The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
TTYKLILNLKQAKEEAIKEAVDAGTAEKYFKLIANAKTVEGVWTYKDEIKTFTVTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
From the Cover: A minimal sequence code for switching protein structure and function.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
DESIGNED PROTEIN
|
| molecule tags |
Igg binding protein
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| total genus |
12
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-01-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KQ4 X; 1PGA A; 4KGR A; 2K0P A; 3FIL B; 2ONQ A; 2J53 A; 2KDM A; 5HFY A; 4HJG E; 2PLP A; 5BMI A; 4HKZ E; 1K53 A; 1FCC C; 4D2K A; 1K52 A; 2J52 A; 2LHE A; 2QMT A; 2OED A; 4OZC A; 2GI9 A; 2QSD A; 1P7F A; 5BMG A; 2JU6 X; 2RMM A; 1IGC A; 2N7J A; 1GB4 A; 1MPE A; 1HEZ E; 4KGT A; 1D4B A; 1MHH E; 4GLS C; 2IGH A; 2PW9 A; 1PGB A; 4WH4 A; 2ON8 A; 2EEL A; 1IBX A; 2PTL A; 4OZB A; 1F2R I; 2JZP A; 5HG2 A; 2JWU A; 4MAC A; 1MVK A; 3UI3 A; 3FIL A; 5BMH A; 1JML A; 2IGG A; 1XCQ L; 2RPV A; 1YNT E; 5HI1 A; 2LUM A; 1IGD A; 2ZW1 A; 1MI0 A; 2N9L A; 1XF5 L; 3MP9 A; 1K50 A; 5HHD G; 1YMH E; 2JXT A; 2KN4 A; 2I38 A; 2JSV X; 3V3X A; 1HZ6 A; 1P7E A; 4KGS A; 1C9F A; 1ZXH A; 1QKZ A; 1UWX A; 4IOI E; 2NMQ A; 1PGX A; 2N9K A; 1MHX A; 2I2Y A; 1EM7 A; 2GB1 A; 4IKG A; 1FD6 A; 2IGD A; 2LHD A; 2KAC A; 1XCT L; 2ZW0 A; 1F2R C; 1HZ5 A; 1GB1 A; 1FCL A; 4OZA A; 1K51 A; 2LGI A; 3GB1 A; 2KWD A; 5JXV A; 1IBX B; 1Q10 A; 1KH0 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1WJ6 A; 2CHZ A; 2J0J A; 3N32 A; 1TS5 A; 2QIE B; 2WQY B; 3I9V 1; 4RF0 A; 3CST A; 2G3Q B; 4MH0 E; 4NJ7 A; 4D2K A; 1A70 A; 1ZGU B; 5LXH A; 2KWC A; 2W82 A; 3R8B A; 4MGI E; 4OZC A; 2GI9 A; 3WAN A; 2ZNV B; 3Q6B A; 2H88 B; 2MP2 B; 1L5P A; 3PLV A; 1VR9 A; 3KWV A; 4BBN F; 3ETR A; 1HEZ E; 1V86 A; 5E6J A; 3CIR B; 1JWM D; 4CQN A; 3DBL I; 3ZNI D; 2KTR B; 1FFV A; 3B2F A; 1KF6 B; 2HJ8 A; 2DAF A; 2KN5 A; 3L54 A; 2V1Y A; 1P1A A; 2NPT B; 3HVZ A; 1XF5 L; 5HHD G; 2NBW B; 3VQI A; 1JAL A; 5EE9 A; 4DWF A; 3PRP B; 5EE3 A; 3BZD B; 3JSV B; 4W9F A; 1AW7 A; 3O13 A; 4F1S A; 4W9G A; 3UIN B; 2BYF A; 1SSN A; 4K81 A; 2LUE A; 4NAM A; 4LJO B; 4JL9 A; 3X0W A; 4WJN A; 4MH8 A; 4US9 