The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
56
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structure length |
56
|
Chain Sequence |
MQYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Ultrahigh resolution protein structures using NMR chemical shift tensors.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
|
| molecule tags |
Protein binding
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| source organism |
Streptococcus sp. group g
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| total genus |
14
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-07-26 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2ZW0 A; 1F2R C; 1MI0 A; 2PTL A; 1HEZ E; 1P7F A; 1K51 A; 3FIL A; 1PGB A; 1K50 A; 1XF5 L; 1IGC A; 1IGD A; 1D4B A; 1PGA A; 2EEL A; 2N7J A; 2LHE A; 2J53 A; 2N9K A; 1MHH E; 2JZP A; 2GB1 A; 1JML A; 2JSV X; 1IBX B; 4OZB A; 1F2R I; 3MP9 A; 1FCL A; 1P7E A; 5HHD G; 4KGS A; 1GB1 A; 1KH0 A; 2PW9 A; 1HZ6 A; 5HG2 A; 4HKZ E; 1FD6 A; 1MPE A; 2I2Y A; 1C9F A; 2RMM A; 2I38 A; 1IBX A; 4HJG E; 4IKG A; 2GI9 A; 2IGH A; 3GB1 A; 1K52 A; 2QMT A; 1YMH E; 1YNT E; 1QKZ A; 2JXT A; 2RPV A; 3V3X A; 5HFY A; 2IGG A; 1XCT L; 2KDM A; 5JXV A; 1UWX A; 2OED A; 2K0P A; 5HI1 A; 2LGI A; 2NMQ A; 4KGT A; 4OZC A; 2ZW1 A; 1Q10 A; 4KGR A; 2PLP A; 2KAC A; 1EM7 A; 2J52 A; 1FCC C; 2QSD A; 2ONQ A; 1ZXH A; 2KQ4 X; 4GLS C; 2IGD A; 4WH4 A; 5BMI A; 3UI3 A; 2KN4 A; 1XCQ L; 5BMH A; 1GB4 A; 2LUM A; 2LHD A; 1MVK A; 3FIL B; 4IOI E; 1MHX A; 2JU6 X; 2JWU A; 4OZA A; 2ON8 A; 1HZ5 A; 2N9L A; 4D2K A; 1K53 A; 2KWD A; 4MAC A; 1PGX A; 5BMG A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3VDZ A; 1WIA A; 1HEZ E; 2Z59 B; 2BYF A; 3WIM A; 1P98 A; 4CO7 A; 3BII D; 1B1Z A; 2EEL A; 2LHE A; 2CJN A; 3B2F A; 1UZX B; 2QJL A; 3VH3 B; 4ZYN A; 4TMA B; 4OZB A; 2O6V D; 3KLS X; 1JWB D; 2LGD A; 1TZO A; 3M95 A; 1ACC A; 2J0K A; 1J7B A; 3ZNZ B; 2FNJ B; 3DBL I; 2GOW A; 4HKZ E; 3NZU A; 1RRB A; 3JVZ X; 3DCG A; 2IBI B; 1E7P B; 5DPR A; 4ICV A; 3ZDT A; 