The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
|
sequence length |
56
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structure length |
56
|
Chain Sequence |
MQYKLILNGKTLKGCTTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Rotameric preferences of a protein spin label at edge-strand beta-sheet sites.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
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| molecule tags |
Immune system
|
| source organism |
Streptococcus sp. group g
|
| total genus |
14
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
|
| chains with identical sequence |
B, C, D, E, F, G, H
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-05-22 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KWD A; 1MHH E; 1Q10 A; 2GB1 A; 2J53 A; 1F2R I; 4KGS A; 1MHX A; 1YMH E; 2PLP A; 4IKG A; 1GB1 A; 3MP9 A; 4GLS C; 1PGA A; 1F2R C; 4WH4 A; 1GB4 A; 2OED A; 3GB1 A; 4KGR A; 5BMI A; 4OZC A; 1XCQ L; 2ZW1 A; 2EEL A; 1FD6 A; 1P7E A; 2N9K A; 2ZW0 A; 2ON8 A; 2LHE A; 5HHD G; 1XF5 L; 1EM7 A; 1FCL A; 2IGG A; 2N9L A; 2PTL A; 1C9F A; 1MPE A; 4IOI E; 3FIL B; 2IGD A; 4OZB A; 1IGD A; 5BMH A; 1HEZ E; 1IBX A; 2RMM A; 5HFY A; 1ZXH A; 2N7J A; 1D4B A; 2IGH A; 1MVK A; 3V3X A; 2KQ4 X; 2J52 A; 4HJG E; 1IBX B; 2ONQ A; 2LGI A; 4OZA A; 3FIL A; 5HG2 A; 1P7F A; 4KGT A; 2RPV A; 4HKZ E; 1JML A; 2KAC A; 2JSV X; 2JU6 X; 5JXV A; 5BMG A; 2QSD A; 1YNT E; 1PGX A; 4MAC A; 1HZ5 A; 1FCC C; 1PGB A; 1QKZ A; 2JXT A; 1IGC A; 4D2K A; 1MI0 A; 2K0P A; 2PW9 A; 1XCT L; 1KH0 A; 1HZ6 A; 1K53 A; 1K50 A; 1K51 A; 3UI3 A; 1UWX A; 5HI1 A; 2I38 A; 2NMQ A; 2GI9 A; 2LHD A; 2I2Y A; 2KDM A; 2JZP A; 2JWU A; 1K52 A; 2KN4 A; 2LUM A; 2QMT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1WXV A; 2OOB B; 4XGA B; 1I7H A; 2G3Q B; 1E8Z A; 4IWO A; 4ARI A; 4ACF A; 4GLS C; 1VRA B; 4ANX A; 4KGR A; 3L10 B; 2O6V A; 2ZVN A; 4DDG D; 5C3J B; 1WGG A; 4LNF A; 4N6E B; 2KWV B; 4RNA A; 3ZIM A; 1AW7 A; 4W9K A; 2FE8 A; 1J7B A; 1V5T A; 1RRB A; 2IY0 B; 2GBM A; 2YLM A; 3L0W B; 4HCP B; 2GBK A; 1IP9 A; 3AE7 B; 4TKN A; 5CHF A; 3DBR B; 4TMA B; 1UH6 A; 2RMM A; 2DYB A; 2DX5 B; 1TY0 A; 2IY1 B; 1MVK A; 4TV3 A; 3HM3 A; 3O13 A; 4K7S A; 3AU5 A; 1WRI A; 4AS1 A; 1YD8 U; 2D07 B; 4HJG E; 1L6U A; 2NTS A; 1FEH A; 1EF5 A; 2C9W B; 3A9J A; 1C4C A; 4NAW B; 4HKQ A; 4MH8 A; 3D32 A; 3AM9 A; 2WDV B; 1WFY A; 3BY4 B; 3EGR A; 1J7A A; 2VZK D; 3Q8A A; 1NVI D; 3QAQ A; 2QCZ A; 1XXG A; 1WGD A; 3AI5 A; 4C80 A; 2I1K A; 2KWU B; 3KQ4 A; 3ZGZ A; 2W82 A; 1R4N I; 1PFD A; 2O2V B; 3VAW A; 2DLB A; 4GGQ A; 2WX1 A; 4XX5 A; 4E3C A; 4DHJ D; 2GI9 A; 4NJ7 A; 4RGM A; 4MEL A; 2KDM A; 3BVM A; 2N9P C; 2UWQ A; 2PE6 B; 1ZDX A; 1VZ7 A; 3AE4 B; 3L54 A; 2N9X A; 3PT2 B; 4IWQ A; 4PK1 A; 2KWD A; 5D3I B; 3L08 A; 4HPP A; 2D3B A; 