The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
55
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structure length |
55
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Chain Sequence |
TYKLVINGKTLKGETTTKAVDAETAEKAFKQYANDNGVDGVWTYDDATKTFTVTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Simultaneous determination of protein backbone structure and dynamics from residual dipolar couplings
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G precursor
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Streptococcus sp. 'group g'
|
| total genus |
13
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| structure length |
55
|
| sequence length |
55
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-10-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01378 | IgG_binding_B | B domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1PGX A; 2LHE A; 5HFY A; 1P7F A; 2RMM A; 1KH0 A; 2RPV A; 4IOI E; 1K53 A; 5BMG A; 1FCL A; 1ZXH A; 4GLS C; 2ONQ A; 2JZP A; 3FIL A; 1HZ5 A; 1YMH E; 2J53 A; 2KAC A; 4OZB A; 1XF5 L; 1GB1 A; 2EEL A; 2GI9 A; 1MHX A; 1XCT L; 1PGB A; 4HJG E; 4KGS A; 5JXV A; 1FD6 A; 1GB4 A; 2NMQ A; 4OZA A; 3V3X A; 1IGC A; 2N9K A; 1QKZ A; 1P7E A; 1IBX B; 1EM7 A; 2KN4 A; 4KGR A; 2ZW1 A; 4HKZ E; 2ZW0 A; 1D4B A; 4OZC A; 1F2R C; 3GB1 A; 2KDM A; 2QSD A; 2PTL A; 1K50 A; 2K0P A; 5HHD G; 1HEZ E; 4D2K A; 5HI1 A; 1Q10 A; 1UWX A; 2I38 A; 2JWU A; 5BMH A; 2QMT A; 1K52 A; 5BMI A; 2PW9 A; 3MP9 A; 2JXT A; 2JU6 X; 2IGD A; 2LGI A; 3FIL B; 4WH4 A; 2KQ4 X; 3UI3 A; 1IGD A; 1YNT E; 1F2R I; 2GB1 A; 1PGA A; 2ON8 A; 2LHD A; 2IGH A; 1MPE A; 1XCQ L; 1FCC C; 2I2Y A; 2J52 A; 1K51 A; 2N7J A; 1IBX A; 2N9L A; 4MAC A; 2OED A; 5HG2 A; 2JSV X; 2PLP A; 4IKG A; 1MI0 A; 1MHH E; 2KWD A; 1MVK A; 1HZ6 A; 4KGT A; 1JML A; 2LUM A; 2IGG A; 1C9F A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2CHX A; 2LMC A; 1YJJ A; 4OVZ A; 3TEX A; 4P16 A; 2V3N A; 2J4X A; 3DQV A; 4JWU C; 2LJI A; 4URK A; 4BKS D; 3P63 A; 3UQA A; 1E7V A; 1NYR A; 1M4V A; 2KAC A; 4HKQ A; 3T8M A; 3GP7 