The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
4
|
sequence length |
66
|
structure length |
66
|
Chain Sequence |
MNVTVEVVGEETSEVAVDDDGTYADLVRAVDLSPHEVTVLVDGRPVPEDQSVEVDRVKVLRLIKGG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
solution structure of ubiquitin-like small archaeal modifier protein in Haloferax volcanii
rcsb |
| molecule keywords |
Small archaeal modifier protein 2
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Haloferax volcanii
|
| total genus |
4
|
| structure length |
66
|
| sequence length |
66
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-09-01 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LJI A; 2L32 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1ACC A; 4BVU C; 1D6E C; 3WCQ A; 2FUH B; 1TGZ B; 4M8M A; 4ANW A; 4MGY E; 3AE5 B; 3I5J C; 2D3G A; 2YLM A; 4MGZ E; 1WGR A; 2WXH A; 2QDF A; 4ZOH C; 1FCC C; 1T0Q C; 1YN3 A; 2BYF A; 4F8C B; 2LVQ A; 1E6E B; 4ARC A; 3FKY A; 2LJI A; 3H7P A; 5GXG B; 2YEP B; 2MW5 A; 3PO0 A; 1ESF A; 2JU6 X; 3PTF C; 1NDD A; 3AXC A; 4HVB A; 3V62 A; 2DYB A; 3WAN A; 2N9L A; 3NZ3 A; 5IN7 A; 2K6Q A; 3X0W A; 3ZYY X; 5FKA C; 2C7M B; 1L5P A; 5IOI A; 1YD8 U; 4HDQ A; 4UDU C; 1HZ5 A; 1I42 A; 4XE0 A; 1UWX A; 4W9C A; 2BWE S; 3KUC B; 1YJ1 A; 2D11 A; 2RPV A; 2G3Q B; 1EU4 A; 4LJP B; 3ML9 A; 1L6V A; 3KQ4 A; 3AEC B; 2CR5 A; 1UGJ A; 4KGR A; 1MJD A; 3RNB C; 4TMA B; 3SFD B; 4K3C A; 1ZE3 D; 2BS3 B; 2W55 A; 2O2V A; 2BYE A; 4M0W B; 2JQR B; 1UUP A; 1YQ4 B; 3L0W B; 2KZR A; 3MJ5 A; 3DVN V; 1FNW A; 3HVD A; 4H2A A; 2MBQ A; 1YQB A; 5FR6 A; 4MEM A; 2GBN A; 1WY8 A; 5HI1 A; 4KKI A; 2D5G A; 5J17 A; 4WAF A; 2KQS A; 3NVV A; 1SSN A; 4FXC A; 3E56 A; 3M3J A; 2KDE B; 5L83 A; 2ACZ B; 3PHW B; 2V4I B; 4IM2 A; 2I38 A; 1KM7 A; 2PTL A; 1WXS A; 3ONS A; 5JXV A; 2JUO A; 2GI9 A; 3I57 A; 3BII D; 3QWZ B; 1OEY J; 3AH7 A; 1WZ0 A; 3SEB A; 1XLO A; 4ZRI A; 3U52 E; 1E10 A; 5LXH A; 3KVF B; 4HRO A; 2UU7 A; 2LVO A; 2N0S B; 1P9D U; 4P1C C; 5CX3 A; 3MC8 A; 4ANX A; 2IO1 B; 2J42 A; 2MX2 A; 2X8X