A; 4JQW C; 2L00 B; 4ZYN A; 4HDO A; 5JXV A; 1SEB D; 3V60 A; 4NAW B; 3WA0 A; 2AWT A; 3NJT A; 3NZU A; 1E8W A; 2J53 A; 2WGS A; 1TY0 A; 5AZF A; 2MBH A; 3Q3J A; 1K53 A; 1BXT A; 3B08 A; 2DZM A; 4DHZ B; 3JSV A; 4NNJ B; 3B9J A; 1WJU A; 5AZG A; 2D3C A; 3RNF C; 2H89 B; 3R3M A; 1WRI A; 2FCM A; 1JWS D; 4KKJ A; 2LGY A; 3DBL B; 1P7F A; 4FJY A; 2QCZ A; 1WXA A; 2KK8 A; 4G11 A; 5D6J B; 3T9L A; 3PV1 A; 2DYB A; 2IDY A; 4MEL A; 3MC9 A; 4TSS A; 5T8I A; 2WNM A; 3U4E G; 3IFW B; 1XO3 A; 1C4C A; 2PTL A; 3BK2 A; 5L95 C; 2JZP A; 3PGE A; 5CHW A; 1VCB A; 4YT0 B; 1XT9 B; 4WAA A; 4ARC A; 1YNT E; 3UQA A; 4ITK A; 4L23 A; 2BS4 B; 1E10 A; 1HXY D; 5J2R A; 2ZPY A; 2JZ3 B; 1FNW A; 2K1F A; 1I7H A; 1EF1 A; 2WXK A; 5D3D A; 1N61 A; 2FCS A; 3PHW B; 1YQB A; 2MQJ A; 4K1R B; 2RDB C; 1MHX A; 4ICU A; 4BKS A; 4EE2 A; 3L10 B; 1C78 A; 1EF5 A; 1JCK B; 2PIA A; 3VR9 B; 1ISN A; 3U8Z A; 4BFR A; 4BOZ B; 1D6E C; 2ZJD A; 3N20 C; 1GC6 A; 1KTK A; 1MJD A; 2QJL A; 4C4V B; 2M1M A; 2FUG 1; 2KMC A; 1ZDV A; 3PZ8 A; 4KVG B; 3Q14 C; 1FRD A; 3P4P B; 5BMI A; 4HKQ A; 4DXF A; 4FN2 A; 2JX5 A; 4BKS D; 3RPF C; 3TJP A; 3IBE A; 3ML9 A; 3P42 A; 2CJO A; 4N59 A; 3VR8 B; 5BYQ A; 1OTR B; 2BF8 B; 1MPE A; 1WE7 A; 2G9H D; 4ZHP A; 4A8X C; 3AI5 A; 4MGK E; 4DXA B; 1RFA A; 3Q8C A; 1V81 A; 1VZ8 A; 1XEE A; 4W9K A; 2R61 A; 2MRP A; 4C4V A; 3QK0 A; 2HD5 B; 3RYT A; 3PPA A; 4HEA 1; 1MVK A; 2L83 A; 2GRI A; 4MSQ B; 1HTO A; 3IAM 1; 2IGG A; 2J0M A; 4AUQ C; 4MSM B; 4FUL A; 4ICV A; 1LGR A; 4FBJ B; 1UH6 A; 3MP9 A; 4GU2 A; 4LNK A; 1N5X A; 2GBK A; 3KH0 A; 1V9J A; 4DK5 A; 4LNN A; 1ZXH A; 2CS4 A; 1DGJ A; 3AED B; 1E7P B; 2YLM A; 2NMQ A; 3P4Q B; 3KQ4 A; 1YN5 A; 1T0R C; 2JF5 A; 3ZDM C; 4TQ0 A; 3A33 B; 2LVQ A; 5LLI A; 2K6D B; 3C0R B; 1FO4 A; 3S2A A; 2ZCC A; 4JPS A; 3VUX A; 2NVU I; 1YOV B; 1UBQ A; 2L8J A; 4W9C A; 5HKH A; 1C77 A; 4WWO A; 4XC2 A; 3RZF A; 4ANV A; 1UBI A; 3Q3F A; 3QC8 B; 5C2T B; 3FIL B; 2JPH A; 4US8 A; 1NI3 A; 3HUI A; 2JQR B; 2WP9 B; 2DWQ A; 1AWD A; 2IZV B; 5IO9 A; 1I35 A; 1RAX A; 1B9R A; 2DNF A; 3AH7 A; 1KRH A; 5BMG A; 4XGA B; 1QT9 A; 2LJ5 A; 4AQ7 A; 2M8S A; 3NHE B; 2K25 A; 2WXN A; 1ZOY B; 1UD7 A; 3R66 C; 3SEB A; 3V61 A; 5G2N A; 4ANU A; 3TEW A; 2AX5 A; 1KLG D; 3AXC A; 4XDC A; 3A4S C; 2J0K A; 2KLC