The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
4
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sequence length |
66
|
structure length |
66
|
Chain Sequence |
MNVTVEVVGEETSEVAVDDDGTYADLVRAVDLSPHEVTVLVDGRPVPEDQSVEVDRVKVLRLIKGG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
solution structure of ubiquitin-like small archaeal modifier protein in Haloferax volcanii
rcsb |
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Haloferax volcanii
|
| molecule keywords |
Small archaeal modifier protein 2
|
| total genus |
4
|
| structure length |
66
|
| sequence length |
66
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-09-01 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LJI A; 2L32 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2D5G A; 4WAA A; 2D11 A; 3BY4 B; 4J6I A; 2YLM A; 2WXN A; 3W1Y A; 1TTN A; 3ZDT A; 3RN9 C; 1EU3 A; 3RZW C; 2ZJD A; 5LNK 1; 2NBU A; 1SJE D; 2IGH A; 5IN7 A; 3RPF C; 2WXL A; 2J0J A; 4FJY A; 2K9X A; 4B9K A; 4M0W B; 3R7Q A; 1YMH E; 3HUI A; 1TIF A; 2Y5P A; 4XDD A; 1QZE A; 2WXH A; 1WGH A; 3AU4 A; 2QEJ C; 2GB1 A; 4FLH A; 1V81 A; 3KWL A; 4L23 A; 4W9G A; 2RSU A; 3VUW A; 2WXR A; 3Q8A A; 3I57 A; 1SGH A; 1MHX A; 3IAM 1; 2W55 A; 1VJK A; 2IJ0 A; 3GE3 C; 1UUP A; 1WI0 A; 4ANV A; 4ZHO A; 2OOB B; 3GB1 A; 3I5J C; 3QQ8 B; 2NCN A; 4M01 A; 4A55 A; 3LJ3 A; 1XF5 L; 4FAD A; 4KGT A; 2N9K A; 2J42 A; 2J4X A; 4X57 B; 4IM3 A; 1ET6 A; 2JWZ A; 2L0T A; 3AV8 A; 3Q3M C; 3AMZ A; 3A9K A; 3Q14 C; 2KTR B; 3DBH I; 2CR5 A; 1KLU D; 1E9M A; 4BOS C; 2CJN A; 3DVN U; 3CIR B; 2QDF A; 2N7J A; 4HJG E; 1YN3 A; 4EE2 A; 1KOT A; 3Q2A C; 5FK9 C; 1VZ7 A; 3ZKJ C; 2LUE A; 1RM6 C; 4IWP A; 3AEE B; 1WGD A; 2LZ6 A; 3ZTD A; 1KRH A; 1L4D B; 2FCM A; 4KIK A; 4C7Z A; 1FCC C; 3PPA A; 3UIP B; 4N9F 4; 2KNB A; 2PJH A; 5EE9 A; 4MH0 E; 1A70 A; 4JPS A; 4QAY A; 3BK2 A; 2BPS A; 1K53 A; 3BWU D; 2CHW A; 5DPR A; 1NEK B; 2DHZ A; 3RUI B; 1UH6 A; 3LYY A; 1QOB A; 1KM7 A; 1UZX B; 3NZU A; 4RGT A; 2KC1 A; 3A4R A; 4HPL B; 2N1W A; 3AI5 A; 2KDM A; 2LEK