A; 4GSW A; 2IGG A; 4HJG E; 2PVG C; 3ZRF A; 4FHJ A; 2D10 A; 4M00 A; 3NZU A; 3SU8 X; 1FPY A; 1WXQ A; 4FBJ B; 3R2I A; 1AAR A; 5JHB A; 1DOI A; 3VAW A; 2KQ7 A; 5HKH A; 2HJ8 A; 2RPV A; 1VZ8 A; 2WDR B; 1QF6 A; 3WCQ A; 3PS6 A; 5BMH A; 2INN E; 2JVC A; 2CKH B; 2X8X X; 1V1O A; 2C5L C; 3NVY A; 4I6L B; 3IAS 1; 2WHI A; 1V80 A; 1FCL A; 1Y56 A; 2IY1 B; 5L95 C; 3DOW A; 2AX5 A; 1XT9 B; 4PS8 A; 3W5V B; 4ZRK A; 2L32 A; 2AQ1 B; 4BBN F; 1FRD A; 2MP2 A; 3ZVV A; 4WAA A; 4CHK A; 3AMZ A; 3GS2 A; 2KTR A; 2MBH A; 2KMM A; 3W1Y A; 1OEY A; 4HWI B; 3VRA B; 1JCK B; 2C7H A; 4HKZ E; 1V86 A; 2K39 A; 5D7G A; 4A90 A; 4HRS A; 2Z59 B; 2KDM A; 2KN4 A; 3KLS X; 4IWQ A; 3RNB C; 1GNU A; 4REZ A; 2LVQ A; 3RYT A; 1XF5 L; 2GMI C; 2IY0 B; 4HPM B; 1V6E A; 2KWD A; 3BK1 A; 1UGM A; 4JL9 A; 4KDI C; 2V1Y A; 5CHW A; 1TZO A; 1UUP A; 3MTN B; 2IO0 B; 2L1A A; 1E90 A; 4AP4 C; 3L0W B; 3U7Z A; 3C19 A; 4XDC A; 3EFU A; 2GBM A; 4IOI E; 2FID A; 4EZJ A; 1FEH A; 2QIL A; 3RUL A; 1V2Y A; 3IVF A; 2INP E; 1KF6 B; 2FNJ B; 4WWP A; 5G5H A; 2D3C A; 1KJT A; 1SE4 A; 3AED B; 4ARC A; 1FIQ A; 2WXR A; 2KD0 A; 2NCN A; 2K3U A; 2QJL A; 2JU6 X; 3A9J B; 3ZLZ A; 2E6X A; 2J42 A; 2IBI B; 3T3O A; 1EU3 A; 2L76 A; 1KLV A; 3Q69 A; 2BS2 B; 4WJO A; 3ZTD A; 2QDF A; 1SE3 A; 5DPR A; 2KAC A; 2L00 B; 1XCT L; 3VFK A; 4F1S A; 1NVI D; 1HZ5 A; 3MP9 A; 4TMA B; 3AXC A; 2ZCB A; 4IW0 A; 1UF0 A; 1PGA A; 1JRO A; 3I3T B; 3RD2 A; 1TS5 A; 3RT3 B; 4TQ0 A; 3N1X C; 2JX5 A; 1YX5 B; 2D3G A; 2ZEQ A; 3NVV A; 4KGS A; 5JXV A; 3U7D A; 3CST A; 1Q5W B; 3WIM A; 1E7P B; 2EMT A; 3DCG A; 3B08 A; 4IG7 B; 4MEM A; 1UBQ A; 1BUI C; 3NVW A; 4LDT D; 2H88 B; 2DHZ A; 3BZD B; 2OJR A; 1LFD A; 5AZF A; 2KVR A; 3ZKJ C; 3IG3 A; 3AM9 A; 2K25 A; 2MWS B; 1M94 A; 1NI2 A; 1ZDX A; 3UIN B; 3H8H A; 2DWQ A; 2KOX A; 3Q8F A; 2L3Z A; 2BVC A; 4H2A A; 2WXF A; 3L13 A; 4WJN A; 5IA7 A; 2M56 B; 1YIW A; 2DLB A; 4YXD B; 1FXA A; 2LEK A; 2GOW A; 2VZK B; 1IBX A; 2YEP F; 3KWL A; 2B3A A; 2WNM A; 2JWU A; 2KAN A; 5AUI A; 3E56 A; 3HM6 X; 1MJD A; 4AS1 A; 5IO9 A; 3A1Q A; 2BQQ A; 4ANU A; 2MHJ A; 3RZF A; 1E7V A; 2J53 A; 2G45 B; 1STE A; 4XGA B; 3Q8C A; 1JAL A; 4DQO C; 4F8C B; 4D2K A; 4DHZ E; 1JRP A; 2K6Q A; 