The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
|
sequence length |
82
|
structure length |
82
|
Chain Sequence |
DTKIIYHMDEEETPDLVKLPVAPERVTLADFKNVLSNRPVHAYKFFFKSMDQDFGVVKEEIFDDNAKLPCFNGRVVSWLVLA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Molecular basis of WNT activation via the DIX-domain protein CCD1
rcsb |
| molecule keywords |
Segment polarity protein dishevelled homolog DVL-1
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Mus musculus
|
| total genus |
12
|
| structure length |
82
|
| sequence length |
82
|
| chains with identical sequence |
B, C, D, E, F, G, H
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-12-14 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3PZ8 A; 2D5G A; 3PZ7 A; 1WSP A; 4WIP A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3GE3 C; 3RNF C; 2LEK A; 3N3K B; 3ZO5 B; 4I6N B; 2J0K A; 4BZA A; 3AU5 A; 3WA0 A; 4AOF A; 2K39 A; 2MBH A; 1QOF A; 2MRP A; 2RDH A; 1F77 A; 1TZO A; 4TUU A; 3VQI A; 4AUQ C; 1WGY A; 1OFF A; 2DNF A; 3B0A A; 1WJU A; 5IAA C; 2WXM A; 3U4E G; 2W55 A; 4AP4 C; 1RFK A; 1B9R A; 2BVC A; 3NVV A; 3P4Q B; 3IT6 B; 2BPS A; 4IKG A; 3U30 A; 1S1Q B; 4KDL B; 4H2A A; 4DHZ E; 3HIZ A; 1EU4 A; 2WX1 A; 1UGJ A; 2QDF A; 3A9K A; 2L52 A; 2JZP A; 4K7S A; 4IWP A; 3TSS A; 3TJP A; 1PYW D; 2EMS A; 3B9J A; 1H4R A; 4MGY E; 1J7B A; 4WQO B; 3NJT A; 4A90 A; 1E8X A; 1LFD A; 4KSL C; 3OAW A; 3AE2 B; 4AWJ A; 2MCN B; 4IM0 A; 3DBH I; 4MEL A; 3PRM B; 4WWP A; 1AW7 A; 4EZK A; 3W9C B; 1JWS D; 3MC9 A; 1LO5 D; 5LXI B; 4LNI A; 4QAY A; 1ROE A; 3E9S A; 2HJ8 A; 2AL3 A; 1TS3 A; 2GBJ A; 2NS5 A; 4XDC A; 2JUO A; 4M8N A; 1UH6 A; 1BT0 A; 1H8C A; 5D3D A; 2H89 B; 1WE6 A; 2V1Y A; 3R3M A; 1R7S A; 3C0R B; 5JHB A; 2WQY B; 4PK1 A; 1RFA A; 4J6I A; 2N1W A; 1YIW A; 2L0T A; 3HHM A; 1V1P A; 1V86 A; 1CK1 A; 2B76 B; 1IYF A; 1WFY A; 3Q3N C; 4ANV A; 2QC8 A; 4IUM B; 4NQL B; 2AX5 A; 1JRO A; 2KTF A; 2UYZ B; 2PIA A; 2ZJD A; 1YD8 U; 3DBH B; 3OJ3 A; 4HEA 1; 1ISN A; 1N5W A; 3ALB A; 3VHT C; 2WXH A; 3LJ3 A; 5DPS A; 3IAS 