The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
72
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structure length |
72
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Chain Sequence |
MVYTVSYDVDGTVIKTKVEAGTRITAPKPPTKQGYVFKGWYTEKNGGHEWNFNTDYMSGNDFTLYAVFKAET
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Fold and Function of the Inlb B-Repeat.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
INTERNALIN B
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| molecule tags |
Protein binding
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| source organism |
Listeria monocytogenes egd
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| total genus |
11
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| structure length |
72
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| sequence length |
72
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| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-01-17 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2Y5P A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5G5H A; 1OQY A; 1C4C A; 3RMK C; 2KNB A; 1WXA A; 2NCN A; 3RUL A; 2DBY A; 2BKF A; 3W1S C; 4IOI E; 1SE9 A; 3RD2 A; 1L4Z B; 2OOB B; 1E6E B; 3T8M A; 2WS3 B; 2NTT A; 4K3C A; 3VFK A; 4DBG A; 4B0E A; 2KX0 A; 2BS3 B; 4B9K A; 1N5W A; 4HPP A; 2PKO A; 4M8N A; 2WLB A; 4WWN A; 1P98 A; 2KOX A; 3PSE B; 4WJQ A; 2KDM A; 1JML A; 2PPH A; 4RM8 A; 1P0R A; 3EGR A; 2DYO A; 2M17 A; 2R61 A; 3RFZ B; 2D3B A; 3AXC A; 4BVU C; 2JUO A; 2J0K A; 2LGS A; 1ZPS A; 3PHX B; 2BF8 B; 1QOB A; 3MJ5 A; 3KW5 B; 3UQA A; 3KLS X; 2OJW A; 3WIM A; 3VDZ A; 4DXF A; 2CU1 A; 2V9H A; 3A9J A; 4YWG G; 1WM2 A; 3B0A A; 1WWT A; 2IO1 B; 3BWU D; 3KWL A; 3A9K B; 3P63 A; 3QK0 A; 1V5O A; 3DWM A; 3Q8C A; 4DHJ B; 2B76 B; 2AQ2 B; 2C5L C; 3QHT A; 4XWW A; 3ZJU A; 2GBK A; 4LLG M; 2X8X X; 2LEK A; 2BYV E; 2GOW A; 3RZW C; 1WFY A; 3NVV A; 4LTU A; 5LLI A; 2OHF A; 2LGY A; 3ZXV A; 3Q2A C; 3H8H A; 2AQ3 B; 3ZRF A; 5J18 A; 3NHE B; 1NI2 A; 2DAF A; 1YQB A; 3UIO B; 4EZL A; 4BBN F; 3T3O A; 2D3G A; 3JSV B; 2BYF