The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
|
sequence length |
91
|
structure length |
91
|
Chain Sequence |
GSSGSSGPARPFRVSNHDRSSRRGVMASSLQELISKTLDALVIATGLVTLVLEEDGTVVDTEEFFQTLGDNTHFMILEKGQKWMPSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the CIDE-N domain of human cell death activator CIDE-A
rcsb |
| molecule keywords |
Cell death activator CIDE-A
|
| molecule tags |
Apoptosis
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
14
|
| structure length |
91
|
| sequence length |
91
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-02-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF02017 | CIDE-N | CIDE-N domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2ONQ A; 2LGI A; 1ZXH A; 2JWU A; 2LUM A; 2ZW1 A; 4IOI E; 5BMH A; 5HFY A; 1PGA A; 4GLS C; 1K53 A; 2IGD A; 2J52 A; 4KGT A; 4KGS A; 1IBX A; 1JML A; 1K50 A; 1UWX A; 2IGG A; 1XF5 L; 2JU6 X; 1MPE A; 2EEL A; 1XCQ L; 1YNT E; 1FCC C; 1PGX A; 3GB1 A; 3FIL A; 4MAC A; 2QMT A; 1GB1 A; 4HJG E; 2N9L A; 2JSV X; 2ON8 A; 2KQ4 X; 2ZW0 A; 1F2R I; 2IGH A; 1HEZ E; 3MP9 A; 2I2Y A; 2N7J A; 2K0P A; 5JXV A; 2LHD A; 1EM7 A; 3UI3 A; 2OED A; 2JXT A; 5HHD G; 2QSD A; 5BMG A; 2RPV A; 2J53 A; 1HZ6 A; 2KDM A; 2GI9 A; 2KWD A; 1KH0 A; 1C9F A; 4KGR A; 1P7F A; 5HG2 A; 1MVK A; 1IBX B; 2LHE A; 2PW9 A; 1HZ5 A; 1MHH E; 2GB1 A; 1FCL A; 1PGB A; 2N9K A; 2KN4 A; 1F2R C; 4WH4 A; 2PLP A; 4OZC A; 2KAC A; 1YMH E; 5HI1 A; 3V3X A; 1Q10 A; 3FIL B; 4D2K A; 4HKZ E; 1QKZ A; 2PTL A; 4OZA A; 1K52 A; 1IGD A; 1MI0 A; 2NMQ A; 1K51 A; 2JZP A; 1MHX A; 2RMM A; 1D4B A; 1GB4 A; 5BMI A; 1P7E A; 1FD6 A; 2I38 A; 1IGC A; 4IKG A; 1XCT L; 4OZB A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3SD5 A; 4FUL A; 1OQR A; 4M0W A; 4JPS A; 4N6E B; 2LUM A; 3EEC A; 3DCG A; 5FR3 A; 3GOE A; 2MSE D; 3I5J C; 3B2G A; 3E56 A; 2UYZ B; 4YTN B; 1L0V B; 2N4F A; 4RF1 A; 4KX6 B; 1WRI A; 3U8Z A; 1QT9 A; 2X38 A; 4NJC A; 2OHF A; 2EEL A; 1I4Q A; 2WWZ A; 2IO0 B; 2QMT A; 1YX6 B; 3GS2 A; 3V60 A; 3DWG C; 5HKH A; 1P9D U; 2C7N