The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
MQYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solid-State Protein-Structure Determination with Proton-Detected Triple-Resonance 3D Magic-Angle-Spinning NMR Spectroscopy.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
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| molecule tags |
Protein binding
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| source organism |
Streptococcus sp. 'group g'
|
| total genus |
9
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-08-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| X | PF01378 | IgG_binding_B | B domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5HI1 A; 1YNT E; 2LGI A; 1MHH E; 1FCL A; 5HHD G; 2EEL A; 1MHX A; 2PLP A; 2IGG A; 2PTL A; 2ZW0 A; 1PGX A; 2PW9 A; 5BMH A; 1GB1 A; 1IBX B; 2QSD A; 2N9K A; 3UI3 A; 1FCC C; 2ON8 A; 2I2Y A; 2RPV A; 5HG2 A; 1QKZ A; 1EM7 A; 2J53 A; 1PGA A; 2OED A; 2GI9 A; 2LUM A; 2JXT A; 2IGH A; 2LHE A; 1C9F A; 1P7E A; 1K51 A; 2KQ4 X; 1D4B A; 4IKG A; 4HKZ E; 5BMI A; 3MP9 A; 1KH0 A; 4OZC A; 2KWD A; 4GLS C; 4KGR A; 4IOI E; 2QMT A; 1UWX A; 2LHD A; 2J52 A; 5BMG A; 4HJG E; 3FIL A; 2ZW1 A; 2ONQ A; 2JU6 X; 1XF5 L; 5JXV A; 2IGD A; 1P7F A; 1F2R C; 4KGS A; 2JZP A; 1IGD A; 1Q10 A; 1XCQ L; 2N7J A; 3FIL B; 4OZA A; 2JWU A; 4MAC A; 1IGC A; 1MVK A; 2KDM A; 4WH4 A; 2I38 A; 1F2R I; 5HFY A; 1XCT L; 1K53 A; 4D2K A; 1HEZ E; 1GB4 A; 1K52 A; 2JSV X; 1FD6 A; 1IBX A; 2KAC A; 1HZ5 A; 1K50 A; 2GB1 A; 1ZXH A; 1JML A; 2RMM A; 1PGB A; 4KGT A; 1YMH E; 2N9L A; 3V3X A; 3GB1 A; 4OZB A; 2KN4 A; 2NMQ A; 1HZ6 A; 1MI0 A; 1MPE A; 2K0P A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DZM A; 3V60 A; 2IBI B; 1QOG A; 1JWS D; 2PVO D; 3KWV A; 3V05 A; 4GN1 A; 1FCL A; 1F9J A; 4RM8 A; 1DOY A; 3PZD A; 1WSP A; 2ZW0 A; 4JWS C; 2L32 A; 3OWE B; 3IT4 B; 1MJD A; 2N7E A; 3NUH B; 3Q2A C; 1WR6 E; 3RZF A; 4EZK A; 5DPS A; 2JZ3 B; 3PRE A; 2N9K A; 4HDQ A; 3N9Y C; 3H1U A; 2GBR A; 3LXF A; 2KX3 A; 2N9X A; 1ROE A; 