A; 3K9O B; 1KM7 A; 5HHD G; 2HTH A; 2IBI B; 3A9J B; 5D2M B; 1F77 A; 1YQ3 B; 3PRP B; 4WQO B; 1J7C A; 1WSP A; 2Y5B B; 4XYC A; 2KTR B; 3KUZ A; 2BGF A; 2LI5 A; 2CJO A; 4NNJ B; 2I1J A; 4PYZ A; 4HVB A; 1BML C; 5TSS A; 2I1K A; 3Q8A A; 1V97 A; 4K7U A; 3PGE A; 3BII D; 3KQ4 A; 2REX A; 2QMT A; 4RGO S; 3Q3J A; 5JH5 C; 2IO3 B; 3RI7 C; 1RAX A; 2A5U A; 3TEZ A; 3VVW B; 4MGK E; 2O6V D; 2L0F A; 3CWI A; 1KTK A; 1FXT B; 1Z5S B; 1GC6 A; 4GGQ A; 2MQJ A; 2IO0 B; 2J53 A; 2JXX A; 4WWO A; 2LXC A; 5HI1 A; 5JHB A; 3MTN B; 2GBR A; 1RYJ A; 3M63 B; 1L5P A; 2G4D B; 1L0Y B; 2IO2 B; 4E71 A; 2BQQ A; 4RF1 A; 3AMZ A; 3O65 B; 2G9H D; 2PVG C; 4HJK A; 2LXA A; 4MEM A; 2LHD A; 4NJ6 A; 3ZNZ B; 4EFO A; 3AE5 B; 2CHW A; 3ZYY X; 4LDT D; 1KLG D; 4FXC A; 2HD5 B; 4KIK A; 1OFF A; 2BWF A; 3A4R A; 1ZDX A; 1KJT A; 4W9H A; 2KN5 A; 5D6J B; 4AJY B; 1HTO A; 2J0J A; 3TEW A; 1EO6 A; 2GMI C; 4I6L B; 2DZI A; 3APC A; 3NVZ A; 3AE6 B; 1YN4 A; 4NPN A; 4ANW A; 2I38 A; 1K50 A; 2JYT A; 1HTQ A; 1JRO A; 3DHH C; 4J6I A; 1C78 A; 4MJS A; 2UYZ B; 1CMX B; 4IW0 A; 4C80 A; 4II3 B; 5DPR A; 2N1V A; 1E5W A; 3VAW A; 4G3X B; 1EU3 A; 4DDI D; 4ZHP A; 1WX8 A; 2AYO B; 1XCQ L; 1T3Q A; 4C00 A; 4GDK A; 2MSE D; 3AM9 A; 1UEL A; 1YX5 B; 2WDV B; 3DBR I; 3VTV A; 4PS3 A; 1KLV A; 3ZTD A; 3AN1 A; 2C7H A; 4LNF A; 2ZW1 A; 1OEY J; 1T0Q C; 1VD2 A; 2L00 B; 5DPT A; 3BY4 B; 1G6J A; 1QKZ A; 2W54 A; 1FCL A; 1WGG A; 3H7P B; 1WM3 A; 4LJO B; 4OHJ A; 3W1S A; 1GAQ B; 2E3T A; 2KMM A; 1H4R A; 3P4S B; 3VRA B; 2KHW B; 1Q5W B; 1XQQ A; 1WGY A; 4N58 A; 1WRI A; 2DWQ A; 3M3J A; 2K1F A; 2O2V B; 5FR6 A; 5C3J B; 2MJ3 A; 4GDK B; 2LJ5 A; 1D5X C; 1GPX A; 3N9Y C; 1B1Z A; 1WGD A; 1E8X A; 2BB6 A; 5E6N A; 3W1Y A; 1HA5 A; 3VTW A; 2NS5 A; 4LJP B; 3PZ8 A; 1DOX A; 3AE7 B; 5KHQ A; 3NZ3 A; 1SEB D; 3PRZ A; 5HG2 A; 3L13 A; 3N32 A; 5IP4 D; 3TBL D; 5BYQ A; 1LFD A; 1MVK A; 1F2R C; 1A5R A; 1E8Y A; 3CST A; 4HRO A; 1VJK A; 4KX6 B; 3RNE C; 2A4Z A; 3ETR A; 1WH3 A; 5D3I B; 2H89 B; 4G0N B; 1EWC A; 1C4A A; 3Q3M C; 2DZK A; 3Q14 C; 3LDZ E; 4OZB A; 2GRI A; 2ZW0 A; 4XDD A; 1MPE A; 4KKJ A; 2INN E; 3WAO A; 4C7Y A; 1XO3 A; 3PVL A; 