The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
22
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sequence length |
80
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structure length |
80
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Chain Sequence |
MIKVLFFAQVRELVGTDATEVAADFPTVEALRQHMAAQSDRWALALEDGKLLAAVNQTLVSFDHPLTDGDEVAFFPPVTG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of a molybdopterin synthase-precursor Z complex: insight into its sulfur transfer mechanism and its role in molybdenum cofactor deficiency.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Transferase
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| source organism |
Escherichia coli
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| molecule keywords |
Molybdopterin-converting factor subunit 1
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| total genus |
22
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| structure length |
80
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| sequence length |
80
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-11-30 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3AE7 B; 2PKO A; 5G5G A; 1J7B A; 4A9A A; 1SB3 C; 1L0V B; 1QF6 A; 2WU5 B; 1JRP A; 1WRI A; 3HUI A; 3WCQ A; 1FRR A; 1AYF A; 3AE2 B; 1SF0 A; 2Q5W D; 3AE8 B; 3P4P B; 4WWM A; 1TYG B; 1B9R A; 1V8C A; 2B76 B; 2PIA A; 1FRD A; 2AX5 A; 3NVZ A; 2W3R A; 5H8Y E; 3AE9 B; 4ZOH C; 3W9C B; 1WWT A; 1FIQ A; 1QT9 A; 3AE3 B; 2K9X A; 1ZOY B; 4US9 A; 5EE3 A; 3AE1 B; 4YTN B; 2BS4 B; 3VR8 B; 4C80 A; 1OFF A; 1E9M A; 3AH7 A; 4YTM B; 1KF6 B; 1JWA D; 2MJE A; 1ROE A; 2WDV B; 4US8 A; 1WGK A; 1RFK A; 1V97 A; 3AEE B; 5AUK A; 2E3T A; 1ZUD 2; 3LXF A; 3ABV B; 2WDR B; 1TKY A; 2PVO D; 1XLP A; 1GPX A; 3VRB B; 1FXA A; 2DWQ A; 4ZHO A; 1E10 A; 1FO4 A; 1F0Z A; 3DWG C; 2OHF A; 1FFU A; 3LB8 C; 4WQM A; 1RWS A; 3SR6 A; 2WP9 B; 1PUT A; 2CJO A; 1T3Q A; 3AEA B; 1CZP A; 5EE9 A; 1NEK B; 3AMZ A; 4HRS A; 4JWU C; 5H92 C; 3VR9 B; 1WXQ A; 2QJL A; 1E7P B; 1R7S A; 3CWI A; 3FC4 A; 1OQQ A; 1TKE A; 2WLB A; 3NVW A; 1NYQ A; 2MJ3 A; 