The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
|
sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
MQYKLHLHGKTLKGETTTEAVDAATAEHVFKHYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The double-histidine Cu2+-binding motif: a highly rigid, site-specific spin probe for electron spin resonance distance measurements.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
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| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Streptococcus sp. group g
|
| total genus |
15
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2014-09-19 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2N7J A; 4IKG A; 1F2R I; 4IOI E; 2K0P A; 3MP9 A; 1FD6 A; 1HEZ E; 1ZXH A; 2N9L A; 1EM7 A; 1GB4 A; 4OZB A; 3FIL B; 2JXT A; 4HJG E; 1C9F A; 2RMM A; 4KGT A; 2PLP A; 2KDM A; 4HKZ E; 1IGD A; 5HG2 A; 1MVK A; 1PGA A; 2JU6 X; 1UWX A; 2JWU A; 2KQ4 X; 5HFY A; 1Q10 A; 4WH4 A; 3GB1 A; 2ONQ A; 1JML A; 2N9K A; 5HI1 A; 1IGC A; 1MI0 A; 1MHX A; 1YNT E; 4OZC A; 1K53 A; 3UI3 A; 1F2R C; 2KAC A; 2PTL A; 4GLS C; 2ZW1 A; 1FCL A; 2PW9 A; 4MAC A; 2GB1 A; 2I38 A; 1P7F A; 1YMH E; 1D4B A; 2LHD A; 1XCT L; 5BMG A; 2J53 A; 2IGG A; 2GI9 A; 2QMT A; 2ON8 A; 2J52 A; 5BMI A; 2JSV X; 1FCC C; 1MPE A; 1GB1 A; 2JZP A; 1K52 A; 2LUM A; 1MHH E; 2NMQ A; 1KH0 A; 1P7E A; 4OZA A; 2LHE A; 1XCQ L; 1IBX A; 2KN4 A; 1PGX A; 2I2Y A; 2OED A; 1PGB A; 5BMH A; 4D2K A; 2RPV A; 1XF5 L; 1HZ5 A; 2IGH A; 4KGS A; 1K50 A; 5HHD G; 5JXV A; 3V3X A; 2IGD A; 1HZ6 A; 3FIL A; 4KGR A; 1K51 A; 2LGI A; 2KWD A; 2ZW0 A; 1IBX B; 1QKZ A; 2EEL A; 2QSD A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1RFK A; 4JGH B; 3CWI A; 3DVN V; 3EA6 A; 2WS3 B; 2KX3 A; 2N1V A; 1YN4 A; 3JSV B; 3HK0 A; 2WDV B; 2AQ2 B; 3A9K A; 4OZB A; 2HTM E; 1JRP A; 3RNG C; 1C4C A; 2DEN B; 4W9F A; 3SDL C; 2GBJ A; 2RDH A; 2L0T A; 2LMC A; 3WIM A; 4NAM A; 4LCD E; 2KMA A; 4HPL B; 4WH4 A; 5GXG B; 1UNS A; 1F77 A; 1GNU A; 3V60 A; 4C4V A; 2FCN A; 2BQQ A; 1L0X B; 4NPN A; 2G1E A; 