The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
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sequence length |
66
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structure length |
66
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Chain Sequence |
MNVTVEVVGEETSEVAVDDDGTYADLVRAVDLSPHEVTVLVDGRPVPEDQSVEVDRVKVLRLIKGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
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| source organism |
Haloferax volcanii
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| publication title |
Structure of a protein from Haloferax volcanii
rcsb |
| molecule keywords |
Small archaeal modifier protein 2
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| total genus |
5
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| structure length |
66
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| sequence length |
66
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-09-14 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2L32 A; 2LJI A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3KH0 A; 4OVU A; 2KTR A; 1I4P A; 4AS1 A; 1WMH B; 2JQR B; 1HZ5 A; 3AH7 A; 4HWI B; 2WXG A; 3OJ4 B; 2FIF A; 4HCP B; 1NBF C; 1N60 A; 1XLQ A; 2IY0 B; 3AED B; 3DHG C; 5CHV C; 2ONQ A; 4XWW A; 4HPP A; 4C00 A; 3FIL A; 2LVO A; 1PQS A; 3MC8 A; 4WJP A; 4KVG B; 1TZ1 A; 2IZV B; 4XYC A; 2IGH A; 4NQK E; 2WWZ A; 4BFR A; 1SE3 A; 5J2R A; 1JWU D; 1WXS A; 3Q2A C; 3N1Z C; 1UEL A; 4N59 A; 4A8X C; 3RNC C; 3B0A A; 3I57 A; 2MP2 B; 1FFV A; 2I38 A; 1WGR A; 3BYT B; 1FCL A; 3QIJ A; 3TEY A; 1GG3 A; 1OQY A; 3Q3O C; 3V6C B; 1T5X D; 2KC1 A; 4BBN C; 2W3R A; 3AMZ A; 4DHZ B; 4HJK A; 1IBX A; 4FJV B; 3N3K B; 3AU5 A; 3A33 B; 2HTH A; 2QMT A; 2M19 A; 2VZK D; 2RDB C; 1E8Z A; 2BWE S; 4K81 A; 1G6J A; 4H2A A; 3L08 A; 3DBS A; 3DBL B; 2PEA A; 4BAX A; 2MX2 A; 2L0F A; 2M17 A; 1PUT A; 3H9D A; 1SBB B; 3NRZ A; 1F52 A; 1TKE A; 1EF1 A; 1IP9 A; 3DQV A; 1J7B A; 3AE8 B; 3Q8A A; 1OFF A; 1E5W A; 4MGI E; 2LGS A; 5T8I A; 3FKY A; 4K7W A; 5IO9 A; 4YTM B; 2DEN B; 2QSD A; 5D94 A; 1YD8 U; 