The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
32
|
sequence length |
98
|
structure length |
98
|
Chain Sequence |
GSTVPYTITVNGTSQNILSNLTFNKNQNISYKDLEGKVKSVLESNRGITDVDLRLSKQAKYTVNFKNGTKKVIDLKSGIYTANLINSSDIKSININID
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The Crystal Structures of EAP Domains from Staphylococcus aureus Reveal an Unexpected Homology to Bacterial Superantigens.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
truncated cell surface protein map-w
|
| molecule tags |
Toxin, protein binding
|
| source organism |
Staphylococcus aureus
|
| total genus |
32
|
| structure length |
98
|
| sequence length |
98
|
| chains with identical sequence |
B
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-01-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF03642 | MAP | MAP domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SJE D; 4C56 C; 1YN3 A; 1JWU D; 3O13 A; 1FNU A; 4RFB A; 1I4P A; 1SBB B; 3MFG A; 1D5X C; 3W2D A; 3OWE B; 1FNW A; 1V1O A; 1TY0 A; 2AQ2 B; 1I4G A; 5D3I B; 1KLG D; 3SEB A; 4ZYS A; 2AQ1 B; 1JCK B; 4TSS A; 4O1N A; 1D5M C; 1YN5 A; 1UNS A; 2QEJ C; 3BZD B; 2ICI A; 3V05 A; 2XN9 C; 1B1Z A; 2AQ3 B; 1CK1 A; 1BXT A; 1SXT A; 1T5X D; 2RDG A; 2G9H D; 1EU4 A; 2SEB D; 1JWS D; 1GOZ A; 2R61 A; 1ET9 A; 2RDH A; 1JWM D; 1AW7 A; 3BYY B; 1SJH D; 1F77 A; 4DXG A; 1FNV A; 1QIL A; 1ESF A; 1TS5 A; 1LO5 D; 1SE4 A; 5FK9 C; 4RGO S; 3TSS A; 1HQR D; 3KLS X; 1ENF A; 1TS3 A; 1DYQ A; 1V1P A; 1SEB D; 1KLU D; 1HA5 A; 1UUP A; 3EA6 A; 4RGN A; 2XNA C; 5TSS A; 1XXG A; 1V1P B; 1EWC A; 1SE2 A; 2QIL A; 1CQV A; 2NTT A; 4UDU C; 2NTS A; 1I4Q A; 2IPK D; 2Z8L A; 1D5Z C; 3URY A; 4RH6 A; 1I4H A; 4OHJ A; 2TSS A; 1AN8 A; 1STE A; 1TY2 A; 1PYW D; 1I4X A; 3R2I A; 2IJ0 A; 1L0Y B; 5FKA C; 4DXF A; 3BVG A; 3BVM A; 1D6E C; 1KTK A; 3BYT B; 1EU3 A; 1L0X B; 3R2T A; 4RGT A; 4NZL B; 1HXY D; 1TS2 A; 3R8B A; 4RCO A; 3MC0 B; 3GP7 A; 1M4V A; 1I4R A; 3BVZ A; 5I4D A; 1ET6 A; 1SE3 A; 5D3D A; 1TS4 A; 1YN4 A; 4RGM A; 2J4X A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1ZOY B; 3TL5 A; 2MEK A; 1YN3 A; 3E56 A; 4HEA 1; 4M0W B; 3VFK A; 4EKU A; 2Y5B B; 3OAW A; 4PS7 A; 4AJY B; 3QAQ A; 4YXD B; 4KDL B; 2KJ6 A; 2K39 A; 3QJZ A; 5FR6 A; 5BYS A; 3KQ4 A; 4ZDV A; 3H7P B; 1FFU A; 2ZW1 A; 1SF0 A; 3V05 A; 1HTO