2EMT A; 2V4L A; 3AE2 B; 2K25 A; 4TSS A; 2ZNV B; 3TCA A; 3ZW3 A; 3AEE B; 3EFU A; 2AQ1 B; 4JLC A; 3CSF A; 4XX5 A; 2Z0E B; 1C4C A; 4LNK A; 2CR5 A; 3RD2 A; 3KQ4 A; 3H9D A; 1T0Q C; 4GDL B; 1ZXI A; 2O2V A; 4XE0 A; 3A9J A; 3LJ3 A; 1ZPS A; 3QIJ A; 1C1Y B; 2QSD A; 3VRB B; 4P6V F; 4E71 A; 4XGA B; 2KQ4 X; 2MHJ A; 5G2N A; 3PS6 A; 3GOE A; 1L0X B; 2L76 A; 3P42 A; 2OJW A; 3SFD B; 3ZTD A; 3U8Z A; 2BWE S; 4GDL A; 1N61 A; 3HM3 A; 2K1F A; 3HUI A; 2CU1 A; 1D5M C; 1JCK B; 2WDT B; 3UQA A; 3AU5 A; 2BS3 B; 2W3R A; 1GOZ A; 1WZ0 A; 3PHX B; 2K8C A; 1JRP A; 1UNS A; 3KYD D; 4RFB A; 1DOX A; 1J0G A; 4FJY A; 4NAW A; 1EUV B; 1T0S C; 2KZR A; 3SEB A; 4N9F 4; 1KF6 B; 3W9C B; 3B9J A; 2VH1 A; 3AMZ A; 2NS5 A; 2RDG A; 1FCL A; 1TKE A; 2RDB C; 1YN5 A; 5E6O A; 1FFU A; 2KMC A; 3IAS 1; 3DBR I; 5IO9 A; 2C7H A; 3Q8F A; 4RCO A; 5LXI B; 2I2Y A; 3AB5 A; 1Q1O A; 4MGK E; 4YSY B; 4BOZ B; 5BYQ A; 3L10 B; 2MP2 B; 2INN E; 4A8X C; 1R4M I; 3ZUN A; 4AS1 A; 2QMT A; 2ZPY A; 3OJ4 B; 1X1M A; 1YNT E; 2HTM E; 3Q69 A; 1PDX A; 1XT9 B; 2HJ8 A; 4KVG B; 2LMC A; 2AL3 A; 3NRZ A; 1T0Y A; 2MP2 A; 1TBE A; 4REZ A; 5IN7 A; 2V4I B; 2IYD B; 3CF6 E; 2IY0 B; 3R7R A; 1LXD A; 3AM9 A; 2WXQ A; 4X57 B; 1C4A A; 1F77 A; 3WAM A; 4C7Z A; 1ET6 A; 4XZ4 A; 3QCA A; 4ZOH C; 2XK5 A; 3UI3 A; 3SDL C; 3LB8 C; 2INP E; 5C23 A; 2NPT B; 4H2A A; 5BYR A; 1E8Z A; 1FXA A; 2BW2 A; 4YWG G; 1EU3 A; 1V5O A; 3AU4 A; 3RNG C; 4YSZ B; 5L83 A; 1GUA B; 4DDI D; 1V1O A; 1C3T A; 3RNF C; 2KDE B; 2NPT A; 3RN9 C; 5H8Y E; 1P0R A; 5D6J B; 3Q14 C; 1OQY A; 3T3O A; 2K5P A; 3SD5 A; 2BYV E; 3RZW C; 4P7I A; 2INC C; 1ESF A; 1TTN A; 1HTO A; 2JRH A; 1GJZ A; 4LNF A; 4B0E A; 1WF9 A; 5AZF A; 3IT6 B; 4A3P A; 3R2I A; 4I6N B; 1GC6 A; 2BF8 B; 3U7D A; 3B2G A; 2WDQ B; 1FMA D; 3H1U A; 3KVF B; 3TBL D; 1SE4 A; 4GMV A; 1IUE A; 4FHJ A; 2MRP A; 2XNA C; 2KD0 A; 3GZN I; 2W82 A; 4JQW C; 4KKI A; 5E6N A; 5HKH A; 4WWM A; 1L5P A; 4GOC A; 3NZS A; 1YMH E; 4LJO B; 3N20 C; 2NBV B; 1SB3 C; 3PTF C; 2KDM A; 3HRD D; 2C5L C; 4ZHO A; 4NNJ B; 3H8H A; 2UYZ B; 3QAR A; 3T3N A; 