The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
26
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sequence length |
125
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structure length |
116
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Chain Sequence |
DLYFNPRFLLSRFENGQELPPGTYRVDIYLNNGYMATRDVTFNTGDSEQGIVPCLTRAQLASMGLNTASVAGMNLLADDACVPLTTMVQDATAHLDVGQQRLNLTIPQAFMSNRAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Chaperone/structural/membrane protein
|
| source organism |
Escherichia coli
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| publication title |
Structural basis of chaperone-subunit complex recognition by the type 1 pilus assembly platform FimD.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Chaperone protein fimC
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| total genus |
26
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| structure length |
116
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| sequence length |
125
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-04-17 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4J3O D; 4B0E A; 1ZE3 D; 1ZDV A; 3BWU D; 4B0M A; 3RFZ B; 1ZDX A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2QHO A; 2KVZ A; 1E8Z A; 1DOY A; 2HE7 A; 1B1Z A; 2KTF A; 2K39 A; 3ZLZ A; 4L1B A; 4FJZ A; 1F0Z A; 1JQ4 A; 4RF1 A; 1I7H A; 3PZ7 A; 1M94 A; 1C3T A; 1L0V B; 3LB8 C; 2GMI C; 2JYE A; 1HTO A; 3W5V B; 3VR9 B; 4BKS D; 3PGE A; 4EZJ A; 3GE8 C; 1NEK B; 2KMC A; 2NBU A; 3UIN B; 3S2A A; 1E90 A; 3ONS A; 2LEK A; 3DQV A; 2LXC A; 3UGB B; 4PS7 A; 3DBL I; 3ZTC A; 1RLF A; 3RUI B; 1ZDX A; 3RNC C; 1K53 A; 2CHX A; 1L0Y B; 3RD2 A; 3C19 A; 3ZRF A; 2ZPN A; 1SIF A; 4O1N A; 1ZDV A; 4LTU A; 3KVF B; 3BVG A; 2D07 B; 5GXG B; 3BYY B; 3TSS A; 3L0W B; 1V80 A; 4HXD A; 4MGY E; 3EA6 A; 1HE8 A; 2KHW B; 2PE9 A; 3ML9 A; 2DAF A; 4US9 A; 3VR8 B; 1ET9 A; 4M0W B; 1WRI A; 2K25 A; 3WAO A; 4HPL B; 3DOW A; 1JWB D; 2C5L C; 2XK5 B; 3D32 A; 1J7A A; 1GC6 A; 3VDZ A; 3RNA C; 2KZR A; 1K52 A; 5BO4 B; 3FC4 A; 1TT5 B; 3SU8 X; 4B6W A; 2NPT A; 1WI0 A; 