The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
|
sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
MQYKLHLHGKTLKGETTTEAVDAATAEHVFKHYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The double-histidine Cu2+-binding motif: a highly rigid, site-specific spin probe for electron spin resonance distance measurements.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Streptococcus sp. group g
|
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
|
| total genus |
15
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2014-09-19 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2ONQ A; 2KQ4 X; 4OZB A; 2PTL A; 5HI1 A; 1FD6 A; 1P7E A; 1IBX A; 1YNT E; 1PGB A; 1IGD A; 2LGI A; 1XCQ L; 1FCC C; 5BMI A; 1YMH E; 4KGT A; 1K51 A; 2LUM A; 1K52 A; 1XF5 L; 2KAC A; 2QMT A; 1MVK A; 1ZXH A; 2OED A; 3FIL B; 3UI3 A; 1PGA A; 1C9F A; 1F2R C; 1HZ6 A; 4IOI E; 1FCL A; 4KGR A; 2PW9 A; 2JXT A; 1XCT L; 2RPV A; 3MP9 A; 4GLS C; 1K50 A; 2RMM A; 1IGC A; 2JWU A; 1Q10 A; 4HKZ E; 1PGX A; 2QSD A; 2ON8 A; 2J52 A; 1MHH E; 2GB1 A; 5BMH A; 2IGG A; 1HZ5 A; 1MI0 A; 2KWD A; 1JML A; 2IGH A; 3FIL A; 5HHD G; 1K53 A; 2K0P A; 4WH4 A; 4OZC A; 1GB1 A; 2ZW1 A; 2N9K A; 4HJG E; 2ZW0 A; 2N9L A; 3V3X A; 1F2R I; 4KGS A; 1UWX A; 5JXV A; 5HFY A; 2EEL A; 1P7F A; 2NMQ A; 1IBX B; 3GB1 A; 4OZA A; 4D2K A; 2JU6 X; 4MAC A; 2PLP A; 2J53 A; 5HG2 A; 1GB4 A; 2N7J A; 1EM7 A; 2LHD A; 2I2Y A; 1MHX A; 1QKZ A; 1HEZ E; 2IGD A; 2KN4 A; 4IKG A; 2GI9 A; 1D4B A; 2JSV X; 2JZP A; 5BMG A; 2KDM A; 1MPE A; 1KH0 A; 2LHE A; 2I38 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2IDY A; 1P98 A; 1WXS A; 1HXY D; 4TQ0 A; 2C7N B; 1FD6 A; 3BIN A; 1QLB B; 1YNT E; 1ET6 A; 4NJ7 A; 1MG8 A; 1B1Z A; 4W9K A; 3GP7 A; 1VCB A; 1YMH E; 3DWM A; 1TS4 A; 3W1S A; 3X23 A; 1WX8 A; 4S0R A; 3P42 A; 2QMT A; 3GE3 C; 2KNB A; 3H9D A; 1WXM A; 4MEL A; 4PK1 A; 1BML C; 1GG3 A; 3KW5 B; 1F2R C; 4HCP B; 4WWP A; 1B9R A; 1WX7 A; 2JXX A; 3UIP B; 1T3Q A; 1UBI A; 1TKG A; 2M1M A; 3KH0 A; 3MP9 A; 4GLS