The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
TTYKLILNLKQAKEEAIKEAVDAGTAEKYFKLIANAKTVEGVWTYKDEIKTFTVTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
From the Cover: A minimal sequence code for switching protein structure and function.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
DESIGNED PROTEIN
|
| molecule tags |
Igg binding protein
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| total genus |
12
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-01-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1FD6 A; 1QKZ A; 4OZB A; 2JWU A; 1JML A; 1GB4 A; 2I2Y A; 2I38 A; 4OZA A; 1HZ6 A; 2EEL A; 4HJG E; 5BMI A; 3MP9 A; 2LHE A; 2JU6 X; 2K0P A; 2LGI A; 2IGH A; 2PTL A; 1FCL A; 5BMG A; 2GB1 A; 5HHD G; 1K52 A; 2LUM A; 1XF5 L; 2JXT A; 1C9F A; 2J53 A; 2PLP A; 1D4B A; 1MHX A; 2RPV A; 4KGR A; 4KGT A; 2N9L A; 1XCQ L; 2GI9 A; 4D2K A; 1Q10 A; 4IKG A; 1MI0 A; 1P7E A; 1PGX A; 2OED A; 3GB1 A; 5BMH A; 2ZW1 A; 2ZW0 A; 2JSV X; 1YMH E; 4GLS C; 4MAC A; 1MVK A; 2KN4 A; 2ON8 A; 2KWD A; 4IOI E; 1IBX A; 1MHH E; 2ONQ A; 3FIL A; 4KGS A; 1YNT E; 1MPE A; 2LHD A; 5HG2 A; 1IGD A; 2QSD A; 2JZP A; 2QMT A; 1K51 A; 1IBX B; 5HI1 A; 1K53 A; 1EM7 A; 3FIL B; 1HZ5 A; 4WH4 A; 1ZXH A; 1PGA A; 3V3X A; 1GB1 A; 1KH0 A; 2IGG A; 2RMM A; 4OZC A; 1FCC C; 3UI3 A; 1F2R C; 1K50 A; 2KQ4 X; 1F2R I; 1IGC A; 4HKZ E; 1PGB A; 1XCT L; 2PW9 A; 2NMQ A; 2KAC A; 5HFY A; 2N9K A; 1HEZ E; 2IGD A; 2N7J A; 1UWX A; 5JXV A; 2J52 A; 1P7F A; 2KDM A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1YJ1 A; 2V3P A; 1C3T A; 2I2Y A; 1WGH A; 2WU5 B; 4NJ7 A; 4S0R A; 4TSS A; 3ABV B; 4ANV A; 3JSV B; 2AQ3 B; 4ITK A; 2D11 A; 1JRP A; 1FNU A; 2V1Y A; 2GB1 A; 3NHE B; 5D7G A; 1XF5 L; 4ANW A; 1IUE A; 1JWS D; 2KAN A; 4TKN A; 2K8C A; 3AV8 A; 3M3J A; 2D3C A; 1AN8 A; 2L83 A; 3AE1 B; 2RPV A; 3DOW A; 3VVW B; 1EU4 A; 2KN5 A; 1L6U A; 4ANX A; 5C23 A; 1Q5W B; 1C1Y B; 3X23 A; 1J0G A; 1TS5 A; 1WXS A; 4I6L B; 4M8N A; 2HDE A; 1STE A; 2CR5 A; 5BO4 B; 5AZG A; 2KN4 A; 1WRI A; 3N30 A; 2IYD B; 4C4V B; 4J3O D; 3DQV A; 4C56 C; 4H2A A; 2ONQ A; 3HM3 A; 3U30 A; 2JZP A; 2Y5P A; 2L52 A; 1L0V B; 4CQN A; 1LFD A; 2KT7 A; 1P1A A; 4BKS A; 1ZXH A; 2EKI A; 1P98 A; 4AOF A; 3WAP A; 1UBI