The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
|
sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
MQYKLHLHGKTLKGETTTEAVDAATAEHVFKHYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The double-histidine Cu2+-binding motif: a highly rigid, site-specific spin probe for electron spin resonance distance measurements.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
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| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Streptococcus sp. group g
|
| total genus |
15
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2014-09-19 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4KGS A; 1Q10 A; 4KGR A; 1GB4 A; 1K52 A; 1K53 A; 2IGG A; 5HHD G; 4WH4 A; 1P7F A; 2JU6 X; 3FIL A; 1MHX A; 1FCL A; 2GB1 A; 5HFY A; 1PGA A; 3GB1 A; 2GI9 A; 2JWU A; 1XCQ L; 2QSD A; 3FIL B; 2KAC A; 2IGD A; 2K0P A; 2KDM A; 2JZP A; 4OZA A; 5BMH A; 1FCC C; 4OZC A; 3V3X A; 2PTL A; 2ON8 A; 3MP9 A; 1F2R I; 2LHD A; 1HZ5 A; 4HKZ E; 1FD6 A; 1IGC A; 5BMI A; 2ONQ A; 1MHH E; 4GLS C; 2KN4 A; 1PGB A; 2IGH A; 4MAC A; 2N9L A; 5JXV A; 1UWX A; 1YNT E; 1HEZ E; 1IGD A; 2PW9 A; 1F2R C; 2PLP A; 1MI0 A; 1P7E A; 1XCT L; 1YMH E; 2N9K A; 4KGT A; 2LHE A; 2JSV X; 4D2K A; 5HG2 A; 1PGX A; 2LUM A; 2ZW0 A; 1KH0 A; 2OED A; 2ZW1 A; 2LGI A; 1MVK A; 2QMT A; 1IBX A; 2KWD A; 2I38 A; 2KQ4 X; 1QKZ A; 4OZB A; 3UI3 A; 1K50 A; 4IOI E; 2I2Y A; 2RMM A; 1EM7 A; 2J52 A; 2RPV A; 1K51 A; 1HZ6 A; 2EEL A; 1C9F A; 1IBX B; 1D4B A; 1XF5 L; 1ZXH A; 1MPE A; 2JXT A; 4IKG A; 1JML A; 2J53 A; 2NMQ A; 5BMG A; 4HJG E; 2N7J A; 1GB1 A; 5HI1 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4JL9 A; 3HVZ A; 3TIX A; 4I6N B; 3IT6 B; 4RM8 A; 3Q3F A; 2PMV A; 1BML C; 2QIL A; 1P7F A; 3NS1 A; 1VZ6 A; 1E8Z A; 3MJW A; 1PGA A; 1WR6 E; 1TKG A; 2LGD A; 2XNA C; 2HJ8 A; 2DAJ A; 1SE9 A; 2NBU A; 2ZPY A; 4OVZ A; 2IPK D; 1LGR A; 4GN1 A; 3P4S B; 4P7I A; 1KOT A; 2IGD A; 2QEJ C; 1V6E A; 3DBS A; 2W54 A; 1QZE A; 3TL5 A; 5AUK A; 4A9A A; 3BVM A; 1F2R I; 4K7U