The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
|
sequence length |
54
|
structure length |
52
|
Chain Sequence |
DTYKLILNGGLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDGTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Protein-like Tertiary Folding Behavior from Heterogeneous Backbones.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Streptococcal Protein GB1 Backbone Modified Variant: Aib10,
|
| molecule tags |
De novo protein
|
| total genus |
13
|
| structure length |
52
|
| sequence length |
54
|
| chains with identical sequence |
B
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2013-04-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01378 | IgG_binding_B | B domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2JXT A; 1MHX A; 1KH0 A; 2KWD A; 1MVK A; 2NMQ A; 4WH4 A; 2PTL A; 1MPE A; 2JWU A; 1K53 A; 4D2K A; 5HHD G; 2RMM A; 2KDM A; 1EM7 A; 3MP9 A; 5JXV A; 5BMG A; 1XCQ L; 1MHH E; 1GB4 A; 1C9F A; 4KGR A; 1YNT E; 1ZXH A; 2N9K A; 5HFY A; 2ON8 A; 2QSD A; 2QMT A; 1PGB A; 3GB1 A; 5HI1 A; 1IGD A; 4KGS A; 1MI0 A; 2EEL A; 4KGT A; 1IGC A; 2KQ4 X; 2ZW1 A; 4IKG A; 2RPV A; 1P7E A; 2KN4 A; 4OZB A; 2GB1 A; 2LGI A; 2J52 A; 2JSV X; 2N7J A; 1IBX B; 1IBX A; 1K50 A; 1XF5 L; 2IGG A; 1XCT L; 1FCC C; 2I38 A; 2ONQ A; 1K51 A; 1FCL A; 2IGD A; 1UWX A; 2LHE A; 1F2R C; 2ZW0 A; 1PGA A; 4OZC A; 5HG2 A; 1P7F A; 4HKZ E; 1FD6 A; 1K52 A; 1HZ5 A; 2K0P A; 1HZ6 A; 1QKZ A; 2J53 A; 2JU6 X; 2IGH A; 3UI3 A; 4HJG E; 2PW9 A; 5BMH A; 1HEZ E; 1YMH E; 2JZP A; 3FIL B; 3FIL A; 4MAC A; 1PGX A; 4OZA A; 2KAC A; 5BMI A; 2N9L A; 2LUM A; 2I2Y A; 1D4B A; 1JML A; 2OED A; 3V3X A; 2LHD A; 4GLS C; 1Q10 A; 1F2R I; 1GB1 A; 2PLP A; 2GI9 A; 4IOI E; #chains in the Genus database with same CATH topology 1KH0 A; 3DWG C; 2V9H A; 4RFB A; 1WE7 A; 4PS3 A; 5DPR A; 4JWU C; 4M02 A; 4ZHP A; 2IBI B; 4WH4 A; 4DQO C; 2PTL A; 3DBH I; 1L0X B; 3N30 A; 4KKI A; 2WS3 B; 4FJV B; 4ARC A; 1JAL A; 4LLG M; 1WXS A; 3KVF B; 3AUL A; 1JRP A; 4ANV A; 2KT7 A; 3M3J A; 4DDI D; 4RF1 A; 