1; 5E6N A; 2BYE A; 1V5T A; 2LXA A; 4RH6 A; 1WRD B; 2JX5 A; 4HXD A; 3ZNG C; 2FBW B; 3RT3 B; 2KLG A; 3VXW A; 3MJW A; 2RD0 A; 3TEZ A; 3EFU A; 3MTN B; 2BYF A; 4A3O A; 2FAZ A; 2KNB A; 2KQS A; 1SSN A; 1V6E A; 2C60 A; 1NYQ A; 2NBW B; 5AUK A; 4XDD A; 3ZXV A; 4RGM A; 2ZNV B; 2LFI A; 4NJC A; 4KGS A; 4YL8 A; 3KWL A; 5BMH A; 2Z0D B; 4F7Z A; 3U7Z A; 1N6Z A; 2LHE A; 2WP9 B; 3UF8 A; 2BW2 A; 1PGA A; 2ZVN A; 2MEK A; 1TS4 A; 2GBR A; 5E6O A; 3NG0 A; 4US8 A; 2V3N A; 4ACF A; 2DZI A; 2QSD A; 2KWC A; 5BMI A; 4GDK B; 2JF5 A; 2C5L C; 3W5U B; 2LJ5 A; 4GSW A; 1FEH A; 4BBN C; 5HFY A; 4W9I A; 2KN5 A; 1ZKH A; 2KVZ A; 4PS8 A; 4USA A; 3W5V B; 1UBQ A; 1KJT A; 2RSU A; 1ZDV A; 3JSV B; 4CYE A; 1NEN B; 2MJ3 A; 4EZJ A; 3R66 C; 2IGD A; 4AS1 A; 2VZK B; 2G3Q B; 2DAJ A; 1SJH D; 2WHI A; 4KDI C; 2W54 A; 1MI0 A; 2IGG A; 2RDB C; 1WXM A; 2KWU B; 2ZW0 A; 2IY1 B; 3AED B; 1EM7 A; 1SE4 A; 1E8W A; 4N59 A; 3ZW3 A; 1XF5 L; 3EC8 A; 3K9O B; 2MBE A; 3P4S B; 4DHJ B; 3RZF A; 1C77 A; 2IO2 B; 2LRW A; 1JW9 D; 2JYT A; 4W9L A; 1I4H A; 2FIF A; 2LGD A; 1JCK B; 3WAM A; 1J19 A; 2KC2 A; 2J0M A; 3L0W B; 5GXG B; 1KM7 A; 2AYO B; 2WXL A; 3DBR I; 3RCZ A; 2NCN A; 1OTR B; 3RNG C; 2WU2 B; 2SEB D; 1QOA A; 2KAC A; 2NTT A; 4W9J A; 2WXK A; 4L23 A; 2DBY A; 3PS6 A; 3W1S A; 2KTR B; 1TGZ B; 1I7H A; 4KZ0 A; 2IJ0 A; 3FC4 A; 2BF8 B; 1UBI A; 2LVO A; 4JWU C; 1FIQ A; 5D6J B; 3RMK C; 1KTK A; 4WUR A; 5IOI A; 3A1Q A; 2CKH B; 2HTM E; 3AE9 B; 4JWS C; 4W9H A; 3RNB C; 2ON8 A; 3Q3J A; 4XWT A; 4URK A; 4JQW C; 4C56 C; 3ZNH B; 3ONS A; 2GBK A; 2X8X X; 4TKN A; 2NMQ A; 3AE4 B; 2NTS A; 3DPD A; 1P0R A; 4E74 A; 4M02 A; 2BB5 A; 3A33 B; 3DBR B; 4WJP A; 2IDY A; 2JZZ A; 2N7E A; 2N0S B; 1FNW A; 2WGS A; 1CQV A; 1OQR A; 1P7F A; 3VR9 B; 1WR6 E; 2G1E A; 1T0S C; 3PHX B; 2LAS A; 4N6E B; 4FJZ A; 4G50 A; 4TQ1 A; 3HRD D; 4LCD E; 5IKC M; 2DAF A; 2WX0 A; 3GP7 A; 3Q8A A; 1ZGU B; 3P63 A; 2DYB A; 3RNE C; 1P98 A; 3I3T B; 3BVZ A; 4HKZ E; 4L1B A; 1PQS A; 3NZS A; 2TSS A; 2D11 A; 3I63 C; 4WWO A; 4MGI E; 5E6P A; 3AU4 A; 4NNJ B; 1K51 A; 4MGK E; 2JRH A; 