The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
64
|
structure length |
64
|
Chain Sequence |
MEEVTIKANLIFANGSTQTAEFEGTFEEATSEAYAYADTLEEDNGEWTVDVADEGYTLNIEFAG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural basis for the aminoacid composition of proteins from halophilic archea
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Protein L
|
| molecule tags |
Immune system
|
| source organism |
Peptostreptococcus magnus
|
| total genus |
15
|
| structure length |
64
|
| sequence length |
64
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-11-04 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4IKG A; 4KGR A; 2JXT A; 1JML A; 2JSV X; 1MHX A; 5HFY A; 2ZW1 A; 1FCL A; 1EM7 A; 2LUM A; 1FCC C; 1IBX A; 3UI3 A; 1FD6 A; 1UWX A; 2N7J A; 4D2K A; 2KN4 A; 2N9L A; 4KGT A; 3V3X A; 4HJG E; 4WH4 A; 2KQ4 X; 2I38 A; 2ON8 A; 1D4B A; 2J53 A; 1HEZ E; 2JU6 X; 2PW9 A; 4IOI E; 1IBX B; 2ZW0 A; 5HI1 A; 2NMQ A; 1XCT L; 2ONQ A; 2GB1 A; 2RPV A; 1K52 A; 2QMT A; 1HZ5 A; 2EEL A; 3FIL A; 5BMG A; 1K50 A; 2I2Y A; 2IGG A; 2LGI A; 4MAC A; 1XCQ L; 5BMI A; 1GB1 A; 1MPE A; 1C9F A; 2PLP A; 1KH0 A; 2J52 A; 1ZXH A; 1PGX A; 1IGD A; 2IGH A; 1QKZ A; 1MHH E; 2LHD A; 1GB4 A; 2KDM A; 1P7E A; 3FIL B; 2K0P A; 2LHE A; 1MI0 A; 3MP9 A; 1XF5 L; 4OZA A; 5HHD G; 1Q10 A; 2JWU A; 2PTL A; 4GLS C; 4KGS A; 2KAC A; 1K51 A; 3GB1 A; 2QSD A; 2KWD A; 2JZP A; 1YNT E; 4OZB A; 1PGA A; 1P7F A; 1IGC A; 1K53 A; 1HZ6 A; 2OED A; 5JXV A; 5HG2 A; 1F2R I; 2GI9 A; 5BMH A; 1F2R C; 1YMH E; 2RMM A; 4HKZ E; 1PGB A; 4OZC A; 1MVK A; 2N9K A; 2IGD A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4KGR A; 2AQ2 B; 2JXT A; 3DHI C; 4KIK B; 4DDG D; 3GE8 C; 3A9K B; 3LDZ E; 2YEP F; 3RZW C; 2CR5 A; 2KNB A; 2LVQ A; 1SF0 A; 2N7J A; 3Q8C A; 3GE3 C; 1KTK A; 4WAF A; 2MBQ A; 4MH0 E; 3QX1 A; 1WE7 A; 2WXG A; 5G5G A; 1ZXI A; 4KKJ A; 2MA9 B; 5DPS A; 2ZW0 A; 2ZVN A; 3ML9 A; 4ZRK A; 2FUH B; 5BMG A; 2YEP B; 3CF6 E; 2KFJ A; 3T3O A; 1WR1 A; 2LXC A; 2MSE D; 2JRH A; 3PLV A; 3QJZ A; 4TV3 