1YNT E; 1TZO A; 1ISN A; 4FN2 A; 4PYU A; 2YLM A; 2BBC A; 2OHF A; 3WAL A; 3JYU A; 1FMA D; 1YQ4 B; 1C77 A; 2L00 B; 3KUD B; 2N1W A; 5IO9 A; 1CZP A; 2XK5 A; 1TKG A; 2IDY A; 4A9A A; 1VR9 A; 1L7Y A; 3NY5 A; 4OZB A; 5G5G A; 4TQ0 A; 3VFK A; 2KD0 A; 1XF5 L; 2LXC A; 4MEL A; 2WX1 A; 2LFI A; 2MBB B; 2MP2 A; 3DHG C; 3Q8B A; 2ZZP B; 2KTR B; 1EWC A; 5BYS A; 2N7D A; 1V80 A; 3LYY A; 4S17 A; 3GZN B; 2MCN B; 3VTU A; 5KHO A; 1EU4 A; 4GDK B; 1ZUD 2; 2ZNV B; 4RNA A; 4A3P A; 3SEB A; 3ZQ4 A; 1E5W A; 1OGW A; 1PYW D; 2N7E A; 2WXG A; 2EMS A; 4IUM B; 3QAR A; 3N1Y C; 2MEK A; 2RSU A; 3FAH A; 4RCO A; 2LHD A; 1E8Z A; 3AN1 A; 1GB1 A; 2RD0 A; 3GS2 A; 3V6C B; 3Q14 C; 2W3S A; 2XEW A; 2JXT A; 1MHX A; 4BZA A; 4KKJ A; 4FHK A; 1V49 A; 4R3D A; 4B0M A; 1WI0 A; 2JX5 A; 1ET9 A; 5E6P A; 4CQN A; 3VRB B; 2KC2 A; 4B6W A; 1E90 A; 3QHT A; 4RGT A; 1WGG A; 2FCM A; 2AL6 A; 2BQQ A; 4FHJ A; 3CSF A; 1ZXH A; 2RDH A; 4G50 A; 3ZTD A; 3DQV A; 1UNS A; 2QMT A; 4MSM B; 1L4D B; 2V4L A; 4GGQ A; 5LLI A; 2REX A; 4W9J A; 3Q3N C; 5D2M B; 2FCS A; 4HVB A; 3N1Z C; 2KHW B; 3DBL I; 3BVG A; 3DBS A; 3ABV B; 2JY6 A; 2PJH A; 5I4D A; 2IO2 B; 1EU3 A; 4M0W B; 3ONS A; 3UQA A; 1IBX A; 1KFY B; 3M95 A; 1VDV A; 3QK0 A; 3NOB A; 3DBR I; 2FID A; 5LXH A; 2O6V D; 4W9H A; 1N5W A; 2FAZ A; 2KMA A; 2WDV B; 1OEY J; 1K51 A; 3NZU A; 2DX5 B; 4GOC A; 1E9M A; 1EF1 A; 2KWU B; 3PO0 A; 1WM3 A; 3PLV A; 3VUX A; 1WJ4 A; 2ZVO A; 1IPG A; 4LNF A; 2Y5P A; 2L32 A; 3B08 A; 3MHZ A; 4E3C A; 3AEA B; 2WWZ A; 2D3G A; 4EZJ A; 1SBB B; 3ZJU A; 3DVG X; 3TMP B; 1XT9 B; 3R3M A; 2KFK B; 3MJW A; 2AYO B; 1XLQ A; 5DPW A; 3GE8 C; 2NR2 A; 1VZ7 A; 4JE3 B; 2ZVN A; 2JZ3 B; 2HJ1 A; 1F9J A; 4A55 A; 3PPA A; 4IM0 A; 1GC6 A; 1IP9 A; 2WXH A; 2MJE A; 3KWL A; 1D6E C; 4ZYS A; 1FRR A; 1Z2M A; 1WMH A; 3B9J A; 2ON8 A; 2FNJ B; 2Z59 B; 1L2N A; 3Q8E A; 2XK5 B; 4MJS A; 3GB1 A; 3TUO A; 1WR1 A; 4K7W A; 2KN5 A; 3WCQ A; 2WXF A; 3NVZ A; 4KGT A; 2HJ8 A; 1ZGU B; 1P7E A; 3A9K A; 5CHV C; 2PEA A; 2KVZ A; 3P4P B; 1NYR A; 3I3T B; 1ESF A; 4JWS C; 3PZ8 A; 4P16 A; 4I6L B; 4K3C A; 3PHX B; 2HTH