The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
54
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structure length |
54
|
Chain Sequence |
TYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVT
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Ultrahigh-resolution backbone structure of perdeuterated protein GB1 using residual dipolar couplings from two alignment media
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
|
| molecule tags |
Immune system/protein binding
|
| source organism |
Streptococcus sp. 'group g'
|
| total genus |
11
|
| structure length |
54
|
| sequence length |
54
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-04-20 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2I38 A; 1GB1 A; 2ONQ A; 2JU6 X; 3MP9 A; 4KGS A; 1MPE A; 2PLP A; 4HJG E; 4D2K A; 1PGX A; 1ZXH A; 2KAC A; 2I2Y A; 1K51 A; 1FCL A; 3FIL A; 3UI3 A; 1IGD A; 1FCC C; 5HFY A; 2J52 A; 2LUM A; 1IBX B; 2JWU A; 5BMI A; 2ZW0 A; 2GB1 A; 5HG2 A; 2RPV A; 1KH0 A; 2IGG A; 1C9F A; 2PTL A; 2ZW1 A; 1Q10 A; 4IOI E; 3V3X A; 1MVK A; 1XF5 L; 1MHX A; 2IGD A; 1FD6 A; 1K50 A; 2JXT A; 2ON8 A; 1K53 A; 1EM7 A; 1YNT E; 1PGB A; 4KGR A; 4GLS C; 4KGT A; 5HHD G; 1F2R C; 1QKZ A; 4OZA A; 1F2R I; 2KN4 A; 4MAC A; 2JSV X; 2KWD A; 3GB1 A; 4HKZ E; 1JML A; 2LHD A; 2K0P A; 1XCQ L; 1MI0 A; 2RMM A; 5JXV A; 3FIL B; 5BMH A; 1P7F A; 1IGC A; 1IBX A; 2LHE A; 1K52 A; 2PW9 A; 5HI1 A; 1PGA A; 2KQ4 X; 2J53 A; 1HZ5 A; 2QMT A; 2QSD A; 4IKG A; 2LGI A; 1UWX A; 2IGH A; 4OZB A; 2NMQ A; 1MHH E; 2N9K A; 1XCT L; 5BMG A; 1HZ6 A; 4WH4 A; 4OZC A; 2N9L A; 1P7E A; 2EEL A; 2N7J A; 1HEZ E; 1D4B A; 2OED A; 2KDM A; 1GB4 A; 1YMH E; 2GI9 A; 2JZP A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1UD7 A; 2CS4 A; 3AU5 A; 1YOV B; 3SHQ A; 4PS7 A; 4HPM B; 2XNA C; 3ZRF A; 2JRH A; 1SXT A; 3IBE A; 4WJQ A; 4KDI C; 4S17 A; 4AQ7 A; 1C4P A; 3TEY A; 3HVD A; 1FNW A; 3CST A; 1L4D B; 3CWI A; 4L1B A; 4C7Y A; 3DBR I; 2ASQ A; 2N9X A; 2FNJ B; 2GB1 A; 1KOT A; 1SF0 A; 4ICV A; 4YT0 B; 1D3Z A; 3VDZ A; 