The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
108
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structure length |
108
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Chain Sequence |
GSSGSSGRKPLQEPCTIFLIANGDLINPASRLLIPRKTLNQWDHVLQMVTEKITLRSGAVHRLYTLEGKLVESGAELENGQFYVAVGRDKFKKLPYGELLFDSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
Solution structure of RSGI RUH-062, a DCX domain from human
rcsb |
| molecule keywords |
Doublecortin domain-containing protein 2
|
| total genus |
13
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| structure length |
108
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| sequence length |
108
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-04-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF03607 | DCX | Doublecortin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Doublecortin domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1MFW A; 5IN7 A; 5IP4 D; 5IO9 A; 2BQQ A; 5IOI A; 1MG4 A; 5IKC M; 1MJD A; 1UF0 A; 2DNF A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4BKT A; 4EKU A; 3QAQ A; 1E7V A; 1EUV B; 4P7I A; 3VHT C; 3B9J A; 3DBR I; 1YN5 A; 4LJO B; 5BYQ A; 2MJE A; 1P7F A; 2QCZ A; 2MP2 B; 2LGX A; 3R2T A; 2GBJ A; 4ZYS A; 3VTW A; 1I42 A; 3RNG C; 3JYU A; 3S2A A; 3QIJ A; 2JXT A; 3Q3O C; 4EUT A; 2KXJ A; 2LXA A; 3NRZ A; 3Q8E A; 2MP2 A; 4MJS B; 2IGD A; 3AEC B; 5TR5 A; 4RGT A; 2UWQ A; 4IWQ A; 4REZ A; 3ZO5 B; 3VR8 B; 1EWC A; 2WYQ A; 2NTT A; 2AQ1 B; 2JYT A; 5HI1 A; 1V2Y A; 4RNA A; 1GUA B; 1YN4 A; 4JL9 A; 3RUI B; 4KVG B; 5D6J B; 2KT7 A; 4LNN A; 1VDV A; 5JHA A; 3KUZ A; 4ANW A; 3ZXV A; 2DBY A; 2IO1 B; 4IOI E; 2GOW A; 4NY0 A; 3NZ3 A; 1D6E C; 2LVP A; 1FIQ A; 3DHH C; 3AE5 B; 4TMA B; 3V6C B; 3NG0 A; 4BKS D; 2LEK A; 1T0Q C; 2J53 A; 3A9K B; 1NDD A; 2FCN A; 4B0M A; 2BS3 B; 5CTR C; 4QAY A; 3ABV B; 1E8X A; 2KC2 A; 1TKG A; 2QIE B; 1FFU A; 3DPD A; 3GB1 A; 4WIP A; 2JRI B; 3A9K A; 2M0A A; 1SJE D; 3PLU A; 3UIP B; 3IT6 B; 2AL3 A; 1Z2M A; 1V8C A; 2O2V A; 4YTP B; 4YWG G; 1L6V A; 3QHT A; 4ZHO A; 4C80 A; 