The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
56
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structure length |
56
|
Chain Sequence |
MQYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Ultrahigh resolution protein structures using NMR chemical shift tensors.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
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| molecule tags |
Protein binding
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| source organism |
Streptococcus sp. group g
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| total genus |
14
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-07-26 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2JZP A; 4MAC A; 4HJG E; 1FCL A; 1PGA A; 1FD6 A; 2IGH A; 2ONQ A; 1K51 A; 1MVK A; 3MP9 A; 2KDM A; 1GB4 A; 2LHD A; 1XF5 L; 1YMH E; 5HI1 A; 2IGG A; 4D2K A; 1JML A; 3V3X A; 1EM7 A; 5BMG A; 2KN4 A; 1HZ6 A; 1K50 A; 2LGI A; 2QMT A; 1K52 A; 1D4B A; 1IBX A; 2EEL A; 2JSV X; 1HZ5 A; 4HKZ E; 2PW9 A; 2J52 A; 4IKG A; 2QSD A; 2OED A; 2RMM A; 1HEZ E; 2KWD A; 1P7F A; 5HHD G; 2N9K A; 2N7J A; 1PGX A; 2GB1 A; 2J53 A; 2N9L A; 5BMH A; 4KGT A; 3FIL A; 2ZW1 A; 4KGS A; 1FCC C; 2PLP A; 2KQ4 X; 1GB1 A; 1YNT E; 3GB1 A; 4OZB A; 2K0P A; 1MI0 A; 1Q10 A; 2PTL A; 2I2Y A; 1C9F A; 1XCT L; 1F2R C; 1ZXH A; 3UI3 A; 2RPV A; 1P7E A; 1MHH E; 4IOI E; 2I38 A; 2LHE A; 4GLS C; 1K53 A; 2ZW0 A; 1IGD A; 2JU6 X; 2LUM A; 2GI9 A; 4KGR A; 5BMI A; 2JXT A; 2JWU A; 4WH4 A; 1IGC A; 1XCQ L; 5JXV A; 1UWX A; 1MPE A; 4OZC A; 1F2R I; 2IGD A; 2ON8 A; 1PGB A; 4OZA A; 2NMQ A; 5HFY A; 1QKZ A; 3FIL B; 1MHX A; 2KAC A; 5HG2 A; 1KH0 A; 1IBX B; #chains in the Genus database with same CATH topology 4WUR A; 1L0V B; 3HIZ A; 1D6E C; 3JSV B; 2JUO A; 2KC1 A; 1TYG B; 2BYT A; 3AE7 B; 1JAL A; 3DBH I; 2W9N A; 2J7Q B; 2WWZ A; 3DVN V; 3J9C A; 1WM2 A; 3ONS A; 2C7M B; 5IO9 A; 3I57 A; 2IZV B; 3KYD D; 5D7G A; 3C8Y A; 4IM2 A; 3VRA B; 1C4P A; 2LGI A; 1UGM A; 3KWV A; 3A1Q B; 2LEK A; 1V1P A; 3SR6 A; 4PYU A; 1MJD A; 