The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
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sequence length |
66
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structure length |
66
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Chain Sequence |
MNVTVEVVGEETSEVAVDDDGTYADLVRAVDLSPHEVTVLVDGRPVPEDQSVEVDRVKVLRLIKGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
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| source organism |
Haloferax volcanii
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| publication title |
Structure of a protein from Haloferax volcanii
rcsb |
| molecule keywords |
Small archaeal modifier protein 2
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| total genus |
5
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| structure length |
66
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| sequence length |
66
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-09-14 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LJI A; 2L32 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4KIK B; 4RCO A; 3NVZ A; 2FNJ B; 4A8X C; 3T3O A; 1DOI A; 1SE3 A; 3VVW B; 3VUW A; 2KTR B; 1MI0 A; 2GBJ A; 2C7N B; 2D3A A; 1G6J A; 3K9O B; 3BK2 A; 3QA8 A; 5TSS A; 3RUI B; 1PGB A; 1V81 A; 2LI5 A; 1Q0W B; 4IUM B; 2JZ3 B; 1R4M B; 1GB1 A; 3APF A; 4A3P A; 1VZ7 A; 3B2G A; 3TL5 A; 1D6E C; 2LEK A; 4WJP A; 2EMT A; 3PLU A; 1V2Y A; 4LTU A; 1FMA D; 4M8M A; 3L4P A; 3P42 A; 2KQS A; 1V6E A; 1OQR A; 3FKY A; 3ETR A; 3PZD A; 2ZVN A; 1D5X C; 4LNF A; 2KTF A; 2PVG C; 2A5U A; 1GOZ A; 3V6C B; 2N9K A; 4MEL A; 2WU2 B; 2LJ5 A; 3NS1 A; 5JHB A; 2LWP A; 1E7V A; 2WYQ A; 2ZNV B; 2QC8 A; 4AOF A; 1BXT A; 1RAX A; 2JU6 X; 4NAW B; 1N60 A; 4GGQ A; 1FCC C; 3ZDT A; 1E8X A; 4YTN B; 3V05 A; 4QAY A; 2DYO A; 3APC A; 4NZL B; 2N9X A; 2MJE A; 2HDE A; 5FR6 A; 1C79 A; 1JWB D; 2HE7 A; 2L0T A; 2QJL A; 3Q3N C; 1E8Z A; 2PTL A; 2D5G A; 1N5W A; 1L0V B; 2DNF A; 1CQV A; 3OG5 A; 5DPR A; 1WX7 A; 3TCA A; 1C1Y B; 2BYT A; 1NYQ A; 4FN2 A; 1LO5 D; 1BUI C; 3OJ4 B; 3N30 A; 4WJQ A; 1TY2 A; 