A; 3ZDT A; 3Q3O C; 2D3A A; 2FUG 1; 4KZ0 A; 4K81 A; 1H8C A; 3AEE B; 4WWP A; 3PRM B; 1QQR A; 2BKR B; 2VZK B; 2WXM A; 3B08 A; 3M3J A; 4L1B A; 2IDY A; 1B1Z A; 1QF6 A; 3SR6 A; 1WE7 A; 1HE8 A; 3ZLZ A; 4YL8 A; 1AW7 A; 3DHH C; 3AXC A; 3DOW A; 5G5G A; 4FJY A; 4KVG B; 2PE6 B; 4HPM B; 4J6I A; 3RN9 C; 1LFD A; 3IAS 1; 1LM8 B; 4ICU A; 2RGF A; 2NCN A; 3ZJU A; 4GDL B; 2R2O A; 1RFA A; 3MHS D; 4HPP A; 1RYJ A; 1PUT A; 3ZXR A; 2G1E A; 1WM2 A; 2WGS A; 2GOW A; 3PZ7 A; 3WAP A; 1GC6 A; 3BIN A; 4W9K A; 1V86 A; 5C1Z A; 1IGD A; 2N1W A; 2K22 A; 2DEN B; 4LJP B; 1DGJ A; 1FEH A; 4DWF A; 2PEA A; 4R3D A; 1T0R C; 3DDC B; 2DNF A; 1VRA B; 2MW5 A; 3SHQ A; 1V6E A; 3DVN V; 2M1M A; 3A9J B; 4IG7 B; 2B3A A; 1T0Q C; 4IKG A; 4NAW A; 1MHH E; 3LDZ E; 2WHI A; 1JWS D; 2ZNV B; 2IGG A; 4DDG D; 1E90 A; 1YIW A; 1XQQ A; 2WXR A; 4GN1 A; 1RRB A; 2UU7 A; 4MGY E; 1WXV A; 1A70 A; 1WZ3 A; 2DZI A; 2KAJ A; 3QCA A; 2KVR A; 2LZ6 A; 1TKG A; 1I4R A; 1J7A A; 2CJN A; 4WIP A; 2IJ0 A; 1Q0W B; 4OW0 A; 2WXP A; 2FE8 A; 1ZP0 B; 3HM3 A; 3VH3 B; 3APD A; 1HTO A; 3VQI A; 1XF5 L; 1STE A; 1YN4 A; 3W1S A; 5JXV A; 1UGJ A; 1ROE A; 5JHB A; 1TZO A; 5CHW A; 2BWE S; 2NS5 A; 3AEG B; 4PS7 A; 1KTK A; 1P7E A; 3PZ8 A; 4II2 B; 1WWT A; 1L6V A; 4B0E A; 3PLV A; 3A4S C; 1FXA A; 3ZO5 B; 1WX8 A; 4ARC A; 2M0A A; 4JE3 B; 2LVO A; 3HHM A; 2N9E B; 3UIP B; 2NVU I; 2OJW A; 3A9K B; 2MQJ A; 3ZRC A; 2IND C; 4ANU A; 5DPR A; 1IP9 A; 1Q1O A; 4XYC A; 2L83 A; 1WRD B; 2UYZ B; 2KQ7 A; 2HTM E; 1WJ4 A; 4ANW A; 3L4P A; 1C78 A; 4DXA B; 3O13 A; 3MFG A; 1WX9 A; 4W9L A; 1M94 A; 1WXQ A; 2JUO A; 5DPW A; 2D07 B; 5LXI B; 3AM9 A; 3DHG C; 4C00 A; 3VTU A; 2D3G A; 2N7J A; 3VUW A; 2VH1 A; 2BYT A; 1WJ6 A; 2MBO A; 2YLM A; 3P4P B; 3QWZ B; 1WGY A; 4EFO A; 4NPN A; 1ET6 A; 3RNG C; 4DHJ B; 2KJ6 A; 2ACZ B; 1UD7 A; 3CIR B; 4TMA B; 1SE4 A; 2JRH A; 1UEL A; 1D5Z C; 3BYT B; 5IOI A; 4FN2 A; 4JGH B; 3X0W A; 1Z2M A; 2PVO D; 2BYV E; 2MX2 A; 3T9L A; 2KFK B; 2ZVN A; 2MBB B; 1FMA D; 1SE2 A; 3HVD A; 5EE0 A; 2W9N A; 1I35 A; 4L2Y A; 4JIO U; 1PGB A; 1BXT A; 1ZXI A; 5IP4 D; 4ZYN A; 3AH7 A; 4PT5 A; 1R4N