The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
|
sequence length |
63
|
structure length |
63
|
Chain Sequence |
EVTIKVNLIFADGKIQTAEFKGTFEEATAEAYRYAALLAKVNGEWTADLEDGGNHMNIKFAGK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Evidence for plasticity and structural mimicry at the immunoglobulin light chain-protein L interface
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Fab, light chain
|
| molecule tags |
Immune system
|
| source organism |
Finegoldia magna
|
| total genus |
18
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| structure length |
63
|
| sequence length |
63
|
| chains with identical sequence |
F
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-08-20 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1PGB A; 2ONQ A; 4IKG A; 2PLP A; 3UI3 A; 2I38 A; 2JXT A; 1MHH E; 2IGH A; 4KGT A; 4MAC A; 4D2K A; 1F2R I; 2N7J A; 2ZW0 A; 1C9F A; 1IBX B; 3V3X A; 2NMQ A; 2OED A; 5BMH A; 2J53 A; 1YMH E; 2LHE A; 2EEL A; 2JWU A; 1ZXH A; 1IBX A; 5BMI A; 2IGD A; 1HZ6 A; 5JXV A; 2LHD A; 2J52 A; 2KQ4 X; 2RMM A; 2JU6 X; 4GLS C; 1EM7 A; 2JZP A; 2JSV X; 4HJG E; 4OZC A; 4OZA A; 1JML A; 1F2R C; 2K0P A; 3FIL B; 2LGI A; 1MHX A; 4OZB A; 2KWD A; 1FCC C; 1HZ5 A; 2LUM A; 1FCL A; 1MVK A; 1K53 A; 5HHD G; 3FIL A; 1UWX A; 1GB1 A; 2PW9 A; 2N9K A; 1MI0 A; 1K50 A; 2KAC A; 5HG2 A; 1FD6 A; 1P7F A; 1PGX A; 5HFY A; 1XF5 L; 3GB1 A; 1HEZ E; 1YNT E; 1D4B A; 2ZW1 A; 1GB4 A; 1QKZ A; 2PTL A; 4IOI E; 2GI9 A; 1XCT L; 2KN4 A; 3MP9 A; 2GB1 A; 1MPE A; 1XCQ L; 2QMT A; 4KGR A; 5BMG A; 1IGC A; 4KGS A; 2I2Y A; 2KDM A; 2RPV A; 5HI1 A; 1P7E A; 2QSD A; 4HKZ E; 4WH4 A; 2ON8 A; 2IGG A; 1IGD A; 1K51 A; 1KH0 A; 1K52 A; 1PGA A; 1Q10 A; 2N9L A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4M01 A; 2G4D B; 1TZO A; 3H7P A; 1E0Z A; 2K6Q A; 2CJO A; 1WRD B; 5FR6 A; 4HWI B; 2WXG A; 3V60 A; 1C3T A; 3BYY B; 1T6B X; 3L4P A; 2J53 A; 2MP2 B; 3U4E G; 3RZW C; 1S3S G; 5FK9 C; 3NZU A; 4GMV A; 3AEE B; 1LGR A; 1YN4 A; 2X38 A; 1YQ4 B; 3E9S A; 4K81 A; 1QIL A; 1N63 A; 3A9J A; 3PGE A; 1GPX A; 5FR3 A; 1KFY B; 1C1Y B; 1D6E C; 2V3N A; 4LNI A; 4O1N A; 4W9F A; 1NDD A; 4DHJ D; 3VRB B; 3FC4 A; 1MJD A; 3L54 A; 1J0G A; 1TKE A; 2BS4 B; 5C2T B; 5EE0 A; 4FJV B; 4RGN A; 5HHD G; 1T0S C; 1MI0 A; 2DZJ A; 3Q8C A; 1L0Y B; 2K1F A; 2AL6 A; 2AQ1 B; 1ET6 A; 4XC2 A; 2L83 A; 2L0F A; 3BVM A; 4YTM B; 1KLG D; 1OTR B; 1TS3 A; 1L0X B; 3IBE A; 4CQN A; 2W55 A; 5LXI B; 2BKF A; 2QIE B; 1JWM D; 4PS7 A; 4P16 A; 2UYZ B; 5D3I B; 4USA A; 2NTT A; 1FM0 D; 2H88 B; 2K8C A; 4G11 A; 2KQ7 A; 4MGY E; 1I4R A; 3PZD A; 1VD2 A; 3ZVV A; 2BGF A; 4YTP B; 1KRH A; 2J0K A; 5AZH A; 4AP4 C; 1GC7 A; 3TSS A; 4KSK C; 2DAF A; 4EE2 A; 3QJZ A; 5C1Z A; 4HK2 A; 2YEP F; 3V6E B; 4M8N A; 1YX6 B; 4I6N B; 3TL5 A; 2R61 A; 2A4Z A; 1CK1 A; 4P1B C; 2GMI C; 3ZTD A; 1QF6 A; 4FUL A; 3RD2 A; 4ZHO A; 5I4D A; 1GAQ B; 4XX5 A; 3DBR B; 3MHZ A; 4OVV A; 3VQI A; 2M4N A; 4MM3 B; 4FLH A; 4B0M A; 4S0R A; 3URY A; 1AWD A; 3IG3 A; 2WX1 A; 3H8H A; 2L76 A; 3LXF A; 2WLB A; 2WXI A; 1FCC C; 2JYE A; 2LUM A; 1MVK A; 3PRE A; 2WU2 B; 4DK5 A; 2C7H A; 2LVQ A; 1UEL A; 1N5X A; 2C7M B; 3UGB B; 5DPT A; 4K7U A; 2PVG C; 4DXG A; 1U4A A; 3ETR A; 1BT0 A; 4IWO A; 1KJT A; 4LDT B; 3TBL D; 1F52 A; 2KNB A; 1SEB D; 1C4C A; 2IO3 B; 2QMT A; 3PHW B; 3WIM A; 1DYQ A; 2CHZ A; 2KX0 A; 2LWP A; 4WWN A; 4P6V F; 4A3P A; 3ML9 A; 4US8 A; 3Q8A A; 2DZM A; 1D5M C; 2WHI A; 3WAP A; 1V5T A; 2M19 A; 3LB8 C; 4ANW A; 4RF0 A; 1R7S A; 3AV8 A; 4CYE A; 4M8M A; 3DWM A; 1XLP A; 2DX5 B; 4ACF A; 4US9 A; 3RT3 B; 3L10 B; 4NQL B; 1P98 A; 2M1M A; 1FXT B; 1UF0 A; 2LJI A; 3BK1 A; 4XWW A; 1IPG A; 1NVI D; 2MBQ A; 2DZK A; 1EO6 A; 2LVP A; 4ZRQ A; 1ZGU B; 3PRP B; 3BY4 B; 3EGR A; 1N60 A; 3UQA A; 2ACZ B; 2LGY A; 2DYO A; 3SR6 A; 3EEC A; 2Z0E B; 4DHJ B; 3I9V 1; 2GBJ A; 2IGD A; 4GIV A; 4JWS C; 4JGH B; 5J18 A; 1C77 A; 2WXF A; 1SE2 A; 4HDO A; 1GG3 A; 2MBE A; 1WX7 A; 2JU6 X; 2ICI A; 3AEA B; 1FMA D; 3LJ3 A; 5JHB A; 2KWV B; 4HJG E; 3PHX B; 4A3O A; 3BK2 A; 1AAR A; 3AMZ A; 3L0W B; 2Y5B B; 4HLE A; 4ZYS A; 3HM3 A; 3VH3 B; 1OFF A; 2WXP A; 2HJ1 A; 1Z5S B; 2MBO A; 2Y5C