B; 2IPK D; 1JWA D; 1R4N I; 3DBL B; 2IGH A; 4YSZ B; 1EWC A; 1T0R C; 2MWS B; 4IG7 B; 1C3T A; 4WJQ A; 5EE9 A; 1R7S A; 3PTF C; 3AU5 A; 4E3C A; 3DBR I; 4MGI E; 4K3C A; 2DX5 B; 3VH4 B; 1MJD A; 4HXD A; 3QHT A; 1WGH A; 2BW2 A; 3IG3 A; 2KDM A; 2KWD A; 1FO4 A; 3V61 A; 1KH0 A; 4PS3 A; 3V62 A; 3ZNG C; 2LVO A; 2K5P A; 4RM8 A; 3W5V B; 1V1P A; 1NEN B; 3UQB A; 2QEJ C; 1MHH E; 4N58 A; 2CHZ A; 1UWM A; 3QCA A; 3TIX A; 3CSF A; 1H4R A; 2WU2 B; 2ZZP B; 4HKZ E; 4US8 A; 3QQ8 B; 1FNW A; 4OZA A; 4B0M A; 2PVG C; 1WE6 A; 4XC2 A; 3ZO5 B; 4MSM B; 3IFW B; 4TKN A; 3N30 A; 2LVP A; 2G9H D; 3HRD D; 4ZYS A; 1WSP A; 1WYW B; 2KMA A; 4NY0 A; 3BVZ A; 1NDD A; 1YN4 A; 2DAF A; 2NCN A; 3U30 A; 2VH2 A; 1YQ3 B; 3ABV B; 3VTU A; 4IKG A; 4ANU A; 2HTM E; 1E0Z A; 3SFD B; 2WLB A; 4DXA B; 3NZU A; 2FAZ A; 4MDK E; 4BZA A; 3A1Q A; 1E8Y A; 3OJ3 A; 3RNG C; 2WU5 B; 2RGF A; 5JHA A; 3VUW A; 4WIP A; 4YSY B; 2MBO A; 2CHX A; 4XWW A; 1YJI A; 2KMM A; 3K9P B; 2ZVN A; 1V6E A; 4N59 A; 3AH7 A; 2RDH A; 2OOB B; 4QAY A; 2FUH B; 4MAC A; 4NJ7 A; 1IUE A; 2SAK A; 3P63 A; 3Q8B A; 2HD5 B; 3QA8 A; 1TTN A; 1U4A A; 2GMI C; 1QOG A; 2I2Y A; 1WGR A; 4MGZ E; 1DOI A; 1SSN A; 2A5U A; 2WXL A; 1TZ1 A; 2MJE A; 4AJY B; 1DOY A; 2AQ2 B; 3T3O A; 3A1Q B; 1C9F A; 1WM2 A; 1C4C A; 2BS3 B; 2L05 A; 2WXO A; 1XLP A; 2QC8 A; 1KFY B; 2LRW A; 4W9C A; 5BYQ A; 4GB9 A; 1SF0 A; 1XLN A; 2BTE A; 3R2T A; 2O2V A; 3DOW A; 3OG5 A; 4TQ0 A; 4KV2 A; 2Z59 B; 1MI0 A; 2L76 A; 2NMQ A; 3V6C B; 5DPW A; 2H88 B; 4L23 A; 2BWE S; 2SEB D; 3RNF C; 1VDV A; 2VH1 A; 3CF6 E; 2KJH B; 2NR2 A; 1WXA A; 2FCS A; 2QCZ A; 1E8W A; 3H8H A; 3RUI B; 2FUG 1; 4FA6 A; 2KVR A; 4EFO A; 4IWQ A; 4BKS A; 3R7Q A; 3U7D A; 3SFE B; 1TYG B; 4HDQ A; 3PZ7 A; 1K53 A; 4AQ7 A; 4KGT A; 1ZOY B; 5CX3 A; 1K50 A; 4WQM A; 1UUP A; 4XYC A; 2BYE A; 5C23 A; 4RNA A; 5DPT A; 1MPE A; 2CJO A; 2LZ6 A; 2LGY A; 2EKE C; 3M3J A; 4A9A A; 1Q0W B; 2I1J A; 2O2V B; 4M8M A; 2JZZ A; 2KQ4 X; 1QF6 A; 5T8I A; 1NI3 A; 3WAM A; 3MP9 A; 2MBH A; 2K0P A; 4PYZ A; 1TY2 A; 2N7D A; 2CU1 A; 5IP4 D; 2W3S A; 4W9F A; 2A4Z