The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
|
sequence length |
63
|
structure length |
63
|
Chain Sequence |
EVTIKVNLIFADGKIQTAEFKGTFEEATAEAYRYAALLAKVNGEWTADLEDGGNHMNIKFAGK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Evidence for plasticity and structural mimicry at the immunoglobulin light chain-protein L interface
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Fab, light chain
|
| molecule tags |
Immune system
|
| source organism |
Finegoldia magna
|
| total genus |
18
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| structure length |
63
|
| sequence length |
63
|
| chains with identical sequence |
F
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-08-20 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2JU6 X; 1FD6 A; 4GLS C; 2NMQ A; 2RMM A; 1HEZ E; 1MHX A; 2J53 A; 2LUM A; 2GI9 A; 1YMH E; 1FCL A; 2ONQ A; 5JXV A; 2LHD A; 1XCQ L; 1YNT E; 1MI0 A; 1IBX A; 1Q10 A; 5BMI A; 4HKZ E; 1K53 A; 2IGG A; 2QSD A; 1D4B A; 2QMT A; 2KDM A; 4OZA A; 4MAC A; 1KH0 A; 1PGX A; 1IBX B; 2J52 A; 2KN4 A; 2JZP A; 1HZ5 A; 2LGI A; 1ZXH A; 2LHE A; 2PLP A; 1K50 A; 2N9L A; 2KQ4 X; 2KWD A; 4HJG E; 4KGT A; 2IGD A; 2N7J A; 1MPE A; 1P7F A; 3UI3 A; 4D2K A; 1UWX A; 1F2R I; 1IGD A; 1C9F A; 1F2R C; 2I38 A; 1HZ6 A; 2JXT A; 2ON8 A; 1QKZ A; 4KGR A; 1K52 A; 1GB4 A; 4OZC A; 4WH4 A; 2JWU A; 2I2Y A; 4IOI E; 1PGB A; 5HG2 A; 3MP9 A; 3FIL A; 2K0P A; 1MVK A; 3GB1 A; 2ZW1 A; 5BMH A; 2EEL A; 2KAC A; 2N9K A; 5HFY A; 3V3X A; 3FIL B; 1PGA A; 4IKG A; 1IGC A; 1MHH E; 1XCT L; 2GB1 A; 2OED A; 1GB1 A; 2IGH A; 4KGS A; 1JML A; 1XF5 L; 4OZB A; 1K51 A; 1P7E A; 1EM7 A; 2PTL A; 5HHD G; 5BMG A; 1FCC C; 2PW9 A; 2RPV A; 5HI1 A; 2JSV X; 2ZW0 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1MFW A; 2JZ3 B; 4M0W B; 1V1P A; 4E3C A; 1SGH A; 3U7Z A; 3DBL I; 2C7N B; 4DXA B; 1P9D U; 2MH7 A; 1XEE A; 4LNF A; 5JH5 C; 5JXV A; 2C7M B; 2LZ6 A; 3RUI B; 3QAQ A; 1U4A A; 3EA6 A; 3K9O B; 3RNB C; 2V4I B; 2KLC A; 3OAW A; 1F0Z A; 5TSS A; 4WQM A; 1JRO A; 4B6W A; 2L8J A; 