I; 2ZEQ A; 1FXT B; 1RWS A; 3AE1 B; 2YEP B; 2KJH B; 1YOV B; 1WE6 A; 3RZW C; 3Q8A A; 4A6Q A; 1N5X A; 2KN4 A; 1NEN B; 2ZCC A; 1FRR A; 4LNF A; 2SEB D; 1V9J A; 2MRP A; 3VAW A; 3CWI A; 2XEW A; 2KHW B; 4XC2 A; 1J7B A; 3BVZ A; 1D6E C; 3P4Q B; 1L4Z B; 1J7C A; 5E6N A; 2HD5 B; 1VCB A; 1JW9 D; 2G45 B; 2WQY B; 3MTN B; 1UWX A; 1WFY A; 2HJ1 A; 2LVP A; 1KLV A; 2ZZP B; 3Q8F A; 4HJK A; 4FBJ B; 2WXF A; 2RDB C; 3ZRF A; 1R4M I; 4LNK A; 1PGA A; 5DCN A; 5FR6 A; 4AUQ C; 3I3T B; 3EEC A; 3H6N A; 4RGO S; 3KW5 B; 2Y5B B; 1K51 A; 1CK1 A; 3AUL A; 5D2M B; 1IUE A; 3RNC C; 1MJD A; 1MI0 A; 4NZL B; 1JML A; 4C80 A; 5KHO A; 5J17 A; 2FCN A; 2WXH A; 1HA5 A; 2WXN A; 4XZ4 A; 3VUX A; 3APF A; 2GLS A; 4IOI E; 4HDQ A; 2SAK A; 2VZK D; 3WAL A; 4NQK E; 4WJQ A; 1D3Z A; 2KX0 A; 1V2Y A; 1GB1 A; 1C76 A; 5HKH A; 5AUI A; 2FAZ A; 2LJ5 A; 1IYF A; 2NMQ A; 3JYU A; 1P1A A; 3P1M A; 3M62 B; 1VZ8 A; 1DOI A; 4F7Z A; 1QKZ A; 1V1O A; 2VH2 A; 2BQQ A; 1TS2 A; 4NAW B; 3W5V B; 1IPG A; 2KTF A; 4W9F A; 4A90 A; 3CST A; 2DHZ A; 4G11 A; 3M95 A; 1WIA A; 4WAF A; 3ZNH B; 4XE0 A; 2JY6 A; 2KDB A; 2ICI A; 2J42 A; 3Q3N C; 4BKG A; 2K8C A; 1WGG A; 1TY0 A; 4K7W A; 2E3T A; 3A33 B; 2DAJ A; 2AL3 A; 2A4Z A; 4KV2 A; 4GDK A; 1P98 A; 4LNI A; 1MPE A; 2L32 A; 5IN7 A; 1HQR D; 2PVG C; 2MJE A; 4II3 B; 4RGM A; 3RUI B; 2V4I B; 1WY8 A; 2C60 A; 1WGH A; 4FLH A; 2KC2 A; 1K8R B; 1XT9 B; 4EKU A; 2BWF A; 4FXC A; 1HZ6 A; 4KGT A; 3P2B A; 4KKI A; 2L7R A; 4ZRQ A; 1PGX A; 4JLC A; 5CHV C; 5G5H A; 1P7F A; 3AEA B; 4ZHO A; 1E10 A; 3ML9 A; 1XLP A; 4W9J A; 1V5T A; 3KH0 A; 3IG3 A; 4FJZ A; 3NG0 A; 3PRE A; 5D7G A; 3ECI A; 1YMH E; 2JXX A; 3H1U A; 5GMV A; 4G0N B; 3AI5 A; 4PK1 A; 1OFF A; 3QK0 A; 1WGD A; 2ZCB A; 4GXB A; 3BYY B; 2IO0 B; 1ACC A; 4YSX B; 3RZF A; 2WXK A; 1E8Y A; 2WXO A; 1YN3 A; 4F8C B; 1EO6 A; 2CU1 A; 3DVG X; 3L17 A; 2GBN A; 2MBH A; 2G4D B; 3B1L X; 3VXW A; 3W2D A; 1NI2 A; 3LB8 C; 3GE3 C; 2N9P C; 4QAY A; 2LUE A; 2XN9 C; 2INC C; 3R2I A; 2IPK D; 1K50 A; 2BBC A; 2KTR A; 4IDI A; 5HI1 A; 1L0V B; 1WXA A; 5BMI A; 1JRO A; 2ZPY A; 4WJO A; 1OQQ A; 3U7Z A; 2IGD A; 1BT0 A; 