A; 5EDS A; 1V1P B; 3L08 A; 4W9I A; 4MEM A; 4AWJ A; 4N6E B; 2D10 A; 4HCN B; 1HTO A; 3ZNI D; 2O6V D; 3UF8 A; 2KVZ A; 1T0Q C; 4C4V B; 3KUD B; 4M0W B; 1QKZ A; 2WXR A; 3DBR I; 3RCZ A; 1S1Q B; 1R4N B; 1OEY A; 1ET9 A; 4WWP A; 2J4X A; 1XCQ L; 3BVG A; 4BKS D; 1FFU A; 3DBH I; 4DWF A; 3MJ5 A; 1AYF A; 3VTW A; 2OHF A; 5MPO A; 1PUT A; 4XGA B; 2IGG A; 2M56 B; 1E5W A; 2AQ2 B; 1UGM A; 2WU5 B; 1H4R A; 3C8Y A; 4GDK B; 4TSS A; 1RYJ A; 1IUE A; 3HVZ A; 1XD3 B; 3ZNH B; 2GOW A; 5KHO A; 2KFK A; 4W9K A; 5CX3 A; 3BZD B; 5BO4 B; 3U7D A; 5G2N A; 4K7W A; 3MTN B; 4EEW A; 2KMM A; 4BKG A; 3ZO5 B; 2QEJ C; 3Q14 C; 5JHA A; 4F7Z A; 4RGT A; 2SEB D; 2KJH B; 4KKI A; 4OVU A; 1ENF A; 4RCO A; 3AE1 B; 1LXD A; 2RDG A; 2RDH A; 2KJR A; 4WAA A; 2XNA C; 1WWT A; 1WYW B; 5BYQ A; 1C76 A; 2O2V B; 2RMM A; 3VTV A; 4CO7 A; 3HVD A; 3W1S C; 3QC8 B; 2EKE C; 2NCN A; 1J19 A; 4LNF A; 4FN2 A; 3JSV A; 2KQS A; 4ZRJ A; 3KWV A; 3M95 A; 1V86 A; 3O65 B; 2JVC A; 3R3M A; 1UWX A; 2J0M A; 3LYY A; 3Q3O C; 3H6N A; 4XE0 A; 2QIL A; 4NPN A; 3GB1 A; 2ZPN A; 1SE9 A; 3NVW A; 1HEZ E; 3N30 A; 2L7R A; 1PFD A; 3TCA A; 1TS5 A; 1RRB A; 2ZW1 A; 1I4P A; 1GB4 A; 3TMP B; 2IO2 B; 1B1Z A; 2BWE S; 2REX A; 5IN7 A; 4OHJ A; 1GOZ A; 4N9F 4; 3MJW A; 3BVZ A; 4CHK A; 3Q3J A; 1E8Z A; 1TBE A; 4HKZ E; 2MJ3 A; 3Q3N C; 4GN1 A; 3X23 A; 1KF6 B; 5FKA C; 1E6E B; 4ANU A; 5GXG B; 5LLI A; 4NQK E; 3EA6 A; 1PGA A; 4GB9 A; 2MJD A; 4HRO A; 3W9C B; 3AE5 B; 4B6W A; 2WDV B; 2ZNV B; 4LTU A; 2V3P A; 3UI3 A; 2PLP A; 3CWI A; 1R4N I; 4N58 A; 4MGI E; 2KFJ A; 1R4M B; 5LXH A; 4LCD E; 1ZXH A; 3A4S C; 1JRO A; 3ZQ4 A; 1LM8 B; 2DBY A; 2LJ5 A; 3Q6B A; 3WAO A; 4IDI A; 1I42 A; 1EWY C; 3KWL A; 4FHJ A; 3OLM D; 4NAW B; 2IPK D; 3DDC B; 2LEK A; 4GU2 A; 2LGD A; 4WQO B; 3A33 B; 3APD A; 3QHT A; 2G1E A; 2DZI A; 1UWM A; 2O6V B; 4KIK B; 4FXC A; 1K53 A; 2K25 A; 1GB1 A; 4ZDV A; 2K5P A; 2WXQ A; 3PPA A; 1YJ1 A; 4WWO A; 3ZDM C; 3RZF A; 3A1Q A; 3ENE A; 4MEL A; 3IHP C; 4FA6 A; 4IOI E; 4MDK E; 2KMA A; 3NVZ A; 3CF6 E; 4GDL A; 1C78 A; 3KW5 B; 3AEC B; 2Y3A A; 4PYU A; 2JXX A; 5BMG