The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
|
sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
MQYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYFNDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of GB1 A34F mutant
rcsb |
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
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| molecule tags |
Immune system
|
| source organism |
Streptococcus sp. 'group g'
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| total genus |
13
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
|
| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-10-30 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1FCL A; 2KN4 A; 1IBX B; 1HZ5 A; 5BMI A; 4MAC A; 4KGT A; 4KGR A; 4OZC A; 1EM7 A; 1GB1 A; 1XCQ L; 1K52 A; 2IGG A; 2QSD A; 5BMG A; 1K50 A; 4HKZ E; 2NMQ A; 5HI1 A; 1YNT E; 2GI9 A; 4IOI E; 3FIL B; 2RMM A; 1MPE A; 5HFY A; 4GLS C; 1XCT L; 2IGD A; 1FD6 A; 1FCC C; 1JML A; 2IGH A; 3UI3 A; 5HG2 A; 1XF5 L; 2J52 A; 1K51 A; 2K0P A; 2KQ4 X; 3V3X A; 2ZW0 A; 2N9K A; 1K53 A; 2JSV X; 1C9F A; 1IBX A; 1PGB A; 2N7J A; 4HJG E; 1UWX A; 2I38 A; 5BMH A; 2RPV A; 4KGS A; 2KDM A; 1HEZ E; 1F2R C; 1YMH E; 1MHH E; 1QKZ A; 2ONQ A; 1D4B A; 1HZ6 A; 2GB1 A; 2LHE A; 4WH4 A; 3FIL A; 1GB4 A; 2LHD A; 3GB1 A; 4IKG A; 2ON8 A; 2OED A; 1IGC A; 2PLP A; 3MP9 A; 1IGD A; 2N9L A; 1F2R I; 2JWU A; 2ZW1 A; 1MHX A; 2JU6 X; 1PGX A; 1MI0 A; 1MVK A; 1Q10 A; 2PW9 A; 2LUM A; 2EEL A; 2JZP A; 2JXT A; 2KAC A; 1PGA A; 2QMT A; 1ZXH A; 2PTL A; 4OZB A; 2LGI A; 2J53 A; 1P7E A; 2KWD A; 2I2Y A; 4OZA A; 5JXV A; 1P7F A; 4D2K A; 5HHD G; 1KH0 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2WX1 A; 2MJE A; 2XBB C; 2EMS A; 2IBI B; 4JWU C; 2Q5W D; 3DBH I; 2ZPY A; 1MJD A; 3AU5 A; 1P9D U; 1I4R A; 2D3C A; 4M8N A; 4PYU A; 3KVF B; 2MJ3 A; 1ET6 A; 3Q3N C; 4ZRJ A; 3GE3 C; 2CHX A; 1QOA A; 2L76 A; 4F1S A; 1UEL A; 2KDF B; 3NVW A; 2BKR B; 1FD6 A; 2PE6 B; 4ZRK A; 3TEW A; 2UU7 A; 1P3Q U; 1NDD A; 3ZNG C; 1GC6 A; 1L0Y B; 4DXF