The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
MQYKLVINGKTLKGETTTKAVDAETAEKAFKQYANDNGVDGVWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Spatial elucidation of motion in proteins by ensemble-based structure calculation using exact NOEs.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Streptococcus sp. 'group g'
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| total genus |
9
|
| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-06-18 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2OED A; 2JZP A; 1K53 A; 2N9L A; 2LHD A; 1PGA A; 1YNT E; 2GB1 A; 2LHE A; 1HZ6 A; 1MVK A; 5HFY A; 2I38 A; 4IKG A; 5HHD G; 1P7F A; 1FCL A; 2JXT A; 5BMI A; 2ON8 A; 2K0P A; 2ZW0 A; 1XCT L; 2KAC A; 4OZB A; 1XCQ L; 1KH0 A; 1IBX A; 2KN4 A; 2JWU A; 1HZ5 A; 2J53 A; 1K52 A; 2QSD A; 3V3X A; 1MI0 A; 1YMH E; 2KDM A; 2JU6 X; 1P7E A; 1XF5 L; 3FIL A; 2RPV A; 1IBX B; 1UWX A; 2GI9 A; 2PTL A; 2IGD A; 1F2R C; 1EM7 A; 2PLP A; 3MP9 A; 2LUM A; 2IGG A; 4WH4 A; 2QMT A; 5HI1 A; 1QKZ A; 4KGS A; 4IOI E; 2LGI A; 2KWD A; 1MPE A; 1Q10 A; 4OZA A; 1MHH E; 2RMM A; 5BMG A; 3FIL B; 4HJG E; 4D2K A; 2N9K A; 5BMH A; 1IGD A; 4OZC A; 1K51 A; 2J52 A; 1IGC A; 3UI3 A; 1D4B A; 1F2R I; 2N7J A; 5HG2 A; 1PGB A; 1FD6 A; 1FCC C; 1PGX A; 2IGH A; 1GB1 A; 2I2Y A; 1C9F A; 1JML A; 2PW9 A; 1GB4 A; 2EEL A; 4KGR A; 2ONQ A; 2JSV X; 5JXV A; 1HEZ E; 1K50 A; 4GLS C; 4HKZ E; 1ZXH A; 4MAC A; 4KGT A; 2NMQ A; 3GB1 A; 2KQ4 X; 1MHX A; 2ZW1 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1JRU A; 5IOI A; 1PUT A; 1UD7 A; 4IM2 A; 1NYR A; 1YX5 B; 1OQY A; 3IHP C; 1RWS A; 3KLS X; 3EEC A; 3HHM A; 1P9D U; 3EFC A; 4TSS A; 1OGW A; 4B0M A; 5L95 C; 2IPK D; 4G0N B; 4GGQ A; 3E9S A; 2FUG 1; 3APF A; 1T0Y A; 4MH0 E; 3RNF C; 3A4S C; 2JPH A; 3WIM A; 2WXQ A; 3Q3M C; 2AQ2 B; 1XCT L; 3ZUN A; 1XT9 B; 2QJL A; 1IUE A; 2BWE S; 1XCQ L; 4F8C B; 3AI5 A; 1I4G A; 1T0S C; 3RNB C; 3ABV B; 4LLG M; 2QCZ A; 3Q8E A; 2JWU A; 4NJ7 A; 1WX9 A; 2B76 B; 4BAX A; 4ITK A; 3TEZ A; 