3ENE A; 2WXK A; 2DWQ A; 3RUI B; 3N3K B; 1EF5 A; 1Q5W B; 1QQR A; 2E3T A; 3O13 A; 2DYB A; 1YIW A; 3I5J C; 2OOB B; 3IG3 A; 1I4X A; 1J7A A; 1ZXH A; 2IGD A; 1SGH A; 4HKQ A; 3NVV A; 3P4P B; 1JRO A; 1ROE A; 4IG7 B; 1Z5S B; 2Y5C A; 3CWI A; 1T5X D; 1KM7 A; 4NJ6 A; 2JYE A; 2EMS A; 2ICI A; 1E90 A; 1K53 A; 4US8 A; 4NAM A; 5BO4 B; 4USA A; 4IM0 A; 4W9J A; 4ANV A; 2PTL A; 3N1X C; 5IP4 D; 3DWG C; 1E9M A; 1GC7 A; 1L4Z B; 1N63 A; 3WAN A; 2HE7 A; 1IGD A; 1WXS A; 2XBB C; 2ZVN A; 2QC8 A; 1DGJ A; 2WX1 A; 2M17 A; 2FAZ A; 2DX5 B; 1SF0 A; 3ETR A; 2PEA A; 1IBX B; 2CHZ A; 2WYQ A; 3O65 B; 2WDV B; 2D5G A; 1YN3 A; 3E9S A; 5HHD G; 2ZVO A; 1JRU A; 2L83 A; 3EC8 A; 2V3P A; 3AE5 B; 2K6Q A; 4DQO C; 5E6J A; 2KK8 A; 1IBX A; 3HM6 X; 2MSE D; 2KC2 A; 1OTR B; 1V5T A; 2KAN A; 3FKY A; 4W9D A; 3X0W A; 1D3Z A; 3VUX A; 1XCT L; 1WR6 E; 3PHW B; 3E56 A; 3IBE A; 4W9G A; 3ZXR A; 4HWI B; 3NS8 A; 2KAJ A; 5D2M B; 4OHJ A; 1STE A; 2XN9 C; 3BVM A; 1SJE D; 2WQY B; 1ZUD 2; 2WXO A; 3DHH C; 5E6P A; 4IW0 A; 2M56 B; 2L1A A; 4B0M A; 3Q3N C; 3EFC A; 4IOI E; 1TT5 B; 2CHX A; 2LAS A; 1Q0W B; 1S1Q B; 3MJ5 A; 4N6E B; 2KDB A; 1VLB A; 2QEJ C; 3QC8 B; 2JWZ A; 5JZE B; 4MEL A; 4RGM A; 2W3S A; 3P2B A; 1MI0 A; 2BB6 A; 1FPY A; 1T6B X; 4WQM A; 4LJP B; 4WJP A; 4WWP A; 2MWS B; 3ZO5 B; 4BKT A; 1UBQ A; 2X8X X; 1XF5 L; 1IGC A; 3DVN U; 3RI7 C; 2JY6 A; 2LVQ A; 1FFV A; 3PVL A; 4DHJ B; 4DWF A; 2D3B A; 1P7E A; 3ZNG C; 2IND C; 4EZL A; 3VTW A; 4UDU C; 2KNB A; 4K7U A; 4HK2 A; 4B9K A; 1IP9 A; 4RGT A; 2FE8 A; 1K52 A; 3Q3M C; 1QZE A; 3HK0 A; 3VUW A; 4BKS D; 2RPV A; 3ONS A; 4MJS B; 4KIK A; 3DWM A; 1Y8R C; 5JXV A; 1UWX A; 4J6I A; 1WXV A; 4LNO A; 4L2Y A; 3TL5 A; 3RNB C; 2K0P A; 4PYU A; 2N7E A; 3FC4 A; 1WMH B; 3NVY A; 2N9P C; 2G4S A; 3C0R B; 2L0T A; 2L32 A; 4LCD E; 2QIE B; 2IO0 B; 3Q8C A; 5D94 A; 1UF0 A; 2E6X A; 4K3B A; 2ONQ A; 5G5G A; 2KTR B; 2WWZ A; 3NJT A; 4WIP A; 2KFJ A; 3KWL A; 2DZM A; 1RLF A; 3WAL A; 4GB9 A; 2JZ3 B; 2KJ6 A; 2MX2 A; 3DVG Y; 1E0Z A; 3PRP B; 3Q6B A; 4OZA A; 4GDK A; 4D2K A; 2KTR A; 4E74 