The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
83
|
structure length |
83
|
Chain Sequence |
CDSIVVAYYFCGEPIPYRTLVRGRAVTLGQFKELLTKKGSYRYYFKKVSDEFDCGVVFEEVREDEAILPVFEEKIIGKVEKVD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of axin dix domain
rcsb |
| molecule keywords |
Axin 1 protein
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| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Rattus norvegicus
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| total genus |
15
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| structure length |
83
|
| sequence length |
83
|
| chains with identical sequence |
B, C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-11-08 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00778 | DIX | DIX domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4WIP A; 1WSP A; 3PZ7 A; 3PZ8 A; 2D5G A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2L52 A; 2QSD A; 5FR3 A; 1TTN A; 2JQR B; 3NY5 A; 1XCQ L; 4XWW A; 2JWZ A; 5LXH A; 2LGI A; 4PK1 A; 1VZ7 A; 2LGD A; 1WGR A; 4JWS C; 3SFD B; 3MJW A; 4XGA B; 4HK2 A; 1PYW D; 2QDF A; 4FXC A; 1TT5 B; 3URY A; 3GZN B; 4IM3 A; 1MHH E; 2WXI A; 2MRP A; 1RM6 C; 4USA A; 2GOW A; 3KWV A; 3PGE A; 1PFD A; 3E9S A; 1M94 A; 2IPK D; 1EWC A; 3O13 A; 1P3Q U; 2FE8 A; 1G6J A; 2CHW A; 3ML8 A; 4W9I A; 2JX5 A; 5HHD G; 4MJS A; 3P1M A; 4HCN B; 3HHM A; 2JYE A; 1WY8 A; 2MJD A; 4UDU C; 5BO4 B; 2M8S A; 2WDT B; 5AUK A; 2VH1 A; 1FRR A; 2N9E B; 4HPM B; 3JVZ X; 3W9C B; 5D7G A; 3SFE B; 3VR8 B; 3AE1 B; 3ZRC A; 4LDT D; 3V05 A; 1ESF A; 4J6I A; 1WXV A; 3LB8 C; 4HLE A; 2BYF A; 3KUZ A; 2FID A; 5EE0 A; 2FCM A; 1WX9 A; 1HA5 A; 3R7Q A; 1WE7 A; 3AE3 B; 2M0X A; 3TIX A; 4DWF A; 3BZD B; 2CS4 A; 4LLG M; 2KWU B; 3A9K A; 3NS8 A; 3K9O B; 4ITK A; 2VZK B; 4WAF A; 3UQA A; 1T0Y A; 3EEC A; 4WAA A; 1UUP A; 4JWU C; 3QHT A; 1L6U A; 1P7F