X; 1FNV A; 3NVY A; 2KKC A; 4KKJ A; 1TBE A; 1TIF A; 4B95 A; 2L05 A; 2PLP A; 4A8X C; 1N63 A; 3DOW A; 3Q3F A; 3PRE A; 1TS5 A; 3P4S B; 1TS2 A; 2MJD A; 1KLU D; 1YN5 A; 3DBH B; 3LJ3 A; 3NY5 A; 4GLS C; 1HE8 A; 2X38 A; 2R2O A; 4HXD A; 1EWY C; 4HPP A; 3WAP A; 4HK2 A; 1V49 A; 4TV3 A; 2AYO B; 1MVK A; 1AW7 A; 3OLM D; 3P42 A; 4XGA B; 5BYQ A; 2N1W A; 3BK2 A; 3ZXR A; 4ZRQ A; 4JIO U; 3ZNG C; 4NJ7 A; 1E8Z A; 3AUL A; 3BVZ A; 1LO5 D; 3UQA A; 3R2T A; 4O1N A; 3DBS A; 1C1Y B; 2FCQ A; 1IGC A; 2G9H D; 4NNJ B; 2L76 A; 1WXM A; 3V05 A; 3V60 A; 2ZEQ A; 3KH0 A; 2MBE A; 3NZS A; 2H88 B; 4YSX B; 2WXG A; 2GBK A; 1PGA A; 1F2R I; 2Y5B B; 4GDK B; 4IC7 B; 2KFJ A; 1WYG A; 2WDQ B; 1Q5W B; 4EE2 A; 3QCA A; 2RR9 A; 3L16 A; 3B9J A; 4DK5 A; 2N9K A; 2R2Q A; 4N6E B; 3IT4 B; 3A1Q A; 2D10 A; 3MHS D; 4MGI E; 3KYD D; 2H89 B; 1NBF C; 4PS7 A; 2K9X A; 4DXA B; 1N61 A; 2LZ6 A; 4MH8 A; 1RFA A; 4ACF A; 1N5W A; 3PRM B; 3VRB B; 3QAQ A; 5C3J B; 1T0Y A; 3TIX A; 1CZP A; 2G45 B; 3AE3 B; 1QOA A; 1WSP A; 1FCL A; 3ZRC A; 3NJT A; 4J6I A; 1XCT L; 2VZK B; 5HKH A; 3HUI A; 4WJN A; 1OQQ A; 5BYR A; 1NYQ A; 3W2D A; 2UYZ B; 3L08 A; 3N1Z C; 3I3T B; 5AZH A; 2PIA A; 1XT9 B; 3VTW A; 3UIP B; 3RZF A; 2Z0E B; 5C1Z A; 4M02 A; 2IJ0 A; 4KV2 A; 2A4Z A; 4LNK A; 4P16 A; 1K8R B; 4PS8 A; 3Q3M C; 1WH3 A; 2JZP A; 2KJR A; 3BK1 A; 3ZUN A; 4AQ7 A; 2ZNV B; 3WAM A; 3NOB A; 2V0G A; 2JRH A; 1J7C A; 3L13 A; 2K0P A; 3BZD B; 3BWU D; 1JCK B; 1L0Y B; 4RH6 A; 5LLI A; 2KN4 A; 3SDL C; 4GSW A; 4KIK A; 2WXR A; 4NJ6 A; 3DBH I; 2N4F A; 4HWI B; 3RNA C; 2M0A A; 2NCN A; 3JYU A; 2Y5C A; 4GN1 A; 3RN9 C; 4NZL B; 4RNA A; 2BF8 B; 4KDI C; 1WJ4 A; 2KDF B; 1XEE A; 2JYE A; 2KVR A; 3R2I A; 1L0X B; 3ZTC A; 2GBJ A; 4ZDV A; 1TKY A; 4IOI E; 4ZRJ A; 4K3B A; 3T3N A; 2CU3 A; 2LXC A; 2K39 A; 2JVC A; 1IUE A; 1TZ1 A; 3PS6 A; 1L2N A; 1MFW A; 2AQ3 B; 3Q8A A; 1WMH B; 1TT5 B; 2HJ1 A; 4I6N B; 1VDV A; 4QAY A; 1QKZ A; 2N9X A; 2DYM A; 2KMM A; 4K7S A; 1C78 A; 2LWP A; 2LHD A; 2NBW B; 3GS2 A; 1RWS A; 5KHO A; 5EE3 A; 5AUK A; 2QMT A; 3M95 A; 2HE7 A; 