3AB5 A; 4FXC A; 1L5P A; 2WDQ B; 3AM9 A; 3P1M A; 2BS2 B; 1KRH A; 2HTM E; 4P6V F; 3AEC B; 3AEG B; 2EKI A; 4LTU A; 3P63 A; 4ITK A; 3KWL A; 1J7A A; 1NVI D; 1RYJ A; 4YTP B; 4N59 A; 4YSZ B; 1NI3 A; 1EWY C; 1N5X A; 1J7C A; 2WS3 B; 3ETR A; 4YT0 B; 2LEK A; 4JWS C; 1JAL A; 1N61 A; 1RM6 C; 1A70 A; 1XLN A; 2W55 A; 3P4Q B; 2BT6 A; 2BS3 B; 2QIE B; 3NVY A; 5AUI A; 3SFD B; 1KFY B; 2KMM A; 1QOF A; 3VRA B; 1FMA D; 2H89 B; 3AEF B; 1N63 A; 3B2F A; 1TJE A; 3AN1 A; 1N62 A; 1QLB B; 4YSY B; 3RPF C; 1DOY A; 1OQR A; 2M19 A; 2CJN A; 1CJE A; 3DWM A; 4C7Y A; 1QOB A; 2FBW B; 4N6E B; 2PVG C; 3AE4 B; 3AV8 A; 1TKG A; 2W54 A; 1JWB D; 3PO0 A; 4IDI A; 1L6U A; 1YQ4 B; 5MPO A; 1FXI A; 2G1E A; 2JX5 A; 1AWD A; 1DGJ A; 2Y5C A; 4USA A; 1PFD A; 1UWM A; 1GAQ B; 1XLQ A; 4YXD B; 3NS1 A; 1N5W A; 1QOG A; 2MH7 A; 3W5V B; 2WQY B; 2JQR B; 3P4R B; 1SIJ A; 2CU3 A; 3P4S B; 3CIR B; 1YQ3 B; 1IUE A; 3BII D; 1NEN B; 2MJD A; 3HVZ A; 4YSX B; 1N60 A; 1YJI A; 3AEB B; 5EE0 A; 1DOX A; 2WU2 B; 3W5U B; 4C7Z A; 1JQ4 A; 2L83 A; 3B2G A; 3NVV A; 3ZYY X; 1VLB A; 1DOI A; 1PDX A; 1E6E B; 4N58 A; 1ZP0 B; 2L52 A; 1VJK A; 1XLO A; 1VDV A; 2ACZ B; 4HRO A; 1YJJ A; 5GXG B; 4JX1 C; 1I7H A; 1ZXI A; 1JW9 D; 1NYR A; 1WYG A; 3EUB 2; 5EE1 A; 1QOA A; 3AE5 B; 2W3S A; 3L4P A; 3NRZ A; 5C2T B; 3HRD D; 1E0Z A; 2M56 B; 1L6V A; 2K5P A; 2KAJ A; 3AE6 B; 2DBY A; 3B9J A; 3SFE B; 1XO3 A; 4ZHP A; 2H88 B; 3AED B; 5G5H A; 2N0S B; 5C3J B; 1JRO A; 3FAH A; 4KX6 B; 1FM0 D; 2K22 A; 1FFV A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1J7B A; 2WU5 B; 4HLE A; 4DHZ B; 1OTR B; 3I5J C; 2KWV B; 1OQY A; 4FA6 A; 2KDE B; 2MBB B; 4PYU A; 1KF6 B; 4RM8 A; 1J8C A; 1WGK A; 5AUK A; 2DYO A; 4FHK A; 4X57 B; 2MEK A; 3L0W B; 3T9L A; 3N20 C; 4H2A A; 1EU3 A; 1ENF A; 2K1F A; 3PPA A; 3H8H A; 4KSK C; 4WQM A; 1XCQ L; 2IBI B; 3MC0 B; 1ISN A; 3BY4 B; 3UQA A; 4KIK B; 5G55 A; 3E56 A; 3OWE B; 2KLC A; 3ZIM A; 5JXV A; 2TSS A; 2LAS A; 2VH2 A; 2N9L A; 3DBH I; 4YTP B; 1N5X A; 1V5T A; 4YT0 B; 1LFD A; 4MGZ E; 2IYD B; 1ZKH A; 3MP9 A; 4FUL A; 3QIJ A; 2K39 A; 2DYM A; 3ZO5 B; 4F7Z A; 3V60 A; 3UGB B; 2PE9 A; 2SAK A; 2CJN A; 4A3P A; 1VR9 A; 1TS3 A; 