3A33 B; 3LYY A; 2ZJD A; 2WXJ A; 3OJ4 B; 4K81 A; 2CHZ A; 3FAH A; 1N5X A; 2QIE B; 3MFG A; 1WXQ A; 1WMH B; 2NBV B; 5EE1 A; 4K7S A; 1WJU A; 4IKG A; 1XF5 L; 2L3Z A; 2NVU I; 2FBW B; 2IND C; 3DQV A; 1TGZ B; 2L32 A; 1R4M I; 3IT4 B; 2WP9 B; 3L17 A; 2WXO A; 2INC C; 4M00 A; 1R4N I; 4RGM A; 2O6V A; 2CS4 A; 5BO4 B; 3NZS A; 3HK0 A; 1JCK B; 1WI0 A; 2UWQ A; 2WXL A; 3U2S C; 1JRU A; 2KVZ A; 1V81 A; 1I4G A; 3DHG C; 3NOB A; 4JWU C; 3ZJV A; 3DBS A; 4N6E B; 3TJP A; 3N1Z C; 4IWP A; 2RPV A; 1ZDV A; 5G5G A; 1DYQ A; 4EE2 A; 3L10 B; 2DLB A; 4M02 A; 5T8I A; 2J0M A; 1K52 A; 4S0R A; 3RNF C; 4NAW A; 4OVV A; 3RUI B; 3WAP A; 1WJ6 A; 3P1M A; 1AW7 A; 3HM6 X; 2KMA A; 1LGR A; 1IUE A; 2O6V B; 4C56 C; 1FO4 A; 4ZRJ A; 2BS4 B; 1SB3 C; 4PS8 A; 3V62 A; 3AE2 B; 3RNB C; 1I35 A; 2MRP A; 5LNK 1; 2JVC A; 3BVG A; 4DK5 A; 2KC1 A; 1WGK A; 2IGH A; 3R2T A; 3DOW A; 3AEC B; 1V1P A; 5E6J A; 4HEA 1; 2XEW A; 3ML8 A; 4MM3 A; 4KGS A; 1T6B X; 3BK1 A; 2NPT A; 3Q8E A; 4GB9 A; 3T3N A; 1I4R A; 4NAW B; 4EZK A; 4FA6 A; 5DCN A; 1GUA B; 4LDT B; 1V49 A; 4GDL A; 1YNT E; 2V3N A; 4A8X C; 2WXK A; 3SHQ A; 1QIL A; 3QJZ A; 2K8C A; 2MBB B; 1JWA D; 3BYT B; 3L16 A; 3W5V B; 2ZVN A; 2XK5 B; 3OG5 A; 5D3D A; 1CJE A; 4DHZ E; 2KFJ A; 4II2 B; 3QA8 A; 3GB1 A; 1TJE A; 2LGX A; 1WX7 A; 3TMP B; 2BTE A; 3SEB A; 3LJ3 A; 2BPS A; 4MM3 B; 4MGY E; 3D32 A; 4FJZ A; 1WXM A; 1RFK A; 3A1Q B; 2R2Q A; 2SEB D; 1SE4 A; 2K25 A; 4N59 A; 1T0R C; 1WZ3 A; 3DWG C; 4KGT A; 2JU6 X; 2N9L A; 2DNF A; 4GSW A; 1VZ8 A; 4UDU C; 2PVO D; 4BKT A; 2LJI A; 2LFI A; 3R66 C; 1SIJ A; 2BS2 B; 3MJW A; 2LMC A; 3AI5 A; 1HQR D; 2GI9 A; 3U4E G; 3H9D A; 2K6Q A; 2LWP A; 3A4S C; 4W9F A; 3GZN B; 1ISN A; 1OEY A; 3MP9 A; 3ZO5 B; 3A9K A; 5AZG A; 3NG0 A; 3QIJ A; 5L95 C; 1ET6 A; 1F2R I; 5E6P A; 3NVY A; 4FN2 A; 4WWP A; 2MJE A; 2MCN B; 1R7S A; 4JE3 B; 2JF5 A; 4NY0 A; 2WX0 A; 2EEL A; 4LCD E; 3NVW A; 3QCA A; 2LZ6 A; 4JL9 A; 2C7N B; 4KZC A; 2MW5 A; 2KLG A; 3QWZ B; 2LAS A; 1ZW7 A; 4NQL B; 3TSS A; 1TTN A; 4MGZ E; 1V5T A; 3TCA A; 1WE6 A; 2L83 A; 3ENE A; 1J0G A; 5IO9 A; 3LB8 C; 3NRZ A; 1FNV A; 3MHZ A; 1WJN A; 3QC8 B; 4G50 A; 1E7P