The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
64
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structure length |
64
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Chain Sequence |
MEEVTIKANLIFANGSTQTAEFEGTFEEATSEAYAYADTLEEDNGEWTVDVADEGYTLNIEFAG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural basis for the aminoacid composition of proteins from halophilic archea
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Protein L
|
| molecule tags |
Immune system
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| source organism |
Peptostreptococcus magnus
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| total genus |
15
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| structure length |
64
|
| sequence length |
64
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-11-04 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1MHX A; 2LHE A; 1KH0 A; 1IGD A; 1HEZ E; 2IGG A; 4KGT A; 2OED A; 2KWD A; 4KGS A; 1EM7 A; 2I2Y A; 2NMQ A; 4IOI E; 2J52 A; 1MHH E; 2JSV X; 2JZP A; 3UI3 A; 4HJG E; 1FCC C; 1Q10 A; 4D2K A; 1PGX A; 1QKZ A; 2ON8 A; 2QSD A; 3V3X A; 1GB4 A; 2ONQ A; 3GB1 A; 1FCL A; 1XCQ L; 1K51 A; 1XF5 L; 1XCT L; 5HHD G; 5BMH A; 4IKG A; 2PLP A; 1C9F A; 2IGH A; 2GB1 A; 4GLS C; 3FIL B; 5BMI A; 1MI0 A; 1GB1 A; 2RPV A; 1UWX A; 1MVK A; 2JWU A; 1HZ5 A; 1P7E A; 5HG2 A; 1YNT E; 1YMH E; 1IGC A; 2RMM A; 4MAC A; 2LHD A; 5JXV A; 1FD6 A; 2EEL A; 2N9L A; 2PW9 A; 2ZW1 A; 5HFY A; 1K52 A; 1F2R I; 3FIL A; 2GI9 A; 2PTL A; 4OZA A; 2ZW0 A; 4HKZ E; 5BMG A; 4OZB A; 1ZXH A; 2K0P A; 2LUM A; 4OZC A; 2JU6 X; 1MPE A; 2LGI A; 1PGA A; 4KGR A; 2KDM A; 2KAC A; 2IGD A; 2KN4 A; 3MP9 A; 1D4B A; 2N9K A; 1HZ6 A; 1K53 A; 2KQ4 X; 5HI1 A; 1PGB A; 2QMT A; 1F2R C; 2J53 A; 1IBX A; 2N7J A; 1IBX B; 2JXT A; 1P7F A; 1K50 A; 1JML A; 4WH4 A; 2I38 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4G50 A; 2PVO D; 4YTN B; 2LHE A; 4XDD A; 1Q1O A; 2Q5W D; 1XO3 A; 2Y5B B; 3NZ3 A; 5IA7 A; 4A55 A; 2CS4 A; 2MLB A; 2R2Q A; 3ZRF A; 3QIJ A; 4G3X B; 1TKE A; 2DAJ A; 2IY0 B; 