4WJN A; 2LMC A; 4LCD E; 3AV8 A; 3W1S A; 4EE2 A; 3RYT A; 1Z5S B; 1DGJ A; 2O6V B; 4MEL A; 3ZQ4 A; 1XLQ A; 4FBJ B; 1TTN A; 2WQY B; 2FE8 A; 3APC A; 4MSM B; 2LVP A; 1C4A A; 3SHQ A; 1YJI A; 2HDE A; 3QA8 A; 2ZNV B; 5EE0 A; 1DOX A; 3KWV A; 3J9C A; 4RGO S; 3ZNH B; 4NZL B; 2MBE A; 4W9L A; 3HRD D; 1VZ8 A; 4FJZ A; 4ZRJ A; 2L7R A; 1XO3 A; 5HFY A; 4EKU A; 1HA5 A; 1JRP A; 3T3O A; 1CQV A; 2DZM A; 2Z59 B; 4BKT A; 2CHZ A; 3N3K B; 4MAC A; 3M95 A; 1V8C A; 3H6N A; 4XYC A; 2KTR A; 2XBB C; 4MJS A; 1SGH A; 2KAN A; 2BS4 B; 4C80 A; 2ONQ A; 2JF5 A; 2JVC A; 2BBC A; 3GE8 C; 2BB6 A; 2DYB A; 4HWI B; 1SSN A; 3VRB B; 1ET6 A; 2ASQ A; 2DWQ A; 3CST A; 3LB8 C; 4XZ4 A; 2NTS A; 3VR9 B; 1WXQ A; 2YEP F; 1FXT B; 2MJ3 A; 4IM2 A; 2QC8 A; 2D07 B; 1XF5 L; 4A20 A; 2MP2 A; 2DLB A; 4WWO A; 1NI3 A; 1F52 A; 2W55 A; 1XLN A; 3TJP A; 2PPH A; 4W9H A; 3HHM A; 1N62 A; 4WUR A; 3ZJU A; 3I57 A; 2WXJ A; 3V05 A; 3PHW B; 1WJ4 A; 3GS2 A; 3H7P B; 1P98 A; 1PFD A; 1WXS A; 4JL9 A; 4R3D A; 1LXD A; 2KX0 A; 4W9I A; 1I4P A; 3Q2A C; 3VUY A; 1AAR A; 1WGY A; 3AU4 A; 2KJ6 A; 1JQ4 A; 2WXO A; 3APF A; 2K25 A; 2D10 A; 1KLU D; 4YWG G; 1PDX A; 2KQ4 X; 2ZVO A; 1VJK A; 4KVG B; 4ICU A; 4NPN A; 1I7H A; 5C2T B; 2Z0E B; 1L6V A; 2JXX A; 4W9F A; 4A8X C; 2IO1 B; 2KWD A; 4FLH A; 4IC7 B; 4W9G A; 4NAW A; 3V6E B; 4E71 A; 1AW7 A; 2W9N A; 3KQ4 A; 1SF0 A; 4WWM A; 3U7D A; 1FRD A; 3R7Q A; 1E8W A; 4HPL B; 4US9 A; 3GZN I; 5CX3 A; 4A6Q A; 4D2K A; 3TEZ A; 4BOS C; 2JZZ A; 4M02 A; 3ZDT A; 1WIA A; 3QJZ A; 3DPD A; 4GDK A; 1FPY A; 4E3C A; 4I6P A; 3AEE B; 4C4V B; 3ZGZ A; 2E3T A; 4ARC A; 1HTQ A; 1I4H A; 4F1S A; 1ZXH A; 2FUG 1; 3DVN U; 2BVC A; 3DWG C; 2DAF A; 1P7E A; 1WXM A; 3BZD B; 2CJO A; 4XDD A; 5EE9 A; 1CZP A; 2BYF A; 2J52 A; 1J19 A; 1T0Q C; 3FC4 A; 2MHJ A; 1IYF A; 4A90 A; 2IO0 B; 4PS8 A; 3DBL I; 1J7A A; 1RYJ A; 1PGB A; 1GNU A; 1EWY C; 2ZZP B; 2WS3 B; 2GOW A; 1L4D B; 2BS3 B; 1JWU D; 1JML A; 1KFY B; 2R2O A; 4O1N A; 3APD A; 4B6W A; 3RNB C; 4LLG M; 1KOT A; 4JQW C; 1STE A; 3ZNG C; 4XWW A; 3TEY A; 2GBK A; 3BK2 A; 4N6E B; 3KH0 A; 3R3M A; 1GC7 A; 2G3Q B; 1FXI A; 3UQB A; 1YX5 B; 3JSV A; 2MBQ A; 2QSD A; 2M4N A; 1EF5 A; 1J0G