A; 1V1O A; 2JWU A; 2L1A A; 4J6I A; 3TEX A; 3FIL A; 4EZK A; 5C23 A; 3H1U A; 3SR6 A; 2PKO A; 2E3T A; 1HTQ A; 2LUM A; 1PUT A; 3UGB B; 4JX1 C; 2OOB B; 2D2Q A; 2KJR A; 1YMH E; 3E9S A; 2I38 A; 5DPT A; 3AMZ A; 3AE6 B; 2KNB A; 4KGS A; 3L08 A; 1UWX A; 4P6V F; 2O2V A; 4LTU A; 1J7B A; 3WCQ A; 2AQ1 B; 2KZR A; 3BYY B; 2ICI A; 1XCT L; 4EZJ A; 5E6P A; 4LDT B; 2LXA A; 4FA6 A; 1WX8 A; 3M63 B; 3QX1 A; 1C4P A; 4A3P A; 2CU1 A; 1H8C A; 1WH3 A; 3H7P A; 2WXF A; 3LXF A; 3ABV B; 3GP7 A; 1FRR A; 4N9F 4; 2ONQ A; 3TEZ A; 1XXG A; 4HJG E; 1L6U A; 4UDU C; 5H92 C; 1SE2 A; 3ZGZ A; 4RGN A; 1H4R A; 2Z0E B; 2PJH A; 2AYO B; 4A90 A; 3WAM A; 3KUC B; 2N7J A; 3PRM B; 3VDZ A; 4A6Q A; 1RYJ A; 2RR9 A; 2D10 A; 2PE6 B; 4GMV A; 3A4R A; 3NVV A; 2XK5 A; 3URY A; 4EKU A; 2CHW A; 1TY2 A; 2QC8 A; 2ZEQ A; 3FC4 A; 4O1N A; 2JRH A; 1WJN A; 2MJD A; 1RM6 C; 1QOG A; 5DPS A; 1C76 A; 2WYQ A; 1MI0 A; 3K9O B; 4B6W A; 2XBB C; 1TS3 A; 4IWQ A; 4LDT D; 2JSV X; 3V3X A; 2KQ7 A; 4C7Y A; 4WQM A; 1GPX A; 2N9P C; 4CYE A; 2FID A; 3ZXV A; 4W9J A; 3DPD A; 3C19 A; 2DZI A; 2AL3 A; 2C5L C; 4IDI A; 1JRU A; 3BVG A; 1R4M B; 1NEN B; 2BKR B; 2I2Y A; 2ZNV C; 3I63 C; 1MG4 A; 3A9K A; 1L2N A; 3Q8B A; 1WGR A; 3I5J C; 4K3B A; 1WXV A; 1WZ0 A; 3RCZ A; 1FCL A; 3VTW A; 3MTN B; 1TZO A; 2LGI A; 2V4L A; 3GB1 A; 4LLG M; 3BYT B; 2GOW A; 2MBB B; 2CHX A; 4G50 A; 3VRA B; 3DQV A; 2IND C; 3PO0 A; 5MPO A; 4P1C C; 2D11 A; 3RI7 C; 5HFY A; 2WDV B; 1EWC A; 2ACZ B; 4HVB A; 2BYV E; 5JH5 C; 2D3B A; 3Q69 A; 5D94 A; 2BB6 A; 2KLG A; 3A9J B; 4L1B A; 2G1E A; 5GMV A; 1NEK B; 3WAP A; 2WXI A; 1ZE3 D; 4IC7 B; 4EEW A; 2BW2 A; 3L4P A; 1SIF A; 3VTU A; 1QLB B; 3R7Q A; 2C7N B; 1TKY A; 1IYF A; 2LZ6 A; 1L0Y B; 3SHQ A; 1JRP A; 2NCN A; 4C7Z A; 2WXQ A; 2VRR B; 4GB9 A; 3OJ4 B; 2B3A A; 1E8X A; 2M17 A; 2W54 A; 2ON8 A; 4IW0 A; 3RNG C; 2BPS A; 1LO5 D; 2G4D B; 2KC1 A; 1VRA B; 3VVW B; 4ZYS A; 2LEK A; 1XLP A; 2O6V B; 4BKT A; 3CSF A; 1LXD A; 1N62 A; 2N0S B; 3N3K B; 1WM3 A; 1IGD A; 3GS2 A; 2K8C A; 2KDE B; 4JIO U; 4BZA A; 3A9J A; 2JYT A; 2KC2 A; 4HCP B; 1C1Y B; 4N58 A; 1E8Z A; 4EFO A; 3GE8 C; 4H2A A; 1OQR A; 1XQQ A; 3ZJU A; 2M0X A; 1ET9 A; 1HZ6 A; 1YX6 B; 1C3T A; 5LXI B; 1K8R B; 2JXX A; 4NY0 A; 2KVZ A; 4HRO A; 1C4A A; 1YQ4 B; 2JT4 B; 4W9E