1FO4 A; 3K9P B; 2C7N B; 4FJY A; 1FM0 D; 4LDT D; 4FBJ B; 1LFD A; 2ON8 A; 5IKC M; 3AE1 B; 4ZRI A; 5D94 A; 1TJE A; 1YJI A; 5EE0 A; 4PS7 A; 3VUX A; 4JIO U; 1HTQ A; 1TZ1 A; 4NZL B; 5D6J B; 2JT4 B; 4KZ0 A; 2K1F A; 5G5G A; 1Y8R C; 1P7E A; 1WJN A; 2LRW A; 4A90 A; 1MG8 A; 2V3S A; 1SJH D; 3U7Z A; 2IO2 B; 5T8I A; 1K52 A; 5DPS A; 3TUO A; 2C5L C; 2NBV B; 1WY8 A; 2MA9 B; 5H92 C; 1XLP A; 2CHW A; 2KWC A; 1VD2 A; 2N9E B; 3AU5 A; 1L4D B; 3IFW B; 4PS3 A; 1Q5W B; 4EFO A; 4RGN A; 3UIN B; 2REX A; 2KAC A; 5D2M B; 2LGY A; 4ICU A; 4LNN A; 1WXV A; 3IAM 1; 1FIQ A; 1XLN A; 2LGS A; 1UNS A; 2KDB A; 4E71 A; 2QDF A; 1XT9 B; 2MBB B; 1K8R B; 1F2R C; 3NOB A; 1D5Z C; 5DPR A; 2DZI A; 1QOF A; 2J53 A; 5E6P A; 4AQ7 A; 5FR6 A; 3UF8 A; 3PPA A; 4DHZ B; 5IN7 A; 2N7J A; 4N6E B; 1WIA A; 5C1Z A; 2SEB D; 4RGT A; 4GDL B; 1KH0 A; 2LVP A; 1TY2 A; 4BKS A; 1C4A A; 2GBJ A; 4S17 A; 2WYQ A; 4W9J A; 1WMH A; 3GZN I; 2G4D B; 4NQL B; 2WXJ A; 3T9L A; 1RAX A; 2A4Z A; 4CYE A; 2BWE S; 4DXA B; 4L1B A; 1C4C A; 2UYZ B; 4WQO B; 4S0R A; 1TIF A; 2IY1 B; 2KK8 A; 1WFY A; 3RUI B; 3U7D A; 3R7R A; 1R4N B; 1SB3 C; 1HXY D; 3EFC A; 3QHT A; 1E0Z A; 1TGZ B; 3RT3 B; 3VQI A; 3MJ5 A; 3IHP C; 3Q2A C; 4KVG B; 1WXS A; 1YMH E; 1N5X A; 2BPS A; 3NY5 A; 2RMM A; 4YWG G; 1JQ4 A; 5JXV A; 5L95 C; 3JW0 X; 3QK0 A; 4OW0 A; 5BYS A; 3AEB B; 4W9C A; 3KQ4 A; 2WDR B; 2GI9 A; 2KJ6 A; 2PTL A; 5EE3 A; 3LXF A; 3Q14 C; 2J0J A; 4ANV A; 1U4A A; 1JWB D; 3A4R A; 4ZYS A; 5I4D A; 2M56 B; 1N62 A; 5AUK A; 4CO7 A; 2BS3 B; 4C7Y A; 4IG7 B; 2RDG A; 1SE9 A; 1BUI C; 1YN5 A; 2ZPN A; 4REZ A; 2DYO A; 4OVV A; 1UD7 A; 3EGR A; 1GC6 A; 1LGR A; 3LDZ E; 3A1Q A; 1TBE A; 3N20 C; 4XC2 A; 4YT0 B; 3MHZ A; 3H7P A; 3KYD D; 3W1S C; 2JY6 A; 3ZO5 B; 4AJY B; 3C19 A; 2KAJ A; 1TKY A; 3TCA A; 3P4Q B; 3TEX A; 1MHH E; 1WZ0 A; 1DYQ A; 3EC8 A; 2CR5 A; 1C4P A; 1NYR A; 2WDV B; 1UBQ A; 1DOX A; 5GMV A; 1OFF A; 1PQS A; 4HKQ A; 2Y5P A; 3U30 A; 2KTF A; 1E7U A; 1ISN A; 4BKS D; 1EF1 A; 2WDQ B; 1GPX A; 3RUL A; 1V9J A; 1XF5 L; 2K25 A; 4GGQ A; 4ZHO A; 1ZKH A; 1R4M I; 1OTR B; 3AN1 A; 4W9I A; 1B9R A; 5CHV C; 