2CU1 A; 2BWF A; 5G5G A; 1QOA A; 2PLP A; 3MJW A; 2BYT A; 4DHJ B; 2ZPY A; 4HPP A; 3KYD D; 1RAX A; 1AYF A; 1TGZ B; 1D5X C; 3VAW A; 5LNK 1; 1DOY A; 1UBI A; 3UI3 A; 5I4D A; 4NAW B; 2YVC A; 2IJ0 A; 2HE7 A; 4DQO C; 1OEY J; 1ZOY B; 1GAQ B; 2D3B A; 3ABV B; 1GB4 A; 2KOX A; 4FJZ A; 3ML9 A; 3KQ4 A; 2I2Y A; 3A1Q A; 1N63 A; 1Q1O A; 1E5W A; 2MP2 A; 2A4Z A; 3TL5 A; 4Q2J A; 2N1W A; 4TSS A; 3RT3 B; 1IYF A; 4M8M A; 2GMI C; 3QA8 A; 2IGH A; 4NQK E; 1JML A; 3DBL B; 1V9J A; 3M3J A; 1D5M C; 3UIP B; 2R2Q A; 4OVV A; 4XGA B; 4O1N A; 4EZL A; 4MH8 A; 3AI5 A; 4OVZ A; 1FNV A; 3ZDM C; 3RFZ B; 1BXT A; 2INC C; 2ZW0 A; 2W3R A; 3KYC D; 2JXX A; 1V97 A; 2I1J A; 1HEZ E; 3UGB B; 2WXH A; 1ZPS A; 3PZD A; 2PEA A; 3PLU A; 2QEJ C; 3IFW B; 4MH0 E; 1XLP A; 1TJE A; 1OTR B; 1NEN B; 2WDV B; 1MI0 A; 1E0Z A; 2D3A A; 2YEP F; 4AUQ C; 2WXL A; 5TR5 A; 4AJY B; 1WJ6 A; 1UNS A; 4TQ1 A; 1JRU A; 3W9C B; 2REX A; 4RF1 A; 3TSS A; 2WX1 A; 2KMC A; 3MHZ A; 2LRW A; 4JX1 C; 1R4M I; 5L95 C; 1KFY B; 4TV3 A; 5E6P A; 3AU5 A; 1ZDX A; 2KKC A; 1UBQ A; 2QHO A; 1I4P A; 2D3C A; 1XXG A; 4K1R B; 5AZF A; 2ZNV C; 3PRM B; 1TBE A; 1WY8 A; 3ETR A; 4URK A; 1I7H A; 5LLI A; 3X0W A; 4WAA A; 3ZNH B; 3MP9 A; 3TIX A; 1WE6 A; 4JLC A; 1DOX A; 2K5P A; 4JQW C; 5D7G A; 5T8I A; 4WJP A; 2PJH A; 4HVB A; 4ZHO A; 1P3Q U; 1UGM A; 4A3P A; 1F77 A; 3RN9 C; 4A6Q A; 1TY2 A; 2MLB A; 4GDL B; 1KM7 A; 3RNF C; 4IW0 A; 1UEL A; 4HLE A; 1VZ8 A; 2M19 A; 2PE6 B; 3U30 A; 2LEK A; 5BMG A; 4N59 A; 2H89 B; 2JZZ A; 1L0Y B; 2WXI A; 4W9F A; 4ZRJ A; 1YX5 B; 2BYV E; 5G55 A; 2VRR B; 2AL3 A; 5DPR A; 2RD0 A; 3NVY A; 3BYT B; 1SXT A; 1HXY D; 2G1E A; 2LFI A; 2LUM A; 1E7P B; 4S17 A; 2LWP A; 3L16 A; 1WGR A; 4B9K A; 1SE4 A; 5BYS A; 1XLQ A; 1R4M B; 4IUM B; 1NI3 A; 4LDT B; 4OW0 A; 3SDL C; 3PV1 A; 3I63 C; 1V6E A; 4MDK E; 1GUA B; 2KDF B; 1MG8 A; 2IO3 B; 1E7U A; 2PPH A; 1J7A A; 1KLU D; 1IPG A; 2N7D A; 3EEC A; 3IAS 1; 4KVG B; 3H9D A; 3N20 C; 2LVO A; 4OZA A; 1DGJ A; 2OHF A; 2AWT A; 4MGY E; 5FKA C; 1EU4 A; 3L0W B; 2J0K A; 2LHE A; 4AS1 A; 3P4Q B; 2IBI B; 1JWM D; 3P4S B; 2KWD