3KUD B; 1JRO A; 4MM3 A; 4NAW B; 3QIJ A; 2B76 B; 3CSF A; 1T3Q A; 3SR6 A; 1D4B A; 2FCM A; 2LGX A; 2O6V D; 4RM8 A; 2N9K A; 2ICI A; 4GGQ A; 1R7S A; 2JT4 B; 1I4Q A; 4BBN F; 3TBL D; 4LK0 M; 1E9M A; 2PE6 B; 3DBR I; 1GNU A; 3AEC B; 1L5P A; 3BY4 B; 4X57 B; 3HM6 X; 1WMH A; 1L2N A; 4RCO A; 3ALB A; 5L83 A; 1PGA A; 4DHZ E; 1VCB A; 1A70 A; 4KGS A; 3IT6 B; 2KAC A; 3I57 A; 3Q6B A; 2L52 A; 3KYC D; 2V1Y A; 4CHK A; 3TIX A; 1EWC A; 4C56 C; 2FIF A; 1VJK A; 3Q14 C; 4OHJ A; 3A33 B; 2FCS A; 3NUH B; 3RI7 C; 3NOB A; 4P16 A; 2LRU A; 2AX5 A; 2ZW0 A; 2WXQ A; 2CS4 A; 3K9O B; 2MLB A; 4BFR A; 4BKG A; 2D2Q A; 2K6Q A; 2N7J A; 2KNB A; 4ITK A; 2BYV E; 4WWP A; 1WXA A; 3A1Q B; 2ZVN A; 1VD2 A; 1WYG A; 3WCQ A; 3IHP C; 2JRI B; 3NRZ A; 3PSE B; 3R7R A; 2L32 A; 1ZKH A; 1QF6 A; 3QAR A; 5HI1 A; 1E8W A; 1NYQ A; 1PQS A; 2N9E B; 4OW0 A; 3C8Y A; 3WAL A; 2M1M A; 3VH4 B; 2REX A; 3ZXR A; 3Q69 A; 3VTV A; 2JU6 X; 1TJE A; 5IN7 A; 3AUL A; 3DBH B; 1WGK A; 1SJH D; 2PJH A; 1L4Z B; 3CF6 E; 1RM6 C; 4NAM A; 3JSV B; 3MHZ A; 2JRH A; 1FO4 A; 3WA0 A; 2RPV A; 1E0Z A; 3UIP B; 2L1A A; 3VQI A; 4EFO A; 2CJN A; 1YQB A; 3VUW A; 3SDL C; 2FAZ A; 4YSY B; 4W9L A; 1C78 A; 2KFK A; 4KKI A; 4E74 A; 2K8B A; 1IP9 A; 3AE3 B; 2KLC A; 5C23 A; 1YJJ A; 2MJ3 A; 4EKU A; 4MGK E; 5BYQ A; 2O2V A; 2NTT A; 1FNU A; 4II2 B; 2EEL A; 2YVC A; 3RYT A; 3PRM B; 3ZTD A; 2IJ0 A; 2W55 A; 1ACC A; 1RRB A; 1YNT E; 2PIA A; 3AEA B; 2V3S A; 2M56 B; 1XLQ A; 1EUV B; 2UU7 A; 2PEA A; 2KLG A; 2QIL A; 3HRD D; 4LCD E; 4MGZ E; 3PZD A; 3TEW A; 3RZF A; 2DYO A; 1C77 A; 2GB1 A; 1V1P A; 1WGG A; 1CMX B; 2WYQ A; 1XF5 L; 4FAD A; 1AYF A; 4GDK A; 1LXD A; 1CZP A; 2YLM A; 3ECI A; 1XXG A; 2I1J A; 2KC2 A; 3PRE A; 1E8Y A; 1YQ3 B; 3MFG A; 3P4R B; 3M63 B; 2NBW B; 4WQO B; 2KT7 A; 3APC A; 4IKG A; 3ZNH B; 4KSK C; 1WXQ A; 2KMM A; 3P4S B; 1T0Y A; 4RF0 A; 4J3O D; 2IGD A; 3ZRC A; 2N9P C; 4FJY A; 4CO7 A; 1I42 A; 1TKG A; 3LYY A; 1N5X A; 1R4M I; 3QCA A; 2IY0 B; 1Z5S B; 4KZ0 A; 4LNI A; 1BML C; 3VFK A; 1DOI A; 5JHA A; 3O13 A; 2K8C A; 2K22 A; 1V6E A; 4A90 A; 3AEB B; 2JQR B; 2YEP F; 4KIK A; 3DWM A; 4US8 A; 2FBW B; 1YX5 B; 4NJ6 A; 4P1B C; 2G1E A; 4WWO