The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
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sequence length |
56
|
structure length |
56
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Chain Sequence |
MQYKLILCGKTLKGETTTEAVDAATAECVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Immune system
|
| source organism |
Streptococcus sp. 'group g'
|
| publication title |
High-resolution structure of a protein spin-label in a solvent-exposed beta-sheet and comparison with DEER spectroscopy.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
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| total genus |
8
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
|
| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-12-14 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4HJG E; 2J52 A; 1K51 A; 2EEL A; 2JXT A; 1MHH E; 2I38 A; 1XCT L; 2ON8 A; 4WH4 A; 1MHX A; 1IBX A; 1MI0 A; 4GLS C; 1EM7 A; 2KWD A; 5HI1 A; 1YNT E; 1IGC A; 1ZXH A; 2N7J A; 2J53 A; 5HHD G; 1P7F A; 1HZ5 A; 2RMM A; 4KGS A; 2K0P A; 4IOI E; 2LHD A; 2PTL A; 2ZW1 A; 1HEZ E; 2JWU A; 1C9F A; 3GB1 A; 1IBX B; 5BMG A; 1XF5 L; 1PGX A; 2N9K A; 1KH0 A; 2GB1 A; 3FIL A; 5HG2 A; 2IGG A; 5HFY A; 1GB1 A; 4MAC A; 3MP9 A; 2KDM A; 1GB4 A; 2JZP A; 2LHE A; 1QKZ A; 2JSV X; 4KGR A; 2QMT A; 1YMH E; 1FCL A; 2JU6 X; 3V3X A; 1FCC C; 4KGT A; 4D2K A; 5BMI A; 2IGD A; 1MVK A; 1D4B A; 1XCQ L; 1PGA A; 1IGD A; 1K52 A; 1P7E A; 2IGH A; 2LGI A; 2KAC A; 2ONQ A; 2PLP A; 5JXV A; 4OZA A; 4IKG A; 2KN4 A; 2OED A; 3UI3 A; 3FIL B; 2N9L A; 2RPV A; 2KQ4 X; 4OZC A; 4HKZ E; 2LUM A; 1HZ6 A; 5BMH A; 2I2Y A; 1F2R I; 1Q10 A; 2PW9 A; 1MPE A; 2QSD A; 2NMQ A; 1UWX A; 1K53 A; 1PGB A; 1F2R C; 1JML A; 2ZW0 A; 4OZB A; 2GI9 A; 1K50 A; 1FD6 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5I4D A; 2QIL A; 3PZ7 A; 4KKI A; 4W9L A; 5FR6 A; 5CHV C; 1UGJ A; 1FEH A; 3FAH A; 2J53 A; 1C78 A; 4TKN A; 4KGS A; 1GC7 A; 2LGX A; 2AQ1 B; 1JAL A; 2JZ3 B; 4RMA A; 3D32 A; 2K8H A; 1N62 A; 2RGF A; 4RGT A; 1JWS D; 2V4I B; 2WXP A; 