The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
16
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
MQYKLILNGKTLKGVLTIEAVDAATAEKVFKQYANDLGVDGEWTYDDATKTFTVTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Streptococcus sp. 'group g'
|
| publication title |
Dimer Formation of a Stabilized Gbeta1 Variant: A Structural and Energetic Analysis
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
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| total genus |
16
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-12-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF01378 | IgG_binding_B | B domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2ZW1 A; 2QSD A; 3FIL B; 1JML A; 4OZA A; 4WH4 A; 1XCQ L; 5HFY A; 1FD6 A; 5BMH A; 2ON8 A; 2PTL A; 2KDM A; 4OZC A; 2ZW0 A; 1FCC C; 2RMM A; 1HZ6 A; 2JZP A; 5JXV A; 4IOI E; 4OZB A; 1F2R I; 2JXT A; 2NMQ A; 5BMI A; 3V3X A; 1IBX B; 1D4B A; 1P7F A; 2GB1 A; 2IGH A; 1PGX A; 2OED A; 1F2R C; 1QKZ A; 1IGD A; 2KQ4 X; 2N9K A; 1MVK A; 3FIL A; 2RPV A; 1GB4 A; 5HI1 A; 1PGB A; 2N7J A; 2JSV X; 1IBX A; 2LHE A; 4KGR A; 1PGA A; 1HEZ E; 5HG2 A; 1UWX A; 2KN4 A; 2IGG A; 1K53 A; 5BMG A; 4IKG A; 1K50 A; 4HKZ E; 1YMH E; 2JWU A; 4HJG E; 2I2Y A; 1ZXH A; 1FCL A; 1P7E A; 3UI3 A; 4GLS C; 2K0P A; 1K51 A; 4D2K A; 3GB1 A; 4KGT A; 2EEL A; 2KWD A; 2ONQ A; 1HZ5 A; 1GB1 A; 2I38 A; 2N9L A; 2LGI A; 1MI0 A; 2GI9 A; 1XF5 L; 1Q10 A; 1YNT E; 5HHD G; 1K52 A; 1MHX A; 2LUM A; 3MP9 A; 1MPE A; 1KH0 A; 4KGS A; 2PLP A; 1C9F A; 2LHD A; 1EM7 A; 2QMT A; 2JU6 X; 2KAC A; 2J53 A; 1IGC A; 1XCT L; 1MHH E; 2IGD A; 2J52 A; 4MAC A; 2PW9 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1YJI A; 3RPF C; 3Q3F A; 4AQ7 A; 2WNM A; 1YN3 A; 3A1Q A; 1N5W A; 2WP9 B; 2NBU A; 1FM0 D; 2MP2 A; 2PKO A; 1JWA D; 1V5T A; 3EC8 A; 3UQA A; 1HTQ A; 1VLB A; 2YLM A; 2WXJ A; 3H9D A; 3AUL A; 2BBC A; 2O6V A; 2Z0D B; 4A55 A; 2D3G A; 3AB5 A; 2DZJ A; 3NY5 A; 4IUM B; 1QLB B; 2MEK A; 3RFZ B; 2DZM A; 3QQ8 B; 2D10 A; 2W3R A; 2JF5 A; 4WJQ A; 3PZD A; 1V1O A; 2HTH A; 4FXC A; 4US9 A; 1MVK A; 4GGQ A; 4QAY A; 3R2I A; 1OQQ A; 1TIF A; 3CMM B; 4WQO B; 2AX5 A; 1MFW A; 2LGY A; 2FUG 1; 5GXG B; 1L4D B; 1WXQ A; 4II3 B; 5H92 C; 5G2N A; 2WDR B; 3ZNZ B; 4DHJ B; 1D6E C; 4HJG E; 4HRS A; 3B2F A; 4US8 A; 2OOB B; 4WQM A; 5C3J B; 1FNU A; 1WXV A; 1WY8 A; 4ANU A; 3B9J A; 3U7D A; 4PS3 A; 5LNK 1; 2DLB A; 1HZ5 A; 1TS3 A; 2N1V A; 2AQ1 B; 2LUM A; 2WXG A; 4AJY B; 2LEK A; 2MWS B; 1NI2 A; 4HCN B; 2UWQ A; 4NNJ B; 1UBQ A; 1L0Y B; 1WXA A; 1E7P B; 1J7A A; 2ZJD A; 3VUX A; 3ZIM A; 1AW7 A; 5E6N A; 1KF6 B; 2MCN B; 1T0Q C; 3FIL B; 1DGJ A; 5HFY A; 1MG8 A; 4M8M A; 2VH1 A; 3KYC D; 1L0V B; 1F0Z A; 1I4Q A; 4DXG A; 1FD6 A; 3NVZ A; 1FXA A; 4N9F 4; 3H1U A; 1EF1 A; 3HM6 X; 3ZGZ A; 1ENF A; 2W55 A; 4B9K A; 4YTM B; 4BKT A; 5E6J A; 3BVZ A; 3W1Y A; 3LYY A; 3DHG C; 4FA6 A; 3RMK C; 4AS1 A; 4UDU C; 2IPK D; 4DDI D; 2LWP A; 5H8Y E; 4FJV B; 2VH2 A; 1E8Z A; 1YN4 A; 3ZVV A; 4AWJ A; 4TQ0 A; 3OJ4 B; 3WA0 A; 2DYO A; 1SE4 A; 5D2M B; 2KX3 A; 2N9K A; 2KN5 A; 4Q2J A; 5JHA A; 2WGS A; 4KGR A; 2G4S A; 1WX9 A; 2KNB A; 4G0N B; 1HEZ E; 3R7Q A; 1HE8 A; 4KZ0 A; 4MGK E; 2IND C; 2IGG A; 1E8W A; 1OEY J; 4N6E B; 3QWZ B; 1TJE A; 1SE9 A; 3UI3 A; 1P1A A; 5GMV A; 1UUP A; 2ACZ B; 3FAH A; 1V49 A; 4FHK A; 2KWD A; 1BT0 A; 3Q8E A; 3TEX A; 4HPM B; 2KVZ A; 4M00 A; 4FUL A; 2J42 A; 1JWB D; 3N1X C; 3E9S A; 3NVW A; 3WAN A; 1P98 A; 3AN1 A; 1WSP A; 4DHZ B; 1GAQ B; 3ML8 A; 1CJE A; 1XXG A; 1L2N A; 2L3Z A; 2WXQ A; 2J53 A; 3J9C A; 3OJ3 A; 1JWS D; 1I4X A; 2J52 A; 3WIM A; 2NBV B; 1FXI A; 3BK2 A; 1V97 A; 1XLO A; 4OZA A; 4I6P A; 4WH4 A; 3VTU A; 5EE9 A; 1I42 A; 4NJ7 A; 4MSQ B; 2M4N A; 1L6U A; 2O2V B; 3DDC B; 3V60 A; 4K81 A; 2LZ6 A; 1IUE A; 2CHZ A; 2J0M A; 2HD5 B; 2NS5 A; 3N32 A; 2E3T A; 1JRP A; 2BYF A; 3BK1 A; 2LJI A; 3PV1 A; 1VD2 A; 3SHQ A; 4ZHO A; 3K9O B; 1D4B A; 4A3O A; 1TZO A; 2KYW A; 1TS2 A; 5BYR A; 4PS7 A; 2KTR B; 1F2R C; 1WYG A; 5HI1 A; 2MBH A; 1NEN B; 2KMC A; 2WDV B; 3BIN A; 5HG2 A; 1LFD A; 1UWX A; 3NS8 A; 3ETR A; 5G55 A; 1E8Y A; 4TKN A; 3SU8 X; 5DPS