A; 3B2G A; 4XZ4 A; 2XEW A; 3SFE B; 4L23 A; 2H89 B; 1WJU A; 2JPH A; 3ZO5 B; 2BKR B; 3EFU A; 2IDY A; 1OEY A; 2JXX A; 1AN8 A; 3Q3J A; 1WE6 A; 2WXK A; 3DVG X; 1QT9 A; 2MCN B; 4JGH B; 2L0T A; 1V5T A; 3RMK C; 1TZ1 A; 2KX0 A; 5H92 C; 2Z8L A; 1KLG D; 1BXT A; 5GMV A; 1XLN A; 4DK5 A; 4HJK A; 4EUT A; 2K8H A; 1V8C A; 1XCT L; 3FIL B; 3AE6 B; 2LUM A; 1KLV A; 1HZ5 A; 3EGR A; 2KMA A; 4URK A; 3SD5 A; 2R61 A; 5D7G A; 1SGH A; 4NPN A; 1EO6 A; 4J6I A; 3QAQ A; 4II3 B; 4PK1 A; 1G6J A; 2XK5 A; 3PRP B; 4RMA A; 4HRO A; 3J9C A; 4YSZ B; 1SEB D; 4HKQ A; 2O6V B; 1D5M C; 1ZUD 2; 1NBF C; 1HXY D; 3T9L A; 3Q3F A; 4LNO A; 2M8S A; 2AQ3 B; 1Y56 A; 2XN9 C; 1P3Q U; 3Q8C A; 2IY1 B; 1FFV A; 2BYE A; 3ZYY X; 3DHH C; 1XCQ L; 1MG8 A; 5D94 A; 1YN5 A; 3IG3 A; 2NMQ A; 2J0K A; 3NZS A; 3B2F A; 1JW9 D; 5AZH A; 1DGJ A; 4DBG A; 3N1Y C; 4NY0 A; 2IO3 B; 1FXT B; 1OQR A; 2KDI A; 4W9E A; 2C60 A; 4W9D A; 4IUM B; 3ZJV A; 1PUT A; 5D2M B; 3DVG Y; 3HHM A; 4EZL A; 1WH3 A; 2LXA A; 3ZVV A; 3KYD D; 1FPY A; 4M8N A; 1E7V A; 3ZQ4 A; 1YN4 A; 4ZHO A; 3W2D A; 2J53 A; 3PT2 B; 3L10 B; 5DPT A; 1L6U A; 2FE8 A; 1XLO A; 1WE7 A; 2MRP A; 2FNJ B; 4IM3 A; 2AQ1 B; 2KDF B; 1J7C A; 2N1V A; 1UBI A; 1T5X D; 1FCC C; 2GBJ A; 2GLS A; 2XBB C; 4KKJ A; 1ENF A; 3IXS A; 1D5Z C; 2L8J A; 3X23 A; 4MSQ B; 4ASW C; 1UUP A; 4B95 A; 2LD9 A; 3P63 A; 2NR2 A; 1YJI A; 1IGD A; 3OWE B; 4DQO C; 2C9W B; 3AE7 B; 3A4S C; 4FA6 A; 1TS4 A; 2L0F A; 3PLV A; 3ML8 A; 3H1U A; 3NVZ A; 3H9D A; 3H6N A; 4MAC A; 1D6E C; 3N20 C; 4MJS A; 4R3D A; 3IAS 1; 1C79 A; 4BZA A; 2LJI A; 1TS5 A; 2H88 B; 4ARC A; 5JHB A; 3U30 A; 2KXJ A; 3IFW B; 2NCN A; 3AEE B; 4DDG D; 3NS1 A; 4WJP A; 2KQ4 X; 2WDQ B; 4D2K A; 3N32 A; 1UEL A; 4N9F 4; 5LNK 1; 2N4F A; 3E56 A; 5JXV A; 2KFJ A; 2JYT A; 2C7N B; 3BZD B; 2Z0E B; 2ZNV B; 1PGB A; 3ZIM A; 1RAX A; 3KLS X; 4AP4 C; 4KZC A; 1EF1 A; 1TKY A; 3OG5 A; 4IM0 A; 2W54 A; 4AJY B; 2KOX A; 3E9S A; 1WJN A; 4NNJ B; 4C00 A; 5C1Z A; 2HD5 B; 1HZ6 A; 2EMT A; 2KKC A; 1UWX A; 2QCZ A; 3V05 A; 1STE A; 3TEX A; 1GG3 A; 1WGY A; 1WX8 A; 2N7D A; 1ZPS A; 4HWI B; 4YT0 B; 2JVC A; 4M02 A; 2V4I B; 1VZ8 A; 4IM2 A; 1AWD A; 3IVF A; 2WXH