3DBR I; 3A1Q B; 1WMH B; 2NTT A; 3QWZ B; 2W55 A; 2IGG A; 2PVO D; 2L00 B; 3RYT A; 4WWM A; 4LNO A; 2WYQ A; 5IOI A; 2CJO A; 4JQW C; 2L1A A; 3IFW B; 2HDE A; 1VLB A; 1CK1 A; 1Z5S B; 4TQ0 A; 3MHS D; 3C19 A; 4AP4 C; 3RI7 C; 2RR9 A; 3Q8E A; 2OJR A; 2N7E A; 1HQR D; 3W5U B; 2ZEQ A; 1FXT B; 3AU4 A; 1C4A A; 3GOE A; 1QOB A; 2C7N B; 1TY2 A; 2JY6 A; 4JE3 B; 2PEA A; 3ML8 A; 3QQ8 B; 3EFU A; 3DBH B; 3PT2 B; 4OZA A; 1VD2 A; 2LI5 A; 5E6N A; 4G11 A; 2CHX A; 2L76 A; 4OZC A; 4C7Y A; 2LXC A; 3VFK A; 2QJL A; 1WYG A; 2EMS A; 2FID A; 4S0R A; 2K3U A; 3N30 A; 3BZD B; 1ENF A; 3TCA A; 2FUH B; 4A90 A; 4C80 A; 4II2 B; 1HTO A; 2QDF A; 3WIM A; 1K53 A; 3TSS A; 3WAO A; 3QAR A; 4ZRI A; 4ZDV A; 4FHJ A; 1YIW A; 3VRA B; 3A9J A; 1I4Q A; 4W9H A; 2ON8 A; 2BYV E; 1IGC A; 4JWS C; 4CHK A; 1HZ5 A; 4US9 A; 1XLO A; 3C0R B; 2D3B A; 3B2F A; 4HDO A; 3AEG B; 2FCM A; 3NG0 A; 1E7U A; 2R2Q A; 2IY1 B; 1QQR A; 3ETR A; 3CSF A; 4PS3 A; 3UQA A; 2MH7 A; 2DZK A; 3RNB C; 3U7Z A; 4Q2J A; 4KKJ A; 2KT7 A; 3NVY A; 3AE4 B; 3IHP C; 3T9L A; 4JX1 C; 3FKY A; 3SDL C; 1ET9 A; 3AH7 A; 1WXM A; 4LJO B; 3V3X A; 3PO0 A; 3WAM A; 5L95 C; 1AW7 A; 3KW5 B; 1SE3 A; 3IAS 1; 1NYQ A; 4HRS A; 2J4X A; 3P63 A; 2KFJ A; 1SB3 C; 4FJY A; 3Q69 A; 2NR2 A; 4E74 A; 3GS2 A; 4B0M A; 1I42 A; 3NOB A; 5G5H A; 1WIA A; 1GNU A; 4F7Z A; 1WZ3 A; 4M0W A; 4HKQ A; 2YLM A; 1TGZ B; 4RGN A; 4X57 B; 4AOF A; 2AX5 A; 2VZK B; 2J0M A; 2JVC A; 2KQ7 A; 1F2R I; 4XDD A; 3AEE B; 1E9M A; 4FUL A; 1F0Z A; 2L3Z A; 2NMQ A; 2WX1 A; 4ARC A; 1OFF A; 3RMK C; 1GC6 A; 2NBW B; 1F52 A; 1SIF A; 4HPL B; 2KAN A; 1MI0 A; 2WXO A; 1SIJ A; 1YNT E; 4GDK B; 1V1O A; 1P7F A; 1P3Q U; 2LHD A; 4K1R B; 2D3C A; 3R7R A; 1T3Q A; 4B0E A; 2WU2 B; 5H8Y E; 1M94 A; 3DCG A; 4KIK B; 1IBX B; 3A4R A; 2R2O A; 2C5L C; 1CJE A; 2KMC A; 3BWU D; 3RNG C; 2MHJ A; 2IJ0 A; 3HM3 A; 4JGH B; 2MBB B; 4P1C C; 2QMT A; 3ZO5 B; 1VZ7 A; 2MBQ A; 4NZL B; 4RF0 A; 1ZE3 D; 3JVZ X; 3DQV A; 2D3A A; 2KTR A; 3HVZ A; 3B08 A; 1QF6 A; 1E8W A; 4TSS A; 1UUP A; 1X1M A; 2FCN A; 3GZN I; 1ZXI A; 3SFE B; 2VH1 A; 3MFG A; 2ONQ A; 3AE3 B; 2C60 