4MM3 B; 3KWL A; 3Q8F A; 1KFY B; 4IM3 A; 4XC2 A; 1VD2 A; 3FKY A; 4GOC A; 1P0R A; 4S17 A; 1T6B X; 1UZX B; 2FIF A; 1SGH A; 3QK0 A; 2ASQ A; 3N3K B; 1YQ3 B; 4YTN B; 5BYR A; 4IUM B; 1GJZ A; 4C4V A; 1FCC C; 2PLP A; 2JY6 A; 1V6E A; 4P6V F; 2K8C A; 1HE8 A; 3OAW A; 1WMH B; 4BBN C; 3U52 E; 3HM3 A; 3NY5 A; 3H1U A; 1GG3 A; 2G45 B; 2ZJD A; 1FNW A; 2ZPY A; 1K53 A; 5BO4 B; 3AE3 B; 2FE8 A; 2KNB A; 2M0A A; 2KOX A; 4A8X C; 1S3S G; 2BYV E; 2JZ3 B; 1L7Y A; 1IUE A; 5CTR C; 5BMI A; 2AQ1 B; 2X38 A; 4NAM A; 4IWO A; 2YLM A; 4AP4 C; 2G4D B; 1RFK A; 3O65 B; 1GC7 A; 2M56 B; 4DDG D; 2G1E A; 1J7B A; 3Q8C A; 3H8H A; 3SFD B; 1EF5 A; 1SF0 A; 3RNF C; 4NJC A; 3AE8 B; 2MJD A; 5C23 A; 1YOV B; 5EE1 A; 1JRU A; 2AWT A; 1CK1 A; 3IXS A; 3R2T A; 2JYT A; 3A4R A; 4IWQ A; 3ML8 A; 3U2S C; 4MSM B; 1C4A A; 1IBX A; 4I6L B; 2K6Q A; 2RD0 A; 2J52 A; 5G2N A; 2VH1 A; 2OED A; 3DPD A; 2PEA A; 4J3O D; 5TSS A; 5CX3 A; 2FCQ A; 2LMC A; 4TV3 A; 1JW9 D; 3VR9 B; 4W9I A; 3RMK C; 1ZUD 2; 3QIJ A; 2MJ3 A; 1AYF A; 1WF9 A; 2WP9 B; 5L83 A; 2ZPN A; 4ZRQ A; 1TZ1 A; 1U4A A; 2IO0 B; 5DPR A; 2IBI B; 1J19 A; 2KQS A; 4F1S A; 1XLP A; 5TR5 A; 4YSY B; 4CQN A; 3E56 A; 3RPF C; 3WAP A; 5IN7 A; 2XNA C; 2DNF A; 2LUE A; 2JQR B; 1NVI D; 2ACZ B; 3Q8E A; 3VR8 B; 2V3N A; 1WGK A; 3U7D A; 2ICI A; 5FKA C; 1UWM A; 3RD2 A; 4DXG A; 4JPS A; 1V81 A; 3AUL A; 3QCA A; 4FHK A; 1MHX A; 2X8X X; 1I4X A; 2IND C; 3P1M A; 1FCL A; 2H88 B; 2PE9 A; 1FD6 A; 5IKC M; 3TL5 A; 3TUO A; 2INP E; 1KLU D; 4MJS A; 2OJW A; 2CS4 A; 3ZNZ B; 1GB4 A; 2KTR B; 3ML9 A; 1QF6 A; 1E7V A; 4D2K A; 3ZJU A; 1C79 A; 1AW7 A; 2FAZ A; 4ASW C; 2D3A A; 4PS7 A; 1WGD A; 2LRW A; 2A5U A; 1CJE A; 5AEK B; 2G3Q B; 5T8I A; 2QC8 A; 1QIL A; 2ZZP B; 1UH6 A; 3AEE B; 1C77 A; 3CSF A; 3AE9 B; 1T3Q A; 1EUV B; 1B9R A; 4W9K A; 4MDK E; 1E7P B; 1I4H A; 3L54 A; 5BYS A; 3PTF C; 3W5U B; 4CO7 A; 3SHQ A; 1N5X A; 4XGA B; 3A9J A; 3M3J A; 2KQ4 X; 4DDI D; 3ZXR A; 3GB1 A; 2OOB B; 5FR6 A; 3VVW B; 3IAM 1; 2QDF A; 4G11 A; 3M62 B; 4B0E A; 4ANU A; 2G9H D; 3DBH B; 4MSQ B; 2DEN B; 2BPS A; 2PTL A; 