A; 3TEZ A; 3M63 B; 2KQS A; 2KO3 A; 1I4G A; 3QAQ A; 3W1S C; 4JL9 A; 5BO4 B; 2LJI A; 3LDZ E; 3UQA A; 3DBH B; 3UI3 A; 4ZHP A; 1FFV A; 4TQ1 A; 3GZN I; 3MHS D; 5DPW A; 3MFG A; 1GG3 A; 2DEN B; 1V1O A; 1WZ0 A; 1GUA B; 1YQB A; 2LFI A; 3CF6 E; 3Q6B A; 2D3B A; 2K0P A; 3TMP B; 1LQB A; 4YTN B; 1E8Y A; 2N7D A; 2B76 B; 2KLC A; 5DPT A; 3WA0 A; 4P16 A; 3PLV A; 4KZ0 A; 1QOA A; 1Q1O A; 3AE1 B; 1YQ4 B; 2O2V B; 4BKS D; 1SEB D; 1D5Z C; 4EUT A; 2MEK A; 3DBL I; 3ETR A; 3U4E G; 5J2R A; 2GBJ A; 2ZEQ A; 3ZJT A; 1K52 A; 1BT0 A; 1XT9 B; 3W5V B; 5D7G A; 1FXT B; 3VAW A; 2LUM A; 1T0Q C; 3VTV A; 1NYR A; 1J7A A; 1ZDV A; 2LD9 A; 3P2B A; 2MQJ A; 3Q8F A; 1T5X D; 2LJ5 A; 3T3O A; 1IBX A; 1K50 A; 4ACF A; 3PRP B; 2LXC A; 2K6Q A; 2KXJ A; 3QK0 A; 2IGD A; 4RM9 A; 1YX6 B; 1TZ1 A; 2D07 B; 1P0R A; 2IDY A; 3GZN B; 2A4Z A; 1U4A A; 4AWJ A; 3T3N A; 3SDL C; 2V4I B; 1J7B A; 1Q10 A; 4DXG A; 4XE0 A; 1ZDX A; 4C4V A; 1JQ4 A; 1WRD B; 4W9C A; 5CTR C; 4GXB A; 3DVN V; 3EA6 A; 3P63 A; 4OVU A; 1FRD A; 1L7Y A; 4XZ4 A; 3OWE B; 4KVG B; 1T0R C; 2AYO B; 5L95 C; 1QIL A; 2WP9 B; 2DAJ A; 1WJ6 A; 3PRM B; 3DBL B; 4AJW A; 1QT9 A; 1DOX A; 4KSL C; 2NVU I; 4MH8 A; 2N7E A; 4L2Y A; 2FID A; 4JWU C; 3Q69 A; 2KDB A; 2K8B A; 1C78 A; 1TGZ B; 4I6P A; 2FNJ B; 2GBK A; 3PTF C; 3PGE A; 1MG8 A; 2LGY A; 2KKC A; 2W82 A; 5CHF A; 2IPK D; 2BKF A; 4HKQ A; 2L52 A; 1EWY C; 3BK1 A; 2XN9 C; 3AXC A; 1WJ4 A; 4II2 B; 2LI5 A; 5TR5 A; 5C2T B; 2DZJ A; 3QCA A; 4XC2 A; 1I35 A; 3KVF B; 3WAM A; 4F8C B; 1Z5S B; 2BT6 A; 5LXI B; 2GLS A; 3N3K B; 3FC4 A; 3K9O B; 3UGB B; 3V61 A; 1L4Z B; 4KKJ A; 2QMT A; 3VFK A; 1C77 A; 5BMG A; 4NAM A; 2NTT A; 3I9V 1; 4US8 A; 2WS3 B; 2LHD A; 2WYQ A; 4W9L A; 3JSV B; 4MEL A; 1WXM A; 1HEZ E; 3AE2 B; 3V3X A; 1XD3 B; 3FIL B; 2ZW0 A; 3Q3N C; 2EKE C; 3OAW A; 2G4S A; 4TUU A; 3MTN B; 3ZO5 B; 5BYS A; 2INP E; 4K7U A; 4YWG G; 4W9J A; 1GAQ B; 1XXG A; 2WXF A; 1V1P B; 1S1Q B; 1KTK A; 2M17 A; 2WXJ A; 1XLQ A; 4NJ6 A; 2BYT A; 4RF0 A; 3BVM A; 3R3M A; 1XQQ A; 3V6C B; 2M8S A; 4CO7 A; 2KFJ A; 2IO3 B; 4W9E A; 3AE6 B; 1VZ6 