4ANV A; 1N63 A; 1WZ3 A; 3QCA A; 4YTP B; 4RM8 A; 2OED A; 1WX8 A; 3NHE B; 4RNA A; 4ZRQ A; 3BVM A; 3SDL C; 2J0M A; 1JRU A; 2ONQ A; 3AE3 B; 2KO3 A; 2LD9 A; 3CWI A; 2DEN B; 1J7C A; 1HEZ E; 1I7H A; 4OZC A; 1ACC A; 2L83 A; 1HA5 A; 1J7B A; 3VDZ A; 2J0K A; 2HTH A; 2WXI A; 4YSZ B; 4MSM B; 2CHX A; 2UYZ B; 1NEN B; 1AWD A; 1V81 A; 3DBR B; 3LYY A; 2KLC A; 3RMK C; 1WGK A; 4II2 B; 5DPW A; 4YTN B; 4IWO A; 2KDI A; 3APF A; 4EZL A; 1EWY C; 3OG5 A; 1WX9 A; 4RGN A; 2KDB A; 3TSS A; 1ZGU B; 1LGR A; 2AL6 A; 1TS2 A; 1YD8 U; 3TEZ A; 4ZOH C; 1YN4 A; 3RNA C; 3VR8 B; 3KH0 A; 2V4L A; 3GE3 C; 2KTR B; 3HUI A; 2NBW B; 4DHJ D; 1VLB A; 1UWX A; 3N1Z C; 1D5Z C; 2WXN A; 4OHJ A; 2GLS A; 3R3M A; 3FAH A; 2XK5 B; 5LLI A; 1L6U A; 4MH8 A; 1ZW7 A; 4AOF A; 2ZNV C; 1KOT A; 4BZA A; 3TJP A; 1TKY A; 2KC1 A; 2N4F A; 1KLG D; 2LHD A; 4PYZ A; 4BAX A; 2FAZ A; 4C56 C; 2IJ0 A; 2N1W A; 2GBK A; 3HHM A; 3UQA A; 1UH6 A; 5IP4 D; 1K8R B; 4LK0 M; 4BOS C; 1HQR D; 2KZR A; 3OAW A; 2JZZ A; 2A5U A; 1H4R A; 3NZS A; 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3ZDT A; 1SJE D; 1ZE3 D; 2GI9 A; 2MX2 A; 3PHX B; 5J18 A; 4LJP B; 4LJO B; 1XLQ A; 1U4A A; 1K51 A; 2ZCC A; 3RNE C; 2PJH A; 4JE3 B; 4HXD A; 1WF9 A; 2KQ4 X; 2KVZ A; 5DPT A; 4F7Z A; 3N1Y C; 1IBX B; 5HG2 A; 1J19 A; 1NBF C; 1E8X A; 2ZJD A; 1YQ3 B; 2V3P A; 3EA6 A; 1JQ4 A; 1Z5S B; 1DOX A; 4PT5 A; 1E5W A; 4FAD A; 2ON8 A; 1YJJ A; 2I38 A; 2RSU A; 3A1Q B; 2KJR A; 5D3I B; 2BBC A; 2LAS A; 1WRD B; 5I4D A; 5H8Y E; 2BT6 A; 1RFA A; 2MH7 A; 1OQY A; 3WAN A; 4ACF A; 1Q1O A; 4L23 A; 2LXA A; 4KGR A; 3AE7 B; 2XNA C; 4EEW A; 1R4N B; 2VRR B; 1EF5 A; 2BTE A; 1VZ7 A; 2WXG A; 4WH4 A; 2V3S A; 5HI1 A; 1J8C A; 4JX1 C; 2KNB A; 1CZP A; 3ECI A; 1NEK B; 1WE7 A; 1HXY D; 4DXA B; 1OFF A; 1ZKH A; 3HIZ A; 2DNF A; 3VVW B; 1KM7 A; 3JYU A; 4G3X B; 5JHA A; 2X38 A; 3TCA A; 5EE3 A; 4A9A A; 4MM3 A; 3GZN B; 1FXI A; 1V5T A; 1CMX B; 3KYC D; 4II3 B; 3N20 C; 4B0E A; 4UDU C; 5IN7 A; 4RH6 A; 2N9X A; 2PE9 A; 3AV8 A; 3IAM 1; 1IYF A; 1FM0 D; 4KZ0 A; 2ZW1 A; 4AUQ C; 2XK5 A; 2JYT A; 1KH0 A; 3B2F A; 1WR1 A; 3P2B A; 1WE6 A; 2O2V B; 4LTU A; 3KQ4 A; 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