A; 3DDC B; 1C3T A; 2KN4 A; 5D7G A; 5LXH A; 2W9N A; 2E6X A; 3FIL B; 1HXY D; 3PTF C; 2KVR A; 3PSE B; 5C3J B; 4KIK A; 4K3B A; 4REZ A; 4HCP B; 4DK5 A; 2MP2 A; 3A33 B; 4FA6 A; 1PUT A; 4NQL B; 4FLH A; 3U8Z A; 2N9P C; 2LWP A; 3RN9 C; 4BKG A; 2KLC A; 2BS3 B; 3UGB B; 1VZ6 A; 1XT9 B; 3V6E B; 4DDI D; 2LJ5 A; 1DOY A; 1K50 A; 2NBU A; 2XK5 B; 4HJG E; 4GN1 A; 2INP E; 2B3A A; 1XCT L; 2KNB A; 2WXN A; 3Q8A A; 1MHX A; 1UWM A; 4NJ7 A; 4GLS C; 4EEW A; 1NEK B; 1LFD A; 4AQ7 A; 2Q5W D; 5D3I B; 4MGZ E; 1VJK A; 3RNE C; 2YVC A; 2C7H A; 3P4P B; 2GBK A; 5GMV A; 2E3T A; 1A5R A; 4IC7 B; 2JYE A; 2V0G A; 1ZDX A; 3H1U A; 3PRZ A; 2L8J A; 5IO9 A; 2GB1 A; 1MG4 A; 2RPQ A; 1RM6 C; 3FIL A; 3CIR B; 2LMC A; 3KWL A; 4DWF A; 3TJP A; 2PIA A; 5GXG B; 4YSX B; 5DPR A; 2IO3 B; 4OHJ A; 5EE1 A; 4WAA A; 3NRZ A; 4MEL A; 4BBN C; 1G6J A; 4BZA A; 2FBW B; 1J19 A; 2MLB A; 1PGA A; 1ROE A; 1KTK A; 1EF1 A; 3ECI A; 3E56 A; 2K25 A; 1P9D U; 4WJN A; 4K7W A; 3OAW A; 3V6C B; 2LXA A; 2O2V B; 2I1J A; 4MDK E; 1Q1O A; 4K81 A; 3MC0 B; 4BKS A; 1V9J A; 5AZF A; 4ANU A; 2KTF A; 3WAP A; 2Z8L A; 3IT4 B; 4HKZ E; 1FNU A; 1I4H A; 2WXG A; 2HJ8 A; 1NEN B; 2AL6 A; 5BMH A; 3U30 A; 1FFV A; 2K9X A; 4JIO U; 4PS7 A; 5AZH A; 5BO4 B; 1TYG B; 3P4Q B; 2JF5 A; 4PT5 A; 2DBY A; 2LZ6 A; 1JML A; 1JWM D; 3OLM D; 4OZB A; 3OJ3 A; 3TBL D; 4ZYS A; 2BQQ A; 3ZNH B; 1WF9 A; 5J17 A; 2BTE A; 1WRI A; 1YJ1 A; 2JXT A; 2UU7 A; 4KX6 B; 1EM7 A; 3AXC A; 3N1X C; 2X8X X; 1BUI C; 3V61 A; 2KWU B; 2KWV B; 3ABV B; 4PK1 A; 1L7Y A; 3Q3J A; 3VUY A; 4AJW A; 3BK2 A; 3NY5 A; 1LQB A; 3Q2A C; 3URY A; 1C9F A; 2MX2 A; 1XO3 A; 3RCZ A; 4M01 A; 3B2G A; 3ALB A; 2KFK A; 1B1Z A; 2BYT A; 5IKC M; 1XEE A; 3CMM B; 1J7B A; 3IBE A; 4BKS D; 4MSQ B; 3APC A; 4HRO A; 3MJ5 A; 2KX3 A; 1I7H A; 5AUI A; 4ZYN A; 3I63 C; 3R66 C; 1RFK A; 4RF1 A; 2BF8 B; 3W2D A; 2K1F A; 4RGO S; 4MGI E; 2XBB C; 4PYU A; 1H8C A; 2BS2 B; 2IO1 B; 1Y8R C; 4D2K A; 2CHZ A; 3LB8 C; 5G55 A; 2MBO A; 1I4P A; 3BY4 B; 3U2S C; 3TL5 A; 2WP9 B; 4UDU C; 2KMM A; 4ANX A; 3IAM 1; 1CMX B; 2JPH A; 2IZV B; 4RNA A; 3VH3 B; 2MJE A; 