A; 1ZUD 2; 4LJO B; 4DXA B; 4NJC A; 3QC8 B; 2EEL A; 3RNF C; 5MPO A; 1WR6 E; 1M94 A; 1PGB A; 5G5G A; 5KHQ A; 2D10 A; 3P4S B; 3B2F A; 3U7Z A; 5JH5 C; 2RDG A; 1IGD A; 4RMA A; 2V3P A; 1D4B A; 2DYB A; 5E6P A; 1D3Z A; 2MW5 A; 5EE1 A; 1JAL A; 1WXV A; 2WX0 A; 4C80 A; 4FHJ A; 5TSS A; 1J19 A; 2WXO A; 2KDI A; 3X23 A; 1LGR A; 1OGW A; 1MI0 A; 1IYF A; 4JIO U; 3AE4 B; 1WIA A; 3CSF A; 4HLE A; 2NBW B; 4G0N B; 5H92 C; 1JML A; 5EE3 A; 2PTL A; 2DZI A; 2UWQ A; 4LNO A; 4ARC A; 3VRA B; 3ENE A; 1BUI C; 2OJR A; 4WWN A; 1TZO A; 4NQK E; 3TEY A; 3L0W B; 4KDI C; 4ANU A; 1I4R A; 1WXQ A; 2Z8L A; 3J9C A; 4ZRQ A; 2PKO A; 1IBX B; 1SE2 A; 3VXW A; 3ZNG C; 1C76 A; 4HDO A; 4PS7 A; 2A5U A; 1N5W A; 3DBR I; 5G55 A; 3UIO B; 4S0R A; 1F77 A; 3HIZ A; 1V2Y A; 4HRS A; 3HK0 A; 1WGR A; 1WX7 A; 1T6B X; 2KYW A; 2RPV A; 3ABV B; 5E6J A; 2Z0E B; 1YX5 B; 4A3O A; 5FR3 A; 2REX A; 2KOX A; 2M4N A; 1KF6 B; 3W9C B; 1J0G A; 1AW7 A; 1PGA A; 2JXT A; 2V4L A; 2MHJ A; 2K8H A; 3VTW A; 4J3O D; 1OQQ A; 4WUR A; 4B0E A; 3B9J A; 3K9P B; 3OG5 A; 4C56 C; 2L8J A; 3OJ3 A; 1V5T A; 4IW0 A; 2JRH A; 3SEB A; 3V60 A; 2Y5C A; 4ZDV A; 1XCQ L; 1V97 A; 2RDB C; 3O65 B; 1TS3 A; 2ZPY A; 4KGS A; 4LNF A; 2ZZP B; 3M62 B; 4EKU A; 2ZCB A; 1ROE A; 1YOV B; 2JT4 B; 3DBS A; 3H8H A; 3KYD D; 5KHO A; 4DK5 A; 1D5X C; 1SSN A; 3AEA B; 3RD2 A; 2XK5 A; 1XEE A; 3P42 A; 2LAS A; 1YQ3 B; 2HDE A; 1YN5 A; 4OZB A; 2BB5 A; 3Q3J A; 2ASQ A; 1ZP0 B; 4YSY B; 3DBR B; 4ARI A; 1C9F A; 1P7E A; 4WH4 A; 1OFF A; 3PZ7 A; 2FUH B; 1R4M I; 1N62 A; 1N61 A; 3WCQ A; 4WJQ A; 3U30 A; 2N1V A; 1WJN A; 1WM2 A; 4LLG M; 2XEW A; 3ZTC A; 1FD6 A; 1JWU D; 3MC8 A; 1HTO A; 4HCN B; 1WYW B; 4MEM A; 1PDX A; 1WYG A; 2JYE A; 2KK8 A; 3QHT A; 3NZS A; 4PK1 A; 1SE9 A; 1I4P A; 3DHH C; 4B0M A; 5CHV C; 1UWX A; 1NI2 A; 1XLP A; 2R2Q A; 2ZW1 A; 3WAO A; 2MP2 A; 3H7P B; 1TKY A; 3A4S C; 2VZK B; 1TS5 A; 3TBL D; 2ONQ A; 4AS1 A; 1KJT A; 3ZNI D; 2Y3A A; 2KX0 A; 1UWM A; 4RM8 A; 2JZZ A; 1IP9 A; 3R66 C; 1IPG A; 2Y5B B; 1XO3 A; 3P4R B; 2NS5 A; 1HZ5 A; 4ASW C; 3RNE C; 1WY8 A; 4IM0 A; 