1VJK A; 3A1Q B; 3T3O A; 4HJK A; 4MSM B; 1AW7 A; 2M56 B; 2C5L C; 4II2 B; 2IPK D; 3T3N A; 3MTN B; 4FN2 A; 4YTM B; 1WR6 E; 2WXR A; 3N32 A; 3M62 B; 4L2Y A; 4YL8 A; 5AZG A; 2YVC A; 3P4P B; 1OEY A; 3PHX B; 3KWV A; 2GBK A; 3R8B A; 1BXT A; 3K9P B; 3EFC A; 3RCZ A; 5CHF A; 3KYC D; 1ZOY B; 3I5J C; 4HXD A; 5EE1 A; 1WFY A; 4M00 A; 1RFK A; 3ZKJ C; 3ZJV A; 4AUQ C; 4ZYS A; 2WLB A; 4YSZ B; 4LDT B; 3LXF A; 4P1B C; 4BKS D; 1H8C A; 2AX5 A; 3RNC C; 4LNO A; 1M94 A; 1T0Q C; 2FUH B; 3T9L A; 2DYO A; 3ML9 A; 2LRU A; 3TEW A; 1KF6 B; 2WDV B; 2B76 B; 2NMQ A; 2MJE A; 1I4X A; 2WP9 B; 5D3D A; 5GMV A; 1YN5 A; 1WX8 A; 3AV8 A; 1JWM D; 2UYZ B; 3U30 A; 1A5R A; 1YN3 A; 3H8H A; 1D4B A; 2KFJ A; 2JT4 B; 1OTR B; 3Q2A C; 1N63 A; 4W9G A; 2JZZ A; 2E3T A; 2WXL A; 4MH8 A; 3P63 A; 1NEK B; 1SJH D; 2QIE B; 3SU8 X; 4HJG E; 3NJT A; 3T8M A; 2D3B A; 3PV1 A; 2KAC A; 3KUC B; 3VUY A; 5LLI A; 2X8X X; 2BS3 B; 2PEA A; 5G2N A; 1VZ6 A; 1WF9 A; 2L3Z A; 2MRP A; 3OJ3 A; 2D3G A; 5D6J B; 4LNK A; 3OLM D; 4N59 A; 3PS6 A; 1SE2 A; 2M0X A; 2JWU A; 3VQI A; 3V62 A; 2CJO A; 3RZF A; 1V97 A; 2JRI B; 1STE A; 4XYC A; 4EEW A; 1FIQ A; 1MJD A; 4ZRP A; 2CU3 A; 2K22 A; 4MGY E; 3KUZ A; 4WAA A; 3DBS A; 2BBC A; 1WGY A; 1F52 A; 1FEH A; 1XLO A; 2G1E A; 1T0S C; 3SEB A; 2LGX A; 3AE2 B; 1SE4 A; 4RFB A; 1DOX A; 2YLM A; 3ZXV A; 2KWV B; 1GNU A; 4OZA A; 3Q3J A; 3GB1 A; 2WXQ A; 3JYU A; 1XCQ L; 2W3R A; 2L0F A; 5LXH A; 1V49 A; 1F9J A; 4FLH A; 4MM3 A; 4W9H A; 3TCA A; 2JF5 A; 2PPH A; 4X57 B; 3DHG C; 3VTU A; 5HI1 A; 5C23 A; 3H9D A; 2R2Q A; 5DPT A; 4IKG A; 2BWF A; 5FK9 C; 3U7Z A; 4PYZ A; 4AJY B; 1EWY C; 2NTS A; 4GDK A; 4OZB A; 5IP4 D; 1HA5 A; 2SAK A; 3BVM A; 2GMI C; 1EUV B; 3PO0 A; 3C8Y A; 2DYM A; 2I1J A; 3Q8E A; 2N7J A; 4NAW B; 1XLP A; 3Q8C A; 3HHM A; 1JWU D; 4WAF A; 2JQR B; 1FM0 D; 1GB1 A; 1OGW A; 1NVI D; 4BKS A; 1ZP0 B; 4XWW A; 2W55 A; 4HDO A; 3EUB 2; 4LTU A; 4FJZ A; 1LQB A; 3AUL A; 4IWP A; 2WHI A; 3VFK A; 3X0W A; 2J0M A; 5IOI A; 1GC7 A; 4A6Q A; 1QOA A; 4E3C A; 4DXG A; 2NBV B; 2KC1 A; 2C60 A; 1I4R A; 4N9F 4; 2NBU A; 1WXS