3DOW A; 4S0R A; 3EFU A; 3D32 A; 4IUM B; 1MFW A; 4TSS A; 5BYS A; 5KHQ A; 2WNM A; 5I4D A; 4MSM B; 3PZD A; 2KZR A; 3CMM B; 4WQM A; 4RM9 A; 4PYZ A; 4K1R B; 2QDF A; 1XLP A; 4KGS A; 3H1U A; 1L4D B; 4A3O A; 4AJY B; 2EMS A; 1JRO A; 1WIA A; 2KN4 A; 2HDE A; 2AL6 A; 3OAW A; 4X57 B; 2KX3 A; 3BZD B; 3ZIM A; 1J0G A; 1FO4 A; 2D07 B; 4K3B A; 2LZ6 A; 1FRD A; 3E56 A; 2KFK B; 3RPF C; 3Q3N C; 3LDZ E; 2FCQ A; 3SFE B; 1V1P B; 5HKH A; 2DHZ A; 2WWZ A; 1ZUD 2; 5CHW A; 2OJW A; 2C60 A; 1V5O A; 3IHP C; 1S3S G; 1V1P A; 3EGR A; 3NVW A; 5BMH A; 3URY A; 2DYM A; 3UQB A; 4K7U A; 4FHK A; 2ASQ A; 5IAA C; 4XYC A; 2FBW B; 3Q3J A; 1QOA A; 2KHW B; 4EZL A; 2KTR B; 2NMQ A; 2J42 A; 4KZ0 A; 2J0M A; 2HTM E; 5LNK 1; 4HPP A; 4GOC A; 1F9J A; 1N5X A; 2R61 A; 2V4L A; 1CQV A; 4AUQ C; 1WXV A; 4PS7 A; 4RMA A; 4YTN B; 1ZGU B; 1C3T A; 3NUH B; 3MHZ A; 4NJ7 A; 3GZN B; 3GZN I; 1GPX A; 3SFD B; 4B95 A; 1OTR B; 3RNF C; 1GAQ B; 2ZNV B; 2GBN A; 1WXM A; 2KAN A; 3QA8 A; 2JZ3 B; 2BBC A; 5IOI A; 1UGM A; 2IGG A; 5GMV A; 2CJN A; 4XDC A; 2JF5 A; 4HPL B; 4MH0 E; 3N1Y C; 4GMV A; 1TIF A; 2CU3 A; 1PGA A; 2BQQ A; 2W3S A; 4W9D A; 1FCL A; 1L2N A; 3AB5 A; 4GSW A; 1E10 A; 5T8I A; 1HZ5 A; 3Q6B A; 2KDM A; 1F1H A; 3EHV A; 2WXJ A; 2KWV B; 4BAX A; 3KH0 A; 3DHI C; 3OJ4 B; 2DYB A; 1HZ6 A; 3IG3 A; 4JIO U; 3GOE A; 2TSS A; 1IP9 A; 2DNF A; 3EUB 2; 1F2R I; 4YSZ B; 3AE9 B; 3QJZ A; 1F77 A; 4ZDV A; 2PIA A; 2K22 A; 1WY8 A; 4LNI A; 4WWP A; 1KJT A; 1WJ6 A; 3UQA A; 1JML A; 3VTV A; 5DCN A; 2MJ3 A; 4L2Y A; 3HVD A; 1OGW A; 4DXF A; 1WXQ A; 3ZNG C; 4ICV A; 3DHG C; 4RF1 A; 2D5G A; 3DBH B; 2RPV A; 1WX9 A; 4DBG A; 2KX0 A; 1RFK A; 4OHJ A; 1Q5W B; 2G4D B; 5AZH A; 2C5L C; 4CQN A; 4DHZ E; 1Y56 A; 3LB8 C; 3IVF A; 3W1Y A; 2BKF A; 3C0R B; 3Q8B A; 2V3N A; 2W3R A; 3VRA B; 4MGZ E; 2NPT B; 1N62 A; 1KTK A; 2LVO A; 3RUL A; 5MPO A; 3TL5 A; 2LUE A; 2BB5 A; 2EKI A; 3NVZ A; 1TY2 A; 3T8M A; 2Z0E B; 2N4F A; 4HWI B; 3AE3 B; 3MTN B; 2MRP A; 2GB1 A; 1PFD A; 2RGF A; 2DWQ A; 1QOF A; 4K81 A; 3ENE A; 3NVV A; 4EFO A; 3RT3 B; 4ACF A; 1OEY A; 1GJZ A; 4GU2 A; 4JQW C; 2LXC A; 3AMZ A; 2QMT A; 5JHB