The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
MQYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Ultrahigh resolution protein structures using NMR chemical shift tensors.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
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| molecule tags |
Protein binding
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| source organism |
Streptococcus sp. group g
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| total genus |
14
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-07-26 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1K53 A; 1KH0 A; 1K52 A; 1XCT L; 4D2K A; 2OED A; 2I2Y A; 2LUM A; 4IOI E; 5HFY A; 1MI0 A; 1K51 A; 1YNT E; 2LHD A; 4GLS C; 2N9L A; 5JXV A; 1IGC A; 4OZB A; 1P7F A; 1MHX A; 2KAC A; 2KN4 A; 1IBX A; 1HZ6 A; 3UI3 A; 1C9F A; 3FIL A; 5HHD G; 2ZW1 A; 4IKG A; 1YMH E; 1HZ5 A; 5BMG A; 3GB1 A; 4WH4 A; 1PGB A; 4KGS A; 2LHE A; 1PGA A; 2IGH A; 2N9K A; 2JU6 X; 1F2R I; 2KWD A; 1GB4 A; 1MVK A; 1XCQ L; 1XF5 L; 2LGI A; 2J52 A; 1EM7 A; 2RMM A; 1GB1 A; 2QSD A; 2KQ4 X; 2J53 A; 2NMQ A; 2N7J A; 4HJG E; 2JSV X; 2JXT A; 2JZP A; 2GB1 A; 2GI9 A; 2ONQ A; 2I38 A; 2QMT A; 2ZW0 A; 2PW9 A; 1HEZ E; 4OZA A; 1FCL A; 2JWU A; 1F2R C; 1PGX A; 1MHH E; 1QKZ A; 5HG2 A; 2EEL A; 1IBX B; 5BMH A; 3V3X A; 3FIL B; 4HKZ E; 4MAC A; 2KDM A; 1FCC C; 2PLP A; 1IGD A; 4KGT A; 5BMI A; 4OZC A; 2PTL A; 3MP9 A; 1D4B A; 2RPV A; 2ON8 A; 2IGD A; 1P7E A; 5HI1 A; 1Q10 A; 1UWX A; 2K0P A; 1JML A; 4KGR A; 1FD6 A; 1MPE A; 2IGG A; 1K50 A; 1ZXH A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4W9G A; 2GRI A; 3C19 A; 1XCT L; 3OAW A; 5IA7 A; 4HPL B; 1C4P A; 3RUL A; 2D3G A; 1GAQ B; 3VFK A; 2Z0D B; 4CYE A; 3V61 A; 2L0T A; 1L6V A; 2LZ6 A; 4GN1 A; 1ZP0 B; 3AED B; 4FN2 A; 5LNK 1; 1T5X D; 3MC8 A; 3DHH C; 1T0R C; 2WGS A; 1TT5 B; 2KQS A; 3RNG C; 1AW7 A; 2W3R A; 3ML8 A; 3WAL A; 4YSX B; 2HE7 A; 1TKY A; 2JU6 X; 5D7G A; 1P98 A; 3RD2 A; 1XCQ L; 1N63 A; 2PE9 A; 1KLV A; 3EFC A; 5AZG A; 