2W54 A; 4DHZ E; 1YNT E; 1IP9 A; 5IOI A; 2K3U A; 2MBQ A; 1VLB A; 4XYC A; 2V4L A; 1KLV A; 1WXQ A; 2RD0 A; 1WXM A; 3VFK A; 1R7S A; 1D4B A; 2INP E; 2PIA A; 4XE0 A; 5DCN A; 2W3R A; 2IO3 B; 1MG8 A; 2KO3 A; 4MH0 E; 3VUX A; 2K9X A; 1YIW A; 3B0A A; 1MPE A; 4LK0 M; 1K52 A; 2FUH B; 3BK1 A; 1STE A; 3VVW B; 3W1S A; 1XQQ A; 3MJ5 A; 4JLC A; 4MEM A; 1M94 A; 2CU1 A; 3PLU A; 4WJQ A; 4GIV A; 5E6N A; 3PVL A; 4G50 A; 2BWF A; 3AU4 A; 1YQB A; 1GC7 A; 3AEE B; 5IN7 A; 3TEY A; 1VR9 A; 2JYE A; 3TL5 A; 5C3J B; 4WWP A; 1BXT A; 1IBX B; 3IAM 1; 5C23 A; 3NG0 A; 1X1M A; 1CQV A; 4IOI E; 4A6Q A; 4L2Y A; 2K0P A; 4NQK E; 4DWF A; 1XO3 A; 2LI5 A; 3AE4 B; 2C7H A; 4OVV A; 3S2A A; 1T6B X; 1WX9 A; 1CZP A; 4KGT A; 4QAY A; 4M0W B; 1C79 A; 1MVK A; 3PZ7 A; 2LEK A; 3KUZ A; 4TUU A; 2GBN A; 2C9W B; 5KHO A; 2KC1 A; 1SIF A; 2MH7 A; 2BW2 A; 3VTU A; 4YWG G; 2DX5 B; 3OLM D; 4YSZ B; 3URY A; 2BKF A; 1T0R C; 1E10 A; 3LB8 C; 3IHP C; 1MI0 A; 2WU5 B; 1P9D U; 1F2R C; 2YEP B; 4HDO A; 3UIO B; 3VHT C; 4MAC A; 2G45 B; 3PPA A; 1P7F A; 1ZE3 D; 3ML8 A; 1B9R A; 3D32 A; 1L4Z B; 1WX8 A; 5E6P A; 4MM3 A; 3Q69 A; 3WAN A; 2LUE A; 3WAP A; 3CST A; 3W2D A; 1JAL A; 1UF0 A; 4C7Z A; 2LZ6 A; 1ESF A; 2UU7 A; 1I7H A; 3KH0 A; 1YJ1 A; 2JZP A; 4PT5 A; 2L76 A; 1OQR A; 1P7E A; 4A3O A; 5LXH A; 2WXI A; 2KNB A; 3PZ8 A; 5AEK B; 1ZDX A; 4ZRQ A; 1WGY A; 3Q3M C; 2CKH B; 2OJW A; 2JY6 A; 1K50 A; 4F7Z A; 2AX5 A; 5IO9 A; 3AEA B; 2J0K A; 3B2F A; 4BOS C; 3KQ4 A; 1V5O A; 2EKE C; 2MRP A; 1ET9 A; 1J7B A; 3A1Q B; 4XZ4 A; 1WGR A; 2K6Q A; 4G11 A; 2ZW0 A; 1OGW A; 2VZK D; 1XLP A; 4CHK A; 4YSY B; 3FC4 A; 4ICU A; 3MP9 A; 2WNM A; 3U30 A; 4RH6 A; 1HEZ E; 4LTU A; 4ANU A; 4LNK A; 1XLO A; 2NR2 A; 4MGI E; 4GDL A; 3HM3 A; 4IUM B; 4DHJ B; 2KFK B; 1TJE A; 3GZN I; 2RR9 A; 2QDF A; 3ALB A; 3RNE C; 3AM9 A; 2MBH A; 3AEC B; 4LDT B; 1T0Y A; 1FMA D; 2WHI A; 3M95 A; 2WGS A; 2JQR B; 2L05 A; 4B6W A; 2BYT A; 4LNI A; 1E8W A; 4DDI D; 1LXD A; 3UI3 A; 4R3D A; 1C76 A; 1TY0 A; 4GDK B; 3DWG C; 2JT4 B; 1V1O A; 1WE6 A; 2IO0 B; 1I4R A; 4P16 A; 2MX2 A; 