A; 3DBR I; 1SGH A; 4HVB A; 1GNU A; 1IP9 A; 4B6W A; 1N5W A; 2DAJ A; 3PGE A; 4URK A; 3U2S C; 3HK0 A; 2AX5 A; 3R7Q A; 3RCZ A; 2BWF A; 2BBC A; 3I5J C; 3VR9 B; 2WXM A; 2Z0D B; 4XE0 A; 3ML9 A; 3EHV A; 2CKH B; 2Y5C A; 5I4D A; 4GSW A; 4J6I A; 3URY A; 1XD3 B; 2J0K A; 4PS7 A; 1IGD A; 2W54 A; 3ZRF A; 3R3M A; 5CHV C; 4G50 A; 2JWU A; 2TSS A; 1UZX B; 2KAJ A; 3B0A A; 3T9L A; 3DHI C; 2OJR A; 1Q10 A; 4KDL B; 1HE8 A; 1KLV A; 5C23 A; 1QF6 A; 1R4N I; 2J42 A; 2JXT A; 2O6V D; 2MBH A; 4ZHO A; 2KFK B; 4OZB A; 2DZM A; 3RFZ B; 2KWD A; 3EFC A; 3OJ4 B; 3L0W B; 2V9H A; 4D2K A; 4N6E B; 4HDO A; 3AE9 B; 3N20 C; 4MAC A; 1J0G A; 2ZNV B; 3AEG B; 4OZC A; 4JPS A; 4KKI A; 2IDY A; 2K1F A; 2SAK A; 3W2D A; 3OJ3 A; 1E9M A; 1CMX B; 1WGR A; 2C60 A; 2KTR A; 1YJI A; 4YTM B; 1P98 A; 5JH5 C; 1FIQ A; 1T0Y A; 2IO2 B; 1OQY A; 2KXJ A; 4HKZ E; 1TY0 A; 4IDI A; 2ZCC A; 3BVZ A; 2AL6 A; 3H9D A; 1XCT L; 4W9G A; 3M3J A; 2D10 A; 5AZF A; 2MP2 A; 3VVW B; 1FFV A; 4BAX A; 3JSV A; 5LLI A; 4HCN B; 1FM0 D; 2N9E B; 3PZ7 A; 3RNG C; 5G2N A; 3L13 A; 1TS5 A; 2KJ6 A; 2O6V B; 3DVN U; 1CZP A; 3MHS D; 2KDM A; 1KLU D; 4IG7 B; 1L4D B; 4OW0 A; 2A4Z A; 2WYQ A; 4TSS A; 1RWS A; 3SEB A; 2ZEQ A; 4WIP A; 1STE A; 4N58 A; 3C0R B; 1TTN A; 1V81 A; 3R2I A; 2K8H A; 1FXT B; 1IGC A; 5IA7 A; 4YSY B; 2CHW A; 3BYT B; 3ZGZ A; 4FAD A; 3VUW A; 2AQ2 B; 1SIF A; 1MI0 A; 1UGM A; 4WAA A; 5BYS A; 5IKC M; 2I1J A; 2D11 A; 4EE2 A; 3Q3M C; 1WX9 A; 1V49 A; 5EE9 A; 3TEZ A; 1Y8R C; 3QA8 A; 4KSK C; 3KUZ A; 1SE9 A; 4LNI A; 2M4N A; 1HTO A; 2HDE A; 4LJO B; 4K7S A; 2WWZ A; 4MGI E; 5KHQ A; 1MFW A; 4MJS B; 5L83 A; 2KN4 A; 3BVM A; 2C5L C; 4L1B A; 3R7R A; 4GU2 A; 4RF0 A; 2XK5 B; 3KQ4 A; 2FCM A; 2LXA A; 1C79 A; 3RUL A; 4RM9 A; 1TIF A; 3WAO A; 2INC C; 1Z5S B; 3LXF A; 3B9J A; 1V97 A; 4HEA 1; 4OVV A; 3AE5 B; 2N7D A; 3H7S A; 5AEK B; 2WLB A; 3UI3 A; 1E90 A; 1T5X D; 3QIJ A; 4XX5 A; 2MLB A; 3U7D A; 1WE6 A; 3AED B; 2N9K A; 4GDK B; 1UF0 A; 3GZN B; 2KWV B; 1TYG B; 4IWQ A; 3MC9 A; 3H6N A; 1YJ1 A; 2DLB A; 3U30 A; 1OEY A; 3KW5 B; 2XEW A; 4I6L B; 