The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
TTYKLILNLKQAKEEAIKEAVDAGTAEKYFKLIANAKTVEGVWTYKDEIKTFTVTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
From the Cover: A minimal sequence code for switching protein structure and function.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
DESIGNED PROTEIN
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| molecule tags |
Igg binding protein
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| total genus |
12
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-01-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KAC A; 2KDM A; 2IGG A; 5HHD G; 1K51 A; 1HZ5 A; 5BMG A; 4WH4 A; 2RPV A; 4D2K A; 2JXT A; 1HEZ E; 4OZC A; 2JZP A; 1F2R C; 1K50 A; 5HI1 A; 2GI9 A; 2N9K A; 2GB1 A; 5HG2 A; 3UI3 A; 1EM7 A; 2JWU A; 1C9F A; 2QSD A; 2K0P A; 1FCL A; 4OZA A; 1PGX A; 1K52 A; 1FD6 A; 2ZW0 A; 4OZB A; 1XCQ L; 2OED A; 2N9L A; 2I2Y A; 1FCC C; 1MHX A; 3MP9 A; 4IKG A; 2J52 A; 2IGH A; 2J53 A; 2LUM A; 2LHE A; 1MI0 A; 3FIL B; 1XF5 L; 4IOI E; 4MAC A; 1IBX B; 2JU6 X; 4KGR A; 2LHD A; 2ON8 A; 2KWD A; 4KGS A; 2PTL A; 1YNT E; 1ZXH A; 5JXV A; 2ZW1 A; 1PGB A; 1MHH E; 2N7J A; 1GB4 A; 1XCT L; 1JML A; 4HKZ E; 2KN4 A; 1HZ6 A; 1IGC A; 1P7E A; 2PW9 A; 1Q10 A; 4HJG E; 1K53 A; 1MVK A; 3FIL A; 1F2R I; 5HFY A; 1IBX A; 2LGI A; 1UWX A; 2IGD A; 2RMM A; 2NMQ A; 1QKZ A; 2EEL A; 1IGD A; 1P7F A; 1MPE A; 2KQ4 X; 4KGT A; 5BMI A; 1D4B A; 2ONQ A; 4GLS C; 1KH0 A; 1PGA A; 2QMT A; 2JSV X; 5BMH A; 2I38 A; 1YMH E; 3GB1 A; 3V3X A; 2PLP A; 1GB1 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4ARC A; 1OTR B; 4KDI C; 1S1Q B; 2KDM A; 1SSN A; 5LXI B; 4LDT B; 1WF9 A; 2L0F A; 3VAW A; 3AN1 A; 4REZ A; 1RFA A; 4C4V A; 4RF1 A; 2LD9 A; 5JH5 C; 4KIK A; 1SE9 A; 2QSD A; 1TBE A; 2LAS A; 2TSS A; 2NTS A; 3ML8 A; 3NY5 A; 4F1S A; 3KW5 B; 2ZZP B; 1VD2 A; 3HK0 A; 4YTM B; 1CK1 A; 2I2Y A; 4A55 A; 1E5W A; 5D7G A; 4NQK E; 2X8X X; 3NZ3 A; 2CU1 A; 2V3P A; 1WXV A; 3A1Q B; 4W9J A; 4KVG B; 3NRZ A; 2SEB D; 4KGR A; 2C5L C; 3TJP A; 2PPH A; 4OVZ A; 3BYY B; 1YJ1 A; 1H4R A; 4IM3 A; 2BVC A; 1UF0 A; 2WU5 B; 3N1X C; 4RNA A; 3MHZ A; 4ZHO A; 4W9D A; 1XD3 B; 3MHS D; 2AQ1 B; 3QQ8 B; 3ZNI D; 3V60 A; 3CSF A; 2MH7 A; 3PLU A; 3UF8 A; 2KDF B; 