The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
54
|
structure length |
54
|
Chain Sequence |
TYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVT
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Ultrahigh-resolution backbone structure of perdeuterated protein GB1 using residual dipolar couplings from two alignment media
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
|
| molecule tags |
Immune system/protein binding
|
| source organism |
Streptococcus sp. 'group g'
|
| total genus |
11
|
| structure length |
54
|
| sequence length |
54
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-04-20 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1P7E A; 2QMT A; 2KAC A; 1MPE A; 2J53 A; 1F2R C; 1KH0 A; 1IBX B; 2KQ4 X; 2I38 A; 1QKZ A; 1F2R I; 1K53 A; 3FIL A; 1EM7 A; 2KDM A; 2GI9 A; 1P7F A; 2LHE A; 4IKG A; 1GB4 A; 4KGT A; 1XCT L; 1PGA A; 4KGR A; 5HG2 A; 2K0P A; 4HJG E; 1C9F A; 2JU6 X; 1ZXH A; 2JSV X; 2LGI A; 1HZ5 A; 1IBX A; 1IGC A; 2LHD A; 5BMG A; 2OED A; 2RMM A; 2JZP A; 1K52 A; 2J52 A; 1XCQ L; 5JXV A; 2PTL A; 5HI1 A; 2LUM A; 2PW9 A; 4IOI E; 4HKZ E; 2NMQ A; 2IGH A; 4WH4 A; 1Q10 A; 1PGB A; 2EEL A; 1MI0 A; 2PLP A; 5HFY A; 2ON8 A; 1FCL A; 1FD6 A; 1HZ6 A; 2N7J A; 2KN4 A; 2ZW1 A; 4KGS A; 2KWD A; 4MAC A; 2JXT A; 1K50 A; 1PGX A; 2I2Y A; 2JWU A; 2IGD A; 4D2K A; 2N9K A; 2N9L A; 1D4B A; 1MHX A; 2IGG A; 1UWX A; 4OZA A; 5BMH A; 2ZW0 A; 3V3X A; 1FCC C; 1MVK A; 4OZC A; 2QSD A; 1K51 A; 1MHH E; 4OZB A; 1GB1 A; 1YNT E; 5HHD G; 2GB1 A; 3GB1 A; 4GLS C; 1XF5 L; 1JML A; 2RPV A; 1HEZ E; 3MP9 A; 3FIL B; 2ONQ A; 5BMI A; 1YMH E; 3UI3 A; 1IGD A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4NQK E; 1E8Y A; 1SJH D; 3KLS X; 3LXF A; 3VUW A; 4NNJ B; 1JAL A; 5IOI A; 4DBG A; 3U7D A; 2BS4 B; 3SD5 A; 4W9H A; 2V3S A; 2DBY A; 2KDM A; 3CMM B; 4ZYS A; 3A1Q A; 2MQJ A; 4WWM A; 1S3S G; 3AU4 A; 3BK1 A; 1PGA A; 1UWM A; 3RYT A; 1ZXH A; 3U7Z A; 3JSV A; 3DVG Y; 1NEK B; 1N63 A; 1JQ4 A; 2D3B A; 2JZP A; 2MBO A; 3P4S B; 2AEH A; 2REX A; 