A; 2LVQ A; 2MW5 A; 2AQ3 B; 4F1S A; 2WS3 B; 1R4N I; 3Q69 A; 3ZTC A; 4NQK E; 3VR8 B; 3TMP B; 3AEB B; 2LAS A; 5AUK A; 3PS6 A; 2Y5P A; 1FM0 D; 3ABV B; 1WWT A; 4PK1 A; 2K6Q A; 1I42 A; 1ZP0 B; 1IGD A; 3AED B; 1DYQ A; 2LHD A; 3AM9 A; 2K25 A; 1QOF A; 4BVU C; 4USA A; 2BF8 B; 2OJW A; 5HI1 A; 4C80 A; 4CQN A; 1WZ0 A; 2D3B A; 2ZZP B; 1L2N A; 2YEP F; 3C0R B; 3ML8 A; 2IPK D; 2JXT A; 2HTH A; 2D5G A; 3N32 A; 2INP E; 5D6J B; 4CHK A; 3A4S C; 2JQR B; 4M0W A; 1UWX A; 2QSD A; 1H4R A; 4KVG B; 2J0J A; 4A90 A; 1T0R C; 1Q5W B; 2AWT A; 2KYW A; 1L6U A; 2W3R A; 1YOV B; 4WWP A; 1TZO A; 4A55 A; 4HJK A; 3PVL A; 2BKR B; 1C4A A; 4HXD A; 2KN4 A; 3W5U B; 3B1L X; 4XE0 A; 2WXG A; 4HRO A; 1UF0 A; 3PSE B; 3BII D; 1C79 A; 5D7G A; 2EKI A; 3NRZ A; 5MPO A; 2W3S A; 4P1C C; 3PZ8 A; 3TEZ A; 4MH8 A; 3OJ4 B; 4WQO B; 2KAC A; 2XK5 B; 3N20 C; 4ANU A; 1YJ1 A; 1ZKH A; 2LVO A; 3L08 A; 4RMA A; 2KLG A; 1PGA A; 2ICI A; 2R2O A; 3B9J A; 4BBN C; 5BMH A; 2INN E; 4FJV B; 1TGZ B; 3DVG X; 1SIF A; 4WJO A; 4E71 A; 1IGC A; 4K7S A; 4XC2 A; 1MPE A; 2RDH A; 4IWQ A; 2LXA A; 3SFE B; 4HDO A; 1FNV A; 1ACC A; 1EWY C; 4EZK A; 3DBR B; 2NMQ A; 5FK9 C; 3RMK C; 4RGO S; 2V3N A; 2Y3A A; 1WXS A; 3U2S C; 2M56 B; 1GC7 A; 3W1S C; 1VZ8 A; 4JPS A; 3CIR B; 1UGJ A; 2NBV B; 2JPH A; 5GMV A; 5H92 C; 3V6C B; 1ZE3 D; 1NI2 A; 2DX5 B; 3ENE A; 1KJT A; 4M02 A; 2BPS A; 2KVZ A; 2B3A A; 2LJ5 A; 1S3S G; 4DQO C; 2HD5 B; 1K50 A; 2J0M A; 2JU6 X; 4WWN A; 4N59 A; 3VR9 B; 3LDZ E; 2MX2 A; 4JGH B; 1PQS A; 3AE4 B; 4IM0 A; 2K5P A; 3KYD D; 1V97 A; 1G6J A; 4DXF A; 4OZA A; 3PHX B; 2IBI B; 5G2N A; 3PRP B; 1N5X A; 3E9S A; 4ZRQ A; 5I4D A; 2LFI A; 3OLM D; 3UF8 A; 4RGM A; 3Q8C A; 2BWE S; 3GS2 A; 2ONQ A; 1FNW A; 1JAL A; 1U4A A; 2L1A A; 5BO4 B; 1OQY A; 1N61 A; 2BTE A; 4LLG M; 2KWD A; 3M63 B; 4OW0 A; 1HTQ A; 2PW9 A; 5EE0 A; 3WA0 A; 1ZPS A; 2MJE A; 1F2R I; 2MSE D; 2BS3 B; 1XLP A; 2G9H D; 1VJK A; 1P98 A; 4HCP B; 3I63 C; 3JSV B; 1ET9 A; 1JRU A; 3NZS A; 4CYE A; 1KH0 A; 3V60 A; 4DDG D; 1J0G A; 2AL6 A; 3VUX A; 1NEK B; 3AE8 B; 5HG2 A; 2LRU A; 1HQR D; 3UQB A; 3SU8 X; 2OED A; 3RT3 B; 4JWS C; 2KC2 A; 1MG4 A; 2WDQ B; 1L0V B; 1TKG A; 2I38 A; 4G3X B; 1M94 A; 1CJE A; 1TYG B; 5TSS A; 3IFW B; 4ZYN A; 3ZXR A; 5HKH A; 2NVU I; 2NTS A; 4BOZ B; 3TCA A; 1UWM A; 1XCQ L; 1JWB D; 5AEK B; 4JL9 A; 1JRO A; 2TSS A; 2L32 A; 3Q3F A; 2DLB A; 2WNM A; 3MTN B; 2SAK A; 3Q8B A; 2KMA A; 1L0Y B; 3BVM A; 5G55 A; 2WDR B; 1K51 A; 1IUE A; 2I1J A; 3ZNH B; 3MJW A; 3WCQ A; 3KUC B; 1VZ6 A; 5IAA C; 1SGH A; 1GPX A; 3BVZ A; 2IDY A; 1V49 A; 3JSV A; 3H8H A; 2EEL A; 2KKC A; 1TJE A; 2C7H A; 4HVB A; 4GDK B; 3O13 A; 2AEH A; 4WH4 A; 1D5X C; 4K7U A; 2D07 B; 2KJR A; 3PRZ A; 2RDB C; 3ECI A; 1WRI A; 1PGX A; 1UBI A; 4XZ4 A; 3BZD B; 3ZDM C; 3RD2 A; 1NVI D; 3C8Y A; 3ALB A; 2DYB A; 3DWG C; 4LNO A; 2MBE A; 4MH0 E; 4ZOH C; 3A9J B; 5GXG B; 3LXF A; 1KLV A; 2O2V B; 3Q8F A; 3HIZ A; 1E8Y A; 2KMC A; 1HE8 A; 1R4N B; 4JE3 B; 3DBL I; 1DOX A; 2DYM A; 2CJO A; 4LJO B; 2WXJ A; 1FPY A; 3VXW A; 2XBB C; 2MQJ A; 3O65 B; 5CTR C; 1NYR A; 4ZHP A; 1C77 A; 2JUO A; 4LK0 M; 5AZF A; 1NYQ A; 4GDL B; 3VVW B; 1KFY B; 2L52 A; 4KIK B; 4HPP A; 3VHT C; 1R7S A; 1STE A; 1XO3 A; 2GB1 A; 3QAR A; 2WGS A; 3X23 A; 4DK5 A; 2IYD B; 5DPR A; 3ZTD A; 4NPN A; 2N9L A; 2LEK A; 1D6E C; 1XT9 B; 3DOW A; 1WXV A; 4B0M A; 1YJI A; 3BK1 A; 2KHW B; 1N5W A; 2X8X X; 4NZL B; 2J53 A; 3MC0 B; 2ACZ B; 2CHW A; 1QKZ A; 3N1X C; 2LGS A; 5AZH A; 4LNK A; 5G5H A; 5J18 A; 1I35 A; 3X0W A; 1P7F A; 2O2V A; 4RM9 A; 1XLN A; 2KTR B; 2R2Q A; 1TKY A; 4LCD E; 3PRM B; 1BML C; 4DXA B; 2NBW B; 1A5R A; 3ZNG C; 1EM7 A; 2AL3 A; 4O1N A; 1T0Y A; 2WXQ A; 2HE7 A; 1HEZ E; 4D2K A; 2C60 A; 1B1Z A; 3ZJU A; 2WQY B; 4P16 A; 2RDG A; 3EC8 A; 2BVC A; 5H8Y E; 1T0S C; 4GDL A; 2IY0 B; 2DZM A; 1F9J A; 3AE6 B; 4KIK A; 2GBJ A; 2MWS B; 2YVC A; 2L05 A; 2L83 A; 3HHM A; 4N9F 4; 4AUQ C; 3A33 B; 1UUP A; 2MJD A; 5LXH A; 4MT5 A; 2DBY A; 3TEX A; 2D3A A; 3W9C B; 3AEE B; 3GZN I; 3EFU A; 1VDV A; 2WXI A; 3DDC B; 1NBF C; 1Y8R C; 2KAN A; 2KT7 A; 5IP4 D; 2KTR A; 4QAY A; 4WUR A; 2DEN B; 1N63 A; 2JXX A; 2IGD A; 3L16 A; 2FCS A; 4HPM B; 2VZK D; 3A9K A; 5IO9 A; 2M4N A; 3CWI A; 2KO3 A; 2BW2 A; 2X38 A; 2E3T A; 4N6E B; 3FC4 A; 3VH3 B; 2LXC A; 4ZRK A; 2D2Q A; 2FIF A; 4FA6 A; 5EE9 A; 3GP7 A; 1QF6 A; 1WI0 A; 1JRP A; 4JLC A; 4NAW B; 2LGD A; 3K9O B; 3A4R A; 3L13 A; 4W9C A; 3V62 A; 4II2 B; 4MGZ E; 2KK8 A; 4KV2 A; 4RFB A; 3EEC A; 4PYU A; 1OQR A; 2V3S A; 3VRB B; 5D3I B; 3VTU A; 1T0Q C; 2JZ3 B; 1IYF A; 3KVF B; 1UNS A; 2KQ4 X; 3JYU A; 2J7Q B; 1UBQ A; 2G4D B; 1YX5 B; 2KQ7 A; 4WIP A; 2QIE B; 3SD5 A; 5BYQ A; 1GOZ A; 4NNJ B; 1YQB A; 2K9X A; 3DQV A; 3I5J C; 2N1V A; 4S17 A; 1ESF A; 1E90 