The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
116
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structure length |
116
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Chain Sequence |
GSSGSSGKKAKKVRFYRNGDRYFKGIVYAISPDRFRSFEALLADLTRTLSDNVNLPQGVRTIYTIDGLKKISSLDQLVEGESYVCGSIEPFKKLEYTKNVNPNWSVNVKTSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the N-terminal DCX domain of human doublecortin-like kinase
rcsb |
| molecule keywords |
Serine/threonine-protein kinase DCAMKL1
|
| molecule tags |
Transferase
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| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
13
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| structure length |
116
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| sequence length |
116
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| ec nomenclature |
ec
2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase. |
| pdb deposition date | 2003-05-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF03607 | DCX | Doublecortin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Doublecortin domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5IO9 A; 2DNF A; 5IKC M; 1MG4 A; 1MFW A; 5IP4 D; 2BQQ A; 5IOI A; 1UF0 A; 1MJD A; 5IN7 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1E7P B; 4ZRJ A; 2WXF A; 1MHX A; 1ET9 A; 2FID A; 3HUI A; 4P1B C; 3VH3 B; 2HD5 B; 3TUO A; 3EA6 A; 3QAQ A; 2M1M A; 2ZVN A; 4NJC A; 1WYW B; 3T3N A; 4E3C A; 2INN E; 4FHJ A; 2M17 A; 2N0S B; 4A9A A; 3H6N A; 3DBL B; 4AS1 A; 1E0Z A; 2N9E B; 1V81 A; 3MC8 A; 2RGF A; 3QX1 A; 2WXL A; 4WJP A; 4EKU A; 3N32 A; 2VZK B; 3V60 A; 2Q5W D; 2N9P C; 3QWZ B; 3AE1 B; 2D3B A; 2QMT A; 2J0K A; 2CHZ A; 2QCZ A; 3GP7 A; 2PIA A; 2QHO A; 1WR6 E; 4LJO B; 2L0T A; 4MEM A; 1QOB A; 1J7B A; 2D3A A; 4BKT A; 5JH5 C; 1KLG D; 2MP2 A; 1T0R C; 2QJL A; 3SDL C; 2OOB B; 5KHO A; 2MP2 B; 4C00 A; 2A4Z A; 4W9I A; 5JZE B; 5J2R A; 3N20 C; 4GOC A; 5G55 A; 2IBI B; 3URY A; 2KTR B; 3ZO5 B; 4DHJ D; 1WI0 A; 3L10 B; 1UH6 A; 3A9J A; 1C4A A; 3A9J B; 4F8C B; 3P4S B; 4M00 A; 1YJJ A; 