A; 2EKE C; 1CJE A; 2JQR B; 3NS8 A; 3P4P B; 4QAY A; 3MTN B; 3GOE A; 1C3T A; 3LDZ E; 2R2O A; 1C9F A; 1JWB D; 1ROE A; 2DZK A; 4LCD E; 1WXS A; 2DAF A; 2JXT A; 3JSV A; 5J2R A; 2SEB D; 1FPY A; 3ZO5 B; 4IDI A; 4ZRK A; 1RYJ A; 4XDD A; 3PO0 A; 4P6V F; 2L05 A; 4HEA 1; 3BY4 B; 3DHH C; 2WGS A; 3HVD A; 3W5V B; 4YTN B; 2NTT A; 1SB3 C; 1L7Y A; 2X38 A; 2XN9 C; 3AV8 A; 3ZXR A; 3Q8B A; 1RM6 C; 2L32 A; 2L1A A; 3RNA C; 2AQ2 B; 3N3K B; 2N0S B; 4EFO A; 3BIN A; 2BS2 B; 4N58 A; 3AXC A; 1R4N I; 3FAH A; 2KN5 A; 1UUP A; 2IZV B; 5CTR C; 1J7C A; 2W55 A; 1H8C A; 2OOB B; 3VUX A; 2NMQ A; 5EE1 A; 3RNE C; 1SJH D; 3Q14 C; 2KTR B; 2KX0 A; 2WDQ B; 4BVU C; 1V80 A; 4LDT D; 2MX2 A; 1YN5 A; 1XCQ L; 1WYW B; 1JRP A; 3AEG B; 1YN3 A; 1L5P A; 4WUR A; 3M63 B; 2QSD A; 2HJ8 A; 1D4B A; 2K9X A; 4I6N B; 2W54 A; 4K7U A; 5BYR A; 2D11 A; 5EE0 A; 2LGI A; 1TZ1 A; 1WWT A; 3T9L A; 4KSK C; 3P4R B; 2MHJ A; 3S2A A; 3V62 A; 4P7I A; 4P16 A; 4KGT A; 4LLG M; 1WRI A; 3JYU A; 3ZYY X; 3AE7 B; 1LFD A; 1WM3 A; 2N7J A; 1MPE A; 3GE8 C; 3ZGZ A; 2IO0 B; 1VD2 A; 5G5H A; 3U4E G; 3ZNG C; 4P1B C; 2LGD A; 1QKZ A; 3AEB B; 4N9F 4; 3RMK C; 4HDQ A; 1NI2 A; 1SE3 A; 2WXG A; 2RGF A; 2PE9 A; 2IDY A; 3FIL A; 2W82 A; 3D32 A; 4DWF A; 3H8H A; 1MVK A; 4JL9 A; 4C56 C; 2EEL A; 1HQR D; 3PTF C; 1R4N B; 1FXT B; 3EUB 2; 3T8M A; 1D3Z A; 1L6U A; 1PGA A; 1AN8 A; 2KJ6 A; 2FIF A; 2LXA A; 4KKJ A; 4ZDV A; 2MQJ A; 3N1Y C; 4RCO A; 5DPS A; 4PS7 A; 2M4N A; 4WWO A; 1I4Q A; 1OFF A; 3L17 A; 5D94 A; 3Q69 A; 2RPV A; 3P2B A; 1H4R A; 3R2T A; 1ET6 A; 2PKO A; 2VH2 A; 4XC2 A; 5AUI A; 2JU6 X; 2C7H A; 5E6N A; 4HXD A; 2V3S A; 1E7V A; 3VRA B; 3NS1 A; 2KMA A; 1TS4 A; 3R3M A; 2HTH A; 3ZKJ C; 1TT5 B; 3ZDT A; 4REZ A; 1ET9 A; 2E3T A; 4GDK A; 4A90 A; 2K8B A; 4EZK A; 2FUH B; 2Y5B B; 1SEB D; 3ZRC A; 3AE5 B; 1QF6 A; 2KVZ A; 1KH0 A; 2WQY B; 3HM3 A; 1IBX B; 1ZUD 2; 2BB5 A; 4BFR A; 1YX6 B; 4C7Z A; 1WGY A; 1K8R B; 2O6V B; 3ZW3 A; 2NBW B; 4XDC A; 1T6B X; 2RSU A; 5J18 A; 3PS6 A; 4RGN A; 3AUL A; 1KLV A; 2KFK A; 3B08 A; 2K6Q A; 2M56 B; 1UWX A; 2FE8 A; 4US9 A; 1I4R