A; 2JT4 B; 3DQV A; 2JUO A; 3W1S C; 2JWU A; 2DAJ A; 3QWZ B; 4RM9 A; 2D2Q A; 2YLM A; 1TZO A; 3D32 A; 3B2F A; 2KVR A; 2BB5 A; 1V5O A; 3VH4 B; 2DHZ A; 1YX6 B; 2W82 A; 1E0Z A; 2WXF A; 4BBN F; 4HVB A; 3DBL B; 1HEZ E; 3O65 B; 3VDZ A; 3S2A A; 1E7P B; 4BBN C; 1ZW7 A; 3FIL A; 3WA0 A; 2L32 A; 3C19 A; 2PE6 B; 1E5W A; 1U4A A; 3MHS D; 4PYU A; 3VUY A; 4O1N A; 2MSE D; 3ZXR A; 4L1B A; 2I1K A; 2W9N A; 2CKH B; 3I5J C; 4YTP B; 4H2A A; 2J52 A; 3DBH B; 3ZW3 A; 1ZPS A; 4JGH B; 1TKG A; 1UBI A; 2BYV E; 4ANU A; 1RRB A; 1L5P A; 3FIL B; 4N58 A; 1TS5 A; 1YJ1 A; 4FAD A; 2MBO A; 2MH7 A; 2D3C A; 2V0G A; 2ZW0 A; 2EEL A; 3EFU A; 2KLC A; 1V1O A; 1WIA A; 1F52 A; 2DZI A; 1FFV A; 1UBQ A; 1T6B X; 3MTN B; 2K8C A; 2J7Q B; 4M0W A; 2ZVO A; 3GP7 A; 1WM3 A; 3E56 A; 2BS4 B; 5CX3 A; 5EE9 A; 3AE2 B; 2KMA A; 2EMS A; 2WDR B; 2E3T A; 3OJ4 B; 4HPL B; 4P6V F; 3SR6 A; 4C7Z A; 4IKG A; 3TEY A; 3B1L X; 4W9J A; 1KLG D; 1V5T A; 1VR9 A; 1WH3 A; 1Z2M A; 2JF5 A; 3N32 A; 3W5U B; 4EEW A; 2JXT A; 2RR9 A; 4OVU A; 1L0V B; 2KFK A; 2V1Y A; 4GU2 A; 1CMX B; 3V62 A; 2KYW A; 5C23 A; 2MQJ A; 3I63 C; 4GLS C; 1N61 A; 1MG4 A; 2V3S A; 1MVK A; 4HDO A; 4KDI C; 3UQB A; 4CHK A; 4BFR A; 3P4Q B; 1YMH E; 1SXT A; 1HE8 A; 3OAW A; 1MJD A; 2ASQ A; 4YL8 A; 2DYO A; 3QA8 A; 3NOB A; 2JZP A; 2KFK B; 1WXQ A; 2LUM A; 3DBR B; 2NCN A; 3ETR A; 2D3G A; 4GN1 A; 4N59 A; 1FNU A; 3KVF B; 2ZPN A; 5BMG A; 4XZ4 A; 2ZVN A; 3ZNH B; 4BZA A; 1UD7 A; 2J42 A; 3M95 A; 2FCN A; 3DVG Y; 5JZE B; 2X8X X; 2WQY B; 3CST A; 4GDK B; 3T3O A; 4NY0 A; 1GPX A; 3DHH C; 3QAR A; 4KZ0 A; 4PS7 A; 4AJW A; 3AI5 A; 2RMM A; 1XLP A; 2MLB A; 2RDB C; 1T3Q A; 3QIJ A; 2SEB D; 2KTR B; 4LTU A; 1JRO A; 2C7H A; 2TSS A; 3LXF A; 4RMA A; 1VCB A; 4KDL B; 1WYW B; 1PGB A; 2MW5 A; 4US8 A; 4W9C A; 4DDG D; 3PRE A; 3JYU A; 2JXX A; 1XLO A; 1FXA A; 5MPO A; 1GUA B; 2KAN A; 1BXT A; 3H7P B; 2QIL A; 3KW5 B; 1FNV A; 2NBV B; 4K7W A; 