A; 3PT2 B; 1NVI D; 2IGD A; 2LHD A; 3TSS A; 2V0G A; 4NZL B; 2KTF A; 1XLO A; 3AB5 A; 2KHW B; 2O6V A; 1YJI A; 1WJ4 A; 4X57 B; 2TSS A; 2MWS B; 1QOF A; 2N7D A; 3V6E B; 1QZE A; 2OJW A; 1Q10 A; 3LJ3 A; 1KH0 A; 2Y5B B; 2WDR B; 2LRU A; 3RNC C; 3Q8A A; 3TIX A; 2AL6 A; 3VH4 B; 2K22 A; 2VZK B; 4S17 A; 4WWN A; 2BWE S; 1ESF A; 1FCC C; 3B2G A; 1B1Z A; 1JW9 D; 1KM7 A; 1LM8 B; 2FCN A; 2LVO A; 3CF6 E; 3ZW3 A; 4KV2 A; 4LNI A; 3NRZ A; 4GN1 A; 1I4R A; 4IWO A; 5IP4 D; 1UGM A; 2KD0 A; 1MHH E; 3RUL A; 2XEW A; 1WE6 A; 4PK1 A; 3BIN A; 1JWU D; 2W3R A; 4TQ1 A; 4RH6 A; 4KSK C; 3N30 A; 3UI3 A; 1TIF A; 3DVG Y; 2IBI B; 2KMA A; 1NBF C; 3IT6 B; 2PPH A; 2K9X A; 2EMT A; 2KAJ A; 2NS5 A; 3AEF B; 1E6E B; 4OHJ A; 1BML C; 2IO2 B; 2K8B A; 4OVU A; 3UF8 A; 5J17 A; 1E9M A; 2IO3 B; 3M95 A; 1TKG A; 3LYY A; 2D07 B; 3APF A; 3QQ8 B; 2R2Q A; 1T0Y A; 2JYE A; 1DOY A; 1AAR A; 1WGD A; 2WXJ A; 2N9E B; 5CHF A; 2EMS A; 3MHZ A; 3APC A; 4XX5 A; 4PS3 A; 3TMP B; 4IM2 A; 4FHJ A; 5D3I B; 1EU4 A; 1EM7 A; 1I4H A; 1FD6 A; 3ZLZ A; 3WIM A; 3AU4 A; 4IG7 B; 2VZK D; 2ZW0 A; 1HZ5 A; 3RT3 B; 2K5P A; 1TBE A; 4XDD A; 1SJE D; 2SEB D; 5CTR C; 1K51 A; 1GG3 A; 3CWI A; 1Y8R C; 2INN E; 3ZNG C; 2ZZP B; 1PDX A; 3OG5 A; 3KVF B; 4G0N B; 1DYQ A; 2FIF A; 4C56 C; 1F52 A; 2BYT A; 1D3Z A; 3MFG A; 1K52 A; 3SD5 A; 1FPY A; 2WX1 A; 4WQO B; 3DCG A; 2WX0 A; 2BKF A; 3PRE A; 5IKC M; 5AZH A; 2M19 A; 4IWP A; 3PVL A; 4WUR A; 1BUI C; 4K7S A; 3RZW C; 5I4D A; 3VUW A; 4LNO A; 3JW0 X; 4MM3 B; 4HWI B; 2V9H A; 1WRD B; 1T5X D; 2KO3 A; 4YL8 A; 3NZ3 A; 3TBL D; 3UIP B; 2WXG A; 3ZIM A; 1MFW A; 1X1M A; 3VRB B; 3AE9 B; 5FR6 A; 3AEC B; 4HK2 A; 1FEH A; 3EUB 2; 3L17 A; 4HLE A; 5JZE B; 2K6Q A; 2Y5C A; 2DZK A; 3X23 A; 1Q1O A; 4MJS B; 4DXG A; 5HI1 A; 2Q5W D; 2X8X X; 1JRO A; 1RFK A; 3P4R B; 4ARI A; 3ZQ4 A; 2WS3 B; 3RD2 A; 4B9K A; 2HE7 A; 2INC C; 4JE3 B; 1I4X A; 4MM3 A; 1J19 A; 3TUO A; 3N1Z C; 2N1V A; 4ZRI A; 4WJO A; 4OVV A; 3K9P B; 2C9W B; 1PGX A; 2DYO A; 3D32 A; 1FFU A; 2DX5 B; 2GBJ A; 1V1P B; 2PMV A; 3WAL A; 5L83 A; 1DOI A; 4HDQ A; 1WR6 E; 4HJK A; 2KAC A; 2KJH B; 5DPR A; 4WIP A; 4B0M A; 3EGR A; 4ASW C; 1ZXI A; 2D3A A; 4MJS A; 2WDT B; 1IPG A; 1IBX B; 3AE5 B; 2WDQ B; 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