A; 1GAQ B; 4OVU A; 3TBL D; 2E3T A; 1F2R C; 1N61 A; 2ICI A; 1WGD A; 2BF8 B; 1WR1 A; 2N4F A; 2CU1 A; 2K25 A; 2MHJ A; 4HCN B; 2W55 A; 1BUI C; 3U8Z A; 2DX5 B; 2INC C; 2J52 A; 4HWI B; 1TY0 A; 4MSM B; 1FD6 A; 1NDD A; 2JWU A; 3MJ5 A; 2BYT A; 3N1Y C; 3VH3 B; 2G3Q B; 2KLC A; 3UGB B; 3NZU A; 2IPK D; 2CJN A; 2HTH A; 2CJO A; 2KXJ A; 2IGH A; 1JWM D; 2WP9 B; 3A33 B; 3UIN B; 2NR2 A; 2XBB C; 2LJI A; 4KKI A; 1GC7 A; 2KFK A; 4WWM A; 1V81 A; 3W9C B; 4HKQ A; 3E9S A; 1V9J A; 3RYT A; 3JW0 X; 3MHZ A; 4RF0 A; 2KX0 A; 4B9K A; 3Q3J A; 2KC2 A; 4IM3 A; 4A9A A; 4HVB A; 4ACF A; 1HQR D; 1VZ8 A; 4JWU C; 4JLC A; 4GMV A; 3AE5 B; 3ZO5 B; 2ZJD A; 2L0F A; 2V0G A; 2WHI A; 1ZE3 D; 2W82 A; 3QC8 B; 1V8C A; 3BY4 B; 1UNS A; 3PRM B; 2C9W B; 5BYS A; 1HXY D; 4GLS C; 1JWU D; 2Y3A A; 4KX6 B; 3W1S A; 1YJI A; 2MQJ A; 2MA9 B; 3A9K A; 3DDC B; 4NJ6 A; 1FFV A; 4DBG A; 2MJD A; 1FNW A; 4GDK B; 1LM8 B; 4RM9 A; 3SU8 X; 1TS2 A; 1ESF A; 5C2T B; 1L4D B; 1OTR B; 5IAA C; 4DXG A; 3N1Z C; 1R7S A; 2QMT A; 2W3S A; 2JPH A; 3OG5 A; 1MG8 A; 1WJ4 A; 1MJD A; 2MSE D; 1QOG A; 4OVZ A; 1WH3 A; 4HRS A; 1WXV A; 4REZ A; 4EZJ A; 1ZOY B; 2WDQ B; 2MP2 B; 1F2R I; 2V3S A; 4Q2J A; 3N32 A; 2KAC A; 2GRI A; 3AEB B; 4NAM A; 2FIF A; 4GU2 A; 1HEZ E; 3VH4 B; 5CX3 A; 2XEW A; 4XWT A; 1OQR A; 1E10 A; 4DXA B; 1SIJ A; 1L0X B; 1PFD A; 3VDZ A; 2MJE A; 1LO5 D; 3RNE C; 3BYT B; 4XC2 A; 3APD A; 3DHI C; 4CYE A; 1KFY B; 3DBL I; 2N0S B; 4BVU C; 2LUM A; 4M02 A; 2IJ0 A; 2KLG A; 1V80 A; 1A5R A; 1RM6 C; 2H89 B; 2I1K A; 3RFZ B; 2INN E; 3ZNG C; 4WJQ A; 4KGR A; 1WWT A; 3ZKJ C; 1TYG B; 2LWP A; 4JL9 A; 3AM9 A; 3V61 A; 3P1M A; 4HRO A; 2KWU B; 5DCN A; 5J18 A; 2XK5 B; 3MJW A; 4B0M A; 5TR5 A; 1WRD B; 2JY6 A; 1FXI A; 1ZDX A; 3V6E B; 5D3D A; 1GC6 A; 2DWQ A; 1WIA A; 4PS7 A; 4XDD A; 5E6N A; 1AW7 A; 1TT5 B; 2MH7 A; 3IFW B; 4DHJ B; 2QDF A; 2D3A A; 4DHZ B; 4P7I A; 1VD2 A; 3VUW A; 3AB5 A; 3ZYY X; 1T0Y A; 4US9 A; 2MCN B; 2DAF A; 1E9M A; 2RPQ A; 1UGM A; 4ZYN A; 1N5X A; 3LYY A; 5J17 A; 4HPM B; 1R4N B; 4BBN F; 4YL8 A; 3Q2A C; 4YSZ B; 1WJN A; 3MHS D; 1HA5 A; 3HVD A; 4GB9 A; 2PJH A; 1QQR A; 1D5Z C; 2DZJ A; 2BS4 B; 4JIO U; 3GE3 C; 1ROE A; 2M8S A; 2KFJ A; 3PZ8 A; 5JH5 C; 5G5H A; 2VH1 A; 1FCL A; 4W9H A; 1SXT A; 4R3D A; 1SE9 A; 1SSN