A; 1EUV B; 2X8X X; 4G50 A; 1WGH A; 4FN2 A; 3VH3 B; 2L0T A; 2KDE B; 2DBY A; 1P1A A; 2IND C; 4HXD A; 4EUT A; 3EEC A; 3I5J C; 2WXG A; 3GS2 A; 2R61 A; 3ML9 A; 2DWQ A; 4MJS A; 4ARI A; 2W3S A; 1WR1 A; 2H89 B; 1NBF C; 1YMH E; 4KGT A; 4RNA A; 1CJE A; 1KF6 B; 1M94 A; 4GGQ A; 5DPT A; 1P98 A; 2L52 A; 1WYW B; 1TGZ B; 1HA5 A; 1GNU A; 3B2F A; 4J6I A; 4A8X C; 4HKQ A; 2BBC A; 4XC2 A; 4LNN A; 1XF5 L; 1Q0W B; 4F1S A; 2BT6 A; 3NUH B; 2L00 B; 4CO7 A; 3EFC A; 3LXF A; 1UUP A; 3L4P A; 2MCN B; 1SF0 A; 5HKH A; 1EU3 A; 1L2N A; 2DLB A; 5E6J A; 1WM2 A; 2KAJ A; 2KVZ A; 4IWQ A; 4S0R A; 4ZYN A; 2KMA A; 3MC8 A; 2DYM A; 2CJN A; 3TSS A; 4IM2 A; 3JSV A; 1JRU A; 5KHQ A; 4MH0 E; 2W55 A; 1SJH D; 1L0V B; 2JWU A; 2EKI A; 2KQS A; 3JYU A; 3SDL C; 4ANW A; 2RDH A; 5C1Z A; 3TEY A; 4A6Q A; 3VXW A; 2KFJ A; 2DEN B; 4OVU A; 1OTR B; 1E9M A; 4WWP A; 2KN4 A; 1TZ1 A; 2R2Q A; 2V3P A; 3S2A A; 4WUR A; 5GXG B; 1YQB A; 3IXS A; 4MSM B; 1T6B X; 2KO3 A; 4NAW B; 1ZXI A; 4LCD E; 4N59 A; 2N1V A; 2REX A; 1UBI A; 2LWP A; 2FAZ A; 4PYU A; 2MH7 A; 3SD5 A; 2N9K A; 3VTW A; 3CSF A; 3UQB A; 3DHG C; 2BQQ A; 1ZW7 A; 4IG7 B; 4PS3 A; 4OZB A; 3Q3O C; 3ZXV A; 3ZJU A; 2IY1 B; 4YT0 B; 5EE3 A; 4XGA B; 2CKH B; 1MPE A; 4KKI A; 4G0N B; 2Z0D B; 4W9I A; 2KDF B; 2KLG A; 5D94 A; 2MJD A; 1ET9 A; 1ZDX A; 2UYZ B; 4MT5 A; 4P1B C; 3ZQ4 A; 1PUT A; 3RCZ A; 1E7P B; 3KUC B; 4MH8 A; 4G11 A; 2AWT A; 2BS4 B; 4M02 A; 2NS5 A; 3MC9 A; 4XDD A; 4RGN A; 3EA6 A; 3FIL A; 2INC C; 4URK A; 3SU8 X; 3TEW A; 1YQ4 B; 3RMK C; 3AE9 B; 4HEA 1; 4NQL B; 2PKO A; 4MM3 A; 2PIA A; 2GMI C; 5DCN A; 1NEN B; 4ANX A; 1F1H A; 2MBO A; 3W1Y A; 4XE0 A; 3DDC B; 4XWT A; 1WMH B; 4NAM A; 2MJ3 A; 1E90 A; 1DOY A; 1BUI C; 3CWI A; 4AP4 C; 3H9D A; 4LNF A; 3BY4 B; 4DXG A; 5AZG A; 1V9J A; 2NBW B; 1H8C A; 4YSX B; 2ZNV C; 1F77 A; 2XEW A; 3NZS A; 4L1B A; 3DBR I; 2V4L A; 4RGM A; 5L83 A; 3KH0 A; 1FM0 D; 3R3M A; 2K8H A; 4WAF A; 5BYQ A; 1ESF A; 2OHF A; 2BKR B; 2PPH A; 3UF8 A; 1T3Q A; 1AN8 A; 1L6U A; 5G55 A; 4E74 A; 4GIV A; 3DHH C; 1HE8 A; 1PQS A; 4JX1 C; 