2C7N B; 3A1Q B; 3RD2 A; 1GOZ A; 1KJT A; 2MA9 B; 2GBM A; 2WXH A; 5DPR A; 3AE5 B; 2JRH A; 3BVG A; 2RDG A; 2ZCC A; 3KLS X; 2ZPY A; 4IUM B; 1E8X A; 4ZYN A; 2WXQ A; 1SB3 C; 4IM2 A; 4IW0 A; 2J4X A; 1FXT B; 4LNN A; 2GBR A; 3ZIM A; 2QIE B; 4OW0 A; 4MEL A; 3NVW A; 1WXA A; 3ZTC A; 5DPS A; 2BTE A; 4YWG G; 1EU4 A; 4FJZ A; 3QX1 A; 1SBB B; 2DNF A; 2LJ5 A; 1A5R A; 3W1Y A; 1TKY A; 1V1P A; 3WAL A; 2ICI A; 4TKN A; 2VZK D; 3Q2A C; 1QKZ A; 1SGH A; 2IGD A; 1RYJ A; 1QQR A; 3ZTD A; 2PLP A; 3TEX A; 1TGZ B; 1DOY A; 5FKA C; 5LNK 1; 5HKH A; 3HVZ A; 1YIW A; 3GS2 A; 2MCN B; 5LLI A; 2RPQ A; 1D5M C; 2M56 B; 4A3O A; 1L0Y B; 4LNK A; 1EU3 A; 2GBJ A; 1NI2 A; 5IO9 A; 1PGA A; 2G1E A; 2QMT A; 5C3J B; 1P1A A; 3AN1 A; 2KXJ A; 4J3O D; 4YTM B; 4I6P A; 1JWM D; 3CMM B; 3Q6B A; 3GE8 C; 4F8C B; 3U30 A; 2NS5 A; 4TSS A; 4C56 C; 2I2Y A; 2I1J A; 4DDI D; 2LHE A; 1HQR D; 1AAR A; 2MX2 A; 1P9D U; 3TMP B; 2L83 A; 2KX0 A; 2N7E A; 2QC8 A; 1SEB D; 4WJN A; 2KQS A; 1K52 A; 3ZNZ B; 3KUD B; 3BK1 A; 3NRZ A; 4ARC A; 1WMH A; 2XK5 B; 4FJY A; 4DXA B; 2KDE B; 3QAQ A; 2RGF A; 1E10 A; 1I4R A; 3KYC D; 1EF1 A; 2WNM A; 2AQ1 B; 2D11 A; 3W1S A; 1WZ3 A; 3K9P B; 2L1A A; 4YSX B; 2CHX A; 3RCZ A; 1ZXI A; 3HK0 A; 1T5X D; 1FRD A; 2NR2 A; 3SDL C; 2KZR A; 4GXB A; 2MBE A; 3ZUN A; 1SE3 A; 2KLG A; 3FAH A; 2MEK A; 1WXS A; 1MHX A; 1QOB A; 3RZW C; 2EKI A; 2K6Q A; 2M19 A; 5GMV A; 2ZW1 A; 4N9F 4; 1L7Y A; 2WXR A; 1OFF A; 2L00 B; 4HRO A; 4B0E A; 4NJC A; 5E6J A; 1HTO A; 4RGN A; 1GB1 A; 2J53 A; 2FCS A; 5C2T B; 4DBG A; 2ZZP B; 2BWE S; 1QOF A; 4C4V A; 2LWP A; 4WWP A; 2KFJ A; 1C4C A; 2UU7 A; 4BKT A; 4MDK E; 4DK5 A; 4RFB A; 4WUR A; 1DGJ A; 1F77 A; 3TCA A; 1E7U A; 2G9H D; 3AE6 B; 2N9P C; 5J18 A; 3UF8 A; 4X57 B; 1HTQ A; 3M3J A; 2LZ6 A; 4YXD B; 3PVL A; 2MBB B; 1QLB B; 4MGY E; 1YN3 A; 3PRP B; 5BYQ A; 4JQW C; 1SJH D; 3VHT C; 3IAS 1; 1TJE A; 4BAX A; 2Z8L A; 1N63 A; 4IDI A; 4KVG