The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
108
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structure length |
108
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Chain Sequence |
GSSGSSGRKPLQEPCTIFLIANGDLINPASRLLIPRKTLNQWDHVLQMVTEKITLRSGAVHRLYTLEGKLVESGAELENGQFYVAVGRDKFKKLPYGELLFDSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of RSGI RUH-062, a DCX domain from human
rcsb |
| molecule keywords |
Doublecortin domain-containing protein 2
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| molecule tags |
Protein binding
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| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
13
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| structure length |
108
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| sequence length |
108
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-04-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF03607 | DCX | Doublecortin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Doublecortin domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5IO9 A; 5IKC M; 1MG4 A; 5IN7 A; 1UF0 A; 1MJD A; 2DNF A; 2BQQ A; 5IOI A; 5IP4 D; 1MFW A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1SE3 A; 1F2R C; 2PPH A; 4YTM B; 3JSV B; 1T0S C; 2BQQ A; 4JE3 B; 3KWV A; 3RUI B; 5CHV C; 4MSM B; 5D6J B; 3NVV A; 3QCA A; 1FFU A; 3FKY A; 3VXW A; 2WU2 B; 4FN2 A; 4QAY A; 4W9D A; 4B95 A; 1TY2 A; 2CJN A; 4RF0 A; 4W9I A; 2FUG 1; 5CX3 A; 3Q8F A; 2RDB C; 1BXT A; 1XXG A; 3P4S B; 1KOT A; 4DK5 A; 2VZK D; 3P42 A; 1R4N I; 3BYT B; 2D3A A; 1I4P A; 2L32 A; 3CF6 E; 1XLO A; 3QC8 B; 1FMA D; 2YVC A; 2BBC A; 4MGK E; 4YSZ B; 4LTU A; 2BYF A; 1D5M C; 1V5O A; 3PRE A; 4O1N A; 1PGA A; 5EE0 A; 1E10 A; 4P16 A; 2LZ6 A; 2AWT A; 4KGS A; 1ESF A; 1BUI C; 5AZH A; 2L0F A; 1RM6 C; 1L4D B; 3DWM A; 1WYW B; 2O2V B; 1BT0 A; 1E90 A; 2CKH B; 4RF1 A; 2JXT A; 3AEC B; 3QX1 A; 4M01 A; 4CO7 A; 5IO9 A; 1M94 A; 1FCL A; 1Y8R C; 1TS4 A; 2V3N A; 2WXF A; 1GG3 A; 2Z8L A; 3AEA B; 4KIK A; 3T8M A; 1V1P A; 4BFR A; 2J0M A; 3PPA A; 3Q8E A; 