A; 1Q5W B; 1RFA A; 2INP E; 1V5O A; 2NVU I; 1V6E A; 3NHE B; 3OJ4 B; 5IKC M; 4I6P A; 5DPS A; 2CHX A; 4IW0 A; 4XZ4 A; 5CHW A; 3CSF A; 2RDB C; 2WXN A; 2MW5 A; 3C19 A; 4ARI A; 4EZL A; 4HJK A; 3QK0 A; 3RFZ B; 2AEH A; 3PRZ A; 3V05 A; 1SE3 A; 1KLU D; 5E6O A; 2LFI A; 2MEK A; 1AW7 A; 1C79 A; 2MJE A; 3JYU A; 2O2V A; 3A4R A; 4XDD A; 4J3O D; 3P4Q B; 3WCQ A; 1E10 A; 1MG8 A; 4A90 A; 2EEL A; 4BBN F; 1QZE A; 1ESF A; 3S2A A; 4BAX A; 3BII D; 4BVU C; 1FIQ A; 1LO5 D; 3VUY A; 2KWC A; 2KVR A; 3HM6 X; 2FCQ A; 3IAS 1; 3KYC D; 4ZRP A; 2Q5W D; 4TKN A; 3PVL A; 1WGH A; 3VXW A; 3Q8B A; 1L7Y A; 2G9H D; 2V1Y A; 3U7Z A; 2FBW B; 1OQR A; 3AN1 A; 1YOV B; 3H7S A; 2KWD A; 2I1K A; 2KT7 A; 3KQ4 A; 1R4M I; 3GS2 A; 1WI0 A; 1GC6 A; 5LNK 1; 3FKY A; 4ASW C; 1JW9 D; 1P7F A; 3VH4 B; 3P4P B; 1RFK A; 3B1L X; 3V6C B; 1CJE A; 3PZ7 A; 1QOB A; 4KV2 A; 1SGH A; 1YNT E; 3RPF C; 4A20 A; 5JZE B; 3W5U B; 2DYM A; 4PT5 A; 2H89 B; 3W1S A; 1T5X D; 1WJU A; 1FEH A; 3GE3 C; 3U30 A; 1XEE A; 3T8M A; 4LNK A; 1ZPS A; 1QQR A; 3AE7 B; 2K22 A; 4A8X C; 2BB6 A; 1WXM A; 3NY5 A; 1FRD A; 2ON8 A; 3L16 A; 2ZCB A; 4DBG A; 1Y56 A; 4JX1 C; 3KLS X; 2V0G A; 1HXY D; 1WM3 A; 1E7V A; 4MJS A; 2N7E A; 4W9C A; 3SHQ A; 3SU8 X; 2SAK A; 4W9H A; 3B0A A; 4S17 A; 1ZW7 A; 3KYD D; 1ZDV A; 5G5G A; 2KN5 A; 4P1C C; 4LNO A; 4DQO C; 1IBX B; 4RH6 A; 3AEG B; 1YQ3 B; 4C7Y A; 1UBI A; 2CR5 A; 3ECI A; 1VLB A; 1YMH E; 3RNF C; 1NYR A; 5H8Y E; 2GRI A; 2LHE A; 2L32 A; 3N1X C; 2KDE B; 3TJP A; 1DOY A; 2Y5P A; 3KUC B; 3T3N A; 1P1A A; 3FAH A; 2MQJ A; 1F77 A; 4HRS A; 4N59 A; 1P0R A; 2MA9 B; 3R2T A; 1OQQ A; 1M4V A; 1VZ8 A; 4NY0 A; 4RNA A; 3HRD D; 3ZRF A; 2VRR B; 1TY2 A; 4NNJ B; 2PE9 A; 3GP7 A; 2NBU A; 3AI5 A; 4L23 A; 4ICV A; 3ZUN A; 2KDF B; 2BPS A; 1L4Z B; 2ZEQ A; 2N9K A; 4HPM B; 3NZS A; 4EZK A; 1K50 A; 4LJO B; 4ZRK A; 3ABV B; 1XF5 L; 2PIA A; 5HKH A; 1FNU A; 2DYB A; 1ZKH A; 3PT2 B; 2AL3 A; 4G0N B; 4K3C A; 4HKQ A; 1RWS A; 3OWE B; 3U52 E; 2KO3 A; 3DBH B; 2IO1 B; 1A70 A; 4MH8 A; 2DLB A; 3PRM B; 2I2Y A; 2JRH A; 2K6D B; 4MGK E; 4BOS C; 3T3O A; 2RD0 A; 