2W55 A; 2GBJ A; 3GE3 C; 4NJ6 A; 1AN8 A; 2KAN A; 3A33 B; 4AOF A; 1QKZ A; 3V61 A; 1L2N A; 5DCN A; 2KTR A; 1N63 A; 5KHO A; 2WXH A; 2G45 B; 2L1A A; 2UU7 A; 1UEL A; 3AMZ A; 1DYQ A; 5DPT A; 3LJ3 A; 2KX0 A; 1L0X B; 1L4D B; 3PPA A; 2BS4 B; 2PVO D; 5IOI A; 3NVZ A; 2EKI A; 1FXI A; 2V3N A; 1GUA B; 1FXA A; 2DBY A; 3BY4 B; 2ZJD A; 4D2K A; 1FEH A; 1ZDX A; 3W1S C; 4BVU C; 1ZKH A; 5HKH A; 2KTR B; 1E8Z A; 3IHP C; 1FCL A; 2RDG A; 4MM3 A; 2VZK D; 5FK9 C; 3NUH B; 1HE8 A; 2WXG A; 1AAR A; 2OED A; 1T0Q C; 2AQ3 B; 1FCC C; 2IDY A; 3UIP B; 1WJU A; 2ZNV C; 4LCD E; 2JU6 X; 1L4Z B; 4GDL A; 3X0W A; 3DVN V; 2J0J A; 1ZE3 D; 3A9K A; 3I5J C; 4JWS C; 3R7Q A; 2MWS B; 3BIN A; 1XCT L; 2K9X A; 2DZK A; 2WDR B; 2EKE C; 3X23 A; 2FBW B; 4WJO A; 4FA6 A; 3EEC A; 2KFJ A; 2KN4 A; 3Q8A A; 1V1P A; 3H7P A; 3MC9 A; 2BKF A; 2KN5 A; 2Z8L A; 1R4N I; 5AZG A; 1QF6 A; 3PSE B; 2KJ6 A; 3T8M A; 3PLV A; 1GPX A; 1UWX A; 2JUO A; 2CHW A; 2IGD A; 5E6P A; 2Y3A A; 2IYD B; 2R61 A; 3A4R A; 3AE1 B; 1C3T A; 2KLG A; 3EFC A; 1T0S C; 3RNB C; 2PMV A; 1PGA A; 3DWG C; 1DOY A; 2K8H A; 2PLP A; 2Z0D B; 4KKJ A; 1YD8 U; 3KUD B; 2Y5P A; 2M0A A; 1V49 A; 4HPM B; 3BK1 A; 1HZ5 A; 3MTN B; 2D07 B; 2L76 A; 4OZC A; 1SGH A; 2WXF A; 2N9K A; 2GB1 A; 1R4N B; 4MGZ E; 1TYG B; 1WGR A; 2HTH A; 1NVI D; 2AEH A; 3ZRC A; 4MH0 E; 4M0W B; 4L1B A; 2KDB A; 2KK8 A; 3ZKJ C; 3VUW A; 1SE4 A; 1M94 A; 4OZB A; 2KFK A; 1MHX A; 2YEP B; 4KZ0 A; 2LUM A; 4WWN A; 1WY8 A; 1T0R C; 1V2Y A; 4IC7 B; 4K7U A; 2IO3 B; 1IPG A; 2M8S A; 4LNI A; 3AE6 B; 2LRU A; 2PVG C; 1EF1 A; 3IXS A; 1C1Y B; 2YEP F; 3EC8 A; 2AX5 A; 4JGH B; 4EKU A; 2M4N A; 3UQB A; 2R2O A; 2KWV B; 1FRR A; 3VR8 B; 4HRS A; 4XC2 A; 4HPP A; 1JML A; 2WXK A; 4NZL B; 2XEW A; 3BII D; 2JRH A; 1UGJ A; 4BOZ B; 1HZ6 A; 2LUE A; 1JRU A; 3NS1 A; 4MGY E; 1PQS A; 3L13 A; 2MBB B; 2DNF A; 1XXG A; 2WDT B; 2G4D B; 3OJ3 A; 1V5O A; 3VUX A; 3DBL B; 2WX0 A; 1K53 A; 3JSV B; 4XDD A; 3HIZ A; 1WM2 A; 4GSW A; 5HFY A; 2LGS A; 1P0R A; 2RMM A; 3HHM A; 2WWZ A; 2GLS A; 5GXG B; 3PVL A; 1MPE A; 2J4X A; 4KKI A; 3M63 B; 4DDG D; 1SE2 A; 5D2M B; 2D3G A; 4DHJ B; 2JSV X; 2I38 A; 2L32 A; 4S0R A; 3H9D A; 2K1F A; 3DOW A; 1UD7 A; 4W9G A; 3OWE B; 3V6E B; 2KVR A; 1RRB A; 3DWM A; 3TEW A; 3RCZ A; 3ECI A; 3J9C A; 5JHA A; 2KNB