4RFB A; 1R4M B; 2DZM A; 1YD8 U; 3PV1 A; 1K51 A; 3L10 B; 2Z59 B; 3AE7 B; 4GOC A; 2K6D B; 3AH7 A; 3MHZ A; 1OEY J; 4BKG A; 2HE7 A; 3SFD B; 2W54 A; 2VZK D; 1F1H A; 2QIE B; 2C7N B; 4MT5 A; 5C1Z A; 2CJO A; 3ZGZ A; 4XDC A; 3RNC C; 4F7Z A; 4E74 A; 3D32 A; 2NR2 A; 2PIA A; 5HI1 A; 2HTH A; 2QJL A; 1KLG D; 2KWD A; 4ZRI A; 3H1U A; 5GXG B; 3HVD A; 5BMI A; 4GDL B; 1LM8 B; 5HKH A; 2LGI A; 3AE3 B; 4MGK E; 5D6J B; 4FUL A; 3QIJ A; 3QWZ B; 1ISN A; 1XLN A; 1UD7 A; 5D94 A; 4FA6 A; 3TIX A; 2CS4 A; 4FJV B; 4AJY B; 2KLG A; 4Q2J A; 2M19 A; 3C19 A; 1HTQ A; 1L2N A; 5EE0 A; 3B0A A; 1UGJ A; 2L3Z A; 2IGG A; 4E3C A; 1WMH A; 2LVO A; 3VRB B; 2FAZ A; 1E6E B; 1FFU A; 2IY0 B; 2UYZ B; 5AUK A; 4RGO S; 4HCP B; 1EUV B; 3VR8 B; 5C3J B; 1GPX A; 3ZVV A; 2JYT A; 1H4R A; 1FM0 D; 3L13 A; 5J17 A; 1RRB A; 4ANX A; 2DWQ A; 2HTM E; 2HJ8 A; 4G50 A; 5AZH A; 4OHJ A; 2WGS A; 1RFA A; 1GB4 A; 5IAA C; 3WIM A; 4OZC A; 2W9N A; 2MLB A; 3APD A; 4IKG A; 2WWZ A; 1R7S A; 2KWV B; 4IM2 A; 5DCN A; 5JHB A; 3N1X C; 4D2K A; 2DBY A; 1UF0 A; 2C5L C; 1FXA A; 2E6X A; 2W3R A; 3PO0 A; 1WR1 A; 3RZF A; 1NYQ A; 3MC0 B; 2UU7 A; 4MM3 A; 1DGJ A; 4IOI E; 4YTP B; 4II3 B; 1WM3 A; 4REZ A; 1JCK B; 2M0X A; 1AN8 A; 2GBM A; 2GI9 A; 4YT0 B; 2IY1 B; 5G5H A; 1BXT A; 3HHM A; 3A1Q A; 2ICI A; 2WHI A; 3QAR A; 2WDV B; 2KT7 A; 1V9J A; 1QOG A; 4L1B A; 4DHZ B; 4RGM A; 2MBQ A; 3AEB B; 3IG3 A; 2PVG C; 1CZP A; 1YIW A; 3PLU A; 2KWU B; 3NG0 A; 2I38 A; 1I4H A; 3R7R A; 3URY A; 4YSX B; 1ZPS A; 4B6W A; 1Y8R C; 4HRO A; 4HEA 1; 3AU5 A; 3UIN B; 1DOI A; 3V62 A; 4N6E B; 3KW5 B; 4NPN A; 3NRZ A; 3HRD D; 4BKT A; 5E6O A; 2KMC A; 2L83 A; 3PSE B; 2KWC A; 2WXK A; 1WZ3 A; 1I4Q A; 2KC2 A; 1UGM A; 1TBE A; 3DHG C; 3BZD B; 3B1L X; 2PEA A; 4NNJ B; 3ZIM A; 1A5R A; 1WFY A; 2EMT A; 3UQB A; 2PLP A; 3VDZ A; 1TS2 A; 2IND C; 3KUZ A; 4GGQ A; 2VH2 A; 3AM9 A; 2JSV X; 2LXA A; 3IVF A; 2DYM A; 2M56 B; 5BMH A; 1AAR A; 2LRU A; 3MJ5 A; 1V86 A; 2GMI C; 1CK1 A; 3VQI A; 3GS2 A; 3ZRC A; 3BVZ A; 3A9K B; 4BOZ B; 4WIP A; 2BS2 B; 2MBE A; 1ESF A; 3I63 C; 3DQV A; 2FIF A; 