A; 2NVU I; 3Q69 A; 1RAX A; 3I57 A; 3MJW A; 4I6N B; 3L10 B; 2JX5 A; 3P4Q B; 2WGS A; 4IW0 A; 1S1Q B; 5E6J A; 1JW9 D; 1P1A A; 2ZNV C; 2R2O A; 3ECI A; 4KGR A; 4EEW A; 3HK0 A; 4HJK A; 5HG2 A; 3WAP A; 4NAM A; 3A9K A; 2DZI A; 5LXH A; 3L16 A; 2J0J A; 3ZVV A; 1HA5 A; 4HVB A; 2E6X A; 2FID A; 1E7V A; 2M0X A; 2FE8 A; 2GBN A; 3TL5 A; 5JZE B; 1YJJ A; 1V97 A; 2JF5 A; 2PMV A; 4ANV A; 4KIK A; 1OTR B; 3NVZ A; 3EA6 A; 3BII D; 4PS7 A; 2J4X A; 4ACF A; 2DYO A; 1TZO A; 2IZV B; 2J7Q B; 1RYJ A; 3U52 E; 4EE2 A; 3RNA C; 4K3B A; 3PV1 A; 2KNB A; 4F1S A; 1C76 A; 2K6D B; 5IA7 A; 3Q8E A; 3JVZ X; 3A9K B; 3VXW A; 2CS4 A; 1KLU D; 2L00 B; 2K8C A; 5IKC M; 3JSV A; 5DPR A; 2BYV E; 3ZRC A; 1L4D B; 3N9Y C; 1WX9 A; 3CIR B; 1T5X D; 4HCN B; 2REX A; 1R4N B; 4CHK A; 1F0Z A; 3V6E B; 3NS8 A; 3AE9 B; 3DVN U; 2QHO A; 4YXD B; 1A70 A; 2N7J A; 3AE4 B; 3ZJV A; 2KC2 A; 1L7Y A; 2OED A; 5EDS A; 3KYD D; 2LEK A; 3DBR B; 4P7I A; 5CHF A; 1TS2 A; 5D6J B; 1SJH D; 2KAN A; 4CO7 A; 3ZDT A; 4LNF A; 3EHV A; 2NTS A; 4HDO A; 1FNU A; 5JH5 C; 2L52 A; 4JQW C; 2MX2 A; 1WJU A; 1HZ5 A; 1FCL A; 2GB1 A; 5TR5 A; 4FJV B; 5E6O A; 1F2R C; 3AEG B; 3A33 B; 5TSS A; 4UDU C; 1WZ3 A; 2V1Y A; 1FRR A; 3JSV B; 3R66 C; 2BQQ A; 2PJH A; 5EE3 A; 1B1Z A; 1QOA A; 1GG3 A; 1N63 A; 4ZRK A; 1UBQ A; 1GC6 A; 4ZRJ A; 3SHQ A; 3X23 A; 1HQR D; 2KX0 A; 4ICU A; 1TT5 B; 1FD6 A; 2JUO A; 1ZDX A; 3H1U A; 2RR9 A; 2IY1 B; 3IVF A; 2KJR A; 1WH3 A; 1WXM A; 2PEA A; 2L7R A; 1VZ6 A; 2H89 B; 4H2A A; 3ZDM C; 2IYD B; 2LVQ A; 3OLM D; 4K81 A; 3AXC A; 3HIZ A; 2EMT A; 4JWU C; 1ENF A; 4E74 A; 3BK1 A; 2IGD A; 4HEA 1; 1C4A A; 1J7B A; 5LXI B; 2MBB B; 2WXM A; 2IO3 B; 1XO3 A; 2G4S A; 3AI5 A; 2JU6 X; 2DBY A; 4WAF A; 3TCA A; 3AMZ A; 5BYS A; 4MEM A; 4AOF A; 1JAL A; 3VR8 B; 2JZ3 B; 5AUK A; 2ON8 A; 3APD A; 1DOX A; 3O13 A; 5C3J B; 4YTM B; 5IO9 A; 4R3D A; 2MW5 A; 4HPL B; 4FJZ A; 4RMA A; 3RPF C; 1F2R I; 3PPA A; 3HVZ A; 5D3I B; 2ZVO A; 3GZN I; 4NQL B; 1E7P B; 3TJP A; 3KUD B; 2KYW A; 2RPV A; 2RDB C; 1T0Y A; 4W9L A; 1I4H A; 1NYR A; 3VFK A; 2KT7 A; 5AZF A; 1TKE