A; 1TZ1 A; 4JQW C; 1Q5W B; 3X0W A; 1V97 A; 1E8W A; 1NI3 A; 2D2Q A; 5L83 A; 1KJT A; 5HG2 A; 2E3T A; 4W9G A; 4TUU A; 4IG7 B; 1N63 A; 4LTU A; 2NS5 A; 1XD3 B; 3KH0 A; 1H8C A; 1WYG A; 3FIL A; 5MPO A; 2KAC A; 3ZJT A; 2KQS A; 4J6I A; 5GXG B; 2UU7 A; 2M8S A; 3VQI A; 4F8C B; 5IOI A; 4W9C A; 4LCD E; 1MVK A; 4PS8 A; 4RH6 A; 4RM8 A; 2NMQ A; 4NJC A; 4RGN A; 2BGF A; 3H8H A; 4HDO A; 1YJ1 A; 4C7Y A; 5J17 A; 3NVV A; 3R2T A; 2FCQ A; 4HPM B; 4L23 A; 4GXB A; 1I7H A; 3S2A A; 3CMM B; 3PT2 B; 3Q6B A; 1TGZ B; 3WAN A; 3ZNZ B; 2W55 A; 1C76 A; 3VXW A; 2JRI B; 1FXA A; 1M4V A; 2DZK A; 2D3C A; 5LNK 1; 4ARI A; 3SFE B; 2VH2 A; 3T8M A; 4RGO S; 3RNA C; 3RI7 C; 4XWT A; 1E7V A; 1HA5 A; 4AWJ A; 4P7I A; 3ZNI D; 2M1M A; 3W1S C; 2L83 A; 1L6V A; 3AH7 A; 1IBX B; 3AE6 B; 4WWN A; 3I9V 1; 2BYV E; 3KUZ A; 3MTN B; 1A5R A; 1HTQ A; 2C7N B; 1OTR B; 4WAF A; 4WWP A; 3R8B A; 3H6N A; 4BBN C; 4LNI A; 4A20 A; 2N4F A; 5CHW A; 4DHJ D; 4OZC A; 2IY1 B; 4HDQ A; 1N6Z A; 1VD2 A; 3UIP B; 2ZNV C; 1R4M I; 2BB5 A; 4LJP B; 3AI5 A; 1J7A A; 3BIN A; 3TJP A; 4DDG D; 1HEZ E; 4ZRI A; 3IHP C; 3MHS D; 5C2T B; 4HPP A; 3WAM A; 3ZLZ A; 4NY0 A; 5LXI B; 4DK5 A; 1K8R B; 2KTR A; 2KAN A; 2CR5 A; 1WR6 E; 2PLP A; 3P42 A; 4GDK A; 1MG8 A; 4P1C C; 2GBK A; 3DHI C; 1QOA A; 4ACF A; 4XX5 A; 3EC8 A; 2AL3 A; 1WXM A; 1SIF A; 2M4N A; 1GOZ A; 2FUH B; 4L2Y A; 1I4R A; 4USA A; 1ZW7 A; 1B1Z A; 4BKT A; 3DDC B; 4AJY B; 3MC8 A; 2M19 A; 3A4S C; 1XCQ L; 3D32 A; 2DYB A; 2K8B A; 2L7R A; 2IND C; 5TR5 A; 3HK0 A; 5CX3 A; 3EUB 2; 4GDL B; 3ZW3 A; 3AM9 A; 1WMH B; 3BYY B; 4BFR A; 2QSD A; 1C4A A; 5EE9 A; 3AMZ A; 2K39 A; 1UBQ A; 2AQ2 B; 2K22 A; 2JYT A; 3AEC B; 3APF A; 4KGS A; 2EEL A; 2INP E; 1IGC A; 2RR9 A; 2WLB A; 2WP9 B; 2J52 A; 3A9J A; 4HRS A; 2ZPY A; 2IO0 B; 1DOY A; 1XCT L; 1P0R A; 4YSY B; 3L17 A; 4OVZ A; 4RM9 A; 3AE4 B; 4C80 A; 1FNV A; 2L0T A; 4FBJ B; 4C56 C; 2CJO A; 4ITK A; 1XO3 A; 1DGJ A; 3ZYY X; 3QQ8 B; 1VZ6 A; 3BWU D; 2NTS A; 2J42 A; 3Q3O C; 3A1Q B; 3BK1 A; 4XWW A; 1SB3 C; 2KJH B; 4K81 A; 1OQY A; 4M0W A; 4WWO A; 2KQ7 A; 2ZCC A; 1S1Q B; 