2PEA A; 3ETR A; 1SSN A; 3NVY A; 3ZIM A; 5AEK B; 1FCC C; 2IZV B; 4NQL B; 3W5V B; 2K6Q A; 2ZW0 A; 2LFI A; 4OVU A; 4IM0 A; 4IDI A; 2L00 B; 1RFK A; 4AWJ A; 2DAJ A; 2XN9 C; 1LQB A; 3QWZ B; 2INC C; 3VH3 B; 2WXO A; 2M17 A; 1WF9 A; 1FD6 A; 2KDF B; 1F0Z A; 2J4X A; 5E6J A; 2YEP F; 1QF6 A; 1QT9 A; 3A9J A; 3MC8 A; 3N1X C; 3QHT A; 3Q8A A; 3HUI A; 1B9R A; 2M0A A; 1L7Y A; 4TQ1 A; 3LXF A; 3WCQ A; 1WJ6 A; 4FA6 A; 2WQY B; 4G11 A; 4DDI D; 2M4N A; 2WNM A; 4NPN A; 5IN7 A; 4BZA A; 3MJW A; 1TIF A; 1UH6 A; 4BBN C; 3UIO B; 5HHD G; 4WWP A; 3TEZ A; 2ZJD A; 1SE9 A; 1IPG A; 4C7Z A; 2L0T A; 2Z0E B; 4DHZ B; 2WHI A; 1HQR D; 2L3Z A; 2K8B A; 3Q6B A; 2KVR A; 1XLP A; 2K39 A; 3Q3M C; 3X0W A; 3R2T A; 3PTF C; 4WAA A; 2MA9 B; 1PGX A; 1NI2 A; 4FLH A; 2D3G A; 1WJN A; 1HTO A; 1JQ4 A; 4GGQ A; 4HCP B; 3RNB C; 1SBB B; 2WXP A; 5C3J B; 4Q2J A; 4WAF A; 1WZ3 A; 3KW5 B; 5BMH A; 3VUY A; 2QEJ C; 4PYZ A; 2I2Y A; 4C56 C; 1TKG A; 1XEE A; 4HKQ A; 2IO3 B; 2DZJ A; 3RCZ A; 3V05 A; 5LXH A; 3LDZ E; 2L83 A; 2ACZ B; 5G5H A; 1DOY A; 3DBL I; 3P63 A; 1Q5W B; 3AU4 A; 1OQY A; 3JW0 X; 4KDL B; 3TSS A; 4GDK B; 3HHM A; 2HJ8 A; 4MJS B; 2KT7 A; 2BYT A; 1G6J A; 3N3K B; 2C9W B; 2L7R A; 2V4L A; 1Z2M A; 2V3P A; 4W9C A; 1FM0 D; 2WX1 A; 3IG3 A; 3AE4 B; 3K9O B; 3DCG A; 1D5X C; 2JXX A; 2K25 A; 2C7N B; 5G2N A; 1XO3 A; 4IWP A; 3EC8 A; 2XK5 B; 2BTE A; 1YIW A; 5IP4 D; 4NAW A; 3DBR I; 3M3J A; 2W82 A; 3DVN V; 5FK9 C; 4HK2 A; 3IHP C; 4LDT B; 5EE3 A; 3L08 A; 3AI5 A; 1L0Y B; 3H8H A; 2X8X X; 1HA5 A; 4FAD A; 1F52 A; 1WXV A; 1XF5 L; 2MHJ A; 4MH8 A; 3U8Z A; 4W9K A; 2UU7 A; 2GLS A; 1ISN A; 1SEB D; 2LGI A; 1KLG D; 3PZD A; 4P7I A; 3TJP A; 3URY A; 3SDL C; 4WIP A; 1Q10 A; 3SHQ A; 2MBH A; 2JPH A; 2KC2 A; 3UGB B; 3GS2 A; 3W1Y A; 4MGI E; 3ZJV A; 1UD7 A; 4II2 B; 2W54 A; 2W3R A; 2Z0D B; 2VH2 A; 3NZU A; 2GBN A; 1NYR A; 1E5W A; 3BVG A; 2K1F A; 4W9E A; 5FKA C; 4NJ6 A; 2IGG A; 4OZC A; 3DBH I; 3N9Y C; 3L0W B; 1ZP0 B; 1FNV A; 1I4Q A; 3ZO5 B; 1AW7 A; 1UNS A; 1DOI A; 2D10 A; 2CHZ A; 3GP7 A; 1KTK A; 2KFK A; 1WE6 A; 4RM9 A; 1NYQ A; 2B3A A; 4LK0 M; 4W9H A; 3PRZ A; 4YSX B; 2KDE B; 4HXD A; 3BYY B; 