4M8N A; 3W1S A; 1UZX B; 5D3D A; 4C00 A; 2KJH B; 2LRU A; 2MBH A; 3GE8 C; 2IJ0 A; 3QC8 B; 3L54 A; 1HQR D; 2J52 A; 2LGS A; 1IBX B; 1D4B A; 5FR6 A; 3UQA A; 3V62 A; 1JWS D; 3BWU D; 4ITK A; 5AZH A; 1VR9 A; 3X0W A; 5JHA A; 3AEA B; 2D5G A; 1A70 A; 3MTN B; 4A3O A; 3T9L A; 3AEE B; 2ZNV B; 2GBK A; 3AU5 A; 5IKC M; 2QHO A; 4KIK B; 1JCK B; 1OGW A; 2YEP F; 4IM0 A; 1AWD A; 1FXI A; 4ZRK A; 1UWM A; 1UH6 A; 2LXC A; 2N7E A; 1WJ6 A; 2PE6 B; 4DDI D; 1V86 A; 4WWM A; 1FXT B; 3DBL B; 5LXI B; 1I4Q A; 5BMH A; 2JPH A; 4OZC A; 1OEY A; 2C7N B; 2WXL A; 3MP9 A; 5C3J B; 2KWV B; 1HZ5 A; 4BVU C; 3RD2 A; 2DX5 B; 1WRD B; 2D10 A; 5LXH A; 1BXT A; 2VZK B; 2FUH B; 3PHW B; 4JGH B; 3RUI B; 5MPO A; 4M0W B; 4ANU A; 2O6V D; 1VD2 A; 1LFD A; 1R7S A; 1JWU D; 3AEC B; 2NPT A; 3GP7 A; 1WH3 A; 4NQK E; 2G1E A; 4LNK A; 2PLP A; 4ARC A; 2ICI A; 4TQ1 A; 1MI0 A; 1NEK B; 3PO0 A; 4HPM B; 1A5R A; 2PE9 A; 2BF8 B; 2Q5W D; 2LUM A; 1TIF A; 2ZCC A; 3A9J B; 3LJ3 A; 2KDI A; 1VRA B; 1IYF A; 1NI3 A; 4CQN A; 3NVZ A; 1EWC A; 3V05 A; 3ZNG C; 1HTO A; 1XXG A; 2D2Q A; 4DK5 A; 2RSU A; 3QQ8 B; 1YX5 B; 2D11 A; 2Y3A A; 5BO4 B; 2K8C A; 3HM6 X; 4IWO A; 2J0K A; 5TR5 A; 4W9G A; 1N62 A; 3AE7 B; 3Q3M C; 2BPS A; 2J53 A; 4RMA A; 3N9Y C; 2K6D B; 4LNI A; 2Y5C A; 4EZK A; 2YLM A; 1Q10 A; 1GB4 A; 3I57 A; 4HRS A; 1WX9 A; 1E8W A; 4ZRP A; 1FPY A; 4C56 C; 2CU3 A; 4YTP B; 1VCB A; 2GB1 A; 3VUX A; 4WWN A; 2LVQ A; 1YX6 B; 4ZDV A; 2NBV B; 3KQ4 A; 3VDZ A; 3ML8 A; 3DCG A; 4MGY E; 3B9J A; 1WX7 A; 1XLQ A; 1WE6 A; 2M56 B; 1L4D B; 5E6P A; 3VTV A; 2KWC A; 3ENE A; 2ZEQ A; 2WXQ A; 1LM8 B; 1TS5 A; 1MG8 A; 2PVO D; 2BVC A; 1NYR A; 4KSK C; 2J4X A; 3BYY B; 2LEK A; 1MHH E; 1JRO A; 3DVG Y; 4ZRJ A; 1KRH A; 1I4R A; 1QQR A; 3KUD B; 1YNT E; 4LTU A; 2DZJ A; 2Z0E B; 1R4M I; 1WXV A; 2MW5 A; 2N9X A; 2K1F A; 3Q2A C; 5DPR A; 3M62 B; 4F7Z A; 4FUL A; 4USA A; 1PGX A; 4S17 A; 1N63 A; 2N0S B; 4HWI B; 2YVC A; 5H92 C; 3OG5 A; 2IO3 B; 3PS6 A; 2QMT A; 1D5M C; 2NVU I; 2MA9 B; 1E5W A; 1J7A A; 3AE3 B; 1HTQ A; 2V9H A; 3U8Z A; 1FNV A; 1ZXH A; 4FHK