2LXA A; 4A20 A; 2Z8L A; 2BYV E; 3NS8 A; 5D3I B; 3GB1 A; 2QIE B; 5AUI A; 2KLC A; 2JUO A; 2G1E A; 3PVL A; 1UNS A; 1YN5 A; 3AE5 B; 3H7P B; 3PLU A; 1V1P B; 3H6N A; 3APF A; 2LUE A; 2BQQ A; 4DXA B; 2KOX A; 4JL9 A; 2KD0 A; 4B6W A; 1E7P B; 2ZPY A; 2GBM A; 4FBJ B; 2DHZ A; 3Q3J A; 4S0R A; 2WXJ A; 3AE2 B; 1WX7 A; 4K1R B; 2XN9 C; 2INN E; 4WQM A; 3MJ5 A; 1TJE A; 3OLM D; 2KAN A; 1P1A A; 3L10 B; 1UGM A; 2L32 A; 3U8Z A; 1MVK A; 3B2F A; 2N1W A; 1YOV B; 3R8B A; 3L4P A; 3KW5 B; 2CU1 A; 2CU3 A; 2IY1 B; 1QZE A; 4DWF A; 3JVZ X; 3ALB A; 2MLB A; 4N6E B; 2KXJ A; 4PK1 A; 2CJN A; 1HEZ E; 4EFO A; 3Q8C A; 3ONS A; 2KZR A; 2Q5W D; 2BBC A; 3DVN U; 5I4D A; 2LUM A; 2D10 A; 3NJT A; 1FIQ A; 1ENF A; 1J19 A; 4HPL B; 1TY0 A; 4LJP B; 4AWJ A; 2K9X A; 4HKQ A; 4P7I A; 3GE8 C; 1YNT E; 2IPK D; 1EWY C; 2L0T A; 4YTP B; 1HA5 A; 2DYM A; 3U2S C; 1ZXI A; 3DBR I; 4KSK C; 2B76 B; 4DXF A; 4KKI A; 1RFK A; 1RWS A; 1GAQ B; 2GOW A; 2UU7 A; 1MPE A; 4US8 A; 2WS3 B; 4WH4 A; 1FNW A; 3RZW C; 1L5P A; 2N1V A; 3KYC D; 4JE3 B; 2WDQ B; 2FCN A; 2ZJD A; 1L0X B; 2K22 A; 1E8W A; 3KLS X; 1T3Q A; 4A90 A; 3WIM A; 1SB3 C; 3VAW A; 3NZU A; 2JZZ A; 1L4D B; 1E10 A; 4RH6 A; 2L00 B; 1ESF A; 2KJ6 A; 2WDT B; 4IOI E; 5JHA A; 2IO2 B; 5D3D A; 2CS4 A; 1DOY A; 2V0G A; 2FCQ A; 2NR2 A; 4MAC A; 2G3Q B; 1FFU A; 3FAH A; 3U4E G; 1ET6 A; 2C7M B; 1ZP0 B; 3E9S A; 3PRZ A; 2FNJ B; 4YSZ B; 1D5M C; 4YWG G; 2KFJ A; 5LNK 1; 1RLF A; 1WXQ A; 3X23 A; 1GJZ A; 4DDI D; 3N9Y C; 3ZVV A; 3D32 A; 3NUH B; 3R66 C; 2WXN A; 4PS8 A; 1V1O A; 2OJW A; 1R4N I; 3JSV A; 2NBW B; 5LXH A; 1WGG A; 3UIN B; 2VZK B; 1NVI D; 3NZ3 A; 2K8C A; 2QDF A; 2BF8 B; 1WR1 A; 2ON8 A; 2DZJ A; 3RNB C; 2M8S A; 4N9F 4; 4G0N B; 4BVU C; 2KWV B; 4II2 B; 3TIX A; 4LNN A; 2RPV A; 3OJ3 A; 2NTS A; 5KHO A; 4IM0 A; 2BB5 A; 4LDT D; 2DX5 B; 1FMA D; 4C4V A; 3RPF C; 2VRR B; 4PT5 A; 1YJ1 A; 3I63 C; 1B1Z A; 4IC7 B; 5KHQ A; 2MSE D; 3M62 B; 4MDK E; 2L05 A; 2JXT A; 4WUR A; 1VLB A; 1MJD A; 3SFE B; 1I4X A; 2V4L A; 4QAY A; 2OOB B; 3A1Q B; 3MTN B; 2LZ6 A; 2GI9 A; 3ZRC A; 1SGH A; 2IGG A; 4MT5 A; 5E6P A; 4FXC A; 3AUL A; 2D3B A; 5AZH A; 2REX A; 5LLI