1E5W A; 3B9J A; 3ZIM A; 2D2Q A; 3OJ4 B; 2DYM A; 3APD A; 3VQI A; 3U52 E; 3H6N A; 2MJD A; 1R4M I; 1C76 A; 3ZTC A; 3KQ4 A; 4HDQ A; 1E7V A; 5E6O A; 1STE A; 2O6V D; 2WXF A; 1UBQ A; 3HVD A; 1D5Z C; 1B9R A; 2KQ4 X; 3P4S B; 3O65 B; 2FCS A; 1QOG A; 3R7Q A; 4LK0 M; 2PKO A; 4EZK A; 1F1H A; 4O1N A; 2H89 B; 2WQY B; 2DAF A; 4L2Y A; 2NPT B; 3DWM A; 3QK0 A; 2ZW0 A; 1A70 A; 3AV8 A; 4MH0 E; 2RDB C; 1N60 A; 1T0R C; 1E7P B; 4II3 B; 2ACZ B; 2EEL A; 5LLI A; 2KKC A; 3BIN A; 2C9W B; 3RT3 B; 3TEY A; 3L08 A; 1NVI D; 4A55 A; 4GOC A; 1RWS A; 2PJH A; 4YSY B; 4HVB A; 2MW5 A; 3Q3M C; 4EE2 A; 3ZUN A; 3BYY B; 1Z2M A; 3KLS X; 1ZKH A; 2G4S A; 4IW0 A; 3MHZ A; 4CYE A; 4C4V A; 4A8X C; 1RYJ A; 1IYF A; 1WGY A; 4TUU A; 1XF5 L; 5D2M B; 3A4S C; 1XLQ A; 4USA A; 1KH0 A; 1NDD A; 4AUQ C; 1L5P A; 1GOZ A; 2HE7 A; 1GB1 A; 2AWT A; 1TTN A; 3RD2 A; 1V80 A; 3JYU A; 4MJS A; 4YL8 A; 3ZXV A; 1RAX A; 1R4N I; 4MM3 B; 4HJK A; 1FXA A; 2EKI A; 2L05 A; 3T3O A; 3IVF A; 3H7P A; 3WAN A; 3VR8 B; 2R61 A; 1GJZ A; 2OJW A; 5BMI A; 4WJP A; 3GZN B; 1D4B A; 2LVQ A; 5BYS A; 3NVW A; 4W9E A; 4H2A A; 2HJ1 A; 2BYF A; 1ZPS A; 2Y3A A; 1V5O A; 4E71 A; 1TZO A; 2KLG A; 4NJC A; 4QAY A; 2W82 A; 2IGH A; 3L0W B; 4XE0 A; 1PQS A; 2KDB A; 1WI0 A; 3ZJV A; 3W5V B; 2JWZ A; 4IKG A; 3X0W A; 3DBS A; 3R2I A; 2G4D B; 4B9K A; 3DBL I; 1IP9 A; 3AM9 A; 4GSW A; 1WX8 A; 3HIZ A; 3NUH B; 3PLV A; 2KO3 A; 1OGW A; 2AQ2 B; 2DAJ A; 2JZZ A; 5IA7 A; 1L4D B; 2JRH A; 2N4F A; 3VHT C; 1WM2 A; 3VUW A; 2WS3 B; 4P7I A; 3SR6 A; 3AB5 A; 4MH8 A; 5BYQ A; 4JWU C; 2K6D B; 3I9V 1; 3H8H A; 1JWB D; 1AAR A; 2KAJ A; 3Q6B A; 1FD6 A; 5C2T B; 4EZL A; 4NQK E; 4RFB A; 2GMI C; 4YTM B; 2DEN B; 3ML9 A; 2K5P A; 1TS3 A; 1FXI A; 1YX6 B; 1TS4 A; 2N7J A; 1YN3 A; 5HHD G; 4DHJ B; 3AE6 B; 3A1Q A; 1FMA D; 1WMH A; 5E6J A; 4EOY A; 4KV2 A; 4G3X B; 2KJR A; 2NCN A; 2TSS A; 2KC1 A; 2LD9 A; 3UIN B; 1E8Y A; 5C23 A; 1F77 A; 2WHI A; 1V1P B; 2MA9 B; 4B6W A; 2W54 A; 2GBR A; 1YN5 A; 4ICV A; 4MAC A; 5KHQ A; 4GB9 A; 5J18 A; 2K39 A; 2JSV X; 4NJ6 A; 1YMH E; 1FO4 A; 1WXQ A; 1SBB B; 1FCC C; 2LRW A; 3QC8 