The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
|
sequence length |
56
|
structure length |
56
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Chain Sequence |
MQYKLVINGKTLKGETTTKAVDAETAEKAFKQYANDNGVDGVWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Evaluation of backbone proton positions and dynamics in a small protein by liquid crystal NMR spectroscopy.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Immune system
|
| source organism |
Streptococcus sp. 'group g'
|
| molecule keywords |
Immunoglobulin G binding protein G
|
| total genus |
15
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-05-01 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01378 | IgG_binding_B | B domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1MPE A; 1P7E A; 5HG2 A; 1FCL A; 4D2K A; 2N9L A; 5HFY A; 2KN4 A; 1MI0 A; 2IGH A; 1EM7 A; 3FIL B; 4GLS C; 1IGD A; 1IBX B; 2QMT A; 1YMH E; 1ZXH A; 2GI9 A; 1P7F A; 2GB1 A; 1Q10 A; 2I2Y A; 3FIL A; 2LHD A; 1IBX A; 1FCC C; 2K0P A; 1F2R I; 2RMM A; 4KGS A; 1XF5 L; 4HKZ E; 1MVK A; 1XCQ L; 1MHX A; 1XCT L; 2ZW0 A; 1KH0 A; 1K50 A; 2JU6 X; 1C9F A; 2J52 A; 2N7J A; 2LHE A; 1MHH E; 2PTL A; 5HI1 A; 2PW9 A; 4KGT A; 2JWU A; 1D4B A; 2KDM A; 1QKZ A; 4IKG A; 2KAC A; 2NMQ A; 4IOI E; 5JXV A; 4OZB A; 5BMG A; 2EEL A; 2KQ4 X; 1IGC A; 2JZP A; 2JXT A; 1YNT E; 2JSV X; 5HHD G; 1GB4 A; 4WH4 A; 2OED A; 1UWX A; 2J53 A; 2LGI A; 2I38 A; 5BMH A; 1K52 A; 1HEZ E; 4OZA A; 1PGX A; 2IGG A; 3UI3 A; 2QSD A; 4HJG E; 2ZW1 A; 1PGA A; 1F2R C; 1K53 A; 2LUM A; 1PGB A; 5BMI A; 4OZC A; 3GB1 A; 2PLP A; 1HZ5 A; 1JML A; 2IGD A; 3V3X A; 4MAC A; 2RPV A; 1GB1 A; 3MP9 A; 1HZ6 A; 1FD6 A; 2KWD A; 2ONQ A; 4KGR A; 1K51 A; 2N9K A; 2ON8 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1Y56 A; 1I7H A; 1IYF A; 1XQQ A; 4D2K A; 2R2Q A; 3TEW A; 1WYW B; 1WGY A; 1ZXH A; 2UYZ B; 2G45 B; 2RDH A; 1E8X A; 2N7D A; 2VRR B; 4I6L B; 3PLU A; 2L7R A; 3VAW A; 3HVD A; 1E7P B; 1EU4 A; 3ZJU A; 4PS8 A; 2JQR B; 2C7M B; 3VR8 B; 4MEM A; 1K50 A; 3PRE A; 2FUH B; 