A; 4BZA A; 3SR6 A; 1N62 A; 2K6D B; 4RM8 A; 3RI7 C; 2EKI A; 3WAP A; 2HE7 A; 4W9E A; 3ENE A; 4P1B C; 3I9V 1; 4H2A A; 1SE4 A; 1SE3 A; 1E7P B; 1Z5S B; 1ZKH A; 4K7U A; 5AEK B; 4KVG B; 1TS4 A; 3BY4 B; 1L5P A; 1I4R A; 1FXI A; 2Y3A A; 2JVC A; 4AJY B; 2PPH A; 2V1Y A; 2J4X A; 1VCB A; 4L2Y A; 4DXG A; 2IY0 B; 1TBE A; 3N3K B; 2I1K A; 1RLF A; 4KX6 B; 4A3O A; 1F2R C; 3ABV B; 5D94 A; 1WRD B; 2FBW B; 3Q8B A; 3V60 A; 3D32 A; 2D07 B; 1MVK A; 2W9N A; 3UQB A; 3APD A; 3PSE B; 5LXH A; 4NAM A; 5HFY A; 4ZRQ A; 4CQN A; 3ZUN A; 3DVG X; 1L4Z B; 3GP7 A; 4YTN B; 4FN2 A; 2JUO A; 3QK0 A; 2BKR B; 3KVF B; 1JAL A; 3R66 C; 1C1Y B; 1UBI A; 1R4M I; 4RFB A; 2Z8L A; 1LO5 D; 1Z2M A; 3HIZ A; 4IOI E; 1V5T A; 1XD3 B; 2MHJ A; 3VHT C; 4K1R B; 2WWZ A; 4B0M A; 4MH8 A; 5EDS A; 1HZ5 A; 3UIO B; 1WX9 A; 3DBR I; 2MWS B; 4JLC A; 4BKG A; 5BMI A; 3L54 A; 1AYF A; 1WYG A; 1FXA A; 1GC6 A; 1Y56 A; 2DX5 B; 3RNB C; 1L2N A; 3BK1 A; 1DOY A; 3GZN I; 2KDM A; 5D7G A; 2LHE A; 3R7Q A; 3AE7 B; 3N9Y C; 2MH7 A; 3E9S A; 3GOE A; 2JPH A; 5HKH A; 2O6V A; 4KV2 A; 1J7A A; 2L8J A; 1GPX A; 2C7N B; 2WU2 B; 2K9X A; 1VLB A; 5MPO A; 1WRI A; 3Q3O C; 4HVB A; 4W9G A; 3AMZ A; 5TR5 A; 4W9C A; 1JWA D; 2LVP A; 3DQV A; 4BFR A; 4N6E B; 1P3Q U; 2JY6 A; 4M02 A; 2RDG A; 4E74 A; 2BTE A; 2BW2 A; 1YX6 B; 3PZ7 A; 2N9K A; 4A3P A; 1KFY B; 2N9P C; 3TMP B; 1TS5 A; 5BYQ A; 2DAF A; 3MC0 B; 2XNA C; 3PHW B; 2JT4 B; 1TKG A; 2C7H A; 2N9L A; 4WIP A; 3ZGZ A; 2WXP A; 1TS2 A; 5J18 A; 1VDV A; 1KLG D; 5AZG A; 2W3R A; 1V86 A; 3PT2 B; 5IP4 D; 3NZU A; 3L13 A; 4FXC A; 1AW7 A; 1KH0 A; 2KVR A; 1ZXH A; 3ZXV A; 2MQJ A; 5C1Z A; 1QKZ A; 3R2T A; 4HPM B; 4ZYS A; 1NVI D; 4AOF A; 5KHQ A; 2EMS A; 1I7H A; 3IHP C; 2UWQ A; 3QHT A; 3LXF A; 3N1Z C; 1FNW A; 2IJ0 A; 3KWV A; 3NG0 A; 4OZA A; 1ZE3 D; 1ESF A; 1L6V A; 3ZNZ B; 2X8X X; 4L1B A; 3SU8 X; 1ACC A; 2C9W B; 2KWD A; 4WJP A; 1QLB B; 1WSP A; 2CHW A; 2FE8 A; 1IYF A; 3AEG B; 5CTR C; 3U7Z A; 5HG2 A; 4GB9 A; 4PS7 A; 4REZ A; 1H8C A; 2K39 A; 4NQK E; 2MBE A; 2R61 A; 3TL5 A; 2G4S A; 1VD2 A; 2PEA