The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
|
sequence length |
54
|
structure length |
52
|
Chain Sequence |
DTYKLILNGGLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDGTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Protein-like Tertiary Folding Behavior from Heterogeneous Backbones.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Streptococcal Protein GB1 Backbone Modified Variant: Aib10,
|
| molecule tags |
De novo protein
|
| total genus |
13
|
| structure length |
52
|
| sequence length |
54
|
| chains with identical sequence |
B
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2013-04-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01378 | IgG_binding_B | B domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4MAC A; 2IGH A; 4KGR A; 1P7E A; 1PGB A; 1IGC A; 2I38 A; 1PGX A; 2ZW1 A; 2EEL A; 1K52 A; 4KGS A; 2QSD A; 3GB1 A; 4OZA A; 3FIL A; 5HFY A; 1XF5 L; 4HKZ E; 1K53 A; 4IOI E; 2LUM A; 2K0P A; 2RMM A; 2KQ4 X; 4WH4 A; 2ZW0 A; 1MVK A; 2PLP A; 1KH0 A; 1HEZ E; 2ONQ A; 1Q10 A; 2JZP A; 2OED A; 1MPE A; 2J52 A; 2IGG A; 1HZ6 A; 2JXT A; 1IBX A; 2N9K A; 1EM7 A; 2PW9 A; 3V3X A; 2KDM A; 1GB4 A; 1FD6 A; 5HG2 A; 2LGI A; 2I2Y A; 1XCT L; 1GB1 A; 1PGA A; 1MI0 A; 1YMH E; 1MHH E; 2IGD A; 2N9L A; 4HJG E; 4KGT A; 3UI3 A; 1P7F A; 1D4B A; 2JWU A; 1K51 A; 2KWD A; 5BMI A; 1MHX A; 2GI9 A; 2LHE A; 5HI1 A; 3FIL B; 5BMG A; 3MP9 A; 1FCL A; 1XCQ L; 4OZB A; 2JSV X; 2PTL A; 1F2R I; 2ON8 A; 1YNT E; 1IGD A; 2N7J A; 1F2R C; 5JXV A; 1K50 A; 2GB1 A; 5BMH A; 1HZ5 A; 1IBX B; 2KAC A; 2JU6 X; 2KN4 A; 1ZXH A; 4OZC A; 1FCC C; 2QMT A; 4IKG A; 4GLS C; 1JML A; 2LHD A; 2RPV A; 2NMQ A; 1C9F A; 2J53 A; 1QKZ A; 4D2K A; 1UWX A; 5HHD G; #chains in the Genus database with same CATH topology 5D2M B; 2DYM A; 1L6U A; 4IDI A; 5LXH A; 2K39 A; 2I1K A; 4E74 A; 2KVR A; 1OEY A; 4RGN A; 4RGM A; 4ANU A; 4LDT D; 4B95 A; 3Q2A C; 2V0G A; 4WJQ A; 2M0A A; 5IKC M; 2ZPN A; 3ALB A; 4W9C A; 1WM2 A; 5EDS A; 4J6I A; 5CTR C; 1N5W A; 2DYO A; 3AE8 B; 2ZEQ A; 4NQK E; 