A; 4JQW C; 1Q10 A; 2WXP A; 4I6L B; 3I3T B; 2K6D B; 1T6B X; 1WR1 A; 2RDG A; 1MHX A; 1P7F A; 4K81 A; 1JRP A; 4EEW A; 4XDD A; 2Y3A A; 2AYO B; 1I4G A; 1C76 A; 2OOB B; 4GLS C; 4JX1 C; 4RGN A; 4ZRP A; 2K9X A; 3FKY A; 2KWD A; 4EZK A; 2JWU A; 4W9C A; 1TS3 A; 2R2O A; 1DOX A; 1CK1 A; 1RWS A; 1E6E B; 2KYW A; 4NJ7 A; 1EM7 A; 1N5W A; 2D10 A; 4NJC A; 1FEH A; 2BS3 B; 3KW5 B; 5LXH A; 4I6P A; 2LVO A; 2OJR A; 2WS3 B; 2JY6 A; 2LGI A; 1N60 A; 3RNG C; 2EKE C; 2KTR B; 2KQS A; 4WAA A; 1X1M A; 2WQY B; 3PLU A; 2FUH B; 5MPO A; 3QC8 B; 2BYT A; 2WDV B; 1F9J A; 2DNF A; 2JZ3 B; 3AE8 B; 3AI5 A; 3DHI C; 2N7E A; 4HPP A; 2KK8 A; 5AUK A; 3IT4 B; 3NZU A; 2I38 A; 3RNF C; 1FXA A; 2K5P A; 1UGM A; 3C0R B; 5HFY A; 4ZRJ A; 1R4N B; 2WXM A; 4A20 A; 4YTM B; 2LJ5 A; 1J7B A; 5E6O A; 3ETR A; 1GJZ A; 2IPK D; 2MBH A; 5EE0 A; 2YEP B; 2Y5P A; 3GS2 A; 2LWP A; 2I1K A; 1HQR D; 2GBK A; 3AE1 B; 2MP2 B; 3DVN U; 2V3P A; 3RNE C; 3AE9 B; 1M4V A; 4QAY A; 2MA9 B; 4LJP B; 3A9K B; 2CU1 A; 2KJR A; 1V9J A; 1JML A; 1RFK A; 1JWU D; 3PO0 A; 2KWV B; 1IPG A; 3DHG C; 2L7R A; 2RMM A; 1QOA A; 1WGD A; 1GC7 A; 1B9R A; 4GXB A; 2AQ2 B; 3Q3M C; 3EUB 2; 1YOV B; 2MH7 A; 2G45 B; 1OQQ A; 1FIQ A; 4JPS A; 3JVZ X; 5G5G A; 3I5J C; 3PRZ A; 3KQ4 A; 1SE9 A; 4DXA B; 4KDI C; 2RDB C; 2V9H A; 2BS4 B; 4DXG A; 3KUC B; 1GUA B; 2ZCB A; 2BYF A; 1WGR A; 3H7P A; 2ZEQ A; 3DCG A; 4JLC A; 1TZO A; 2HJ8 A; 4WJQ A; 2ZJD A; 1T0Q C; 1WFY A; 3CST A; 4HCN B; 1Q5W B; 3NVY A; 4HKZ E; 4LNN A; 2INN E; 4B0M A; 1WYW B; 3HVD A; 3T3N A; 2FCN A; 4FLH A; 3ZJU A; 4JIO U; 4MDK E; 3WAP A; 2K3U A; 4DHZ B; 2KAJ A; 3M62 B; 1UBQ A; 1WY8 A; 4WH4 A; 4JWU C; 4G3X B; 1WR6 E; 4WIP A; 3QX1 A; 1J8C A; 1SXT A; 1UF0 A; 1D3Z A; 4OZB A; 1VRA B; 1IBX B; 4PS3 A; 1TY2 A; 2DZK A; 1YIW A; 3BWU D; 5E6J A; 2WWZ A; 5BMG A; 1ET6 A; 4YTP B; 2VH1 A; 1FRD A; 1UZX B; 3KWL A; 4XWT A; 3U7D A; 2BB5 A; 3RPF C; 1E7U A; 1NYR A; 2QIE B; 4YXD B; 2GBR A; 2J0J A; 1C4P A; 3TEZ A; 3V60 A; 1WXV A; 1LGR A; 1MPE A; 3PTF C; 2N0S B; 3MC8 A; 1P9D U; 2IZV B; 4ICV A; 1TTN A; 3RCZ A; 3DDC B; 1FCL A; 5DPR A; 3M95 A; 3P42 A; 2DYM A; 1YMH E; 1E7P B; 2OHF A; 2CHW A; 3B1L X; 