3RNA C; 2WXO A; 1P9D U; 1Q1O A; 1TS2 A; 4KDL B; 1T6B X; 1UWM A; 4K7S A; 3VQI A; 2FUH B; 3DWM A; 2EMS A; 1UWX A; 1VZ8 A; 4Q2J A; 3HIZ A; 1IBX A; 4LNN A; 1NEN B; 2MRP A; 4ACF A; 1WXM A; 3DVG Y; 1HEZ E; 5IOI A; 3QCA A; 1HE8 A; 1YIW A; 2FIF A; 3GE3 C; 3RN9 C; 4YL8 A; 2IO0 B; 4S17 A; 4US8 A; 2L0F A; 2LRW A; 2BWE S; 5G2N A; 2J0M A; 1KOT A; 4HXD A; 3AE8 B; 4HWI B; 4BKG A; 1FFV A; 4EE2 A; 2FE8 A; 2NMQ A; 2ZCC A; 3DOW A; 3V62 A; 2LFI A; 4G11 A; 1P7E A; 4AJW A; 2WXP A; 5D3D A; 2XK5 A; 4DK5 A; 2JZZ A; 4FJY A; 4BKS A; 3UIO B; 4US9 A; 5EDS A; 2JRH A; 2W55 A; 1RFA A; 2K0P A; 3R7Q A; 4GXB A; 4IM3 A; 1VD2 A; 1WRI A; 5AZF A; 4TUU A; 2Y5C A; 5LXH A; 3PVL A; 1D3Z A; 2J52 A; 2NBW B; 2KN4 A; 2BS2 B; 5G55 A; 2CHW A; 2PEA A; 1JCK B; 3QAQ A; 1YQ3 B; 1TZ1 A; 1WYW B; 5MPO A; 3ZNG C; 4F7Z A; 1SB3 C; 3CST A; 3VRB B; 2IYD B; 3CF6 E; 3NZ3 A; 1YJ1 A; 2XN9 C; 5FR3 A; 3IBE A; 2WXL A; 3AE7 B; 4IWQ A; 2ACZ B; 2BKR B; 2MBH A; 3AE2 B; 2LGY A; 2JZP A; 2PE9 A; 5JZE B; 1DOY A; 1FFU A; 3RUL A; 1NEK B; 4NY0 A; 2IY1 B; 2E3T A; 2N9P C; 3EFC A; 1E5W A; 4B6W A; 2JF5 A; 1WSP A; 2G9H D; 3QHT A; 1YX5 B; 3BVM A; 1WR1 A; 1ZDX A; 3P4P B; 1EF5 A; 1WJU A; 4RGT A; 1V86 A; 3L0W B; 3PGE A; 3N3K B; 3N1Z C; 3I3T B; 2GBN A; 3EA6 A; 2LMC A; 1QLB B; 3M63 B; 4YSZ B; 3AEG B; 3U8Z A; 5IP4 D; 3DVN U; 3LJ3 A; 3DPD A; 3SD5 A; 1OQQ A; 3URY A; 2R61 A; 4JLC A; 2KT7 A; 3PZ8 A; 1T0Y A; 2CHZ A; 2MP2 A; 4FA6 A; 1KM7 A; 1VCB A; 1WMH A; 2UYZ B; 1IGC A; 4ZRK A; 2WDV B; 1ZGU B; 2KHW B; 2NR2 A; 4KDI C; 1ZDV A; 1HTQ A; 2J4X A; 2LHD A; 5HG2 A; 3Q2A C; 4O1N A; 5AEK B; 2EKE C; 3MJW A; 1ET6 A; 3KVF B; 1L4D B; 5C23 A; 1L4Z B; 3R66 C; 2E6X A; 2WXJ A; 1SE9 A; 3PRM B; 4EZL A; 1JWS D; 4NPN A; 1C76 A; 1WXA A; 1SJE D; 1UUP A; 5G5G A; 2KFK B; 3RYT A; 3TMP B; 3PHX B; 1E7U A; 1EUV B; 4PS3 A; 1T5X D; 2L1A A; 4KSL C; 2K8B A; 1WJ6 A; 3DBL I; 5BYQ A; 2W3S A; 2AEH A; 1AWD A; 2PMV A; 2QHO A; 4LK0 M; 2SAK A; 3HVZ A; 4LNK A; 4HKZ E; 3BYY B; 3KWL A; 3VTV A; 4URK A; 5E6P A; 3AMZ A; 4BOS C; 1YOV B; 2H88 B; 2KC1 A; 1TY0 A; 2BKF A; 3W2D A; 1TJE A; 2WXR A; 2NPT A; 2WP9 B; 1KJT A; 3FIL