3W5V B; 1K53 A; 2XNA C; 1E6E B; 1TKE A; 2WP9 B; 1E7U A; 3QCA A; 3N30 A; 4HPL B; 4RNA A; 1FMA D; 2AQ3 B; 2H89 B; 1EU4 A; 2M19 A; 1IGD A; 3UQA A; 3NZU A; 4ZYN A; 4WUR A; 1KF6 B; 4LDT B; 2KN4 A; 2W3R A; 1RYJ A; 5LXH A; 3SFE B; 2ZNV C; 3NY5 A; 3IXS A; 3PZ8 A; 1RRB A; 1L4D B; 2ICI A; 2CR5 A; 2JYE A; 2GBK A; 1XXG A; 4TUU A; 1UEL A; 4Q2J A; 2KJR A; 2BBC A; 1B1Z A; 4C7Y A; 1Z5S B; 4MH0 E; 3B0A A; 4WWM A; 2KMM A; 1E8W A; 5EE1 A; 3VAW A; 5FKA C; 3SHQ A; 2DX5 B; 2GBM A; 3RYT A; 3WAN A; 3L0W B; 2DAF A; 4B0E A; 5AEK B; 5EE9 A; 3LB8 C; 5G5G A; 3KUD B; 1I4G A; 2KZR A; 4AWJ A; 5G5H A; 5AZF A; 2PE9 A; 4NAM A; 2KVZ A; 2AQ2 B; 1V86 A; 3KH0 A; 4MJS B; 1FIQ A; 3ECI A; 3WAP A; 4C7Z A; 2CJO A; 4DHZ B; 1YNT E; 3NUH B; 4DXG A; 4GDK A; 3ML8 A; 2I2Y A; 2AL3 A; 3BYY B; 1XLP A; 3KLS X; 3NRZ A; 3KYD D; 4KGT A; 2GB1 A; 3J9C A; 3AE8 B; 3TL5 A; 5BMH A; 4LNO A; 5GMV A; 1C1Y B; 3QAR A; 3RNA C; 2L05 A; 3BYT B; 3ETR A; 4A3P A; 3U7D A; 4BOS C; 3ZKJ C; 2HJ8 A; 4C4V A; 5BMI A; 2BS4 B; 4ZYS A; 4C4V B; 1VR9 A; 3RNG C; 3NVY A; 4MEL A; 4YSY B; 1UF0 A; 3DQV A; 1SE2 A; 4URK A; 1TY2 A; 2NBW B; 1P7F A; 3PRE A; 4GN1 A; 3CST A; 2KFJ A; 3EUB 2; 2LI5 A; 3U2S C; 3SEB A; 4II2 B; 3MC0 B; 3BWU D; 4JWU C; 4ITK A; 2V4I B; 2YEP B; 2MBH A; 1D5M C; 2LAS A; 4KDL B; 3X23 A; 4AOF A; 2GBN A; 2D3G A; 4PS8 A; 2JWZ A; 4WJO A; 2L8J A; 2H88 B; 2NTT A; 1KOT A; 2W3S A; 3Q69 A; 1J0G A; 1FFV A; 2M4N A; 4HLE A; 5FR6 A; 1XCT L; 4P7I A; 3ZDT A; 3JYU A; 3GE8 C; 3PTF C; 2KK8 A; 3CMM B; 2I1K A; 1VZ6 A; 1L0X B; 2LFI A; 3UGB B; 2V4L A; 4PT5 A; 4XGA B; 3ALB A; 3HK0 A; 2AX5 A; 2LHD A; 4YTN B; 1WXM A; 4TQ1 A; 2GOW A; 1T3Q A; 1WGD A; 3FKY A; 2UU7 A; 2JZP A; 5BMG A; 2CKH B; 1XD3 B; 2X8X X; 1QQR A; 2CS4 A; 4JE3 B; 3K9O B; 2KAC A; 2LMC A; 3B9J A; 4BVU C; 3GZN I; 4ANV A; 1NI3 A; 2DBY A; 4K7W A; 3RNB C; 2VH2 A; 4DDG D; 2V3P A; 1UBQ A; 3HM3 A; 4M02 A; 1C9F A; 3CSF A; 1FD6 A; 3P63 A; 3U7Z A; 2WQY B; 5AUI A; 4B9K A; 2KHW B; 4W9D A; 2KQS A; 2WXP A; 2LRU A; 3ZNH B; 4ANX A; 2RPQ A; 4R3D A; 3AUL A; 3Q8C A; 4DHZ E; 3C19 A; 1YIW A; 3WCQ A; 2ON8 A; 2D2Q A; 2WS3 B; 1BML C; 3VTW A; 3TJP A; 4JGH B; 