1V1P A; 5BO4 B; 2J0M A; 3I63 C; 4TMA B; 3AU4 A; 2DAF A; 3UF8 A; 3AEC B; 4WJQ A; 2WXP A; 5DPS A; 3Q3O C; 3PS6 A; 2QIL A; 4K3B A; 2KJH B; 3WCQ A; 3ZJU A; 1KM7 A; 2RD0 A; 2HJ8 A; 3U7Z A; 2KHW B; 5IO9 A; 4AJW A; 4RFB A; 4K7W A; 1RAX A; 2Z8L A; 4KSL C; 2IO0 B; 1YQ4 B; 2LEK A; 2KN5 A; 1U4A A; 3K9O B; 2WXG A; 1Q1O A; 3ZTC A; 2ICI A; 3DCG A; 1D6E C; 1IUE A; 1T0S C; 2KAC A; 1ZW7 A; 2M0A A; 2NCN A; 3IVF A; 4DWF A; 2N1V A; 3AH7 A; 2KMA A; 3NOB A; 1YX6 B; 2MH7 A; 1QT9 A; 2HE7 A; 4USA A; 3SDL C; 4LK0 M; 1V80 A; 1WFY A; 5E6N A; 4HPM B; 3X0W A; 4ARI A; 3BY4 B; 3QK0 A; 3W5U B; 3QAQ A; 4GMV A; 4DBG A; 4W9J A; 1HZ5 A; 1FXI A; 2VH2 A; 3QAR A; 2R61 A; 4W9E A; 4LTU A; 5CX3 A; 3QX1 A; 3OWE B; 3A9K B; 4GDL A; 2KMM A; 3GOE A; 2M1M A; 1UBQ A; 4W9K A; 3P4Q B; 3CST A; 3N30 A; 4KZC A; 4ANU A; 1GAQ B; 1FNU A; 3ZQ4 A; 1FEH A; 3MJW A; 5HI1 A; 1UGJ A; 1H8C A; 2INN E; 2LRU A; 1P0R A; 2LJ5 A; 2DX5 B; 2PPH A; 1FCC C; 3CMM B; 2LFI A; 2MQJ A; 1ZDV A; 1J19 A; 2KNB A; 3SU8 X; 1L5P A; 1CK1 A; 5BYR A; 3C19 A; 3X23 A; 1IBX A; 1I42 A; 2J7Q B; 1FMA D; 1L0V B; 1I4Q A; 1JWA D; 1TS2 A; 2DZJ A; 2INP E; 3ZXV A; 5J17 A; 2I38 A; 1NVI D; 3NVV A; 1VJK A; 2RPV A; 3JVZ X; 1SBB B; 3FC4 A; 2K3U A; 3ONS A; 1WI0 A; 4YSX B; 5D6J B; 3A9J A; 2L8J A; 1N5X A; 2JRH A; 1B9R A; 2O2V A; 2GBK A; 3FIL A; 3IT4 B; 1D5X C; 3CSF A; 2KWC A; 2BYE A; 3TBL D; 4IKG A; 2L83 A; 2G3Q B; 2W3S A; 1R4M B; 2KFJ A; 3MP9 A; 3P42 A; 4KX6 B; 1XT9 B; 3NS8 A; 4HPL B; 2C7H A; 2JU6 X; 4W9L A; 3ZKJ C; 1ZOY B; 1DGJ A; 1YQB A; 2GBR A; 5FR6 A; 1PGA A; 1PDX A; 4B9K A; 1E8X A; 4MM3 A; 3W9C B; 3IAS 1; 3ZJT A; 4OZA A; 4C80 A; 2VZK D; 4ZHP A; 1QZE A; 3E9S A; 4DK5 A; 2AWT A; 2N4F A; 1V5T A; 2LD9 A; 3KWL A; 2M56 B; 2K25 A; 3EEC A; 3FKY A; 4RM8 A; 2IGG A; 1NEN B; 2C9W B; 4MGY E; 4C56 C; 3B1L X; 4TQ0 A; 3RNB C; 4PT5 A; 2WXN A; 1XXG A; 1SE4 A; 1WIA A; 1WF9 A; 2KDE B; 4XDD A; 3UQA A; 3WA0 A; 2N9P C; 1C4A A; 2JQR B; 1BXT A; 2K39 A; 1K53 A; 3NRZ A; 2KT7 A; 4ZYS A; 3HM3 A; 3OG5 A; 2W9N A; 1HEZ E; 3DHH C; 1WXS A; 2BT6 A; 3DBS