A; 2PKO A; 4AWJ A; 4MJS A; 4DWF A; 4EZJ A; 1Q5W B; 2RPQ A; 3TJP A; 5J18 A; 1TS3 A; 3SR6 A; 1C3T A; 4W9I A; 4LJO B; 3V05 A; 3QAQ A; 3N1X C; 2N7E A; 3KW5 B; 4MT5 A; 3RYT A; 4ZRI A; 1FXA A; 5E6O A; 1MG8 A; 3OJ4 B; 4HWI B; 1PGB A; 1YN4 A; 4FXC A; 1QT9 A; 3J9C A; 2LZ6 A; 4A55 A; 4KGT A; 2Y5C A; 4NJ6 A; 1HTO A; 2DNF A; 4HDQ A; 2K3U A; 2ZZP B; 1TKY A; 2R61 A; 2LRW A; 1C1Y B; 2D11 A; 3NVZ A; 4IW0 A; 3AU4 A; 4HEA 1; 4FHK A; 3Q6B A; 1J7A A; 2QHO A; 4AJW A; 2D2Q A; 2WXM A; 3QJZ A; 2DEN B; 4PS8 A; 3ZDM C; 2ZVO A; 4JL9 A; 3RNE C; 2IO3 B; 4UDU C; 3Q3F A; 4IM3 A; 2V3N A; 2VRR B; 1PGA A; 3KYD D; 5CX3 A; 1RWS A; 3W1S C; 4BZA A; 3B2F A; 4JWU C; 1K8R B; 4F7Z A; 2INC C; 4MGI E; 1WXQ A; 2KAN A; 3BYT B; 2D10 A; 2LJ5 A; 4ZHO A; 1GOZ A; 3WA0 A; 1FNV A; 2PIA A; 1OFF A; 4TMA B; 2BPS A; 1TZ1 A; 2WYQ A; 1NYR A; 4KIK A; 3ALB A; 3V6C B; 1OQR A; 4ACF A; 3U7D A; 1Q1O A; 1PGX A; 2JZ3 B; 2WXF A; 2GRI A; 3R7Q A; 1M4V A; 5T8I A; 4I6L B; 4BKG A; 1QOF A; 2GLS A; 1TZO A; 3PSE B; 4M02 A; 3A9J B; 3HRD D; 2KN5 A; 1E90 A; 4KKJ A; 4AOF A; 2V0G A; 3VR8 B; 4EKU A; 3B0A A; 3HK0 A; 3AXC A; 2ZW1 A; 1RAX A; 4M8N A; 4K3B A; 3AEE B; 5BYS A; 1V5T A; 4ICU A; 3NRZ A; 2WXK A; 4P7I A; 4K7S A; 3Q8B A; 3L08 A; 1WXV A; 3IG3 A; 2BYF A; 4BOZ B; 1L6V A; 1L7Y A; 4PYU A; 4A3P A; 3O13 A; 1WRD B; 2BB6 A; 2BS4 B; 3A1Q A; 4HKZ E; 2CHZ A; 3IT4 B; 4BBN C; 4PK1 A; 3EHV A; 3RNB C; 4EFO A; 1AN8 A; 3FIL B; 1KLV A; 3GE8 C; 4TKN A; 4ZDV A; 1XD3 B; 1WJU A; 4WWM A; 4HCP B; 2FCN A; 1CMX B; 1K52 A; 3BYY B; 4S0R A; 3CF6 E; 2WS3 B; 3N20 C; 1ENF A; 2KO3 A; 2BS2 B; 2LGS A; 3UIO B; 3PLV A; 3DBL I; 1KM7 A; 2CHW A; 1SB3 C; 2JVC A; 4IDI A; 5AEK B; 1J8C A; 2AQ1 B; 2PLP A; 3VRA B; 3NZS A; 2LWP A; 4MDK E; 3DBR B; 4K81 A; 2BVC A; 2GBJ A; 2XN9 C; 4JPS A; 3B08 A; 1EU3 A; 4HPL B; 3DHH C; 2V4L A; 1PYW D; 4TQ1 A; 2PVO D; 2WXG A; 4WJN A; 1IYF A; 3AI5 A; 3A9K B; 1KLG D; 2A4Z A; 3GOE A; 3HVZ A; 1TBE A; 4C00 A; 1E0Z A; 3RN9 C; 3B2G A; 4CQN A; 1FMA D; 2GBM A; 4O1N A; 2Z59 B; 4YTN B; 4ANV A; 3VAW A; 2YEP B; 1EWC A; 1I4Q A; 