2JF5 A; 2K8H A; 2WXH A; 2IO1 B; 3BVZ A; 1SGH A; 1ZKH A; 1YX5 B; 5D2M B; 1ESF A; 5CHW A; 2RR9 A; 2WLB A; 4D2K A; 4EZK A; 4RCO A; 2INP E; 4OZC A; 1C76 A; 2LD9 A; 1ZP0 B; 3DWG C; 3I9V 1; 1JWM D; 1N60 A; 4NZL B; 3AH7 A; 3TEY A; 2WNM A; 3IAS 1; 1FRD A; 2WXO A; 4A55 A; 1XLQ A; 4FA6 A; 4MSM B; 3RUI B; 3B2G A; 1P0R A; 2Y5P A; 3RD2 A; 5AZH A; 2KJ6 A; 2Y5C A; 4BAX A; 3UIP B; 1EWC A; 2C7M B; 2K8C A; 2JPH A; 1E10 A; 1CJE A; 4YL8 A; 2KDI A; 2YEP F; 1MG8 A; 1J19 A; 3U52 E; 3TMP B; 2BWF A; 2K8B A; 5CHV C; 4A90 A; 1GPX A; 2CHW A; 3N3K B; 1C77 A; 3DWM A; 1RLF A; 2IND C; 2E3T A; 1WFY A; 1D4B A; 1AW7 A; 2LRW A; 2OHF A; 3MHS D; 4BKS D; 5CTR C; 2DZK A; 4J6I A; 1D5Z C; 1L4Z B; 4ZRQ A; 1VRA B; 1I4X A; 1MI0 A; 4EFO A; 4KZC A; 1P9D U; 4NAW B; 3VTV A; 3ZXV A; 2KMC A; 1GUA B; 2DHZ A; 3AEA B; 5DCN A; 4M0W A; 2JXT A; 2A5U A; 1TBE A; 4M0W B; 3IAM 1; 4OZA A; 1ZDV A; 2AEH A; 5H8Y E; 1J8C A; 2C9W B; 2N4F A; 5L83 A; 4FHK A; 2UYZ B; 3AE2 B; 4XC2 A; 1R4M I; 1P98 A; 4HPP A; 4MGY E; 1J7C A; 1ACC A; 2WXR A; 3QC8 B; 4IC7 B; 4M8M A; 4G0N B; 3AE6 B; 2I38 A; 3KUZ A; 1SF0 A; 1PQS A; 5D6J B; 2J52 A; 3AE4 B; 4A20 A; 4A3O A; 3MHZ A; 3U30 A; 3Q14 C; 3AM9 A; 4II3 B; 3OJ3 A; 5DPS A; 1FRR A; 2FNJ B; 4REZ A; 1M4V A; 3V61 A; 2B3A A; 2DWQ A; 2MX2 A; 3KW5 B; 4KVG B; 1MFW A; 1GB4 A; 2J42 A; 1GJZ A; 1YX6 B; 3RI7 C; 1Q10 A; 1EO6 A; 2GMI C; 1VZ8 A; 2PMV A; 3GS2 A; 3AE5 B; 1UD7 A; 1V5T A; 2N1V A; 5EE0 A; 1MHH E; 4GSW A; 2WXI A; 1E90 A; 1LFD A; 1N62 A; 2L52 A; 1JW9 D; 2NVU I; 3PV1 A; 1YQ4 B; 4ZRI A; 1SB3 C; 4K7S A; 3PRZ A; 5BYS A; 2JQR B; 2WHI A; 1EM7 A; 1D3Z A; 1YOV B; 4ICV A; 5E6O A; 4WWN A; 3M95 A; 1WXA A; 2K3U A; 2MQJ A; 2D3C A; 2BS2 B; 2DZJ A; 3PHX B; 2W9N A; 2WDR B; 1UWM A; 1XLO A; 2BPS A; 1ZW7 A; 1TKY A; 1CZP A; 4I6L B; 1K51 A; 1WJN A; 2DLB A; 2MLB A; 1NYQ A; 2RD0 A; 1Z2M A; 3PLV A; 2VH1 A; 1I35 A; 2MA9 B; 3WAL A; 5HFY A; 2FCQ A; 2NMQ A; 3BZD B; 1HZ5 A; 1ZXH A; 2DYB A; 2J0J A; 2WYQ A; 4RGT A; 1WWT A; 3EC8 A; 1YMH E; 4IM3 A; 2LJI A; 2MBQ A; 2N7J A; 4N58 A; 2ZVO A; 1PFD A; 4UDU C; 3JSV B; 2O6V B; 2L7R A; 2LGY A; 1JRO A; 1JAL A; 3VVW B; 2J53 A; 3ENE A; 