2I2Y A; 3ZUN A; 4ANV A; 3LYY A; 4LLG M; 4HRS A; 4A6Q A; 3QWZ B; 2WQY B; 1FNV A; 4EEW A; 4KGR A; 4W9D A; 2OJR A; 5CHV C; 5J17 A; 5JXV A; 1WYW B; 4KSL C; 1F2R I; 4KDL B; 2D3B A; 2GBK A; 4ZYN A; 2AQ2 B; 2WX1 A; 2JYE A; 3NZ3 A; 5IA7 A; 4II3 B; 4MGI E; 4RM8 A; 3FIL B; 1E90 A; 1I4P A; 1GPX A; 3HHM A; 1RYJ A; 1NYR A; 3N1Z C; 3IVF A; 2QIE B; 3WAM A; 1MVK A; 2KXJ A; 4WJO A; 1SE3 A; 4B95 A; 1LGR A; 4O1N A; 1TBE A; 4EKU A; 4ANW A; 2KKC A; 2WGS A; 4LNK A; 5KHO A; 3CIR B; 4YSZ B; 4NY0 A; 1YX5 B; 3QJZ A; 4K3C A; 3SU8 X; 3CF6 E; 3JVZ X; 3RZF A; 1NEN B; 1SBB B; 1D4B A; 3DBR I; 1FPY A; 4DQO C; 2EMS A; 1N6Z A; 3TMP B; 2PW9 A; 2NTT A; 1STE A; 3ZYY X; 4I6P A; 1V97 A; 1V80 A; 2MW5 A; 3ZKJ C; 1LFD A; 2M17 A; 1E5W A; 5D3I B; 3W5V B; 2DWQ A; 1F77 A; 2JVC A; 4MT5 A; 2PKO A; 1LQB A; 1WXV A; 2KMM A; 4KGT A; 4LDT D; 3S2A A; 2BVC A; 1QZE A; 2D3G A; 1SIJ A; 3AEF B; 2LXC A; 2LJI A; 3SEB A; 3VTU A; 4TUU A; 1RM6 C; 4P1B C; 1KLG D; 1QOF A; 3T8M A; 1OQY A; 3KUC B; 2NPT A; 1IYF A; 4JX1 C; 3UIO B; 3IFW B; 3UQB A; 1VZ8 A; 4LNI A; 2L8J A; 2JWU A; 1WFY A; 3DHI C; 3ZJV A; 1CQV A; 5GMV A; 2DYM A; 4IW0 A; 1SE4 A; 4LK0 M; 5E6P A; 3RI7 C; 2SAK A; 4AS1 A; 1PGB A; 3L4P A; 4M0W B; 3R8B A; 2K5P A; 4LCD E; 1ZP0 B; 2W55 A; 2KMA A; 2ZNV B; 4M00 A; 1SE9 A; 3L08 A; 3NVW A; 1SXT A; 1RAX A; 2WXI A; 4N6E B; 3P63 A; 3TEZ A; 3AH7 A; 1D5M C; 5G5H A; 1C1Y B; 2HE7 A; 4BKS A; 4KIK B; 1JWM D; 2VZK B; 3DCG A; 3QA8 A; 2C5L C; 3IT6 B; 1QT9 A; 1XQQ A; 4RF0 A; 5BMG A; 1YJ1 A; 3BYT B; 1TZO A; 1ZKH A; 5JZE B; 3ZJT A; 4X57 B; 1WJN A; 2L0F A; 4WAF A; 3JSV A; 2KLG A; 3AEG B; 3EFC A; 3RNB C; 4DBG A; 2QEJ C; 1ZOY B; 1G6J A; 2MJE A; 3UIN B; 5LNK 1; 3SD5 A; 4NPN A; 1WX9 A; 3BIN A; 1QOB A; 3V05 A; 3H9D A; 3VUY A; 3U4E G; 4K1R B; 3H7P A; 3EHV A; 4EUT A; 2BBC A; 4L1B A; 3QHT A; 4ZRP A; 2NTS A; 2KWU B; 1KTK A; 3A1Q A; 2MH7 A; 1YNT E; 1XO3 A; 3PS6 A; 4MM3 A; 2O6V B; 4R3D A; 4E71 A; 1KOT A; 4GXB A; 2L83 A; 3UI3 A; 1L2N A; 3HK0 A; 4ICV A; 2GMI C; 1J0G A; 1JQ4 A; 3WIM A; 4BKT A; 1KF6 B; 1ZDX A; 1WSP A; 