2ASQ A; 3C0R B; 2KN5 A; 3RPF C; 2FBW B; 4R3D A; 2K25 A; 1SJE D; 2W9N A; 1LGR A; 2PVO D; 2MEK A; 1AWD A; 4KDL B; 1WWT A; 4KGS A; 4A8X C; 3ZKJ C; 4YTM B; 3AEG B; 1I7H A; 2V9H A; 2Y5P A; 1ZP0 B; 2KLC A; 1LM8 B; 4HDO A; 2IPK D; 4CQN A; 5G55 A; 2IDY A; 3AE7 B; 4M01 A; 2LVP A; 4HKQ A; 3R7R A; 3AB5 A; 1T0Q C; 1KTK A; 4B0E A; 3NS1 A; 1KRH A; 1MVK A; 4OZB A; 3N30 A; 4GXB A; 2AL3 A; 4AP4 C; 3PLU A; 3H6N A; 3KQ4 A; 1V9J A; 2EMT A; 1XF5 L; 4WJO A; 3DWG C; 1BML C; 2Z0D B; 3V61 A; 2BT6 A; 4OVU A; 5D7G A; 3A1Q B; 5BMI A; 1MG8 A; 2TSS A; 5E6J A; 4GGQ A; 4NJC A; 3PGE A; 3DVN V; 3MJW A; 4N9F 4; 2QHO A; 1WXV A; 2BBC A; 3JSV B; 1SE2 A; 2LXC A; 2WXO A; 4GDK A; 4URK A; 2G9H D; 1P7F A; 2HDE A; 4IKG A; 5DPS A; 4EZJ A; 4IDI A; 3T3N A; 3L4P A; 1B9R A; 1EF1 A; 1NVI D; 2KLG A; 2X38 A; 3KUD B; 3ZDM C; 2I1J A; 1V5O A; 1SE9 A; 4RFB A; 2DAF A; 2FE8 A; 3VDZ A; 2OED A; 3URY A; 2WXN A; 1EWC A; 4AWJ A; 1M4V A; 1NI3 A; 2N9P C; 2RGF A; 2PTL A; 1I4G A; 2KVZ A; 1ACC A; 2A5U A; 4W9F A; 1BUI C; 4YT0 B; 2D07 B; 2IY1 B; 4EEW A; 4A20 A; 3B0A A; 4MGI E; 5BYQ A; 1ZXI A; 5L83 A; 5CHW A; 2W3R A; 1PGX A; 2JZ3 B; 4DHJ D; 4BZA A; 2JXX A; 4B0M A; 2JWU A; 2K8C A; 4DDG D; 2IGD A; 2D10 A; 3AEE B; 1LQB A; 1OGW A; 1D5X C; 2BYE A; 4TSS A; 1KLU D; 4NY0 A; 1UNS A; 1EO6 A; 2LGX A; 4IM0 A; 3I9V 1; 1NI2 A; 2MBB B; 4TUU A; 4OHJ A; 3T8M A; 1V80 A; 3NZS A; 1WIA A; 1YN4 A; 4HPL B; 5C23 A; 3N20 C; 1WYW B; 2CHX A; 4ZYN A; 3BYT B; 4HPM B; 1PDX A; 4BBN C; 4BKS D; 1ZE3 D; 2L05 A; 2ZNV C; 2KFJ A; 2R2O A; 1E8Z A; 1UBI A; 1Z5S B; 1GAQ B; 1HEZ E; 4GDK B; 4ZRJ A; 3MC9 A; 1P0R A; 3BK2 A; 4W9J A; 1VZ7 A; 5D3I B; 4E74 A; 2EKE C; 3N9Y C; 3RMK C; 1MPE A; 2NBU A; 3O13 A; 2J53 A; 2IZV B; 1J7B A; 4MSM B; 1OQQ A; 2MRP A; 3R8B A; 4RF0 A; 3TL5 A; 1TS2 A; 1N62 A; 5CHF A; 1I4H A; 1XLO A; 3DHH C; 2QCZ A; 2KJR A; 1WH3 A; 2LI5 A; 1ZW7 A; 2IY0 B; 3QAR A; 3WAN A; 3NZ3 A; 4WQO B; 3IFW B; 3T3O A; 3EGR A; 3AE6 B; 3Q8E A; 2K22 A; 1TS5 A; 3NRZ A; 4LNK A; 1UH6 A; 2C7H A; 4KDI C; 4LNF A; 3ZDT A; 2D3G A; 2NMQ A; 