4C7Z A; 2WDT B; 1TTN A; 4LNN A; 4S17 A; 1MI0 A; 1UH6 A; 4JGH B; 2CHX A; 2ZVO A; 2DBY A; 2I1J A; 5IAA C; 2FCN A; 3ZRF A; 3VTU A; 4IKG A; 2OHF A; 3LB8 C; 3Q14 C; 4BKT A; 3PRP B; 2JRI B; 5E6N A; 3GP7 A; 2BB6 A; 3ZGZ A; 4TKN A; 1DOX A; 5G55 A; 4ASW C; 1V86 A; 1KLG D; 1LFD A; 1GC6 A; 3X23 A; 3NS1 A; 2IY0 B; 1AN8 A; 4TQ1 A; 4US9 A; 4RM8 A; 4KGT A; 1WGH A; 2FCM A; 2D3A A; 3FIL B; 1FMA D; 2W3S A; 2Y5P A; 3Q3N C; 2LUM A; 1QOF A; 4W9L A; 3QX1 A; 4NY0 A; 3JSV A; 3GOE A; 4KZC A; 2WXJ A; 4A3P A; 2ZVN A; 3NRZ A; 5IA7 A; 2PE6 B; 3GE3 C; 3SR6 A; 1SF0 A; 4JX1 C; 2KLG A; 4MH0 E; 3AE9 B; 4G11 A; 2WX1 A; 1UZX B; 1C76 A; 3V6E B; 3VXW A; 3AN1 A; 2KC2 A; 3JVZ X; 1SE4 A; 3KLS X; 3EHV A; 2TSS A; 5E6O A; 5H8Y E; 3R7Q A; 3Q8B A; 1I4Q A; 4RCO A; 3BYT B; 3B08 A; 2MBO A; 5JHB A; 5L95 C; 2BB5 A; 1OEY A; 3ZNZ B; 4KX6 B; 1VR9 A; 3VRA B; 2INP E; 2NVU I; 1JRU A; 3AMZ A; 1D3Z A; 4LDT B; 3KWL A; 2WXM A; 3UIN B; 1OTR B; 2BQQ A; 3HHM A; 3PVL A; 3PPA A; 5AEK B; 2ONQ A; 2DEN B; 2BPS A; 3RNC C; 1ZPS A; 1WF9 A; 1WRI A; 1RFK A; 3AB5 A; 3W1Y A; 3ZDM C; 3RNG C; 2B3A A; 2LJ5 A; 2G4S A; 5D94 A; 1GC7 A; 3OAW A; 4RGO S; 1UF0 A; 4YT0 B; 3IVF A; 2BGF A; 4BKS A; 5T8I A; 2KWU B; 3P1M A; 4MJS B; 5CHV C; 1S1Q B; 2KTR B; 1H4R A; 3VTV A; 4FN2 A; 2WXQ A; 1WE6 A; 4Q2J A; 4DHZ E; 3PT2 B; 2KX0 A; 4JQW C; 4OHJ A; 1SB3 C; 2NS5 A; 3K9O B; 4HEA 1; 1A70 A; 1ISN A; 1CJE A; 3Q6B A; 3QJZ A; 3WIM A; 1XF5 L; 2WXF A; 2KK8 A; 1K53 A; 4MM3 A; 4WIP A; 2QJL A; 2JWU A; 4C4V B; 3DDC B; 3A9K A; 2WGS A; 3UF8 A; 3R66 C; 1HA5 A; 1I4H A; 4WWO A; 3TCA A; 2Z8L A; 3Q69 A; 1TYG B; 3A9J B; 2JXT A; 3H1U A; 1PFD A; 3APF A; 1P0R A; 2WHI A; 3H9D A; 4GDL B; 2XN9 C; 2ZZP B; 2A5U A; 5H92 C; 2K1F A; 1V80 A; 3PV1 A; 4A6Q A; 1JAL A; 2FUG 1; 4XDD A; 2MLB A; 2RMM A; 2KWD A; 2K6D B; 1TKE A; 1MG4 A; 1WXQ A; 1WGD A; 3VH3 B; 2WP9 B; 1P7F A; 2NR2 A; 2MRP A; 4F7Z A; 1PQS A; 3AV8 A; 2DHZ A; 2BYV E; 3U7D A; 2OOB B; 1JQ4 A; 2DX5 B; 4BKS D; 5AZF A; 3JW0 X; 2ZW1 A; 4HDO A; 3VHT C; 4DXF A; 3P63 A; 4NAW A; 4B0M A; 1ZOY B; 