The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
22
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sequence length |
107
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structure length |
107
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Chain Sequence |
GAHMGGSMKIRVELINGNEHRTSSTPQQPQQNPSVSHIFDGETAVKDHIKVLLTHFKIPVDKVSSYALQNPFTLAYVEDSFLTPERLVEAEKSYFILRMKPHAIADR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure, dynamics, lipid binding, and physiological relevance of the putative GTPase-binding domain of Dictyostelium formin C.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Actin binding protein
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| source organism |
Dictyostelium discoideum
|
| molecule keywords |
Formin-C
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| total genus |
22
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| structure length |
107
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| sequence length |
107
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-07-27 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2L1A A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2M1M A; 2KDE B; 2J52 A; 1ESF A; 2LGX A; 3NVW A; 4KV2 A; 4OZB A; 4ITK A; 1OEY A; 1Z5S B; 3Q3M C; 1WM3 A; 1L5P A; 1SEB D; 3APF A; 4W9L A; 4FXC A; 1SJE D; 2BVC A; 1LXD A; 2DZI A; 1QF6 A; 3VR8 B; 2L3Z A; 4L1B A; 2ONQ A; 3R2I A; 2LUE A; 3KUZ A; 3OG5 A; 2FNJ B; 5J17 A; 3PPA A; 4F8C B; 2O6V D; 1L2N A; 2JWU A; 3VUY A; 1JW9 D; 2UWQ A; 2AQ3 B; 3M62 B; 2R2O A; 2WXF A; 2D10 A; 4ZRK A; 1S3S G; 3JYU A; 2IO1 B; 3FC4 A; 2KXJ A; 1JML A; 2DAJ A; 1P3Q U; 2DZJ A; 4A6Q A; 2IY0 B; 1PGB A; 3VTW A; 1QOF A; 1SE4 A; 3AMZ A; 1B1Z A; 4RGT A; 2PE9 A; 3BVM A; 3I5J C; 2RMM A; 3JSV B; 3N1Z C; 4OVV A; 1GC6 A; 3RNE C; 4O1N A; 3GE3 C; 4PS3 A; 2GLS A; 3N1Y C; 3E9S A; 3AU4 A; 4HPP A; 1UBQ A; 1T0Y A; 4PS7 A; 2XBB C; 4RGM A; 2V3P A; 3ZKJ C; 4ANW A; 2FUH B; 5IAA C; 3PRP B; 2K22 A; 1C9F A; 3E56 A; 1CK1 A; 3FIL A; 4PS8 A; 4KGR A; 1GAQ B; 4LDT B; 4ZRJ A; 3A4R A; 3C0R B; 4D2K A; 3I57 A; 2KHW B; 