The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
|
sequence length |
65
|
structure length |
65
|
Chain Sequence |
KEEVTIKVNLIFADGKIQTAEFKGTFEEATAEAYRYADLLAKVNGEYTWDLEDGGNHMNIKFAGK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Comparison of the crystallization and crystal packing of two Fab single-site mutant protein L complexes.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Fab 16D9D6, light chain
|
| molecule tags |
Immune system
|
| source organism |
Finegoldia magna
|
| total genus |
15
|
| structure length |
65
|
| sequence length |
65
|
| chains with identical sequence |
F
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-01-21 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1K52 A; 1FD6 A; 4WH4 A; 2ZW0 A; 1ZXH A; 2PLP A; 1Q10 A; 2ZW1 A; 5BMH A; 2PW9 A; 2KN4 A; 2ON8 A; 1HZ5 A; 4OZA A; 2QSD A; 2ONQ A; 1P7E A; 4HJG E; 3GB1 A; 2IGH A; 1MPE A; 4GLS C; 3UI3 A; 4KGS A; 2IGD A; 1MHX A; 1PGA A; 2I2Y A; 2N7J A; 1IGC A; 1F2R I; 1D4B A; 1FCC C; 5HFY A; 1F2R C; 1IGD A; 2OED A; 1QKZ A; 1K50 A; 2EEL A; 2KDM A; 2JZP A; 2J53 A; 3FIL A; 5BMG A; 2K0P A; 1PGB A; 4IKG A; 1MVK A; 2GB1 A; 1UWX A; 1XCT L; 4D2K A; 2LHD A; 1IBX A; 1P7F A; 1XCQ L; 4IOI E; 2JXT A; 5HG2 A; 2I38 A; 2RMM A; 1MI0 A; 1KH0 A; 1HZ6 A; 1XF5 L; 5HHD G; 4KGR A; 2GI9 A; 2N9K A; 2IGG A; 5JXV A; 2N9L A; 1K51 A; 2JWU A; 1MHH E; 2LUM A; 4HKZ E; 5BMI A; 1GB1 A; 1EM7 A; 2KQ4 X; 3V3X A; 3MP9 A; 1C9F A; 1FCL A; 1HEZ E; 2KAC A; 2LGI A; 5HI1 A; 1YMH E; 1JML A; 2JU6 X; 2PTL A; 2QMT A; 3FIL B; 1PGX A; 4KGT A; 2KWD A; 1K53 A; 2J52 A; 4OZB A; 1YNT E; 1GB4 A; 4MAC A; 1IBX B; 2NMQ A; 4OZC A; 2JSV X; 2RPV A; 2LHE A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1TS3 A; 4B6W A; 2KK8 A; 4AWJ A; 3ZDM C; 4JWU C; 2ZW1 A; 3A9J B; 4M02 A; 1ZPS A; 5IO9 A; 2FAZ A; 3E56 A; 5AEK B; 1HZ5 A; 5BYR A; 3ENE A; 4C80 A; 3CST A; 3Q3J A; 4GLS C; 2KT7 A; 4KV2 A; 1MHX A; 2WXO A; 3AEB B; 4USA A; 4J3O D; 3AE1 B; 1ROE A; 2MCN B; 4ICV A; 2BYF A; 2SAK A; 1N5X A; 2QIE B; 4TMA B; 