A; 3HUI A; 3W1S A; 2D3B A; 2KK8 A; 4M00 A; 3WA0 A; 4N58 A; 3UI3 A; 1YQ4 B; 2V3N A; 5JZE B; 4I6N B; 5J17 A; 1MG4 A; 2ON8 A; 4OVU A; 4NAW A; 3RNE C; 1WGY A; 2KT7 A; 2GOW A; 1N5W A; 3I3T B; 4LCD E; 1L7Y A; 4O1N A; 1E8W A; 1YN4 A; 1I4X A; 3N20 C; 1M4V A; 3Q69 A; 5GMV A; 2LRW A; 4DQO C; 3DBL I; 3TBL D; 3VQI A; 1XCQ L; 1Y8R C; 4R3D A; 2L83 A; 4MM3 B; 3NS1 A; 2EKE C; 2LAS A; 2LD9 A; 2B76 B; 4IDI A; 4ICV A; 3PZ8 A; 4XYC A; 4C7Z A; 2CJO A; 2K0P A; 2BT6 A; 1E5W A; 3NRZ A; 1TZ1 A; 4EZK A; 3AE8 B; 4PYZ A; 3RPF C; 5IA7 A; 1NEK B; 2GBN A; 2KDF B; 1V49 A; 1WJU A; 2KMA A; 2KTR B; 2J0K A; 2OOB B; 3BII D; 2MW5 A; 2IZV B; 1OQR A; 3A1Q A; 1JRO A; 4KGS A; 2GMI C; 3GS2 A; 1C77 A; 2WXR A; 3DVG Y; 2N7D A; 4EZL A; 2VH1 A; 3FC4 A; 1U4A A; 1GJZ A; 2V0G A; 4RH6 A; 3NHE B; 4ZOH C; 1SJH D; 3ZRC A; 2NTT A; 1RRB A; 1ZOY B; 1TGZ B; 3DWM A; 4ZDV A; 4KKI A; 4W9H A; 4MGZ E; 4HXD A; 4KDL B; 5AUI A; 2KLG A; 2C5L C; 2JSV X; 2PE9 A; 2QC8 A; 3ZTC A; 3OWE B; 1JQ4 A; 3KH0 A; 1R4M B; 4K81 A; 1IBX A; 3BVM A; 3VH3 B; 3ECI A; 2BWF A; 1ZW7 A; 5IOI A; 3Q3J A; 4D2K A; 1WR6 E; 3I63 C; 3UGB B; 1EWY C; 1I4P A; 3V3X A; 2N4F A; 2WXL A; 1C76 A; 2I38 A; 2KQ4 X; 4XDD A; 1EUV B; 4EUT A; 3H7P B; 2YLM A; 3PRM B; 3VFK A; 1CQV A; 4EZJ A; 2M17 A; 1T5X D; 4J3O D; 2RPV A; 4W9I A; 1H4R A; 2BQQ A; 2WXH A; 3GZN B; 3U52 E; 4IM0 A; 1FFV A; 3AB5 A; 1ZDX A; 3HRD D; 2KN5 A; 1UEL A; 2JYE A; 2NR2 A; 4FJY A; 4N9F 4; 3AEF B; 1I4G A; 1WM3 A; 2Y5C A; 2RDH A; 4PT5 A; 4GU2 A; 4RCO A; 4BKS D; 4BKS A; 3DPD A; 2ZPY A; 2VZK D; 3LJ3 A; 1XF5 L; 2CHX A; 3DWG C; 4JGH B; 3CIR B; 1Q10 A; 2HJ1 A; 3ZYY X; 5GXG B; 2L0T A; 4M8M A; 3BYY B; 2KQ7 A; 5LXI B; 1WI0 A; 5H8Y E; 3AE9 B; 1JWU D; 2RR9 A; 4A90 A; 1FFU A; 1R4N I; 4ZRJ A; 1I42 A; 3KQ4 A; 2WXQ A; 4ZRP A; 4JL9 A; 2NCN A; 3LYY A; 2RMM A; 3A1Q B; 3NVZ A; 4NJ6 A; 1XLO A; 3OJ3 A; 3ZKJ C; 3UIN B; 2V9H A; 3WAO A; 4II2 B; 4W9K A; 1P9D U; 4YWG G; 4HJK A; 3DCG A; 3PLU A; 3P4S B; 2B3A A; 3ONS A; 2WX1 A; 3EGR A; 1J19 A; 1LFD A; 3B1L X; 3Q8F A; 1WFY A; 