B; 4FHJ A; 5BYS A; 3HUI A; 2Y3A A; 1IP9 A; 4EZL A; 3CSF A; 1VDV A; 1GC7 A; 2BVC A; 1E8Z A; 3DVG X; 3TUO A; 5HG2 A; 1FD6 A; 1WGH A; 2WXP A; 1QT9 A; 4A6Q A; 1ZDV A; 1WFY A; 2SAK A; 2MJE A; 1C9F A; 3H9D A; 3AH7 A; 4FBJ B; 3AM9 A; 2JSV X; 4QAY A; 2BT6 A; 3APD A; 1FM0 D; 1Q10 A; 3L0W B; 2BW2 A; 5D3D A; 4KIK B; 4WWO A; 1S1Q B; 4GOC A; 4WJO A; 2W54 A; 2RSU A; 1E8Y A; 1L2N A; 3ZJV A; 4K1R B; 1TYG B; 2KDB A; 3IHP C; 4NQK E; 3NUH B; 1LFD A; 2KKC A; 4MH0 E; 3DCG A; 3PV1 A; 4KSL C; 4E3C A; 1Y56 A; 4JL9 A; 2E6X A; 1WZ0 A; 2VH2 A; 4KX6 B; 1RWS A; 2JYT A; 1SIJ A; 1EM7 A; 3R7R A; 2HDE A; 3R3M A; 2DLB A; 4HXD A; 1WJ6 A; 1I4G A; 2YVC A; 3VQI A; 3MP9 A; 5L83 A; 3Q8A A; 1STE A; 5C1Z A; 1ROE A; 4G11 A; 2IND C; 3OJ3 A; 4B9K A; 1YJI A; 4G0N B; 1WRD B; 4ANX A; 2KMC A; 4LCD E; 1FNW A; 4ASW C; 1K50 A; 2INP E; 1WE6 A; 3NVV A; 1Q0W B; 1C1Y B; 2V4L A; 3HVD A; 3QQ8 B; 3VH3 B; 5JXV A; 3ZYY X; 3ZNI D; 3DVN V; 4LNF A; 2GBN A; 2HJ8 A; 1YQ4 B; 1NI3 A; 4HEA 1; 4GIV A; 2GMI C; 1EWY C; 2LGS A; 3EA6 A; 5HFY A; 3IBE A; 3Q8E A; 2QHO A; 1IPG A; 2IY0 B; 3DVN U; 3RNE C; 3HM3 A; 2C7M B; 2IO1 B; 5IAA C; 4A3P A; 2BYE A; 2KMM A; 3I57 A; 1N6Z A; 3IVF A; 2OJR A; 2R2Q A; 3U52 E; 3P42 A; 4XC2 A; 2RDH A; 1AYF A; 4BOS C; 1ZP0 B; 2KC1 A; 2WS3 B; 4NAM A; 4EZJ A; 3MC9 A; 1GJZ A; 2NPT A; 2G45 B; 1BT0 A; 4A55 A; 2A4Z A; 3PRZ A; 1PDX A; 3P63 A; 1D4B A; 2MWS B; 3KQ4 A; 2KD0 A; 3A33 B; 3VRB B; 4MSM B; 4XYC A; 1J8C A; 4GMV A; 1PUT A; 2BWF A; 3KH0 A; 2N1W A; 2MJ3 A; 4EOY A; 2K25 A; 1MI0 A; 2GLS A; 2INN E; 1J7A A; 2YEP B; 3C8Y A; 4ZHP A; 4HKQ A; 5BMI A; 2NPT B; 3A4S C; 4TMA B; 2REX A; 2CU1 A; 1VLB A; 2J0M A; 1WGY A; 2N7J A; 2AWT A; 4IM0 A; 1LXD A; 1SSN A; 4M8N A; 3ZJT A; 4REZ A; 3EHV A; 2WDV B; 3UIO B; 3WAO A; 1TS2 A; 3NG0 A; 5AZF A; 2IJ0 A; 2JU6 X; 1I35 A; 1EUV B; 1BML C; 2JRI B; 1D3Z A; 3AEB B; 4MAC A; 4K7U A; 5DPT A; 3L17 A; 1Q5W B; 1IBX