A; 4A6Q A; 1C9F A; 2NPT A; 2PVG C; 3R7Q A; 2PLP A; 3QK0 A; 3M95 A; 5BYQ A; 3PT2 B; 3IAS 1; 4IC7 B; 5CHF A; 3A1Q B; 2K3U A; 1R4M B; 3H7P A; 3CST A; 2QCZ A; 3PZ7 A; 3NY5 A; 5H8Y E; 4W9F A; 1SBB B; 3NVZ A; 1X1M A; 2KWV B; 3EGR A; 2N7E A; 4II2 B; 4MGI E; 4NJC A; 5EDS A; 3R2T A; 4HPP A; 1B9R A; 1NI2 A; 2JZ3 B; 3RNC C; 4AP4 C; 1T0S C; 2LVQ A; 2LXA A; 3PLV A; 1WMH B; 1OEY J; 3B2G A; 3PVL A; 1IBX A; 2MBB B; 1WZ0 A; 4LNN A; 1F0Z A; 1SE4 A; 3ZTD A; 4B0E A; 1JRU A; 2KDF B; 4LLG M; 2L1A A; 2WXQ A; 3ZXV A; 5IP4 D; 1J8C A; 2X8X X; 1EM7 A; 1BXT A; 3RD2 A; 3V05 A; 4HPL B; 2IY1 B; 3HIZ A; 3VUX A; 3RNA C; 2BKR B; 3PLU A; 3ML8 A; 2N9E B; 4HKZ E; 3AE7 B; 1IGC A; 2BB6 A; 1UUP A; 4XE0 A; 5E6O A; 4A20 A; 1U4A A; 2FNJ B; 1YX5 B; 4TQ0 A; 3AI5 A; 2EMS A; 2CHW A; 3JSV A; 1VJK A; 2BVC A; 2UWQ A; 3VRA B; 2WWZ A; 2I38 A; 3Q3M C; 1VCB A; 1JW9 D; 3ZVV A; 3EEC A; 4W9D A; 3SR6 A; 1K52 A; 4AJY B; 4WWP A; 3ZJV A; 2WXJ A; 1JWB D; 2YEP B; 1QIL A; 3TEX A; 1LQB A; 2DAJ A; 4WQM A; 1IYF A; 1WX8 A; 4EE2 A; 4ZRP A; 5G2N A; 4BFR A; 1EUV B; 2GI9 A; 1GUA B; 4XZ4 A; 3C8Y A; 2ZVN A; 2WYQ A; 1C77 A; 1P7E A; 1PGX A; 3GB1 A; 1MG4 A; 2ZW1 A; 1PQS A; 3H1U A; 1V2Y A; 2AL6 A; 2M0A A; 3RZF A; 4C4V A; 1YMH E; 2HJ1 A; 3U52 E; 2D3G A; 3AE4 B; 1WXM A; 1AWD A; 4YXD B; 1OQQ A; 2KO3 A; 2BS3 B; 2LGS A; 5IOI A; 3VFK A; 4CO7 A; 2LHD A; 2XN9 C; 3ENE A; 4YSY B; 2DHZ A; 3SFD B; 4BZA A; 2KDB A; 3ZNI D; 3FIL B; 4HEA 1; 2IND C; 1I35 A; 1E7U A; 2WDT B; 3ZUN A; 4NQK E; 3R7R A; 1DYQ A; 2IGG A; 5C3J B; 3P4P B; 3T3N A; 3AE3 B; 3TMP B; 2J7Q B; 4IUM B; 4BKG A; 2KQ4 X; 2ZCB A; 1KLV A; 3LJ3 A; 2K9X A; 1XD3 B; 1YQ3 B; 2JX5 A; 3TEZ A; 4MM3 A; 3L0W B; 2LUE A; 1EF5 A; 3PHW B; 4AWJ A; 2WQY B; 3T3O A; 4JPS A; 2L7R A; 3J9C A; 3K9P B; 2R2O A; 3DWG C; 3IXS A; 3BIN A; 2K6Q A; 3O13 A; 4JX1 C; 3Q3N C; 5T8I A; 2BTE A; 4OZA A; 3ZNH B; 2EMT A; 3ZGZ A; 4YTM B; 2PIA A; 2JU6 X; 2K0P A; 3VAW A; 1RYJ A; 3P4R B; 1UZX B; 1FMA D; 2WXF A; 1E7P B; 4S17 A; 3NRZ A; 5AZH A; 4IWQ A; 4RM8 A; 2KKC A; 1Q0W B; 2WXI A; 4P16 A; 3ZJU A; 4HK2 A; 5MPO A; 1MHX A; 3RT3 B; 2A5U A; 3SEB A; 4PYZ A; 4KGT A; 2CU3 A; 4D2K A; 5JZE B; 2X38 A; 1FO4 A; 3RNG C; 3EUB 2; 4ARC A; 1I4G A; 1R4N I; 3AEE B; 1QOA A; 4IWO A; 3RZW C; 1UH6 