1V5O A; 1D6E C; 2J53 A; 4E74 A; 3VFK A; 4ZDV A; 1WXQ A; 2GOW A; 1XT9 B; 3KW5 B; 1LFD A; 3U52 E; 2GLS A; 2FCS A; 4K7S A; 2UYZ B; 3AEG B; 4WUR A; 4GLS C; 2M4N A; 2LZ6 A; 1QF6 A; 1F0Z A; 1TKY A; 2XK5 A; 5CHW A; 4A6Q A; 4PS8 A; 1XF5 L; 4K7U A; 2K25 A; 2O6V B; 3QA8 A; 4A3P A; 3HVZ A; 3AE5 B; 2KDM A; 2DZI A; 2MBO A; 3PLV A; 3RCZ A; 4D2K A; 1WYG A; 1WWT A; 2N7D A; 3AEE B; 1TKG A; 4ZRP A; 3V62 A; 1N5W A; 2KKC A; 4M0W B; 3FC4 A; 5C3J B; 4CQN A; 4E3C A; 4ZHO A; 1D5Z C; 1WIA A; 2PVG C; 2BF8 B; 5FR6 A; 2BS4 B; 5IKC M; 1SSN A; 4G0N B; 4HDO A; 2MW5 A; 2RD0 A; 3Q8A A; 2G4S A; 1D5M C; 1E6E B; 1BUI C; 2LFI A; 3AEF B; 2KN5 A; 1TJE A; 4W9F A; 4S17 A; 1FXT B; 5EE1 A; 3WIM A; 1C4P A; 1WRI A; 1T3Q A; 2V3P A; 3W1S A; 4W9L A; 2NBV B; 2LRU A; 1WJ6 A; 1VR9 A; 2BS2 B; 3NZ3 A; 4UDU C; 4ICU A; 1F77 A; 4YT0 B; 4TKN A; 1NDD A; 4LCD E; 5BMI A; 2KWU B; 3ZO5 B; 3X23 A; 3ZNI D; 2GMI C; 2CHX A; 2K8H A; 2KC1 A; 4RF0 A; 1RWS A; 4DHZ E; 3ECI A; 2Y3A A; 1B9R A; 2CHW A; 2JYE A; 3V6C B; 1EU3 A; 3RFZ B; 2ZNV C; 3QHT A; 3RNF C; 1OQQ A; 1YJJ A; 4XWT A; 2M0X A; 2L0F A; 2XBB C; 1C4C A; 3Q3O C; 2LD9 A; 4WH4 A; 3O13 A; 4MH8 A; 4ANV A; 2WP9 B; 1J19 A; 2M0A A; 2KAJ A; 1L2N A; 4JLC A; 1HEZ E; 5LNK 1; 3A1Q B; 1TS4 A; 1ZW7 A; 1HZ5 A; 1NBF C; 1UWM A; 1E8X A; 2MEK A; 3Q8C A; 2RMM A; 2MX2 A; 2A5U A; 2DYM A; 3TEX A; 3EC8 A; 2C7N B; 4MSQ B; 3MHS D; 1XLO A; 4W9G A; 4F7Z A; 1S3S G; 2A4Z A; 3AE1 B; 3TUO A; 3W1Y A; 1IP9 A; 3W5V B; 2I1J A; 3LB8 C; 4RFB A; 2WDV B; 4NJC A; 1M94 A; 4CO7 A; 3ZQ4 A; 4K1R B; 2O6V D; 2ZCC A; 1WR1 A; 4G3X B; 1OTR B; 4PK1 A; 2R2O A; 2D10 A; 4HKQ A; 4LDT B; 2W9N A; 3VDZ A; 3ZJU A; 1ET9 A; 1WFY A; 2RPV A; 5HG2 A; 3EEC A; 4P16 A; 3SD5 A; 3E56 A; 1YIW A; 1WJN A; 5DPW A; 3AI5 A; 2KVZ A; 2LUM A; 3P2B A; 2LJ5 A; 2FIF A; 4BVU C; 1WXA A; 4IKG A; 3RD2 A; 1UBQ A; 3T8M A; 1AAR A; 3CWI A; 1KJT A; 3VTW A; 2MBH A; 3RNC C; 1AYF A; 3KUD B; 3VXW A; 1OEY J; 3WAN A; 1UZX B; 3D32 A; 3DPD A; 3NS1 A; 4JQW C; 3HVD A; 4KKI A; 4W9I A; 2NVU I; 4M02 A; 1BML C; 3DWM A; 3VRB B; 1XD3 B; 