1FPY A; 3RMK C; 3CF6 E; 1WRI A; 2RPV A; 2M17 A; 3VUY A; 2MHJ A; 3DBH B; 3N30 A; 5AZH A; 2IO1 B; 2D07 B; 1V80 A; 2L3Z A; 3TL5 A; 2EEL A; 3APC A; 1VCB A; 4IC7 B; 4KSK C; 1GAQ B; 1WGY A; 3AEE B; 1S3S G; 3IVF A; 1KJT A; 2K3U A; 3ETR A; 2NBW B; 4F7Z A; 4DWF A; 3PS6 A; 2KXJ A; 2PMV A; 1J19 A; 4C4V B; 4LK0 M; 4NAW A; 1WXA A; 3AI5 A; 1WGD A; 2AYO B; 2RSU A; 1FRR A; 1MPE A; 1PGA A; 5TSS A; 2KDI A; 3MC8 A; 3GE8 C; 2WXQ A; 3IG3 A; 4ARI A; 2DAF A; 2CKH B; 2QIE B; 4RMA A; 3SU8 X; 1K50 A; 3FC4 A; 1EWY C; 2CHZ A; 3TSS A; 4NPN A; 4HK2 A; 3P1M A; 3VRB B; 2LRU A; 2MW5 A; 2CJN A; 5DPW A; 2PPH A; 1EM7 A; 4F1S A; 3AE2 B; 4TKN A; 4ZOH C; 4K1R B; 3ENE A; 2GRI A; 3GOE A; 1HA5 A; 2M19 A; 3UI3 A; 2JYE A; 5DPT A; 1D3Z A; 4EKU A; 3DVG X; 5IO9 A; 3WA0 A; 1I42 A; 1IYF A; 1V5T A; 2YEP B; 1SXT A; 1XCQ L; 4B95 A; 1QOG A; 3CWI A; 1JWA D; 1GNU A; 4HEA 1; 1WJU A; 3RNF C; 1NYQ A; 3IT4 B; 3TBL D; 1OEY A; 3PRZ A; 2IPK D; 3KUD B; 1J8C A; 1YX6 B; 3JYU A; 3L13 A; 4P7I A; 1WGR A; 3SHQ A; 2FUG 1; 2DYM A; 3EA6 A; 2LHD A; 2HTH A; 1E90 A; 1E6E B; 2X38 A; 4RF1 A; 2QIL A; 3DCG A; 3ECI A; 3KH0 A; 3UIP B; 1WX8 A; 2MWS B; 2V3N A; 1P9D U; 4J6I A; 1OGW A; 1WF9 A; 5LNK 1; 2MX2 A; 1ET9 A; 2KWU B; 3ZNG C; 3VUW A; 1UZX B; 2LD9 A; 1YQ3 B; 2NBU A; 3UQB A; 4BZA A; 3BK2 A; 4JX1 C; 2TSS A; 1XEE A; 3KW5 B; 2QCZ A; 2LAS A; 2KN4 A; 2A5U A; 4RFB A; 4HWI B; 3APD A; 4FN2 A; 1ZDV A; 4JL9 A; 2HJ8 A; 5H8Y E; 2IZV B; 2J7Q B; 2WXF A; 4EZL A; 1I7H A; 5AZF A; 1H8C A; 1KOT A; 1Q0W B; 4IM0 A; 2G9H D; 3OJ3 A; 4GDL A; 5EE9 A; 2KNB A; 4EUT A; 2VZK B; 2PVG C; 3KYC D; 3NHE B; 1HEZ E; 2GBM A; 2DLB A; 2O6V B; 2H89 B; 4A6Q A; 4BOS C; 2L32 A; 2ZNV C; 4RH6 A; 3S2A A; 4MDK E; 3BYT B; 4ZDV A; 4ZRJ A; 3KVF B; 2VH1 A; 4RNA A; 3T3N A; 2FID A; 2KJH B; 2BB6 A; 4M8M A; 2LWP A; 2ZVN A; 4KKJ A; 4ZYN A; 2OOB B; 4A8X C; 4MSM B; 2MBQ A; 4DHJ B; 1TS2 A; 3AU4 A; 2NS5 A; 2PLP A; 3ZQ4 A; 3PRE A; 1N61 A; 2LI5 A; 1UWX A; 2MRP A; 2HDE A; 4YTM B; 1SE3 A; 2R61 A; 1TS3 A; 3CMM B; 5GXG B; 4KIK B; 3PV1 A; 3NVW A; 2KO3 A; 2ZPY A; 1IUE A; 2BQQ A; 1P3Q U; 1XXG A; 3FIL