2BS4 B; 3TL5 A; 3N32 A; 1KLV A; 3SD5 A; 2QC8 A; 3ZW3 A; 2D3B A; 3VFK A; 2RDH A; 2D07 B; 4LTU A; 1AYF A; 3NZU A; 2KJH B; 3MC0 B; 1XXG A; 1ZDX A; 1IPG A; 2LI5 A; 2PKO A; 2JZ3 B; 2C7H A; 2BVC A; 4PYU A; 5FK9 C; 1JWS D; 1YJJ A; 3MHZ A; 2IDY A; 4DHZ B; 2JX5 A; 2WLB A; 5TSS A; 1EWC A; 2WXP A; 4BKG A; 1L7Y A; 3ZTD A; 4LNO A; 3EFC A; 1TZO A; 1P98 A; 2N7J A; 3OJ3 A; 2G4D B; 4B9K A; 1GUA B; 3U7Z A; 3W9C B; 2LFI A; 1FM0 D; 3ALB A; 4P1B C; 2KTF A; 2CJN A; 3TEY A; 4KVG B; 2KVZ A; 3DPD A; 4RF1 A; 3Q8E A; 5DPT A; 4DQO C; 4DDG D; 4KIK B; 3H6N A; 2GLS A; 1BML C; 1WX7 A; 1SGH A; 4WWN A; 4GOC A; 3RCZ A; 1SEB D; 1WJU A; 5EDS A; 3RPF C; 4IW0 A; 4KSK C; 1I4P A; 2J7Q B; 4OZB A; 1GJZ A; 2LRU A; 5IP4 D; 3LDZ E; 2GBM A; 3Q8F A; 2L8J A; 2KQ4 X; 3K9P B; 3SHQ A; 4W9I A; 4HCP B; 1J8C A; 1VJK A; 1QOB A; 2K8B A; 1E7P B; 2XK5 B; 5D3I B; 1RAX A; 2QEJ C; 2KX3 A; 1WXV A; 2WX0 A; 2M56 B; 1E8Y A; 2KDB A; 4YTN B; 2KAJ A; 2JPH A; 2IGD A; 2W3R A; 1FEH A; 1D5Z C; 3CF6 E; 3P4Q B; 4GGQ A; 1BUI C; 1J19 A; 1I4X A; 1V8C A; 2E3T A; 1NEK B; 3Q2A C; 1LQB A; 4TUU A; 3RNF C; 1SIJ A; 2EKE C; 1UEL A; 4K7U A; 1V1P A; 1WX8 A; 1IBX B; 2BTE A; 1UWM A; 3AU5 A; 3UI3 A; 1WIA A; 4FUL A; 2WWZ A; 1H8C A; 3IHP C; 3OG5 A; 2KFK A; 1ZP0 B; 2L1A A; 1UGM A; 2RDB C; 3HM3 A; 5J18 A; 1PGX A; 3BIN A; 2WU2 B; 1AAR A; 1SXT A; 2WDV B; 3V3X A; 4WAA A; 3BYY B; 1XCQ L; 2K8C A; 1LGR A; 3UIO B; 4LLG M; 5E6J A; 2PVG C; 4W9H A; 1RLF A; 4IG7 B; 1JWB D; 4M01 A; 3N20 C; 2KMA A; 1M4V A; 1T5X D; 2WU5 B; 5FR3 A; 2HDE A; 2WQY B; 2XEW A; 3ZO5 B; 1VZ7 A; 3P4R B; 4EFO A; 1E90 A; 4K1R B; 2NPT B; 4RF0 A; 1WGK A; 4EOY A; 4HKZ E; 1P1A A; 2C9W B; 3RNE C; 1Q1O A; 2Z0D B; 3AEF B; 3E9S A; 3QAR A; 1EO6 A; 3PLU A; 4FJV B; 3FAH A; 1D5X C; 2BWF A; 5E6P A; 1VLB A; 2XBB C; 2QSD A; 1UBI A; 1KRH A; 3MP9 A; 2MWS B; 3MTN B; 1GNU A; 2OED A; 1WZ3 A; 5D7G A; 1XO3 A; 2FNJ B; 3URY A; 1WR6 E; 3B0A A; 4OVU A; 4ZYN A; 3VUY A; 1KJT A; 3CWI A; 1VCB A; 1HEZ E; 1B1Z A; 2WXO A; 4A90 A; 1QF6 A; 2KC1 A; 4IWO A; 2KWC A; 1IGD A; 2BBC