4HPP A; 1P7F A; 2V3N A; 1JQ4 A; 3NVZ A; 1I4H A; 4W9E A; 2J0J A; 1E0Z A; 1YJI A; 3OAW A; 2LI5 A; 4IDI A; 1FM0 D; 2PKO A; 2D2Q A; 3RNA C; 1L4D B; 1YX5 B; 4KSL C; 1L5P A; 3RNE C; 1E9M A; 4M01 A; 4BKS A; 1N60 A; 5LXH A; 4W9K A; 3C0R B; 3PPA A; 1EU4 A; 4A90 A; 2K6D B; 4DK5 A; 1V49 A; 3VUW A; 1N62 A; 1X1M A; 4PT5 A; 4WJQ A; 5D94 A; 3FKY A; 2J0K A; 2OJW A; 2PE6 B; 2YLM A; 1VJK A; 1WGH A; 1S1Q B; 3DBH I; 2EEL A; 4Q2J A; 2X8X X; 1L6U A; 3TMP B; 2J42 A; 1E8W A; 1E8Y A; 1T0Y A; 4B9K A; 3PRM B; 3KH0 A; 4RCO A; 2HDE A; 3CF6 E; 3P4R B; 1YJ1 A; 4HRS A; 3RZW C; 2W82 A; 2MH7 A; 2G45 B; 2L00 B; 2G4D B; 2K3U A; 4BBN C; 2RSU A; 3EHV A; 2W55 A; 3B2F A; 2MRP A; 3C19 A; 3HK0 A; 4TSS A; 1VCB A; 3EFC A; 2ZPN A; 3TJP A; 3MP9 A; 4REZ A; 1FMA D; 1JWU D; 3WAP A; 1L0X B; 3N20 C; 2LGS A; 2MP2 A; 1J0G A; 4F1S A; 2PEA A; 1C78 A; 1KRH A; 4AUQ C; 3AM9 A; 4URK A; 3IG3 A; 1F1H A; 4KDL B; 3GZN I; 1WGD A; 2JF5 A; 1N61 A; 1TYG B; 1WRD B; 2WXQ A; 1WY8 A; 3RMK C; 2CU3 A; 2ZEQ A; 2ZJD A; 4WQM A; 3I5J C; 3BVZ A; 3H7P B; 3PTF C; 2INP E; 3CMM B; 3CST A; 3ZGZ A; 3BK2 A; 4RGO S; 1WJ4 A; 3MJW A; 2BKR B; 3WAM A; 4LDT D; 1YQB A; 1R4M I; 3NVW A; 2B76 B; 4LNI A; 1EO6 A; 2LAS A; 5H92 C; 4C7Y A; 4NJ6 A; 4YXD B; 1EF5 A; 4OZB A; 3AUL A; 4EZL A; 2GBN A; 2CKH B; 2YVC A; 2LXC A; 1V8C A; 2IND C; 1MHH E; 1XLN A; 3RUL A; 3U8Z A; 4G50 A; 1IPG A; 1PGX A; 2AQ3 B; 1QIL A; 4ITK A; 1HXY D; 1QQR A; 3QC8 B; 3M62 B; 2XN9 C; 5LLI A; 1IBX B; 1ET6 A; 1V6E A; 2C60 A; 2CR5 A; 2MA9 B; 4FJY A; 4ZRI A; 3U4E G; 3VHT C; 1HTQ A; 1TS5 A; 2N1W A; 2O6V A; 2L3Z A; 2KNB A; 4YTM B; 2O2V A; 4M8M A; 4F8C B; 1YX6 B; 1OEY A; 4MEM A; 1NVI D; 2IGH A; 5BYR A; 1K51 A; 2DYB A; 3N1Z C; 3L10 B; 3PS6 A; 2LWP A; 4AJW A; 1TZ1 A; 1Y8R C; 1P3Q U; 2BQQ A; 2NS5 A; 1N6Z A; 4II2 B; 1ZE3 D; 3A9J B; 2CS4 A; 3UF8 A; 1WGG A; 2HD5 B; 1WXM A; 4M0W A; 2BPS A; 2KYW A; 3MFG A; 1RFK A; 2D3C A; 4HJK A; 4EUT A; 3K9O B; 1WXV A; 2BYF A; 3DBH B; 3TEY A; 4K81 A; 1PUT A; 2MJE A; 1GB4 A; 2JSV X; 4FN2 A; 3V6E B; 1FPY A; 3LYY A; 2WU2 B; 4LJO