3K9P B; 3S2A A; 1V5O A; 1E7P B; 2INN E; 2LGX A; 4N58 A; 2BF8 B; 1YNT E; 3P4R B; 1KRH A; 2L05 A; 4RM9 A; 4MGZ E; 2KJR A; 4FHJ A; 1GAQ B; 2JZ3 B; 1WM3 A; 2JZZ A; 1TJE A; 1WX7 A; 3X23 A; 3Q8E A; 1IBX A; 3KVF B; 2D2Q A; 4HEA 1; 3VDZ A; 1MVK A; 4MM3 A; 1L0X B; 2FID A; 4B95 A; 2LHE A; 1NEK B; 1F52 A; 2L00 B; 3TSS A; 3VH4 B; 1JRP A; 2JT4 B; 5MPO A; 1F9J A; 4TUU A; 1AYF A; 3WAM A; 3KWV A; 4GSW A; 3VRB B; 4HPL B; 2RDH A; 2Z0E B; 1WXS A; 3K9O B; 2LEK A; 1Q5W B; 1MHX A; 1G6J A; 1PDX A; 2D11 A; 2FCS A; 3C19 A; 1OTR B; 1KLU D; 3I57 A; 3Q69 A; 1FPY A; 1N60 A; 1EM7 A; 1FO4 A; 1BUI C; 4OHJ A; 5C3J B; 2ASQ A; 3BK1 A; 4XDC A; 3U8Z A; 3NY5 A; 2MJ3 A; 1KFY B; 4OZC A; 2LFI A; 3GB1 A; 3V62 A; 5EE1 A; 4JPS A; 1TGZ B; 4XWW A; 5IA7 A; 2EKE C; 2JWU A; 3VFK A; 4HVB A; 3MP9 A; 1UNS A; 1ZKH A; 1J0G A; 3H8H A; 3NJT A; 2WWZ A; 4HK2 A; 4RFB A; 1YQ4 B; 5AZG A; 1TS5 A; 2N9X A; 3B2F A; 2GB1 A; 3H9D A; 1KJT A; 1KM7 A; 3APC A; 2N1V A; 1F77 A; 1QLB B; 4KIK B; 4YSZ B; 1JQ4 A; 2LGY A; 2J52 A; 3IT6 B; 3OG5 A; 1YN5 A; 1CJE A; 1EF1 A; 2BPS A; 1HXY D; 2KWD A; 4TKN A; 3HK0 A; 4WJP A; 4RM8 A; 2WDQ B; 1B9R A; 4FHK A; 2H89 B; 1FNU A; 4O1N A; 4M01 A; 2CHZ A; 4YXD B; 2W82 A; 3RMK C; 3TBL D; 2OJR A; 3W1Y A; 1NYQ A; 4E71 A; 4IM0 A; 3V6E B; 3CF6 E; 1JWM D; 3GZN I; 5EDS A; 1YX5 B; 4DQO C; 2WYQ A; 2EEL A; 2GI9 A; 3IT4 B; 3TMP B; 1S3S G; 4GDK B; 1C77 A; 2AL6 A; 2AX5 A; 1I42 A; 2W3S A; 2IYD B; 3N1X C; 3PLU A; 1XD3 B; 1L6U A; 4HKZ E; 5EE3 A; 3Q14 C; 2MWS B; 5LLI A; 4TQ0 A; 3J9C A; 3ZTC A; 1Y56 A; 1DOY A; 2LXC A; 2DYB A; 3N1Y C; 2AQ2 B; 1WJN A; 5AUK A; 3URY A; 3VR9 B; 4RNA A; 4FAD A; 2VRR B; 3GOE A; 1CMX B; 2KDE B; 4K3B A; 2BS2 B; 3ZYY X; 4IM3 A; 2NPT A; 2LRW A; 2NR2 A; 3MC8 A; 1YJI A; 3PTF C; 1NDD A; 3ZXV A; 4FA6 A; 2KT7 A; 3H7S A; 3R2T A; 5KHQ A; 5D3D A; 2QEJ C; 3TEZ A; 4DXG A; 2WNM A; 3SFD B; 4HLE A; 2CKH B; 1P9D U; 3O65 B; 5FKA C; 4CQN A; 1EF5 A; 2PIA A; 3HIZ A; 1FM0 D; 1YX6 B; 1UZX B; 4S17 A; 1SEB D; 1WMH A; 1SB3 C; 2O6V A; 3U30 A; 2C7H A; 2O6V D; 3C8Y A; 1SE9 A; 2KTR B; 2KN5 A; 2Z8L A; 4C7Z A; 2WDV B; 