The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
22
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sequence length |
107
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structure length |
107
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Chain Sequence |
GAHMGGSMKIRVELINGNEHRTSSTPQQPQQNPSVSHIFDGETAVKDHIKVLLTHFKIPVDKVSSYALQNPFTLAYVEDSFLTPERLVEAEKSYFILRMKPHAIADR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Actin binding protein
|
| source organism |
Dictyostelium discoideum
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| publication title |
Structure, dynamics, lipid binding, and physiological relevance of the putative GTPase-binding domain of Dictyostelium formin C.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Formin-C
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| total genus |
22
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| structure length |
107
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| sequence length |
107
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-07-27 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2L1A A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3PS6 A; 2BS2 B; 3DVN V; 1BUI C; 2KTR B; 2CJO A; 5JHA A; 4NJC A; 1C9F A; 2PMV A; 4EFO A; 2L1A A; 3L4P A; 1NDD A; 4HPM B; 2HE7 A; 3NVV A; 4YSY B; 2K39 A; 2LGS A; 2W54 A; 1KF6 B; 1WXV A; 3QAR A; 4P7I A; 2M1M A; 1ZW7 A; 3V62 A; 4TSS A; 1MG8 A; 4MT5 A; 3OJ4 B; 4KIK B; 1MJD A; 1XEE A; 3JSV A; 4XYC A; 2DZJ A; 4F7Z A; 1WSP A; 1ZUD 2; 1IUE A; 2KX3 A; 1VCB A; 4P6V F; 2PKO A; 4RF1 A; 5I4D A; 3MC0 B; 4PS8 A; 2VZK B; 5H92 C; 1WR1 A; 3WAL A; 1WE7 A; 4JGH B; 3SFE B; 2FE8 A; 3Q3F A; 1JAL A; 5AUI A; 2BKR B; 2LJ5 A; 4DXF A; 2ON8 A; 2FID A; 4FHJ A; 1L4Z B; 2HD5 B; 2L00 B; 1SIF A; 3QC8 B; 4OZB A; 2FBW B; 4HJG E; 1TTN A; 2WQY B; 3TEW A; 3AB5 A; 3KWV A; 2BVC A; 1NBF C; 5GMV A; 4P16 A; 4DBG A; 3PHW B; 3OLM D; 1L5P A; 3AEA B; 3PZ8 A; 4DXA B; 3VQI A; 2W9N A; 1GC7 A; 3RPF C; 4CYE A; 1SB3 C; 4GN1 A; 3SU8 X; 3B0A A; 2NTT A; 1STE A; 3B9J A; 3OAW A; 3U2S C; 4MEL A; 4TQ1 A; 2WXR