A; 2J0M A; 3R7R A; 1L0Y B; 3L0W B; 3KWL A; 1JRP A; 1HTQ A; 1D5X C; 4ICV A; 3DBL I; 1V8C A; 4FJZ A; 3VDZ A; 3IAS 1; 3OAW A; 4KX6 B; 5HI1 A; 3KUC B; 1WJU A; 4ZYN A; 4KGR A; 2DAJ A; 2ZVN A; 3IXS A; 2TSS A; 4ANU A; 3IT6 B; 2C5L C; 4X57 B; 2FAZ A; 2V3N A; 4HXD A; 4FLH A; 5FR6 A; 5J17 A; 2BTE A; 1TBE A; 4WAA A; 3W5V B; 2WQY B; 2SAK A; 1VZ7 A; 3PT2 B; 1ZUD 2; 3JW0 X; 2QIL A; 3GP7 A; 4MJS A; 3KWV A; 4W9C A; 2LGD A; 1C1Y B; 3PGE A; 2LRU A; 1WYG A; 3W9C B; 4MSM B; 5BYR A; 1GPX A; 1VDV A; 3ENE A; 1RAX A; 4L23 A; 2Y5B B; 1WI0 A; 4KGS A; 4DK5 A; 4WQO B; 1AAR A; 3GOE A; 3P4R B; 2Y5C A; 1KH0 A; 3PHW B; 5C1Z A; 1ZDV A; 1AYF A; 3RD2 A; 4WWN A; 3U30 A; 2OED A; 1T6B X; 1TIF A; 2IGD A; 2LHE A; 3DPD A; 2ZCB A; 2V1Y A; 3VVW B; 2PTL A; 4B0E A; 3RI7 C; 3ZRF A; 1E8Y A; 1N62 A; 1A70 A; 2W55 A; 1Q0W B; 3TEW A; 3RYT A; 3N32 A; 3SEB A; 2KJH B; 3QJZ A; 2J42 A; 4K7S A; 2Y5P A; 3Q3F A; 3PRM B; 2RD0 A; 1TS3 A; 3TL5 A; 2JYT A; 4IWQ A; 1LM8 B; 2B3A A; 2AQ1 B; 2DYB A; 1LXD A; 3B08 A; 3HIZ A; 4K3B A; 4EOY A; 2UWQ A; 2MHJ A; 4TMA B; 3AEC B; 3AE1 B; 3BVM A; 4OVZ A; 1XO3 A; 2MEK A; 2GRI A; 3RNE C; 1XXG A; 2INP E; 4IWO A; 4RM9 A; 4C7Y A; 2K0P A; 1L2N A; 2NBU A; 1CK1 A; 3PSE B; 1R7S A; 3B9J A; 2I1K A; 1WF9 A; 1P7E A; 5JZE B; 2KVZ A; 3ZNZ B; 1SIF A; 4KZC A; 1N63 A; 2DZI A; 3MC9 A; 4UDU C; 3DVG Y; 4HKZ E; 4TQ0 A; 2Z59 B; 1JCK B; 4M0W A; 5IAA C; 3P1M A; 4KIK B; 1XEE A; 4NNJ B; 2KAC A; 1C77 A; 2ZVO A; 2IO0 B; 4W9J A; 4HVB A; 2KTR B; 3WAL A; 1X1M A; 2PVO D; 4HDO A; 2XEW A; 3T3O A; 4ZRP A; 2OHF A; 5JH5 C; 4R3D A; 2X38 A; 3FIL B; 4ZRI A; 2O2V A; 2HJ8 A; 2HTM E; 1C3T A; 3O13 A; 4LDT B; 4ARC A; 2FID A; 1E6E B; 2KMM A; 1WIA A; 1V86 A; 3BII D; 1NEK B; 3N1Y C; 2AL6 A; 1VD2 A; 1P9D U; 3R7Q A; 3NHE B; 3ZTD A; 1K51 A; 1YN4 A; 2VH1 A; 3ZNI D; 5FK9 C; 4BZA A; 1OQR A; 4F1S A; 1LFD A; 1DYQ A; 4E74 A; 2N9L A; 1ACC A; 4JIO U; 3KVF B; 3AM9 A; 2N7E A; 2AEH A; 2LRW A; 1C4C A; 3DVG X; 2L83 A; 1MHX A; 3HM6 X; 2KTF A; 4US9 A; 4RGM A; 4BBN F; 4MGY E; 5EDS A; 1WGK A; 4ZOH C; 1IBX B; 5GMV A; 1R4M B; 3W1S C; 4J6I A; 4EZK A; 3HVZ A; 2WXO A; 2QJL A; 