2R2Q A; 5D3I B; 2PIA A; 4I6N B; 3EGR A; 2ZEQ A; 2MH7 A; 2HTM E; 4X57 B; 2WXP A; 2FCN A; 4LDT D; 3TUO A; 1YMH E; 3D32 A; 2KX3 A; 2A4Z A; 2K6Q A; 2VZK D; 4A8X C; 3NVZ A; 4WJN A; 1F1H A; 5HI1 A; 1EU4 A; 2LWP A; 2N0S B; 2DHZ A; 1WFY A; 5G5G A; 4FUL A; 4IG7 B; 5CHF A; 3VDZ A; 2BTE A; 3KWV A; 5BMH A; 3AE5 B; 4ZHP A; 1H8C A; 4US8 A; 1AWD A; 5CX3 A; 2DZM A; 3KW5 B; 2OJR A; 3Q2A C; 3P63 A; 1Q5W B; 3Q3O C; 2HD5 B; 2GBJ A; 1C9F A; 3UQA A; 2NBW B; 3DBH B; 2V1Y A; 2MP2 B; 1WXQ A; 2LGY A; 1YX6 B; 2I1J A; 2WDR B; 1L7Y A; 1N5X A; 1JW9 D; 1WX8 A; 1YJ1 A; 4P6V F; 1E10 A; 3Q6B A; 1K53 A; 5AZF A; 1GC6 A; 3RN9 C; 5E6J A; 2BYF A; 2KHW B; 2GB1 A; 3P1M A; 2LHE A; 5DPS A; 3R2I A; 1YJJ A; 1WGY A; 3AE3 B; 3P4P B; 2W3R A; 4A3P A; 4HXD A; 2JRI B; 1N5W A; 3L4P A; 2R2O A; 3UIN B; 2DBY A; 2Z8L A; 3Q8A A; 3S2A A; 1WXV A; 2RPQ A; 4M02 A; 3ZVV A; 1TY2 A; 3DBL B; 5BO4 B; 2KLG A; 1V80 A; 1KH0 A; 3DBR B; 4OVU A; 4HCN B; 5DPR A; 5MPO A; 2WXJ A; 1TS5 A; 1OEY J; 4PS8 A; 1K52 A; 2NR2 A; 2ICI A; 2WXG A; 3NRZ A; 3BY4 B; 3A1Q A; 4AP4 C; 1FRR A; 4OHJ A; 1TY0 A; 1KLG D; 2V0G A; 2CJO A; 2GMI C; 5EE0 A; 2RR9 A; 2PPH A; 3Q8F A; 1L0V B; 4MDK E; 4BFR A; 1V1P B; 4IC7 B; 2IDY A; 2D10 A; 2LJ5 A; 2CHZ A; 2H88 B; 3R7R A; 1VLB A; 1E8W A; 1L4D B; 1S3S G; 4HJG E; 2MP2 A; 1SJH D; 5C1Z A; 4YXD B; 2LVO A; 3ZDM C; 2WXN A; 1K51 A; 2IO1 B; 3AXC A; 3WCQ A; 4C80 A; 1D3Z A; 1F2R I; 2JY6 A; 3WAM A; 5JHA A; 2D3B A; 4HPM B; 2JX5 A; 2BPS A; 1AW7 A; 2NBV B; 4HPL B; 3RNG C; 2PW9 A; 1B1Z A; 1SGH A; 4BKS D; 3DQV A; 3RT3 B; 1C77 A; 2HE7 A; 2GBK A; 5JH5 C; 1F52 A; 1SIF A; 4PYZ A; 3A9J B; 2LRW A; 5JHB A; 4MGI E; 4PYU A; 2V3P A; 3V6E B; 2DYB A; 5TSS A; 3R8B A; 4BOZ B; 5HKH A; 3AE6 B; 2ASQ A; 1MJD A; 2WU2 B; 3FKY A; 1QF6 A; 2IO3 B; 4A9A A; 1KLV A; 5EE3 A; 1N62 A; 2DLB A; 3GE8 C; 2Y3A A; 3H7P A; 1C79 A; 3ZYY X; 2K8C A; 2JRH A; 3SDL C; 3AE8 B; 3V61 A; 1ENF A; 1SE4 A; 3ZXV A; 2K25 A; 4REZ A; 1I4P A; 4JE3 B; 1P0R A; 2N4F A; 3TIX A; 1R7S A; 2OHF A; 2XNA C; 1V1P A; 4MT5 