A; 3P4R B; 2JZ3 B; 1V2Y A; 2QMT A; 2WX1 A; 2RDH A; 1U4A A; 1WMH B; 3DBR B; 1VZ6 A; 2MBH A; 2BWE S; 4MDK E; 4GLS C; 3EUB 2; 4MGI E; 1YN5 A; 1EUV B; 1PQS A; 3AED B; 3VFK A; 2HD5 B; 3T3N A; 1FD6 A; 3NJT A; 3ZRC A; 1YQB A; 3QAQ A; 5D6J B; 2V3P A; 2WXK A; 1TYG B; 1ZDX A; 2KK8 A; 3AE1 B; 4KZ0 A; 3VR8 B; 4BZA A; 2WDV B; 3IBE A; 5FR6 A; 3WA0 A; 1QZE A; 2PVO D; 1OGW A; 3A9K B; 5CHW A; 4LNF A; 4NQL B; 1I4Q A; 2JYE A; 1GB4 A; 4JWU C; 1EF1 A; 3NVW A; 1DYQ A; 2KC2 A; 2WDT B; 2AQ3 B; 2HTM E; 5E6J A; 3WAL A; 2LVQ A; 4FHJ A; 5IOI A; 4YSZ B; 1UZX B; 2JZP A; 3UI3 A; 3EC8 A; 3QC8 B; 2L3Z A; 3K9O B; 2VRR B; 3B2F A; 1DOY A; 2M19 A; 3MJW A; 1E8X A; 3DWM A; 4K3C A; 1GOZ A; 3NS8 A; 3BK1 A; 2M1M A; 5D94 A; 4XGA B; 1WGR A; 4KV2 A; 4IDI A; 3KUZ A; 2JX5 A; 2QCZ A; 3DCG A; 3KVF B; 2Y5C A; 3C8Y A; 4EZJ A; 2AQ1 B; 4L23 A; 2RPV A; 3Q3N C; 3BWU D; 1PGA A; 4FJY A; 2K8C A; 1F2R C; 2MJD A; 1ET9 A; 1P7F A; 4DHZ E; 2L83 A; 4K7U A; 1Y56 A; 1C4P A; 2MX2 A; 1TT5 B; 4HRO A; 4BKG A; 2W3S A; 1P3Q U; 4IOI E; 3QX1 A; 1SIF A; 4MM3 A; 3WAP A; 3SFD B; 5AZH A; 1MI0 A; 1GJZ A; 3Q8E A; 3ZXR A; 2L0F A; 5IN7 A; 4OZA A; 2D3A A; 3D32 A; 2KYW A; 1E90 A; 2K9X A; 3L17 A; 4DK5 A; 5DPS A; 3TL5 A; 3QAR A; 1I4R A; 2K6D B; 2J0M A; 3KUD B; 3ZXV A; 4GIV A; 3CF6 E; 3O13 A; 2KFJ A; 1GB1 A; 1LGR A; 1E7P B; 2LXC A; 3BVG A; 2NTT A; 4OVV A; 3OJ4 B; 1YNT E; 1V5O A; 5E6O A; 1CMX B; 1KJT A; 3Q14 C; 4HDQ A; 2VZK D; 2J0J A; 1A70 A; 4LDT D; 4ACF A; 4II2 B; 4L1B A; 3R2I A; 2H89 B; 2MCN B; 1OQR A; 1E7V A; 2RDB C; 2G9H D; 4GDL A; 2PVG C; 2IJ0 A; 1JWB D; 4MGK E; 2PW9 A; 2XK5 B; 1UWM A; 2C9W B; 3EHV A; 1TIF A; 4XE0 A; 2N1W A; 1TZO A; 2J0K A; 2JT4 B; 1IUE A; 2FCM A; 5CTR C; 1N60 A; 1QQR A; 2OJW A; 1SEB D; 3B2G A; 3NVV A; 1VLB A; 1DOI A; 4ARI A; 4DBG A; 2JWZ A; 4RM9 A; 3AE5 B; 2LUM A; 4RGT A; 3A9J A; 1WGD A; 3NZS A; 2HJ8 A; 3AE7 B; 4E74 A; 4A9A A; 3U8Z A; 1BML C; 4EZK A; 4OVU A; 3NOB A; 1AYF A; 1E8Y A; 1GC6 A; 1EO6 A; 3RT3 B; 3MC8 A; 2AL3 A; 3AE9 B; 2BYE A; 2A5U A; 2KWU B; 2KTF A; 2DX5 B; 4RF1 A; 1JWA D; 2MJE A; 3IVF A; 4KKI A; 4FJV B; 2V3N A; 1WF9 A; 3SU8 X; 1ZPS A; 2ZCC A; 3BVZ A; 2GRI A; 