3R2T A; 1NEN B; 4A55 A; 1MI0 A; 5G55 A; 1MG4 A; 1JAL A; 5IKC M; 1ET9 A; 1P98 A; 2G4S A; 2D3C A; 4GOC A; 4M00 A; 1FEH A; 5C2T B; 5J18 A; 4I6L B; 5BMI A; 2KN4 A; 4RMA A; 1FXT B; 2N9X A; 2PJH A; 5EE9 A; 1IUE A; 5IOI A; 3QX1 A; 3GZN B; 3RT3 B; 4RGN A; 1GC6 A; 3IFW B; 4WAF A; 1F2R I; 1EM7 A; 4W9K A; 1UGJ A; 5G5H A; 4W9H A; 4LNF A; 5D2M B; 1JQ4 A; 2BWF A; 2JRH A; 3PRE A; 2LGY A; 1UZX B; 5BMG A; 2BS2 B; 1WFY A; 1Q1O A; 2DYO A; 1T0Y A; 3RN9 C; 1BUI C; 2NTT A; 2BS4 B; 3TMP B; 3IT4 B; 1JML A; 2NS5 A; 5MPO A; 2G4D B; 1PFD A; 3N30 A; 1VCB A; 1QT9 A; 1GB1 A; 3GE3 C; 1A5R A; 3AEF B; 4JPS A; 2NPT B; 3PPA A; 2CHW A; 3L17 A; 2DZM A; 1YX6 B; 1LQB A; 2YEP B; 4ZYS A; 4FN2 A; 5L83 A; 2ZZP B; 2BKR B; 3CF6 E; 4L1B A; 4D2K A; 3VXW A; 4REZ A; 4BKT A; 3RNA C; 1CQV A; 1J8C A; 3W2D A; 4OHJ A; 3J9C A; 4IM3 A; 2KDB A; 3ZLZ A; 5DPS A; 1AWD A; 2WYQ A; 2WXH A; 2D11 A; 1KLU D; 3QC8 B; 2WGS A; 4GDK A; 1TKG A; 2AQ3 B; 4YL8 A; 1KF6 B; 2FBW B; 3AEE B; 4ASW C; 1RYJ A; 4ZHP A; 4ANV A; 1CJE A; 1FPY A; 2JSV X; 3Q8B A; 2V4I B; 1Y56 A; 3SDL C; 3ZJT A; 5AEK B; 3GS2 A; 2LHD A; 2AWT A; 3A4S C; 3M95 A; 1QOA A; 2BW2 A; 4JGH B; 2L7R A; 3W1S A; 2MW5 A; 5H8Y E; 2ZNV C; 2KN5 A; 4WJQ A; 3U7D A; 3E56 A; 2E3T A; 3A9K A; 2N9E B; 1FD6 A; 1SE4 A; 4WJO A; 3VRA B; 4ICU A; 1QF6 A; 3ZJV A; 2FCS A; 4URK A; 5D7G A; 2H89 B; 3X0W A; 2PE9 A; 1SSN A; 4EEW A; 4BOZ B; 1NYR A; 4YSY B; 2V3P A; 4G50 A; 2PKO A; 2GLS A; 4XC2 A; 2FUH B; 3Q6B A; 3CIR B; 1EO6 A; 2CR5 A; 3WAO A; 4WWO A; 3EFU A; 1WE6 A; 2YLM A; 3CST A; 4MGK E; 1K53 A; 1C79 A; 3UI3 A; 4MH8 A; 2M56 B; 5AZG A; 2IDY A; 3BVG A; 3PZD A; 1ZGU B; 3ML8 A; 3VR9 B; 1KM7 A; 1WGY A; 3HRD D; 1OQQ A; 4OVV A; 2KWC A; 2PIA A; 4GGQ A; 2RDH A; 3KQ4 A; 2AQ2 B; 2R61 A; 4MGZ E; 2H88 B; 4LK0 M; 3P4Q B; 1UH6 A; 5CTR C; 1V80 A; 1QOG A; 2GBN A; 1I42 A; 4YSX B; 3HHM A; 3BWU D; 4NJ6 A; 1XLO A; 2KT7 A; 2KHW B; 3JSV B; 4MM3 A; 2GB1 A; 5IA7 A; 2JX5 A; 2KMC A; 1WGD A; 2WXP A; 4RFB A; 3AE4 B; 4Q2J A; 2N7D A; 1WXA A; 1E7U A; 2MBO A; 1PGB A; 4JWS C; 4IDI A; 4RGO S; 1E90 A; 3ZDM C; 2KC2 A; 2KDI A; 2WXM A; 1WZ3 A; 4WWP A; 2RDG