The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
22
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sequence length |
107
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structure length |
107
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Chain Sequence |
GAHMGGSMKIRVELINGNEHRTSSTPQQPQQNPSVSHIFDGETAVKDHIKVLLTHFKIPVDKVSSYALQNPFTLAYVEDSFLTPERLVEAEKSYFILRMKPHAIADR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure, dynamics, lipid binding, and physiological relevance of the putative GTPase-binding domain of Dictyostelium formin C.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Formin-C
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| molecule tags |
Actin binding protein
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| source organism |
Dictyostelium discoideum
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| total genus |
22
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| structure length |
107
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| sequence length |
107
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-07-27 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2L1A A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2MLB A; 4MGK E; 4ZDV A; 5DPT A; 5IP4 D; 4AS1 A; 4AJW A; 4FAD A; 1WMH A; 5C3J B; 3A9K A; 1L6U A; 3R7Q A; 2A4Z A; 4L23 A; 4XDC A; 1SE9 A; 2Q5W D; 4DHJ D; 1YD8 U; 2WXR A; 2G45 B; 2CHW A; 3ZXR A; 1ISN A; 3URY A; 4L1B A; 3ALB A; 3MFG A; 2JRI B; 2MHJ A; 4FLH A; 2L52 A; 4FJZ A; 4TV3 A; 1PGA A; 2D2Q A; 2BBC A; 1E9M A; 2L05 A; 3TBL D; 1WXA A; 1PGB A; 1V80 A; 3NHE B; 3I57 A; 1TKG A; 3RZF A; 4JIO U; 3QA8 A; 1FO4 A; 2BS3 B; 4BAX A; 1WY8 A; 3MJW A; 3W1S C; 1RAX A; 2HJ8 A; 1C78 A; 1C9F A; 1E8Y A; 5EE3 A; 4G50 A; 3Q8E A; 1L5P A; 3Q14 C; 2WXG A; 4AWJ A; 2O6V D; 5D7G A; 4ANV A; 1ESF A; 2XK5 A; 1QOB A; 2L1A A; 1WFY A; 1KLU D; 2D3C A; 2Y5B B; 3ZJV A; 3B2G A; 3RZW C; 2WDQ B; 2J4X A; 3RT3 B; 3VAW A; 1SB3 C; 2LD9 A; 3EGR A; 4JGH B; 3IXS A; 1I4X A; 4N58 A; 3VR8 B; 5AZG A; 1FFV A; 1TGZ B; 2C7N B; 2D10 A; 3MC0 B; 1P1A A; 4EEW A; 1F77 A; 2IDY