A; 1PDX A; 3TEY A; 1QZE A; 3K9O B; 1D5Z C; 1STE A; 3AXC A; 3X23 A; 1VCB A; 4NPN A; 2GBK A; 3CF6 E; 1XD3 B; 3VDZ A; 2K5P A; 4FHJ A; 4HJG E; 2MHJ A; 4WQO B; 1V80 A; 3ZJU A; 3TSS A; 5G5H A; 3M63 B; 2KO3 A; 3PRZ A; 3VH3 B; 4K7S A; 1VRA B; 3AU5 A; 3Q8F A; 2BW2 A; 2ZJD A; 1XXG A; 1WRI A; 3EFC A; 2WXN A; 2JPH A; 2EEL A; 4W9L A; 4RM8 A; 1I4R A; 2KWD A; 4I6L B; 3MC9 A; 3AEA B; 5E6O A; 3H7S A; 5FR6 A; 5HHD G; 1VD2 A; 3QWZ B; 2N7E A; 5BMI A; 1P3Q U; 1SF0 A; 2XBB C; 5J2R A; 1AN8 A; 2ICI A; 3KWL A; 4MT5 A; 4US9 A; 1N61 A; 2LJ5 A; 1KLV A; 4CYE A; 3SDL C; 2RR9 A; 1J7B A; 3W1S C; 2PEA A; 2JU6 X; 4YTM B; 3PZ8 A; 3ZLZ A; 3GS2 A; 2IZV B; 3AE7 B; 4GDK B; 2CHW A; 2UYZ B; 4HVB A; 3UIO B; 2KKC A; 4A55 A; 4ARC A; 3PLV A; 1PQS A; 1B9R A; 2IND C; 2WX1 A; 3DWG C; 1AYF A; 4GDK A; 3JSV A; 1E8Z A; 2RDB C; 2VZK B; 2G9H D; 1RYJ A; 1V81 A; 1WSP A; 3PSE B; 4BOZ B; 2JZP A; 1RWS A; 1WR6 E; 1Q10 A; 2MBB B; 2KMA A; 2DAJ A; 4DDI D; 4FXC A; 2ZVO A; 3SHQ A; 3V6E B; 4W9J A; 2LVQ A; 3U4E G; 1ZPS A; 2K8C A; 1ZDX A; 3DWM A; 1FXT B; 2Z59 B; 4IWP A; 3P42 A; 4N59 A; 1DGJ A; 1K52 A; 4GN1 A; 3AEE B; 1JCK B; 4US8 A; 2JWU A; 4HRO A; 2KAJ A; 2NS5 A; 4ICU A; 2G4S A; 1GG3 A; 3RI7 C; 4BBN F; 4PK1 A; 2CJO A; 5BYR A; 1B1Z A; 1NYR A; 3PRE A; 3BVG A; 1KRH A; 2WDT B; 3TJP A; 5EE1 A; 4E3C A; 2L52 A; 2WXK A; 4FJV B; 3MC0 B; 2L83 A; 2N9L A; 5H92 C; 1JQ4 A; 3KYC D; 3HUI A; 3VVW B; 1FEH A; 1YJJ A; 1YOV B; 3MJ5 A; 3ZNZ B; 1TS2 A; 5AEK B; 4C7Z A; 2PMV A; 1WJN A; 2KOX A; 5CHV C; 2K6D B; 4G50 A; 2FE8 A; 3UIN B; 1FNW A; 3DBR B; 2H89 B; 2VRR B; 3DVG X; 4M8M A; 1LM8 B; 4W9E A; 3HK0 A; 2ZW0 A; 3ZRC A; 3OG5 A; 2KQ4 X; 1K50 A; 1R4N I; 1WE6 A; 3ZTC A; 5D3I B; 3KUC B; 2L0T A; 3AE1 B; 5IO9 A; 4A3P A; 2INC C; 2MSE D; 4MJS A; 1YJI A; 4F1S A; 1DOX A; 2FID A; 2LGY A; 4M01 A; 2KDI A; 1QOB A; 1FM0 D; 3BVZ A; 2Y5C A; 1RFA A; 1EF5 A; 2PPH A; 4IM0 A; 2QJL A; 5LLI A; 2NBW B; 4EOY A; 2E6X A; 1CJE A; 1UF0 A; 4TQ1 A; 4KIK B; 2LJI A; 3RNB C; 1T0R C; 3JW0 X; 3L54 A; 5CHF A; 4RCO A; 2X8X X; 5G5G A; 3IT4 B; 5EE9 A; 4EZJ A; 3BK1 A; 2QIL A; 1HTO A; 2PTL A; 