5BYQ A; 4HWI B; 1BUI C; 3WAO A; 1C77 A; 3HUI A; 3PTF C; 3IT6 B; 1I4H A; 2M17 A; 3ZXR A; 2L0F A; 2OOB B; 3AI5 A; 5AZF A; 2Y5C A; 2BWE S; 2LRW A; 2KTF A; 3WAL A; 2HJ1 A; 3DHI C; 2W54 A; 1GNU A; 2MP2 B; 2O6V A; 2WQY B; 1ET6 A; 4XDC A; 3OJ3 A; 4GB9 A; 2KDF B; 3P4S B; 3U2S C; 1WGY A; 5E6J A; 2L52 A; 3PRZ A; 4C00 A; 2CJN A; 3MC0 B; 3IVF A; 1V2Y A; 4JX1 C; 2DYB A; 2M8S A; 1TZ1 A; 3NY5 A; 2VH1 A; 3KW5 B; 3BVZ A; 1TS5 A; 3AEF B; 3DVG Y; 2BF8 B; 2KVZ A; 3CIR B; 3V62 A; 3RUL A; 1XLN A; 3KYC D; 4MGI E; 2CU1 A; 3RN9 C; 3DDC B; 3AE7 B; 5AZG A; 3T9L A; 1AW7 A; 3HRD D; 4WWN A; 4RM9 A; 1IGC A; 2UYZ B; 2B3A A; 2PVO D; 1WJ6 A; 4FJZ A; 2WXQ A; 2JX5 A; 3RT3 B; 2Z0E B; 2LI5 A; 4XC2 A; 4HKQ A; 2BT6 A; 3Q3F A; 3DBL I; 2CS4 A; 3H7P B; 4N58 A; 3VQI A; 3SR6 A; 4MAC A; 2PKO A; 2CKH B; 3PS6 A; 1RLF A; 4NNJ B; 1CJE A; 2NBW B; 3TMP B; 4IC7 B; 2WX0 A; 4R3D A; 2A5U A; 1PGX A; 1RM6 C; 4ZDV A; 3V6E B; 4HRO A; 3A9K B; 2KQS A; 1GUA B; 5CTR C; 1ZE3 D; 2ICI A; 2RD0 A; 1WH3 A; 2L76 A; 5LLI A; 1V80 A; 1KH0 A; 3ZNG C; 3Q3O C; 3MP9 A; 2WXK A; 3ONS A; 3RI7 C; 1MJD A; 2W55 A; 4RH6 A; 3VH4 B; 3PLU A; 3IAS 1; 2GOW A; 2BS4 B; 1WWT A; 1JRU A; 2KMC A; 1R4M B; 1QZE A; 3WA0 A; 1RAX A; 2N9X A; 1WMH B; 1ZDX A; 4GU2 A; 1KOT A; 3TSS A; 4LJP B; 3IHP C; 1YQ4 B; 5IO9 A; 1ACC A; 2AQ2 B; 4X57 B; 2WXI A; 1I4X A; 2KDB A; 4A3O A; 4I6L B; 2AL6 A; 2IBI B; 2RR9 A; 2BTE A; 1B9R A; 1WIA A; 2JRI B; 2QIL A; 1JWS D; 1YOV B; 1I35 A; 2WDV B; 5D7G A; 4OZA A; 2WXG A; 4JGH B; 2JZ3 B; 2W82 A; 4BKG A; 1L4Z B; 2ZW0 A; 3N20 C; 4KKJ A; 4ICU A; 1ZXH A; 3HVZ A; 3P63 A; 1Q0W B; 1T3Q A; 4HXD A; 2DEN B; 3ZDT A; 1AWD A; 1FPY A; 2ON8 A; 4ZYN A; 2ZPN A; 1TT5 B; 3L0W B; 3BVG A; 2KJ6 A; 2O2V A; 3R8B A; 2YEP B; 4BBN F; 1WFY A; 3ENE A; 1YNT E; 5JHB A; 2KC2 A; 4G11 A; 1FD6 A; 2Q5W D; 2KFJ A; 3EC8 A; 4LTU A; 5L83 A; 2L05 A; 3ZJU A; 4NY0 A; 1J19 A; 4TQ1 A; 4CYE A; 2H88 B; 2KAN A; 4ARI A; 4MJS B; 1JWB D; 2I38 A; 1VDV A; 3PHX B; 1WSP A; 1MHX A; 4REZ A; 2G45 B; 1WRD B; 5DPT A; 1SXT A; 3X23 A; 1A5R A; 3QWZ B; 4IKG A; 1I4R A; 3VUX A; 4WAF A; 3ML8 A; 4NJC A; 2KN4 A; 1SE2 A; 2D3G A; 1E0Z A; 2JZP A; 