B; 1J7B A; 3B0A A; 2YEP B; 4KGT A; 5KHO A; 2WXO A; 2D3B A; 2G9H D; 1CQV A; 3PZ8 A; 4C56 C; 4E71 A; 4A8X C; 2L0T A; 3ZJT A; 2AEH A; 1XEE A; 4LTU A; 1MPE A; 1Q0W B; 4IM0 A; 1KLG D; 4P7I A; 3RN9 C; 5EE0 A; 4KIK A; 3A4S C; 4RH6 A; 4P1C C; 1ZOY B; 1QOA A; 3R7R A; 3JSV A; 2KMM A; 2LGD A; 2VH2 A; 1UF0 A; 3EUB 2; 4DXF A; 1IUE A; 1UBI A; 1GOZ A; 4KVG B; 2KMA A; 2W3S A; 4TMA B; 3GZN B; 1ENF A; 3VH3 B; 2E6X A; 1GC7 A; 4OW0 A; 2WXI A; 4K7W A; 2L76 A; 1IYF A; 4BKG A; 2RR9 A; 4MGI E; 3PRP B; 5DPR A; 3W5U B; 1KH0 A; 4FBJ B; 1R4M B; 3A1Q A; 1FRR A; 2GBK A; 1SE4 A; 2KK8 A; 5D3I B; 2BVC A; 3WA0 A; 2NPT B; 3QX1 A; 3I3T B; 1FEH A; 4XC2 A; 4JX1 C; 2ONQ A; 4GU2 A; 1KM7 A; 3QAR A; 4KGS A; 4AOF A; 2JZP A; 3MTN B; 5KHQ A; 4B0M A; 3FIL B; 2MJ3 A; 1VRA B; 2GRI A; 3ZYY X; 2KXJ A; 4HWI B; 3AH7 A; 2IO3 B; 4FJZ A; 4C4V A; 2K8B A; 3NVV A; 2QEJ C; 1FD6 A; 2CU1 A; 2KDE B; 3NOB A; 4MDK E; 2BTE A; 2DZJ A; 5BO4 B; 2FAZ A; 4NAW B; 1QLB B; 2Y5P A; 4GSW A; 1SB3 C; 3CSF A; 4M8N A; 2KMC A; 5IAA C; 3Q3M C; 4W9C A; 2MWS B; 1Q5W B; 1LGR A; 1T0Q C; 2KWV B; 3Q6B A; 4US9 A; 4GDL A; 1MI0 A; 2DYO A; 4GOC A; 3P4Q B; 1KFY B; 3L4P A; 2M8S A; 5HI1 A; 2DZK A; 2EKI A; 4G11 A; 1T0S C; 1JCK B; 1AN8 A; 1PDX A; 2QCZ A; 3VUY A; 2MSE D; 4KDI C; 2IGG A; 2PTL A; 2NCN A; 2IYD B; 3A9K B; 1GB1 A; 1SJH D; 2MQJ A; 1WMH A; 2I2Y A; 3I57 A; 1V1P B; 2M19 A; 3Q8F A; 3JYU A; 3VAW A; 3MJ5 A; 1JWM D; 1V9J A; 2OED A; 2ACZ B; 2JRI B; 4JIO U; 2KZR A; 3DWG C; 1SEB D; 3T3N A; 1QOF A; 2H89 B; 4H2A A; 1VZ6 A; 4WJP A; 2VRR B; 4W9H A; 4HKZ E; 3AB5 A; 2QC8 A; 4C80 A; 2J7Q B; 2KDI A; 5BYQ A; 1RRB A; 1V80 A; 5IA7 A; 2G1E A; 1N5X A; 1RYJ A; 4GMV A; 2BWE S; 3M95 A; 3APC A; 1WGR A; 1CZP A; 2JU6 X; 1QZE A; 2LRW A; 3UIN B; 2K9X A; 1FIQ A; 3R2T A; 4MM3 B; 1P9D U; 3ALB A; 4A9A A; 3PHW B; 4LJP B; 3UIP B; 1V5T A; 2KTR A; 2WXP A; 1K52 A; 1YN3 A; 2KWC A; 2K6Q A; 3W1S C; 2BS3 B; 2MHJ A; 2GB1 A; 2WXH A; 1GAQ B; 3PT2 B; 2D5G A; 5E6O A; 2R2Q A; 4EEW A; 1JAL A; 4DQO C; 1QT9 A; 4W9J A; 1WGK A; 2NMQ A; 4IW0 A; 4HK2 A; 2QDF