5TSS A; 1P7E A; 2V9H A; 4KIK A; 2BYT A; 4IM2 A; 1NVI D; 2V3P A; 3P4R B; 1L0Y B; 2JRH A; 1R4M I; 2L76 A; 1NI3 A; 4KSK C; 3MP9 A; 5IA7 A; 5E6J A; 2K1F A; 4L1B A; 3BYT B; 2KD0 A; 1XO3 A; 1ET9 A; 4ANV A; 3H8H A; 1M4V A; 3QCA A; 5AZG A; 4OVV A; 1YNT E; 3NHE B; 4FJZ A; 4DQO C; 1MPE A; 3W2D A; 1WI0 A; 1TY0 A; 3NOB A; 3U8Z A; 4BBN C; 1WZ0 A; 2IDY A; 2GI9 A; 2KK8 A; 2WXI A; 2AQ3 B; 3FIL B; 3T3N A; 2D3C A; 3MFG A; 2WLB A; 4KGT A; 1BML C; 2AQ2 B; 1KFY B; 4PT5 A; 3H7P B; 4YT0 B; 4XWT A; 3L10 B; 2C9W B; 4II3 B; 5DPT A; 3ZQ4 A; 2HD5 B; 2MW5 A; 3EA6 A; 1UWM A; 2L8J A; 3Q8A A; 3H7P A; 3U52 E; 1D4B A; 4MAC A; 1SSN A; 3L08 A; 2AX5 A; 1J7C A; 1FXA A; 2K0P A; 1D5M C; 2K6Q A; 3NY5 A; 3PT2 B; 1EU3 A; 3I3T B; 2JQR B; 2ONQ A; 3QK0 A; 2GRI A; 3A1Q B; 4EZK A; 3NVY A; 3ML9 A; 1FNV A; 3HHM A; 2D3B A; 2IO0 B; 1YQB A; 3N32 A; 1AWD A; 4M0W B; 5FR3 A; 1WGY A; 2HJ8 A; 5JH5 C; 3TBL D; 1UGJ A; 1XCT L; 2C7N B; 2J52 A; 3L13 A; 4WJP A; 1N6Z A; 2G1E A; 3UF8 A; 4IG7 B; 4ANU A; 2Q5W D; 5JZE B; 3BWU D; 4TKN A; 2KFK A; 2RD0 A; 1QF6 A; 1LXD A; 4WJO A; 1C77 A; 2MJD A; 4WAF A; 5D2M B; 3E9S A; 1FFV A; 4LTU A; 4GIV A; 4W9I A; 3RNE C; 4Q2J A; 2WXO A; 4BOS C; 2BKR B; 1GB1 A; 4HJK A; 1WGG A; 1UUP A; 4CO7 A; 3R3M A; 1QOG A; 5CX3 A; 2WXQ A; 1ESF A; 3APD A; 4P1B C; 2REX A; 4TQ0 A; 3UGB B; 3Q3F A; 3R7R A; 1QLB B; 4MEM A; 1WXA A; 4GXB A; 2WXL A; 2VH2 A; 1SGH A; 2KTR A; 2J0K A; 2ZCC A; 2Y3A A; 1YX6 B; 3WAL A; 3DQV A; 3RCZ A; 1XLO A; 4I6P A; 3VUW A; 3AE8 B; 4A8X C; 3C19 A; 5C1Z A; 2AYO B; 2XEW A; 2CS4 A; 2W82 A; 1UD7 A; 4KSL C; 3UI3 A; 2YEP F; 3T3O A; 1WF9 A; 3AV8 A; 2K3U A; 1T0Y A; 1ENF A; 1KLU D; 1PUT A; 1T6B X; 4KX6 B; 3SU8 X; 3HM3 A; 3N30 A; 3ETR A; 2B76 B; 2SAK A; 3ZDM C; 4WWO A; 3DVN V; 1E5W A; 3DVG Y; 2MLB A; 4KGR A; 2BGF A; 3PO0 A; 2V3S A; 1Z5S B; 3IAS 1; 2BB6 A; 4NJ6 A; 4FAD A; 4XX5 A; 3RD2 A; 2IY1 B; 4C4V B; 1WGR A; 4LNO A; 3ZNI D; 2PE6 B; 3HRD D; 4S17 A; 3RZF A; 1V1O A; 2MBE A; 3I9V 1; 3V3X A; 3L0W B; 2PW9 A; 2WS3 B; 2PE9 A; 5DPW A; 4C4V A; 2N9X A; 2O6V B; 4JPS A; 4HCN B; 4RF0 A; 2QSD A; 2KMC A; 3LXF A; 3DBS