4LLG M; 3V60 A; 5FR6 A; 2IO1 B; 2CR5 A; 2LVO A; 2V0G A; 2WXH A; 4GSW A; 1YIW A; 5GMV A; 1IP9 A; 2HD5 B; 3N32 A; 1EUV B; 4LJO B; 3Q8B A; 4W9E A; 3IHP C; 3OG5 A; 3PPA A; 3R7Q A; 3RNF C; 3VVW B; 1QOG A; 1MHX A; 2DYB A; 1TGZ B; 3DCG A; 4AJW A; 4C80 A; 2PIA A; 4AQ7 A; 3V05 A; 4GN1 A; 3OLM D; 1DOI A; 2K5P A; 4HJK A; 3GB1 A; 4XDD A; 1QZE A; 2QC8 A; 2K8B A; 4GLS C; 3WAM A; 5FR3 A; 1ZPS A; 4J6I A; 4LNO A; 4DXG A; 3ZNI D; 1FMA D; 1N5W A; 1EF5 A; 2R2Q A; 1WJ4 A; 3A4S C; 2JRI B; 2MJD A; 2WXG A; 1OFF A; 4IC7 B; 2WXP A; 1WGK A; 1SIJ A; 2LRW A; 4RMA A; 1QT9 A; 3MC8 A; 2LGS A; 4KV2 A; 2FCM A; 2E6X A; 3SU8 X; 3AN1 A; 2N4F A; 3LJ3 A; 1OEY A; 1XLQ A; 3HHM A; 3ABV B; 1T6B X; 3DBL B; 4IWQ A; 1SSN A; 3GZN I; 4GB9 A; 1KF6 B; 1C4A A; 3NHE B; 1EWY C; 3VH4 B; 2GLS A; 4TMA B; 1T3Q A; 2KD0 A; 5JXV A; 1L6U A; 2D11 A; 1T0Y A; 4ANV A; 2VH2 A; 4MH0 E; 2WNM A; 1HTQ A; 4HKZ E; 3L08 A; 4JLC A; 2NR2 A; 5I4D A; 3W9C B; 4FA6 A; 3PRP B; 1VRA B; 3HK0 A; 3NVV A; 1RFK A; 2LVQ A; 4XGA B; 1ZOY B; 3GE8 C; 1F9J A; 4MJS A; 1CJE A; 4P1B C; 3QQ8 B; 3AEB B; 1PQS A; 3VHT C; 3QX1 A; 2ZNV B; 1JWU D; 4WAA A; 4DXA B; 3PVL A; 3WAO A; 4Q2J A; 3AED B; 2KJH B; 2W55 A; 3ZGZ A; 4NAW B; 2FAZ A; 2G1E A; 3NZU A; 4DHZ E; 2IGG A; 3TMP B; 2MBE A; 4KKI A; 4BKS A; 5LNK 1; 1FCC C; 4PYZ A; 3GE3 C; 4F1S A; 5GXG B; 2LWP A; 4JWS C; 1XEE A; 2LFI A; 2DZM A; 2K9X A; 1C4P A; 4S0R A; 4DDI D; 3Q69 A; 3KYD D; 1R4N B; 1WGD A; 4EUT A; 1J8C A; 1UBQ A; 1TY2 A; 4P16 A; 3V6C B; 3DBH I; 4KZC A; 2ONQ A; 5LLI A; 4C00 A; 2WXI A; 2XEW A; 1LO5 D; 1N60 A; 4L1B A; 2MWS B; 3TEX A; 3B08 A; 1YD8 U; 2MW5 A; 4F7Z A; 2N1V A; 2Y5C A; 3RUL A; 2O2V A; 5E6N A; 2UYZ B; 3SR6 A; 4HEA 1; 1WXM A; 4FBJ B; 2WP9 B; 2K8H A; 3KW5 B; 2E3T A; 1WGG A; 3JYU A; 4MEM A; 4DHJ B; 3K9O B; 5MPO A; 1NYR A; 3RCZ A; 4BAX A; 1JCK B; 4MJS B; 3S2A A; 4W9D A; 1KOT A; 5IO9 A; 4C7Y A; 3VRA B; 4EE2 A; 4IWP A; 2DAJ A; 3X0W A; 1Q10 A; 2BVC A; 1L0V B; 5H8Y E; 4YTP B; 2WGS A; 1TT5 B; 5IP4 D; 2PE6 B; 5J2R A; 3H1U A; 4MAC A; 4ACF A; 3ZTC A; 4GOC A; 1WXS