4C80 A; 3PLV A; 3CF6 E; 1MG4 A; 2KJ6 A; 4NQK E; 1BXT A; 3AEF B; 1ACC A; 2YEP B; 3A9J B; 4KGR A; 5TR5 A; 1CZP A; 2LZ6 A; 3ETR A; 2Y5C A; 1C4A A; 2Z59 B; 4RGT A; 4XE0 A; 2R2O A; 4R3D A; 2HD5 B; 3ECI A; 4MDK E; 1TT5 B; 2JWZ A; 5JH5 C; 2DYM A; 3B2F A; 2KX0 A; 2E3T A; 3L54 A; 3AE1 B; 2LGY A; 1C78 A; 1WM3 A; 2WDV B; 4FAD A; 1JWM D; 4YTM B; 3EUB 2; 4JGH B; 2MW5 A; 3ZNI D; 2OHF A; 1WX8 A; 2MX2 A; 3PZD A; 3AMZ A; 3ZGZ A; 3GOE A; 2PLP A; 2D2Q A; 3BIN A; 2RPQ A; 1SBB B; 3AEA B; 2PVG C; 1Z5S B; 2CR5 A; 4B0M A; 2J0J A; 1SE9 A; 1GOZ A; 1KLV A; 2KX3 A; 1UEL A; 2KVR A; 1ZP0 B; 3AUL A; 2EEL A; 1LM8 B; 1T0Q C; 3Q3M C; 2KT7 A; 4ICV A; 3SD5 A; 4JX1 C; 2XK5 A; 5EDS A; 1KLG D; 1U4A A; 4GDL A; 3U7D A; 1TBE A; 3VUY A; 3RUI B; 4CHK A; 3AXC A; 1QKZ A; 5MPO A; 2C7N B; 2N9X A; 3KUC B; 4UDU C; 2FID A; 4KKJ A; 1F9J A; 2BS4 B; 4M00 A; 4EKU A; 3AEE B; 1HXY D; 1XEE A; 2WXP A; 3NVY A; 4ARI A; 2ONQ A; 4DHZ B; 3N30 A; 3QAQ A; 4LDT B; 3ENE A; 3M3J A; 2L05 A; 2L76 A; 2N9E B; 1SF0 A; 3APF A; 3AN1 A; 2D3B A; 2NBV B; 1Y8R C; 3VH3 B; 1IUE A; 3RPF C; 3IVF A; 1FRR A; 3M62 B; 3V05 A; 2DEN B; 4BKT A; 2IY0 B; 2K5P A; 1I4X A; 1IBX B; 3V60 A; 5I4D A; 2K8C A; 2O2V B; 4XX5 A; 1WMH A; 2M0X A; 3AEB B; 4WAF A; 1TZ1 A; 1WYG A; 1SIF A; 2BKF A; 5BYS A; 2RPV A; 3MFG A; 1Z2M A; 4O1N A; 4BAX A; 1YQB A; 5C1Z A; 1YN4 A; 1YQ4 B; 1CJE A; 1VJK A; 3HM3 A; 2EKE C; 4W9K A; 1UUP A; 1V80 A; 2NPT A; 3BYY B; 1C9F A; 1QQR A; 3DVN U; 2QJL A; 2K6Q A; 2K0P A; 4ZYS A; 3TEW A; 1KRH A; 2KFK B; 3TEY A; 1QZE A; 4K81 A; 1EWC A; 1J0G A; 4LNK A; 3KQ4 A; 1TY2 A; 3BWU D; 3HVZ A; 1TKE A; 1WY8 A; 4A55 A; 3AH7 A; 4K3C A; 1F2R C; 2CU1 A; 5BO4 B; 1K52 A; 2LMC A; 4EEW A; 4FXC A; 3HK0 A; 2BTE A; 4A8X C; 2LGS A; 4GXB A; 3DVN V; 5AZG A; 4YSZ B; 1Y56 A; 4S0R A; 2L3Z A; 2MBB B; 2MQJ A; 4YTN B; 4G0N B; 2REX A; 3ZUN A; 1MJD A; 3BK1 A; 1HTO A; 3AEC B; 3L10 B; 2PJH A; 1E90 A; 3QIJ A; 2Z8L A; 4MM3 A; 3EGR A; 3VTV A; 1T0Y A; 2MP2 A; 4IC7 B; 4D2K A; 2DZK A; 4FN2 A; 4MSQ B; 2BS2 B; 4NAW A; 2V9H A; 3IXS A; 4II2 B; 1FXA A; 