A; 1ZDX A; 3P4S B; 4BOS C; 2QMT A; 3OG5 A; 4ANW A; 3KLS X; 1PUT A; 3IAM 1; 3M3J A; 1SEB D; 1V1P A; 1KLU D; 2CU1 A; 2N9E B; 3AI5 A; 3C19 A; 2N7J A; 2PPH A; 1EUV B; 4K3B A; 3ZVV A; 2C5L C; 5IOI A; 3OJ3 A; 4E74 A; 4E3C A; 3AN1 A; 4MM3 B; 2FUH B; 1D5Z C; 2LRW A; 3NVV A; 2JYT A; 4B9K A; 1AN8 A; 2PJH A; 3WAM A; 3IT6 B; 4LJP B; 2WDT B; 2RPV A; 4MSM B; 4US8 A; 4LDT D; 1KM7 A; 2KAJ A; 2HJ1 A; 3U30 A; 3AEC B; 3PTF C; 5E6N A; 1WXM A; 2WX1 A; 2L76 A; 4A3O A; 1CZP A; 3W5V B; 2MP2 B; 1M4V A; 2RSU A; 1MHH E; 2DZJ A; 2W55 A; 2WU2 B; 1QLB B; 1ZXH A; 1E6E B; 1DOY A; 4KGT A; 4BZA A; 5E6P A; 2L0F A; 1QOG A; 1RYJ A; 2JWU A; 4MDK E; 4Q2J A; 1ZXI A; 3QC8 B; 3PLV A; 2JVC A; 3RNE C; 1RRB A; 3H7P A; 3NJT A; 2AQ1 B; 5KHO A; 3AUL A; 5AZG A; 4XDD A; 1YN5 A; 1V2Y A; 5J2R A; 1K53 A; 2KLC A; 3NS1 A; 4P7I A; 1ZW7 A; 2I1K A; 3QK0 A; 4G11 A; 4REZ A; 4NJC A; 2BYE A; 4HRS A; 1F0Z A; 1HZ5 A; 4XWT A; 4YTN B; 4KZC A; 2C9W B; 3ZYY X; 1JWS D; 1MG8 A; 1QQR A; 5FR3 A; 3EUB 2; 2CJN A; 4C4V B; 1QIL A; 4K1R B; 3R7R A; 3APD A; 2WXR A; 3GE8 C; 3MC9 A; 3AXC A; 2IY1 B; 2MHJ A; 3KUD B; 2N7E A; 2BS2 B; 3PT2 B; 4CO7 A; 2IGG A; 3RNA C; 4FUL A; 2M0X A; 3Q8E A; 5IKC M; 3AE3 B; 1CQV A; 3K9P B; 3DBL B; 4FHK A; 4FHJ A; 1YX6 B; 4OHJ A; 3GE3 C; 2ZW0 A; 4GN1 A; 4F7Z A; 1XEE A; 2WLB A; 4FAD A; 2MBB B; 4IG7 B; 2N4F A; 2KMM A; 2PKO A; 3DHG C; 2JZP A; 4XWW A; 3JVZ X; 2O6V B; 3DBS A; 4MAC A; 2MJ3 A; 3R7Q A; 2UWQ A; 4KSK C; 3RNG C; 4DWF A; 5DPS A; 2GBN A; 1N6Z A; 3VQI A; 2NPT B; 1L5P A; 4HKZ E; 1YIW A; 2J0K A; 2LZ6 A; 1FMA D; 1J7C A; 4C56 C; 3P63 A; 2GBR A; 2XK5 A; 2VH2 A; 2H88 B; 3W2D A; 4AWJ A; 1PDX A; 2VH1 A; 2C7N B; 2JY6 A; 3AE9 B; 4TSS A; 3KH0 A; 4WAA A; 1WF9 A; 1SB3 C; 2A4Z A; 1VCB A; 1P1A A; 1WY8 A; 2Z0D B; 4GSW A; 1CK1 A; 1WGG A; 1BXT A; 2MBO A; 4DDI D; 1FD6 A; 2SEB D; 3BYY B; 2YLM A; 4DXG A; 4TV3 A; 2ZNV B; 3AU5 A; 3CSF A; 2BYT A; 3SFD B; 2JX5 A; 1LO5 D; 5LLI A; 2WDV B; 2J42 A; 4MSQ B; 4WJQ A; 1OTR B; 4WJP A; 2NS5 A; 3JW0 X; 1UD7 A; 2O6V A; 4W9F A; 3FKY A; 3TUO A; 3VRA B; 1IPG A; 5DPW A; 4MGY E; 2LUM A; 4ARC A; 3PZD A; 2BWF A; 2XNA C; 3PZ7 A; 1EWC A; 3CF6 E; 3HVD A; 4M01 A; 3MHS D; 2QIL A; 3PLU A; 1WX7 A; 2K1F A; 3KUZ A; 2NPT A; 2WXN A; 2D11 A; 3UIP B; 1I4Q A; 2CHZ A; 3P42 A; 5TR5 A; 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