A; 4XDD A; 4MJS B; 1BML C; 2L0F A; 1PDX A; 2L32 A; 4WAA A; 1T3Q A; 2MA9 B; 1ET6 A; 2DAJ A; 2K3U A; 2LI5 A; 4W9E A; 4IW0 A; 3PZ8 A; 1FIQ A; 4MJS A; 2LGI A; 2ZCB A; 1XEE A; 2DZI A; 1TTN A; 1CZP A; 1V1P B; 2B76 B; 4BBN F; 1Q0W B; 1F52 A; 1KH0 A; 1FO4 A; 1QT9 A; 2L7R A; 2IO1 B; 1SJH D; 1F9J A; 2DNF A; 2KK8 A; 3HVZ A; 3KQ4 A; 1ZOY B; 1ZPS A; 5LXI B; 3AEE B; 3RN9 C; 4YSZ B; 1FXT B; 3L10 B; 2KDF B; 2WU2 B; 3ZUN A; 2GBR A; 3UIN B; 1WJN A; 4A6Q A; 4PS8 A; 2MJD A; 5BMH A; 2DBY A; 1TGZ B; 3Q3N C; 3A4S C; 3A9K B; 4LJO B; 1SIF A; 3NZU A; 4F7Z A; 3Q6B A; 2N9X A; 4HDQ A; 3ZTD A; 4ZRQ A; 3IVF A; 3MC8 A; 3PZ7 A; 2C60 A; 1ZGU B; 1TS5 A; 3X23 A; 1ZDV A; 2M56 B; 3ML9 A; 1F2R I; 4JWU C; 3A9K A; 2WXM A; 3ALB A; 3UGB B; 4H2A A; 3M3J A; 3NVV A; 1WI0 A; 2BPS A; 2M0A A; 2KT7 A; 4WJP A; 3GE8 C; 1E5W A; 1V9J A; 3Q2A C; 2JYT A; 1B1Z A; 2C5L C; 1L6V A; 3CF6 E; 2FCS A; 2JSV X; 4GB9 A; 2D2Q A; 1SB3 C; 4IWQ A; 3AEG B; 4PYU A; 1CK1 A; 2AL6 A; 1R7S A; 3CWI A; 4HK2 A; 4NZL B; 1LGR A; 1F1H A; 3U2S C; 4RGN A; 4YSY B; 2FUH B; 2LUE A; 1JRU A; 2MW5 A; 4XWW A; 3BVM A; 3P63 A; 3U8Z A; 4W9I A; 1FEH A; 3DCG A; 4L1B A; 1GB1 A; 2LVQ A; 2OJW A; 2G1E A; 2CHW A; 3GS2 A; 1Z5S B; 4ZDV A; 4P1B C; 2K8B A; 1DOX A; 4HCP B; 2CHX A; 4E3C A; 1AYF A; 2D3A A; 3VR8 B; 2K6Q A; 4WJN A; 4P1C C; 4TMA B; 1N62 A; 3SFE B; 3NHE B; 1V81 A; 2AWT A; 2KLG A; 1N6Z A; 2LRW A; 2PTL A; 2MJE A; 4IC7 B; 4DWF A; 3T3N A; 1F77 A; 4AOF A; 3R3M A; 2ZCC A; 3L13 A; 1Q1O A; 2SAK A; 3NG0 A; 3HK0 A; 2KWV B; 1DOI A; 1I4P A; 5IA7 A; 4RGO S; 4OVU A; 1EWY C; 1SJE D; 2J0J A; 1IGD A; 1WGH A; 1YX6 B; 2REX A; 2N7J A; 1T0Y A; 1ZUD 2; 2KJH B; 1XQQ A; 1WR6 E; 2QHO A; 2N4F A; 1UH6 A; 4ARC A; 3WAM A; 2LGX A; 3RI7 C; 4IKG A; 1GUA B; 3M63 B; 2JWU A; 4IWO A; 4GDL A; 2QIE B; 4GN1 A; 3AEC B; 1WH3 A; 4D2K A; 2Y3A A; 3GB1 A; 2IY0 B; 4TUU A; 3PHX B; 3I63 C; 3URY A; 3W2D A; 1AWD A; 1J7B A; 5BYQ A; 3UQB A; 1PFD A; 1GC6 A; 3MP9 A; 5AZF A; 4KGS A; 1FRR A; 3EA6 A; 3ZNH B; 3IBE A; 2K1F A; 3AU4 A; 5FR3 A; 2QMT A; 3JSV B; 2WXP