B; 4DXG A; 3ZDT A; 3WAN A; 3GZN I; 4LJO B; 2FUG 1; 3Q8C A; 2CU3 A; 2JPH A; 3DWM A; 3DWG C; 1YD8 U; 3JW0 X; 2AYO B; 4S17 A; 1F9J A; 3RNG C; 1XF5 L; 5G5G A; 1XQQ A; 2W55 A; 3BYT B; 2GI9 A; 3Q3F A; 1KLU D; 4MGI E; 5T8I A; 3ONS A; 4K81 A; 3RNC C; 1FEH A; 1L4Z B; 3N1Z C; 1H4R A; 3BIN A; 3A9J B; 2LMC A; 2V9H A; 3WCQ A; 5D94 A; 3JSV B; 2KTF A; 2KWV B; 2N1V A; 3GB1 A; 3ALB A; 1WXM A; 2NTS A; 2L3Z A; 1WRI A; 4II3 B; 5TR5 A; 4AQ7 A; 5E6P A; 2BF8 B; 5DPW A; 3EFC A; 3WAM A; 1KRH A; 3CWI A; 4M02 A; 4GDK A; 4B0M A; 4BOZ B; 1NYR A; 3DPD A; 4HPP A; 2LHD A; 2ZNV B; 2KTR A; 2QJL A; 1UGJ A; 2WXO A; 1E6E B; 3SEB A; 1HZ6 A; 2N9K A; 2PVO D; 3IG3 A; 4Q2J A; 4IWQ A; 3GOE A; 1M4V A; 3ZLZ A; 2JZ3 B; 2XN9 C; 4NNJ B; 3W2D A; 1N60 A; 2ZCB A; 4P1C C; 2AEH A; 1TS4 A; 3H7P A; 3HM6 X; 3RZF A; 4OVZ A; 5EDS A; 4LNO A; 3L4P A; 1C4P A; 3A1Q A; 1YQ3 B; 3KUC B; 1I4H A; 1RFK A; 3MC0 B; 4JPS A; 2JZZ A; 1WSP A; 3VTW A; 4PS3 A; 4YTN B; 1NEN B; 2ON8 A; 4NQL B; 1GB4 A; 2D5G A; 3TEZ A; 5IP4 D; 4RH6 A; 1CZP A; 3TBL D; 3ZJU A; 1YN5 A; 1TS3 A; 3PLU A; 4NAW A; 2YEP F; 2FCQ A; 3VUW A; 1XT9 B; 3AU4 A; 2KWC A; 2XBB C; 3Q69 A; 3L10 B; 1JML A; 2KOX A; 2KN5 A; 4NJ6 A; 4B95 A; 4W9E A; 1MPE A; 4XDC A; 2AQ3 B; 3L13 A; 2LRU A; 3DBH I; 2LAS A; 2O2V A; 2IGH A; 3DOW A; 4A90 A; 4NAW B; 2L0F A; 3PZD A; 5CHV C; 2FBW B; 1WM2 A; 3ABV B; 1ET9 A; 1UH6 A; 4FJV B; 2WP9 B; 3SU8 X; 3VTU A; 2KC2 A; 4JE3 B; 5G2N A; 1E9M A; 3UGB B; 1UEL A; 1RLF A; 1OQR A; 2O6V B; 3AED B; 4HRS A; 3RUI B; 1KLV A; 4ZRP A; 5G55 A; 4US9 A; 2O2V B; 3RNF C; 2M0A A; 3Q8F A; 2J0J A; 2D10 A; 3VAW A; 4C80 A; 1JQ4 A; 2RD0 A; 2D07 B; 1ISN A; 3ENE A; 4RGT A; 2OED A; 4DHZ E; 5CTR C; 1V9J A; 4M8M A; 4MH8 A; 3CF6 E; 4I6L B; 2NTT A; 1GNU A; 4WQM A; 3RMK C; 4A8X C; 3LJ3 A; 2K5P A; 3V61 A; 3DBS A; 1WF9 A; 4OZC A; 2Z59 B; 4W9G A; 4S0R A; 4TV3 A; 1Z5S B; 3P4R B; 2XK5 A; 4ANW A; 3QCA A; 