A; 2DZK A; 5IOI A; 4IWO A; 2Y5P A; 1KTK A; 1FFU A; 3BY4 B; 2KLG A; 2M8S A; 2LJI A; 4LNO A; 1KLG D; 3UQA A; 2BT6 A; 3HM6 X; 3BZD B; 2KFJ A; 4DDG D; 4RCO A; 2WXJ A; 3V3X A; 1WJN A; 2JRH A; 1Y8R C; 2PTL A; 3QWZ B; 1V81 A; 4XDD A; 2K8B A; 4N9F 4; 1D5M C; 1WGY A; 4BKT A; 1E9M A; 2C7H A; 3Q3N C; 1YQ4 B; 4RGN A; 4ARI A; 4ZRP A; 2PE6 B; 1LO5 D; 1AWD A; 4GLS C; 4ZDV A; 3TEZ A; 3SU8 X; 5LNK 1; 5CHV C; 2ONQ A; 4A8X C; 5BMH A; 1WIA A; 3ZNI D; 5E6N A; 2MQJ A; 2YVC A; 4PK1 A; 4DXF A; 1NEK B; 2KWC A; 4Q2J A; 1J19 A; 1XCQ L; 4DHJ B; 3WAN A; 1XLO A; 1GB1 A; 2INC C; 3L4P A; 5LLI A; 2DYB A; 2MRP A; 1LGR A; 1SE4 A; 4ASW C; 4FHK A; 1GOZ A; 2JWZ A; 1NVI D; 4KKI A; 3AU4 A; 4EZJ A; 1L6V A; 2KK8 A; 4GDK A; 2DWQ A; 1WMH A; 2JXT A; 5HHD G; 2VZK B; 3NRZ A; 1L0X B; 1GNU A; 5L83 A; 2WXN A; 1J7A A; 2J0M A; 3IXS A; 1JRU A; 4MH0 E; 1WE7 A; 3PRE A; 4ARC A; 1AN8 A; 3B2F A; 3H9D A; 4IWP A; 1HE8 A; 4HLE A; 1AYF A; 3ZIM A; 3KYC D; 2VRR B; 2C9W B; 4ANX A; 5KHQ A; 1RRB A; 2O6V A; 4M0W B; 4P1C C; 2V3P A; 3NOB A; 4WAA A; 3PHX B; 4PS8 A; 5H92 C; 2BB5 A; 2Z8L A; 4REZ A; 2JYE A; 1VD2 A; 1D4B A; 1P7E A; 5D3D A; 5GMV A; 1I4X A; 4GDK B; 2M19 A; 1WMH B; 2G3Q B; 5C2T B; 3UIN B; 3VQI A; 1EU3 A; 2CU3 A; 3HM3 A; 4A3P A; 3DPD A; 2LUE A; 4B9K A; 2M17 A; 1ZXH A; 1DYQ A; 4LK0 M; 4RFB A; 1SE2 A; 1XXG A; 3URY A; 3Q3M C; 2B3A A; 3DHG C; 1E8Z A; 3PVL A; 4XX5 A; 1JML A; 4L2Y A; 2IGG A; 3IHP C; 1NYQ A; 4HRS A; 1V49 A; 3P4R B; 3ZYY X; 2ZNV B; 2D2Q A; 4DXG A; 3NZ3 A; 1NI2 A; 3M95 A; 1D5Z C; 2AEH A; 3RCZ A; 2KFK A; 4YWG G; 1VRA B; 1E10 A; 1JWB D; 3D32 A; 2WXG A; 2WXH A; 3QAQ A; 1V1P B; 3K9O B; 4I6L B; 2M56 B; 4DBG A; 1HZ6 A; 3B9J A; 3DQV A; 4NJ6 A; 1VJK A; 2GI9 A; 1IPG A; 4NAW A; 2KKC A; 1WFY A; 2ZCC A; 3AEE B; 3L13 A; 5BO4 B; 1JRP A; 1V5O A; 4OVU A; 5EE0 A; 3ZQ4 A; 1MG8 A; 2DZJ A; 4FN2 A; 2D10 A; 3ETR A; 3KW5 B; 1KOT A; 3Q3J A; 1WXV A; 2B76 B; 2KC1 A; 2D07 B; 1WRD B; 5GXG B; 2JT4 B; 1C77 A; 2LXA A; 1WXQ A; 4C80 A; 2W54 A; 1TS5 A; 1V5T A; 3L54 A; 3R7R A; 3VR9 B; 4S17 A; 5BMI A; 3BYY