A; 3KUC B; 3A33 B; 1YOV B; 3DBL B; 2KMC A; 3PHX B; 2BS4 B; 2XBB C; 2KO3 A; 1VLB A; 1ZKH A; 3DVG Y; 4FJZ A; 1FXA A; 1JWB D; 2KDM A; 3PRP B; 4EKU A; 4JLC A; 1TS4 A; 4OVU A; 4WIP A; 2WX0 A; 1F1H A; 3W1Y A; 3Q8E A; 3GS2 A; 3AV8 A; 3H7P A; 1FIQ A; 4IUM B; 3A4R A; 1K50 A; 4B0E A; 4KKJ A; 1SSN A; 3M62 B; 5JHB A; 1WYW B; 1HEZ E; 2OHF A; 1WGD A; 1DYQ A; 4GDK B; 2CHZ A; 3R7R A; 3DVG X; 2LAS A; 4E74 A; 2LUE A; 4MGI E; 1VDV A; 1QOF A; 2J7Q B; 4NAW B; 2E6X A; 1XCQ L; 2GBK A; 2O6V A; 2ZEQ A; 1S1Q B; 1DOI A; 4KSK C; 4QAY A; 4HLE A; 3VUX A; 4US8 A; 5DPT A; 2IGD A; 1WMH A; 2BW2 A; 2BTE A; 1M94 A; 3AMZ A; 4RCO A; 2R2Q A; 1YJI A; 2KJ6 A; 1E9M A; 1E6E B; 1Y8R C; 3Q2A C; 5IO9 A; 5E6N A; 3JYU A; 2DWQ A; 1WGH A; 2FCQ A; 2KAJ A; 1RWS A; 3EFC A; 2LUM A; 3GE3 C; 2LWP A; 5FKA C; 3ZJV A; 4EZL A; 4AUQ C; 1JWM D; 4HPL B; 5HFY A; 2WXG A; 4ITK A; 2BT6 A; 2WWZ A; 3RNF C; 4HEA 1; 2LRU A; 4ARI A; 3N20 C; 4M01 A; 3SHQ A; 4RGM A; 1Q10 A; 2UU7 A; 3AUL A; 2K8B A; 3Q6B A; 2IY1 B; 3VRB B; 3ZIM A; 4DHZ B; 2MLB A; 3QWZ B; 4IWP A; 2KDF B; 4MSQ B; 4EEW A; 3ZQ4 A; 2LVO A; 5LXI B; 2JZP A; 3C0R B; 3BIN A; 3GOE A; 4RM9 A; 2D11 A; 4JX1 C; 4K3B A; 1GB1 A; 2QC8 A; 3VDZ A; 3PRM B; 1JWS D; 3VTU A; 2D3C A; 2L7R A; 1HZ5 A; 3JW0 X; 2DYM A; 1BML C; 3GE8 C; 1I42 A; 2MQJ A; 3PZD A; 4LNK A; 2A4Z A; 3DBH I; 4UDU C; 3O65 B; 1V5T A; 2JZZ A; 1AW7 A; 4ZOH C; 2WGS A; 3VUW A; 2KAN A; 1MFW A; 2WXP A; 4ZRI A; 3B2F A; 3I5J C; 1H8C A; 2RR9 A; 1L6V A; 3PGE A; 3ZDM C; 1WWT A; 1JRP A; 3NUH B; 2JRI B; 2K6D B; 3PTF C; 2O2V B; 3AI5 A; 4PS7 A; 2D2Q A; 5D2M B; 3NY5 A; 1PYW D; 3TEX A; 3NG0 A; 2KC2 A; 3HVZ A; 1UBQ A; 2N7E A; 4J3O D; 2LFI A; 3ZGZ A; 3EHV A; 3L0W B; 2O2V A; 3EUB 2; 2G4D B; 3ZRC A; 2W55 A; 3W1S C; 1RM6 C; 3R2I A; 3HM6 X; 3ZYY X; 3U4E G; 3Q3N C; 2FIF A; 1LO5 D; 4O1N A; 2HTM E; 1QKZ A; 2WDR B; 3ZNI D; 4C4V B; 4A6Q A; 1WGK A; 2KN4 A; 3Q3O C; 3H1U A; 3HM3 A; 2RGF A; 5H8Y E; 1XT9 B; 4LDT D; 3EA6 A; 3AE3 B; 4FJY A; 4L1B A; 2L0F A; 3DHI C; 4MGY E; 3AH7 A; 4A9A A; 1A70 A; 3DBR B; 1TT5 B; 2CHX A; 5BO4 B; 5D7G A; 2X38 A; 3N3K B; 1MPE A; 4LNF A; 2L32 A; 1R4M B; 4XWW A; 4AP4 