B; 2IO3 B; 4GOC A; 1M4V A; 3ZTD A; 2M17 A; 3IVF A; 2ZVO A; 3ZYY X; 4HK2 A; 2ON8 A; 2O6V D; 1TKY A; 3OJ3 A; 1FXT B; 3O65 B; 2CU3 A; 3TBL D; 1C4C A; 4DQO C; 1NBF C; 3DBR B; 3NG0 A; 2K22 A; 3Q3J A; 3PV1 A; 1FEH A; 1HA5 A; 2K3U A; 3Q3M C; 3B0A A; 2JSV X; 3BZD B; 1WX8 A; 5TR5 A; 4FHK A; 2LXA A; 2YEP F; 1DGJ A; 2Z0E B; 1PGX A; 5IO9 A; 3VH3 B; 5KHO A; 4PK1 A; 1Y8R C; 3PRZ A; 1QOG A; 2KVZ A; 2KDM A; 3VFK A; 2AL6 A; 5JH5 C; 4NJC A; 2IZV B; 3SFE B; 2GRI A; 4J6I A; 1N61 A; 1WWT A; 1Z5S B; 1JWU D; 4DHZ E; 1D4B A; 2N1V A; 2N0S B; 2AQ3 B; 1FM0 D; 4BOZ B; 3BYT B; 3VR8 B; 5BMH A; 3AB5 A; 3HUI A; 5D3I B; 2KFJ A; 2D3G A; 2QIL A; 5JXV A; 3DCG A; 3P4R B; 4HPL B; 3VH4 B; 1FXI A; 3CMM B; 2KJH B; 4IOI E; 3W1Y A; 3B2F A; 3BIN A; 2K5P A; 1F0Z A; 4M00 A; 5BYR A; 2JRI B; 1JRO A; 2WXQ A; 1HZ6 A; 4NNJ B; 4YXD B; 2KMC A; 3I9V 1; 1RM6 C; 2KMA A; 2PW9 A; 2KQ4 X; 2L7R A; 1V1P B; 2FCQ A; 2D3B A; 1X1M A; 2KVR A; 4BVU C; 2IND C; 4L1B A; 1FNV A; 1S1Q B; 2JYE A; 4KGT A; 1KFY B; 4RF0 A; 2EKI A; 1I35 A; 5C2T B; 2O6V B; 2KOX A; 1K53 A; 4FLH A; 3NZS A; 3O13 A; 5E6J A; 3LXF A; 3KUD B; 4FXC A; 2WX1 A; 3HM6 X; 2GI9 A; 3VAW A; 2KWU B; 2WXH A; 4HJG E; 4JWS C; 2HJ8 A; 3AEC B; 3LB8 C; 4ANX A; 4RH6 A; 4A20 A; 1PDX A; 4LDT D; 3PO0 A; 4E71 A; 3P2B A; 3GB1 A; 1YQB A; 4HCP B; 4MM3 A; 1T0Q C; 5EE9 A; 1I4X A; 3IFW B; 4EFO A; 4P7I A; 2H89 B; 2C60 A; 5I4D A; 4FJV B; 3H9D A; 1E0Z A; 3GOE A; 3X23 A; 4HLE A; 3AV8 A; 1QKZ A; 3L16 A; 5HI1 A; 3ZRF A; 4NJ7 A; 2WX0 A; 2KWD A; 3BWU D; 5DPS A; 4ITK A; 1JAL A; 1FRR A; 1FD6 A; 2IBI B; 4ARC A; 4F8C B; 4BBN F; 3AED B; 5D7G A; 4A3O A; 1H8C A; 2J0J A; 2DLB A; 4MDK E; 1QF6 A; 2DEN B; 1RLF A; 4E74 A; 1KTK A; 1T3Q A; 1AN8 A; 3ZRC A; 3KWV A; 3N32 A; 3IAS 1; 4RMA A; 3IAM 1; 2D11 A; 1OEY A; 4FUL A; 3ABV B; 1QOF A; 4WQM A; 2X38 A; 2J53 A; 2RDH A; 4S0R A; 4TQ1 A; 4B0E A; 1WFY A; 3A1Q A; 2R2O A; 1OEY J; 4KIK A; 1PUT A; 1KRH A; 4AWJ A; 2B3A A; 3ONS A; 1JRP A; 2LGS A; 3NRZ A; 3TEZ A; 4PS7 A; 2KTR A; 2BPS A; 2N7J A; 1K51 A; 1IYF A; 2Y5B B; 3EHV A; 1WGD A; 3DBH I; 4RGO S; 1QQR A; 5AZG A; 4BKS D; 1VJK A; 3E9S A; 