A; 1LO5 D; 1QKZ A; 1ZKH A; 4EZK A; 2JVC A; 5KHO A; 3APD A; 2VZK B; 4X57 B; 2K6D B; 3VTU A; 3V61 A; 2LVO A; 4M0W B; 3EA6 A; 1ZDX A; 1EO6 A; 3Q6B A; 3FAH A; 4NAW B; 2KAN A; 4K81 A; 2LZ6 A; 4GGQ A; 3RUI B; 2FIF A; 2KDB A; 4ZRI A; 2PEA A; 3IT6 B; 2LUM A; 4E3C A; 4ARC A; 2R2O A; 2QMT A; 3V6E B; 1P7E A; 4WWO A; 2WXJ A; 3AN1 A; 1S1Q B; 3DBL B; 2KQS A; 2W82 A; 1F9J A; 4IM2 A; 3TIX A; 1OQQ A; 1KH0 A; 4IM3 A; 3AEA B; 2KJR A; 2BYF A; 1C76 A; 1I4X A; 3CF6 E; 2WXO A; 4KGT A; 3EC8 A; 1WJ4 A; 4W9D A; 3VFK A; 4B0E A; 1V5O A; 3NY5 A; 1GB1 A; 2L0T A; 1WXV A; 2PJH A; 3H7P A; 1XLO A; 1K50 A; 3DQV A; 1FNW A; 3ENE A; 1AWD A; 3KLS X; 1Q0W B; 2HTM E; 5HFY A; 1WZ3 A; 4M00 A; 2WHI A; 2IGH A; 1HA5 A; 4XYC A; 4LJP B; 4ZRQ A; 2KQ4 X; 3AE2 B; 3L16 A; 3ZNI D; 3RZF A; 3LDZ E; 2JSV X; 5DPW A; 2E6X A; 1DOI A; 1AAR A; 4GIV A; 2KK8 A; 2WDQ B; 1L6V A; 1WMH A; 3LJ3 A; 1RLF A; 2L3Z A; 2BTE A; 4REZ A; 2K9X A; 3A1Q A; 1JW9 D; 1I4G A; 1MG4 A; 4UDU C; 4AOF A; 4AQ7 A; 1L4Z B; 4TQ1 A; 3VH4 B; 4B95 A; 3ML8 A; 1KTK A; 1PGX A; 3RZW C; 4GB9 A; 3L10 B; 1RFA A; 2FNJ B; 2RDB C; 3V60 A; 3RNC C; 2NBU A; 3PRZ A; 1JWS D; 2EEL A; 2FID A; 2D5G A; 2J53 A; 3ETR A; 2UWQ A; 4YWG G; 1FFU A; 2WXI A; 1P7F A; 2V0G A; 2RDG A; 4TV3 A; 1T3Q A; 1VD2 A; 2LGD A; 1V6E A; 1HQR D; 1UD7 A; 5CTR C; 5J18 A; 3JW0 X; 5TR5 A; 2KC1 A; 3AI5 A; 4I6N B; 1YN3 A; 4YTP B; 4RGM A; 1J7C A; 1TBE A; 3VUY A; 3K9P B; 2MSE D; 3AMZ A; 3PZD A; 1L2N A; 3SFE B; 2N9X A; 2E3T A; 1MPE A; 4NAM A; 4WJN A; 3NHE B; 5IOI A; 2AL3 A; 1F77 A; 2N0S B; 4NY0 A; 5EE1 A; 1TKG A; 3AM9 A; 4A90 A; 2L7R A; 2B3A A; 5D94 A; 1WGK A; 4HRO A; 4RCO A; 1R7S A; 3A33 B; 1WR1 A; 2PKO A; 2V4I B; 3GZN I; 4PS3 A; 2PE9 A; 4US9 A; 3DVN V; 2MBQ A; 4FUL A; 3KWV A; 4BKG A; 1NI2 A; 3PRM B; 1ROE A; 2ZZP B; 2BS4 B; 3Q8A A; 3GB1 A; 2QC8 A; 2ON8 A; 1KOT A; 3C8Y A; 2WXQ A; 4HXD A; 3WAL A; 2N9L A; 1MG8 A; 2LVP A; 5G5G A; 2G4D B; 4E71 A; 1SB3 C; 1MHX A; 3I3T B; 3RPF C; 2KTR B; 5AZG A; 2M0X A; 1K8R B; 2IZV B; 3AE3 B; 2OOB B; 3Q14 C; 4BFR A; 4NJ6 A; 2LGI A; 