A; 2PEA A; 1WXS A; 2KNB A; 1XLN A; 2C9W B; 3U4E G; 1XLO A; 2GBR A; 3AEE B; 4ARC A; 1L5P A; 1F2R C; 2E6X A; 1OQR A; 2PLP A; 3P4R B; 4UDU C; 4E71 A; 1E7U A; 4WAA A; 1SSN A; 1LO5 D; 2JWZ A; 3AEG B; 1R4M I; 1ACC A; 1TT5 B; 2DYO A; 5G2N A; 3KH0 A; 5DCN A; 3FC4 A; 4XX5 A; 4ZRK A; 3SHQ A; 1I4R A; 3AH7 A; 3RFZ B; 4RGO S; 2L7R A; 3A33 B; 2INN E; 3QX1 A; 3QWZ B; 3AMZ A; 4GB9 A; 3VUW A; 3A9J A; 4FJV B; 1ISN A; 1RM6 C; 2WDV B; 4KGR A; 1V97 A; 3CSF A; 4KKI A; 3TSS A; 2G9H D; 1TS2 A; 3PRZ A; 4RNA A; 1E7V A; 2V9H A; 5BYS A; 1YNT E; 1I4Q A; 1TS4 A; 1C3T A; 1OTR B; 1ROE A; 3JYU A; 3I63 C; 3V60 A; 1Q0W B; 2N7E A; 4FA6 A; 1FNU A; 4R3D A; 3N32 A; 3HK0 A; 3RD2 A; 2G1E A; 4FLH A; 1HTO A; 2D11 A; 2LUE A; 4RFB A; 3EA6 A; 2MBH A; 2C7M B; 4W9I A; 2NTS A; 1CJE A; 4NQK E; 1J7B A; 1NI3 A; 2WP9 B; 3AEA B; 3V05 A; 3RMK C; 1V9J A; 2ZZP B; 3A4R A; 1KFY B; 1WRD B; 3LYY A; 1XD3 B; 3WA0 A; 4ZYN A; 3O65 B; 2REX A; 3H7S A; 4BBN F; 1B9R A; 1PFD A; 3NZS A; 3GP7 A; 1V1O A; 1TKY A; 2WLB A; 1UZX B; 3T8M A; 1J8C A; 3CF6 E; 5G55 A; 4KGS A; 3KYC D; 4G11 A; 2LAS A; 2WDQ B; 2DZI A; 2KJ6 A; 1MG4 A; 2ZVO A; 4ICV A; 2TSS A; 1FXI A; 2NTT A; 3LJ3 A; 3CST A; 1JWU D; 1NYQ A; 2YEP F; 2N9P C; 3DVN U; 1FD6 A; 4C00 A; 4HRS A; 1DYQ A; 3PRM B; 4TUU A; 1KM7 A; 1JML A; 2NS5 A; 3HUI A; 2KJH B; 4AJW A; 3IBE A; 3B1L X; 4GIV A; 2JYE A; 2Z0E B; 4KGT A; 4XZ4 A; 4AQ7 A; 2WXO A; 1FO4 A; 1MHX A; 3NZ3 A; 2N1V A; 4B0E A; 2MW5 A; 3MC8 A; 4DQO C; 3DVG X; 3B0A A; 3BK1 A; 2LHD A; 3ECI A; 3P4S B; 3RUI B; 1WE7 A; 2L05 A; 4OW0 A; 3AM9 A; 3BVM A; 5HFY A; 3BK2 A; 2RSU A; 2ACZ B; 2Y5P A; 2VH1 A; 5CTR C; 1SE2 A; 4W9H A; 2KC2 A; 4B6W A; 4LNO A; 1E5W A; 1FPY A; 2MJD A; 3AE4 B; 2KK8 A; 1VJK A; 4RM9 A; 3VH3 B; 2ZVN A; 1ZKH A; 2FNJ B; 1VD2 A; 3MC9 A; 3HM3 A; 3L13 A; 3MHS D; 1T6B X; 2KJR A; 1R4M B; 3ZRC A; 4LNN A; 2N7D A; 4XC2 A; 4KIK B; 3OWE B; 4MGZ E; 3ML8 A; 3PTF C; 3BVZ A; 1EM7 A; 2KZR A; 4W9K A; 1WGD A; 2CHX A; 3NJT A; 1YIW A; 3OG5 A; 4IOI E; 1R4N I; 3Q14 C; 4P16 