2KN4 A; 2IDY A; 1ZDV A; 4AQ7 A; 2IND C; 1GAQ B; 1IBX B; 3P4R B; 3IFW B; 2L00 B; 2NMQ A; 3DVN V; 2BBC A; 4G0N B; 1PUT A; 1BT0 A; 3HM3 A; 1B9R A; 4MT5 A; 2ASQ A; 3I57 A; 2M19 A; 4MAC A; 3J9C A; 4IUM B; 2AQ1 B; 2ZJD A; 4JIO U; 3M63 B; 3R7R A; 4HDO A; 2CKH B; 2OJR A; 4AP4 C; 2DLB A; 1SEB D; 1NBF C; 3AE4 B; 3C0R B; 2BYE A; 2DYB A; 2Y5B B; 1P0R A; 4S0R A; 1V9J A; 5E6J A; 2BKF A; 4WWO A; 3KW5 B; 2KLC A; 5AZF A; 2HD5 B; 3ZNH B; 2DZK A; 2MJD A; 2IPK D; 3QC8 B; 3AV8 A; 2M1M A; 2RDB C; 1E6E B; 2W54 A; 1TY0 A; 2JZZ A; 4WWM A; 3JYU A; 1DOX A; 5H92 C; 1E9M A; 2KWC A; 3QWZ B; 2GLS A; 1WGD A; 2H88 B; 2VRR B; 2VZK B; 3OLM D; 2FCQ A; 1XLN A; 1IGC A; 4P6V F; 1TYG B; 3VVW B; 1M94 A; 2KAN A; 2KDI A; 4CYE A; 3MTN B; 4TMA B; 4LNF A; 2CJN A; 4FUL A; 1CJE A; 3ZNI D; 1R7S A; 1Q5W B; 4DHJ D; 2MBB B; 2WXF A; 3TEZ A; 4JPS A; 4HKZ E; 4BKT A; 1EU3 A; 3KWL A; 2IGD A; 2KZR A; 4NZL B; 2DAJ A; 1VR9 A; 1GG3 A; 1WJN A; 1YD8 U; 2LUM A; 4ZHP A; 4YSX B; 1QZE A; 3C8Y A; 3DOW A; 3QA8 A; 4OVZ A; 2BYF A; 1HTO A; 1STE A; 4WUR A; 2KFK A; 3QCA A; 2IY1 B; 3JVZ X; 1Q1O A; 2L52 A; 5I4D A; 2IO3 B; 2GB1 A; 1WXM A; 4P1C C; 3FIL A; 5EE1 A; 2KJR A; 2BB6 A; 2WDR B; 1LQB A; 1E90 A; 2LGX A; 5T8I A; 2RD0 A; 4WQM A; 3U8Z A; 3RFZ B; 1OQQ A; 4KZ0 A; 1FNV A; 2IO1 B; 3QAR A; 4AUQ C; 4HLE A; 4LDT D; 1QIL A; 4HWI B; 3BK2 A; 3EFC A; 2MLB A; 1G6J A; 5C23 A; 1TTN A; 2BS2 B; 3RUI B; 1WX8 A; 3UQA A; 3URY A; 2JQR B; 1KF6 B; 3ZJU A; 4C00 A; 4YSY B; 1XLQ A; 1LM8 B; 2N1W A; 2KX3 A; 3EC8 A; 2LGS A; 4YTM B; 3GB1 A; 1AAR A; 5BO4 B; 5G5H A; 1UZX B; 2L3Z A; 2N9X A; 4C56 C; 2O6V D; 1YMH E; 3VRA B; 5EE3 A; 1PFD A; 1OTR B; 1TZO A; 2LVO A; 4AJW A; 3ZLZ A; 1FRR A; 2KWU B; 2V3P A; 4FJZ A; 3R8B A; 2IYD B; 1EO6 A; 2KXJ A; 3UF8 A; 3RZF A; 4M8N A; 3ZDT A; 1WGH A; 4TQ1 A; 3VAW A; 4DHJ B; 1CMX B; 3AEA B; 2KKC A; 4II3 B; 2E6X A; 2K1F A; 3ZTD A; 3RNA C; 4PK1 A; 5BYR A; 1ZP0 B; 3ML8 A; 1D3Z A; 1KM7 A; 3H8H A; 3V61 A; 5HI1 A; 3H6N A; 3VUX A; 1YJI A; 2EEL A; 2LGD A; 3TIX A; 3O65 B; 2FID A; 2I1J A; 