2IO3 B; 1GNU A; 4ITK A; 1OEY A; 2MLB A; 4RGT A; 1FFV A; 3FIL A; 1FXI A; 5D3I B; 1QT9 A; 3SDL C; 3DPD A; 4WWO A; 1LO5 D; 3BVG A; 1LGR A; 1WGK A; 4EZK A; 3NUH B; 4KDI C; 1V49 A; 3NHE B; 3RD2 A; 2XNA C; 3ABV B; 3NVW A; 2CJO A; 2CS4 A; 1XEE A; 4WAA A; 2IY1 B; 1N61 A; 2X38 A; 1IBX B; 2MP2 A; 3U7D A; 4LLG M; 4C4V A; 3DVG Y; 2L8J A; 4UDU C; 2PPH A; 1C4A A; 4MM3 B; 4US9 A; 4B9K A; 2Z0D B; 3MC9 A; 2V3S A; 1MG8 A; 5AEK B; 4CO7 A; 4ZHP A; 3UIN B; 4BBN C; 1HEZ E; 2AYO B; 2MCN B; 4DHZ B; 1TZ1 A; 4XGA B; 1Q10 A; 3PO0 A; 2OOB B; 2G3Q B; 2DYM A; 3FC4 A; 2FNJ B; 2JU6 X; 3ZNZ B; 1L5P A; 4WH4 A; 3JSV A; 3B9J A; 3AV8 A; 4WUR A; 4XDD A; 4N59 A; 2V0G A; 3EC8 A; 4NJC A; 4MDK E; 2D3C A; 4OVU A; 2UWQ A; 2DZM A; 2LVQ A; 5H8Y E; 3PGE A; 3DBH I; 1YJ1 A; 3ML8 A; 4US8 A; 5GXG B; 4RH6 A; 1GC7 A; 2KZR A; 4MT5 A; 4LNN A; 2XK5 A; 2KNB A; 2RD0 A; 3PPA A; 1C79 A; 4W9C A; 2KX3 A; 4K7S A; 3DWM A; 4ZDV A; 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1A5R A; 2RPQ A; 1HZ5 A; 3L10 B; 2NPT B; 4KX6 B; 4OZB A; 4MEL A; 2PMV A; 1SIJ A; 5J18 A; 1MFW A; 4HCP B; 4HJG E; 3SD5 A; 4JL9 A; 3W5U B; 4OZA A; 5TSS A; 1VDV A; 3R66 C; 5D94 A; 2V4L A; 2OHF A; 1ZDV A; 4RCO A; 3TUO A; 1I4X A; 3QAR A; 2DLB A; 3MHZ A; 4FUL A; 3ALB A; 2WDR B; 2K3U A; 1D4B A; 3BWU D; 3OAW A; 1WMH B; 3KYD D; 3DBL I; 1F2R C; 4L23 A; 2O6V B; 1T3Q A; 2KWC A; 2KDM A; 1PYW D; 1U4A A; 3AEF B; 3M63 B; 1E8X A; 2FBW B; 2KQS A; 2M0X A; 2KMM A; 4YTN B; 2J0K A; 1S1Q B; 4EUT A; 3FIL B; 3AN1 A; 2WXG A; 1F1H A; 1ZGU B; 5DPS A; 4WQM A; 2W54 A; 1OEY J; 1JCK B; 1N6Z A; 1PQS A; 2ON8 A; 5LNK 1; 3ETR A; 3KLS X; 4A9A A; 1E8Z A; 1HTQ A; 3BZD B; 1TS3 A; 3BY4 B; 3EUB 2; 1RAX A; 1WGR A; 2MP2 B; 4B6W A; 4C4V B; 3PV1 A; 4M0W B; 2WS3 B; 2RSU A; 3E56 A; 3Q3J A; 2OED A; 4W9E A; 2BTE A; 4MSM B; 3RUL A; 1AWD A; 3QC8 B; 2KXJ A; 1QOA A; 1ZW7 A; 2DZJ A; 3KUZ A; 1KH0 A; 3AE3 B; 3N20 C; 2LD9 A; 3PRZ A; 1YD8 U; 1Z5S B; 3JSV B; 2ZPN A; 1EUV B; 3A1Q A; 1VLB A; 1TTN A; 3TCA A; 5AZF A; 4KGS A; 1FD6 A; 2D5G A; 3HM6 X; 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