A; 5MPO A; 5HG2 A; 3UI3 A; 3IAS 1; 1WX7 A; 4FBJ B; 3TSS A; 3RT3 B; 4BKS A; 3ZRF A; 2HJ8 A; 2N7E A; 3KYC D; 4WQM A; 2KWU B; 4DDI D; 2QC8 A; 3P4Q B; 3L17 A; 1N5X A; 5GMV A; 3B2F A; 2A4Z A; 2ZCC A; 2KC1 A; 2JYT A; 3VH3 B; 3VDZ A; 2W82 A; 5TSS A; 2KWD A; 1YQ4 B; 4KSL C; 1SE3 A; 1KLU D; 3Q3O C; 1MFW A; 4GB9 A; 3M62 B; 2KAJ A; 3JVZ X; 3T3N A; 3PHX B; 1Q5W B; 2BGF A; 1TY0 A; 3U2S C; 3R2I A; 1ENF A; 2PE9 A; 1Q1O A; 1L6U A; 3AE4 B; 2J7Q B; 4GDK A; 4DBG A; 4YL8 A; 2O6V D; 1BUI C; 2WXJ A; 2KJR A; 2RDH A; 5D6J B; 4RGM A; 1NYR A; 3W1S A; 2NBU A; 1J0G A; 2KZR A; 2PW9 A; 1LM8 B; 2WP9 B; 4A90 A; 4RM8 A; 2EEL A; 1WGY A; 4E74 A; 1NBF C; 1F0Z A; 3I63 C; 3U7D A; 3ZNH B; 2JZ3 B; 4YSX B; 2AWT A; 3DHH C; 4W9F A; 3GB1 A; 1EU4 A; 3PV1 A; 4XZ4 A; 4LTU A; 3V3X A; 2I1K A; 4HK2 A; 2KMM A; 2OHF A; 3U8Z A; 2K8C A; 2L7R A; 4X57 B; 3VTW A; 2H89 B; 3E9S A; 2V3S A; 1KRH A; 2JXT A; 3KVF B; 4XX5 A; 1E8X A; 1ISN A; 4CYE A; 1MJD A; 4J3O D; 2R2Q A; 2ICI A; 4R3D A; 1PGX A; 1D5M C; 1SF0 A; 1WR6 E; 3KUC B; 4BBN F; 1D5Z C; 3MP9 A; 4RM9 A; 4YTN B; 1AYF A; 1WXQ A; 3U52 E; 4A8X C; 3TBL D; 4M01 A; 2L52 A; 1E9M A; 4P6V F; 4BOS C; 2IND C; 2W54 A; 1YX5 B; 2BTE A; 1TKY A; 3ABV B; 3R3M A; 4M00 A; 2V0G A; 3ZDM C; 1FO4 A; 2QDF A; 3ENE A; 4BFR A; 4MEL A; 3L54 A; 2QCZ A; 3MC0 B; 2G1E A; 2YLM A; 3I9V 1; 2LGX A; 3U30 A; 4C80 A; 1DOX A; 1L7Y A; 2LMC A; 1IBX A; 3KQ4 A; 2LGI A; 2WYQ A; 1V8C A; 4FLH A; 3SHQ A; 1SJE D; 3EUB 2; 3OG5 A; 2H88 B; 2CHX A; 4AWJ A; 3ZJT A; 2QMT A; 3RNE C; 4UDU C; 2KDI A; 2IY1 B; 2BT6 A; 2DAJ A; 4URK A; 2MSE D; 2N4F A; 3KH0 A; 2MLB A; 3W2D A; 4LDT D; 1ACC A; 2JZZ A; 3TEX A; 1FNU A; 4WH4 A; 4ZYS A; 3NJT A; 2K6D B; 2JWU A; 4N6E B; 5EE1 A; 2N0S B; 2D3A A; 3SEB A; 4XDC A; 2WU2 B; 3EA6 A; 4OVV A; 4AP4 C; 2V4L A; 3PS6 A; 4FHJ A; 3VQI A; 1L0Y B; 3SDL C; 2J52 A; 1I4X A; 2J53 A; 2MBQ A; 3IBE A; 3U4E G; 3FIL B; 3RI7 C; 5E6J A; 2FCM A; 1GOZ A; 1YN4 A; 2WXM A; 2L0T A; 5AEK B; 2M0X A; 1VLB A; 2L00 B; 3PT2 B; 1Y56 A; 5LXH A; 2BB5 A; 3VR9 B; 3TMP B; 2ZPN A; 2K39 A; 4XGA B; 1QT9 A; 4MEM A; 4K7S A; 3IG3 A; 4K81 A; 4AS1 A; 1ZOY B; 1SXT A; 4C4V B; 2KMC A; 4KIK B; 4G0N B; 1NI2 A; 2WXI A; 4US9 A; 1S3S G; 2YVC A; 1SIF A; 5CHV C; 1ZDV A; 3ZLZ A; 5IN7 A; 2L05 A; 3AU5 A; 