3RNF C; 4GXB A; 4N9F 4; 1TYG B; 3P1M A; 3EHV A; 3P4P B; 4P16 A; 1JRP A; 1V1P A; 2N9X A; 3ZTC A; 2AQ1 B; 1P7E A; 3BVG A; 4DWF A; 1V1P B; 1SIJ A; 2KO3 A; 1V8C A; 2BWE S; 2MRP A; 1QKZ A; 1R4N I; 2IPK D; 2YVC A; 1WX9 A; 3DVG X; 3NVV A; 4KSK C; 3AEB B; 3EEC A; 1JWA D; 1VLB A; 3PRP B; 2JT4 B; 2N9K A; 2L1A A; 5IKC M; 1Q1O A; 3RMK C; 1FCC C; 4BZA A; 2FE8 A; 2ZCB A; 2C60 A; 4RM9 A; 5IOI A; 4E71 A; 2SAK A; 4BOZ B; 2KTR A; 2ZJD A; 2MJE A; 2DEN B; 4GMV A; 2Z0E B; 3L17 A; 2JZZ A; 3LXF A; 2Y3A A; 2NPT B; 2C5L C; 1N61 A; 1VDV A; 4P1C C; 3V3X A; 4JX1 C; 3VFK A; 3BK1 A; 4ICU A; 3ONS A; 3PO0 A; 1JCK B; 3HM6 X; 1F9J A; 3A4S C; 4MM3 B; 2KDM A; 3AEE B; 4AJW A; 5BYR A; 2BVC A; 4WQM A; 1C4C A; 5CHF A; 2MH7 A; 4GGQ A; 3OJ4 B; 2GBJ A; 4MSQ B; 1N5W A; 2XK5 A; 2K9X A; 2XK5 B; 1L0Y B; 3VR9 B; 2NCN A; 3E56 A; 1WXS A; 2LZ6 A; 1L6U A; 2BF8 B; 4FUL A; 3PVL A; 1KJT A; 1ZDX A; 3GE3 C; 1JRU A; 3N1Y C; 5DPT A; 2OJW A; 4OZB A; 3DBH B; 3Q8F A; 3RZF A; 5D94 A; 1VJK A; 1QF6 A; 3CWI A; 3E9S A; 4QAY A; 1ISN A; 3QIJ A; 3TCA A; 2Z0D B; 1F2R C; 3VR8 B; 1WSP A; 3KVF B; 2KTF A; 2KDE B; 1SE3 A; 3OLM D; 5FK9 C; 3BII D; 2OED A; 1AWD A; 2AWT A; 2DZI A; 2FUG 1; 4MJS A; 2EEL A; 2CU1 A; 3P4Q B; 4XZ4 A; 3U8Z A; 1UGJ A; 3RZW C; 1TTN A; 4S17 A; 4HKQ A; 4BKG A; 2ZZP B; 4J3O D; 4LNF A; 3WA0 A; 2JYT A; 4W9G A; 3V62 A; 3PGE A; 2WX1 A; 4O1N A; 4AUQ C; 3T3O A; 3ZRF A; 2KN5 A; 2BW2 A; 3ZRC A; 4GIV A; 5KHQ A; 1GG3 A; 1N6Z A; 4KSL C; 2KC2 A; 2CJN A; 3DVN V; 3R7Q A; 1DGJ A; 4IWP A; 4E74 A; 1C4P A; 3ZJT A; 1HQR D; 1YJ1 A; 1WGR A; 2IY1 B; 1WYG A; 3W5U B; 2JX5 A; 2KFK B; 1MJD A; 2R61 A; 4HXD A; 2PKO A; 2Z8L A; 4KGS A; 4HK2 A; 2BB5 A; 3DHI C; 2M0A A; 3HIZ A; 1WY8 A; 3SU8 X; 2K25 A; 3AN1 A; 2PE6 B; 1VD2 A; 2FUH B; 3Q3N C; 4DHJ B; 3NS1 A; 4WH4 A; 5JHB A; 2LUM A; 4MDK E; 3AU5 A; 4W9C A; 1OTR B; 2V3N A; 3D32 A; 3ZNZ B; 2XN9 C; 3VQI A; 2IO3 B; 2D10 A; 3VUY A; 3RN9 C; 2RDB C; 1YQ3 B; 1F52 A; 4N59 A; 4ASW C; 5IA7 A; 1PDX A; 4HRS A; 1YN3 A; 4HDQ A; 1AN8 A; 2FBW B; 1FXA A; 1WGY A; 1XT9 B; 3ZXR A; 4NY0 A; 1ROE A; 1E5W A; 4B0M A; 3NOB A; 4XDD A; 2GLS A; 4YTM B; 2BTE A; 1Q0W B; 1KM7 