4FA6 A; 4W9D A; 4NJ7 A; 4G3X B; 2WX0 A; 2NBV B; 1JWM D; 2WXM A; 4NJ6 A; 1R4N I; 3HM6 X; 2GLS A; 4WJO A; 3FIL B; 3AE9 B; 3R66 C; 1J19 A; 1NEK B; 2L8J A; 2LUM A; 1SE2 A; 1RM6 C; 2KWV B; 2JQR B; 1SIJ A; 3M62 B; 1C79 A; 3V61 A; 3FC4 A; 1D5X C; 1UGJ A; 1QOG A; 5D3I B; 2WXR A; 2G1E A; 4EOY A; 3BY4 B; 4G11 A; 3LDZ E; 3RFZ B; 4UDU C; 1NYQ A; 1WYW B; 5AZG A; 3U8Z A; 3IXS A; 2HDE A; 1EM7 A; 2KFK A; 2DZM A; 1F0Z A; 2YVC A; 3W5V B; 4O1N A; 3Q3F A; 4WWM A; 1MHH E; 3W9C B; 3UQB A; 1ZDV A; 1TS4 A; 5TSS A; 1XQQ A; 2IJ0 A; 3K9O B; 2ACZ B; 4CHK A; 3O13 A; 3AED B; 2L76 A; 2B3A A; 2PPH A; 4TV3 A; 3N3K B; 2KQ4 X; 3BVM A; 2LVQ A; 3E56 A; 4OHJ A; 2RPV A; 1NBF C; 2CJN A; 3GOE A; 2DWQ A; 2AQ3 B; 4N59 A; 1ACC A; 1WXV A; 3HVZ A; 3LJ3 A; 1LM8 B; 1RRB A; 1NI2 A; 2CHW A; 2SAK A; 4K1R B; 2MHJ A; 3K9P B; 4KSK C; 5G5H A; 1FO4 A; 4W9K A; 3U30 A; 1SSN A; 4FXC A; 2IGD A; 4PS7 A; 1WGR A; 2KOX A; 2D3B A; 4RGM A; 5AZH A; 3V6E B; 3FKY A; 3JW0 X; 4TSS A; 2K0P A; 1YIW A; 4IC7 B; 1WGK A; 3Q3J A; 3QIJ A; 2KDB A; 2JWZ A; 2C60 A; 2PE6 B; 1KOT A; 2D10 A; 2VZK D; 4URK A; 1YMH E; 2JZP A; 2WXL A; 3AU5 A; 4A8X C; 1YJI A; 4WAA A; 4LDT B; 4JLC A; 1B9R A; 1FFU A; 3B2G A; 4IW0 A; 3MC0 B; 2R61 A; 3IT4 B; 2RDB C; 1HXY D; 4AQ7 A; 1XLN A; 3RCZ A; 1J0G A; 5J2R A; 1XXG A; 3Q8A A; 3AB5 A; 2J4X A; 1SJH D; 1SF0 A; 2XNA C; 5C1Z A; 1RLF A; 4AJW A; 2QEJ C; 2LVO A; 2MBE A; 4ANW A; 5JZE B; 3R2I A; 1UH6 A; 1NVI D; 5D94 A; 2RDG A; 1MPE A; 4DWF A; 5IKC M; 1Q1O A; 2WXO A; 4KV2 A; 4XDC A; 2V3S A; 1TY2 A; 2QIL A; 1GJZ A; 1HTO A; 1CQV A; 3L16 A; 2CHX A; 3HVD A; 2BWF A; 3NJT A; 1C9F A; 2GBN A; 4CYE A; 2N9K A; 2DHZ A; 2LGY A; 4HCP B; 2L1A A; 3ZRF A; 3E9S A; 3IT6 B; 4LJO B; 4WJQ A; 3VTV A; 3L13 A; 3AEB B; 1OFF A; 4DXA B; 4US8 A; 3MFG A; 3A9J B; 1V1O A; 2CHZ A; 2N7J A; 1I4Q A; 2D11 A; 2UYZ B; 1WSP A; 2ONQ A; 2DLB A; 3VDZ A; 2KTF A; 2Q5W D; 3VTW A; 2LHE A; 4BKS A; 3HHM A; 4EUT A; 3P63 A; 1WZ3 A; 2C5L C; 4HKZ E; 5FR6 A; 5IAA C; 2LGS A; 3RUL A; 1TT5 B; 2PE9 A; 3KW5 B; 4WQM A; 2IGH A; 3GZN I; 3TEW A; 2V1Y A; 1SEB