1L2N A; 5J2R A; 1GC6 A; 1I4Q A; 3ZJT A; 1VZ8 A; 2O6V A; 4OVZ A; 4WAF A; 3AE3 B; 4ZOH C; 1R4N B; 1V6E A; 1WI0 A; 4LJO B; 2VZK D; 2W9N A; 3AM9 A; 2M4N A; 3AXC A; 3SD5 A; 1C79 A; 3SU8 X; 2WDQ B; 2MP2 A; 1I42 A; 1UGJ A; 1EU3 A; 4KSK C; 3Q2A C; 2K6D B; 1G6J A; 2LFI A; 2KT7 A; 3MHZ A; 2NS5 A; 3HIZ A; 2JVC A; 1SE9 A; 4IM2 A; 2DWQ A; 1DOY A; 2LVO A; 3NVZ A; 1IPG A; 2MWS B; 2I2Y A; 3SDL C; 1I4R A; 1XLO A; 1ZDX A; 2KVR A; 4W9L A; 3V6E B; 3LB8 C; 2L05 A; 3U7Z A; 1NEK B; 2MBB B; 1LXD A; 3V62 A; 1V80 A; 3BII D; 2K8B A; 2WQY B; 5G55 A; 3UGB B; 3L08 A; 4B0E A; 3SHQ A; 1UGM A; 3VDZ A; 4W9C A; 3ZKJ C; 4F7Z A; 2BWE S; 3NJT A; 4DBG A; 2RDB C; 1I4G A; 2L1A A; 2GLS A; 3VH3 B; 1ESF A; 4EOY A; 2FCN A; 3APF A; 4TUU A; 2J52 A; 2BW2 A; 4GXB A; 1EU4 A; 1E8X A; 4WQM A; 2ZNV C; 1YX5 B; 1RM6 C; 2LXA A; 4HJG E; 1I4X A; 1AWD A; 3RFZ B; 4XDC A; 4KIK A; 1I4P A; 4BVU C; 3AU5 A; 2C60 A; 2JWU A; 1L0X B; 3ZNI D; 4AOF A; 2LGX A; 4X57 B; 2WNM A; 2EMT A; 3IT6 B; 2CU1 A; 1KJT A; 2BKR B; 1E7P B; 2DYM A; 2BWF A; 5AZF A; 5HKH A; 1FXA A; 2KD0 A; 2REX A; 1KTK A; 3N3K B; 4RGO S; 2YLM A; 4JWS C; 4GDL A; 4MGZ E; 3NRZ A; 3M3J A; 3MFG A; 1P9D U; 2M56 B; 4G50 A; 3NZU A; 4PS3 A; 2ZZP B; 4XC2 A; 1I4H A; 2L32 A; 3DCG A; 3W2D A; 3BVM A; 1JRO A; 3L16 A; 3QWZ B; 3DVN U; 2Y5P A; 2E6X A; 3R3M A; 2BTE A; 4B9K A; 4XWW A; 1SJH D; 2LUM A; 3A9J A; 4BOZ B; 1WE6 A; 1Q1O A; 5MPO A; 4K7U A; 4DXA B; 2NR2 A; 1C3T A; 2L0F A; 3PSE B; 2G9H D; 4K7W A; 5IP4 D; 2N9L A; 4EEW A; 2R2Q A; 3KQ4 A; 4RH6 A; 2HJ1 A; 1IGC A; 2N0S B; 2PMV A; 3Q3M C; 3FIL A; 2ZW1 A; 2KFJ A; 3M63 B; 5BMG A; 1Q0W B; 4WJP A; 4E74 A; 4AJW A; 1XF5 L; 3UIN B; 1CQV A; 3C0R B; 1V9J A; 1V5T A; 4DHJ B; 2JX5 A; 1HQR D; 1L4D B; 2GB1 A; 2LXC A; 2QIL A; 1J7A A; 2FNJ B; 2D2Q A; 2KWU B; 5DPR A; 3T3N A; 1TY0 A; 1WH3 A; 2HDE A; 1CMX B; 4JL9 A; 2MCN B; 4AQ7 A; 4JX1 C; 4MH8 A; 1FRD A; 2XNA C; 2JPH A; 2BYV E; 2K1F A; 2R61 A; 4O1N A; 3BYT B; 4KVG B; 3B1L X; 1WJN A; 2YEP B; 2KWC A; 2VH2 A; 2KTR A; 4IM0 A; 1QT9 A; 3B08 A; 1P7E