A; 3B1L X; 5IAA C; 5D6J B; 3Q8C A; 4K7S A; 3V6C B; 3ENE A; 1M4V A; 1ACC A; 4MEL A; 4ANX A; 4IWO A; 4ZYN A; 3GB1 A; 5BMH A; 3QK0 A; 2LJI A; 1KTK A; 1N5X A; 3Q6B A; 1C1Y B; 2ZZP B; 1FRD A; 2XNA C; 3WCQ A; 2KO3 A; 4OZB A; 1RLF A; 2K25 A; 4K3C A; 2BBC A; 3RNC C; 4AOF A; 2K22 A; 4FUL A; 1VZ7 A; 4NNJ B; 2WWZ A; 3WAL A; 2X8X X; 3PHW B; 4ZHP A; 3LXF A; 1MHX A; 3NVV A; 1F1H A; 3DOW A; 3A9K A; 2YLM A; 1OQR A; 5D3D A; 2V3P A; 1FNW A; 4NJC A; 4C4V B; 2MBB B; 1L6V A; 2KQS A; 3PZ8 A; 1N5W A; 1Q0W B; 4P1C C; 2OJR A; 5DPW A; 5FR6 A; 2N9X A; 1EWY C; 1C79 A; 2O6V D; 3IHP C; 2JUO A; 3CSF A; 3NY5 A; 2IO2 B; 1GG3 A; 4BBN C; 2QIL A; 1F52 A; 1ZDV A; 4HK2 A; 1HE8 A; 3VRB B; 1QOF A; 3AE2 B; 4FJY A; 4RFB A; 4WWN A; 3VDZ A; 2CR5 A; 4EEW A; 1WMH A; 4II3 B; 3GS2 A; 3AEF B; 4HRO A; 4FLH A; 1LQB A; 1KLG D; 4FBJ B; 4I6P A; 4KZ0 A; 2W9N A; 1SF0 A; 3RYT A; 4CQN A; 4A20 A; 2IPK D; 2GRI A; 2ZW1 A; 1WR1 A; 1BUI C; 1C4A A; 3VTW A; 5HFY A; 2KWV B; 5FK9 C; 1WJ4 A; 2MW5 A; 5IP4 D; 2FAZ A; 2L00 B; 3AE1 B; 1EO6 A; 1GB1 A; 1VCB A; 3MFG A; 1E90 A; 4C4V A; 2VZK D; 3L13 A; 5LXI B; 2AQ1 B; 5LXH A; 1EM7 A; 3EFC A; 3HVZ A; 3VR8 B; 2RDB C; 2KYW A; 3AEE B; 4IC7 B; 4M0W A; 3C19 A; 1AAR A; 3DVG X; 4RM9 A; 5IO9 A; 3QC8 B; 3BII D; 3KWL A; 4GB9 A; 3AED B; 4FN2 A; 3JVZ X; 4AJW A; 2IND C; 4WAF A; 2KJR A; 2XBB C; 1QT9 A; 1WIA A; 2NVU I; 3QAR A; 4ARC A; 3H7P B; 3X23 A; 1NYQ A; 1UH6 A; 2BKF A; 2FCS A; 2FCQ A; 3DBR I; 3H6N A; 1TTN A; 2G4S A; 4DBG A; 4HKQ A; 3ZJU A; 3WA0 A; 3RPF C; 2KZR A; 2NPT B; 1NVI D; 3AEA B; 3BVM A; 2JYT A; 4ACF A; 1TKY A; 3PVL A; 3WAO A; 4NAW A; 4PYU A; 3VUY A; 1TZO A; 3GZN I; 5H92 C; 1EUV B; 4WWP A; 1VLB A; 3MC0 B; 2UU7 A; 3DQV A; 5H8Y E; 3T3O A; 1Y56 A; 5MPO A; 3KVF B; 5HG2 A; 1ZP0 B; 1NBF C; 4ITK A; 2N9K A; 5KHQ A; 3OJ4 B; 4MJS B; 1FNU A; 2DLB A; 2M0A A; 1L4Z B; 1FEH A; 3KH0 A; 4FAD A; 2V0G A; 2Z0E B; 4DXG A; 2BYF A; 1GC7 A; 2KVR A; 2N9P C; 4DDG D; 1RWS A; 1QQR A; 3O65 B; 4GLS C; 1DYQ A; 3DBR B; 4KIK B; 1QOG A; 2AEH A; 4TQ0 A; 2M0X A; 2JRH A; 4FHK A; 1SJE D; 5AUK A; 