A; 3EA6 A; 3KH0 A; 2HE7 A; 3KVF B; 2MA9 B; 3VRB B; 2RR9 A; 3Q6B A; 1KLG D; 2KMC A; 1KJT A; 1C77 A; 5D94 A; 1T5X D; 3M62 B; 3DPD A; 5AZF A; 4A9A A; 3EHV A; 2WXR A; 3Q3F A; 2NS5 A; 5KHO A; 1V6E A; 3B9J A; 5IN7 A; 2NCN A; 4MGK E; 3LYY A; 2BGF A; 2INP E; 3CSF A; 2BB5 A; 2AL6 A; 5AUK A; 1H8C A; 3J9C A; 2X8X X; 1L4D B; 3A9J A; 3BVZ A; 1LFD A; 3VUY A; 1N6Z A; 4HCN B; 5CTR C; 3SFD B; 1V81 A; 2V4L A; 1YJI A; 2LHE A; 2LUE A; 3IVF A; 3APF A; 1JWB D; 2K3U A; 3C19 A; 2UWQ A; 3UIO B; 2Z59 B; 2SEB D; 2V3P A; 3TCA A; 2DX5 B; 1IBX A; 1IGC A; 1JWA D; 3UF8 A; 3AM9 A; 3B2G A; 1TS3 A; 4G3X B; 3R66 C; 1EU3 A; 2J42 A; 3BII D; 3B2F A; 4KIK A; 2WYQ A; 3IAM 1; 5FK9 C; 1WR1 A; 4NAM A; 2GBJ A; 4HK2 A; 4C7Z A; 4ZRI A; 2IBI B; 3FAH A; 5KHQ A; 3MJ5 A; 2HJ8 A; 4IG7 B; 2JXT A; 4WAF A; 4CO7 A; 4M00 A; 3ENE A; 4CYE A; 4ASW C; 2N7D A; 1WM3 A; 3N1Y C; 3W1S C; 3ALB A; 3VH3 B; 3APD A; 1WJN A; 1N5X A; 2KWC A; 1UWX A; 3ZIM A; 4TQ1 A; 4RGN A; 3V3X A; 4YSX B; 4K3C A; 2KAN A; 3P1M A; 2JY6 A; 1FO4 A; 4HRO A; 4AOF A; 1GB1 A; 2BYF A; 3QHT A; 4K7W A; 2M8S A; 3A9J B; 1R7S A; 3W1Y A; 4YXD B; 2G45 B; 1CQV A; 1ISN A; 2WXM A; 5DPT A; 4JIO U; 2IJ0 A; 2BKR B; 3Q3O C; 1IYF A; 1GNU A; 1IBX B; 1VZ8 A; 1WXA A; 2PMV A; 1PYW D; 4RM9 A; 2L00 B; 1ESF A; 2K0P A; 4HJG E; 4M0W A; 3N1Z C; 4KIK B; 3ZVV A; 2BPS A; 4PK1 A; 2OJR A; 3DBS A; 3ZJU A; 2J4X A; 1SEB D; 1UGJ A; 4QAY A; 3DVN U; 3RNA C; 2NTT A; 2KDF B; 3KWV A; 1YJ1 A; 2H89 B; 4TV3 A; 2PKO A; 1E10 A; 2PW9 A; 2IGH A; 4WH4 A; 3U8Z A; 4NJ6 A; 5LXH A; 4MGZ E; 5HFY A; 2CJO A; 3W1S A; 3VAW A; 3AE5 B; 4HXD A; 1TZ1 A; 4MSQ B; 3ZW3 A; 2RSU A; 2VRR B; 1K50 A; 5AZG A; 3MC0 B; 4AS1 A; 1WYG A; 4G11 A; 4RGM A; 1JRU A; 3BIN A; 1E9M A; 1WE7 A; 2KTR A; 4NJ7 A; 2K1F A; 1TKY A; 1E0Z A; 3KWL A; 4OW0 A; 1VCB A; 5BYR A; 4P6V F; 3OWE B; 3NVW A; 1VD2 A; 1K51 A; 2KKC A; 3NG0 A; 3APC A; 4EKU A; 4RGO S; 1Y56 A; 3U52 E; 3DDC B; 3JVZ X; 1F0Z A; 1L0X B; 2GBN A; 2LZ6 A; 2FID A; 2N9E B; 3L17 A; 1SGH A; 3HVD A; 2O6V D; 1H4R A; 1WJ6 A; 2QJL A; 2JRH A; 1P7E A; 