A; 2JYT A; 2OHF A; 2MW5 A; 1K50 A; 3Q8C A; 4ITK A; 4KX6 B; 5L95 C; 3IAM 1; 2KQ7 A; 2J0M A; 2B3A A; 1NEN B; 4MEM A; 4FJZ A; 4YTN B; 1N5W A; 2G4D B; 3TBL D; 4EZK A; 4BKS A; 2V1Y A; 3NOB A; 1TJE A; 3ALB A; 3N1Z C; 4E3C A; 3N30 A; 1HE8 A; 1V97 A; 2TSS A; 3BK1 A; 4YSZ B; 3MHS D; 3EUB 2; 2J7Q B; 3QX1 A; 4HXD A; 2BB6 A; 4NAW B; 3RI7 C; 3NHE B; 3L17 A; 4ANV A; 2J42 A; 4MH0 E; 2JYE A; 3DDC B; 2JQR B; 1I35 A; 5FR3 A; 1WR1 A; 2WXQ A; 1GPX A; 2E3T A; 5EE3 A; 2MBO A; 3NZ3 A; 2G45 B; 3W1Y A; 1FXI A; 2LGI A; 2C7N B; 2WDR B; 4DXF A; 1RYJ A; 4L2Y A; 1QLB B; 1SE4 A; 5AEK B; 2FE8 A; 1FM0 D; 5J17 A; 2X38 A; 1ISN A; 2MA9 B; 4MGY E; 1CJE A; 4YSY B; 1F2R C; 4EUT A; 3DWM A; 3NY5 A; 2WS3 B; 2EEL A; 4YT0 B; 5E6O A; 2LEK A; 2OJW A; 2MJE A; 5JH5 C; 2BPS A; 1FFV A; 5JHA A; 1TS2 A; 2PE6 B; 4MGK E; 3W5V B; 3KUC B; 3DHG C; 1WX9 A; 1SIJ A; 2ACZ B; 3PRM B; 2KTF A; 1X1M A; 2I1J A; 2V4L A; 4RCO A; 1YOV B; 3VVW B; 4NJC A; 4IWP A; 5G5H A; 2BYF A; 1J0G A; 5C3J B; 4IWQ A; 4P16 A; 1FFU A; 4LJP B; 1SXT A; 2KX0 A; 1M94 A; 2IYD B; 4CHK A; 1XXG A; 3CSF A; 1YN3 A; 4IOI E; 3ZIM A; 1FO4 A; 3VQI A; 1MI0 A; 2N1V A; 3CWI A; 2LHD A; 4GSW A; 2KMC A; 3ZDM C; 3I9V 1; 2MJ3 A; 5JXV A; 1PYW D; 2WYQ A; 2NPT B; 2OOB B; 3P2B A; 2KKC A; 3DVN V; 5JHB A; 1NI3 A; 2V3N A; 1GC7 A; 4M0W B; 3MC0 B; 1QOF A; 4C80 A; 1YJJ A; 3VRB B; 1HZ5 A; 4P7I A; 2LHE A; 2WXK A; 1YN4 A; 4IC7 B; 1DOI A; 4TV3 A; 4FBJ B; 2LVP A; 4JE3 B; 3HUI A; 1AAR A; 2KWV B; 1FIQ A; 1N62 A; 5E6P A; 2DNF A; 1SE3 A; 2JXX A; 3TUO A; 2QMT A; 3SFD B; 4ZRP A; 2WDT B; 1VCB A; 2A5U A; 1WGD A; 2IO3 B; 3A1Q A; 5FK9 C; 1N5X A; 4K7S A; 3Q3J A; 4DHJ D; 2RR9 A; 5BMH A; 2SEB D; 4ZDV A; 3NS8 A; 4K81 A; 4Q2J A; 4P1B C; 4W9K A; 4URK A; 5EE0 A; 4OVV A; 3ZDT A; 4KKI A; 2QIE B; 3ZO5 B; 1WFY A; 2WXI A; 1P0R A; 2V4I B; 3TMP B; 2ON8 A; 1HTO A; 1RFK A; 5IAA C; 1UWX A; 1KLG D; 1YD8 U; 2JZZ A; 1WZ3 A; 3V05 A; 2FUG 1; 1RLF A; 1ZE3 D; 1QF6 A; 4MDK E; 1PUT A; 1SGH A; 4PS7 A; 2AWT A; 3HM3 A; 1ZDV A; 4F1S A; 1JQ4 A; 1SF0 A; 2NCN A; 