2ZVO A; 1L5P A; 2J42 A; 1SJE D; 2WDQ B; 3NG0 A; 4OVZ A; 3ZIM A; 4RGO S; 2D3C A; 2JXT A; 2IGH A; 2HDE A; 1XT9 B; 1UZX B; 1I4X A; 3RNB C; 1F2R I; 2KK8 A; 1JAL A; 5GMV A; 3AEB B; 2JX5 A; 2IZV B; 3SFE B; 1YN5 A; 3GOE A; 4YT0 B; 1UH6 A; 2JWU A; 4PS8 A; 3W1Y A; 2AWT A; 3X0W A; 3NZ3 A; 2JYT A; 2MP2 A; 2HJ8 A; 1N62 A; 5AUI A; 2MWS B; 5JXV A; 1KM7 A; 1E9M A; 3W5V B; 2KKC A; 3ZYY X; 1EU4 A; 1M94 A; 1EM7 A; 1H8C A; 1A5R A; 1LFD A; 3I63 C; 2L05 A; 3A9K B; 3AE9 B; 2NS5 A; 4YSX B; 5IOI A; 1Z2M A; 2CU1 A; 1L0V B; 3R2I A; 2LXA A; 4JE3 B; 2PKO A; 2GBR A; 1ZDX A; 1QLB B; 3DOW A; 4I6L B; 1K8R B; 1WIA A; 4ZYN A; 5HFY A; 2WX0 A; 2UU7 A; 4YWG G; 3NS1 A; 4YXD B; 2PTL A; 4URK A; 2JZZ A; 1WJ4 A; 3E56 A; 1JRP A; 3AE8 B; 1IGC A; 2XBB C; 4HPP A; 1VRA B; 5HI1 A; 2VH1 A; 1P7E A; 2JUO A; 2ZJD A; 3DPD A; 4EZJ A; 3RNE C; 1XLQ A; 5IAA C; 1K51 A; 3HK0 A; 4ARC A; 4RM8 A; 3M63 B; 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4NZL B; 4WQM A; 4HEA 1; 2J7Q B; 4NJ6 A; 4A55 A; 2C9W B; 3AED B; 2A5U A; 2L0T A; 2NBW B; 4ITK A; 5AZG A; 5BMI A; 1EF1 A; 2D2Q A; 4IM3 A; 2DWQ A; 3A9J B; 1VZ6 A; 4YSY B; 1WZ0 A; 2GBN A; 2K8B A; 5J2R A; 3RUI B; 1V8C A; 1SXT A; 1I4H A; 2LRU A; 3H9D A; 4OZC A; 2IJ0 A; 2LGI A; 1YJI A; 2K3U A; 2LD9 A; 4R3D A; 1GNU A; 4IC7 B; 3ZTC A; 2BS3 B; 2EKI A; 2BW2 A; 3IXS A; 4IWQ A; 2NPT B; 3MFG A; 3I57 A; 1FPY A; 3AEF B; 1V1P A; 1V81 A; 5JH5 C; 4NJC A; 3PLU A; 2KC2 A; 1FXA A; 4IM0 A; 4MT5 A; 3R8B A; 4AJY B; 4LK0 M; 5D94 A; 3ML8 A; 2IY0 B; 1XCT L; 3V62 A; 2XN9 C; 1XLO A; 4C4V A; 2Z59 B; 4M0W A; 1MPE A; 2YLM A; 4M00 A; 4TMA B; 1WH3 A; 1VCB A; 3L17 A; 4HDQ A; 2D11 A; 4NJ7 A; 2MRP A; 2BQQ A; 2W3S A; 3P1M A; 2N1V A; 2C60 A; 4REZ A; 3QAQ A; 2K8H A; 1TKY A; 1QOA A; 1E8W A; 1IGD A; 3RI7 C; 2WDR B; 2MX2 A; 2LGS A; 4OW0 A; 4WAF A; 4X57 B; 4GDK A; 1SJH D; 1MHH E; 1F9J A; 4ANV A; 4M02 A; 1PDX A; 2CU3 A; 2FID A; 2LRW A; 3Q69 A; 2N9P C; 3VTU A; 1WY8 A; 3TIX A; 5L95 C; 3NRZ A; 3IT6 B; 1E8Y A; 5E6J A; 2K9X A; 4GXB A; 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