A; 3N9Y C; 1ZKH A; 1P3Q U; 3ZVV A; 4MGK E; 5HG2 A; 1N5X A; 1E7V A; 3IAM 1; 1K52 A; 1PGB A; 2M0X A; 2PE9 A; 1ZXI A; 2OJW A; 2L0T A; 1N60 A; 1GAQ B; 4USA A; 4C56 C; 2DAJ A; 3WA0 A; 5DPR A; 4JPS A; 3H8H A; 2LGX A; 5I4D A; 2J53 A; 2RPQ A; 1SBB B; 1L6U A; 1B9R A; 2YVC A; 2AEH A; 4G0N B; 2K3U A; 2JWZ A; 2VRR B; 4MM3 B; 1QOG A; 2IO2 B; 3EUB 2; 3PHX B; 1YNT E; 1D4B A; 3TEZ A; 3ABV B; 5LXI B; 1I4G A; 4NPN A; 2IGG A; 4W9J A; 3AE1 B; 5IKC M; 3U8Z A; 4C7Y A; 4RMA A; 1ENF A; 1PYW D; 4XWT A; 4N59 A; 2MP2 A; 2WXK A; 4HJK A; 1YIW A; 2IZV B; 2J4X A; 4MDK E; 3H7P B; 2XNA C; 3B2F A; 4BAX A; 4II3 B; 2WS3 B; 1VZ6 A; 1Z5S B; 4JWS C; 2IO0 B; 2WYQ A; 5CTR C; 3KUD B; 2C5L C; 3M62 B; 3BVG A; 3GB1 A; 3TBL D; 1T0R C; 3IG3 A; 1UNS A; 2KT7 A; 3ZJU A; 1FFU A; 2LGI A; 1WYW B; 4AP4 C; 2JY6 A; 3BY4 B; 2L7R A; 2QCZ A; 2W9N A; 4HPM B; 1NI2 A; 1FRR A; 3AEA B; 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5EE0 A; 1NVI D; 2EMT A; 1E7U A; 4RFB A; 1K51 A; 1HTQ A; 3V61 A; 3AE4 B; 2CJO A; 4II2 B; 2PMV A; 3AE6 B; 4MAC A; 4GXB A; 2FAZ A; 1HZ6 A; 2NTS A; 4YL8 A; 3GZN I; 4US8 A; 1SE9 A; 1UBQ A; 1I7H A; 1WGG A; 2CU1 A; 5JHA A; 3N1X C; 4ZRP A; 4YSZ B; 1P7E A; 1ZDV A; 2O6V A; 3R8B A; 3ML8 A; 2QHO A; 1WE7 A; 3OWE B; 1ZUD 2; 4AJW A; 3S2A A; 1OQY A; 4HPL B; 4XC2 A; 2BT6 A; 1NEN B; 5C23 A; 2DWQ A; 1ET9 A; 3QC8 B; 2L00 B; 4XWW A; 2BW2 A; 1R7S A; 3DVN U; 3ZNH B; 1MHX A; 1JWM D; 1E8X A; 3J9C A; 3ZDT A; 3EC8 A; 1OQR A; 1XLN A; 2L32 A; 2MBH A; 5D3D A; 1YJI A; 4IWQ A; 5KHQ A; 4FHJ A; 4GB9 A; 4MSQ B; 3NUH B; 4A20 A; 4XZ4 A; 2KXJ A; 2K25 A; 3V6C B; 1QT9 A; 2LGD A; 3A1Q B; 4G50 A; 5CHF A; 2MA9 B; 1QLB B; 1I35 A; 4BOS C; 3APD A; 5G2N A; 2VZK D; 5AZG A; 1WMH A; 2ZPN A; 2V9H A; 1WX9 A; 4XYC A; 3TJP A; 2KJ6 A; 3SU8 X; 3DBR I; 1LXD A; 3ZLZ A; 3I9V 1; 3MFG A; 3AM9 A; 2OJR A; 4EUT A; 1IYF A; 1QIL A; 2AL6 A; 4ANV A; 4ITK A; 2RSU A; 2C7N B; 1X1M A; 3PZD A; 2D2Q A; 3KYC D; 1FO4 A; 1XQQ A; 4CHK A; 4GMV A; 2DZM A; 1PDX A; 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