2MBH A; 1WR1 A; 1Z5S B; 2BKF A; 2V3N A; 3B08 A; 4ZYS A; 1FNV A; 1AYF A; 3PS6 A; 2QCZ A; 1YQ4 B; 1IP9 A; 1ET6 A; 1WX7 A; 2KDM A; 5AEK B; 3VFK A; 1WMH A; 4RCO A; 2LFI A; 2BTE A; 1MFW A; 1F1H A; 4YTN B; 3IAM 1; 2KLG A; 3ENE A; 4A20 A; 4FA6 A; 2KWU B; 1P7F A; 3VUW A; 2HDE A; 1D4B A; 2JZZ A; 3P4S B; 4WWP A; 5I4D A; 2WXQ A; 3MP9 A; 2H88 B; 2Y5C A; 2RDH A; 3PRZ A; 1I35 A; 4J3O D; 4R3D A; 4X57 B; 4RM9 A; 2FAZ A; 2LUE A; 3R8B A; 3JSV B; 1V1O A; 4MDK E; 2WNM A; 4ZDV A; 3DBH I; 1V6E A; 1C3T A; 4F7Z A; 2KN4 A; 1TTN A; 4GDL B; 2BYE A; 4MM3 B; 3ZRF A; 1WJU A; 2MP2 B; 3HRD D; 4K3B A; 1LQB A; 2J0M A; 1WE7 A; 3Q14 C; 4BKS D; 1WH3 A; 3NS1 A; 3EGR A; 3UIN B; 2YEP F; 1I4G A; 4HWI B; 2JYT A; 2N9X A; 2BWE S; 4W9H A; 3KLS X; 4BFR A; 1TIF A; 1TT5 B; 2FCM A; 2PPH A; 3DBL B; 2KLC A; 2FUH B; 1QOG A; 5L95 C; 2DYB A; 1UD7 A; 3VR9 B; 1YQB A; 3ZXR A; 3AEE B; 4ARC A; 1XLN A; 4JWS C; 4M00 A; 3ECI A; 3Q8F A; 1V1P A; 3QX1 A; 3NG0 A; 2JZP A; 1IUE A; 4NJ7 A; 1J7B A; 4P16 A; 2BPS A; 3HIZ A; 3EFU A; 1Y8R C; 2JX5 A; 4FXC A; 4NJC A; 4XE0 A; 3N30 A; 3AE1 B; 2W55 A; 4GOC A; 3Q8C A; 2WU5 B; 2R2Q A; 1QOF A; 1EWC A; 2LGI A; 2ZPY A; 2RD0 A; 3HK0 A; 2CR5 A; 4HPM B; 2KKC A; 2QIL A; 3KWL A; 1D5M C; 3RZW C; 3EHV A; 4ZRK A; 3ZW3 A; 4JGH B; 2N4F A; 1NVI D; 4HJG E; 2O6V D; 3V6E B; 2C7M B; 4M0W B; 3MFG A; 1T5X D; 3ZDM C; 1SIF A; 3RCZ A; 2QDF A; 4C4V A; 5BMI A; 3ZNG C; 3KH0 A; 4YTM B; 4PS8 A; 2TSS A; 1V5T A; 1SGH A; 2GRI A; 3FAH A; 4HRS A; 1RLF A; 3IAS 1; 1SBB B; 4EZL A; 5KHQ A; 3PRP B; 3APD A; 3A4R A; 1ISN A; 3ZJT A; 3N3K B; 2M19 A; 2IY0 B; 1MG8 A; 1MJD A; 3NHE B; 1JML A; 2J53 A; 3AU5 A; 3TJP A; 4PS7 A; 1FFV A; 2ZNV C; 1V80 A; 1GG3 A; 4MEM A; 2FID A; 3MHS D; 1B1Z A; 3RD2 A; 1IGC A; 3DPD A; 4US9 A; 3CIR B; 4K3C A; 2KQ7 A; 2EEL A; 4NPN A; 2LVQ A; 2IPK D; 2KO3 A; 1P0R A; 3CMM B; 3L17 A; 2K8C A; 2QEJ C; 4RFB A; 4MGI E; 1ZOY B; 2KC1 A; 5BYR A; 3PT2 B; 4WH4 A; 4ZOH C; 3RI7 C; 4W9G A; 1TS4 A; 2KJ6 A; 2BGF A; 4CO7 A; 4M01 A; 5JHA A; 4GIV A; 2W9N A; 1WJ4 A; 2M1M A; 1I4X A; 3A9J A; 1Z2M A; 2UWQ A; 2AX5 A; 3PRM B; 2X8X X; 1WX8 A; 2DZI A; 4N6E B; 4YT0 B; 2LWP A; 4AUQ C; 3DVG Y; 4K7W A; 1WJ6 A; 4LNN A; 3DBH B; 2GI9 A; 1SIJ A; 3V6C B; 4C7Z A; 1XXG A; 1E10 A; 1F52 A; 2BYV E; 5DPS A; 2ON8 A; 2JWZ A; 5TSS A; 1F2R C; 4ZHO A; 1SE9 A; 3CF6 E; 2PVO D; 3P63 A; 5C2T B; 3L54 A; 1TY2 A; 3NVY A; 4DXG A; 4N59 A; 2LRU A; 1FCC C; 3AED B; 4W9I A; 2MJD A; 2FNJ B; 2RPV A; 5AZH A; 4BAX A; 1ZE3 D; 1WGD A; 2L0T A; 3VH4 B; 1C77 A; 3LB8 C; 3O65 B; 5IP4 D; 4W9J A; 1I7H A; 4Q2J A; 1V81 A; 3B0A A; 3KUZ A; 2HE7 A; 3CST A; 3U52 E; 1I4R A; 4ICV A; 4TQ1 A; 2NCN A; 2B3A A; 2LJI A; 3HVZ A; 4M02 A; 1K53 A; 2IND C; 2WLB A; 2XK5 A; 3AE3 B; 4BOZ B; 1WWT A; 1TBE A; 2E6X A; 3DHG C; 4BKG A; 5DCN A; 3EA6 A; 2L83 A; 2ONQ A; 1JCK B; 4B0E A; 4EEW A; 3R3M A; 2KDI A; 2MA9 B; 2KTF A; 2DZK A; 3HUI A; 1L4D B; 2J52 A; 1A5R A; 5D3I B; 2IZV B; 1Q5W B; 4HDO A; 2ZJD A; 1OGW A; 1F0Z A; 2ACZ B; 3ZTC A; 4BBN C; 1ZUD 2; 4JX1 C; 2VZK B; 2IGD A; 5EE3 A; 2CU3 A; 2JPH A; 3KQ4 A; 5DPT A; 2AQ1 B; 4OHJ A; 2FCN A; 2B76 B; 2WS3 B; 3TIX A; 4G50 A; 2W3S A; 3IT4 B; 3QAR A; 4XGA B; 4YSY B; 4LJO B; 3OG5 A; 4USA A; 2R2O A; 3H8H A; 2MQJ A; 2GLS A; 2Y5P A; 4GDL A; 3L13 A; 1SF0 A; 2MP2 A; 2C60 A; 4M8M A; 2WP9 B; 4N9F 4; 3ZYY X; 1FM0 D; 3AXC A; 2WXF A; 4ITK A; 2M8S A; 4LDT B; 3Q3O C; 1EUV B; 4NZL B; 1QT9 A; 4GLS C; 3MHZ A; 2M56 B; 3VVW B; 2Z59 B; 1EWY C; 4D2K A; 1FFU A; 3WIM A; 4OVZ A; 2LXA A; 5JHB A; 4C7Y A; 3NZ3 A; 2IO2 B; 2LD9 A; 2M17 A; 2XNA C; 5DPR A; 2KD0 A; 2Y5B B; 3I9V 1; 2G45 B; 3GB1 A; 3W1Y A; 4OZA A; 3VTW A; 2LAS A; 2ZCB A; 4XDD A; 2IJ0 A; 3Q8A A; 3U7Z A; 1XT9 B; 3NUH B; 3DBR B; 3W5U B; 3RNE C; 4KX6 B; 2FCS A; 2A4Z A; 2KOX A; 1WSP A; 1XLO A; 4NQL B; 2Z0D B; 4REZ A; 3DBS A; 2ZZP B; 1GB4 A; 2PMV A; 4WUR A; 3NOB A; 3ZNI D; 4GGQ A; 2QC8 A; 2ZVN A; 4FAD A; 2AEH A; 4FJY A; 3MTN B; 2WXI A; 3LDZ E; 3DBL I; 3OJ3 A; 3VUX A; 2KWD A; 4LLG M; 2BB6 A; 3RNF C; 4WJN A; 1M94 A; 3A33 B; 1FNW A; 2PIA A; 3AEC B; 2K1F A; 1BML C; 2CU1 A; 2BYT A; 5EE9 A; 4NY0 A; 1EU4 A; 3ZUN A; 2JU6 X; 3ZJV A; 1T0Q C; 3JYU A; 