1I4P A; 1JRU A; 1J19 A; 4LDT B; 2IDY A; 3ZJV A; 4K1R B; 4ZHP A; 1XO3 A; 4EUT A; 1STE A; 1UH6 A; 1C77 A; 1OQY A; 3HRD D; 1GAQ B; 4KGR A; 4W9C A; 1UGM A; 4WJN A; 3HHM A; 1WI0 A; 1UF0 A; 2CJO A; 1WIA A; 1WR6 E; 1K50 A; 4MGY E; 3PRP B; 2D3C A; 1L6V A; 5GXG B; 3AU4 A; 4X57 B; 3KW5 B; 3C8Y A; 1Q10 A; 2MBB B; 3DWG C; 4W9G A; 1NI2 A; 3ZVV A; 2QCZ A; 4LNO A; 5HKH A; 3BY4 B; 3SR6 A; 5FK9 C; 2BVC A; 5EE3 A; 2DBY A; 2K6Q A; 1WZ0 A; 2BBC A; 3NUH B; 4HCN B; 1R4N I; 5G5H A; 4MEM A; 3GS2 A; 3NJT A; 5DPW A; 4DDG D; 4IG7 B; 4L23 A; 4R3D A; 3VUX A; 3GZN I; 2INN E; 1N63 A; 4PT5 A; 1F77 A; 2JWU A; 3ZGZ A; 1QIL A; 3AEA B; 3LYY A; 1SIJ A; 3Q8B A; 4OVV A; 4M8N A; 5JHA A; 4M01 A; 1E6E B; 1E8W A; 5HFY A; 4C56 C; 2K1F A; 3PLV A; 2JPH A; 1EU3 A; 1Y56 A; 2N9L A; 4DXG A; 2WWZ A; 1MG8 A; 5BO4 B; 3MP9 A; 1J0G A; 2BF8 B; 2DAJ A; 4GDL B; 2MCN B; 3RZW C; 1V5T A; 2IGG A; 3W9C B; 3UIN B; 1WE6 A; 3A9J B; 3W1S C; 1E10 A; 4XDC A; 4II2 B; 4H2A A; 1WGK A; 1YN4 A; 4HPM B; 4YTP B; 2LUE A; 2VH2 A; 1TKG A; 4W9J A; 3RMK C; 1LXD A; 2KX3 A; 3U4E G; 2VZK D; 1BT0 A; 3NY5 A; 4RM8 A; 5D6J B; 1XEE A; 2YVC A; 1WY8 A; 2K8H A; 2REX A; 3NVV A; 2WXI A; 2IGH A; 2M1M A; 2WDR B; 4UDU C; 4MH8 A; 1DYQ A; 2MBO A; 3Q8C A; 4AUQ C; 3Q8F A; 3CWI A; 2Z59 B; 1H4R A; 1PGA A; 4GDK B; 3MTN B; 1CMX B; 3WAO A; 1UD7 A; 3H7P B; 2LJI A; 2PLP A; 1B1Z A; 3IHP C; 3ZNZ B; 3PSE B; 3ML9 A; 2KZR A; 5EE0 A; 3SEB A; 4GU2 A; 4DXA B; 1V9J A; 2G4S A; 3R7R A; 4N59 A; 2DWQ A; 3MC8 A; 3V60 A; 2JWZ A; 3VTW A; 5IKC M; 2WU5 B; 3AE6 B; 5L83 A; 1FPY A; 5H92 C; 1IUE A; 2WNM A; 2PIA A; 2CS4 A; 4DDI D; 3QJZ A; 4B9K A; 2SEB D; 5E6N A; 1UEL A; 1FCL A; 1KLG D; 1ROE A; 2ICI A; 1N5X A; 2KKC A; 3ZJT A; 4IM2 A; 3U52 E; 3ZDM C; 2CJN A; 4USA A; 1UBI A; 1VLB A; 3AE1 B; 4MJS B; 3ALB A; 2KDE B; 5J17 A; 1KH0 A; 1BML C; 1RFK A; 1SIF A; 2JY6 A; 1ACC A; 2RPV A; 2IO1 B; 1D5Z C; 4TSS A; 2AWT A; 2MP2 B; 4BBN C; 2Y3A A; 4P16 A; 1P3Q U; 2VZK B; 1IPG A; 3GP7 A; 2O2V B; 3KYD D; 1FXA A; 4NJ6 A; 2LHE A; 4RNA A; 4WIP A; 2C9W B; 2MLB A; 2M4N A; 1YN5 A; 3J9C A; 3RPF C; 1F52 A; 3NOB A; 2MEK A; 3V3X A; 4JX1 