4G3X B; 5LXH A; 3V6C B; 2K0P A; 5G2N A; 2WXR A; 2WLB A; 5JHA A; 4H2A A; 3NJT A; 1QOA A; 2JWZ A; 5T8I A; 3C19 A; 4MH0 E; 4RFB A; 1ZDV A; 4XZ4 A; 3ZXV A; 2IJ0 A; 5HG2 A; 2IO3 B; 1IPG A; 4PT5 A; 1YN3 A; 4MEM A; 4ZRP A; 2KTR B; 2GMI C; 3RNB C; 1V6E A; 2KX0 A; 3M3J A; 2Y5B B; 4AP4 C; 1S1Q B; 3IG3 A; 3VXW A; 1YQB A; 3PLV A; 3AEB B; 1SB3 C; 4ZOH C; 2DLB A; 1OQR A; 2KLC A; 3HM6 X; 3NUH B; 4M0W A; 4WJO A; 2MEK A; 3TEZ A; 4C7Z A; 4BKS D; 2V3S A; 1IBX B; 2IYD B; 1A70 A; 1EF5 A; 2JYT A; 3MC8 A; 1P7E A; 3WAM A; 1UNS A; 3NZ3 A; 3TCA A; 4DXF A; 1M94 A; 1YD8 U; 4LLG M; 4OW0 A; 2CHZ A; 2L8J A; 2W3R A; 2KVR A; 2QMT A; 1HTO A; 2LZ6 A; 1WF9 A; 2KO3 A; 3NRZ A; 4MM3 B; 3VUW A; 3ZDM C; 3QAR A; 2CU3 A; 4WWP A; 5TR5 A; 1Q5W B; 4A8X C; 3KUC B; 3GOE A; 1EU3 A; 3RFZ B; 1WX8 A; 4HJK A; 2WNM A; 1RYJ A; 1C79 A; 2VZK D; 4IUM B; 1TKG A; 2E3T A; 4F7Z A; 1MI0 A; 4MGZ E; 4RF0 A; 1L6U A; 2KJH B; 3GZN B; 4YT0 B; 4URK A; 2D3B A; 3DWG C; 2ASQ A; 2K8H A; 3AU5 A; 4WJQ A; 1ZPS A; 4A9A A; 2D07 B; 1VCB A; 1LFD A; 2BWF A; 4GDL B; 4C80 A; 1UBI A; 3DQV A; 1RFK A; 1KLV A; 2XK5 B; 2I1J A; 4BBN C; 4G50 A; 1EM7 A; 3K9O B; 5E6O A; 2PIA A; 3HM3 A; 1I42 A; 3APC A; 2FCN A; 3Q69 A; 1PQS A; 4NQL B; 2KWV B; 2IZV B; 3NZU A; 2D3A A; 1KM7 A; 1QOB A; 1HEZ E; 3BII D; 2FCM A; 5G5G A; 3DBH B; 3GB1 A; 3AE6 B; 3PZD A; 3RMK C; 1R4N B; 2Y3A A; 3Q8A A; 3BY4 B; 2JXT A; 1UUP A; 1TZO A; 1DOY A; 2KN5 A; 2KQ4 X; 4ICV A; 5EE0 A; 4CHK A; 4W9E A; 2NS5 A; 1STE A; 2BYT A; 1E90 A; 2C7M B; 1TKY A; 4DHZ E; 1JRO A; 2D5G A; 2ZJD A; 3DBR B; 4HRS A; 4J6I A; 4WUR A; 1UH6 A; 2J0K A; 1FFV A; 2K9X A; 2NBV B; 1T6B X; 1OTR B; 4HCN B; 4CO7 A; 4YTP B; 1ZW7 A; 3U52 E; 1OEY J; 2WX1 A; 2VRR B; 3KVF B; 3ZNI D; 1L0X B; 3ZYY X; 1E7P B; 3KWL A; 2PJH A; 3P4R B; 5C23 A; 2QSD A; 3MFG A; 2C7N B; 2RSU A; 4A55 A; 1L7Y A; 1NI3 A; 2IY1 B; 2NVU I; 2LXC A; 3RNF C; 2CJO A; 2QEJ C; 4AWJ A; 2K8C A; 2OHF A; 3TEX A; 2HD5 B; 1V1P B; 2MBH A; 4HKZ E; 5G55 A; 2E6X A; 2KYW A; 2MH7 A; 3H6N A; 2M0X A; 1F52 A; 1IUE A; 4G0N B; 3QIJ A; 1WZ0 A; 1UD7 A; 1WGH A; 1WE6 A; 4USA A; 3URY A; 1BT0 A; 5BMG A; 1YJ1 A; 2Z8L A; 3PSE B; 