1FCC C; 3APD A; 2H88 B; 5HFY A; 3TEW A; 2LAS A; 1JCK B; 1F2R C; 4KVG B; 1F52 A; 1PYW D; 2K0P A; 3RMK C; 1LQB A; 1L2N A; 2A4Z A; 3OWE B; 3M95 A; 2IDY A; 1PUT A; 2J0J A; 3TCA A; 4HLE A; 1GOZ A; 2RSU A; 4MEM A; 4MGZ E; 4M0W B; 1R7S A; 2NBV B; 4WWO A; 4C56 C; 1VCB A; 3PS6 A; 1C4C A; 2X38 A; 4LNN A; 1P9D U; 2JT4 B; 3W9C B; 1OTR B; 2J0K A; 2FCQ A; 2ZCC A; 3R66 C; 2WYQ A; 3RZF A; 3H7P A; 2M19 A; 4G3X B; 3HM6 X; 4A9A A; 1ESF A; 3IG3 A; 1FXI A; 1L0X B; 4N6E B; 2R2Q A; 5JZE B; 1M94 A; 4KZC A; 4DHJ B; 1P0R A; 2Y5B B; 3NZ3 A; 1TGZ B; 4B9K A; 2G4D B; 3AMZ A; 4R3D A; 4ZHP A; 2FNJ B; 2PVO D; 3W1S C; 2W3S A; 2DYM A; 5GMV A; 1I7H A; 2MRP A; 2NTS A; 3APF A; 3PTF C; 3QJZ A; 2LVP A; 4EOY A; 1I4R A; 2YEP F; 3JSV B; 4JQW C; 1ZXH A; 5BMH A; 4B0M A; 2UWQ A; 2RDH A; 4IDI A; 4A20 A; 3H9D A; 1SF0 A; 4K3C A; 3AE2 B; 2K39 A; 3PV1 A; 4BVU C; 1T3Q A; 1UGM A; 1UWM A; 2L00 B; 2MLB A; 2KC1 A; 5IN7 A; 4RFB A; 4LTU A; 3IBE A; 4OVZ A; 2WXN A; 1QOB A; 2GRI A; 1ZP0 B; 2GBK A; 2NS5 A; 3VXW A; 3BYT B; 4ARI A; 4K3B A; 2NTT A; 2Y3A A; 2AQ2 B; 2KDI A; 4EFO A; 3U4E G; 2NVU I; 4ZYS A; 3IT4 B; 4KX6 B; 4DXG A; 1V1O A; 4WUR A; 4K7S A; 2LHD A; 2INN E; 4MJS B; 2GOW A; 2V3N A; 1KOT A; 5FR3 A; 2BT6 A; 1XLQ A; 1L6U A; 3ZXV A; 2IJ0 A; 1TIF A; 1WJ4 A; 4DDI D; 3NS8 A; 2L83 A; 3WAN A; 1S3S G; 3GOE A; 2M0X A; 2MWS B; 3CSF A; 3NVZ A; 3W1Y A; 4ITK A; 3MJ5 A; 5JXV A; 1JRP A; 3RI7 C; 4RMA A; 2KJ6 A; 1I35 A; 3UQB A; 3MTN B; 1EF5 A; 2LD9 A; 4WJQ A; 3J9C A; 3B1L X; 5CHV C; 1HEZ E; 2LGI A; 3C19 A; 1CK1 A; 4K1R B; 1V86 A; 3AEE B; 2E6X A; 2M8S A; 4W9H A; 4W9F A; 1JRU A; 2BB5 A; 2Y5P A; 1WGH A; 3OJ4 B; 2FID A; 2KFJ A; 3LYY A; 2W9N A; 2KVR A; 4OZB A; 1V5O A; 1L4Z B; 1YNT E; 3CF6 E; 3OAW A; 2BS3 B; 3P1M A; 4RCO A; 5AZF A; 1WM2 A; 3VDZ A; 3DVN U; 2GBR A; 2KTR A; 4KDL B; 2G1E A; 3N3K B; 4C7Z A; 3ZNI D; 3QQ8 B; 4LJP B; 3W5V B; 2L76 A; 2L8J A; 1J7A A; 1TS4 A; 4RGM A; 4GU2 A; 1N6Z A; 2ZVN A; 2DWQ A; 3QWZ B; 4G0N B; 1WIA A; 1VRA B; 3QC8 B; 5IA7 A; 2YVC A; 3B2F A; 1A70 A; 3KYD D; 2R61 A; 4PS8 A; 2R2O