2MWS B; 1TS2 A; 3P42 A; 2QCZ A; 3MC9 A; 3B9J A; 3W1S A; 2DHZ A; 1YIW A; 2KJH B; 2KMM A; 5AEK B; 3GZN B; 2PVO D; 4H2A A; 2KDM A; 3TBL D; 4IWQ A; 1PGX A; 3R2I A; 2DX5 B; 4NY0 A; 4ANW A; 3VTV A; 3TEW A; 3PGE A; 2N9L A; 3DBH I; 3UQB A; 3L4P A; 4KDL B; 2IGD A; 4MJS A; 2ZPN A; 2NTS A; 4YXD B; 4WJO A; 3PRE A; 2RDG A; 1PYW D; 2LJ5 A; 4GMV A; 4A3O A; 2LVP A; 1FFV A; 2LGS A; 2UYZ B; 4N6E B; 1TYG B; 4ANV A; 1HZ6 A; 5G2N A; 3VFK A; 4E71 A; 4AWJ A; 3Q3F A; 2D10 A; 4RNA A; 3E56 A; 2MJE A; 4A8X C; 1E8X A; 2KHW B; 3B0A A; 4MM3 B; 2KDE B; 1KF6 B; 2CU3 A; 1OEY A; 4YSX B; 5E6O A; 3R8B A; 2K0P A; 3FKY A; 3SHQ A; 2QDF A; 3PT2 B; 1FO4 A; 4GDL A; 4MT5 A; 2JY6 A; 1PQS A; 1J8C A; 3A33 B; 2INN E; 2NR2 A; 4L23 A; 1V49 A; 1ZE3 D; 2BGF A; 2K1F A; 3RNG C; 3JW0 X; 2BS3 B; 3T3N A; 5IOI A; 3DVN U; 2PTL A; 1EF5 A; 2L0T A; 2PW9 A; 3NHE B; 1UD7 A; 4NAM A; 5BMI A; 1C77 A; 1XT9 B; 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3UIN B; 5FR3 A; 4YT0 B; 2LHD A; 2YEP B; 1YNT E; 4B0M A; 2WU5 B; 3QQ8 B; 1LM8 B; 1YJI A; 3FC4 A; 2D07 B; 1JWA D; 2O2V B; 4NZL B; 4US8 A; 1SE9 A; 3Q3N C; 3QX1 A; 3I5J C; 5BYQ A; 2MBQ A; 4ANU A; 2B3A A; 2FCN A; 1K50 A; 1GNU A; 2NBU A; 3C8Y A; 1RFK A; 1HTO A; 3RUL A; 3R7Q A; 3A9J A; 2FID A; 2NCN A; 1PFD A; 2KWU B; 3NOB A; 4LJP B; 1FXA A; 2ON8 A; 4RM8 A; 1VR9 A; 2N4F A; 2MBO A; 4NQL B; 2MBH A; 4RMA A; 5IN7 A; 2H88 B; 2GBM A; 1QZE A; 2JPH A; 3MC8 A; 3DBS A; 1B1Z A; 3PPA A; 3VXW A; 2BT6 A; 1NYR A; 3ZLZ A; 4GSW A; 4IKG A; 4IG7 B; 2AL6 A; 2WXJ A; 1C76 A; 5JZE B; 3AE8 B; 2OJW A; 3N9Y C; 2RR9 A; 3HIZ A; 4ASW C; 4BKS D; 3L08 A; 4HDO A; 1ZXI A; 1C4C A; 4G11 A; 2WYQ A; 1T0Q C; 4IWP A; 1WGG A; 4UDU C; 5HI1 A; 2BW2 A; 2KNB A; 2DBY A; 4FJV B; 1LO5 D; 2HD5 B; 1T0R C; 3MJ5 A; 2GBK A; 2K8C A; 3ZJT A; 3GE3 C; 1V1P B; 3BWU D; 3Q3J A; 4XYC A; 4LNK A; 2VZK B; 3KW5 B; 3DPD A; 2L52 A; 1I4G A; 1IBX A; 1Q10 A; 1K53 A; 3VVW B; 2MJD A; 2PIA A; 2K39 A; 4F1S A; 3AMZ A; 3UF8 A; 2O6V A; 4USA A; 2WXP A; 1ZXH A; 1SIF A; 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