3PGE A; 4MEL A; 4OVU A; 3NZU A; 1F9J A; 1WY8 A; 3ZDM C; 2L52 A; 1P98 A; 4W9J A; 1X1M A; 1WGH A; 1WMH A; 4LTU A; 2KVZ A; 2FBW B; 4GMV A; 3GE8 C; 4FXC A; 1LO5 D; 3KH0 A; 4PYZ A; 4XWW A; 4A20 A; 2FCN A; 4ZDV A; 2LWP A; 4HJK A; 2IY1 B; 2PPH A; 1XLN A; 1YN5 A; 1V5T A; 3Q3M C; 2FUH B; 2CU3 A; 1P1A A; 3V3X A; 3NRZ A; 1UBI A; 2VH2 A; 1YJJ A; 4L2Y A; 3I5J C; 4UDU C; 3WCQ A; 2QMT A; 2B3A A; 2IYD B; 2ZNV C; 2J42 A; 1ENF A; 2H89 B; 3B0A A; 1KLV A; 1TY2 A; 3OG5 A; 4L23 A; 4B6W A; 5HHD G; 1SIF A; 2KT7 A; 2N0S B; 4M8M A; 3M95 A; 3K9P B; 2PVO D; 4W9L A; 2GBR A; 4N9F 4; 1UD7 A; 4FBJ B; 1NI2 A; 2W54 A; 3VAW A; 1WX8 A; 3Q3N C; 3AN1 A; 4IM0 A; 3UQA A; 1WE7 A; 3DQV A; 2IJ0 A; 4Q2J A; 2ZEQ A; 5JHA A; 4WJQ A; 2LXA A; 5AZH A; 5BYQ A; 1BUI C; 1AAR A; 2KTF A; 2Z59 B; 4LDT B; 3DBR B; 1D3Z A; 1GOZ A; 1UBQ A; 4PS3 A; 3W2D A; 2XK5 B; 1HTQ A; 3P42 A; 4OZC A; 1TS3 A; 4RGN A; 4YTP B; 1RWS A; 2DYO A; 1WX7 A; 4TKN A; 1TS5 A; 1Q1O A; 1PDX A; 3R7Q A; 2NVU I; 2QIL A; 2DZK A; 5HG2 A; 3BY4 B; 1Q0W B; 3BYY B; 1AN8 A; 4DXF A; 3T3N A; 2D10 A; 4I6N B; 1UF0 A; 2IPK D; 1EO6 A; 3CMM B; 4LNF A; 2HTM E; 2JF5 A; 3UIP B; 2J4X A; 1R7S A; 4RF1 A; 4ARI A; 4DHZ E; 3GE3 C; 5CHW A; 1ZW7 A; 2CJO A; 2KLC A; 4AUQ C; 2PIA A; 3ECI A; 4IC7 B; 4ARC A; 2NS5 A; 1K52 A; 3QAR A; 4JLC A; 2GBJ A; 3L13 A; 2RR9 A; 2O2V A; 4KVG B; 2KVR A; 1FFV A; 2WU2 B; 2NBV B; 2KHW B; 2BQQ A; 2DAF A; 4YWG G; 1F52 A; 1R4M I; 3CWI A; 4YSX B; 2MX2 A; 1XLO A; 3AI5 A; 2KTR A; 1JRO A; 1Z2M A; 4XYC A; 3M63 B; 1ROE A; 2JZZ A; 1EU3 A; 5G55 A; 3AU5 A; 4YT0 B; 2OHF A; 5EE0 A; 4GB9 A; 1Y8R C; 1WXM A; 5C2T B; 3N1Y C; 3RCZ A; 2JRH A; 3Q3F A; 2N7E A; 3TEY A; 1F2R C; 4P1C C; 4K7U A; 5J2R A; 3MJW A; 3VXW A; 3WA0 A; 3DWG C; 3CST A; 2J0K A; 4MGY E; 4NAW A; 3U7Z A; 2W3S A; 1RFA A; 3RNA C; 2M8S A; 1XCQ L; 2LVQ A; 4ZHP A; 1GUA B; 2BGF A; 2GOW A; 3ZIM A; 4AOF A; 3ZTD A; 2ON8 A; 3DWM A; 3NOB A; 4TSS A; 3RYT A; 1ZGU B; 2WDQ B; 3MC8 A; 1N60 A; 2WXJ A; 1QKZ A; 2MP2 B; 1VR9 A; 2KK8 A; 2IO3 B; 4C4V B; 3PLV A; 1YQ4 B; 4FAD A; 2XEW A; 