A; 2G45 B; 2L05 A; 3O13 A; 4LNN A; 2JPH A; 4II2 B; 2FE8 A; 4N59 A; 2PEA A; 1P9D U; 5D7G A; 1RWS A; 1ZE3 D; 5BYS A; 3LXF A; 3QAR A; 1Y56 A; 3BVG A; 4KX6 B; 3JSV A; 1VRA B; 2WHI A; 3C0R B; 5IO9 A; 4R3D A; 4RF0 A; 2FCM A; 2L00 B; 1J7C A; 1VCB A; 3RUL A; 2H88 B; 3P4S B; 2MQJ A; 3MJ5 A; 1XLP A; 4RH6 A; 4CO7 A; 1WXS A; 4PT5 A; 2RMM A; 4ANW A; 2L52 A; 5C1Z A; 2DHZ A; 3ZXV A; 4GIV A; 3DBL I; 4WUR A; 1DOY A; 3B0A A; 3PLV A; 4W9C A; 1KRH A; 1UWM A; 2BF8 B; 3APD A; 3TSS A; 3V05 A; 3N1Z C; 4KKJ A; 4WWM A; 4HJK A; 2WXL A; 2ASQ A; 2IO0 B; 4AJW A; 2IJ0 A; 2RDH A; 2NR2 A; 1FNW A; 4HVB A; 4C7Z A; 2K39 A; 1N5X A; 1WMH B; 2MBB B; 1STE A; 5KHQ A; 2WXR A; 3MC9 A; 3IAM 1; 1TS4 A; 4A8X C; 4W9K A; 2G3Q B; 2FBW B; 2IO3 B; 3ECI A; 2Z0E B; 1D5X C; 1WGY A; 1WXM A; 3ZXR A; 3QCA A; 1SBB B; 2DWQ A; 1UZX B; 4M02 A; 1B9R A; 3KLS X; 4BKS D; 4GLS C; 2RR9 A; 3BZD B; 1L0X B; 1K51 A; 3L17 A; 1LO5 D; 3VH4 B; 1NYQ A; 2J7Q B; 3Q8F A; 4ZHP A; 4BAX A; 4DBG A; 1A70 A; 2RGF A; 4XZ4 A; 2N9L A; 1C3T A; 1MG4 A; 5CTR C; 1NDD A; 4J3O D; 5C23 A; 3TUO A; 1YQ4 B; 3CST A; 4WJO A; 2NTT A; 3O65 B; 4W9F A; 2GRI A; 5JH5 C; 2V3N A; 1E9M A; 2HJ8 A; 3C19 A; 3U30 A; 2WWZ A; 1HXY D; 1Q5W B; 2LD9 A; 2LHD A; 3VFK A; 1WGD A; 4PK1 A; 3H6N A; 4OHJ A; 1TKE A; 3PT2 B; 2KMM A; 1D5Z C; 2WYQ A; 2FIF A; 1A5R A; 4DDG D; 2BKR B; 2DX5 B; 5IOI A; 2KFK B; 2M1M A; 3MFG A; 4C7Y A; 1V6E A; 2ON8 A; 1RM6 C; 2ZNV B; 3I9V 1; 4N58 A; 2BTE A; 4JPS A; 2JZ3 B; 1C78 A; 3Q8B A; 2KDM A; 4EOY A; 1TT5 B; 4LNO A; 3RCZ A; 5JZE B; 3H7P B; 4C4V B; 1YD8 U; 4LNI A; 4K7U A; 2KFK A; 4RMA A; 4M0W B; 1E10 A; 2LMC A; 3W1S C; 4YTN B; 3AE7 B; 1I4R A; 3JVZ X; 5IP4 D; 3UIP B; 2DAF A; 4MSM B; 3ZQ4 A; 4HXD A; 2ZPY A; 4C4V A; 1LM8 B; 2INC C; 5AZH A; 2DYB A; 1P7F A; 4JLC A; 4M0W A; 2CS4 A; 2JYE A; 3IXS A; 1HQR D; 4MEM A; 3U4E G; 3FIL A; 2MHJ A; 3V6C B; 4IWP A; 1GOZ A; 3QC8 B; 2A5U A; 1C76 A; 3PTF C; 3MHS D; 4KDL B; 5D3D A; 2JRH A; 3EUB 2; 1SXT A; 1FPY A; 1EU4 A; 4W9J A; 4EE2 A; 2AQ3 B; 5FR6 A; 2K0P A; 2Z8L A; 5LLI A; 1C4P A; 