2GBM A; 4DXA B; 3CWI A; 3I5J C; 2DWQ A; 1PFD A; 4KV2 A; 4TQ0 A; 1Q1O A; 1N5X A; 1FCC C; 2KDE B; 4GOC A; 2JU6 X; 5BMG A; 2JWU A; 3ZIM A; 4FLH A; 3C19 A; 2BBC A; 1ESF A; 4US9 A; 1IP9 A; 4B0E A; 1MPE A; 3AE3 B; 1AN8 A; 3BK2 A; 4XZ4 A; 2C7H A; 2K3U A; 1OEY J; 3APC A; 2V3S A; 4M8M A; 1SJE D; 3ZLZ A; 1KLU D; 2MBO A; 3H8H A; 4W9E A; 1QLB B; 4KSK C; 1E10 A; 2INN E; 1NI2 A; 1K53 A; 3KUZ A; 4XGA B; 1XO3 A; 2V3P A; 3IG3 A; 3DOW A; 2L00 B; 1XD3 B; 4C00 A; 3QAR A; 5DPR A; 3ZQ4 A; 4RGN A; 4AJY B; 1EF5 A; 4X57 B; 2KKC A; 3RN9 C; 5DPW A; 3M95 A; 3BVG A; 4ZRP A; 4XYC A; 3IT4 B; 4RGO S; 3SHQ A; 4DDI D; 1RAX A; 2OJW A; 4HKQ A; 3Q3F A; 3PT2 B; 3NS1 A; 1ZDX A; 3JYU A; 4RNA A; 1MFW A; 3N20 C; 2VRR B; 3GZN I; 1AWD A; 1WH3 A; 2ZPN A; 3DQV A; 2MSE D; 2CHX A; 3RD2 A; 3VVW B; 2ACZ B; 1L6U A; 5C23 A; 3NOB A; 4XC2 A; 2M4N A; 3PHW B; 4BVU C; 1NEK B; 5HHD G; 1I35 A; 1OQY A; 1EUV B; 1TKY A; 2DLB A; 1F2R I; 4W9F A; 1OEY A; 2R2Q A; 4OVV A; 1E9M A; 2BB6 A; 3U8Z A; 2N1V A; 2K9X A; 1TS5 A; 1WI0 A; 2W3S A; 4M0W B; 4AJW A; 4MEM A; 3B08 A; 4REZ A; 4OZA A; 1FFU A; 2XBB C; 3LXF A; 3N9Y C; 3Q8E A; 4WJN A; 1WZ0 A; 3MC0 B; 1A5R A; 4NZL B; 1ZXH A; 1E8Y A; 3AE8 B; 3U52 E; 4BOZ B; 5L83 A; 3N1Z C; 3GZN B; 4RF1 A; 4HJG E; 1WJ4 A; 2VH1 A; 1I4P A; 5JXV A; 1F52 A; 1MG8 A; 1WF9 A; 4N58 A; 3DWM A; 2LGI A; 2Z0E B; 2IGH A; 5KHO A; 1Q0W B; 1ZXI A; 1ZOY B; 2OED A; 2C9W B; 1N61 A; 4W9C A; 3R7Q A; 2K6D B; 5EE0 A; 1FD6 A; 1C4P A; 2MWS B; 3DWG C; 1L7Y A; 2PPH A; 2L1A A; 1XLQ A; 3RYT A; 1VR9 A; 3BY4 B; 3FKY A; 5G5G A; 2AWT A; 4L2Y A; 3O65 B; 3MHS D; 3DBL I; 4ANU A; 4KGT A; 4PT5 A; 1RYJ A; 3UI3 A; 3R2I A; 4A3P A; 1L4D B; 3DBS A; 3UQA A; 2LVP A; 1WGR A; 3V6E B; 4OW0 A; 4HDQ A; 4XWW A; 4NJ7 A; 3MC8 A; 5G55 A; 5EE3 A; 1P1A A; 4F8C B; 3TBL D; 2NBU A; 2ICI A; 4AQ7 A; 2PEA A; 2WNM A; 4DXG A; 1BUI C; 2ZW1 A; 1YMH E; 4TSS A; 2QEJ C; 2R61 A; 4LK0 M; 3PGE A; 3WIM A; 2WDR B; 2WXR A; 3X0W A; 5JHA A; 2WXN A; 4BFR A; 2WS3 B; 2KN4 A; 3GS2 A; 5E6J A; 4DBG A; 4OVZ A; 3PRE A; 4DDG D; 2ZPY A; 3FIL B; 