B; 4EZK A; 2KWU B; 2N1V A; 2K39 A; 3VTV A; 2KHW B; 5MPO A; 5I4D A; 1IYF A; 2KAJ A; 4JX1 C; 2KTF A; 4OVV A; 3DWM A; 3WIM A; 3WA0 A; 3M63 B; 2ZW1 A; 2UWQ A; 1J7C A; 4NAW B; 4PYU A; 4W9K A; 3AE5 B; 4LNK A; 2PVO D; 3QIJ A; 3PSE B; 3C19 A; 3ZXV A; 4OVZ A; 3L08 A; 2L1A A; 4FJY A; 2M4N A; 4K7W A; 3ZNZ B; 1WI0 A; 3PRP B; 3R8B A; 3RUL A; 3IAS 1; 2JSV X; 3Q2A C; 5H8Y E; 3RI7 C; 4LJO B; 1WGK A; 2LMC A; 1LXD A; 4WWP A; 2DAJ A; 3GZN B; 2JYT A; 2CR5 A; 2BB6 A; 3TMP B; 4RGT A; 2BVC A; 2L3Z A; 2GBM A; 3KLS X; 2WP9 B; 3KWV A; 4IM2 A; 2WS3 B; 4DHJ D; 2V0G A; 4G50 A; 2MP2 A; 3EC8 A; 2GBR A; 3EFU A; 2ZPN A; 2V4L A; 1E6E B; 2INP E; 1FXI A; 3EUB 2; 4JE3 B; 1OGW A; 2PW9 A; 4AS1 A; 2IY0 B; 4KVG B; 3N1Z C; 2WX0 A; 4HKQ A; 2MH7 A; 1JWM D; 2JRI B; 1MFW A; 1R4M I; 2PLP A; 1ZXI A; 1I4R A; 2WNM A; 3RFZ B; 1QKZ A; 3MHZ A; 2VZK D; 1MG4 A; 2PIA A; 5E6P A; 2WYQ A; 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1LQB A; 3U2S C; 1J8C A; 4OW0 A; 3VHT C; 1WYG A; 1A5R A; 1WM3 A; 3P4P B; 2KX3 A; 3T8M A; 5L95 C; 2W9N A; 1BT0 A; 2IND C; 4YTP B; 4HJG E; 2XNA C; 1TY0 A; 1GUA B; 4IDI A; 3SDL C; 4DK5 A; 2MHJ A; 3H7P A; 2LRU A; 2WDR B; 4GDL B; 4NPN A; 5KHO A; 3RN9 C; 1F1H A; 3VVW B; 2LGX A; 3LYY A; 3UF8 A; 4B6W A; 4LLG M; 5EE1 A; 2LHD A; 1ESF A; 3UI3 A; 3BYT B; 3KUZ A; 2RSU A; 3KWL A; 3ZJT A; 2K9X A; 2CKH B; 2WXK A; 2IBI B; 2FNJ B; 2D11 A; 4FLH A; 3BVM A; 2G4D B; 3DBH B; 1WY8 A; 2KOX A; 1TJE A; 1EUV B; 2EMS A; 2KVZ A; 2WXI A; 4BBN F; 4KSL C; 4MM3 A; 3JYU A; 3H7S A; 4JWS C; 2KDB A; 4W9D A; 3AE6 B; 4US9 A; 1ZKH A; 1ZUD 2; 2BYF A; 3CMM B; 1X1M A; 2I38 A; 3ZTC A; 4O1N A; 1FXT B; 3I3T B; 4M8N A; 2YEP F; 2EKI A; 2GOW A; 2GRI A; 4B95 A; 1BXT A; 2DEN B; 3O65 B; 2KDE B; 4BKS D; 1XLQ A; 4RF0 A; 3VDZ A; 3SEB A; 4MM3 B; 2K8H A; 1XT9 B; 2WXQ A; 3UGB B; 2J42 A; 2J0K A; 4IM0 A; 2AQ3 B; 2D3B A; 2IDY A; 5BYR A; 5DPS A; 3PRM B; 1HEZ E; 2JXX A; 3MC9 A; 1WGD A; 5G2N A; 5FK9 C; 2KWV B; 4MEL A; 2BPS A; 3AM9 A; 4JIO U; 2N9X A; 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