A; 1WGK A; 2DYM A; 3VHT C; 1S1Q B; 1I4R A; 3MJ5 A; 2R2Q A; 3V6C B; 2J4X A; 3RNE C; 5LNK 1; 4C80 A; 1SEB D; 5BYQ A; 1N5X A; 4WAF A; 3QHT A; 4GDL B; 2MJD A; 1LXD A; 1C78 A; 1T0Q C; 4IWO A; 1FNU A; 1F1H A; 1HXY D; 1L0V B; 3UF8 A; 1X1M A; 2XBB C; 4EUT A; 4MGI E; 3L4P A; 4CHK A; 1TS2 A; 3R2I A; 3MJW A; 4GLS C; 3ZTD A; 4NPN A; 5AZG A; 3RFZ B; 1NI2 A; 4KV2 A; 1OQY A; 2J0M A; 1TKG A; 3NS8 A; 3PS6 A; 1LO5 D; 1V97 A; 3MTN B; 2WDQ B; 4RF1 A; 5D3D A; 3Q3F A; 3L13 A; 1RFK A; 2LXA A; 1FCL A; 1QZE A; 4TMA B; 2V1Y A; 3L08 A; 4DK5 A; 1FXI A; 4HRO A; 3PPA A; 2PTL A; 3CF6 E; 3IT4 B; 4K3C A; 2V0G A; 3RPF C; 1ZOY B; 1GOZ A; 4FJV B; 3ZNI D; 3DBR I; 3QA8 A; 3B08 A; 4PYU A; 1A70 A; 2BS3 B; 3N1Z C; 4EOY A; 1OQQ A; 2PLP A; 4XWT A; 3I57 A; 4OVV A; 1TZ1 A; 1OQR A; 3R7R A; 1M94 A; 3A9K A; 3ABV B; 4W9K A; 3AED B; 2KJH B; 3A9K B; 2LGI A; 4RFB A; 1LM8 B; 4HCN B; 4NNJ B; 1SJH D; 3R2T A; 2I1J A; 3DPD A; 1C3T A; 5FR3 A; 5E6P A; 5DPW A; 2HE7 A; 1OEY A; 2WGS A; 4TQ0 A; 5IO9 A; 1Y56 A; 1H4R A; 2L32 A; 1UNS A; 4NAW A; 2LHE A; 1D5X C; 1UWX A; 2C7H A; 3BVM A; 4X57 B; 2WU2 B; 4TKN A; 3NVZ A; 2EMT A; 3AEF B; 2WXQ A; 3UIO B; 4EZJ A; 1FNW A; 2AYO B; 1SJE D; 1E8Z A; 2GBR A; 1NVI D; 4YTP B; 3HHM A; 4NQK E; 1ZGU B; 4OVU A; 2VRR B; 1WRI A; 4IKG A; 1YQB A; 3W1S A; 1KH0 A; 1ZPS A; 5LLI A; 3S2A A; 4B6W A; 2HTM E; 3Q3M C; 3DHG C; 3FIL A; 3ZVV A; 3DVG Y; 3NZ3 A; 4FXC A; 3T9L A; 4WJQ A; 3FIL B; 1K52 A; 4KX6 B; 4LTU A; 2RMM A; 1V5O A; 2HTH A; 4XWW A; 1NEN B; 1ZUD 2; 3GZN B; 1WE7 A; 1EU3 A; 5I4D A; 3Q6B A; 1AYF A; 1K50 A; 2OJR A; 4K81 A; 2VZK D; 3DBL I; 3RNC C; 4FJZ A; 3ZJV A; 4K3B A; 2SEB D; 1BXT A; 2IDY A; 1WMH B; 3H1U A; 3HVD A; 4TV3 A; 3DBS A; 3AXC A; 4A8X C; 4BBN C; 1SIF A; 3H8H A; 4PS3 A; 2CHX A; 5C1Z A; 1SXT A; 4IOI E; 3C0R B; 5T8I A; 1TT5 B; 2R2O A; 1LGR A; 1B9R A; 2D07 B; 2MHJ A; 4HCP B; 4I6N B; 3M63 B; 2KYW A; 2KAN A; 1RFA A; 5HG2 A; 3PHW B; 5CX3 A; 3VUW A; 4ANU A; 4ANW A; 2ZPY A; 1FM0 D; 2QDF A; 1IPG A; 1RAX A; 4FN2 A; 4CYE A; 4WQO B; 1CMX B; 2K6Q A; 1I4P A; 2KVR A; 1IYF A; 1GAQ B; 2JZ3 B; 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