A; 3NVZ A; 1T0R C; 4P6V F; 1CJE A; 2OOB B; 3AE3 B; 5KHQ A; 3U7D A; 4BVU C; 1WZ3 A; 2YEP F; 1R7S A; 4NAW B; 4OZB A; 2KN5 A; 2FAZ A; 5TR5 A; 1WGH A; 2LAS A; 2M56 B; 2LHE A; 3V6C B; 2I1K A; 2AQ3 B; 3VR9 B; 2M0X A; 1J7A A; 2EKI A; 2L0F A; 1SIF A; 3AI5 A; 2KAN A; 1N5W A; 3BYY B; 2V1Y A; 1XF5 L; 5HFY A; 1JAL A; 3RD2 A; 2N1W A; 2OJW A; 1LFD A; 4BKG A; 2LGY A; 3BZD B; 2MBQ A; 1WX9 A; 1LO5 D; 1I35 A; 1WGK A; 2K6Q A; 2B76 B; 4TQ0 A; 1K50 A; 3WAN A; 4L2Y A; 2N7E A; 1IGC A; 2BB6 A; 2KJR A; 2GRI A; 3HUI A; 2BGF A; 5C2T B; 1E10 A; 4KX6 B; 5E6J A; 5T8I A; 2IPK D; 4LNO A; 4YTP B; 4GXB A; 1X1M A; 3BY4 B; 3NOB A; 4RM9 A; 4IWQ A; 5J2R A; 3VH4 B; 4Q2J A; 4LDT D; 1V81 A; 2IND C; 5HG2 A; 2INP E; 2HD5 B; 3SR6 A; 4ZHO A; 1XCQ L; 2RPV A; 2SEB D; 2JSV X; 2KNB A; 1L7Y A; 2G3Q B; 3T9L A; 3R2T A; 3PZD A; 3P4P B; 4IM3 A; 1CMX B; 3KVF B; 4HWI B; 1F0Z A; 4MJS B; 1FM0 D; 3QIJ A; 1R4M B; 1FNV A; 2K8B A; 2LVQ A; 2L8J A; 4WWM A; 1OEY A; 2KQS A; 1WXV A; 3QCA A; 1FRR A; 2KTF A; 4DWF A; 4AJY B; 1L4Z B; 1QLB B; 2LUE A; 3ML9 A; 2KLC A; 4PYU A; 2MCN B; 1L0Y B; 3AUL A; 1T0S C; 3KUZ A; 2W82 A; 4A3O A; 1HEZ E; 5AUK A; 1Q1O A; 2DYB A; 5J18 A; 2LEK A; 1D5Z C; 3OLM D; 3BWU D; 3RI7 C; 2J0M A; 3BK2 A; 1L0X B; 1WE6 A; 4OVZ A; 1HE8 A; 5JXV A; 2INN E; 3RNF C; 1R4N B; 4N6E B; 2BW2 A; 4EUT A; 3IG3 A; 2QJL A; 3NVY A; 1XCT L; 1E6E B; 3RNG C; 4LLG M; 4DHJ B; 3ZJT A; 1HA5 A; 1VDV A; 2UWQ A; 3AH7 A; 3UIO B; 1UBQ A; 3BVG A; 3DBS A; 3AEB B; 4AOF A; 5D94 A; 4DXF A; 3UQB A; 2NMQ A; 3UI3 A; 1R4M I; 4KSK C; 4A3P A; 3B1L X; 2FCM A; 3IHP C; 3M63 B; 3C0R B; 4JX1 C; 2QEJ C; 3FKY A; 2EKE C; 1XXG A; 1AWD A; 2KKC A; 3CIR B; 4ZRJ A; 2GBM A; 4I6P A; 4DQO C; 4HDO A; 2WHI A; 2D3G A; 4MT5 A; 3TUO A; 4E71 A; 2O6V B; 5LXI B; 2BTE A; 1F2R I; 4MH0 E; 2RMM A; 2N1V A; 3SD5 A; 4EFO A; 2FIF A; 2ACZ B; 1IBX B; 4JWU C; 3HVD A; 2WXP A; 1ZDV A; 1MJD A; 1SIJ A; 3X23 A; 3LXF A; 3GZN B; 4II2 B; 3SFD B; 3AU4 A; 1R4N I; 1I7H A; 4BKS D; 1ZXI A; 4GDK B; 2W55 A; 2QDF A; 3R3M A; 2KWV B; 1SE2 A; 2M4N A; 1V8C A; 2MEK A; 2FUH B; 4HJK A; 1XLO A; 3B9J A; 3ZO5 B; 1HTO A; 1KF6 B; 1LM8 B; 3PZ7 A; 2KT7 A; 1UBI