A; 1KF6 B; 1KTK A; 1YN3 A; 2VRR B; 4KSL C; 2J42 A; 4MEL A; 5CHW A; 2N1W A; 5J2R A; 1WJ4 A; 2WDT B; 3E56 A; 3PGE A; 2XNA C; 1VDV A; 3PHW B; 2ASQ A; 5D3I B; 1L7Y A; 1C3T A; 1KLV A; 2QMT A; 4P1C C; 2K8B A; 1SE2 A; 5G2N A; 3RCZ A; 1T6B X; 1JWS D; 1WJ6 A; 2I1J A; 4FJV B; 3A9J B; 2INC C; 2M4N A; 2K6D B; 3LJ3 A; 3PRM B; 2DZK A; 4KV2 A; 4MGI E; 1T0Y A; 3R8B A; 2D3B A; 2OHF A; 2KWD A; 1N60 A; 4WWO A; 4W9D A; 3MC0 B; 1STE A; 2NMQ A; 2GOW A; 3FAH A; 4A20 A; 4P6V F; 4TUU A; 4US8 A; 1TS5 A; 3B9J A; 1Q10 A; 1A5R A; 2PJH A; 1PGX A; 5D3D A; 2JZ3 B; 1J7C A; 1I4Q A; 3UQA A; 1ZP0 B; 1HE8 A; 2FCM A; 1RRB A; 1FFV A; 2KMC A; 3PHX B; 2K39 A; 3BVG A; 2MBH A; 4M8N A; 4I6N B; 1NI3 A; 2INP E; 4HRO A; 1FXT B; 3DBL I; 1C76 A; 1T3Q A; 2K8C A; 1HZ5 A; 4A9A A; 3VTW A; 1LXD A; 4HLE A; 3ZJT A; 3RNC C; 1QLB B; 2WXH A; 2K22 A; 2FIF A; 4GXB A; 2PW9 A; 4XYC A; 3JVZ X; 2ZW1 A; 3ZKJ C; 2MSE D; 3TEW A; 3T8M A; 3H1U A; 3KWL A; 4C4V A; 3Q3N C; 1XLO A; 2HD5 B; 3H8H A; 4G11 A; 4HPL B; 1TTN A; 1AW7 A; 1IPG A; 3NS1 A; 1OQQ A; 2X8X X; 3QC8 B; 4HPP A; 3T3O A; 1JCK B; 2IGD A; 5IAA C; 1G6J A; 1YIW A; 1OEY J; 2PEA A; 4RGO S; 1C1Y B; 4WWN A; 4MGZ E; 3DOW A; 3BZD B; 4JWS C; 2WGS A; 2FNJ B; 3A4S C; 1UH6 A; 3L10 B; 3OLM D; 3U2S C; 4GIV A; 4J3O D; 3O13 A; 4JGH B; 3R7Q A; 4CHK A; 4USA A; 2HE7 A; 4B6W A; 3BK1 A; 4I6P A; 4K3B A; 5CHF A; 2J52 A; 4PK1 A; 4UDU C; 1EWC A; 1YOV B; 4DQO C; 2M8S A; 1WXQ A; 3ML9 A; 2EMT A; 1YJ1 A; 3B08 A; 4B9K A; 1QKZ A; 2J0K A; 3HVZ A; 3N1Y C; 1L6V A; 2WWZ A; 3L17 A; 4BBN F; 2LFI A; 3Q8A A; 1UGJ A; 1F0Z A; 4RM8 A; 2MJD A; 4WJQ A; 2KT7 A; 2B76 B; 2MQJ A; 2GB1 A; 1DOI A; 4X57 B; 2UU7 A; 4KDL B; 3Q3M C; 2XEW A; 3VVW B; 4NY0 A; 1CMX B; 3DWM A; 2K8H A; 1YNT E; 4JLC A; 2V1Y A; 1RFA A; 3OJ4 B; 4A3P A; 4LNF A; 4WQM A; 4HDO A; 2N9L A; 2V0G A; 3BWU D; 4ZRK A; 4XE0 A; 3SD5 A; 2G1E A; 5HFY A; 4LJP B; 4XGA B; 4C80 A; 2KTR B; 1JRU A; 3DBS A; 4XDC A; 2G45 B; 2D10 A; 4HKZ E; 5BMG A; 2BB5 A; 3PT2 B; 3ML8 A; 1AAR A; 1FXI A; 3BYY B; 4MJS B; 2C7M B; 1LO5 D; 1TS4 A; 3R66 C; 1TKG A; 4ASW C; 4N9F 4; 4C7Z A; 