A; 3OLM D; 3RNF C; 4LNO A; 5AUK A; 1D6E C; 3TJP A; 3B9J A; 2BYV E; 2JRI B; 5C23 A; 2JY6 A; 2D3B A; 1SE9 A; 1XCT L; 1R4N I; 1J8C A; 4GGQ A; 1IBX A; 1WI0 A; 1UBI A; 4IM2 A; 1ZOY B; 2KVZ A; 4IOI E; 2KD0 A; 2I38 A; 1N62 A; 3EFU A; 4ZRK A; 4A55 A; 2J0M A; 4N58 A; 5CX3 A; 1XF5 L; 3HK0 A; 2IY0 B; 3EEC A; 3ZLZ A; 4HPM B; 1WYG A; 1V80 A; 1VDV A; 4ARC A; 1KLG D; 4FN2 A; 2Z0D B; 3VVW B; 1HXY D; 4GDK A; 4WQM A; 3V3X A; 1JQ4 A; 1WRI A; 3C8Y A; 1N63 A; 2LFI A; 1E8W A; 1E9M A; 4LDT D; 4FA6 A; 3AUL A; 2W82 A; 2CS4 A; 2CJO A; 2QIL A; 1QF6 A; 3AE4 B; 4MGI E; 4YTN B; 1SJE D; 4A3O A; 4NZL B; 3B0A A; 4EUT A; 1PDX A; 3KQ4 A; 2JX5 A; 3KWV A; 2KMM A; 1I42 A; 1MG8 A; 1STE A; 4II3 B; 5E6O A; 3VUX A; 4FHJ A; 2JQR B; 2WLB A; 4YTP B; 4N9F 4; 4W9K A; 2MBO A; 2JWZ A; 1PGA A; 2I2Y A; 2PE6 B; 3AEA B; 2NBU A; 3UIP B; 3V61 A; 4JIO U; 5LLI A; 3ZVV A; 1Q5W B; 2VZK B; 1AN8 A; 3TBL D; 2EKE C; 1ISN A; 1I4P A; 2N7D A; 3HUI A; 3O13 A; 2DAJ A; 4Q2J A; 4W9I A; 3KLS X; 4NJ6 A; 4XGA B; 4TQ1 A; 2KN5 A; 1T6B X; 4F8C B; 1RYJ A; 2FBW B; 1LXD A; 5J17 A; 3N20 C; 3RN9 C; 3TEY A; 4MGK E; 1XLP A; 1FPY A; 2JF5 A; 3AE9 B; 2KX3 A; 1XEE A; 3AEC B; 2O6V A; 4HKQ A; 2BW2 A; 2WXM A; 3ZTC A; 5HHD G; 4NAM A; 3P42 A; 3R8B A; 3W2D A; 1FIQ A; 3DHG C; 5D6J B; 3C0R B; 1RWS A; 3TEZ A; 3PGE A; 2LUM A; 2DX5 B; 2O2V B; 4IM0 A; 2DHZ A; 4DXF A; 4HRS A; 1YD8 U; 1MG4 A; 1OQY A; 2BWE S; 3Q3F A; 4L1B A; 3UGB B; 4K7W A; 1R4M I; 3L17 A; 1TBE A; 3AU5 A; 1UH6 A; 1LM8 B; 1TY2 A; 2K6D B; 3EC8 A; 5LNK 1; 1E7U A; 1NI2 A; 1UBQ A; 4AQ7 A; 2MP2 B; 4RF0 A; 3JYU A; 3U7Z A; 2FUH B; 1JAL A; 1F9J A; 1Q10 A; 4JL9 A; 3Q3O C; 1SJH D; 1FXT B; 1DGJ A; 3VFK A; 1F1H A; 5E6J A; 4XDD A; 3A1Q B; 4XE0 A; 3EGR A; 2INC C; 3NOB A; 4FLH A; 3PO0 A; 2MEK A; 1XQQ A; 5CHF A; 1V9J A; 2KC2 A; 4JE3 B; 4I6L B; 2EEL A; 1QLB B; 5BMG A; 3NHE B; 4W9G A; 3ECI A; 4HRO A; 4IG7 B; 3AE7 B; 4ZRJ A; 3KH0 A; 1JWS D; 2XBB C; 3RNC C; 3VTV A; 4I6N B; 2H89 B; 2NCN A; 4KDI C; 4NAW B; 4EZL A; 1KRH A; 2HE7 A; 5G5G A; 1EWC A; 2J42 A; 3KYC D; 2WWZ A; 4TV3 