C; 2WP9 B; 1JWA D; 4M0W B; 2KQS A; 1Z2M A; 4HKZ E; 2LAS A; 1WFY A; 1TKE A; 2N4F A; 3SD5 A; 1MI0 A; 4GDK A; 1SB3 C; 3FIL A; 4HKQ A; 1GJZ A; 2WXQ A; 3IAS 1; 2Q5W D; 4PS7 A; 2BVC A; 2ZW0 A; 3E9S A; 4RFB A; 1R4M I; 2N9L A; 5CTR C; 3AEC B; 1PFD A; 4MH8 A; 4DHJ B; 5MPO A; 1JWM D; 2FBW B; 1XXG A; 4HRO A; 1DYQ A; 1I4Q A; 4LDT D; 3HK0 A; 3ZGZ A; 2FUG 1; 4MAC A; 3B2G A; 3ECI A; 2WXI A; 3OJ4 B; 1HEZ E; 4IW0 A; 2HTH A; 2WXP A; 2FUH B; 2KWV B; 3OLM D; 4NQL B; 3ZTD A; 3C19 A; 2FCM A; 3GOE A; 1P0R A; 3R7Q A; 2KLC A; 3ZNH B; 1TS2 A; 1VDV A; 5BO4 B; 1ZUD 2; 4K3C A; 2VRR B; 1T0Y A; 5L83 A; 2BS3 B; 4RGN A; 1XQQ A; 3DPD A; 3NHE B; 2LGI A; 1C79 A; 4W9C A; 4WWO A; 3UIO B; 1JRO A; 1QOG A; 3N20 C; 2KFJ A; 1SIJ A; 1MJD A; 3P4P B; 4AS1 A; 3DWG C; 2MA9 B; 4GDK B; 1ZDV A; 2GBM A; 4XX5 A; 1V49 A; 3FIL B; 1PGA A; 2D5G A; 4W9F A; 1WWT A; 1J7B A; 2MRP A; 4NJ6 A; 3U2S C; 2WHI A; 3R2T A; 2LGY A; 2JXT A; 3KUZ A; 3MHZ A; 2CJN A; 1R7S A; 4M8N A; 1E5W A; 4K7U A; 1E8X A; 4ACF A; 1WRD B; 2KZR A; 1YIW A; 3TBL D; 3R66 C; 3ZNG C; 4DDI D; 3A9J A; 3Q3M C; 1NYQ A; 3VXW A; 2LFI A; 1U4A A; 2C7H A; 2LVQ A; 3K9P B; 3V6E B; 5D7G A; 2BF8 B; 2ZCB A; 2JRH A; 1V9J A; 1UWX A; 4ZOH C; 3APD A; 3TIX A; 3HM3 A; 2DYM A; 2LGX A; 1KJT A; 4BZA A; 4FUL A; 3NUH B; 4XDC A; 1FXT B; 2BYF A; 1WR6 E; 4ANW A; 5DCN A; 1MHX A; 2BS4 B; 2K25 A; 2KTR A; 4BFR A; 4YSZ B; 5LXH A; 4MSM B; 3NY5 A; 2BYV E; 2OOB B; 2EMS A; 4B6W A; 2LMC A; 2WXG A; 1V97 A; 1MHH E; 4TMA B; 3C8Y A; 3NVZ A; 1S3S G; 2KO3 A; 2MBB B; 2SAK A; 4ASW C; 1L0V B; 2NR2 A; 2JWZ A; 4OVU A; 3N30 A; 1Y56 A; 1EF1 A; 1SE9 A; 4W9E A; 3AUL A; 1FCC C; 1T0Q C; 4NNJ B; 3N1X C; 1I4X A; 5H8Y E; 2V3P A; 4FBJ B; 2W54 A; 4N59 A; 1GC7 A; 3A9J B; 3EFU A; 5CHF A; 2L7R A; 1GC6 A; 3FAH A; 2L0T A; 5BYS A; 1C77 A; 2KHW B; 2NTS A; 4A9A A; 3AXC A; 1E8Y A; 1XCT L; 4M02 A; 2WDR B; 2KAJ A; 1Q10 A; 4LNK A; 1IPG A; 1FNU A; 4O1N A; 4LTU A; 1EF5 A; 3VHT C; 3LYY A; 1WX9 A; 2AL3 A; 4YWG G; 4YSY B; 5C2T B; 3O65 B; 3UIN B; 4PT5 A; 2FAZ A; 1YD8 U; 