4WJO A; 2MWS B; 3R7R A; 5J17 A; 2D10 A; 2NMQ A; 1JWB D; 4XDD A; 3ZVV A; 4XDC A; 4I6L B; 4RGM A; 3KYC D; 4ZRP A; 2V3N A; 2WXR A; 4JL9 A; 5E6O A; 2N7E A; 3M62 B; 1I42 A; 1JWM D; 3AE8 B; 1SE9 A; 4ANW A; 1ZOY B; 3APC A; 4WWO A; 3UIN B; 4LNN A; 1N5W A; 1TZ1 A; 3QQ8 B; 4HRS A; 5G2N A; 1QOB A; 2JYT A; 2K6D B; 2D3C A; 3NVZ A; 3DDC B; 4HPP A; 2PE6 B; 5FR6 A; 2DAJ A; 1TYG B; 3ABV B; 3VUY A; 1WRI A; 3B9J A; 1N6Z A; 3RNA C; 3IT6 B; 4DQO C; 4NJC A; 4PS7 A; 4GOC A; 3HM6 X; 3T9L A; 4G0N B; 2RGF A; 2QJL A; 3BY4 B; 2JF5 A; 1OFF A; 3P63 A; 1EO6 A; 4WQO B; 3M3J A; 3RUL A; 3ZDM C; 2B76 B; 3ZTD A; 1JML A; 1YX6 B; 1QZE A; 1SF0 A; 1UUP A; 3H7S A; 5HI1 A; 2YVC A; 1E8X A; 3ZUN A; 4WJP A; 1ZGU B; 2AQ1 B; 1I35 A; 2I38 A; 1NVI D; 2MSE D; 4GXB A; 4N58 A; 2HJ1 A; 4HLE A; 2LXC A; 2J4X A; 2LVO A; 3AE3 B; 3DHI C; 4AJW A; 3BVM A; 2VZK B; 1BT0 A; 4HEA 1; 2JVC A; 2PEA A; 4HCP B; 5DPW A; 3GE3 C; 1PGX A; 2OED A; 2LRW A; 1N62 A; 2QIE B; 2XN9 C; 2K22 A; 4S0R A; 3A33 B; 1N60 A; 3ETR A; 2IGH A; 5D2M B; 2KMM A; 5J18 A; 2KT7 A; 4JWU C; 1OEY J; 2IZV B; 3JSV A; 1YX5 B; 4NJ7 A; 2QEJ C; 5D3D A; 5T8I A; 2CS4 A; 3ZNH B; 1HZ6 A; 2M1M A; 2BYF A; 4US9 A; 2KFJ A; 2MEK A; 2MBO A; 1CJE A; 4O1N A; 3L16 A; 1WGD A; 2UWQ A; 2PE9 A; 4DDG D; 1EU4 A; 2V3S A; 4AUQ C; 1V8C A; 1VDV A; 1B1Z A; 1DGJ A; 1E5W A; 4FXC A; 4LJO B; 2X38 A; 1YQ4 B; 1Y56 A; 4IW0 A; 2OJR A; 2BS3 B; 1GB4 A; 1J0G A; 4MGZ E; 4HJG E; 2HDE A; 2RPQ A; 5LLI A; 5H8Y E; 3EEC A; 5AZF A; 4BVU C; 3NRZ A; 2KQ4 X; 4RFB A; 4HCN B; 4NJ6 A; 2IPK D; 4RGT A; 2H89 B; 3Q14 C; 4HJK A; 2ZNV C; 4IM3 A; 1VCB A; 2FE8 A; 3MJW A; 1CK1 A; 4GLS C; 1G6J A; 3ZJU A; 4YTP B; 2PKO A; 2FUG 1; 4ZYN A; 4BZA A; 4I6P A; 3EFU A; 5IAA C; 3BII D; 2IGG A; 3I9V 1; 3APD A; 4ANX A; 1J7C A; 3ZQ4 A; 4HKQ A; 3U8Z A; 1ZDV A; 3ZJV A; 1LM8 B; 2WXO A; 5G5G A; 2K8C A; 2NTT A; 2FID A; 1BML C; 2L8J A; 4RGN A; 2ZEQ A; 1IBX A; 2KN4 A; 2LWP A; 1D5Z C; 1PGB A; 1FRD A; 3TCA A; 2D3B A; 4UDU C; 1VRA B; 2GMI C; 3AE2 B; 4DXA B; 2V0G A; 4XWT A; 1TY2 A; 4TMA B; 4FJZ A; 2MCN B; 1WF9 A; 3L08 A; 1FPY A; 3NZU A; 2CHX A; 2EMS A; 3ZRC A; 3RZF A; 3RYT A; 1R4N B; 1PFD A; 2MHJ A; 1ZPS A; 4M0W A; 3O13 A; 1GUA B; 3PRP B; 2KWV B; 3V61 A; 2BTE A; 4B0M A; 4BKS A; 2NBU A; 2L1A A; 1I4G A; 2K1F A; 3I57 A; 4MGK E; 1J8C A; 1HQR D; 2KVZ A; 2PJH A; 1FM0 D; 3SFD B; 4EZK A; 2K5P A; 2WX0 A; 2PLP A; 3VH3 B; 2KDM A; 1R4M B; 2IYD B; 5HG2 A; 2ACZ B; 1PGA A; 3MHZ A; 4K81 A; 1UWX A; 3DBH B; 3K9O B; 5JZE B; 3VR9 B; 3PLV A; 3VQI A; 2ASQ A; 2Z8L A; 2N9K A; 4YXD B; 3DHH C; 3HVZ A; 3E9S A; 2L3Z A; 3BWU D; 1WM3 A; 1ENF A; 5L95 C; 1FCL A; 4W9C A; 1Y8R C; 4ANV A; 1YN5 A; 4P6V F; 2ON8 A; 2J52 A; 2UYZ B; 3DBR B; 1NDD A; 1WGH A; 4L23 A; 1C4P A; 4BKG A; 3A1Q A; 3AUL A; 3KUC B; 3DBS A; 3P4S B; 3E56 A; 3TEX A; 1JWU D; 2NVU I; 4W9L A; 2L32 A; 4CQN A; 3N3K B; 4DHJ D; 1NEN B; 2JZ3 B; 5HKH A; 4HVB A; 3MC0 B; 3B2G A; 1WZ3 A; 1UGM A; 3Q2A C; 2AWT A; 4GGQ A; 4LDT D; 1OQY A; 2KDB A; 1UZX B; 4F8C B; 4XWW A; 4P1B C; 1WR1 A; 3TEW A; 5LXI B; 2KFK A; 1RFA A; 3I3T B; 1E6E B; 1HA5 A; 2WLB A; 1YOV B; 3HVD A; 2O2V B; 2J0J A; 2WU2 B; 1UWM A; 2FNJ B; 3CMM B; 2WXP A; 1PYW D; 1RYJ A; 2Z0D B; 2MP2 B; 4TSS A; 2I1J A; 1FO4 A; 1EF1 A; 1DOY A; 3RUI B; 3QJZ A; 4LNO A; 4ARC A; 1EF5 A; 2DAF A; 1T0S C; 2WDQ B; 2M56 B; 4MJS B; 3BVG A; 4MH8 A; 4F1S A; 2KC2 A; 1VZ7 A; 4K1R B; 2MBE A; 5HFY A; 3U2S C; 4IWP A; 2D3A A; 3PHX B; 1I4P A; 3OAW A; 2CR5 A; 3SD5 A; 1Z5S B; 3DBL B; 4EUT A; 4C56 C; 3QAQ A; 2DYM A; 3AV8 A; 3N30 A; 2E3T A; 2MW5 A; 1J7A A; 4G3X B; 2ZW1 A; 4AOF A; 3HUI A; 4EEW A; 1D5M C; 4MGY E; 2D07 B; 2CJN A; 2ZCC A; 1KOT A; 1V1P B; 1JW9 D; 5BYS A; 4P1C C; 5FK9 C; 2WP9 B; 2KD0 A; 4ITK A; 3C19 A; 4PS8 A; 1MHH E; 1KRH A; 2KX0 A; 3HIZ A; 4OZA A; 2AQ3 B; 3X0W A; 5CX3 A; 1E7V A; 1VJK A; 2GRI A; 4B95 A; 5D7G A; 2KHW B; 1WI0 A; 2QHO A; 5EE0 A; 1FNU A; 3GOE A; 3P4Q B; 2C5L C; 1F9J A; 4E71 A; 1J19 A; 1T3Q A; 3N20 C; 4US8 A; 2WXK A; 1QQR A; 4MDK E; 2NPT B; 2MQJ A; 4OVZ A; 4DHZ B; 1WJ6 A; 1ZP0 B; 2CU3 A; 3QAR A; 2WQY B; 3KYD D; 2ICI A; 2H88 B; 3PRE A; 4N59 