A; 2X8X X; 1KLV A; 4HPL B; 1IBX A; 3EUB 2; 1E8W A; 3PVL A; 4NQL B; 1V1O A; 1DOY A; 4IWP A; 2VH1 A; 3M3J A; 3VH3 B; 2V9H A; 1EO6 A; 2O2V A; 1FNW A; 1ZXH A; 4ZYN A; 3AE6 B; 2WXI A; 4F7Z A; 1Q10 A; 3AE4 B; 2KK8 A; 2G1E A; 2NBW B; 4K81 A; 3N32 A; 3WAO A; 3ECI A; 5E6O A; 4B95 A; 1WRD B; 5JH5 C; 2BYE A; 4TQ1 A; 3RNE C; 3W5U B; 5L83 A; 2MJE A; 1RYJ A; 4EKU A; 2HE7 A; 1WXQ A; 3NY5 A; 3LYY A; 1XQQ A; 4RGO S; 2KDI A; 4OVU A; 4OZA A; 1NI3 A; 1OFF A; 4MGY E; 4AUQ C; 2MBH A; 2YLM A; 3AN1 A; 4TUU A; 3V05 A; 2CU3 A; 2D3B A; 3ETR A; 4KIK B; 4XWT A; 3A4R A; 2EEL A; 3Q8A A; 2V0G A; 2PW9 A; 3PS6 A; 4ZRI A; 5IA7 A; 2CKH B; 2CR5 A; 2DAF A; 1V97 A; 2JUO A; 1I42 A; 1GUA B; 2V4L A; 2WYQ A; 3FIL B; 5LLI A; 3P2B A; 2PMV A; 4O1N A; 4B0M A; 4KZC A; 1F2R C; 3I5J C; 2ZCB A; 4M8M A; 2HJ1 A; 1GAQ B; 1JWB D; 5H92 C; 5G2N A; 2J42 A; 3MHS D; 4KIK A; 3H9D A; 1WYW B; 3U2S C; 4DHZ B; 3U52 E; 3BVM A; 1Z2M A; 3VXW A; 2MX2 A; 1PGX A; 4MEM A; 2GMI C; 1PFD A; 4KKJ A; 3FIL A; 1SJE D; 2KDB A; 4RGT A; 1JCK B; 3GOE A; 3MTN B; 2KMM A; 2IZV B; 3AMZ A; 2JY6 A; 3KUC B; 3HVZ A; 1T5X D; 2N9P C; 4HPP A; 2BYT A; 1DGJ A; 2MSE D; 2N7D A; 1Y8R C; 3AE2 B; 3WCQ A; 4HDQ A; 3ZDM C; 2BS4 B; 1WF9 A; 2D5G A; 4MDK E; 3RMK C; 2Y5P A; 1UUP A; 1EWC A; 4FN2 A; 1E8Z A; 2MP2 B; 3NS1 A; 2LUM A; 4KGT A; 3EHV A; 3PHW B; 2L3Z A; 4N59 A; 1LGR A; 1FNU A; 3AE1 B; 4HCP B; 4NY0 A; 2RDH A; 1XEE A; 4RCO A; 2N7J A; 5JHA A; 5BMH A; 1DYQ A; 3NVV A; 1FCC C; 1UEL A; 3S2A A; 3W9C B; 4B0E A; 2MP2 A; 5AEK B; 2WNM A; 1BT0 A; 2BT6 A; 3AE7 B; 3DHI C; 2BKF A; 3DBR B; 4FHJ A; 3T3N A; 1ZP0 B; 5IKC M; 2KD0 A; 2KHW B; 3RYT A; 4P7I A; 4FXC A; 2BWF A; 1SXT A; 1RLF A; 3ZXV A; 2FCQ A; 2K3U A; 2LMC A; 4M0W A; 2Y5C A; 1QT9 A; 1JWS D; 3QJZ A; 4KGR A; 1TIF A; 2NR2 A; 3QWZ B; 3ZQ4 A; 3SHQ A; 1D5X C; 3RUL A; 3RCZ A; 4NJC A; 4XZ4 A; 2UYZ B; 3U8Z A; 1XLP A; 1F1H A; 2LZ6 A; 2MWS B; 1OQQ A; 1D3Z A; 5LXH A; 1YN3 A; 1E7P B; 3VDZ A; 4C7Z A; 5EE0 A; 1BXT A; 2L0T A; 1EUV B; 4OZC A; 3C19 A; 1RWS A; 2MBO A; 1RM6 C; 4ICV A; 3PO0 A; 3AEC B; 1A5R A; 4EZL A; 4KDL B; 2WDV B; 3OG5 A; 1KTK A; 2KAJ A; 4JLC A; 4W9C A; 4IDI A; 4B6W