2ZZP B; 1E8Z A; 1XLQ A; 2OJW A; 1WIA A; 2PIA A; 4WJN A; 4I6L B; 4N59 A; 1SE4 A; 1XQQ A; 1WE7 A; 4KIK B; 3BVM A; 5HKH A; 2KAN A; 3UIN B; 1SGH A; 2G1E A; 4LJO B; 4XDC A; 3E9S A; 2XBB C; 4W9L A; 4HPL B; 1ET9 A; 2JX5 A; 3QJZ A; 1T6B X; 3P2B A; 3DHH C; 1I42 A; 1OQR A; 2GMI C; 1F9J A; 1FXA A; 3WAN A; 2CHX A; 2D3C A; 1DOX A; 3Q3O C; 4OW0 A; 2J0J A; 3RZF A; 2ON8 A; 1TJE A; 3NJT A; 3Q8C A; 5D7G A; 1EU4 A; 1MJD A; 3B1L X; 5LXI B; 3OJ4 B; 2KXJ A; 3O13 A; 3AE8 B; 4MSQ B; 3EFU A; 3M63 B; 4EKU A; 1E8W A; 3R66 C; 1AWD A; 1VJK A; 1GUA B; 1HEZ E; 1MG8 A; 2KOX A; 4US8 A; 4MAC A; 4AJW A; 3PLU A; 4IG7 B; 3VR8 B; 3U2S C; 3CSF A; 4ZYN A; 3DQV A; 3EUB 2; 4XWW A; 1C3T A; 3ZVV A; 4B9K A; 1IBX B; 3DHG C; 1WM3 A; 2M8S A; 1WMH B; 3RI7 C; 4WWN A; 2H88 B; 1KJT A; 2KHW B; 5BMI A; 5I4D A; 2C60 A; 4P6V F; 3J9C A; 1T0R C; 1I4H A; 2KJH B; 1P0R A; 3AM9 A; 1YD8 U; 1K8R B; 2DYM A; 2FCM A; 2D07 B; 4HJG E; 2NBU A; 4FJV B; 4US9 A; 4KSL C; 1OFF A; 1KF6 B; 3PO0 A; 1H4R A; 2K0P A; 4FBJ B; 3V6E B; 1MG4 A; 1UWX A; 4IM2 A; 4IC7 B; 1JW9 D; 2MBE A; 4OVV A; 3MHZ A; 2LD9 A; 3V62 A; 3TUO A; 5H92 C; 1ZPS A; 1EU3 A; 2OOB B; 1SE2 A; 2RPQ A; 1JML A; 4LNN A; 4S0R A; 2JRI B; 2FNJ B; 1N5X A; 4BBN F; 3RPF C; 4WWM A; 3BII D; 1E0Z A; 5BYQ A; 1KFY B; 3VRA B; 3I5J C; 3E56 A; 3M62 B; 4D2K A; 2CHW A; 2NCN A; 1F1H A; 4HRS A; 2KWC A; 1N62 A; 3L17 A; 4HDO A; 3GZN B; 1C4C A; 1SIJ A; 3NVZ A; 1WGG A; 1WGR A; 4NNJ B; 5BYR A; 4KV2 A; 3SEB A; 4C4V B; 3DBR B; 4WJP A; 5FR3 A; 1WRI A; 2LEK A; 1KLU D; 3QA8 A; 3V61 A; 4XE0 A; 4PK1 A; 2KMC A; 3DHI C; 4K7W A; 1E6E B; 3HM6 X; 3AE1 B; 2JSV X; 1UGM A; 1FNW A; 1V5T A; 1FRD A; 3Q2A C; 2CJO A; 3KWL A; 3B9J A; 3MJ5 A; 1VD2 A; 2O6V B; 4LNF A; 2XEW A; 4AS1 A; 2N7D A; 2G4S A; 3VTV A; 2WYQ A; 1NVI D; 4EUT A; 2I38 A; 2EEL A; 3CMM B; 1V2Y A; 3UIP B; 2EMS A; 3VR9 B; 3M95 A; 2WDR B; 4GDL A; 2PVO D; 3R7Q A; 2NPT B; 1AYF A; 1WXM A; 3OG5 A; 3U7Z A; 2K6D B; 2MCN B; 3NG0 A; 3LJ3 A; 4HJK A; 1WJU A; 3DBH B; 5HFY A; 2NS5 A; 5LNK 1; 2MP2 B; 1WM2 A; 2NBW B; 4MGY E; 2PE9 A; 2JRH A; 3ZTD A; 4MEL A; 2IPK D; 2NVU I; 2NMQ A; 2J42 A; 4FHK A; 3ZNI