3TEX A; 2WXM A; 3RMK C; 2XBB C; 2KVZ A; 2JX5 A; 4WQO B; 3ZJT A; 4FHK A; 3NUH B; 2MJE A; 1MPE A; 2D5G A; 3H1U A; 1C4A A; 2EMT A; 2KYW A; 5JH5 C; 1IGD A; 3HVZ A; 1GB4 A; 1P7E A; 3FIL B; 4K7W A; 2ICI A; 4XWT A; 4UDU C; 3SD5 A; 3RNG C; 1YQB A; 2LFI A; 4BVU C; 2KHW B; 1HXY D; 3PO0 A; 1NI3 A; 1FO4 A; 1FEH A; 3WAN A; 1ENF A; 1F1H A; 3P4P B; 3RT3 B; 1BUI C; 1ZPS A; 1UWM A; 2PTL A; 3Q6B A; 4LDT B; 1YX5 B; 1NI2 A; 1K51 A; 1WXQ A; 4MJS A; 2SEB D; 3ZNG C; 1F9J A; 1F0Z A; 5LLI A; 4OZB A; 1ISN A; 1SE2 A; 2M8S A; 4DHZ E; 5EE0 A; 4DK5 A; 1PGB A; 2TSS A; 2GBR A; 3U7D A; 3AE1 B; 2G45 B; 5JHB A; 4E3C A; 2DBY A; 3PVL A; 4A8X C; 1MHX A; 2AQ3 B; 4YTP B; 1EM7 A; 1I4Q A; 1OQY A; 4EFO A; 5DCN A; 3VXW A; 2O6V B; 2V4L A; 1PYW D; 2ZCC A; 2PJH A; 3L4P A; 2GBK A; 2K22 A; 4RGO S; 2LZ6 A; 4DWF A; 3OJ4 B; 4GDL A; 4HJG E; 2JYT A; 3AN1 A; 1SB3 C; 1KOT A; 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4FJV B; 1UNS A; 2N7E A; 1HE8 A; 1C78 A; 2M56 B; 3ZIM A; 4GDL B; 1WXS A; 1TIF A; 2LUE A; 1OEY J; 3ZQ4 A; 3FAH A; 2WS3 B; 3L08 A; 4ANX A; 3AM9 A; 3CSF A; 1B1Z A; 3DBR B; 3ETR A; 1UF0 A; 3AI5 A; 3NZ3 A; 1C4C A; 4QAY A; 5CX3 A; 2SAK A; 1V1P A; 3PTF C; 3VTV A; 2D3C A; 3ZDM C; 2WU5 B; 4JE3 B; 4ANV A; 1WXV A; 1ET6 A; 2KAJ A; 4DXF A; 1DGJ A; 5FKA C; 2WHI A; 2WXJ A; 2DZJ A; 2CU3 A; 4NAW B; 2PKO A; 5DPT A; 3Q8A A; 4J6I A; 2WNM A; 2IBI B; 4ZYN A; 4C4V B; 4ANU A; 5IAA C; 2PIA A; 4HK2 A; 1V8C A; 3TSS A; 4HRS A; 4PS8 A; 2BVC A; 1HZ6 A; 3DDC B; 5JXV A; 4IM3 A; 2GI9 A; 4WJO A; 4IG7 B; 5E6N A; 3NZS A; 4M0W B; 3NY5 A; 4IWQ A; 3WIM A; 2MP2 B; 3EA6 A; 2HTH A; 4OZC A; 2XK5 A; 2VH2 A; 3V6C B; 3MC9 A; 1JML A; 2DWQ A; 3CMM B; 3PHX B; 4JX1 C; 1V2Y A; 1GNU A; 4JQW C; 1JRP A; 3AEE B; 2FCS A; 4Q2J A; 1FPY A; 1PDX A; 2QCZ A; 4LNO A; 2KQS A; 2K3U A; 5D2M B; 2C60 A; 1P98 A; 4OHJ A; 4WWP A; 4TKN A; 3SHQ A; 3T9L A; 1XT9 B; 1SJE D; 1T0R C; 3IXS A; 3NVY A; 3PRZ A; 2QEJ C; 3B08 A; 4YSZ B; 3DHH C; 1UH6 A; 2QMT A; 1C79 A; 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