1WZ0 A; 4J6I A; 2AQ2 B; 1P7F A; 1IBX A; 4G11 A; 4WWP A; 2MSE D; 3KYC D; 3EA6 A; 4M01 A; 4IKG A; 5E6J A; 1UNS A; 5DPS A; 1PGB A; 3HHM A; 3OWE B; 4USA A; 3DWG C; 3ETR A; 5KHQ A; 2MHJ A; 4C7Z A; 2BQQ A; 4W9I A; 3A9K A; 4GMV A; 1F9J A; 4KZ0 A; 5DCN A; 2D11 A; 3P4Q B; 1UD7 A; 4MSQ B; 3NS1 A; 2XK5 B; 3UF8 A; 3ZXR A; 2BS3 B; 2N7E A; 2Z0E B; 2IO2 B; 4AS1 A; 2PVO D; 1EF5 A; 1V1P B; 1SEB D; 2BB5 A; 3JVZ X; 2QSD A; 2LWP A; 2PVG C; 3AE4 B; 3N1Y C; 2NMQ A; 3P42 A; 5H92 C; 1FEH A; 2GBR A; 3C8Y A; 2LJ5 A; 3S2A A; 3NVY A; 4MM3 B; 4MJS A; 2I38 A; 1N6Z A; 4RFB A; 3TEW A; 3PRE A; 1Q5W B; 2NTS A; 3U2S C; 4BAX A; 1H8C A; 4W9J A; 2RPQ A; 1KLU D; 1D3Z A; 4DWF A; 3ZJU A; 1TZ1 A; 2KJH B; 2M0X A; 2DYB A; 1T0S C; 4I6P A; 2J0J A; 2K39 A; 1L5P A; 2A4Z A; 1B1Z A; 1UBQ A; 2CR5 A; 3URY A; 3BVZ A; 2XEW A; 2KFK B; 3BWU D; 3Q3F A; 2KVZ A; 3AB5 A; 2RSU A; 5D6J B; 1L7Y A; 3GZN B; 4BKT A; 3H7P A; 1K53 A; 4WQO B; 4LNK A; 4YXD B; 4BKG A; 3W5U B; 3HRD D; 3PZD A; 3VHT C; 4NQL B; 2JRI B; 1XLN A; 5G5G A; 2HTM E; 3ZLZ A; 4IWO A; 2BBC A; 2W55 A; 3OJ3 A; 3VR8 B; 3EFU A; 4N9F 4; 1HA5 A; 4ICV A; 2L52 A; 2D10 A; 4XZ4 A; 3TEZ A; 4YWG G; 4XGA B; 3Q6B A; 1FMA D; 1WRI A; 1OQY A; 1OEY J; 4TMA B; 3APD A; 3O13 A; 1JWB D; 1V86 A; 4FJY A; 2DBY A; 2GBM A; 2IZV B; 1ZGU B; 2Y5C A; 4KV2 A; 2XN9 C; 3T8M A; 1EM7 A; 2M17 A; 2MBH A; 1C4A A; 2IO0 B; 3KYD D; 1SE2 A; 1VD2 A; 3TIX A; 2JSV X; 2LGY A; 3MJW A; 1C78 A; 1R4N I; 5BYS A; 2AL3 A; 1CK1 A; 2FCQ A; 3R2I A; 2DAJ A; 1FNV A; 3VUY A; 3T3O A; 1PGX A; 1LO5 D; 3GZN I; 2GBN A; 3V3X A; 3KLS X; 4CO7 A; 3RZW C; 1AN8 A; 2C7H A; 4C4V B; 1KFY B; 3U7D A; 3ZXV A; 3ZNZ B; 1J19 A; 4HK2 A; 4XE0 A; 1FCC C; 2KOX A; 2PLP A; 5AZH A; 5C23 A; 2INP E; 4ANX A; 4RNA A; 3I57 A; 3A1Q B; 1WMH A; 4IG7 B; 1E8W A; 4ACF A; 4EE2 A; 1LGR A; 3TCA A; 1SJE D; 1YIW A; 2MQJ A; 2ZPY A; 3AH7 A; 1KRH A; 5L83 A; 5TSS A; 4A55 A; 3ZQ4 A; 2KZR A; 1UH6 A; 1L0Y B; 4FJV B; 3Q3N C; 2FUH B; 4OZB A; 5J18 A; 4ZRQ A; 1TS4 A; 2PKO A; 3IAS 1; 2JZ3 B; 2KLC A; 1VZ6 A; 2FID