3L4P A; 4S17 A; 1MG4 A; 4GMV A; 2SAK A; 3WAM A; 4WWO A; 2O2V B; 1WE6 A; 1GG3 A; 2J0M A; 2EKI A; 5JXV A; 4XYC A; 2VZK D; 1KOT A; 3RUI B; 2KC1 A; 3PT2 B; 4TUU A; 1YD8 U; 2M0X A; 5BO4 B; 4J3O D; 3RMK C; 4CYE A; 2M19 A; 4RGM A; 4MSQ B; 3JW0 X; 1WGK A; 3Q8A A; 4MH0 E; 5BMH A; 4IG7 B; 1KFY B; 4IW0 A; 3IG3 A; 2VH1 A; 3AU4 A; 3K9P B; 4HJG E; 2WP9 B; 1AW7 A; 2D3B A; 5EE0 A; 4ZRK A; 2LUM A; 1PGB A; 1WYG A; 3NZ3 A; 1D5M C; 5BMI A; 3P4R B; 5LLI A; 4FA6 A; 4OZC A; 1ZDX A; 3KUC B; 1WR1 A; 4BKT A; 3V3X A; 2NPT B; 1NEN B; 4FJV B; 3DBH I; 2CHW A; 1CMX B; 2BWF A; 1HTO A; 4M0W A; 1L5P A; 3IBE A; 3AE8 B; 4URK A; 1FNW A; 4WJN A; 5TR5 A; 2W3S A; 3W1Y A; 2DZM A; 2PE6 B; 2BYT A; 1TIF A; 3RT3 B; 1D3Z A; 1V80 A; 2DNF A; 3SU8 X; 1MI0 A; 2IGH A; 2LI5 A; 3EHV A; 1OGW A; 3VUX A; 4GLS C; 3DBH B; 2MQJ A; 4DXF A; 3L10 B; 4MDK E; 4AWJ A; 1QZE A; 5AEK B; 4ANX A; 4XC2 A; 1ROE A; 2BB6 A; 2DZJ A; 2WLB A; 4DXA B; 3CWI A; 4RMA A; 3ML8 A; 2G1E A; 3ZDT A; 2CJN A; 2KAJ A; 2PEA A; 2N7J A; 4YSY B; 1YX5 B; 2PTL A; 4BAX A; 1IUE A; 3WA0 A; 2NVU I; 3U52 E; 3N30 A; 5D3D A; 1QIL A; 2QHO A; 3BK2 A; 1D5X C; 3DBR I; 2DHZ A; 4LNK A; 4HEA 1; 3WAO A; 3GE3 C; 2LUE A; 3AE3 B; 4FUL A; 1UWX A; 3T3N A; 4W9I A; 3RNG C; 4H2A A; 2CU1 A; 4WWP A; 2K25 A; 1N60 A; 3DBR B; 3AXC A; 3WAL A; 4TV3 A; 4BBN F; 1FNU A; 1N62 A; 3KW5 B; 5CHW A; 3PV1 A; 3C0R B; 1SGH A; 1RFA A; 2FCS A; 4YSX B; 1ZP0 B; 2JRH A; 4RCO A; 4RF1 A; 1JWA D; 2AQ3 B; 2KTR B; 3OG5 A; 2IZV B; 2FIF A; 4IWO A; 1Y8R C; 2RPV A; 4KV2 A; 1M94 A; 3OWE B; 2KDE B; 3DQV A; 1QOG A; 1QOA A; 2K6Q A; 4WQM A; 5IA7 A; 1HQR D; 4ANV A; 4P6V F; 1K51 A; 1J7A A; 3PZ7 A; 1WX8 A; 2O6V B; 2ACZ B; 4CO7 A; 3MFG A; 2FCN A; 1F0Z A; 5IO9 A; 5HFY A; 1JWS D; 1WGH A; 1ZPS A; 1EM7 A; 3RZW C; 1SE2 A; 1IGD A; 3H1U A; 3JSV A; 2KZR A; 4HCP B; 4HWI B; 1KF6 B; 3BY4 B; 3R2I A; 4LLG M; 2OHF A; 3UIO B; 2KLC A; 2Y5P A; 3ZGZ A; 1WJU A; 4A3P A; 1XCT L; 4MJS B; 5E6P A; 2BF8 B; 2HTM E; 2ZNV B; 1UBI A; 3U8Z A; 2L05 A; 2KJR A; 1WGD A; 1YJ1 A; 3GS2 A; 4IKG A; 2KAC A; 1E7U A; 2KNB A; 3B0A