2FE8 A; 1N61 A; 2RDH A; 2WX1 A; 3W1S C; 5EDS A; 2L1A A; 1WR1 A; 2ZVO A; 4URK A; 4CYE A; 1HQR D; 2XN9 C; 2VH1 A; 4YSX B; 2PVO D; 2K1F A; 1NEK B; 1WI0 A; 1KTK A; 3M3J A; 5CHV C; 3Q3N C; 4Q2J A; 3P4Q B; 2RDG A; 3VVW B; 2L05 A; 1Q1O A; 4MT5 A; 4KZC A; 4KV2 A; 3D32 A; 3K9O B; 2WXO A; 3I5J C; 3AE9 B; 3B9J A; 4K81 A; 4NAW B; 1UF0 A; 1GAQ B; 3BVM A; 2I38 A; 4EZJ A; 2JVC A; 1PUT A; 3BWU D; 3AM9 A; 1P7E A; 1QOA A; 3HRD D; 3QJZ A; 2KTF A; 4IUM B; 3ZRF A; 2L76 A; 2HJ1 A; 1VZ8 A; 4FAD A; 2N7E A; 2MBH A; 5FR3 A; 2KDE B; 3PTF C; 1XF5 L; 3ZLZ A; 1L2N A; 4LDT B; 2MP2 A; 4BOZ B; 3ZKJ C; 3BK2 A; 2OED A; 1TY0 A; 3I9V 1; 4C7Z A; 3N3K B; 3M63 B; 3TEZ A; 1L4D B; 4KKI A; 4KGR A; 4OW0 A; 2N9X A; 2D3A A; 3CF6 E; 4WAF A; 3SU8 X; 4L1B A; 4IM3 A; 3RNB C; 1HTQ A; 1PGX A; 2QJL A; 3ZJV A; 2ON8 A; 2WXF A; 3ZNZ B; 4RGT A; 2IYD B; 1UGJ A; 2G4D B; 1F77 A; 1N62 A; 4F7Z A; 2BWE S; 2L8J A; 4HPL B; 1JQ4 A; 1OEY J; 2PPH A; 1ROE A; 5LXI B; 3V3X A; 2R2O A; 4KGS A; 1R4N I; 4XC2 A; 1WM3 A; 2DBY A; 2IY0 B; 2KXJ A; 2V1Y A; 3A9K B; 3TMP B; 1SE2 A; 1X1M A; 1WGY A; 4JWU C; 1ZKH A; 1ZDX A; 2BPS A; 4ANV A; 3PHW B; 4JQW C; 1ESF A; 2KN4 A; 1FRD A; 5G2N A; 4MH0 E; 2BS2 B; 1VRA B; 4WJQ A; 3RNG C; 2MP2 B; 3PLV A; 1OFF A; 2MCN B; 4MGY E; 2UU7 A; 1QIL A; 3WAL A; 1L0Y B; 4F1S A; 2ZEQ A; 2AQ3 B; 1N63 A; 3VQI A; 2JPH A; 4DHZ B; 1CZP A; 4FJY A; 2HE7 A; 3ABV B; 3Q14 C; 2WDQ B; 1K52 A; 3NVV A; 4LCD E; 3UQB A; 1V80 A; 1E6E B; 3IT4 B; 4RH6 A; 2KMC A; 5KHO A; 1P3Q U; 1FFV A; 4JLC A; 2C9W B; 3VH3 B; 2M56 B; 2GBJ A; 2FCN A; 2NS5 A; 3A1Q A; 4BKT A; 4USA A; 1SE4 A; 2IO2 B; 4ZYS A; 4RMA A; 4TKN A; 2E6X A; 4ZRJ A; 4WWM A; 3PT2 B; 3MJW A; 1BT0 A; 2NPT A; 3VR8 B; 2PE6 B; 5HHD G; 5DPR A; 1F9J A; 3PV1 A; 3SDL C; 2N9K A; 5G55 A; 1TJE A; 2QIE B; 1UH6 A; 2INC C; 4MGZ E; 1FM0 D; 1JWS D; 1RRB A; 1WMH B; 4NPN A; 3KYD D; 2K8C A; 1QT9 A; 3RUI B; 2MLB A; 3N1Z C; 3Q8F A; 2IZV B; 3MC0 B; 4D2K A; 1XLN A; 3DBH I; 1YQB A; 2WXR A; 2I2Y A; 4EE2 A; 2A5U A; 3RMK C; 3DBR I; 4HPM B; 2IGD A; 3OJ3 