C; 3M62 B; 2C5L C; 2ZW0 A; 2GMI C; 4GN1 A; 2M19 A; 3DVN V; 2D10 A; 2HD5 B; 3DBS A; 5T8I A; 2L3Z A; 1WRD B; 3H6N A; 1WH3 A; 4WQO B; 1P98 A; 1XLP A; 3QK0 A; 1TZO A; 1QZE A; 1SXT A; 5EE1 A; 2VRR B; 1VZ6 A; 5BYS A; 3TEW A; 2IO2 B; 1ISN A; 1KF6 B; 1T0R C; 1NVI D; 1F9J A; 4YWG G; 2UU7 A; 2KD0 A; 4RM9 A; 1V1O A; 4HRO A; 3T9L A; 4REZ A; 3BVG A; 2KFK A; 2QDF A; 4EEW A; 2ZZP B; 2IGD A; 5CHF A; 5LXI B; 4HDQ A; 4BAX A; 4YSY B; 5IAA C; 2YEP B; 2MQJ A; 5E6O A; 1MFW A; 3A4R A; 4IKG A; 3ZUN A; 2V1Y A; 1L0Y B; 4XWW A; 4W9H A; 4IDI A; 1EF1 A; 2LD9 A; 3RT3 B; 1PQS A; 3PRE A; 2M56 B; 2LGD A; 3ZXV A; 2JXT A; 4LLG M; 1ENF A; 1A5R A; 3I63 C; 2MX2 A; 4KSK C; 3PHW B; 4TMA B; 4C80 A; 4WJO A; 1YN3 A; 4D2K A; 3Q6B A; 2GBR A; 4XX5 A; 3ZO5 B; 3RNG C; 3FIL A; 2N7D A; 2FCN A; 5AUK A; 1RWS A; 3P4Q B; 1J8C A; 2V3N A; 1SE2 A; 2M8S A; 3ZW3 A; 2G4D B; 1WGR A; 4W9L A; 3NVY A; 3N1X C; 1R4M I; 4M02 A; 2FBW B; 4PYU A; 3QX1 A; 2V0G A; 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4W9K A; 4OVU A; 2L83 A; 2L52 A; 1XD3 B; 4MGZ E; 2UWQ A; 2LVP A; 2KNB A; 3Q3O C; 3RNF C; 2LAS A; 4MT5 A; 3HVD A; 1GG3 A; 1JML A; 2JQR B; 3DBL B; 3Q14 C; 3DHH C; 3AEE B; 2GLS A; 3JW0 X; 2Q5W D; 3FC4 A; 3MHZ A; 3N1Y C; 2Z8L A; 2RDB C; 3NS8 A; 3AM9 A; 2AX5 A; 2AQ1 B; 4MGI E; 1ZP0 B; 4LCD E; 4XWT A; 2N9E B; 4GSW A; 3N20 C; 5CHW A; 4RFB A; 3U7D A; 3TUO A; 3Q8A A; 3ZNH B; 4RGN A; 3AE3 B; 4JPS A; 1HTO A; 2W54 A; 3KH0 A; 2BYE A; 1KLV A; 2KMM A; 1WM2 A; 2PJH A; 1J7C A; 2TSS A; 3UIP B; 5D94 A; 3JYU A; 3AU5 A; 2ZPY A; 4XGA B; 1N62 A; 1WJ4 A; 2EEL A; 3H7S A; 4A90 A; 4ZDV A; 3A1Q B; 4C7Z A; 3WAM A; 1P1A A; 3R2T A; 1FNU A; 2RDG A; 2LUM A; 2FCS A; 2W82 A; 3R3M A; 4IW0 A; 4JIO U; 4AP4 C; 2KX0 A; 2WDT B; 3EGR A; 4NQL B; 4K3B A; 2BB6 A; 1WXQ A; 1JW9 D; 1UNS A; 2L76 A; 4E3C A; 4GMV A; 3I5J C; 2B76 B; 2DZI A; 3CSF A; 3L13 A; 4CQN A; 2J0K A; 1C9F A; 3L10 B; 4ARI A; 4W9I A; 2FUG 1; 3R8B A; 1OTR B; 3DHG C; 1S3S G; 3MC9 A; 1EO6 A; 1LFD A; 3M3J A; 1E90 A; 2NBV B; 2MHJ A; 1GJZ A; 2A4Z A; 1PYW D; 2M0A A; 3PT2 B; 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