C; 4XX5 A; 2KVR A; 1QZE A; 2M0A A; 1NI3 A; 3L10 B; 2RMM A; 1L7Y A; 1DOY A; 4FBJ B; 1YMH E; 1QQR A; 3BK2 A; 1ROE A; 4JQW C; 4GDL A; 5BYQ A; 3RZF A; 2JY6 A; 1UF0 A; 1V80 A; 3CF6 E; 3MC9 A; 2INC C; 1N60 A; 2L05 A; 4WQM A; 4EE2 A; 2KFK A; 3ZLZ A; 1PGX A; 1HTO A; 3R66 C; 1E8X A; 5J18 A; 3N32 A; 1EO6 A; 3V3X A; 3AE8 B; 1E7P B; 2WDQ B; 1TKG A; 3RD2 A; 1F9J A; 2DZI A; 1N61 A; 4RF0 A; 2C7M B; 3IG3 A; 4NQK E; 2PE9 A; 2PW9 A; 4CO7 A; 3IHP C; 2JT4 B; 4KV2 A; 3U7D A; 4N9F 4; 3UQA A; 1GG3 A; 2HJ1 A; 2FCM A; 3QX1 A; 3KYC D; 1NYQ A; 3O13 A; 1C4P A; 2KMA A; 3V6E B; 1FNW A; 1YX6 B; 1VZ6 A; 3S2A A; 1T0Y A; 3LYY A; 1YJ1 A; 1IGC A; 2MBO A; 4C7Y A; 2KT7 A; 4WWN A; 4K1R B; 2REX A; 1WXQ A; 4LJP B; 3HK0 A; 2DLB A; 2GB1 A; 1E7V A; 1PQS A; 1LM8 B; 2MX2 A; 1JW9 D; 3KYD D; 3QQ8 B; 1U4A A; 3X23 A; 3TL5 A; 2MSE D; 1E0Z A; 3PSE B; 1K53 A; 2BWF A; 1IGD A; 4YXD B; 4JPS A; 4AOF A; 3RNA C; 3NZU A; 1D5Z C; 1H4R A; 2QHO A; 1OTR B; 2VZK D; 4G0N B; 2ASQ A; 2EKE C; 2C7N B; 4C7Z A; 1CZP A; 1P7F A; 4S0R A; 2D10 A; 3KW5 B; 2ICI A; 3RNC C; 1J19 A; 3X0W A; 4ANU A; 3P4Q B; 3WCQ A; 3QAQ A; 1QLB B; 2CR5 A; 3Q8F A; 1E7U A; 1WIA A; 3RUI B; 5C3J B; 5J2R A; 5HKH A; 3A9J B; 1J0G A; 2GLS A; 4GIV A; 4JE3 B; 1ZDX A; 2WXH A; 2KQS A; 4DHZ E; 4EZJ A; 4N58 A; 4H2A A; 1SGH A; 1UBI A; 3TUO A; 2A5U A; 3IVF A; 2PLP A; 4KKI A; 2BYF A; 3TSS A; 3WAM A; 4R3D A; 1KTK A; 3QJZ A; 1R4N B; 4MH0 E; 1V8C A; 3BVZ A; 1XD3 B; 3VFK A; 2JYE A; 4P1B C; 4W9C A; 3UF8 A; 1L6U A; 2DNF A; 4IDI A; 3AE2 B; 2TSS A; 3B08 A; 4YSX B; 1Z5S B; 2N1V A; 2MH7 A; 3AE6 B; 2JQR B; 3EC8 A; 3E56 A; 4YT0 B; 4ARC A; 2KD0 A; 5IOI A; 4W9I A; 1TZ1 A; 1WX8 A; 4IWQ A; 1FPY A; 4HJK A; 4URK A; 2J42 A; 3DDC B; 4YTN B; 3PRZ A; 4BKS D; 2AQ2 B; 3ML8 A; 4TV3 A; 2YVC A; 3U8Z A; 4TKN A; 4RM8 A; 4K81 A; 1GAQ B; 4RGN A; 1C3T A; 3APC A; 4FJV B; 2BYT A; 5AZH A; 5DPW A; 5CHW A; 3NVZ A; 3VXW A; 1FFV A; 1SE2 A; 2ZVO A; 3PLU A; 2BGF A; 2DEN B; 2JXT A; 2PVO D; 3Q14 C; 3JSV B; 2KWU B; 1FRD A; 4PYZ A; 4ANV A; 5LNK 1; 1G6J A; 2BB5 A; 4GB9 A; 1GB4 A; 1R7S A; 3ONS A; 1LFD A; 1EUV B; 1SJE D; 4M00 A; 4XDD A; 2LMC A; 1IPG A; 1MVK A; 