A; 4ANX A; 2BWF A; 3HVZ A; 2FID A; 1BUI C; 4JPS A; 3AEG B; 3U4E G; 5BYQ A; 4P7I A; 2OHF A; 4RM8 A; 2INP E; 2G3Q B; 4M0W A; 2KQ4 X; 1QF6 A; 1IBX A; 2CHW A; 2DWQ A; 5D3I B; 1IGD A; 5AZH A; 2K8H A; 3DOW A; 4AJY B; 1H8C A; 1A70 A; 3A1Q B; 3DBS A; 4UDU C; 3KWL A; 1WY8 A; 4AUQ C; 1LFD A; 4A8X C; 2V9H A; 3P63 A; 5AZG A; 3TCA A; 4GSW A; 2JF5 A; 4K1R B; 1J7C A; 3AI5 A; 3DCG A; 2NPT B; 4LJP B; 1XT9 B; 4IWQ A; 4OVZ A; 3ONS A; 4EZL A; 3BVG A; 2MQJ A; 1D5Z C; 4HRS A; 1LO5 D; 1TBE A; 1L7Y A; 4HJK A; 3NJT A; 1WJU A; 1OTR B; 2EMT A; 2DLB A; 3GE8 C; 3CIR B; 2CS4 A; 1TYG B; 2ASQ A; 2IGG A; 5BMH A; 2KN5 A; 4XGA B; 1M4V A; 3SEB A; 2D11 A; 1JML A; 2IGH A; 3DHH C; 3SHQ A; 2CR5 A; 4KKJ A; 3SFD B; 3A4S C; 2MJ3 A; 4EZK A; 1KFY B; 4W9H A; 4K7S A; 1SXT A; 3MTN B; 5GXG B; 3GZN I; 4RCO A; 4LLG M; 2N1V A; 5HFY A; 4KSL C; 5AEK B; 1KM7 A; 1IBX B; 2YEP F; 1P9D U; 3H1U A; 5LNK 1; 1E9M A; 2PLP A; 2J53 A; 3H7P A; 1AAR A; 3ZXR A; 1YJI A; 2RD0 A; 5IP4 D; 2R2Q A; 2MH7 A; 1NBF C; 2JSV X; 2FCS A; 4ZYN A; 2DYO A; 4X57 B; 1J19 A; 1H4R A; 1MPE A; 4BOS C; 2I1K A; 4LK0 M; 2L83 A; 3QA8 A; 3ZJT A; 5G5G A; 3RN9 C; 4MSQ B; 3NOB A; 4PYZ A; 3KUC B; 1WIA A; 3R2I A; 1V8C A; 1QOB A; 3IAM 1; 4IG7 B; 1FIQ A; 1GUA B; 2KVZ A; 1C78 A; 3MFG A; 2NTT A; 3B1L X; 2EKE C; 3HHM A; 2HTM E; 4BAX A; 2O6V D; 2KOX A; 3RNE C; 2W82 A; 4JL9 A; 4G0N B; 2XK5 A; 4IDI A; 3AEF B; 2N1W A; 2REX A; 3RD2 A; 3NS8 A; 3SR6 A; 2HD5 B; 2MJD A; 4DHZ E; 2ZPN A; 2INN E; 1XLP A; 2RR9 A; 4A3P A; 2QCZ A; 1YJ1 A; 2B76 B; 1V2Y A; 2AEH A; 4ZRP A; 2CHX A; 3CST A; 3H7P B; 4ITK A; 4A3O A; 4DDG D; 2K0P A; 2IBI B; 4IC7 B; 1DGJ A; 3JW0 X; 3VUX A; 5FR6 A; 1R4N B; 5JHA A; 1F1H A; 1WGG A; 4C00 A; 4LNF A; 2YLM A; 2WDV B; 4HDQ A; 3ZDM C; 4RGM A; 2BQQ A; 2D3G A; 3ZJU A; 1NVI D; 1P1A A; 4FHJ A; 1E7V A; 1C1Y B; 2XNA C; 2ZZP B; 4L2Y A; 1E8Z A; 3ZUN A; 2KDM A; 3X0W A; 3QCA A; 3VDZ A; 2XK5 B; 3AV8 A; 4JX1 C; 4B0E A; 1KH0 A; 1RFK A; 4CQN A; 4OZB A; 2ZNV B; 5HI1 A; 4ZRI A; 1WXQ A; 4E3C A; 3W9C B; 3AED B; 3WAP A; 