A; 4HXD A; 2N0S B; 3RCZ A; 3HIZ A; 5DPT A; 2W3R A; 3I57 A; 4B0M A; 4KKI A; 3ALB A; 2I1K A; 3KYC D; 3AUL A; 5G5G A; 1OEY A; 2LD9 A; 1V1P A; 3PO0 A; 5TSS A; 1ZXI A; 3EC8 A; 1XXG A; 3T8M A; 1WZ0 A; 3ZW3 A; 1DGJ A; 4NAW B; 5J18 A; 1RM6 C; 1DYQ A; 1F2R C; 1WM3 A; 2L83 A; 1L4D B; 2C7N B; 3P42 A; 4AOF A; 2BYE A; 4C56 C; 2LEK A; 1MFW A; 4NQL B; 1WMH B; 3HVZ A; 3AM9 A; 2BPS A; 1NVI D; 2KFK B; 2DYM A; 1ZW7 A; 1SJH D; 3NJT A; 1V86 A; 4N59 A; 1FCL A; 4ZRJ A; 2PVG C; 2ZVN A; 2K9X A; 4ASW C; 2K22 A; 4KZ0 A; 3PSE B; 1IBX B; 3APC A; 4YWG G; 2KDF B; 3LYY A; 2YVC A; 3DBL B; 1CK1 A; 3QA8 A; 4XWW A; 1AWD A; 3RNB C; 4W9K A; 3Q8F A; 1GNU A; 3B1L X; 2Z0E B; 1YOV B; 4ANW A; 1ZOY B; 2ZVO A; 4GDK B; 3PZD A; 1VJK A; 4DHJ B; 2JX5 A; 3P4P B; 4IM3 A; 3U4E G; 2B76 B; 1WGG A; 1TY2 A; 2KC2 A; 5BMG A; 2HJ1 A; 2AWT A; 2K3U A; 2Q5W D; 3N20 C; 2MW5 A; 1OEY J; 2KN5 A; 4PT5 A; 3FAH A; 4GN1 A; 3MC9 A; 3KWL A; 4C4V A; 4GOC A; 4NJC A; 1UBQ A; 4II3 B; 1I42 A; 1JRP A; 3PHX B; 4EOY A; 1VLB A; 3E56 A; 2IY0 B; 1SXT A; 2QEJ C; 3DVN V; 4GDK A; 4DDI D; 1CZP A; 2HJ8 A; 2L32 A; 3RYT A; 1FXI A; 1AYF A; 1HEZ E; 1RYJ A; 4N58 A; 3UI3 A; 1JRU A; 1T0R C; 2D5G A; 1PGA A; 3A9K A; 3KUZ A; 3DCG A; 5D2M B; 3VTW A; 3R7Q A; 2FE8 A; 3QK0 A; 4REZ A; 1C4C A; 1GB1 A; 1QOF A; 4KSL C; 3WIM A; 3TUO A; 4KIK B; 3QWZ B; 2C9W B; 1H4R A; 2Y5C A; 2Z8L A; 3SHQ A; 4KSK C; 2M8S A; 1UF0 A; 1WH3 A; 1C3T A; 1SE3 A; 3CIR B; 2WXN A; 4GDL B; 1I4Q A; 1X1M A; 1YMH E; 2GI9 A; 5I4D A; 3I5J C; 4AJY B; 3A4R A; 4KDL B; 4W9C A; 3UQB A; 2BGF A; 2G3Q B; 2RDG A; 5C3J B; 4PYZ A; 2MLB A; 2MH7 A; 3AED B; 2HDE A; 1TT5 B; 3R7R A; 1PUT A; 1PFD A; 4ICV A; 3VQI A; 1WXM A; 5CHF A; 2GRI A; 3SEB A; 4ZHO A; 1GAQ B; 2CS4 A; 2JPH A; 1FXA A; 4AS1 A; 4NAM A; 1FRR A; 3TBL D; 4YTM B; 3VVW B; 1V5O A; 1G6J A; 2KQ4 X; 3AEE B; 4BZA A; 1KJT A; 1L0Y B; 2JSV X; 1S1Q B; 1ZGU B; 3U30 A; 2M4N A; 2BBC A; 2KXJ A; 3HRD D; 1Z2M A; 5C23 A; 2H89 B; 3VRB B; 2ZCC A; 1B1Z A; 2B3A A; 2V4L A; 2WYQ A; 2DYB A; 2GBR A; 5LNK 1; 1N5X A; 2M56 B; 2C5L C; 1T3Q A; 3B9J A; 