1ZKH A; 3SDL C; 5DCN A; 3NG0 A; 3L4P A; 3QA8 A; 4KZ0 A; 1NEN B; 3N9Y C; 4XYC A; 2QHO A; 3TJP A; 1WR1 A; 2DHZ A; 3PRE A; 2N7E A; 3V60 A; 3EHV A; 3NVY A; 4WQM A; 1FXI A; 2BB5 A; 3M63 B; 1KTK A; 3SFD B; 4DXA B; 4W9C A; 3DVG X; 2LGS A; 1VZ6 A; 2V4I B; 4ZRQ A; 4ACF A; 2WXO A; 2J4X A; 1TS4 A; 2GB1 A; 1ENF A; 4LDT D; 3ZTC A; 2EEL A; 4FHJ A; 4EOY A; 1AN8 A; 2N9L A; 1DGJ A; 1SIJ A; 4AOF A; 3CWI A; 2DWQ A; 5CX3 A; 4HK2 A; 4NAM A; 1YIW A; 2KJR A; 3M95 A; 1WXQ A; 1TY2 A; 2JQR B; 3TEW A; 1ZGU B; 1LO5 D; 1TIF A; 4N59 A; 2I1K A; 2KDI A; 2BYE A; 5GMV A; 3RNA C; 2MSE D; 2AX5 A; 4PYU A; 2V1Y A; 4W9G A; 1FXT B; 5BYR A; 5J2R A; 2L0T A; 2JXX A; 5BYS A; 1SGH A; 1UWM A; 4XWW A; 3W1Y A; 2HTM E; 2G4S A; 2KC1 A; 4XE0 A; 5EE1 A; 5BO4 B; 3NZS A; 3TUO A; 2I2Y A; 5BMH A; 4HJG E; 2NMQ A; 1WGG A; 3MJW A; 2HE7 A; 2N9E B; 2YLM A; 3IXS A; 2LWP A; 3RNG C; 2QC8 A; 4KVG B; 3KLS X; 2GBJ A; 1HTQ A; 1UZX B; 1F2R I; 2J53 A; 2PW9 A; 3DVN V; 4YSX B; 2LHE A; 3CF6 E; 2GBN A; 2ZCB A; 3W5V B; 2L83 A; 2BYV E; 3LYY A; 3JSV A; 4FA6 A; 1T0S C; 3P2B A; 2WS3 B; 4GSW A; 3ECI A; 3NVV A; 4IWP A; 4AJW A; 4GLS C; 4QAY A; 3ZTD A; 2EMS A; 2WDQ B; 2WXN A; 2MBE A; 2B76 B; 2AL3 A; 4OVU A; 3L08 A; 1DYQ A; 1WXS A; 1FFU A; 3QC8 B; 3ZLZ A; 2A4Z A; 1P98 A; 1WGR A; 3WAN A; 1FEH A; 3AEE B; 2MBO A; 2MA9 B; 4FJV B; 2J42 A; 3FKY A; 4RM8 A; 3AE3 B; 1OQY A; 4K3B A; 4JLC A; 4S0R A; 3AE2 B; 2C7H A; 1DOX A; 2TSS A; 2MLB A; 1FIQ A; 4YTN B; 2C60 A; 3VHT C; 4LCD E; 1SF0 A; 1YN4 A; 3I9V 1; 4NAW B; 4GGQ A; 3L54 A; 3SHQ A; 2HTH A; 2FIF A; 2IO0 B; 2J7Q B; 3NS1 A; 3Q8E A; 4RNA A; 4W9J A; 2NPT B; 1XD3 B; 2FBW B; 4DK5 A; 4BFR A; 4KSL C; 3WAP A; 2XNA C; 2KNB A; 2PMV A; 3CST A; 4RGN A; 4P6V F; 2MP2 A; 5C3J B; 3KH0 A; 2REX A; 4TKN A; 4BKT A; 5EDS A; 1E5W A; 1QLB B; 3R7Q A; 1C3T A; 4GDK B; 3SU8 X; 1WYG A; 2LJI A; 3QHT A; 4BVU C; 1J7B A; 4K7U A; 5EE9 A; 4TUU A; 4AQ7 A; 3A1Q B; 2LAS A; 2RDG A; 4ANU A; 4B9K A; 1TGZ B; 4ANV A; 2LRU A; 2LHD A; 2J0J A; 1SE9 A; 3MC9 A; 1E10 A; 1C4P A; 3VTU A; 2FCS A; 3EUB 2; 1KF6 B; 4KDL B; 1L0V B; 4N6E B; 4EE2 A; 1D5X C; 1Y56 A; 1NYR A; 3BZD B; 1SIF A; 2OED A; 