2GBR A; 5BO4 B; 4GN1 A; 3IT6 B; 4US9 A; 3FAH A; 3AB5 A; 4GLS C; 2O6V B; 1WGD A; 2MEK A; 4F8C B; 1DOY A; 3H1U A; 1JML A; 1ZGU B; 4B0E A; 2PVG C; 2GBN A; 1PUT A; 3P4S B; 3DVN U; 4Q2J A; 5AUI A; 3R3M A; 2WX1 A; 1XLN A; 2SEB D; 1XEE A; 5G55 A; 2D3A A; 2MHJ A; 3RZW C; 1E8Y A; 3ZVV A; 3ENE A; 4NY0 A; 1J19 A; 2OHF A; 1MHH E; 1C77 A; 2N0S B; 3M63 B; 3WAN A; 4ZRQ A; 2WU5 B; 2CU1 A; 3V61 A; 3JSV B; 3MJ5 A; 2GI9 A; 2KWC A; 5CHW A; 4RGN A; 3AE9 B; 1IP9 A; 3N9Y C; 3EFU A; 3VVW B; 2HD5 B; 3OWE B; 3AMZ A; 4RNA A; 2KMC A; 2A5U A; 2WWZ A; 3GZN I; 1L0X B; 3M3J A; 1YX5 B; 1TY0 A; 3AED B; 2KVZ A; 4NAW A; 3HUI A; 4XDC A; 2Z0E B; 2NPT B; 2J52 A; 1C79 A; 2KJ6 A; 2MX2 A; 2K5P A; 2K6Q A; 3VTV A; 3QK0 A; 2EMS A; 3S2A A; 1JRP A; 1KFY B; 3WAM A; 4B95 A; 2IGG A; 2KDF B; 1G6J A; 3L0W B; 3QAR A; 1BML C; 1J7C A; 1TTN A; 4WWN A; 2VZK D; 1XXG A; 1FD6 A; 3QC8 B; 4TQ0 A; 3PVL A; 4NZL B; 5EDS A; 1YNT E; 3U8Z A; 1KLU D; 4WUR A; 2JWZ A; 3VUW A; 3R2T A; 2MA9 B; 3MC8 A; 1WH3 A; 4YXD B; 3H7P B; 4E71 A; 1QQR A; 4I6P A; 3SDL C; 2FE8 A; 2K8C A; 3MFG A; 2EKE C; 2RDH A; 3PTF C; 4L23 A; 5J2R A; 3DHI C; 1CZP A; 1IGC A; 2IO1 B; 2WDQ B; 4G11 A; 3ZO5 B; 3BII D; 3SD5 A; 3PHW B; 3W5U B; 2L1A A; 3VTW A; 1WR1 A; 1N6Z A; 4RF1 A; 2AWT A; 3VH4 B; 4LNI A; 4W9L A; 4LCD E; 2G4D B; 5EE0 A; 4ZHP A; 2FCM A; 1HZ6 A; 3BZD B; 3OAW A; 2KTR B; 1YQ4 B; 3Q14 C; 2WXO A; 5FKA C; 3ZQ4 A; 1UZX B; 2FID A; 1Z2M A; 4G50 A; 3IAS 1; 1GPX A; 2V3P A; 1TT5 B; 4GDL B; 4IM0 A; 3Q8A A; 1WGG A; 1P0R A; 1KRH A; 2NR2 A; 1WZ3 A; 3L4P A; 4FJY A; 2MJ3 A; 1UGJ A; 3AE4 B; 1FO4 A; 1FXI A; 1C78 A; 3UI3 A; 2MBQ A; 4FJV B; 4II3 B; 4F1S A; 1TKE A; 3WAL A; 5BYQ A; 4ZYN A; 5GXG B; 4DHJ D; 3TMP B; 3N1Z C; 4RGT A; 1B1Z A; 1JQ4 A; 2PTL A; 3EA6 A; 3NG0 A; 4LNN A; 2MP2 B; 2IBI B; 5DPR A; 5TR5 A; 3Q69 A; 2HDE A; 2M8S A; 1UBQ A; 2KTF A; 1FPY A; 1K53 A; 2PE6 B; 2DAJ A; 2OJW A; 1JRO A; 3NVV A; 4M0W B; 2KDI A; 2KWU B; 1LM8 B; 1WM2 A; 1FXT B; 4JE3 B; 2JSV X; 2FIF A; 4BKT A; 2LHD A; 2KFK A; 1E7V A; 3M95 A; 4BOS C; 3AE7 B; 2L7R A; 1EF5 