2AQ3 B; 3A9J B; 4WWM A; 4KKI A; 5AZF A; 1P98 A; 4KDI C; 3MJW A; 1F9J A; 1C79 A; 4NJ6 A; 2J7Q B; 2MJE A; 1RFK A; 1T0S C; 4HJK A; 2DNF A; 2EMS A; 2LGX A; 4GN1 A; 3R2I A; 2FE8 A; 2KFJ A; 3C0R B; 4HVB A; 3TCA A; 3VXW A; 2ASQ A; 3BVM A; 1C1Y B; 1T6B X; 1P3Q U; 1ACC A; 2L05 A; 2GBN A; 3NJT A; 1J0G A; 1TKY A; 3BK1 A; 2ZW0 A; 4A6Q A; 1G6J A; 1VZ6 A; 2L0F A; 4W9L A; 4JLC A; 2OOB B; 2W54 A; 3J9C A; 2N7D A; 2Q5W D; 3DWG C; 3DHH C; 1L4Z B; 2W82 A; 4DXF A; 4O1N A; 5IN7 A; 1NYQ A; 1JWM D; 4TSS A; 3ZKJ C; 1SEB D; 2LEK A; 3SU8 X; 1FIQ A; 1C4A A; 3SFE B; 2OJW A; 3ZLZ A; 3P1M A; 4MH8 A; 4BVU C; 2MLB A; 4JL9 A; 1ET9 A; 4LNF A; 3ETR A; 3WAP A; 1TZO A; 2XK5 B; 4MSM B; 2K8H A; 3ABV B; 3BII D; 2DX5 B; 1SE4 A; 1BXT A; 4WJO A; 1FPY A; 4YL8 A; 2FCQ A; 3VTV A; 1YNT E; 2CJO A; 5AUI A; 3HM3 A; 2LVO A; 2CS4 A; 4IWP A; 3OWE B; 1HZ5 A; 5D7G A; 4DHJ D; 1GPX A; 3ZGZ A; 1STE A; 1IYF A; 3C19 A; 1BT0 A; 1J7A A; 3VQI A; 4YXD B; 2A5U A; 1OFF A; 1UWX A; 5HHD G; 4ICU A; 5DPW A; 2ZVO A; 2KAN A; 2NTS A; 4KZ0 A; 3H7P A; 3M63 B; 1QLB B; 1JAL A; 2JY6 A; 1UWM A; 3EC8 A; 3T3O A; 4MEL A; 1YN4 A; 3T9L A; 2L52 A; 3IVF A; 3A9K B; 4IWQ A; 1GUA B; 4N58 A; 3K9P B; 5HFY A; 4US8 A; 1XF5 L; 4HLE A; 3VR8 B; 1PFD A; 1TGZ B; 5IOI A; 5T8I A; 2WYQ A; 4ANX A; 3P4R B; 1Q10 A; 3M3J A; 3UIP B; 1V97 A; 2D3A A; 2HJ1 A; 1SJH D; 4W9E A; 3W2D A; 2LRW A; 1XLP A; 4KSL C; 3R66 C; 2AYO B; 2JZ3 B; 5GXG B; 4IUM B; 2DZJ A; 3U7D A; 1UEL A; 3DQV A; 3L10 B; 2N9L A; 2RR9 A; 3P42 A; 3ZXV A; 3ONS A; 3TL5 A; 2QHO A; 1VLB A; 1FRD A; 1MHX A; 5HI1 A; 2D10 A; 3V60 A; 1WZ0 A; 1ZPS A; 3MC0 B; 4KZC A; 3GS2 A; 4C00 A; 2N7J A; 2J0J A; 3N32 A; 4IWO A; 4F1S A; 1YIW A; 3AE6 B; 4IW0 A; 3GE3 C; 4MGK E; 3RNA C; 3KWV A; 2LHD A; 4S17 A; 3ZQ4 A; 2OHF A; 1QKZ A; 1RWS A; 1NEN B; 1LXD A; 4KGR A; 1NBF C; 2PVG C; 1KF6 B; 4DDI D; 3W1S C; 1D3Z A; 4K7U A; 3WCQ A; 3WA0 A; 4LCD E; 4KGS A; 2D07 B; 3T8M A; 3FIL A; 1TYG B; 5D6J B; 1NI2 A; 3KYD D; 3S2A A; 1E5W A; 3GZN B; 2KN5 A; 2EMT A; 3W5V B; 2JQR B; 1WGR A; 1S1Q B; 3RYT A; 3BIN A; 3BZD B; 1JRU