4JQW C; 4UDU C; 3H7P A; 2V0G A; 1WXV A; 3GS2 A; 1AYF A; 2BKF A; 3MJ5 A; 1HXY D; 1Q10 A; 2RPV A; 5BMI A; 4KIK B; 2K39 A; 1ISN A; 4WQO B; 3HIZ A; 3R2T A; 3SEB A; 2KD0 A; 5DPR A; 3P4P B; 3W2D A; 4KGS A; 1XT9 B; 4C7Y A; 1OFF A; 2ZNV C; 2X8X X; 1OQQ A; 5MPO A; 4GXB A; 3LXF A; 4FUL A; 1H8C A; 1TKE A; 1WI0 A; 3EEC A; 4XDD A; 4NAW A; 1NVI D; 2RPQ A; 2LJ5 A; 4YXD B; 3A9K A; 1WY8 A; 4E74 A; 3Q8B A; 4M8M A; 1QKZ A; 2WDR B; 4US9 A; 2KOX A; 1JWM D; 3WIM A; 1KLU D; 2Z59 B; 3U8Z A; 1N5W A; 2K3U A; 2ZCC A; 3B1L X; 1EF1 A; 4OHJ A; 2IGH A; 2QDF A; 3PO0 A; 1D6E C; 4WWO A; 2MX2 A; 1JRP A; 1VD2 A; 4Q2J A; 4KSK C; 4FN2 A; 1P0R A; 1WMH A; 4YSY B; 2NBU A; 3BK2 A; 5JH5 C; 3N3K B; 4TQ0 A; 3D32 A; 1IGD A; 1T0R C; 3ZNH B; 1UGJ A; 1XF5 L; 1N5X A; 4GDK A; 2KMM A; 4EUT A; 2PE6 B; 4F1S A; 1K8R B; 4RF1 A; 1CMX B; 4B6W A; 1SSN A; 1WJ4 A; 3HVD A; 2KWD A; 1N63 A; 4A90 A; 1Y8R C; 4IWQ A; 3ZO5 B; 3AH7 A; 3O13 A; 4PK1 A; 3RPF C; 4ZHP A; 2FID A; 1YJI A; 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3VDZ A; 1CZP A; 3EA6 A; 1HQR D; 2L7R A; 2HDE A; 1EUV B; 2MJE A; 2PVG C; 2WP9 B; 3QX1 A; 3AN1 A; 2M56 B; 2LVQ A; 3AEA B; 2K1F A; 2KX3 A; 2UU7 A; 4LNF A; 3NS8 A; 4EZK A; 2DZK A; 5KHQ A; 2L32 A; 4W9I A; 2AQ1 B; 4HPM B; 1D5M C; 1D4B A; 2KFK A; 2KLG A; 4MM3 A; 4RCO A; 5I4D A; 3ETR A; 4KGT A; 4RGO S; 2MBB B; 4A3P A; 4AUQ C; 2K6Q A; 4P1B C; 1WRI A; 2MBQ A; 2KKC A; 4I6P A; 1Z2M A; 3DBS A; 2M19 A; 2WU2 B; 4HVB A; 3HHM A; 3FIL B; 2DZM A; 2RGF A; 2MWS B; 3UQB A; 3N32 A; 1TY0 A; 1XLO A; 1SBB B; 2SAK A; 4IW0 A; 3ALB A; 1N62 A; 3U4E G; 1PYW D; 4HDO A; 5D2M B; 3AE1 B; 2IGD A; 2LD9 A; 3NVZ A; 4C4V A; 1IYF A; 2INN E; 2C9W B; 2RDB C; 1R4M I; 1FM0 D; 2BW2 A; 3MHS D; 1ZP0 B; 2DNF A; 5JZE B; 3A33 B; 3DVN U; 2EMT A; 2YVC A; 3VVW B; 3H7S A; 1I7H A; 5KHO A; 4E3C A; 1XXG A; 1RRB A; 4JWU C; 1L4D B; 2N7D A; 3KYD D; 3GP7 A; 4W9K A; 4US8 A; 2O6V B; 4TV3 A; 4GDL A; 2WXJ A; 3S2A A; 2X38 A; 1U4A A; 3BIN A; 2V4L A; 2XK5 A; 4ZYS A; 2AEH A; 1WXA A; 5LXI B; 1M4V A; 2GBK A; 4L23 A; 1GB1 A; 4IM2 A; 3VFK A; 3DHG C; 3N30 A; 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