B; 1YQ4 B; 2NR2 A; 1CQV A; 3CIR B; 2ZVO A; 2WU5 B; 3JSV A; 4HRS A; 4JPS A; 3ZXR A; 3VR9 B; 1IGC A; 2K39 A; 1GC7 A; 2KTR A; 4BKG A; 2RGF A; 1ZOY B; 4AWJ A; 4ANX A; 4GOC A; 1PGB A; 1NYQ A; 3E56 A; 1FEH A; 3N1Y C; 1FPY A; 1YN5 A; 2KFK B; 1TBE A; 4XWT A; 2KDF B; 3Q3O C; 3HM3 A; 1PUT A; 2J42 A; 1V2Y A; 4E3C A; 1AWD A; 2MP2 B; 4EKU A; 3I3T B; 1SF0 A; 2G4S A; 2AL3 A; 1P3Q U; 4ZRQ A; 1I4Q A; 4HCN B; 4KSL C; 2MBQ A; 2VH2 A; 3AB5 A; 4IWO A; 2KAN A; 1TS4 A; 3AE1 B; 4YT0 B; 4DXA B; 4NJC A; 4XGA B; 1IYF A; 2PMV A; 4MAC A; 4ZOH C; 1FXA A; 1Y8R C; 2PLP A; 1V9J A; 1DOY A; 3Q3F A; 3BVZ A; 4K7W A; 2C7M B; 4W9D A; 3EC8 A; 1QLB B; 1UZX B; 4EZJ A; 1C9F A; 3I63 C; 4F8C B; 1Q1O A; 1JWM D; 4KSK C; 5IOI A; 2RDH A; 4WIP A; 3JVZ X; 3PZD A; 1SSN A; 1MHX A; 1NI3 A; 3PRE A; 4DHZ B; 3N1X C; 1QT9 A; 5E6O A; 3AU5 A; 2W9N A; 3UGB B; 1VDV A; 1EWY C; 2JQR B; 2L1A A; 1KOT A; 1DGJ A; 2IJ0 A; 3O13 A; 2JT4 B; 2VH1 A; 1EF1 A; 2FCM A; 3NY5 A; 3QAQ A; 4RH6 A; 3IXS A; 4OVU A; 2AEH A; 5AEK B; 2FID A; 1MHH E; 1BT0 A; 1SXT A; 3SFE B; 2FUH B; 1WZ0 A; 1AAR A; 1OQR A; 2DHZ A; 4TSS A; 3GE3 C; 1BUI C; 1TZO A; 3PLV A; 5BMI A; 2QDF A; 1TS3 A; 2B3A A; 4HPM B; 4W9I A; 3DCG A; 2MBO A; 2CHX A; 2KT7 A; 3MC0 B; 4HPL B; 1PGA A; 3DBL I; 2ON8 A; 1MG8 A; 4US9 A; 4FJY A; 2IPK D; 2IYD B; 5J17 A; 2V4L A; 1RM6 C; 2WQY B; 4JIO U; 3HIZ A; 3GS2 A; 4WAF A; 3HUI A; 1N6Z A; 1QZE A; 2RDB C; 5L83 A; 2AQ1 B; 2LVQ A; 3OLM D; 1FRD A; 4EUT A; 3AEG B; 1STE A; 3CF6 E; 3V6C B; 2ZNV B; 4BKS D; 5LXH A; 4CQN A; 3N30 A; 3LXF A; 1UUP A; 3H7P A; 2VZK B; 1V1O A; 3I9V 1; 4NQK E; 2N7D A; 2KAJ A; 3H6N A; 2LVO A; 1D5Z C; 4S17 A; 5EDS A; 4M01 A; 4GLS C; 4RGT A; 2O2V A; 4MEL A; 2DYM A; 4MDK E; 2Y3A A; 2ZZP B; 4LNI A; 1PYW D; 1FFU A; 1WE7 A; 3X23 A; 2KWC A; 1XD3 B; 3JW0 X; 1FXI A; 1T0S C; 4ANV A; 2KJH B; 1D4B A; 3DBH I; 5BMH A; 2LUE A; 2ZPN A; 4TV3 A; 4AOF A; 3PTF C; 3AUL A; 3Q8F A; 1SJE D; 3L54 A; 3B2F A; 5TR5 A; 3EFC A; 5EE9 A; 4JQW C; 3WAM A; 1NEK B; 1JWS D; 2BYT A; 4YTN B; 4XC2 A; 1EUV B; 2KJ6 A; 1I7H A; 3OJ3 A; 4XDC A; 1U4A A; 1XLO A; 2Z59 B; 2D5G A; 4Q2J A; 1JWB D; 3VUW