2CJO A; 3QK0 A; 5AZF A; 3VUX A; 2G45 B; 2KYW A; 1GJZ A; 2GMI C; 2J7Q B; 5C3J B; 1NBF C; 1TKG A; 2H88 B; 3UIO B; 3ZRF A; 1ZUD 2; 2BKR B; 3TEX A; 3DDC B; 3H7P B; 1QIL A; 3WAN A; 5CHV C; 4KKI A; 2LUE A; 3KLS X; 3OLM D; 3J9C A; 1CMX B; 1AYF A; 2ZVO A; 1HTQ A; 2EKI A; 4KIK B; 1WSP A; 4PS7 A; 3ZNZ B; 3ZJT A; 2KAJ A; 3D32 A; 4JL9 A; 5JZE B; 4GB9 A; 2KK8 A; 4GN1 A; 1HQR D; 2KMM A; 2IBI B; 4MJS B; 4BKG A; 2LI5 A; 4ZYN A; 2FCM A; 4LJO B; 4P1B C; 3S2A A; 1R4N I; 1YOV B; 1VCB A; 2UWQ A; 1TTN A; 4GGQ A; 2CU3 A; 4ZOH C; 3HVD A; 1V5O A; 2BQQ A; 3MJ5 A; 3PPA A; 1Q10 A; 4ZRJ A; 2WXF A; 4HK2 A; 3V6C B; 1SIJ A; 3DHG C; 1D4B A; 1PGX A; 5TSS A; 1I4Q A; 5BYR A; 3QC8 B; 1P9D U; 1LGR A; 1WXS A; 5HI1 A; 2CHZ A; 2MA9 B; 2AEH A; 4GIV A; 3MHZ A; 2I38 A; 1K8R B; 4LLG M; 3WAP A; 1YQ3 B; 3HM6 X; 4FJV B; 4GDK A; 4ZHP A; 3LDZ E; 2PVO D; 4YTP B; 2YLM A; 4MH0 E; 3TL5 A; 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4EE2 A; 1D5X C; 3DHI C; 3Q3O C; 5G5H A; 3JW0 X; 3T8M A; 3H9D A; 3I57 A; 2YEP F; 3QWZ B; 2HTH A; 4HCN B; 1XLN A; 1NYR A; 2KOX A; 1T5X D; 3C8Y A; 2OJR A; 3IFW B; 1MHH E; 4WWM A; 1WIA A; 1SXT A; 2LD9 A; 1GB4 A; 2N7D A; 1YN5 A; 4HPL B; 4YT0 B; 4PYZ A; 1N62 A; 2IND C; 4Q2J A; 2PW9 A; 2ZCB A; 1E5W A; 2KMC A; 2M0A A; 3TUO A; 4ANX A; 4LNN A; 5J2R A; 1J7A A; 1X1M A; 1GC6 A; 2JZ3 B; 2XEW A; 4ANW A; 1JRP A; 3ZXR A; 1ET9 A; 3NRZ A; 2IPK D; 2NVU I; 4HLE A; 5FKA C; 2QCZ A; 2KDI A; 1WGG A; 4EZL A; 2I1K A; 3K9P B; 4G3X B; 2JY6 A; 2M1M A; 2D07 B; 4YWG G; 2KWV B; 2PE6 B; 2PKO A; 3UGB B; 1OQQ A; 2E6X A; 4NJ6 A; 3A9J A; 3BVM A; 3AV8 A; 4GU2 A; 1S3S G; 5IO9 A; 4BOS C; 2BGF A; 4K1R B; 4ZRQ A; 3R7R A; 1DOI A; 1VDV A; 2V4I B; 4RM9 A; 1MVK A; 3V62 A; 1NVI D; 3ZDM C; 1JWA D; 5G2N A; 4JIO U; 2FE8 A; 1JAL A; 4IDI A; 1XCT L; 4JLC A; 2INP E; 1FPY A; 1KFY B; 4PS3 A; 3TCA A; 3ZJU A; 2JQR B; 4ITK A; 1HZ5 A; 2INC C; 2JXX A; 4IWO A; 2V0G A; 3H7S A; 4KZC A; 4EFO A; 1EO6 A; 3L17 A; 2X38 A; 2MHJ A; 3EHV A; 5D2M B; 4C4V B; 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