A; 2D2Q A; 1L7Y A; 4WAA A; 2HTH A; 3RNE C; 3QAR A; 2N9L A; 1EU4 A; 3HRD D; 2KZR A; 3PSE B; 4JPS A; 4HKZ E; 1L0Y B; 1I4Q A; 3Q8C A; 3IT6 B; 3SD5 A; 2NBW B; 4B95 A; 1TT5 B; 3I9V 1; 3FIL B; 4JLC A; 3T8M A; 4PS7 A; 2B3A A; 5D2M B; 5IP4 D; 2EMS A; 2ZJD A; 3GE3 C; 1V97 A; 4BOZ B; 1F0Z A; 3EUB 2; 4OZC A; 3RFZ B; 4CO7 A; 5HKH A; 3D32 A; 4WH4 A; 2C7M B; 1TYG B; 1WGG A; 2W3R A; 3Q14 C; 2KN4 A; 3DBS A; 3VR8 B; 3A9K B; 5L95 C; 3DCG A; 2ONQ A; 4P6V F; 1C78 A; 4ANV A; 1VJK A; 3GB1 A; 3PZ7 A; 2M17 A; 2KDB A; 3AXC A; 4P7I A; 2PIA A; 4A6Q A; 1CMX B; 5DPW A; 2PKO A; 2FCM A; 2KAJ A; 4RGT A; 3DOW A; 2M56 B; 4ZRQ A; 2V1Y A; 1C79 A; 2V3P A; 1WFY A; 2I1K A; 2CHW A; 2DYB A; 1YQ4 B; 3LXF A; 1YOV B; 1HTO A; 2BYE A; 4AOF A; 3ZJU A; 3ZJT A; 2QEJ C; 5E6N A; 3L54 A; 4OW0 A; 2KWV B; 1WGR A; 2XK5 B; 4XZ4 A; 5HG2 A; 3DHH C; 2VZK D; 1QOG A; 2J7Q B; 3AM9 A; 2KFK A; 4YSY B; 3NY5 A; 4ZOH C; 2IO1 B; 3PHX B; 2GI9 A; 2MX2 A; 2AYO B; 2M4N A; 2YEP B; 1V81 A; 3QK0 A; 1ENF A; 2KQ7 A; 5D3I B; 1MHH E; 2KX0 A; 3QHT A; 1AAR A; 1TZ1 A; 3FC4 A; 2IND C; 2QMT A; 4NJ7 A; 4XDC A; 3KUZ A; 3A4R A; 1JWM D; 2KDE B; 2V0G A; 2D3G A; 4LDT B; 2KWD A; 2C7H A; 3Q3M C; 5D7G A; 3BVG A; 1VD2 A; 2WX0 A; 1KFY B; 3ZNG C; 4GIV A; 1UD7 A; 3N1X C; 4K81 A; 5LXH A; 1YN5 A; 1XD3 B; 1ZDX A; 3AEG B; 2ON8 A; 4OZA A; 3X0W A; 1MPE A; 2K5P A; 3H7S A; 3ABV B; 1U4A A; 2IGD A; 4IWQ A; 4KGS A; 4URK A; 3RNB C; 3L4P A; 1UGJ A; 3P4Q B; 3QAQ A; 3ZDT A; 1FXA A; 1LFD A; 1NVI D; 2AEH A; 2FCS A; 4QAY A; 1ET6 A; 4FHK A; 5AZH A; 1SXT A; 1XLO A; 1IGD A; 1NEK B; 2KWC A; 1WXS A; 1TS2 A; 2DZJ A; 4XWT A; 4YWG G; 1HTQ A; 4MEL A; 3ZTD A; 1RM6 C; 4NQK E; 4HDO A; 2LVQ A; 5CHW A; 2DZI A; 2QCZ A; 1Q1O A; 1HQR D; 3GP7 A; 1JWB D; 2ZPY A; 2PEA A; 1C3T A; 1KH0 A; 2PMV A; 4FBJ B; 1BUI C; 5AUI A; 4KGR A; 2WU5 B; 3VRA B; 3V6E B; 1WGK A; 5BO4 B; 1IP9 A; 2IO3 B; 2MQJ A; 2QHO A; 4FJV B; 3M3J A; 4ICU A; 2AQ3 B; 1C77 A; 1LGR A; 2KQ4 X; 1J0G A; 5FKA C; 1WSP A; 2PJH A; 4TQ0 A; 2JU6 X; 1PGX A; 1EO6 A; 2E3T A; 1YQ3 B; 1ZDV A; 2K6Q A; 3KUC B; 