4OVU A; 1SEB D; 4MGK E; 3L54 A; 1EUV B; 4MAC A; 4WWN A; 1DOI A; 3TEZ A; 2TSS A; 2NBW B; 2QDF A; 3BYY B; 4K7W A; 1A70 A; 5EDS A; 1WY8 A; 1OQR A; 1HZ6 A; 5L83 A; 1SB3 C; 2N4F A; 3ONS A; 4IM0 A; 5D94 A; 3U7Z A; 1STE A; 2LJ5 A; 2LMC A; 2KN4 A; 1ZE3 D; 3AV8 A; 3AN1 A; 2EMS A; 2RSU A; 2LHD A; 2YLM A; 2W82 A; 4R3D A; 1XLO A; 2WDV B; 1BML C; 1NYQ A; 3AB5 A; 2G4D B; 2L76 A; 3AE4 B; 2J7Q B; 3H8H A; 4MT5 A; 2V4I B; 2ZW0 A; 4HVB A; 4IWQ A; 3Q69 A; 1R7S A; 4FN2 A; 3Q8C A; 2MWS B; 2FCM A; 1D4B A; 4ZRQ A; 1FNV A; 2LFI A; 2GBJ A; 4OZB A; 3NVV A; 5D6J B; 1FM0 D; 4US9 A; 1OQY A; 3N1Z C; 4BBN C; 4I6N B; 1V49 A; 2EEL A; 2GBN A; 3AE5 B; 2JXT A; 4F8C B; 1GB4 A; 4WH4 A; 1ET6 A; 1EF5 A; 4DDG D; 3L17 A; 2LZ6 A; 4MGZ E; 2WX1 A; 5IN7 A; 5HKH A; 1C4A A; 1TS5 A; 2INP E; 4WQO B; 3BWU D; 1FPY A; 1JCK B; 1I4P A; 1V2Y A; 3KVF B; 3MC0 B; 3RNF C; 4BOZ B; 3DHG C; 1TKG A; 1YIW A; 2KYW A; 4XGA B; 2LGX A; 2KJ6 A; 1JWB D; 3RD2 A; 2X8X X; 1OQQ A; 1UEL A; 2IO3 B; 3N1Y C; 4M0W B; 2KHW B; 3BYT B; 4HDQ A; 5JHA A; 4BFR A; 2JYT A; 1UGM A; 4W9J A; 3Q3O C; 3NZS A; 3UQA A; 1BXT A; 2XNA C; 4MM3 A; 1WXA A; 4EKU A; 1GC7 A; 4ZRI A; 4EEW A; 3A4S C; 3C19 A; 3AEC B; 1XCQ L; 3IVF A; 2W54 A; 3U7D A; 3AEA B; 4KX6 B; 1L2N A; 4FJY A; 1TYG B; 5AZG A; 5KHO A; 3B2F A; 2MP2 A; 3D32 A; 4W9G A; 2MSE D; 4S0R A; 3W1S A; 3AH7 A; 1QKZ A; 2K6D B; 4F1S A; 2LXA A; 4DK5 A; 4K81 A; 5E6O A; 2WXH A; 2L8J A; 2BYF A; 2IJ0 A; 5CHV C; 1QOB A; 1IGC A; 2BVC A; 2L3Z A; 5JZE B; 1K8R B; 2PE9 A; 2WWZ A; 2KAN A; 3W2D A; 3NVZ A; 2AQ1 B; 3NS8 A; 3LDZ E; 4OHJ A; 1JQ4 A; 3EA6 A; 3SR6 A; 4ACF A; 2ZNV C; 4JX1 C; 1PGX A; 2D11 A; 2CKH B; 3WAP A; 4LCD E; 3TIX A; 4BKG A; 4M02 A; 1I35 A; 1E6E B; 3VR9 B; 4JIO U; 2DEN B; 1F77 A; 4IWP A; 1NI3 A; 1TS4 A; 1J8C A; 2M1M A; 2X38 A; 2BB5 A; 1E8Z A; 4HK2 A; 3TEY A; 2I1J A; 2JRI B; 2BS4 B; 3KLS X; 3W5V B; 4M01 A; 1JWM D; 1UD7 A; 1WR6 E; 3V6E B; 2CJO A; 2BQQ A; 3JSV B; 1EU3 A; 2AL6 A; 4WJP A; 3E9S A; 3P4S B; 4B0E A; 2WGS A; 2DZK A; 1T5X D; 2GMI C; 2K39 A; 5AZH A; 1HXY D; 5IOI A; 3OLM D; 5AZF