A; 2ZCC A; 3GE8 C; 4GDK B; 1F2R I; 2LGS A; 2KXJ A; 4LDT B; 3W9C B; 3ZTC A; 4BKS D; 2V0G A; 3K9O B; 3VRA B; 3UQB A; 1J7C A; 2Q5W D; 3HM6 X; 1GB1 A; 4G3X B; 3QC8 B; 1WXM A; 2JZP A; 1TYG B; 2FCS A; 2ONQ A; 2Z8L A; 3ZYY X; 1SSN A; 1TGZ B; 4A9A A; 2VH1 A; 1XT9 B; 3U52 E; 1T0Y A; 1QOA A; 5HG2 A; 3TSS A; 2CKH B; 2EKE C; 3H9D A; 2IO1 B; 2WWZ A; 4C7Y A; 2XBB C; 3L54 A; 4MJS B; 1D5X C; 4FHJ A; 1ROE A; 1LFD A; 4OZC A; 4XX5 A; 2KYW A; 1E7U A; 3PGE A; 3VTV A; 2D3B A; 2ZCB A; 3PV1 A; 2BKF A; 3Q14 C; 2PJH A; 4RGT A; 2D3C A; 1D6E C; 4A6Q A; 1BUI C; 1P3Q U; 2HTH A; 4YL8 A; 4W9E A; 3DBS A; 2EMS A; 2K3U A; 4HVB A; 2O6V B; 2KJR A; 1TS5 A; 4DXG A; 2OED A; 4LNN A; 4W9D A; 2G1E A; 5CX3 A; 5BYR A; 1V1O A; 3KUD B; 1WGH A; 4M8M A; 3N20 C; 3KW5 B; 2KLG A; 4I6N B; 2KAC A; 4PK1 A; 2MP2 B; 1ZKH A; 2RDH A; 1OTR B; 1ET9 A; 3E9S A; 2LRW A; 5CHV C; 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1RFA A; 3A9J B; 1MJD A; 2QJL A; 4MT5 A; 3SEB A; 2N7J A; 4LDT D; 2JXT A; 1VDV A; 2WX0 A; 1GNU A; 2KHW B; 5I4D A; 3PT2 B; 3W1S A; 5C2T B; 4W9H A; 4II3 B; 1TIF A; 4DDI D; 2JWZ A; 2UWQ A; 2IBI B; 3BZD B; 1FXT B; 3FIL B; 1WXS A; 1NDD A; 1YN5 A; 2YVC A; 2NBU A; 1WGG A; 1C77 A; 2MBQ A; 2Z59 B; 2KDM A; 2M19 A; 3TEX A; 1RWS A; 2BGF A; 2RPV A; 2QC8 A; 1CZP A; 2LRU A; 5LXI B; 1Q10 A; 1JML A; 2DX5 B; 1Y56 A; 1F0Z A; 3AV8 A; 2KDB A; 4L1B A; 1WGY A; 1ZXH A; 1TBE A; 3EHV A; 2WXR A; 1S1Q B; 3BIN A; 3EGR A; 1EWC A; 4ZRK A; 2K8H A; 2KMA A; 3VR9 B; 3APC A; 1QZE A; 4GGQ A; 3P4R B; 2N4F A; 3TJP A; 4JWU C; 2YEP F; 3WA0 A; 1YNT E; 3RNE C; 2WX1 A; 2LGD A; 5IOI A; 2M8S A; 3R7Q A; 2O6V D; 4BFR A; 4LCD E; 3N9Y C; 1WX8 A; 3K9P B; 1LM8 B; 2MBE A; 2RD0 A; 5D2M B; 1YMH E; 2W54 A; 5H8Y E; 1UZX B; 2CHW A; 2DZK A; 3ONS A; 4HCN B; 3AI5 A; 2KTR B; 3KWV A; 1ZW7 A; 1WM3 A; 4WWN A; 2DHZ A; 1ZUD 2; 2G3Q B; 4FLH A; 2X8X X; 1NYR A; 3B2G A; 4LNF A; 4ZYS A; 5DPT A; 3OJ4 B; 1WYG A; 2NBW B; 2RGF A; 4HJK A; 4BOS C; 3PO0 A; 4KKJ A; 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