2ONQ A; 2Y3A A; 4WQO B; 1ZGU B; 3V61 A; 2J0J A; 4MM3 A; 2KK8 A; 4ANX A; 4DXG A; 3A4S C; 2V3N A; 4B0M A; 1C4A A; 1Q1O A; 4C56 C; 4FHK A; 3W1S A; 1ZE3 D; 2LGI A; 2LRW A; 3W5U B; 1D4B A; 1WX7 A; 3IT4 B; 2N9E B; 1V5O A; 4K7U A; 5KHQ A; 1ZPS A; 1GC6 A; 4YL8 A; 1YQ3 B; 2C5L C; 5AUK A; 1ENF A; 1T6B X; 1K8R B; 2IYD B; 5LLI A; 1KOT A; 1RRB A; 1YQ4 B; 1QOA A; 2KVZ A; 3AE5 B; 3UI3 A; 3DOW A; 1E8Z A; 4XZ4 A; 2BPS A; 1FO4 A; 3U7Z A; 2BQQ A; 2J0K A; 3TMP B; 1SIJ A; 1X1M A; 4I6L B; 3H7P B; 4LNN A; 1KLU D; 2ZNV C; 2ZVN A; 1JWU D; 4MGZ E; 1Q5W B; 4WAF A; 2WXF A; 3PO0 A; 4WH4 A; 3SR6 A; 1FCC C; 2C9W B; 3N30 A; 4IWO A; 2YEP F; 4LJO B; 2M19 A; 3B2G A; 4G3X B; 1WRD B; 4YTM B; 4WWP A; 4MSM B; 3TEY A; 3MFG A; 1C77 A; 1T5X D; 2O6V B; 3UIP B; 4DHJ D; 4W9D A; 1P7E A; 3KQ4 A; 1ISN A; 1HXY D; 3TEZ A; 3VRA B; 5EE0 A; 3K9P B; 3QHT A; 1WMH B; 2X8X X; 1FEH A; 3CWI A; 1LQB A; 3I63 C; 4BZA A; 4A55 A; 2D5G A; 2E3T A; 3Q8A A; 4F1S A; 3M95 A; 2N1W A; 3I57 A; 5AZF A; 4RMA A; 3HUI A; 2N9K A; 1AN8 A; 3AU5 A; 1TS5 A; 4NY0 A; 1UNS A; 2MA9 B; 2CU3 A; 3PT2 B; 3DQV A; 1TY0 A; 4KVG B; 4XE0 A; 3RZW C; 3W9C B; 5L95 C; 2K5P A; 1BXT A; 3BWU D; 4FAD A; 3SDL C; 2JSV X; 3ETR A; 2QMT A; 3W2D A; 1P3Q U; 1RYJ A; 1HE8 A; 4TMA B; 2V3S A; 2KYW A; 4GU2 A; 3IFW B; 4NJ7 A; 2MJE A; 2FUH B; 2I1J A; 2QIL A; 4JWS C; 5IN7 A; 4E71 A; 2KKC A; 2L8J A; 3NOB A; 1WXM A; 1JRO A; 2Z59 B; 1F2R I; 2W82 A; 2B76 B; 1Q0W B; 2G9H D; 2J52 A; 3WA0 A; 2IZV B; 3ZNZ B; 2MP2 A; 3CIR B; 4FA6 A; 3TJP A; 1EU4 A; 2W3S A; 1OQR A; 4A3O A; 1WI0 A; 2YEP B; 2N9P C; 5TSS A; 4LLG M; 2V4I B; 1SBB B; 2KQ7 A; 3E9S A; 4ZDV A; 3DBH B; 2IY0 B; 1J7B A; 4DWF A; 3VH3 B; 4KZC A; 2AQ1 B; 4LK0 M; 5G5H A; 3I3T B; 4GSW A; 1XO3 A; 2CS4 A; 4MDK E; 1TJE A; 1V86 A; 2DBY A; 2KC1 A; 2WHI A; 2N7D A; 5GXG B; 1FNU A; 3DHH C; 3DWG C; 2BKF A; 2LJI A; 2DAJ A; 1WJU A; 3H8H A; 3NS8 A; 5KHO A; 2WNM A; 4N6E B; 4DDG D; 3DVN U; 4II2 B; 4HKQ A; 1FFU A; 4ZHP A; 1YD8 U; 3WAO A; 4KZ0 A; 4ZRJ A; 4KDI C; 1ZDV A; 2FCN A; 1P0R A; 3RNE C; 4GGQ A; 4TQ0 A; 2BF8 B; 1NVI D; 4W9K A; 2G1E A; 1YN4 A; 4OHJ A; 2ZCB A; 4ZRP A; 4OW0 A; 2XN9 C; 