A; 1WX8 A; 1WX9 A; 4CHK A; 3Q8E A; 2HJ1 A; 4F8C B; 1ENF A; 3SR6 A; 3ALB A; 2ZCC A; 1XLO A; 1WM2 A; 4TV3 A; 3AUL A; 1OEY J; 2VRR B; 2WX0 A; 2NR2 A; 4II2 B; 4HJK A; 2J7Q B; 4IM3 A; 4K3C A; 2JT4 B; 4M02 A; 2LGS A; 1WXQ A; 1L6U A; 1NEN B; 4N58 A; 3AE9 B; 4DHJ D; 3VTU A; 2KX0 A; 4I6L B; 1XLP A; 4HPL B; 3IFW B; 1WH3 A; 4A55 A; 1HTQ A; 2M4N A; 3MHZ A; 4C80 A; 2KDF B; 2MJ3 A; 4BZA A; 2GBK A; 1F52 A; 5J17 A; 3WCQ A; 2BS2 B; 2KX3 A; 1C76 A; 2IY1 B; 2LXC A; 3U4E G; 2BBC A; 3DBH B; 4A20 A; 1VZ8 A; 1NI2 A; 3V3X A; 2DYO A; 3QK0 A; 1E8Y A; 2H88 B; 4AUQ C; 3QQ8 B; 4P1C C; 4CYE A; 5J18 A; 3EA6 A; 2LGI A; 3AE4 B; 2L8J A; 1N5X A; 1Q10 A; 1I4R A; 4KZ0 A; 3WA0 A; 4GGQ A; 2PIA A; 2KAC A; 2W55 A; 3QA8 A; 2J52 A; 1FCC C; 1CK1 A; 1C77 A; 1TY2 A; 3GE3 C; 2O2V B; 1FO4 A; 3KWV A; 3BIN A; 1JAL A; 3A9J B; 1UGM A; 4JGH B; 3WAP A; 2NVU I; 2LUM A; 2WLB A; 1I42 A; 4I6P A; 4JE3 B; 3AXC A; 1I4P A; 3SHQ A; 3MC9 A; 1TIF A; 3ZNH B; 3W5U B; 2N9L A; 3ZLZ A; 2WXP A; 2KLG A; 4HRS A; 3AE8 B; 1VCB A; 1F2R C; 2N4F A; 1K51 A; 1WJN A; 4W9F A; 2AQ3 B; 5EE3 A; 3VHT C; 1PYW D; 4KSK C; 4NAW B; 3SFE B; 4DDG D; 1YJI A; 2JSV X; 1FIQ A; 2ZJD A; 4WUR A; 3K9O B; 3ECI A; 1WE6 A; 4MH0 E; 1A5R A; 1V81 A; 1FRR A; 4DXA B; 2LXA A; 4ZRQ A; 2N0S B; 4ANU A; 1HZ6 A; 2KFK A; 2CJO A; 3R2T A; 2LGY A; 1AN8 A; 4DXF A; 3KH0 A; 2NTS A; 1MG4 A; 2RMM A; 2KC1 A; 4IDI A; 1WGD A; 4PK1 A; 3P1M A; 1ZP0 B; 3AEC B; 3PZ8 A; 4JPS A; 2W9N A; 1RFK A; 3H7P B; 1R7S A; 3UF8 A; 1N62 A; 1UD7 A; 3L16 A; 2KVR A; 2KOX A; 1NYQ A; 4W9K A; 1WWT A; 5HFY A; 5FKA C; 1GAQ B; 2R61 A; 2V3N A; 1QOB A; 2DYM A; 4C56 C; 2BT6 A; 5JHA A; 4FN2 A; 4HDQ A; 4OZC A; 1FNU A; 3EUB 2; 4KGR A; 3H7P A; 2DZJ A; 2OJR A; 4HEA 1; 2BKR B; 2BVC A; 2KJH B; 2WHI A; 4WAF A; 4P16 A; 1NVI D; 2BGF A; 4G50 A; 1RM6 C; 2R2Q A; 2KN4 A; 2HD5 B; 1C79 A; 3P63 A; 2XK5 B; 1JW9 D; 3J9C A; 2FCM A; 4AQ7 A; 1WGK A; 1ZDV A; 3MC0 B; 1QOF A; 3DPD A; 4RGN A; 1LGR A; 4AP4 C; 2CU3 A; 3V60 A; 3JSV A; 1XLN A; 1PGB A; 2LJ5 A; 2H89 B; 2KTF A; 4C7Y A; 1WRI A; 3QAQ A; 1WYG A; 2N9K A; 2JZP A; 3UIP B; 1SJH D; 4FHK A; 2B76 B; 2WXR A; 1XXG A; 2K9X A; 3ZGZ A; 3A9K A; 1CMX B; 1PUT A; 4YXD B; 2L05 A; 2BS4 B; 1B9R A; 2RR9 A; 2AQ2 B; 3HVZ A; 2NTT A; 1TKG A; 1VDV A; 1XO3 A; 4WWN A; 2LZ6 A; 2IO2 B; 3N1Y C; 1VR9 A; 1R4N B; 4GSW A; 1FEH A; 1WYW B; 3ZJT A; 3NUH B; 3GB1 A; 1UUP A; 4WJQ A; 3DVG X; 3PRZ A; 1XQQ A; 5IOI A; 2LJI A; 3I63 C; 4EZK A; 1E5W A; 1SXT A; 2GBN A; 2LEK A; 3DVN V; 3UIN B; 4NQL B; 3ZIM A; 3QJZ A; 4KDI C; 1IYF A; 1QF6 A; 1LM8 B; 1UEL A; 3B08 A; 2D07 B; 1I35 A; 1WFY A; 1LFD A; 2KO3 A; 4S17 A; 1YX6 B; 4KX6 B; 4ANX A; 5L95 C; 1I4Q A; 2ZCB A; 3L08 A; 1P3Q U; 5DCN A; 3A1Q A; 2CKH B; 4LNN A; 2KMA A; 2VH2 A; 4B95 A; 2KWU B; 1WSP A; 3DBS A; 3R66 C; 4GU2 A; 2NCN A; 4WH4 A; 3KUZ A; 4G11 A; 1XCQ L; 3RNE C; 3SU8 X; 2KT7 A; 1YX5 B; 1WGG A; 5LXH A; 3V6C B; 1SSN A; 2FID A; 2PMV A; 4A9A A; 4EFO A; 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3A4S C; 2V1Y A; 3M62 B; 3VH4 B; 2C9W B; 5CHV C; 1JML A; 3HIZ A; 3VFK A; 1TGZ B; 1WXA A; 2X38 A; 2TSS A; 2KQ7 A; 3APD A; 1FNW A; 3AED B; 1SE9 A; 2GBJ A; 2G3Q B; 3Q2A C; 2PW9 A; 4A90 A; 5HG2 A; 3ZYY X; 1QOA A; 3P4R B; 3V61 A; 4AOF A; 1C9F A; 4MGI E; 4C00 A; 2WDR B; 2WU2 B; 3ZRF A; 2IGH A; 2BYT A; 1L6V A; 5IA7 A; 4GIV A; 3QHT A; 3W2D A; 3PPA A; 1JQ4 A; 1YQ3 B; 2N9X A; 1BXT A; 3AEG B; 3W5V B; 1C4P A; 4EE2 A; 1V9J A; 2BPS A; 3NG0 A; 1V2Y A; 2LD9 A; 2NMQ A; 4KGT A; 2LRU A; 4KIK B; 3TUO A; 2BWF A; 4BAX A; 2D2Q A; 3VRA B; 3RPF C; 1HXY D; 3RT3 B; 2DAF A; 1C78 A; 3GE8 C; 3BK1 A; 3BK2 A; 2KQS A; 3RCZ A; 3RYT A; 2LUE A; 2VZK B; 2G45 B; 3TEW A; 2KHW B; 1QIL A; 2K8H A; 2WS3 B; 2JYT A; 4YL8 A; 1OFF A; 2WXG A; 2EKI A; 4XDD A; 2K3U A; 3CIR B; 1T0R C; 2PKO A; 4FA6 A; 2L0F A; 2O6V B; 1KJT A; 4L1B A; 3AE3 B; 3UGB B; 1PGX A; 2LWP A; 2Z8L A; 4AJY B; 4GDK B; 1I4H A; 4ZRK A; 1CJE A; 2WXF A; 2MBO A; 4TQ0 A; 2FUG 1; 3BVZ A; 4YTM B; 4E3C A; 1GNU A; 1E6E B; 4JX1 C; 4J3O D; 2ACZ B; 4JIO U; 3N1Z C; 3OG5 A; 4LDT B; 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