A; 2WXF A; 3TIX A; 2IJ0 A; 4P1B C; 3ZW3 A; 1LQB A; 1SE4 A; 3KYC D; 3DBR I; 1WI0 A; 1QF6 A; 1GB4 A; 4ZOH C; 1U4A A; 1FCL A; 2KX0 A; 1P9D U; 3BVZ A; 4GIV A; 2JWZ A; 2JWU A; 1D6E C; 2WLB A; 4M01 A; 4ASW C; 1YN5 A; 4GLS C; 1TS5 A; 2BKR B; 4WWO A; 4CYE A; 4K7U A; 2M17 A; 4URK A; 2KWC A; 5H8Y E; 1SE3 A; 3X0W A; 2C9W B; 3ZJU A; 4IG7 B; 1TKY A; 2M0A A; 3AB5 A; 5AZH A; 2IBI B; 2KC2 A; 1P3Q U; 1ET6 A; 4J3O D; 2KZR A; 1FFU A; 1YQ4 B; 4IW0 A; 1QIL A; 1J8C A; 3DVN U; 4ZRP A; 3N30 A; 3U30 A; 1P98 A; 1JWM D; 2JU6 X; 4DXA B; 3ZLZ A; 2FE8 A; 4LNI A; 2PJH A; 2GBK A; 3LJ3 A; 1JWU D; 5CHF A; 4WAF A; 4NAW A; 1V49 A; 3NZS A; 3IBE A; 2QSD A; 1TS3 A; 3KQ4 A; 4NPN A; 4EZK A; 2RDB C; 1KJT A; 4M8N A; 5LNK 1; 1KFY B; 3SU8 X; 4HPM B; 4ARC A; 1WGR A; 4KVG B; 2K8H A; 3B08 A; 4C4V B; 1A70 A; 5TSS A; 2RDG A; 1SGH A; 4HK2 A; 4WWN A; 2D3A A; 2E6X A; 1T6B X; 2RSU A; 1NBF C; 1N63 A; 1N62 A; 2GOW A; 2DYO A; 5G5H A; 2WS3 B; 5GXG B; 2I1J A; 4M02 A; 2LGD A; 4K1R B; 1OTR B; 4FBJ B; 4MM3 B; 1P7E A; 4C56 C; 3APD A; 2LVO A; 5D2M B; 3QQ8 B; 4LCD E; 1FRD A; 2BF8 B; 3APC A; 4MSQ B; 1Q0W B; 4C4V A; 2KLG A; 1YOV B; 4HRS A; 4B9K A; 1C4C A; 4LNN A; 3NJT A; 2EMS A; 2M19 A; 4RM8 A; 3BIN A; 1C4A A; 3Q69 A; 1HXY D; 1FEH A; 1E0Z A; 4HRO A; 1WR1 A; 3R2I A; 2YVC A; 4XDD A; 3VUX A; 2FID A; 3I63 C; 3CF6 E; 4JPS A; 4MJS A; 4AP4 C; 1N6Z A; 1VCB A; 2ZPN A; 3MHZ A; 3N3K B; 4MM3 A; 1TT5 B; 3PRM B; 3DCG A; 4S0R A; 5CHV C; 1JW9 D; 2C7M B; 3WAM A; 2AX5 A; 3TSS A; 2LXA A; 2NBV B; 4CO7 A; 5JHB A; 2C5L C; 1M4V A; 3P4Q B; 3W5V B; 4NZL B; 3QK0 A; 1AN8 A; 3ZRF A; 1ZUD 2; 1PDX A; 1AYF A; 1WGY A; 4IWO A; 2Z59 B; 1S3S G; 2DZM A; 4IOI E; 4RH6 A; 1Y56 A; 1I4H A; 1K51 A; 2LVP A; 3VTW A; 3PTF C; 1IUE A; 2AWT A; 2PIA A; 4W9G A; 3RUI B; 4W9J A; 3E56 A; 4OW0 A; 2N9E B; 3DOW A; 1HQR D; 1NEK B; 1UH6 A; 2LWP A; 4EE2 A; 2JXT A; 2KFK B; 2IO3 B; 2KJH B; 4FJY A; 2X38 A; 1K8R B; 3L4P A; 1FXA A; 1UGM A; 1WXM A; 3HM3 A; 3V60 A; 3IFW B; 1F52 A; 3TL5 A; 2UU7 A; 2WWZ A; 4ZHP A; 2PVO D; 3VRA B; 3TEY A; 2ZW0 A; 1EU4 A; 2H89 B; 5IOI A; 4BOZ B; 2I38 A; 1WM3 A; 4XYC A; 1ZGU B; 4LJP B; 2KQ4 X; 3ZRC A; 2ICI A; 