A; 2ZNV B; 3A4R A; 4HCN B; 2JRI B; 3IAM 1; 3MFG A; 2L52 A; 3BZD B; 4TQ1 A; 2CKH B; 1STE A; 2A4Z A; 4M02 A; 4XE0 A; 4WWM A; 2L8J A; 2LMC A; 2JWU A; 2N9P C; 1N5W A; 4C4V B; 4M8M A; 3ABV B; 3V3X A; 2KDF B; 1K52 A; 2DLB A; 4AOF A; 1Z5S B; 2JWZ A; 4FAD A; 4K3C A; 1RFA A; 3TJP A; 3TSS A; 2Y3A A; 3BK2 A; 2WHI A; 1E7V A; 2HD5 B; 2GBR A; 3UQA A; 4AJW A; 3P42 A; 2IYD B; 5CHW A; 1EU4 A; 1Y8R C; 4GXB A; 2PVG C; 4PYU A; 1KFY B; 3EHV A; 3ZYY X; 1OEY J; 1QQR A; 2W82 A; 2RR9 A; 3K9P B; 1TY2 A; 2KQ7 A; 5TR5 A; 3VUX A; 2EMT A; 1I35 A; 1UD7 A; 4XWT A; 4MSQ B; 2LVQ A; 3ZNG C; 2FE8 A; 5DPR A; 2OJR A; 1YQB A; 2G9H D; 1LGR A; 3M63 B; 5HFY A; 1KOT A; 1DOI A; 3HUI A; 2I2Y A; 5LXI B; 2WXI A; 3RZF A; 2E6X A; 1K8R B; 4W9L A; 5FR3 A; 3CMM B; 4NJC A; 1JWB D; 2LVP A; 4E3C A; 3ZNH B; 2BYE A; 2CJO A; 2XK5 A; 2PPH A; 4KKJ A; 3A9J A; 3BVZ A; 2I1J A; 3TEZ A; 4LNI A; 1YJJ A; 4MJS B; 3AE9 B; 4C56 C; 1KTK A; 3AN1 A; 5DCN A; 1OEY A; 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1WWT A; 4TUU A; 1D5Z C; 3RMK C; 3MHS D; 3VTU A; 3L16 A; 3NS1 A; 3WA0 A; 4LCD E; 3QWZ B; 1BML C; 1E0Z A; 4GDL A; 3PRP B; 3IVF A; 1F0Z A; 1WE7 A; 2WLB A; 4HRS A; 5L95 C; 3M3J A; 1TZO A; 4FHJ A; 2W9N A; 2XNA C; 2V3S A; 3AU4 A; 5G5G A; 2M1M A; 3V60 A; 3ZTC A; 4GN1 A; 2YEP F; 2O6V A; 4LTU A; 1WH3 A; 2IBI B; 4EZL A; 3AEB B; 5IN7 A; 1V5O A; 2PW9 A; 3LDZ E; 5EE3 A; 2BYT A; 2GBK A; 2MJD A; 2KWU B; 3O65 B; 5GXG B; 2MRP A; 4CO7 A; 1TS4 A; 2MA9 B; 2BB6 A; 1JWS D; 1R4N B; 3FC4 A; 5FKA C; 1NI3 A; 3PZ7 A; 1J0G A; 4AJY B; 1BXT A; 1UBI A; 2BVC A; 1P0R A; 1M94 A; 1T0Q C; 4JWU C; 3EUB 2; 4RM8 A; 2M0X A; 1WJN A; 3C8Y A; 2C9W B; 1WXM A; 1LO5 D; 1SJH D; 2KX3 A; 4JLC A; 3DWG C; 3P4S B; 4DQO C; 2K5P A; 2MBE A; 1QLB B; 2LJI A; 5G2N A; 1TGZ B; 1MG8 A; 3C19 A; 1J7A A; 2LWP A; 1MHH E; 3VUW A; 3TCA A; 1JW9 D; 1Q5W B; 1JRO A; 3H8H A; 1L0V B; 2WNM A; 1TTN A; 2IJ0 A; 3DDC B; 5JHB A; 3PS6 A; 3I3T B; 4XDC A; 4GMV A; 2EEL A; 1GUA B; 3LYY A; 4USA A; 4RCO A; 1WMH A; 3U52 E; 3WAN A; 1H4R A; 3EC8 A; 3L13 A; 3LB8 C; 1ZW7 A; 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