5I4D A; 1YJ1 A; 1KJT A; 1TY0 A; 4IM3 A; 2KDB A; 3DBS A; 3WAP A; 4XDC A; 2GI9 A; 1XF5 L; 1Q10 A; 1MHX A; 2M19 A; 3EGR A; 1TKG A; 1I4H A; 3HIZ A; 3IHP C; 4WWO A; 3ZDT A; 1UGJ A; 3DVN U; 4DHZ E; 3AV8 A; 3B2G A; 3AE4 B; 4MAC A; 2QC8 A; 1E0Z A; 1TZ1 A; 3RT3 B; 2K8C A; 4DXA B; 3NVY A; 1XO3 A; 3Q14 C; 4MH8 A; 4W9L A; 1PQS A; 2AEH A; 5IKC M; 1D5M C; 4ARI A; 4YWG G; 4XC2 A; 5IN7 A; 3AE3 B; 5E6O A; 2EMT A; 3L16 A; 2LVO A; 2FCN A; 3QAQ A; 3AM9 A; 1JRO A; 1EWC A; 2PE9 A; 4FJY A; 4KVG B; 2BWE S; 2L8J A; 2FAZ A; 3LJ3 A; 4E74 A; 3HHM A; 3DBH I; 3VXW A; 3AE6 B; 4HEA 1; 2Q5W D; 3L0W B; 3AE9 B; 1V2Y A; 2O2V A; 1WGG A; 5CHF A; 1SSN A; 3TMP B; 2WXO A; 1AAR A; 1FNV A; 4NJ6 A; 3VUY A; 3UIO B; 2BVC A; 2V4I B; 3ZJV A; 2KJ6 A; 3RNE C; 3QA8 A; 4GDK B; 1Y8R C; 4MM3 B; 3DVG X; 4XWT A; 2IO2 B; 1VJK A; 3EFU A; 3VVW B; 1YNT E; 2CKH B; 2KTR A; 4P6V F; 3RD2 A; 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2UU7 A; 2IBI B; 2V0G A; 4HPP A; 2KWC A; 3DOW A; 3P4R B; 4YL8 A; 1YQ3 B; 3SEB A; 1P0R A; 3P42 A; 4NPN A; 4ANV A; 2KAC A; 2XK5 A; 3BY4 B; 1WR1 A; 3VH3 B; 2IGD A; 1KOT A; 1P3Q U; 1J0G A; 3OG5 A; 4F8C B; 4C80 A; 3VTW A; 2WS3 B; 3TIX A; 2Z59 B; 4WAF A; 5TR5 A; 1SGH A; 2ZVO A; 2IYD B; 2AYO B; 4ACF A; 4L2Y A; 2XN9 C; 1NI3 A; 3WCQ A; 2KOX A; 1NVI D; 3X0W A; 3GP7 A; 2K8H A; 5T8I A; 1XLN A; 1EU3 A; 2JXT A; 1C4A A; 2NCN A; 1C1Y B; 3AEF B; 5BO4 B; 4G3X B; 2CJO A; 1PGX A; 2LXC A; 2QDF A; 4AUQ C; 2LGS A; 2KO3 A; 2KMA A; 2KQ4 X; 4L23 A; 3ZLZ A; 1C4C A; 1I7H A; 3DBH B; 1V80 A; 2LHE A; 3BII D; 1PGA A; 2BB5 A; 4KIK B; 3KW5 B; 4G11 A; 2A4Z A; 1Z2M A; 1K50 A; 1KLG D; 1R4N I; 4GU2 A; 3U52 E; 3EFC A; 4LTU A; 1KLU D; 5DPR A; 3OAW A; 4KIK A; 4KGT A; 2WXK A; 3PO0 A; 2JX5 A; 3NS1 A; 2LJ5 A; 4ZYS A; 2C9W B; 5JHB A; 2BYV E; 3IG3 A; 4RCO A; 2LVP A; 2K25 A; 5HHD G; 2K5P A; 3Q8C A; 3PLU A; 2YEP F; 3BWU D; 4JQW C; 2WXN A; 1XT9 B; 1L7Y A; 3IFW B; 3T3O A; 1VZ7 A; 1R4M I; 3MHZ A; 1C9F A; 3GZN B; 3NZS A; 4MGZ E; 4XX5 A; 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