2KFK A; 4E74 A; 4P1C C; 5DPR A; 3ABV B; 5BMI A; 4NQK E; 4OVV A; 4F8C B; 1WGG A; 3O65 B; 3UGB B; 4WH4 A; 2JQR B; 4ICU A; 4BBN C; 1J19 A; 2YEP B; 3Q3M C; 3ZKJ C; 4XX5 A; 4C80 A; 2AQ1 B; 2ONQ A; 3RN9 C; 4IM2 A; 5EE1 A; 3QAQ A; 2ZPY A; 2O6V A; 3A9J B; 1UGJ A; 2MA9 B; 2PPH A; 2L00 B; 2MQJ A; 1YN4 A; 4GN1 A; 2J53 A; 2KDM A; 3AU5 A; 4M00 A; 3V62 A; 3OWE B; 2LXC A; 1H4R A; 1WSP A; 4A55 A; 5G55 A; 2V3S A; 5MPO A; 3E9S A; 2W9N A; 4OHJ A; 4PYZ A; 2IY0 B; 1VZ7 A; 2I2Y A; 4GDK A; 2VH2 A; 4KGS A; 2FBW B; 1PYW D; 5EDS A; 3APF A; 2KO3 A; 1B9R A; 3Q3J A; 2KN4 A; 2NPT B; 2MJ3 A; 3CST A; 3A9J A; 3C8Y A; 2AQ2 B; 1TJE A; 1B1Z A; 5C23 A; 1MHX A; 3IT4 B; 2KWU B; 4REZ A; 2CS4 A; 2JZP A; 2LFI A; 3AEE B; 4TMA B; 3SFE B; 2DWQ A; 2K22 A; 1E90 A; 4K3C A; 1V9J A; 3AE9 B; 1CQV A; 1OQR A; 1PUT A; 1P7F A; 4A90 A; 3JSV B; 1SBB B; 2EMT A; 4LDT B; 1ZPS A; 1HTQ A; 2CHX A; 4X57 B; 3DVG Y; 3NZU A; 3M62 B; 2PEA A; 1ET9 A; 4HEA 1; 3HHM A; 1I4G A; 2NPT A; 3SEB A; 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4PS7 A; 4YL8 A; 1UNS A; 3BII D; 1P0R A; 3LB8 C; 3RNB C; 5G5G A; 2REX A; 4LK0 M; 1MG4 A; 4ANU A; 1C4P A; 3CSF A; 1WJ6 A; 1XO3 A; 3ZNZ B; 2LRW A; 1QQR A; 4RF1 A; 1VZ8 A; 3ZIM A; 2BB5 A; 2DBY A; 1TS4 A; 3O13 A; 3DHH C; 1FXI A; 2ZZP B; 2DZI A; 2KXJ A; 2LGX A; 1MFW A; 5E6P A; 5HI1 A; 2WXQ A; 5HKH A; 1GC6 A; 2PKO A; 2W3S A; 3NUH B; 2IYD B; 1TBE A; 2MJD A; 1NI2 A; 1M94 A; 1ZE3 D; 3ZNI D; 4FA6 A; 4GMV A; 3KLS X; 1DOI A; 4I6L B; 2JYT A; 3Q8B A; 1MVK A; 2OHF A; 2JT4 B; 3DVG X; 3ZDT A; 2C60 A; 4A9A A; 5GMV A; 2L32 A; 2WXM A; 3AEA B; 2ZCC A; 4A6Q A; 1YX6 B; 4DHZ E; 3IAM 1; 1YQB A; 2XEW A; 2FUG 1; 2XK5 B; 5J17 A; 1RRB A; 4BKS A; 2M1M A; 4YSZ B; 4USA A; 2KC1 A; 1OEY J; 1TZO A; 4HVB A; 2G4S A; 2MRP A; 3JYU A; 4BOS C; 4IC7 B; 2PLP A; 1JML A; 5BMG A; 3NG0 A; 1Q5W B; 3WA0 A; 4US8 A; 4ZRQ A; 3RFZ B; 1C77 A; 2QC8 A; 3ZGZ A; 3TEZ A; 2RR9 A; 2K25 A; 1UWM A; 3H6N A; 2QMT A; 1SEB D; 1V2Y A; 2B3A A; 2V4I B; 3K9O B; 3UIP B; 1EWY C; 4ANW A; 3MC9 A; 1T3Q A; 2LGI A; 4ZRK A; 3DVN V; 1G6J A; 1QOF A; 3TEX A; 1KLG D; 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