4ZHO A; 1E10 A; 2RGF A; 3DBH B; 2IZV B; 1QIL A; 4KSL C; 1EWC A; 3SR6 A; 3TMP B; 1SE2 A; 4CQN A; 1Q1O A; 3AB5 A; 4IKG A; 4L2Y A; 2LGY A; 3EFC A; 3OG5 A; 2FID A; 1ESF A; 3KYC D; 4REZ A; 2KJH B; 2EKI A; 3P63 A; 2W82 A; 4JLC A; 1JAL A; 1XQQ A; 1UGJ A; 4ZYN A; 3TBL D; 4IWQ A; 4S0R A; 4AJW A; 5EDS A; 2D3B A; 5L83 A; 2L05 A; 1N63 A; 4YSY B; 1JCK B; 2ZW0 A; 4C7Y A; 2D3G A; 2FBW B; 3DVG Y; 5JZE B; 4G3X B; 4I6L B; 2WHI A; 1MPE A; 1WGG A; 1KLG D; 4USA A; 3DVN V; 3K9P B; 3FIL A; 1ZGU B; 1UEL A; 2JQR B; 2OED A; 1WXV A; 2BKF A; 1SE9 A; 3OLM D; 5D2M B; 3P42 A; 3ZYY X; 3WAN A; 1RRB A; 3U30 A; 4DXF A; 4NJ7 A; 3U7Z A; 3N30 A; 3ALB A; 3VAW A; 1L4Z B; 2KDB A; 3ZTC A; 3RFZ B; 1V1O A; 3RZF A; 5G5G A; 4G50 A; 3SEB A; 2M0A A; 2R61 A; 1P0R A; 1B9R A; 2MQJ A; 3P4P B; 3RNA C; 1P9D U; 3N1Z C; 5EE3 A; 3ML8 A; 2BW2 A; 2ZW1 A; 3VH4 B; 5TSS A; 4ANW A; 4NNJ B; 3BYY B; 1WSP A; 3H9D A; 4AWJ A; 3ABV B; 4HPM B; 2WDR B; 2LI5 A; 4DDI D; 3PT2 B; 3ZNI D; 1FFU A; 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2GMI C; 4NQK E; 4HRS A; 2UYZ B; 1OQQ A; 1NYQ A; 1Q5W B; 4ZDV A; 1WM2 A; 2N1V A; 4BVU C; 3DVG X; 2NBV B; 2RR9 A; 2KN4 A; 2ZPY A; 3PTF C; 3TEW A; 2C5L C; 2V1Y A; 2WXR A; 1C76 A; 1L7Y A; 3RMK C; 4NAW B; 3PS6 A; 5AUI A; 2KMM A; 2KDF B; 3IFW B; 1QLB B; 4B9K A; 1UGM A; 3L10 B; 3AE4 B; 3FKY A; 5BMG A; 2KVR A; 4GDK B; 3IAS 1; 1QOG A; 2ZNV C; 3CIR B; 3BII D; 3VDZ A; 1L0Y B; 1VD2 A; 4Q2J A; 4DXA B; 3IHP C; 4NAM A; 1M94 A; 1E6E B; 1VDV A; 1TY2 A; 2PE6 B; 3SDL C; 2J4X A; 4IWP A; 2V9H A; 4ZHP A; 2MLB A; 4WWP A; 3VTW A; 3QHT A; 2LUE A; 3FAH A; 1FM0 D; 5KHQ A; 2JSV X; 1F2R I; 3ZKJ C; 2JY6 A; 4TQ0 A; 1WRI A; 4IW0 A; 1D5Z C; 2K3U A; 2W3R A; 2DHZ A; 4ZOH C; 1WWT A; 2BGF A; 2Z8L A; 3PLV A; 4UDU C; 2V3S A; 3O65 B; 1WX8 A; 3JSV B; 2BKR B; 3LXF A; 5HHD G; 3ZUN A; 3Q6B A; 3TEX A; 2CU1 A; 4K7W A; 2AL6 A; 2WXL A; 3U52 E; 4BAX A; 2I1K A; 1PUT A; 4EZL A; 4WQO B; 1Q0W B; 3BVM A; 1YD8 U; 2CKH B; 1MFW A; 4LNK A; 3QK0 A; 4K7S A; 3DOW A; 2IO3 B; 4MH8 A; 4M01 A; 3L16 A; 3LYY A; 4DXG A; 2RPQ A; 3N9Y C; 3WIM A; 3RN9 C; 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