A; 2BW2 A; 5DPS A; 1ENF A; 4BKT A; 4FAD A; 2DBY A; 1EO6 A; 2QJL A; 2ON8 A; 4RGT A; 4ZHO A; 2K1F A; 1L7Y A; 2MRP A; 4N9F 4; 1I7H A; 2FE8 A; 4KGS A; 2OHF A; 3NS8 A; 3MTN B; 4LNK A; 5EE1 A; 3TJP A; 2ZPY A; 2KHW B; 2MP2 A; 1WE6 A; 3BYY B; 2IZV B; 4KIK B; 2YEP F; 3QIJ A; 5D3I B; 1H4R A; 1DOY A; 2IO0 B; 2E6X A; 3KWV A; 2VZK B; 4DK5 A; 4A3P A; 2GBR A; 3OWE B; 1XLP A; 2D5G A; 3JYU A; 1WM3 A; 1R4M I; 3LDZ E; 3QWZ B; 1V97 A; 3QAQ A; 4EOY A; 4K3B A; 1P0R A; 3AN1 A; 1WJ6 A; 4OZB A; 2L32 A; 2EEL A; 3VHT C; 3AE8 B; 5KHQ A; 2JYT A; 3RMK C; 3URY A; 1F77 A; 1I4P A; 1N63 A; 3PRP B; 3NVW A; 3TEY A; 3C0R B; 2O2V B; 2IO2 B; 4II3 B; 1XLN A; 2BBC A; 3EFC A; 1TJE A; 2A4Z A; 2LVO A; 3NS1 A; 2WS3 B; 4RGM A; 2XK5 A; 3EC8 A; 3EA6 A; 2YVC A; 5FR3 A; 3PTF C; 1XT9 B; 1N5W A; 4ZOH C; 3TL5 A; 3U7Z A; 1JCK B; 2L0T A; 2B76 B; 3CF6 E; 3C19 A; 1ZP0 B; 1C79 A; 1UEL A; 1KLU D; 1TTN A; 1YX6 B; 1CJE A; 4M0W B; 2R2Q A; 2WXP A; 4IDI A; 5E6P A; 3L16 A; 4HJK A; 2JWZ A; 3N1X C; 4FUL A; 1C76 A; 1L5P A; 3GOE A; 1WYG A; 2REX A; 3NOB A; 5JHB A; 4W9C A; 2GBN A; 2IO1 B; 4JWS C; 4WJN A; 2FID A; 3KH0 A; 1PGA A; 2Q5W D; 2JRH A; 4A8X C; 2RMM A; 2HD5 B; 1FXT B; 1PUT A; 3OLM D; 2QIL A; 5DPR A; 3MC0 B; 3WAO A; 3QAR A; 4C00 A; 2W9N A; 4JE3 B; 3ZTC A; 2IGD A; 2KNB A; 1PDX A; 2LVP A; 3KYC D; 3PO0 A; 2MBE A; 1UWX A; 4P6V F; 4EZK A; 1JML A; 4US8 A; 1HE8 A; 4NZL B; 1UD7 A; 2UYZ B; 1J7A A; 2VZK D; 4E71 A; 5J2R A; 1C78 A; 1KM7 A; 1WYW B; 4K7U A; 3WA0 A; 1LGR A; 2LD9 A; 4P1C C; 1NYR A; 3DHG C; 4EUT A; 3RNB C; 3ZRC A; 2I1J A; 1JRO A; 3A1Q A; 4LNF A; 2NTT A; 3SHQ A; 4HDQ A; 2LJ5 A; 3DHH C; 2BYE A; 2RSU A; 4DQO C; 4LK0 M; 2LI5 A; 2CHX A; 3GZN B; 4ZRK A; 2KJR A; 4E3C A; 1T5X D; 2J0J A; 2KK8 A; 1WMH A; 3NJT A; 5BYR A; 1V86 A; 3EFU A; 2LXC A; 1Q1O A; 3RUI B; 4PYU A; 4I6P A; 1RAX A; 2BS2 B; 2JVC A; 1E8X A; 4WAF A; 1ZXI A; 2K5P A; 4MEL A; 4WJP A; 4YWG G; 2AX5 A; 3AEG B; 5LXI B; 2FCS A; 5CHW A; 4PS8 A; 1E8Z A; 3DWM A; 1TZ1 A; 1OEY A; 2PEA A; 3P63 A; 2GBM A; 2GLS A; 3AU5 A; 4HDO A; 4I6N B; 1Z5S B; 1BT0 A; 4RMA A; 3VUY A; 5AUK A; 2NCN A; 2B3A A; 3TSS A; 2PPH A; 2MX2 A; 5H92 C; 2KDE B; 4LDT B; 4EEW A; 1UBQ A; 3BVM A; 3U2S C; 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