A; 2INP E; 2WDT B; 3VHT C; 3VRB B; 2WXN A; 2LXA A; 3FKY A; 3W9C B; 4LJP B; 4IWP A; 1QOG A; 5D7G A; 4E3C A; 1OQY A; 1ZUD 2; 2D3G A; 2G4S A; 3PTF C; 2GRI A; 3EFU A; 4GSW A; 3MHZ A; 4HDO A; 1LO5 D; 3FAH A; 5IA7 A; 1WZ3 A; 4LK0 M; 5L95 C; 5DPW A; 2BYV E; 3DQV A; 4EOY A; 1WGK A; 3RNC C; 3VH4 B; 2ZCB A; 3GZN I; 1SE3 A; 2WU2 B; 4K7S A; 3NS8 A; 2JYE A; 2G4D B; 2K0P A; 1P9D U; 4TSS A; 1J8C A; 1TY2 A; 2PEA A; 3SR6 A; 3V3X A; 1TZO A; 1DOX A; 2IZV B; 4B95 A; 2JT4 B; 1RLF A; 2PVG C; 2GBR A; 4IUM B; 1FD6 A; 4NAW A; 3NOB A; 1TKE A; 2AQ3 B; 4I6P A; 4BOZ B; 2KK8 A; 5IOI A; 3SFE B; 4IW0 A; 2BWE S; 2IY0 B; 1IPG A; 5IAA C; 3GE3 C; 2FE8 A; 4N9F 4; 2PW9 A; 1GUA B; 1WYG A; 4C7Y A; 5FR3 A; 2KAN A; 4QAY A; 2C60 A; 2GLS A; 4HPL B; 4AUQ C; 2WLB A; 1TS2 A; 4AQ7 A; 2OED A; 3IAS 1; 3AE6 B; 2CS4 A; 3NVY A; 2L0F A; 3P1M A; 3P4Q B; 2LVO A; 4OW0 A; 2IO1 B; 1K8R B; 3TEZ A; 2KDB A; 3WA0 A; 1NYQ A; 2KD0 A; 2MBB B; 1I4H A; 4C7Z A; 2K9X A; 3BZD B; 1GC7 A; 1KFY B; 4FJY A; 1GPX A; 1F9J A; 2WDQ B; 2AX5 A; 2KNB A; 2JX5 A; 4GU2 A; 2HD5 B; 2N7J A; 3AE2 B; 2JY6 A; 4BZA A; 2NTT A; 2MHJ A; 3BYT B; 2KTR B; 2RGF A; 3H1U A; 2RPQ A; 3R66 C; 3PT2 B; 5EDS A; 2BWF A; 1TS3 A; 3RI7 C; 3ETR A; 3U52 E; 2L7R A; 1WMH A; 2KJR A; 1SSN A; 2WNM A; 3DVN V; 3UGB B; 1V49 A; 5JZE B; 2RR9 A; 3IAM 1; 2GI9 A; 1EF1 A; 3QA8 A; 2WXK A; 1QF6 A; 3NRZ A; 3N1X C; 3QHT A; 2CJO A; 4HJK A; 5J17 A; 3ZGZ A; 3RNB C; 3DBH I; 3ZNI D; 4BKS A; 3A1Q B; 3AB5 A; 1FNU A; 2ONQ A; 3A9K B; 1J19 A; 2D3B A; 2V3N A; 3KW5 B; 4DXA B; 1WZ0 A; 3CF6 E; 4XDC A; 1S1Q B; 3M63 B; 5CTR C; 1XEE A; 4TUU A; 3H7P B; 1GC6 A; 1DGJ A; 2EMS A; 4LLG M; 1C4A A; 1V1P B; 3PLV A; 4EZJ A; 2C9W B; 3V6E B; 4CYE A; 3BK1 A; 3V60 A; 1EO6 A; 3RFZ B; 2ZPN A; 1V97 A; 2LHE A; 1EF5 A; 2LZ6 A; 4B0M A; 1F0Z A; 4OVV A; 1SXT A; 2KVR A; 2V4I B; 2N9E B; 1IBX A; 3VUW A; 2I38 A; 5E6N A; 2HTM E; 3JVZ X; 1UEL A; 2LRW A; 1WJ4 A; 2JF5 A; 5LLI A; 1ROE A; 1D5Z C; 1HZ6 A; 2EEL A; 1Y56 A; 1ZDV A; 4AJW A; 1CQV A; 4JWU C; 2IYD B; 1JML A; 3AUL A; 4PYZ A; 3RNF