D; 2RMM A; 2JYT A; 2GI9 A; 4KZC A; 3W1S C; 1NEK B; 1I4G A; 4BOS C; 3VHT C; 2IO1 B; 4A3P A; 1ZOY B; 2N9E B; 4LJP B; 3ZYY X; 1IP9 A; 2R2O A; 2DAF A; 3FIL A; 1JWM D; 4A90 A; 1JWS D; 3IXS A; 1WXS A; 4G3X B; 3AE3 B; 2JY6 A; 2INN E; 2ZEQ A; 1WR1 A; 4JLC A; 4ZRP A; 1YQB A; 4LCD E; 1D6E C; 3PT2 B; 1LXD A; 2DYO A; 2QJL A; 3TIX A; 1RAX A; 1SXT A; 3PHW B; 3NY5 A; 4F8C B; 5HG2 A; 1V1O A; 4MT5 A; 3ABV B; 3MHS D; 4ZHP A; 1I7H A; 3CWI A; 4WQO B; 4B0E A; 5CHF A; 1RRB A; 1TZ1 A; 1IUE A; 1L0V B; 1MHX A; 1UEL A; 2LGS A; 4EZJ A; 1OEY A; 2K3U A; 2M0X A; 3BY4 B; 1YNT E; 3QQ8 B; 2BT6 A; 4XX5 A; 3PZ7 A; 4ZRK A; 2CS4 A; 1UBI A; 2ZCB A; 3WIM A; 3RNC C; 4UDU C; 2MEK A; 4G0N B; 1DGJ A; 2YLM A; 4GSW A; 3ZJU A; 2KYW A; 3GB1 A; 2MH7 A; 2WXN A; 3PVL A; 1TKE A; 2LI5 A; 2MJE A; 2A4Z A; 3ZDM C; 3ZXR A; 4J3O D; 1TTN A; 3DWG C; 5LLI A; 4BOZ B; 2MQJ A; 3L16 A; 3VUW A; 3AN1 A; 4RGO S; 2IY0 B; 2Y5P A; 3KYC D; 2WU5 B; 2RDG A; 2LJ5 A; 4AOF A; 4L1B A; 4N6E B; 3OJ3 A; 2WXJ A; 1D3Z A; 3I3T B; 2KTR A; 2GBR A; 2IO0 B; 3IT6 B; 4XDD A; 4ZOH C; 1SJH D; 2L1A A; 2FIF A; 3TBL D; 1UZX B; 3B2G A; 1P3Q U; 2G4D B; 3PRP B; 3VRB B; 3H7S A; 4IW0 A; 1MFW A; 3L4P A; 5KHQ A; 3A9K A; 3IFW B; 2MRP A; 2AL3 A; 4KGR A; 5L83 A; 1CJE A; 1PUT A; 2BS4 B; 2RPV A; 4KX6 B; 2GB1 A; 4B6W A; 4M0W B; 1FFV A; 1WXQ A; 2BYE A; 1UBQ A; 4IUM B; 5IA7 A; 2M1M A; 3VAW A; 1YX5 B; 3IAS 1; 4JQW C; 3AU5 A; 1C9F A; 1IGC A; 4K3B A; 2LGX A; 3P4R B; 4NJC A; 1Z5S B; 3JVZ X; 3I9V 1; 2BKF A; 3PS6 A; 5D2M B; 3TEX A; 1YMH E; 4ANW A; 4P1B C; 3RYT A; 3Q3J A; 4RM8 A; 5IAA C; 3TL5 A; 1RFA A; 2HDE A; 3X23 A; 1K50 A; 4DWF A; 1NI3 A; 2NR2 A; 3A33 B; 3QIJ A; 4KKJ A; 4JGH B; 3MTN B; 1C1Y B; 3T3O A; 1V81 A; 2DZK A; 2DNF A; 3AXC A; 1WH3 A; 1X1M A; 1VRA B; 4WUR A; 2CR5 A; 2WXR A; 4M00 A; 2ZW1 A; 1NBF C; 1QOF A; 1I4R A; 4YTP B; 2WXQ A; 3NUH B; 1EF1 A; 2H89 B; 2ZVO A; 2PTL A; 3EGR A; 2JF5 A; 1PQS A; 1QLB B; 3AE9 B; 4HVB A; 4K1R B; 2OHF A; 2QSD A; 4KGT A; 1V8C A; 1GB4 A; 4BKS D; 2C5L C; 4A6Q A; 4A3O A; 2V0G A; 3H7P A; 3GZN I; 4YTN B; 5DPS A; 1XT9 B; 4E74 A; 2V9H A; 1ZKH A; 5E6P A; 3VVW B; 4CYE