1UH6 A; 2K6Q A; 4HJK A; 2CR5 A; 4E74 A; 1OFF A; 1ZXI A; 4NZL B; 3N9Y C; 2BQQ A; 2KC2 A; 2MP2 B; 2BPS A; 3JSV B; 4ZDV A; 2KQ7 A; 4NPN A; 4KV2 A; 2REX A; 2KD0 A; 4Q2J A; 3H1U A; 2QHO A; 3DBR B; 3P2B A; 2YEP B; 3SFD B; 2HJ1 A; 3L17 A; 2H88 B; 3ZTD A; 5G5H A; 3Q69 A; 5CHW A; 1GJZ A; 1XLN A; 4DXG A; 2GMI C; 4EEW A; 3BIN A; 4NNJ B; 2L0F A; 2NMQ A; 3ZNZ B; 1L0X B; 3PV1 A; 2QEJ C; 3AE4 B; 3P4P B; 2IGD A; 3AV8 A; 1YN5 A; 3PLV A; 4W9C A; 3ABV B; 2V4L A; 1M94 A; 1N61 A; 4AWJ A; 1WM3 A; 2KWU B; 2JUO A; 1PGB A; 1QIL A; 2JYT A; 2FE8 A; 2NTS A; 4HJG E; 4MEM A; 2DBY A; 3VDZ A; 1NEK B; 3P63 A; 4EOY A; 3M62 B; 1KRH A; 3KUC B; 2BWE S; 4C7Z A; 4OVZ A; 4DQO C; 1JCK B; 1SIJ A; 2WXK A; 5FR3 A; 3EFU A; 1LFD A; 4WH4 A; 4WUR A; 1SXT A; 4R3D A; 1ISN A; 3QJZ A; 2MHJ A; 4LLG M; 2NVU I; 1YQ3 B; 1TKE A; 3MC8 A; 4KIK A; 1R4M I; 1ESF A; 5H92 C; 5AZH A; 4JL9 A; 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4TKN A; 4IUM B; 2BKF A; 2D2Q A; 3W1S A; 4W9I A; 3T8M A; 3RT3 B; 3VHT C; 3APF A; 1WYG A; 1EF1 A; 3R66 C; 1PQS A; 3IG3 A; 3KYD D; 3A9J B; 2FCN A; 3P1M A; 2M19 A; 1YNT E; 2O2V B; 3BVG A; 4IOI E; 3FIL B; 4S17 A; 1JAL A; 2NR2 A; 4ASW C; 1TS3 A; 4LCD E; 3Q3J A; 1XF5 L; 5D3D A; 2J52 A; 2JPH A; 5DPT A; 2FUH B; 2CJO A; 3V05 A; 4MH8 A; 4L2Y A; 2N7J A; 3QC8 B; 2MBB B; 3DVG Y; 5D2M B; 1BML C; 1OTR B; 2NBW B; 4ACF A; 4FJY A; 4LDT B; 2WXH A; 4P1B C; 2NS5 A; 3UIP B; 5BMH A; 3ALB A; 1GG3 A; 1I4P A; 3PT2 B; 4MM3 B; 2N7E A; 1XEE A; 2BS3 B; 3DOW A; 4AJY B; 4EUT A; 1VR9 A; 2DEN B; 3ZVV A; 2IND C; 1E5W A; 2L00 B; 4FLH A; 2LHD A; 2QJL A; 2LGY A; 1V9J A; 1J8C A; 3IHP C; 3RNF C; 3ZW3 A; 2G4S A; 1Z2M A; 4HLE A; 1F0Z A; 3T3O A; 1WJN A; 2MW5 A; 1WYW B; 2MWS B; 1NI3 A; 4FHJ A; 1YOV B; 2CU3 A; 3UIO B; 5C3J B; 5H8Y E; 4XGA B; 4KKJ A; 2KLC A; 4H2A A; 3WAP A; 2LXC A; 4WAF A; 3NVZ A; 1QOF A; 2MBE A; 2FCQ A; 5C2T B; 3OAW A; 2RDH A; 1WGG A; 1DOY A; 1J7B A; 4XWW A; 2BB6 A; 2G1E A; 1N6Z A; 3ZJV A; 4PS8 A; 4C4V A; 4XDC A; 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