2AL6 A; 3RYT A; 1S3S G; 3EUB 2; 2L1A A; 5IO9 A; 4EZK A; 1FPY A; 5FR6 A; 3ZYY X; 2AEH A; 2BYF A; 2MSE D; 1QKZ A; 3JVZ X; 2YEP B; 2JU6 X; 5LLI A; 2GRI A; 1G6J A; 1UEL A; 4HK2 A; 1JWM D; 3NOB A; 4OZA A; 1WX8 A; 3PHW B; 4KIK B; 4F1S A; 1MFW A; 2WXM A; 1N6Z A; 2L00 B; 4WWO A; 2BVC A; 3AEF B; 4IG7 B; 4C00 A; 2PE6 B; 3L16 A; 4HWI B; 4PS8 A; 3GOE A; 1QQR A; 4TV3 A; 1CMX B; 4K3C A; 4ZRJ A; 4M00 A; 1QF6 A; 2KAN A; 3TCA A; 3JW0 X; 3U52 E; 2K8C A; 1OQY A; 2WU2 B; 2KZR A; 2ACZ B; 2RR9 A; 5L83 A; 2X8X X; 1EF1 A; 4WJN A; 1P3Q U; 1WE7 A; 3L54 A; 4A3P A; 2IO2 B; 3SR6 A; 1JRU A; 2JX5 A; 1D6E C; 4C7Y A; 1V80 A; 2MJ3 A; 4B95 A; 1HQR D; 5AZG A; 1E7V A; 4OVZ A; 3NVV A; 3OJ4 B; 3DOW A; 3AB5 A; 3A9J A; 4PT5 A; 2DNF A; 3E56 A; 4GSW A; 1J8C A; 4GU2 A; 4JQW C; 3R8B A; 2IO1 B; 4A8X C; 4EFO A; 2W3S A; 3KYC D; 5HFY A; 1MJD A; 4G11 A; 4JE3 B; 2TSS A; 3B08 A; 3IHP C; 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2EKI A; 2V0G A; 2K25 A; 2IYD B; 4KKI A; 3R2I A; 4IWQ A; 4MSQ B; 1JRO A; 1M4V A; 4BZA A; 2JZP A; 1GC7 A; 2RMM A; 3NVY A; 2JF5 A; 4JX1 C; 3PRE A; 3U8Z A; 2ZPN A; 2FCS A; 2J52 A; 3DCG A; 2WDT B; 2BB6 A; 4DBG A; 2KD0 A; 2WU5 B; 4WAF A; 1NDD A; 3M95 A; 2KAJ A; 2AWT A; 2CKH B; 3H6N A; 2MH7 A; 4JWS C; 1FNV A; 3W5U B; 4HJK A; 2LRW A; 2JVC A; 2MWS B; 1WGY A; 4DHZ E; 2PMV A; 4ICV A; 1V8C A; 4DHJ D; 4FXC A; 4BAX A; 4YSZ B; 3N20 C; 4A90 A; 1CJE A; 4NAW A; 2VRR B; 1WSP A; 2I2Y A; 2MA9 B; 2L05 A; 3VR9 B; 1OEY A; 1I42 A; 4OW0 A; 4EOY A; 4MJS A; 2AL3 A; 4PYU A; 1V6E A; 3VVW B; 1JWB D; 3VH4 B; 2FCQ A; 2BGF A; 1P1A A; 3KUC B; 1KLV A; 4RF1 A; 3DHI C; 4TSS A; 2HJ1 A; 4KGR A; 1RFK A; 3A9J B; 5DPS A; 1VLB A; 5D3I B; 3P4Q B; 3S2A A; 1E8X A; 5LXH A; 1QLB B; 2M1M A; 3HM6 X; 2NBV B; 3AUL A; 2BBC A; 2G4D B; 1F52 A; 3CST A; 1YJ1 A; 1ENF A; 2EMS A; 2R2O A; 2JUO A; 2MJD A; 1WE6 A; 3IXS A; 2PE9 A; 4UDU C; 1EF5 A; 1GJZ A; 4W9D A; 4DQO C; 2RDH A; 2R61 A; 4ICU A; 3BIN A; 1EU4 A; 1L6V A; 1VCB A; 2BYV E; 2BQQ A; 3MJW A; 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