5KHO A; 3UQA A; 1E8X A; 2K1F A; 3Q8F A; 3I9V 1; 4GN1 A; 4XGA B; 2LGD A; 2G3Q B; 4AWJ A; 1F52 A; 4GDL A; 2AL6 A; 1MVK A; 3W1Y A; 2FCQ A; 1I4P A; 4MH0 E; 4REZ A; 4P6V F; 4C4V A; 2DEN B; 2GBM A; 1JCK B; 1KF6 B; 1NI3 A; 3MTN B; 4HVB A; 3R66 C; 3LJ3 A; 2EKI A; 3AED B; 3RNB C; 2PKO A; 5C3J B; 3ZNZ B; 1C1Y B; 3UQB A; 4BAX A; 2WGS A; 4HPM B; 4AQ7 A; 4XE0 A; 3A9J A; 4K7W A; 1ROE A; 1Q0W B; 4W9G A; 3MJW A; 4W9K A; 4DHJ D; 4WJO A; 1MJD A; 4W9H A; 2DAJ A; 2HDE A; 3TJP A; 4MEM A; 3P2B A; 5FKA C; 3TEY A; 3U52 E; 4HEA 1; 3RUL A; 3V62 A; 1PYW D; 4HK2 A; 1ZXI A; 3OJ3 A; 3UIO B; 1BT0 A; 1DYQ A; 2WXR A; 4RNA A; 4HDO A; 1N61 A; 5LLI A; 1L0X B; 3EHV A; 2BW2 A; 4IWP A; 5AEK B; 3DBH I; 3P1M A; 4ANW A; 1WJ4 A; 3MC0 B; 4ZRQ A; 3KWV A; 1Y8R C; 5EDS A; 2IO2 B; 2J52 A; 3BYT B; 2QJL A; 2JSV X; 2JX5 A; 2KQ7 A; 4F1S A; 1PFD A; 2MBB B; 2NPT B; 2PW9 A; 1OGW A; 3VUX A; 1YD8 U; 4MM3 B; 4N58 A; 2MBE A; 3AMZ A; 1SBB B; 3AEG B; 3NVW A; 2QSD A; 4F8C B; 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2O2V B; 2IBI B; 2X8X X; 3GE3 C; 4W9F A; 4HLE A; 4YL8 A; 1MFW A; 1VR9 A; 3A1Q A; 1XD3 B; 1FMA D; 2WHI A; 3VRB B; 5D3I B; 4E71 A; 5BMI A; 2WX1 A; 1S1Q B; 2RD0 A; 5BYS A; 2GOW A; 4OZA A; 1V97 A; 2M19 A; 1SE3 A; 4WQM A; 1MI0 A; 3N9Y C; 5CTR C; 4Q2J A; 1T0S C; 4GDK B; 3ZW3 A; 3BK1 A; 2WXL A; 2KN4 A; 1WXS A; 1F1H A; 4KGT A; 1WIA A; 1F2R I; 1IUE A; 4LDT D; 5J2R A; 3JSV A; 4RM9 A; 3AU5 A; 4LNF A; 1SJE D; 4EE2 A; 4K7U A; 2N1W A; 3TMP B; 4S0R A; 4DWF A; 3H8H A; 4NQK E; 5EE1 A; 5HHD G; 3V6C B; 3V3X A; 1FFU A; 2E3T A; 2N9L A; 2AEH A; 4GOC A; 4HCP B; 3N1X C; 2Z0D B; 3B0A A; 4W9I A; 1RYJ A; 2NTS A; 4KGR A; 3VRA B; 1XQQ A; 2VZK D; 1FNW A; 3DWG C; 1D5X C; 4ANV A; 3DBR B; 1LO5 D; 4F7Z A; 4CYE A; 2KDB A; 1TYG B; 2RPQ A; 1L4D B; 1WWT A; 4MSM B; 2FUG 1; 4KIK B; 4A3P A; 4JL9 A; 3VTU A; 1CQV A; 2BVC A; 3L54 A; 4LNK A; 1E5W A; 3O65 B; 1TKE A; 2HTH A; 1ZP0 B; 2LUE A; 4MEL A; 2JXT A; 3QA8 A; 3W1S C; 2M0X A; 4AS1 A; 1TBE A; 4FBJ B; 2D3C A; 4BKT A; 5FR3 A; 3MP9 A; 4H2A A; 4YWG G; 3NZ3 A; 2WDR B; 3L16 A; 3ZNG C; 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