A; 1L0Y B; 4NJC A; 1Q10 A; 4ZRJ A; 1KRH A; 5KHO A; 2QHO A; 4C56 C; 2J52 A; 3RCZ A; 1PGB A; 3T9L A; 2AL6 A; 4YTM B; 1EUV B; 3VR9 B; 1T0R C; 3ZNH B; 1P3Q U; 1WJ6 A; 4BVU C; 2WXK A; 2KX0 A; 3QJZ A; 4GLS C; 1EU3 A; 1FEH A; 1V5O A; 1HZ6 A; 4FN2 A; 4JWU C; 2O6V A; 2V4L A; 3VH4 B; 1STE A; 3KWL A; 4PT5 A; 4W9D A; 4L23 A; 1EF5 A; 3X23 A; 4II2 B; 3WAP A; 1V2Y A; 3A9K B; 3I9V 1; 1KJT A; 2J4X A; 2Z0D B; 3SD5 A; 2KQ7 A; 3N3K B; 3W2D A; 4BZA A; 3N1Z C; 3P4Q B; 1YN5 A; 3PLU A; 4USA A; 3ZIM A; 1RFA A; 2IO0 B; 2LXA A; 2M0X A; 4YTP B; 1VDV A; 2KTR A; 4M8N A; 3APC A; 2MX2 A; 1UUP A; 4Q2J A; 4P7I A; 3AE7 B; 1SEB D; 3U8Z A; 4HKQ A; 5AUI A; 1XXG A; 2KDF B; 2N1W A; 2KC1 A; 1I4X A; 4TQ1 A; 4CQN A; 4BKG A; 4KSK C; 1D5Z C; 2W3S A; 3MFG A; 4NY0 A; 5D7G A; 1OQQ A; 3U7D A; 4N6E B; 3L08 A; 1AN8 A; 1LQB A; 3BVG A; 3CWI A; 5BMG A; 3VQI A; 2ZNV C; 2CKH B; 1LFD A; 3QHT A; 4OZC A; 2PVG C; 1T3Q A; 1DGJ A; 2K6D B; 3U7Z A; 3OJ3 A; 2L8J A; 3N9Y C; 3PVL A; 3NHE B; 3ZRF A; 4AS1 A; 3AUL A; 2EKE C; 2A5U A; 2CHW A; 2BQQ A; 4II3 B; 4RH6 A; 4IWP A; 1S1Q B; 4ACF A; 3W5U B; 3UIP B; 3IT6 B; 1WYG A; 5FK9 C; 1FMA D; 2KYW A; 3PHW B; 1QOA A; 1WH3 A; 4FJZ A; 2BWF A; 1I35 A; 2PE9 A; 4B9K A; 5BMI A; 3MTN B; 1SBB B; 5L83 A; 2I1K A; 4TQ0 A; 3AED B; 4S0R A; 2L76 A; 3PRE A; 2XN9 C; 3PRP B; 4ASW C; 3JSV B; 5C23 A; 4WJO A; 2WXF A; 1R4N B; 2K3U A; 1WYW B; 1XLQ A; 1HA5 A; 2M17 A; 2JU6 X; 1ZP0 B; 5IA7 A; 3KUD B; 1YQB A; 1IP9 A; 2M4N A; 5E6O A; 2BYE A; 2IGG A; 2DZJ A; 4IUM B; 5J2R A; 3L0W B; 2ZNV B; 3JVZ X; 2NVU I; 3VVW B; 3Q8B A; 2WHI A; 3NG0 A; 3VUX A; 1U4A A; 1E0Z A; 3VXW A; 3DDC B; 2EEL A; 3DPD A; 3DHH C; 3JW0 X; 2NMQ A; 2KWU B; 3TL5 A; 3ZNG C; 2ZW1 A; 2D2Q A; 1E8Y A; 2LI5 A; 3AEC B; 3V62 A; 4G50 A; 4G3X B; 2L3Z A; 3BIN A; 1GAQ B; 4GXB A; 3RNA C; 4JL9 A; 4EZL A; 1SF0 A; 3IVF A; 2I38 A; 5E6P A; 2CU3 A; 2WGS A; 3JSV A; 3QC8 B; 1P7F A; 4MM3 B; 2RGF A; 2MSE D; 1C4P A; 5D3D A; 1HE8 A; 2HTH A; 2KVR A; 3I57 A; 3ONS A; 5G5H A; 1WM3 A; 2ZCB A; 2V4I B; 