A; 3IAM 1; 5BO4 B; 1SJE D; 3BK2 A; 4ASW C; 1WJ4 A; 4TKN A; 1T0Q C; 5JHB A; 2MW5 A; 4OZB A; 3ZRC A; 4LNK A; 1ZGU B; 1C4P A; 2LGY A; 1ZDX A; 5D3I B; 4ZRI A; 4EFO A; 1C77 A; 2KN5 A; 2WXL A; 2GOW A; 3KQ4 A; 4P1C C; 4M02 A; 2WXH A; 4LLG M; 1FIQ A; 2KD0 A; 2DHZ A; 5TSS A; 4MDK E; 1V97 A; 1KH0 A; 3BIN A; 5E6N A; 1EO6 A; 3O65 B; 2BS2 B; 1NEN B; 3ZRF A; 3W5U B; 1FXI A; 5H8Y E; 4YT0 B; 2K8C A; 4AJY B; 3WAP A; 2BF8 B; 4XWT A; 4FUL A; 3N1Y C; 4X57 B; 1N60 A; 1P9D U; 5J17 A; 4L23 A; 3ZLZ A; 3H6N A; 1ROE A; 1I35 A; 4EE2 A; 3W9C B; 1Q1O A; 3JSV A; 2K5P A; 3SR6 A; 2K9X A; 3QK0 A; 2IYD B; 3Q3N C; 3ZJT A; 2D3B A; 1UGJ A; 2Y5C A; 1WYG A; 2KJR A; 2FID A; 2JWU A; 3ZKJ C; 2IND C; 2JZP A; 3WA0 A; 1YQ4 B; 1VZ6 A; 1V1P B; 1YN4 A; 3A4S C; 1CQV A; 2WXG A; 4NJ7 A; 1LGR A; 2MBO A; 1L2N A; 2QHO A; 2AQ3 B; 3H9D A; 1HZ6 A; 1ZE3 D; 3AH7 A; 1L6U A; 3PHX B; 2BYV E; 2MBB B; 3HVD A; 1V86 A; 4RGN A; 1EWC A; 3T3N A; 2KLG A; 3MC9 A; 5KHO A; 3AEG B; 3I63 C; 1UUP A; 2HE7 A; 4W9F A; 5JZE B; 4PS8 A; 1R4M B; 4KSK C; 3TCA A; 1J0G A; 3T9L A; 1QIL A; 2R2Q A; 2IGD A; 4YWG G; 4A20 A; 3AB5 A; 2V1Y A; 2WS3 B; 1K51 A; 4DDG D; 3RNF C; 1TY0 A; 1F77 A; 4ZRJ A; 3A9J B; 2MJD A; 3WAO A; 1P7E A; 2A5U A; 2XNA C; 4L2Y A; 1HZ5 A; 2KMA A; 4JPS A; 4OHJ A; 2O2V A; 4NAM A; 3APD A; 2C7H A; 3W2D A; 4CQN A; 2WWZ A; 4RH6 A; 1GPX A; 1N6Z A; 2LUE A; 4USA A; 3A9K B; 2AX5 A; 1V80 A; 3C19 A; 1WGY A; 2AYO B; 1HXY D; 3NVW A; 5AUK A; 1WGD A; 4M8N A; 3AE2 B; 2FBW B; 4I6N B; 2IO2 B; 4W9J A; 2KWD A; 4JX1 C; 2I1K A; 2GRI A; 2RD0 A; 3IT4 B; 2TSS A; 3VH4 B; 1R7S A; 4RNA A; 2DZM A; 3FC4 A; 5CTR C; 1VZ8 A; 1OGW A; 2ZPY A; 4MEM A; 4GOC A; 4ITK A; 1YOV B; 3BVZ A; 2EKI A; 5DPR A; 1U4A A; 2INP E; 4KDI C; 3RNA C; 3QAQ A; 3ZNZ B; 2N1W A; 2ICI A; 3N30 A; 1YQ3 B; 5J18 A; 4K3C A; 1JRP A; 4ZDV A; 1OQQ A; 1TYG B; 1WXA A; 2FCQ A; 2ZNV B; 2K22 A; 2AQ2 B; 1E7V A; 1ZW7 A; 3V60 A; 3ONS A; 1JAL A; 3UQA A; 1SIF A; 1AN8 A; 1P7F A; 1WZ0 A; 1WGH A; 4GLS C; 3EFC A; 4LDT D; 4IM3 A; 3OWE B; 3RD2 A; 2D11 A; 2RGF A; 4DXF A; 3ZNH B; 4ZHO A; 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