2BTE A; 2ONQ A; 2MQJ A; 3ZW3 A; 3R66 C; 1TGZ B; 2YEP F; 3GS2 A; 3RNG C; 4EE2 A; 1FNU A; 4B9K A; 4K7S A; 4JWU C; 2CJN A; 1AWD A; 3P4Q B; 3AE1 B; 1V1O A; 2VZK D; 2N1W A; 4PK1 A; 2D5G A; 3EC8 A; 3FAH A; 1C78 A; 1YX6 B; 1F1H A; 2FID A; 4FJY A; 2AQ3 B; 3JW0 X; 3WAO A; 3QX1 A; 3NVY A; 2K9X A; 2GBM A; 1YQB A; 2BWF A; 2BS3 B; 4GDL B; 4W9F A; 4HPL B; 2M1M A; 3AV8 A; 3W9C B; 2WDV B; 2N9K A; 3L0W B; 3ETR A; 2PVG C; 2GB1 A; 3H7S A; 3H6N A; 5JH5 C; 3EEC A; 3DHH C; 1N5W A; 4KGS A; 1V9J A; 5FR3 A; 1VZ7 A; 1YN4 A; 3W1S C; 2MLB A; 5E6O A; 4FA6 A; 2O6V D; 2WX0 A; 2LGD A; 5LXH A; 1QQR A; 1OEY J; 4GLS C; 1XT9 B; 1UGJ A; 2LI5 A; 1P3Q U; 1CZP A; 2L05 A; 5CHF A; 3IAS 1; 3ZRF A; 4WQO B; 1I4G A; 1FXA A; 2ZCB A; 4WWN A; 4C56 C; 3MHS D; 1UWX A; 1MPE A; 3MC0 B; 5KHQ A; 4OZA A; 3URY A; 2HTH A; 4XDD A; 4HKQ A; 3B08 A; 1Q5W B; 2CHX A; 4BBN F; 3VRB B; 2HJ1 A; 3HVZ A; 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3V60 A; 1H4R A; 2JZP A; 1L6U A; 2WDT B; 2WXG A; 3I3T B; 2K8H A; 1ZE3 D; 2HD5 B; 1FO4 A; 3X0W A; 2D3C A; 4NQL B; 2CHW A; 1L0X B; 3X23 A; 3ABV B; 3JYU A; 2K6D B; 2KN4 A; 1HZ6 A; 2INC C; 2EKI A; 2KDF B; 3B2F A; 4K7W A; 4S0R A; 4DHJ B; 2DZM A; 1HZ5 A; 3AE4 B; 3UGB B; 4J6I A; 4IG7 B; 3VQI A; 2HDE A; 1P9D U; 1VLB A; 3AE2 B; 3ZNG C; 3HM6 X; 4BOS C; 3VFK A; 1PGX A; 3ZXV A; 2J53 A; 3AB5 A; 1FXT B; 2KD0 A; 2N9L A; 4YXD B; 3AEC B; 2KN5 A; 4M02 A; 1QOG A; 4RCO A; 4RGO S; 3EFU A; 4GIV A; 4OZB A; 3VHT C; 4IWP A; 2CHZ A; 1K8R B; 3KUZ A; 2I38 A; 2WXO A; 2N1V A; 1IGD A; 2BS2 B; 1WYG A; 2N9X A; 2GI9 A; 3DVN U; 3PHX B; 4LNN A; 4WH4 A; 3NS1 A; 4HPP A; 2LGS A; 4KDI C; 2WXK A; 2A4Z A; 2J0J A; 1FFU A; 3PZD A; 1HTO A; 1VDV A; 2LVO A; 4JE3 B; 1I7H A; 3L17 A; 4JL9 A; 2WXR A; 1E0Z A; 1T0Q C; 2L0T A; 3V62 A; 3ENE A; 3TSS A; 1V49 A; 1K51 A; 1Z5S B; 2MWS B; 4MH8 A; 3N20 C; 3GZN I; 4N58 A; 4OW0 A; 2XK5 A; 2LHD A; 4NZL B; 2FCS A; 2TSS A; 2NPT B; 3APF A; 1T0S C; 1EM7 A; 1F0Z A; 4HXD A; 2JT4 B; 3RN9 C; 3RFZ B; 1BXT A; 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