5H92 C; 4DHZ B; 4EFO A; 2FCQ A; 4IDI A; 2IYD B; 2IJ0 A; 3VAW A; 1WE6 A; 3AE1 B; 3E56 A; 3ML9 A; 5TR5 A; 4IM0 A; 2W54 A; 4EOY A; 2M1M A; 5IP4 D; 3QAQ A; 1FFU A; 1Y56 A; 2PE6 B; 1YQ4 B; 4LDT B; 5DPT A; 3B2G A; 3DWM A; 1GG3 A; 4LJP B; 2IGD A; 2KMM A; 3MP9 A; 3GZN I; 2CJN A; 2VZK B; 1F0Z A; 1TGZ B; 5D2M B; 1D5M C; 1QZE A; 3H6N A; 3LB8 C; 4ANW A; 2RMM A; 1IPG A; 3LXF A; 5I4D A; 4BOS C; 1YOV B; 3ENE A; 2NPT B; 3P42 A; 4XWW A; 1IGD A; 3RYT A; 1PQS A; 1ZOY B; 1F9J A; 5IKC M; 4F7Z A; 1HQR D; 3C19 A; 4KV2 A; 2QIE B; 3HRD D; 3L17 A; 4LTU A; 2WX1 A; 2O6V D; 1WGH A; 1Y8R C; 2X38 A; 5IO9 A; 2RDH A; 4K81 A; 3PS6 A; 4N58 A; 1T5X D; 1RYJ A; 2LFI A; 1GPX A; 4GU2 A; 3W9C B; 2DX5 B; 2JZP A; 4MM3 A; 3RZF A; 2C7H A; 4AOF A; 2K5P A; 4FAD A; 4ZYS A; 3T3N A; 1ZPS A; 1UWM A; 1QT9 A; 1SE3 A; 1NI2 A; 4XGA B; 4AJY B; 1FCL A; 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1BT0 A; 1I4H A; 1UGM A; 3PZ7 A; 2BGF A; 3DVG Y; 4N9F 4; 2JT4 B; 2KN4 A; 2MBB B; 1DOX A; 1G6J A; 1IBX A; 3GZN B; 3VHT C; 2D5G A; 4BBN C; 2BB6 A; 4C4V B; 1P98 A; 2JQR B; 4IW0 A; 3O13 A; 4LNI A; 1A5R A; 1ZDX A; 2N9X A; 1TZ1 A; 1FM0 D; 3VTW A; 2ZPN A; 3U30 A; 3Q69 A; 4A3O A; 2KFK A; 2IZV B; 4S17 A; 2O2V A; 2QMT A; 4DHZ E; 4RF0 A; 4HDO A; 4WQM A; 1C4A A; 1WZ3 A; 2IND C; 2KWD A; 1NEK B; 2JF5 A; 2DEN B; 5D94 A; 2DAF A; 2KN5 A; 4BKS A; 2L83 A; 3ZQ4 A; 4GDK B; 1E6E B; 5IAA C; 2NCN A; 1FNV A; 3R66 C; 1FCC C; 5J17 A; 1PGX A; 2IGH A; 4TKN A; 1JRO A; 1XQQ A; 1GB1 A; 2KAJ A; 1GB4 A; 2WXI A; 1UF0 A; 4GN1 A; 1OFF A; 2CS4 A; 5BYR A; 2Y5C A; 3RPF C; 1AYF A; 2KMA A; 1V5T A; 4M00 A; 4DXA B; 5FKA C; 4C7Y A; 1TS3 A; 1CMX B; 1WMH B; 3Q3J A; 1RLF A; 1ZGU B; 2D3G A; 3PO0 A; 3N20 C; 2D07 B; 1QOF A; 5J18 A; 3EC8 A; 1J7C A; 2FID A; 3NVY A; 2LJI A; 2JXX A; 1N61 A; 4WJP A; 4YL8 A; 4WWM A; 1C1Y B; 2MBO A; 2WX0 A; 3DHG C; 2WS3 B; 1TJE A; 1RAX A; 2Z59 B; 5KHQ A; 1AAR A; 1ZXI A; 2KAN A; 4URK A; 1E7P B; 3IFW B; 1QOG A; 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