D; 1ZKH A; 2M0A A; 2EKE C; 2CKH B; 1D3Z A; 2QCZ A; 3VRA B; 4B95 A; 3ZNG C; 3NS1 A; 3B0A A; 1JML A; 1YQ3 B; 2KNB A; 4MEM A; 4PK1 A; 2MLB A; 4RMA A; 3SR6 A; 1N5X A; 1RFK A; 1I4H A; 2X38 A; 1TS3 A; 2V4I B; 3NHE B; 3ZTC A; 4WUR A; 2GRI A; 4ASW C; 5AUI A; 4XE0 A; 3PGE A; 4HWI B; 1VJK A; 2KO3 A; 1TTN A; 1E7U A; 5BMG A; 1LFD A; 1OEY A; 3UIO B; 1GPX A; 4I6P A; 4KGR A; 3RZW C; 4BOS C; 1WXA A; 1WFY A; 2BS4 B; 1UBI A; 3IBE A; 3TCA A; 3VH4 B; 4Q2J A; 1S3S G; 3V62 A; 2WYQ A; 1T5X D; 3SU8 X; 1BUI C; 3I57 A; 2C7H A; 2EKI A; 2MJD A; 1EUV B; 4ZRQ A; 1SJE D; 4YWG G; 3PS6 A; 1K50 A; 1DOI A; 2K5P A; 1EWY C; 4GDL A; 3RUI B; 1D5M C; 3TIX A; 2NPT A; 4YL8 A; 1PFD A; 3H7P A; 2GBJ A; 1RFA A; 3UGB B; 1E8X A; 2C9W B; 1M94 A; 2GBR A; 2LMC A; 5CHF A; 1F2R C; 3NZS A; 4GSW A; 2PKO A; 1FEH A; 4OVU A; 2JVC A; 4LNO A; 1YN4 A; 1T0R C; 2L52 A; 2LRW A; 2JT4 B; 3P2B A; 4IDI A; 2WXJ A; 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4KIK A; 1WX9 A; 1GUA B; 3AU4 A; 1V86 A; 5CTR C; 2JZZ A; 1QOB A; 2ZJD A; 3ZGZ A; 5C3J B; 4ZYN A; 5FKA C; 5H92 C; 3Q69 A; 4E74 A; 1AW7 A; 1ENF A; 2IO3 B; 2Y3A A; 4YTN B; 5D3D A; 4WJN A; 2LI5 A; 3EFC A; 2LRU A; 1YQB A; 3RYT A; 2JSV X; 3T9L A; 2G9H D; 2AEH A; 2IGG A; 2WXI A; 2NPT B; 1JCK B; 4BAX A; 4FUL A; 4B0E A; 3H7P B; 4CO7 A; 3RD2 A; 4EEW A; 3ENE A; 1BML C; 1LQB A; 2O2V B; 2BPS A; 1GC7 A; 2K8C A; 2MX2 A; 2INC C; 2Y5C A; 3UI3 A; 4HRO A; 4F1S A; 4HXD A; 2PW9 A; 4IWQ A; 3NG0 A; 2JUO A; 2I1J A; 2TSS A; 1I35 A; 1YOV B; 3U52 E; 4KSL C; 1A70 A; 1I4P A; 3AEF B; 4KZ0 A; 2MW5 A; 1QLB B; 5BMI A; 1N62 A; 3ML8 A; 1ET6 A; 1XEE A; 2DZJ A; 2OED A; 2XN9 C; 2BS2 B; 4DXF A; 5GMV A; 3VR9 B; 2L05 A; 3AE5 B; 3DBH B; 1E7P B; 2XBB C; 3VHT C; 1L4Z B; 4K7U A; 3U2S C; 1AWD A; 3WIM A; 1RYJ A; 2DAJ A; 4LDT D; 1QT9 A; 2LGD A; 4DHJ B; 4HEA 1; 1I42 A; 1E0Z A; 3PVL A; 5EDS A; 4W9I A; 1E6E B; 3EFU A; 3EEC A; 4WIP A; 1P3Q U; 1BXT A; 2LXA A; 3RPF C; 3ZDM C; 3NZ3 A; 5D6J B; 1YN3 A; 1TIF A; 2QHO A; 4IWO A; 3U4E G; 5FR3 A; 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