A; 1J8C A; 2N9K A; 1WX9 A; 1EM7 A; 3PLU A; 1RYJ A; 3ZO5 B; 3UIO B; 2PE9 A; 2I2Y A; 1PGA A; 3PSE B; 2MW5 A; 1E0Z A; 1UBI A; 4KGT A; 4A55 A; 1QOA A; 4ZRP A; 3VHT C; 3K9O B; 4EKU A; 3Q3F A; 2JWU A; 4BKS A; 4FUL A; 4AJY B; 1R7S A; 2LI5 A; 5MPO A; 1CQV A; 3UF8 A; 1YN5 A; 4WQO B; 2M0X A; 3B1L X; 3VTU A; 2PTL A; 1F2R I; 2GBM A; 3DBR I; 4ANW A; 3FKY A; 3P2B A; 3SFD B; 4YSX B; 1WRI A; 4E71 A; 3TEY A; 1E8X A; 3AE9 B; 1DYQ A; 1GAQ B; 2GMI C; 3RNB C; 4MT5 A; 2WXO A; 2WXG A; 4LJP B; 3U2S C; 5H92 C; 3SDL C; 3D32 A; 3JVZ X; 1HTO A; 3KYC D; 4FHJ A; 1VJK A; 4WAA A; 4BBN F; 4B9K A; 1C4C A; 4RNA A; 2NBV B; 1TS3 A; 2JF5 A; 2CHZ A; 3EEC A; 2O6V A; 1K52 A; 2D3G A; 1DOX A; 2KJH B; 1MG4 A; 4FJV B; 3APC A; 2FUG 1; 1OQR A; 2WDR B; 5LLI A; 4EFO A; 1UGJ A; 4ACF A; 2K6Q A; 3GP7 A; 3Q6B A; 1I4P A; 2GBJ A; 2LUM A; 1T0R C; 3APF A; 1E8Y A; 3TEZ A; 1L0V B; 2KQ4 X; 1MVK A; 1RM6 C; 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4ASW C; 4P7I A; 2WGS A; 3ML9 A; 1WGY A; 4ZHP A; 1L6V A; 2D3B A; 3N20 C; 4I6N B; 1C76 A; 2BQQ A; 2D3C A; 5LXI B; 2MSE D; 3A4S C; 1JWU D; 1FD6 A; 5HG2 A; 3ZIM A; 3TEX A; 3PTF C; 3SR6 A; 4E3C A; 3V61 A; 3B2F A; 3TMP B; 2KWV B; 1RRB A; 2MBE A; 3IFW B; 4W9K A; 1LFD A; 2DHZ A; 2D5G A; 3MC9 A; 3FIL B; 4MSQ B; 4DHJ B; 4JIO U; 1TY0 A; 2XEW A; 1CK1 A; 3L0W B; 2WXN A; 3EUB 2; 3W9C B; 3PRE A; 1YOV B; 3ZNZ B; 2BS4 B; 2DBY A; 3DWM A; 5JZE B; 2L8J A; 3E9S A; 4EUT A; 3ZNH B; 2KWC A; 1WGK A; 1WGH A; 4IKG A; 3P4P B; 1KFY B; 3DVN U; 1YJ1 A; 4WWN A; 5E6J A; 4K81 A; 4YWG G; 3TSS A; 2K22 A; 3HHM A; 3Q3J A; 1LM8 B; 4GXB A; 4WIP A; 2I38 A; 4P1C C; 4IG7 B; 2JUO A; 4GU2 A; 2O2V A; 2GBK A; 2KDB A; 3ZJU A; 1D5X C; 2QSD A; 1QZE A; 2R61 A; 4DWF A; 1L7Y A; 1R4M B; 2JRH A; 3PV1 A; 2K0P A; 2RMM A; 2JRI B; 2G3Q B; 2KX0 A; 2WHI A; 4AQ7 A; 1UF0 A; 4NNJ B; 2OED A; 2V1Y A; 1UZX B; 1D5Z C; 1UNS A; 2IGG A; 1KM7 A; 1HZ6 A; 3RZF A; 2GBR A; 3DCG A; 2BVC A; 2V4I B; 2N9P C; 1SB3 C; 3KUC B; 2BW2 A; 2VZK D; 3ZTD A; 4CQN A; 4BOS C; 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