2XK5 B; 3X23 A; 4W9H A; 2D11 A; 3PVL A; 2WX0 A; 4HJK A; 1FFU A; 4MGK E; 4DBG A; 3EFU A; 1VRA B; 3W9C B; 4GU2 A; 2RPQ A; 1VR9 A; 4K81 A; 1P7F A; 2N9X A; 2B3A A; 3DVN U; 4JQW C; 1MHX A; 1MFW A; 1IGD A; 2IGG A; 3BIN A; 2ZJD A; 2KAN A; 2WXM A; 5CTR C; 4M01 A; 4W9F A; 2Z0E B; 1L0X B; 1R4N I; 3Q6B A; 4IOI E; 3AE4 B; 4CQN A; 2PKO A; 2AWT A; 1SF0 A; 2RGF A; 1E5W A; 1FCC C; 4NJ6 A; 3WAO A; 3M63 B; 3A33 B; 4IDI A; 3AM9 A; 4TMA B; 2WNM A; 2NVU I; 2ONQ A; 2BVC A; 4WWM A; 4K7S A; 1NEK B; 2L83 A; 5L83 A; 2MBE A; 4HDQ A; 5BMH A; 3W1Y A; 3EUB 2; 3Q8B A; 4N59 A; 4YTP B; 2SAK A; 4ZHP A; 1WGG A; 3AE6 B; 1YN4 A; 5IP4 D; 3K9O B; 2M0A A; 1GC7 A; 2G4S A; 2L0T A; 4MT5 A; 3IT6 B; 1D5X C; 2L05 A; 4O1N A; 2KQ7 A; 3HK0 A; 2J4X A; 5KHQ A; 2AL3 A; 3TMP B; 4NJ7 A; 1YX5 B; 1JWM D; 3R2T A; 5BYQ A; 4AS1 A; 3AUL A; 2PE9 A; 1UGM A; 3P42 A; 3APF A; 2JWZ A; 2K0P A; 3L16 A; 4FJZ A; 1XD3 B; 3VHT C; 3DVN V; 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4GN1 A; 1WMH B; 1NBF C; 3R2I A; 3W1S A; 1DOY A; 1IBX B; 1X1M A; 1WH3 A; 1V81 A; 1JW9 D; 1OQR A; 4KGT A; 5BYR A; 2KX0 A; 4FAD A; 4XWT A; 4ITK A; 4ANW A; 2KC1 A; 2VH2 A; 3AEA B; 1PUT A; 2WU5 B; 3ALB A; 4AP4 C; 1SGH A; 5JH5 C; 3PO0 A; 4WAF A; 2O2V B; 1XCT L; 1PDX A; 5HHD G; 3AE5 B; 4JWU C; 1I4H A; 3RFZ B; 2JUO A; 2DEN B; 1L2N A; 2IGH A; 1T0R C; 1WM2 A; 1E7V A; 2MH7 A; 4II2 B; 4L2Y A; 3VH3 B; 1UF0 A; 2BWF A; 1FNU A; 2V3P A; 2D3G A; 4ZRP A; 1V49 A; 2GMI C; 3DDC B; 3I5J C; 2WXO A; 1AWD A; 4DHZ E; 2HJ1 A; 2V4L A; 3AEG B; 3QAQ A; 3WAP A; 4II3 B; 2NCN A; 1ZGU B; 4MJS A; 3MC9 A; 2KLG A; 2D2Q A; 3RD2 A; 1F77 A; 3M62 B; 3BII D; 1TY0 A; 1P98 A; 4NAM A; 4DDG D; 2XK5 A; 4EOY A; 2JU6 X; 2W9N A; 3H9D A; 3AV8 A; 3A1Q B; 1QZE A; 4RF0 A; 2LJI A; 3NJT A; 1CJE A; 3I57 A; 2KDM A; 4G0N B; 4EEW A; 1D5M C; 3NRZ A; 1NEN B; 4RM9 A; 3H7P B; 3W5V B; 1ESF A; 2N9K A; 1XQQ A; 4OVU A; 1M4V A; 2DWQ A; 4IUM B; 2JVC A; 2IO0 B; 1LM8 B; 2CJO A; 1GOZ A; 1CQV A; 1RLF A; 2DHZ A; 4BFR A; 1RWS A; 2DBY A; 1UEL A; 4WH4 A; 4K3C A; 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