1RLF A; 4M0W B; 2VH1 A; 2GOW A; 2KAC A; 3RI7 C; 2Z8L A; 1K8R B; 3ZRC A; 1K53 A; 2KC1 A; 1XLN A; 2KZR A; 3AMZ A; 1QQR A; 2DLB A; 4XC2 A; 2EMS A; 2C7M B; 1BT0 A; 4H2A A; 4II2 B; 3U4E G; 1FM0 D; 3IT6 B; 2BS3 B; 1HE8 A; 2LGI A; 1NDD A; 3VR9 B; 2LHD A; 2EKI A; 2C7N B; 1RWS A; 2G4D B; 5TSS A; 1BXT A; 4ANU A; 2KK8 A; 3R2I A; 4YSZ B; 2G3Q B; 2UU7 A; 1V2Y A; 3C8Y A; 5T8I A; 3NVY A; 3PSE B; 3N1X C; 3AE4 B; 4BFR A; 2N9K A; 3ZXV A; 5G5G A; 3ZRF A; 3ML8 A; 3ZLZ A; 4MEL A; 3AE9 B; 1ZDV A; 1YQB A; 1Q0W B; 2DHZ A; 3AE2 B; 1SXT A; 3FKY A; 2WXK A; 4DK5 A; 5EE9 A; 1GUA B; 1R4M I; 1UEL A; 3AI5 A; 2FUG 1; 3LDZ E; 1L0Y B; 3E56 A; 1ET9 A; 4WJN A; 1AAR A; 1FEH A; 4WIP A; 4MDK E; 3IAS 1; 3GZN B; 5AEK B; 2GMI C; 2W82 A; 4XZ4 A; 1J19 A; 1I4Q A; 2GRI A; 3TEY A; 2J0M A; 4FJZ A; 2JYE A; 5JHA A; 3UI3 A; 4REZ A; 2JZZ A; 3TBL D; 1UZX B; 4A3P A; 4HCP B; 2JQR B; 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3PZD A; 2JSV X; 1D3Z A; 1HZ5 A; 1V8C A; 3V62 A; 2ZPY A; 1MG4 A; 4MT5 A; 2WDT B; 2V1Y A; 3Q8F A; 1RRB A; 3WA0 A; 4A6Q A; 1QOB A; 3DQV A; 1CZP A; 1HXY D; 3DVG X; 1WGH A; 3CST A; 1RYJ A; 4PS3 A; 4N59 A; 1FNV A; 1WE6 A; 1WY8 A; 2N7J A; 3L10 B; 2RPQ A; 3PO0 A; 1F1H A; 1D5Z C; 1SIF A; 1YJJ A; 3Q8C A; 3WIM A; 4X57 B; 2I2Y A; 2LGY A; 1YN3 A; 2L52 A; 2MBQ A; 2B3A A; 1DGJ A; 2O6V B; 2QIL A; 1WF9 A; 3NS8 A; 3D32 A; 3V6E B; 4FJV B; 1WM2 A; 2ZVO A; 1HQR D; 1DOY A; 1I4P A; 2K6D B; 1OQR A; 1RM6 C; 2BWF A; 5CX3 A; 2ZVN A; 2ACZ B; 1YNT E; 3ETR A; 2GB1 A; 3ZNZ B; 4FLH A; 1FRD A; 4RF1 A; 3BVM A; 2LEK A; 5JHB A; 2LMC A; 2RPV A; 1FNW A; 2ZJD A; 4A55 A; 1V1P B; 3EFU A; 2M19 A; 3L54 A; 1YQ4 B; 2PEA A; 1IGD A; 1YX6 B; 1I4R A; 1YX5 B; 2LGD A; 4LNI A; 3AU5 A; 4XX5 A; 3ZXR A; 3AXC A; 1J7C A; 2L1A A; 3CWI A; 4MGY E; 1DYQ A; 1S1Q B; 3DHG C; 2FNJ B; 3DWM A; 3PS6 A; 3T9L A; 3PHW B; 3WAP A; 2O2V B; 2GBK A; 1I42 A; 1Y8R C; 4HRS A; 3H9D A; 3AH7 A; 2KFK A; 4L2Y A; 5DPR A; 2J52 A; 2W3S A; 3Q8A A; 1JW9 D; 1LXD A; 1NYQ A; 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