2IO3 B; 1YJJ A; 2M0A A; 2BBC A; 1YQ4 B; 1UZX B; 4IWO A; 1WE6 A; 4HLE A; 3HVD A; 5LLI A; 4NZL B; 1TTN A; 4IOI E; 3NVY A; 1TT5 B; 3TEW A; 1V1P B; 2LGS A; 1QOF A; 2RDB C; 3NZ3 A; 1ZOY B; 1K50 A; 2X8X X; 3PLU A; 3ZQ4 A; 2EKI A; 1KF6 B; 4KZ0 A; 2KAN A; 4NAW A; 3EA6 A; 3VUY A; 2TSS A; 1WXA A; 4TUU A; 1L4Z B; 1I42 A; 1TZO A; 3ENE A; 1E10 A; 1F52 A; 3RZW C; 2BGF A; 2BKR B; 3HUI A; 1E7P B; 2BB6 A; 3I3T B; 3NS1 A; 4AJW A; 1GB1 A; 3ML9 A; 4HJG E; 3Q3J A; 4LNN A; 3N9Y C; 3L10 B; 3BY4 B; 2CJO A; 1V6E A; 4GIV A; 3DBH B; 4GN1 A; 4KX6 B; 3OG5 A; 4WJP A; 4P1B C; 2GMI C; 2GBR A; 2D3C A; 3PRP B; 2W3R A; 4MGI E; 1DOI A; 2QDF A; 2Z8L A; 3NG0 A; 2WU5 B; 3WCQ A; 2UYZ B; 1WSP A; 2BTE A; 2E3T A; 5J18 A; 2JY6 A; 2O6V A; 4KDI C; 1VZ7 A; 1VZ6 A; 3QX1 A; 2KK8 A; 4N9F 4; 3IXS A; 4YTN B; 4C4V A; 3KWV A; 4GMV A; 1LXD A; 4W9D A; 3Q8B A; 4W9L A; 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4A6Q A; 3UQA A; 3BII D; 1A5R A; 2DAF A; 3AE3 B; 2L3Z A; 1XLO A; 3DVN U; 2KAC A; 2FNJ B; 1WMH A; 1YOV B; 3L08 A; 4BBN F; 4E74 A; 3LDZ E; 1D3Z A; 1EUV B; 2J7Q B; 2WX0 A; 4MJS B; 1FMA D; 3AE8 B; 2KDB A; 1C9F A; 4BVU C; 1KLV A; 3PSE B; 4C56 C; 3PPA A; 2K6D B; 1ENF A; 2DNF A; 4PS8 A; 1UNS A; 3VUW A; 3W5V B; 4LJO B; 4JGH B; 4WJN A; 4IM0 A; 1SJE D; 2M17 A; 3VRB B; 3TL5 A; 1Q0W B; 4KSK C; 1IYF A; 5CX3 A; 3IHP C; 3TEX A; 2WQY B; 4NQK E; 1HZ5 A; 2NBV B; 1F0Z A; 4NJC A; 1YQ3 B; 1WGR A; 1XD3 B; 4HVB A; 3QWZ B; 4QAY A; 1C4C A; 2J0K A; 3BYY B; 3RUL A; 3T8M A; 2DZJ A; 2Y5C A; 2K6Q A; 4XZ4 A; 2ZVN A; 1FEH A; 2A4Z A; 4TV3 A; 1WYW B; 4KVG B; 2L00 B; 2MWS B; 4RF0 A; 2QIL A; 4DQO C; 2KDF B; 3AU4 A; 1EM7 A; 5E6O A; 3GS2 A; 1QKZ A; 2H89 B; 1ET9 A; 3RI7 C; 3EGR A; 3AEB B; 3M62 B; 4ZRK A; 3DVG X; 1WF9 A; 2DZM A; 4I6P A; 1NI3 A; 2OJR A; 4HXD A; 5JHB A; 3Q6B A; 4ZHO A; 2HDE A; 2CKH B; 2JX5 A; 3M95 A; 4II2 B; 4HCN B; 3W5U B; 5G5H A; 3BYT B; 2ONQ A; 2L52 A; 3W1Y A; 2C5L C; 3Q3F A; 4JIO U; 4US9 A; 3IG3 A; 2KX0 A; 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