1V80 A; 1FCC C; 1ZXH A; 2PTL A; 5E6N A; 1XXG A; 1ZOY B; 2G4S A; 1I7H A; 1JRU A; 2N7D A; 2M1M A; 1J7B A; 2GRI A; 5AUI A; 5LXI B; 2N4F A; 4ZDV A; 2MBQ A; 2PPH A; 4MM3 B; 4YSZ B; 1AN8 A; 1CK1 A; 2KDM A; 2WXL A; 1KM7 A; 4BKS D; 2N0S B; 1WJN A; 1WWT A; 2J0K A; 2BQQ A; 2ACZ B; 4CQN A; 3TL5 A; 2B76 B; 3V6E B; 3N9Y C; 1NVI D; 3NZ3 A; 5JHB A; 2WU2 B; 2NVU I; 3DHG C; 4P16 A; 4HDQ A; 1V6E A; 2ZJD A; 4R3D A; 3PZ7 A; 4FA6 A; 4OVV A; 3H6N A; 2LXA A; 3R8B A; 2AL6 A; 1IYF A; 3QJZ A; 3PHX B; 4MT5 A; 1EO6 A; 1BUI C; 1XLQ A; 4C00 A; 4KKI A; 2PMV A; 3VRA B; 4JIO U; 5D6J B; 1D6E C; 1I42 A; 4ZOH C; 2WHI A; 3VUX A; 1L6V A; 2M17 A; 1WYG A; 1N62 A; 5IN7 A; 2KDF B; 1FPY A; 2WXN A; 2DWQ A; 4P1B C; 1JCK B; 4WIP A; 3EUB 2; 4W9D A; 1IGD A; 3BVZ A; 4W9F A; 2PE9 A; 1VZ8 A; 4W9K A; 1T0R C; 3NJT A; 2PEA A; 4EE2 A; 1XD3 B; 5G5H A; 4A9A A; 3AE9 B; 4GDL A; 3DDC B; 3I3T B; 3MC8 A; 2FNJ B; 1VZ6 A; 1E8W A; 4WH4 A; 1V81 A; 4ACF A; 3ECI A; 3L54 A; 5BMH A; 1OQY A; 2Y5B B; 4FUL A; 1EF5 A; 3RNB C; 2C5L C; 1KH0 A; 3I9V 1; 3DHI C; 1UWX A; 4LJP B; 3Q8B A; 1T0Q C; 2KJ6 A; 2Y5C A; 4MGZ E; 2JVC A; 1ZDX A; 4M00 A; 3OWE B; 3AEG B; 3RNA C; 4GDL B; 4PT5 A; 2WLB A; 3VTV A; 3H8H A; 4NJ7 A; 2N9L A; 3EC8 A; 3MFG A; 1F2R C; 5E6O A; 3M62 B; 2EKE C; 4K3C A; 1WJ4 A; 3IFW B; 3N1X C; 3FKY A; 2LGY A; 4KIK A; 3U8Z A; 4AOF A; 5AZG A; 1R4M I; 3MHZ A; 3FC4 A; 4WJQ A; 2DZM A; 2WXJ A; 4G50 A; 4BVU C; 2HTM E; 4KGR A; 3AUL A; 3IT6 B; 2BS3 B; 4RGO S; 1TIF A; 4XWT A; 4ARI A; 2RPV A; 3AMZ A; 1V97 A; 1XCT L; 2OJW A; 2R61 A; 4IOI E; 2L0T A; 4L2Y A; 3R2I A; 1YX5 B; 3PS6 A; 1UNS A; 3AEF B; 3RPF C; 1TBE A; 5KHQ A; 3X23 A; 1JWU D; 1GC6 A; 2FAZ A; 2HTH A; 1L0X B; 3B2G A; 1LM8 B; 1I4P A; 4L23 A; 3QC8 B; 1SE4 A; 4AP4 C; 3ZQ4 A; 2KJR A; 1WR1 A; 2KDI A; 4ZHO A; 4RF1 A; 2L8J A; 2BKR B; 1TZ1 A; 4BKG A; 4ZRI A; 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