2Y5P A; 5IKC M; 2NBV B; 1WE6 A; 3VUY A; 3A9K A; 1A5R A; 3PV1 A; 3URY A; 4ASW C; 5BMG A; 1FXT B; 1L0X B; 3TIX A; 1XF5 L; 3VVW B; 3QIJ A; 5J17 A; 2MBB B; 1ET9 A; 2WXM A; 1VJK A; 4KGT A; 1ZXI A; 1GOZ A; 2I1K A; 2SAK A; 2D3B A; 4LNI A; 1YN5 A; 1KJT A; 4KX6 B; 1L0Y B; 4WWO A; 2UYZ B; 2FUG 1; 2V9H A; 5HI1 A; 3VTV A; 2R2O A; 4M0W A; 2DAF A; 4MGK E; 1YJJ A; 4GDL B; 1SF0 A; 5L83 A; 4BBN C; 4WJO A; 2LVQ A; 3R2T A; 1N5X A; 2KFK B; 1QOB A; 2C60 A; 1GPX A; 1NI2 A; 4XC2 A; 3FKY A; 1N6Z A; 4A3P A; 3ALB A; 2JWU A; 3RMK C; 2WDT B; 1NYR A; 1GUA B; 2LI5 A; 2PEA A; 2YLM A; 4M8M A; 1HQR D; 2KDB A; 3GZN I; 2ZJD A; 2LGD A; 3NZ3 A; 2MBQ A; 5EE9 A; 2LGX A; 2GI9 A; 3P4P B; 1SJH D; 3EGR A; 2NS5 A; 4EOY A; 5LXH A; 3SEB A; 4I6N B; 3SFD B; 1E10 A; 1RFK A; 2XK5 A; 1WGY A; 1FXI A; 4LTU A; 2WXQ A; 2D3G A; 2KWC A; 3L08 A; 1UEL A; 3NS1 A; 1V81 A; 2N4F A; 5D6J B; 3J9C A; 3T8M A; 2PE6 B; 2V4L A; 2PPH A; 4G11 A; 1QF6 A; 4K7S A; 2AL3 A; 2M56 B; 4W9L A; 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4OVV A; 3AEC B; 4IM2 A; 2MWS B; 3Q8C A; 1TZO A; 2Z8L A; 1I4R A; 4FXC A; 4KSL C; 1IBX A; 4RNA A; 1C78 A; 5D94 A; 4LDT B; 3ZJU A; 1I4H A; 4MH8 A; 3DWM A; 3HRD D; 5AEK B; 4K3C A; 4NZL B; 2KXJ A; 3P42 A; 4X57 B; 3EFU A; 1V97 A; 5JXV A; 4IM3 A; 4WUR A; 2KFJ A; 2MRP A; 2NPT A; 5CHF A; 5FK9 C; 1F77 A; 1FMA D; 1WF9 A; 2Z0E B; 2LHE A; 2O6V D; 1YNT E; 4JL9 A; 1UGM A; 2B3A A; 4FUL A; 3D32 A; 2MW5 A; 3DBS A; 2DX5 B; 2QDF A; 4IM0 A; 2FAZ A; 2L76 A; 4PT5 A; 4XGA B; 3ZTC A; 1HTQ A; 1JML A; 2SEB D; 2WU2 B; 3JVZ X; 1OFF A; 2ZW0 A; 1NEK B; 3CMM B; 4HVB A; 3RI7 C; 1XCT L; 1RAX A; 2K25 A; 1XLO A; 2AWT A; 5HG2 A; 4I6P A; 1PDX A; 2ZZP B; 4AWJ A; 4P1C C; 3ZNG C; 3VTW A; 4KGR A; 1VD2 A; 2JU6 X; 2QSD A; 1UUP A; 1I4X A; 2JX5 A; 1WZ0 A; 1KLV A; 2OJW A; 1RFA A; 2HTH A; 1T0Q C; 2RPV A; 4MM3 B; 3UIN B; 2ZPN A; 3IXS A; 1I7H A; 2K1F A; 1WJ4 A; 1TBE A; 2KTR A; 3FC4 A; 4LNO A; 3L54 A; 3K9O B; 5G55 A; 4OVZ A; 3KUZ A; 2LXC A; 1XLQ A; 3TCA A; 2IND C; 4IW0 A; 5HHD G; 2MBH A; 1WH3 A; 1OEY A; 2KQ4 X; 3AN1 A; 3UIO B; 2NBU A; 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