2BS2 B; 1WF9 A; 1FFU A; 5C1Z A; 4YSZ B; 1UUP A; 2D11 A; 5D94 A; 3GZN B; 4MSM B; 4MAC A; 2MJE A; 3Q8E A; 1BML C; 3JVZ X; 2NPT A; 2WXJ A; 2IGG A; 1V1P A; 1YN3 A; 1K52 A; 3V60 A; 3MC0 B; 2A5U A; 2K3U A; 2O6V D; 2PW9 A; 2AX5 A; 1D5M C; 1NEN B; 2Y5C A; 4W9J A; 1J7B A; 3DBL B; 3QX1 A; 3UQA A; 1TS5 A; 4US9 A; 4F7Z A; 3H7P B; 4HVB A; 1G6J A; 5EDS A; 5EE9 A; 2N9X A; 2LJ5 A; 3RPF C; 1FM0 D; 3Q3N C; 2LRW A; 4FUL A; 3A4S C; 4GSW A; 4GDL A; 1N61 A; 2IO2 B; 3O65 B; 2LRU A; 3MHS D; 3WAM A; 2N7E A; 2MW5 A; 2CU3 A; 1BXT A; 4N59 A; 1QZE A; 2ZCB A; 4NY0 A; 1P7F A; 2B76 B; 1WMH A; 1SEB D; 2JXT A; 4ZYN A; 3AI5 A; 2D07 B; 2K9X A; 2ASQ A; 1ZKH A; 2LEK A; 4BKS D; 1HZ6 A; 4LJO B; 4S0R A; 2JZ3 B; 3UF8 A; 4KIK A; 1C4A A; 3ALB A; 4C4V A; 1K51 A; 2BB6 A; 1SE4 A; 2N0S B; 3T3N A; 5G2N A; 2CKH B; 3JW0 X; 1ZW7 A; 1CZP A; 1SE2 A; 1VZ8 A; 1P1A A; 1KLU D; 1C9F A; 1L0V B; 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3U7D A; 3ZUN A; 3DBH I; 3M63 B; 1B1Z A; 4GDK B; 3VAW A; 2GBM A; 3BVZ A; 1UF0 A; 3BZD B; 2D3A A; 1D3Z A; 2WXK A; 1S1Q B; 4GB9 A; 1YJ1 A; 1E10 A; 3N1Z C; 1IPG A; 1KM7 A; 1V2Y A; 2L05 A; 3ZRF A; 1UWX A; 1QQR A; 1WR1 A; 1I4G A; 2DZM A; 3Q69 A; 1TKG A; 1V6E A; 1VZ6 A; 2RMM A; 2KDF B; 2HJ8 A; 3ZQ4 A; 3A9J A; 4P1B C; 3HVD A; 4REZ A; 2KJH B; 1WJU A; 2ICI A; 2N9E B; 3ONS A; 2WQY B; 1GC6 A; 3DVG Y; 3KW5 B; 1PQS A; 1T0R C; 2AWT A; 4RM9 A; 2V4I B; 5D3D A; 2ACZ B; 4WQO B; 1RFK A; 1CQV A; 5FR6 A; 1E90 A; 2XK5 A; 1SIF A; 1WRD B; 2KKC A; 3FAH A; 1IYF A; 3MP9 A; 1ACC A; 3QIJ A; 1FRD A; 3H1U A; 2NR2 A; 2ZNV C; 1SSN A; 3ZNH B; 1EUV B; 1FFV A; 2G4S A; 2J52 A; 4M01 A; 2L7R A; 1SBB B; 1AW7 A; 2W54 A; 2MBQ A; 5JHB A; 4M0W A; 4HWI B; 1LO5 D; 3DVN V; 3I3T B; 4J6I A; 2WGS A; 1WM3 A; 2O6V B; 2X8X X; 1FNU A; 2Z8L A; 3UI3 A; 3K9O B; 1HE8 A; 4TUU A; 2LXC A; 3PZD A; 3P4P B; 3A33 B; 4XC2 A; 4WJP A; 2I1J A; 4HCP B; 4LCD E; 4E74 A; 4PS3 A; 3AN1 A; 4F1S A; 1WXQ A; 2L1A A; 1QOF A; 2AL6 A; 2N1V A; 4BAX A; 2PE9 A; 3Q2A C; 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