B; 1V97 A; 4KGT A; 2IGD A; 3ZNZ B; 1OQR A; 1XD3 B; 3NJT A; 1IGD A; 2K6Q A; 1MFW A; 2WXH A; 2WDR B; 2MCN B; 4RH6 A; 1D6E C; 2LJI A; 1C4C A; 4IM0 A; 3T8M A; 5FKA C; 2YEP F; 2D11 A; 2LEK A; 1L6U A; 3VAW A; 5AZG A; 3CST A; 4EKU A; 2JQR B; 2K8B A; 4A3P A; 1E8Z A; 1N5W A; 4TMA B; 4N58 A; 2J0J A; 1EU3 A; 3MTN B; 3B1L X; 2XEW A; 1PFD A; 2IDY A; 3VRB B; 1DOI A; 1TBE A; 3OWE B; 4C56 C; 1T0Q C; 2GI9 A; 4S17 A; 2GLS A; 1TS2 A; 2CS4 A; 4NAW B; 2KMA A; 4WH4 A; 5G5G A; 3ZYY X; 3NVZ A; 4N6E B; 5CTR C; 2KZR A; 3B0A A; 2WXR A; 2V9H A; 4FN2 A; 1OEY J; 1ZXH A; 4F8C B; 3K9O B; 1WXV A; 2GBJ A; 3RUI B; 1P98 A; 1D5X C; 3GB1 A; 3QX1 A; 3EGR A; 1PGX A; 4WQM A; 3HHM A; 3ZLZ A; 3AE8 B; 3ZDM C; 5IAA C; 4WAF A; 1ZGU B; 1QT9 A; 4FBJ B; 5G2N A; 3AI5 A; 1U4A A; 3Q14 C; 4F1S A; 4IWQ A; 3KVF B; 5KHO A; 4ZHP A; 2MBE A; 5DPW A; 2ZPN A; 1WGR A; 3KYC D; 1WYW B; 1XCQ L; 3RZF A; 2EKE C; 1N5X A; 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1N6Z A; 3NZS A; 2JT4 B; 3RFZ B; 2DX5 B; 1L0V B; 4LDT D; 2MJ3 A; 1DYQ A; 4HCN B; 1OQY A; 4TQ1 A; 1E10 A; 1WFY A; 5CHW A; 1KLV A; 3DPD A; 5JXV A; 3AE5 B; 4RM9 A; 2RPV A; 3BYT B; 2REX A; 1WJ6 A; 3PGE A; 2D5G A; 4GDL B; 4LCD E; 1ISN A; 1EWC A; 2KDI A; 2XK5 A; 3HUI A; 3EC8 A; 5MPO A; 1P0R A; 4URK A; 3J9C A; 3I5J C; 1UD7 A; 2N9X A; 2I1K A; 4MT5 A; 2DZJ A; 5C1Z A; 4NY0 A; 1WR6 E; 1V2Y A; 2N9E B; 3EUB 2; 3AMZ A; 2V3P A; 1JW9 D; 4GIV A; 2J7Q B; 2KD0 A; 1WX9 A; 1QOA A; 1TKY A; 2RMM A; 3AU5 A; 4I6L B; 3VDZ A; 1C4P A; 1ZDV A; 3M62 B; 1SJE D; 3DHH C; 1HEZ E; 3DVN V; 2WGS A; 4G0N B; 2L32 A; 3L10 B; 1GAQ B; 2BT6 A; 1JRO A; 3APF A; 1TZ1 A; 1E0Z A; 3ZRF A; 1WXS A; 2INN E; 3P2B A; 3R3M A; 2DYB A; 5DPS A; 2ASQ A; 2AYO B; 3U4E G; 3N9Y C; 4ZRJ A; 1FPY A; 1WX7 A; 1ZW7 A; 2RDG A; 2Z0E B; 2IO2 B; 4BVU C; 2AEH A; 4GU2 A; 2O2V A; 3Q3N C; 2KYW A; 3SD5 A; 1S3S G; 4A20 A; 3NHE B; 2BS4 B; 2PE9 A; 2ZVO A; 4WUR A; 3N32 A; 1PDX A; 4PS8 A; 3JSV B; 1YQ4 B; 5DPT A; 3RUL A; 4KDI C; 3BVM A; 3ZVV A; 3HRD D; 1EU4 A; 3GE8 C; 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