4AUQ C; 1WH3 A; 5BMI A; 1WZ0 A; 1MG8 A; 5T8I A; 3C19 A; 3URY A; 1WIA A; 2WDQ B; 3W1Y A; 5H8Y E; 2KC2 A; 4HPL B; 2IGG A; 5HHD G; 4XWT A; 5FR6 A; 2D2Q A; 2BB6 A; 1I4R A; 1P1A A; 2LVO A; 2B3A A; 1F2R C; 2HE7 A; 3H1U A; 2IY0 B; 1C9F A; 3OAW A; 3BVM A; 4JLC A; 4KV2 A; 3AH7 A; 4WJN A; 3R7R A; 4RGT A; 2KLC A; 1WSP A; 3H8H A; 5EE3 A; 2D11 A; 4IKG A; 4W9H A; 4DK5 A; 2LHE A; 1KTK A; 4KZC A; 1EWY C; 4N9F 4; 4PT5 A; 5IKC M; 4W9L A; 2HD5 B; 3HM3 A; 5AUK A; 1QOB A; 2GOW A; 5LLI A; 2PTL A; 1WGH A; 1JWM D; 4DXF A; 1E10 A; 1PGB A; 4FN2 A; 1QIL A; 5DPW A; 2MA9 B; 2N7J A; 3BWU D; 2K22 A; 4IWO A; 3ZJV A; 3KYD D; 2MX2 A; 1RFK A; 2JX5 A; 2LJI A; 2MJ3 A; 5E6N A; 2LGY A; 3A9J A; 1IYF A; 1AWD A; 1I4P A; 1P7E A; 2KVZ A; 3RYT A; 1QLB B; 2IZV B; 2V1Y A; 4HJG E; 5BYR A; 2Y5C A; 3H7S A; 4PYU A; 1KM7 A; 3ZUN A; 2WXQ A; 4BBN C; 2D10 A; 4YT0 B; 3AV8 A; 1TJE A; 4MM3 B; 2IJ0 A; 3RMK C; 2SAK A; 3N9Y C; 2DYB A; 3AE2 B; 4ZHP A; 3DDC B; 2NPT A; 4GLS C; 2N9E B; 4EEW A; 2MEK A; 4NJC A; 2BWE S; 2C7N B; 2JXX A; 4HCN B; 4DHZ E; 3A9J B; 4WIP A; 2JY6 A; 2MJD A; 3D32 A; 4M8N A; 1JW9 D; 2KYW A; 4GDL B; 4A9A A; 1WJ4 A; 2M56 B; 2ZPY A; 1V9J A; 3L16 A; 3N1Y C; 1QOA A; 1TS5 A; 2WLB A; 3A9K B; 2W3R A; 2JZP A; 4MSM B; 3UQA A; 2BYT A; 3ALB A; 3MJW A; 1VR9 A; 2JRI B; 2XK5 A; 1EO6 A; 2ASQ A; 5FR3 A; 2KMA A; 1V1P B; 3H7P B; 1OEY A; 1V86 A; 3Q3N C; 1KOT A; 1B9R A; 2W9N A; 2KWC A; 3SFE B; 1RWS A; 2N9P C; 5G55 A; 1I7H A; 3BVG A; 1KJT A; 1N62 A; 3IFW B; 5KHQ A; 2JT4 B; 3Q8E A; 2INC C; 4G50 A; 4RGO S; 1NDD A; 2MCN B; 2N1W A; 2A5U A; 1E8Y A; 1OQQ A; 2FUG 1; 1ZXH A; 4O1N A; 3Q3J A; 2WXN A; 2KTF A; 1E7U A; 4J6I A; 3DHI C; 3DBL I; 3DBR I; 4DXA B; 3L0W B; 2D5G A; 4ZYN A; 4XWW A; 4BKT A; 4DWF A; 2G9H D; 1FIQ A; 3SU8 X; 2FAZ A; 4HKZ E; 1N61 A; 1E90 A; 4HDQ A; 1YQ3 B; 3VH4 B; 5C1Z A; 3DCG A; 2GBR A; 3GP7 A; 1I4G A; 3VXW A; 1V1O A; 3O13 A; 1KFY B; 3N32 A; 5C23 A; 4KSK C; 1ROE A; 2WXO A; 2ZVO A; 1VZ7 A; 4TQ0 A; 4L23 A; 1J19 A; 5JHB A; 1XO3 A; 3AEE B; 4FJZ A; 1TT5 B; 4DHZ B; 4OHJ A; 4YSZ B; 1DGJ A; 1TKG A; 4KGT A; 2DYM A; 1YOV B; 2CJN A; 2RPQ A; 2KFK B; 2ONQ A; 1LQB A; 4DHJ D; 2MBE A; 1ESF A; 2NCN A; 4FHK A; 3WIM A; 4ANW A; 5FKA C; 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