A; 5AZG A; 2QHO A; 2LGI A; 3DVN V; 3NY5 A; 4DHZ B; 4KZC A; 2LVP A; 1PFD A; 2IJ0 A; 5FR3 A; 3SU8 X; 3HM6 X; 4CYE A; 1I4Q A; 4MT5 A; 3W2D A; 2GBJ A; 3DCG A; 3EA6 A; 3B2G A; 3RT3 B; 1GUA B; 3AE6 B; 2WU5 B; 2K39 A; 3SEB A; 3URY A; 4JGH B; 2JVC A; 2K5P A; 3H7P A; 3KUC B; 3ZTD A; 1I4X A; 2LVO A; 3E9S A; 1V1O A; 2PE9 A; 2K1F A; 2D3G A; 4KKJ A; 1ISN A; 4MJS A; 2QMT A; 1HE8 A; 1T6B X; 1Z5S B; 3H6N A; 4AP4 C; 2V9H A; 1AW7 A; 4N6E B; 3GS2 A; 2JXX A; 4XGA B; 4LNF A; 1VDV A; 4YWG G; 1CJE A; 1N63 A; 2L8J A; 3IVF A; 2XK5 B; 3Q3F A; 1IGD A; 3PVL A; 1ZKH A; 3HM3 A; 4OZA A; 3ZDM C; 3IHP C; 4NAM A; 1EUV B; 3BYT B; 4A55 A; 1XCT L; 3PV1 A; 4LNO A; 1GNU A; 2WXM A; 3Q3J A; 1IBX A; 2NTT A; 4XX5 A; 4YTP B; 5CHF A; 2KQ7 A; 1WX9 A; 3MC8 A; 1SF0 A; 5JZE B; 1WGY A; 5IP4 D; 4JWU C; 3DVG Y; 1CMX B; 3QK0 A; 2FE8 A; 3ML8 A; 2EMS A; 1YD8 U; 2N0S B; 4IM3 A; 1R4N I; 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5J18 A; 1AWD A; 1J8C A; 2RGF A; 1FNW A; 1YOV B; 1FCC C; 3U30 A; 2NBW B; 4TUU A; 1MFW A; 4IG7 B; 2MBB B; 4IUM B; 2ICI A; 3AEC B; 2X38 A; 3EGR A; 3MHZ A; 1TS3 A; 2LHE A; 4WAA A; 3L16 A; 4ZYN A; 2KX0 A; 2BW2 A; 4IWO A; 3BIN A; 5MPO A; 1XLQ A; 2FUH B; 2KWD A; 3DVG X; 3M3J A; 4KGR A; 3OJ3 A; 5G2N A; 5D2M B; 4FA6 A; 2J0M A; 3DQV A; 4NAW A; 1ZXI A; 2QIL A; 2J4X A; 2VZK D; 4GDK B; 4IM2 A; 1M4V A; 1R4N B; 3BWU D; 2IO1 B; 1RAX A; 4PS3 A; 2V0G A; 2N7J A; 3AE7 B; 1I4P A; 3GOE A; 2ZVO A; 1HQR D; 2WX0 A; 4EOY A; 1TY0 A; 4HCP B; 3AU4 A; 4L23 A; 2KLC A; 2WXN A; 1RLF A; 3AU5 A; 2I1K A; 3AE4 B; 3N32 A; 4C7Z A; 3KYC D; 2C7M B; 2FNJ B; 3AED B; 3PZ7 A; 1PGB A; 4ANX A; 1TIF A; 5FKA C; 3FAH A; 4QAY A; 3HIZ A; 4IC7 B; 2WDT B; 3JW0 X; 4MGY E; 3SFE B; 1VD2 A; 1WI0 A; 1OGW A; 4P6V F; 1I4G A; 1YN4 A; 3DHH C; 4AJY B; 4NPN A; 2WDR B; 3H8H A; 4HPM B; 4IWQ A; 2BB5 A; 1TKE A; 2KLG A; 2WYQ A; 4EKU A; 2IY1 B; 4XDC A; 1TY2 A; 4GIV A; 1QKZ A; 2HE7 A; 1EM7 A; 4JE3 B; 4NQK E; 2EKE C; 4I6N B; 1VZ7 A; 2L7R A; 3ZJV A; 4RNA A; 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