A; 1UWM A; 1R4M I; 2L32 A; 1ACC A; 2KC2 A; 3QHT A; 1H4R A; 2ZJD A; 4XZ4 A; 2LVO A; 3TL5 A; 2L8J A; 2LGI A; 3EGR A; 2KOX A; 4QAY A; 3TSS A; 2N9P C; 2HJ1 A; 3UIP B; 4A9A A; 1LXD A; 3NHE B; 3APF A; 5D2M B; 2HE7 A; 4WJP A; 2KXJ A; 1LO5 D; 2WXJ A; 1ZDV A; 1FNU A; 2HJ8 A; 3AEG B; 2LVQ A; 3Q3M C; 4FBJ B; 4KGS A; 1ZUD 2; 2N9E B; 2DZJ A; 4KKI A; 3UF8 A; 3QIJ A; 1K51 A; 2WXH A; 3ZNH B; 4MEL A; 4DDI D; 1XT9 B; 3LJ3 A; 1T6B X; 2KLG A; 3WAO A; 3W1Y A; 3I3T B; 4DK5 A; 2QEJ C; 4R3D A; 4YWG G; 5AZF A; 3UGB B; 1D5Z C; 4GGQ A; 1WJN A; 3AE1 B; 3UQB A; 2QJL A; 5TSS A; 1MHX A; 1V9J A; 1S1Q B; 1I7H A; 3RNG C; 1WRI A; 4GSW A; 3Q3O C; 1TIF A; 3KQ4 A; 1SIJ A; 4H2A A; 3UIN B; 1XLQ A; 3A9K A; 2KX0 A; 5HKH A; 2G9H D; 2L00 B; 2IND C; 4ASW C; 2FAZ A; 4ZRK A; 2KDB A; 3VUX A; 3FC4 A; 3ZGZ A; 1SGH A; 1UH6 A; 1I35 A; 1AAR A; 2RMM A; 3P1M A; 2INP E; 5JXV A; 2KK8 A; 3R66 C; 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2D3C A; 1HEZ E; 4JIO U; 2VZK B; 3GZN B; 2I38 A; 3WCQ A; 4EUT A; 3AEA B; 4YTP B; 1FRD A; 3IFW B; 3MP9 A; 4AP4 C; 1TJE A; 5IAA C; 2CKH B; 2RSU A; 3VR9 B; 1BT0 A; 1L4Z B; 2BQQ A; 2JX5 A; 2NCN A; 2XBB C; 4ANW A; 2BGF A; 3PRE A; 2FCQ A; 1Q0W B; 4GDL A; 4MM3 B; 1T0R C; 2V4I B; 5HG2 A; 1V81 A; 1R4N I; 5D3I B; 1V1P B; 2IO2 B; 4RGO S; 2LJI A; 1Q10 A; 3EEC A; 1VD2 A; 1WGH A; 5I4D A; 2ON8 A; 2Q5W D; 1EO6 A; 3PRZ A; 4M8M A; 1QLB B; 1EM7 A; 3DBH I; 2RGF A; 4KGR A; 4JX1 C; 1E6E B; 5H92 C; 1L5P A; 1GC6 A; 4DBG A; 2MP2 A; 1TYG B; 3WIM A; 1WGK A; 1NI2 A; 4YSX B; 1F0Z A; 3RD2 A; 3QCA A; 3DWG C; 1QOG A; 1NYQ A; 4RM8 A; 4XGA B; 2JPH A; 3ZJU A; 2K1F A; 4WQM A; 4M0W A; 3ECI A; 2LXA A; 1E10 A; 5L95 C; 1RM6 C; 4HVB A; 3QQ8 B; 2Z0D B; 2G4S A; 1UWX A; 1D6E C; 4NAM A; 1XCT L; 3JW0 X; 2C7M B; 2QCZ A; 1ISN A; 4KX6 B; 4DHZ B; 1QF6 A; 3LYY A; 5G5G A; 2C7N B; 1NI3 A; 1WYW B; 1YMH E; 5L83 A; 3ZW3 A; 1HTQ A; 4JLC A; 1GUA B; 1KJT A; 5C2T B; 2ZVN A; 2NTT A; 3DQV A; 2NS5 A; 3A4S C; 1ZXH A; 2I2Y A; 2N4F A; 2UU7 A; 5JHA A; 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