C; 1AAR A; 4MGZ E; 2L32 A; 1QIL A; 4KIK A; 3DWG C; 1I4G A; 1TY0 A; 3UIN B; 2WXO A; 1YOV B; 2LJI A; 4W9L A; 2RDB C; 3R2I A; 1GOZ A; 3C0R B; 2M1M A; 3SFD B; 4ZHP A; 1VDV A; 3EUB 2; 2L3Z A; 2L1A A; 4RCO A; 3GB1 A; 2LD9 A; 3D32 A; 2NTS A; 1V5T A; 1J0G A; 3AE1 B; 1ET6 A; 3VR9 B; 2QSD A; 1YIW A; 5H8Y E; 2K6Q A; 2FIF A; 3HIZ A; 3ZIM A; 4DHZ E; 4M0W A; 1GJZ A; 3Q14 C; 1F52 A; 5BMI A; 3QX1 A; 3P2B A; 2ACZ B; 2W82 A; 4I6L B; 2WQY B; 4KZC A; 1DYQ A; 1SE2 A; 2SEB D; 3RUL A; 3AM9 A; 4II3 B; 3A9J A; 1V81 A; 2C7M B; 1Z5S B; 3PZ7 A; 2BYT A; 3NJT A; 3ZVV A; 4MGI E; 4D2K A; 2GBN A; 2JRI B; 4EE2 A; 1E8X A; 2FUG 1; 1Z2M A; 3AU4 A; 2B76 B; 4GB9 A; 3VRA B; 3H6N A; 3APD A; 3A33 B; 1I35 A; 3TMP B; 2XN9 C; 3ZUN A; 3PRP B; 2JXT A; 1ZOY B; 2VH1 A; 3ZRF A; 1SE4 A; 3APC A; 1UNS A; 5G5H A; 2W3R A; 4JLC A; 5KHO A; 2QCZ A; 3L13 A; 4FAD A; 4NNJ B; 4RF1 A; 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3WCQ A; 3KYD D; 4MEL A; 3OWE B; 3RT3 B; 5E6O A; 2GBM A; 2MWS B; 2V3S A; 3A4S C; 3Q8B A; 3DVN U; 3APF A; 2IGH A; 2KHW B; 2QJL A; 3GOE A; 2BW2 A; 1YN4 A; 4NY0 A; 2XK5 B; 4M01 A; 1TBE A; 2KQ7 A; 4JQW C; 1ZPS A; 4MDK E; 1MG4 A; 2Z8L A; 4LNO A; 1KLV A; 4E71 A; 2HDE A; 4DHJ D; 4FHJ A; 2ZW1 A; 4K7W A; 3PVL A; 3ZW3 A; 2DZI A; 4K81 A; 4HPP A; 1EWY C; 4B0E A; 2L05 A; 3T8M A; 1KJT A; 3ZNZ B; 1QKZ A; 1XO3 A; 4IM3 A; 4DQO C; 2G3Q B; 2KJ6 A; 4IOI E; 1WSP A; 2RMM A; 1EM7 A; 2LMC A; 2LGX A; 2KTR A; 3C19 A; 3T3O A; 1I4X A; 4ICU A; 3RYT A; 3DBH B; 4IDI A; 3LYY A; 1J7B A; 4KGS A; 2KMC A; 2FNJ B; 2A4Z A; 2HTH A; 3DPD A; 1XT9 B; 3ZTC A; 2JRH A; 1YD8 U; 2L83 A; 3N1Z C; 1BT0 A; 3TEX A; 1P0R A; 4JPS A; 1U4A A; 3PRE A; 2WXI A; 4TKN A; 3LB8 C; 1ENF A; 5BYR A; 3R8B A; 5JHB A; 4NJ7 A; 4WWO A; 2DZM A; 2BB6 A; 2QIE B; 3A1Q A; 4BFR A; 4NPN A; 4ACF A; 3A9K A; 1WF9 A; 2K25 A; 2JZP A; 4HRO A; 3ZJT A; 2LFI A; 1SIF A; 1PDX A; 1MFW A; 4MEM A; 4KVG B; 2ON8 A; 5AEK B; 1I4P A; 5AUI A; 2BYE A; 2C5L C; 4DBG A; 1ZKH A; 1C76 A; 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