A; 5HKH A; 1LXD A; 4GIV A; 4LNK A; 3JYU A; 3ZGZ A; 1IGD A; 2IY0 B; 2M4N A; 3C19 A; 1GG3 A; 1YIW A; 3X0W A; 2BWE S; 4XE0 A; 2KQ7 A; 1WMH A; 2PE9 A; 2QEJ C; 5JZE B; 1FCC C; 3V61 A; 1PQS A; 3WAN A; 4HKZ E; 2ZCC A; 3U7Z A; 2UU7 A; 1WGH A; 2KWD A; 4RCO A; 1I4P A; 4XX5 A; 3U7D A; 1EU4 A; 4MH0 E; 3AEF B; 2M19 A; 3AEE B; 1OGW A; 3PHW B; 1PDX A; 3Q8B A; 3KVF B; 1YD8 U; 1LO5 D; 3AV8 A; 2DEN B; 4FLH A; 2Z0E B; 1XLQ A; 4PYU A; 1IP9 A; 2KYW A; 2WXG A; 2AL6 A; 2WYQ A; 2KVR A; 3VH4 B; 4LNO A; 2DYB A; 1T5X D; 2XN9 C; 4BBN C; 2K0P A; 4GU2 A; 1UWM A; 4ARI A; 4BOS C; 2PTL A; 1L2N A; 1Q10 A; 2FCN A; 3GP7 A; 3VR8 B; 1ZUD 2; 2WXN A; 3R7R A; 1QOA A; 1TY2 A; 4HK2 A; 1SBB B; 3E9S A; 1QQR A; 1NEN B; 1P9D U; 3UF8 A; 1ET9 A; 1UBI A; 4OVZ A; 1Q0W B; 4RM9 A; 1ZP0 B; 5IN7 A; 5CX3 A; 5EE3 A; 5C1Z A; 2HJ1 A; 2DZJ A; 3IHP C; 3DBR B; 3PPA A; 2JWZ A; 2G3Q B; 4BAX A; 2ZEQ A; 1C79 A; 3TEY A; 2D3C A; 2JX5 A; 1TYG B; 2FAZ A; 2KQ4 X; 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5I4D A; 1E90 A; 2JPH A; 3B2G A; 3V05 A; 2WDQ B; 2QHO A; 1J8C A; 3P4P B; 5G55 A; 4C7Z A; 4FJV B; 4FHK A; 3RZF A; 3I57 A; 1UGM A; 2JZZ A; 4YSZ B; 2FCS A; 2GBN A; 2JYE A; 4CHK A; 2INP E; 2PE6 B; 4JLC A; 4FAD A; 2HE7 A; 3L0W B; 3ONS A; 2ACZ B; 3UI3 A; 1MG4 A; 2PJH A; 4IM0 A; 4W9L A; 3J9C A; 2JWU A; 3CSF A; 5FK9 C; 5G2N A; 3RNA C; 3ZQ4 A; 1AYF A; 2WXM A; 3RPF C; 3AH7 A; 2PW9 A; 3B08 A; 1C77 A; 1YJ1 A; 1KFY B; 5CTR C; 4ZHO A; 3DPD A; 2DZM A; 5BMG A; 1YN3 A; 3BZD B; 4W9G A; 4ANU A; 4EOY A; 3APD A; 3VHT C; 3HRD D; 1LM8 B; 3RN9 C; 1SGH A; 1N63 A; 2MLB A; 3N3K B; 4AUQ C; 2GB1 A; 4RFB A; 3EEC A; 2Z0D B; 2FUG 1; 4ICV A; 3SU8 X; 2LD9 A; 3MC8 A; 3TEX A; 3M95 A; 1XT9 B; 1YJJ A; 4YTM B; 2AX5 A; 4RF0 A; 2JSV X; 3URY A; 1TS2 A; 5J2R A; 3PLU A; 2N9X A; 2IY1 B; 5GXG B; 5BYR A; 5EE0 A; 5DPW A; 1ACC A; 1NBF C; 1SIF A; 2KFK A; 4F1S A; 4EEW A; 3AE4 B; 3MC9 A; 4AS1 A; 1I42 A; 1KLU D; 1UWX A; 2D10 A; 2J4X A; 2MP2 A; 1NYR A; 1HZ5 A; 1JW9 D; 3L4P A; 1T0Y A; 2NBW B; 4NJ7 A; 2VRR B; 1EF5 A; 2DX5 B; 2MJD A; 5MPO A; 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