A; 3RNF C; 3W5V B; 1C78 A; 4E74 A; 2W3S A; 2KOX A; 4KDI C; 2J0M A; 1SJE D; 1TKY A; 2KDF B; 2KLC A; 4PS3 A; 2HE7 A; 3X23 A; 3ZIM A; 3UQB A; 3A9K B; 4MT5 A; 1WRD B; 4BBN F; 3QC8 B; 4BFR A; 1L0Y B; 1TBE A; 2JUO A; 1WM2 A; 3UQA A; 2PVO D; 1S3S G; 3PS6 A; 2PPH A; 3DPD A; 3IT4 B; 3GB1 A; 5DPT A; 4FBJ B; 1R4M I; 2KAN A; 1D5X C; 4C4V B; 4BAX A; 4DXG A; 3A9J B; 3DBH I; 4WJN A; 1IGC A; 1Q0W B; 2LFI A; 3IBE A; 1TS5 A; 4IM2 A; 3VAW A; 2KYW A; 1F52 A; 2KWC A; 4GSW A; 4S17 A; 4W9G A; 4TQ1 A; 2QMT A; 3ZRF A; 5BMI A; 1YN3 A; 2CHW A; 3JYU A; 2NTS A; 2J7Q B; 3I5J C; 5CTR C; 4K7W A; 2OHF A; 2KMC A; 1ACC A; 3DBR I; 3VUW A; 2GOW A; 4W9K A; 3P1M A; 3QHT A; 4MEL A; 2C7N B; 3AE7 B; 1P98 A; 1XT9 B; 1FNV A; 3CSF A; 3JW0 X; 3EHV A; 2R61 A; 4A55 A; 1UH6 A; 2N1W A; 2KKC A; 3V3X A; 1TKG A; 2DYO A; 4KGR A; 2WDT B; 4KKI A; 2A5U A; 4ZHP A; 3UGB B; 2I1K A; 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2LVQ A; 4YSX B; 3K9P B; 3RI7 C; 2ZZP B; 2VH2 A; 1SEB D; 3NY5 A; 2XNA C; 2LXA A; 1FD6 A; 3ZW3 A; 4WIP A; 1TS4 A; 1ZXH A; 1E9M A; 2IO1 B; 4RM8 A; 3ZXR A; 2FCQ A; 4GDL B; 4ZHO A; 4WUR A; 1EUV B; 3N1Y C; 3PRZ A; 2GBK A; 4EZL A; 3CIR B; 1L6V A; 3R66 C; 1NBF C; 3NS1 A; 1JQ4 A; 1MFW A; 3OJ3 A; 2JZZ A; 3IAS 1; 1ZXI A; 3OWE B; 3WAM A; 1I4X A; 1TIF A; 4TQ0 A; 3R2T A; 1UGJ A; 1QLB B; 3VTW A; 3WAL A; 1FFV A; 2MA9 B; 3EGR A; 4KIK B; 3TIX A; 2SEB D; 1MG4 A; 3V05 A; 3W5U B; 3QCA A; 1FFU A; 1TKE A; 5DPS A; 2HTH A; 3NZ3 A; 4AS1 A; 2K8B A; 3BK2 A; 3L17 A; 2G3Q B; 4JX1 C; 1P3Q U; 3Q6B A; 2BPS A; 2L0F A; 5CHW A; 2ZCB A; 1GB1 A; 2IJ0 A; 1KFY B; 1FIQ A; 4W9H A; 4W9D A; 2SAK A; 4NZL B; 2JRH A; 3U7Z A; 2D2Q A; 5AUI A; 1KTK A; 2O2V A; 1WFY A; 1N61 A; 2G9H D; 1IYF A; 4RM9 A; 2MP2 A; 4HK2 A; 2K25 A; 4AP4 C; 2IGD A; 4KZC A; 1QOF A; 3GE8 C; 4MJS A; 4MSM B; 1F1H A; 4K3C A; 1FXI A; 2KN5 A; 2JXX A; 1FRR A; 2LVP A; 2BYE A; 2KJR A; 2YLM A; 2WXL A; 4GN1 A; 2NCN A; 3DWM A; 1OQQ A; 3RZW C; 1L6U A; 1YJJ A; 4GMV A; 2HJ8 A; 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