A; 1XLQ A; 1SIF A; 2O6V A; 1YQ4 B; 4A9A A; 4DHJ B; 3IFW B; 4YL8 A; 3VRB B; 1JRP A; 4WJQ A; 4W9G A; 4KDL B; 5HFY A; 4K3C A; 3B2G A; 2KLG A; 3TEX A; 2K8B A; 1HE8 A; 3BIN A; 5EE3 A; 3A9J B; 1E90 A; 3EEC A; 2IJ0 A; 3HVZ A; 2INP E; 2BVC A; 4YSY B; 1IPG A; 3A9J A; 3RYT A; 2BS4 B; 3R2I A; 4KKJ A; 1KH0 A; 3OLM D; 3TMP B; 2BF8 B; 2A5U A; 2KLC A; 4XDD A; 5FK9 C; 5E6N A; 2GBR A; 2WDR B; 2M8S A; 2PJH A; 2RPQ A; 2KQS A; 3Q8C A; 3L16 A; 4NQK E; 4IKG A; 1HTQ A; 4KZC A; 1T5X D; 1H4R A; 2BYF A; 2N7J A; 3AI5 A; 3OWE B; 4MDK E; 1DOY A; 1SBB B; 4WWM A; 3PVL A; 3APC A; 1WMH B; 4KDI C; 3DDC B; 4YXD B; 1L0X B; 3RN9 C; 1TBE A; 1TKY A; 2W9N A; 2MH7 A; 4PS8 A; 1IBX B; 1OQR A; 3DBL I; 3N1Z C; 5J17 A; 4DXG A; 2IY0 B; 4ZRI A; 3O65 B; 1M94 A; 2V0G A; 2YLM A; 1WMH A; 1YJ1 A; 2L32 A; 1I35 A; 4OVZ A; 3WIM A; 2NBV B; 4JLC A; 4NNJ B; 2EMT A; 3AE6 B; 2OHF A; 2NPT A; 2KDE B; 1TT5 B; 3ZTD A; 3H6N A; 4RGO S; 4HK2 A; 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2RMM A; 3APF A; 1E9M A; 5AUK A; 3A4S C; 4C56 C; 4HKQ A; 3B08 A; 3RNC C; 3RZW C; 1ZOY B; 1T3Q A; 5LXI B; 2XNA C; 2JY6 A; 1SIJ A; 1CK1 A; 1Q1O A; 4MEL A; 5GXG B; 1I4P A; 3J9C A; 1WE7 A; 3ZVV A; 2D3A A; 2IO3 B; 3PGE A; 4USA A; 4JWS C; 1V5T A; 2BWF A; 1P98 A; 5C2T B; 1TJE A; 1C78 A; 2LGD A; 4FA6 A; 3GE8 C; 1S1Q B; 1DYQ A; 2IYD B; 3WA0 A; 1VZ7 A; 2FNJ B; 4XGA B; 1WZ3 A; 2FCM A; 2GLS A; 3I57 A; 1N5W A; 3PHW B; 1FMA D; 3QAR A; 3AH7 A; 3V60 A; 3IAM 1; 1XCQ L; 4TV3 A; 4LNK A; 1TZO A; 2LHE A; 3KW5 B; 2WXF A; 3ALB A; 1LO5 D; 1C4A A; 3RFZ B; 1AW7 A; 3U7Z A; 4LJP B; 1VZ8 A; 3PV1 A; 1WJU A; 1TKE A; 1R4N B; 2AEH A; 1X1M A; 4E74 A; 2G45 B; 1Y8R C; 3W9C B; 3A4R A; 2MBO A; 1VZ6 A; 4IWO A; 1OEY J; 4G3X B; 1CZP A; 2Y5P A; 4JGH B; 1HQR D; 2DYO A; 5G55 A; 1EF1 A; 1PYW D; 1ZXH A; 1ET6 A; 4II2 B; 1WM3 A; 3OJ3 A; 3KLS X; 2PVG C; 1I4X A; 1KM7 A; 3WAM A; 4WH4 A; 2GMI C; 2BYE A; 2KDF B; 1LFD A; 1EU4 A; 4B6W A; 2JYE A; 4IC7 B; 1XQQ A; 1UWX A; 1IUE A; 5E6P A; 3VFK A; 4ZHP A; 3R66 C; 1ZE3 D; 1TS3 A; 1JRU A; 2MEK A; 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