A; 2V3P A; 3I63 C; 1GOZ A; 2D10 A; 1P1A A; 1CJE A; 3VH4 B; 1P0R A; 2JU6 X; 3MJW A; 3OJ4 B; 1MHH E; 1V5T A; 3Q2A C; 5HI1 A; 1YJJ A; 5D3I B; 2FAZ A; 3UIN B; 3BVG A; 3M3J A; 2NMQ A; 1GUA B; 2WXJ A; 1L4Z B; 4C7Y A; 3SDL C; 2WXM A; 2KKC A; 3R66 C; 3EGR A; 1V1P B; 3RNA C; 2OED A; 4E3C A; 2AEH A; 2AYO B; 3BIN A; 5CX3 A; 1QLB B; 1R4M B; 4JPS A; 4CHK A; 1TTN A; 2WDQ B; 1L0X B; 1LFD A; 2EMT A; 2GBK A; 2AQ2 B; 3H6N A; 3UF8 A; 2NCN A; 1TZO A; 3L16 A; 2IDY A; 4N6E B; 1PDX A; 2K8B A; 3IT4 B; 4LTU A; 4C80 A; 4W9L A; 2SEB D; 3ZXV A; 3AE7 B; 4Q2J A; 3QC8 B; 4KKJ A; 3VDZ A; 4A20 A; 2MBH A; 3WCQ A; 3VTV A; 3Q3M C; 3QJZ A; 4OVZ A; 2BTE A; 4A90 A; 5GXG B; 2D3G A; 2DX5 B; 1VCB A; 2O6V D; 5CTR C; 1WXV A; 4N9F 4; 3V6C B; 2MBB B; 4YSZ B; 3ZDM C; 4MGI E; 2PVO D; 2MEK A; 4IM2 A; 3M62 B; 5EE1 A; 3QCA A; 2PMV A; 4US8 A; 3KH0 A; 2CR5 A; 1C76 A; 2UU7 A; 4IDI A; 1B9R A; 4FHJ A; 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3DVG X; 1WX9 A; 4K3B A; 3UIP B; 1LQB A; 3AE2 B; 2LGY A; 3V62 A; 3EEC A; 2YEP F; 4L2Y A; 1UZX B; 1SE9 A; 1WF9 A; 2MRP A; 3TL5 A; 1FRD A; 4AP4 C; 1YN3 A; 1N6Z A; 3VTU A; 2BYV E; 2E3T A; 3H9D A; 1H8C A; 2HD5 B; 5GMV A; 1I4X A; 2AL3 A; 1P9D U; 3T9L A; 2KMC A; 2LXC A; 4PS7 A; 4FBJ B; 2KOX A; 5H8Y E; 3APD A; 3DBS A; 4FJZ A; 3PRM B; 4ZRP A; 4ZYN A; 3ZJV A; 4A9A A; 5LXH A; 2KD0 A; 1KLV A; 2L52 A; 1VR9 A; 2KX0 A; 4WJO A; 1TKY A; 3K9O B; 1RAX A; 2LRU A; 3GOE A; 1OFF A; 2KVZ A; 2KQ7 A; 4GGQ A; 3AE6 B; 1WM2 A; 3PRZ A; 4AJW A; 1WXQ A; 4TKN A; 2D2Q A; 3GP7 A; 4HPP A; 5E6J A; 1JAL A; 3VUW A; 1SBB B; 4ZYS A; 3CST A; 2PJH A; 3RNE C; 1XT9 B; 3ZNH B; 1NDD A; 3BVM A; 4JWU C; 5D7G A; 4DHZ B; 5LXI B; 2D3C A; 3TEX A; 3A1Q A; 2NTS A; 1TY0 A; 4DWF A; 4YTN B; 2JT4 B; 4USA A; 3ZUN A; 1FFV A; 1I4G A; 3FIL A; 3IHP C; 4X57 B; 4HRS A; 3LJ3 A; 2K0P A; 4XE0 A; 2RMM A; 3FC4 A; 1J7C A; 2WX0 A; 4BOS C; 1UH6 A; 1EWY C; 1E8W A; 2WXQ A; 5FR6 A; 3W9C B; 2WXI A; 5MPO A; 2IYD B; 2NS5 A; 3BII D; 4DHZ E; 5J2R A; 5IAA C; 1E90 A; 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