5JHA A; 5MPO A; 3PTF C; 2BVC A; 1QOG A; 2ICI A; 4CQN A; 1WM3 A; 1H4R A; 4DXF A; 2PVO D; 1UWM A; 2ZZP B; 1TS5 A; 4GMV A; 3Q3N C; 1V97 A; 4W9G A; 2ZW1 A; 2AQ3 B; 3NHE B; 2KJR A; 3WA0 A; 3Q3O C; 3A1Q A; 4YSX B; 3PRZ A; 3PLU A; 2MBH A; 4UDU C; 2WU5 B; 4KDI C; 5T8I A; 3DBL I; 3Q8F A; 4TUU A; 4EFO A; 2WDR B; 1V2Y A; 1FXA A; 3P4S B; 1V9J A; 2KJ6 A; 3OLM D; 1V1O A; 3KW5 B; 2FNJ B; 3PZ8 A; 1ZP0 B; 2L0F A; 1N60 A; 5KHQ A; 5FKA C; 5EE0 A; 3EHV A; 1CZP A; 4MGY E; 4P1C C; 3N3K B; 3WAO A; 3M63 B; 2BYE A; 3C0R B; 4GDL A; 4DHZ B; 1MI0 A; 1ROE A; 2PW9 A; 2KAN A; 3RMK C; 2CU1 A; 1HZ6 A; 1TZ1 A; 2JYE A; 3VR9 B; 3Q69 A; 2HE7 A; 2DNF A; 4GU2 A; 3AU4 A; 4US8 A; 4G11 A; 1Z2M A; 1Q1O A; 2M0X A; 1I4H A; 2HD5 B; 3H7S A; 3TL5 A; 1GOZ A; 3TMP B; 2LGS A; 1KLG D; 2WXO A; 2R2Q A; 3ETR A; 3LYY A; 2V4L A; 3RCZ A; 1QZE A; 5DPS A; 3ZJV A; 4XYC A; 3NG0 A; 2KC1 A; 1E7U A; 2FBW B; 1WGH A; 3URY A; 1UEL A; 3PLV A; 5FR6 A; 4KGS A; 2PLP A; 2JXX A; 2N4F A; 1HXY D; 3ABV B; 4B6W A; 2CJO A; 4AJW A; 5LLI A; 4FAD A; 2PPH A; 3VQI A; 2L83 A; 2MP2 A; 4LLG M; 1ISN A; 3O65 B; 1GUA B; 5FR3 A; 1J7C A; 5GXG B; 4KKI A; 1TBE A; 2FAZ A; 1JRP A; 2O6V B; 1FM0 D; 4FA6 A; 1AYF A; 1WY8 A; 2LWP A; 2M0A A; 2L76 A; 1B9R A; 5J18 A; 1JWM D; 1WE6 A; 3NY5 A; 2IND C; 2MJ3 A; 5E6N A; 1IBX A; 1N62 A; 1KOT A; 2WX0 A; 3IBE A; 2W9N A; 3MC0 B; 3WAL A; 1ZPS A; 4HRO A; 3NUH B; 4C7Z A; 1NBF C; 2PMV A; 2DEN B; 1FXT B; 2BWF A; 2LGD A; 4BBN F; 1J19 A; 3RUI B; 4MM3 B; 4M8M A; 3H7P A; 4NJC A; 3ZTC A; 4JGH B; 2LJI A; 2KMA A; 3A9J B; 1E7V A; 3SEB A; 3Q8B A; 3R8B A; 3CST A; 4DK5 A; 4NZL B; 3AEC B; 4ARC A; 2JX5 A; 2D2Q A; 2KT7 A; 2RDH A; 4M00 A; 5J2R A; 5CX3 A; 2LD9 A; 1BUI C; 4JWS C; 3AB5 A; 2KTF A; 3PGE A; 1AWD A; 2C7N B; 4IM0 A; 4LTU A; 3PHX B; 2FIF A; 2MLB A; 3AE6 B; 1XT9 B; 1WXQ A; 2LUM A; 2LJ5 A; 4EKU A; 4MDK E; 3V6C B; 1I4G A; 4RGN A; 3JVZ X; 1LQB A; 2N0S B; 4NJ6 A; 5D3D A; 3K9P B; 1KLV A; 1ZOY B; 3HIZ A; 1ZE3 D; 1YMH E; 3RNE C; 1SF0 A; 1PGA A; 3NJT A; 3GS2 A; 1SE2 A; 4WH4 A; 2LMC A; 3QX1 A; 3GE8 C; 2DBY A; 4A20 A; 4OZC A; 3VRA B; 5DPR A; 1M4V A; 3IHP C; 2CJN A; 2HDE A; 3LDZ E; 2KDE B; 2IJ0 A; 1L4D B; 1J0G A; 4F1S A; 3UGB B; 1J8C A; 2WWZ A; 2DYM A; 4BBN C; 4EEW A; 3LB8 C; 3N1X C; 4ASW C; 3B2F A; 3NVW A; 1SE9 A; 1ZXH A; 3W1Y A; 4ZRQ A; 1L0V B; 3V05 A; 4XDD A; 4YWG G; 3ML9 A; 1KTK A; 1UNS A; 3ZO5 B; 4C56 C; 2KDB A; 4FJY A; 3KLS X; 5D7G A; 1UBI A; 2M1M A; 5IO9 A; 2AQ1 B; 4PS7 A; 3A4R A; 1GG3 A; 2M56 B; 2E6X A; 1YNT E; 4P7I A; 1N5X A; 2L7R A; 3MC8 A; 4II3 B; 2BT6 A; 4GIV A; 4I6P A; 1TT5 B; 2MQJ A; 2MWS B; 1TJE A; 4IW0 A; 5G5H A; 2BWE S; 2KC2 A; 4FBJ B; 1YX5 B; 2DYO A; 1E90 A; 4DWF A; 2HTH A; 3CSF A; 3TEX A; 3MJ5 A; 4GDL B; 1T3Q A; 1UWX A; 2V1Y A; 4G50 A; 4EZJ A; 1D6E C; 3WAM A; 3R7Q A; 5CTR C; 1BT0 A; 4B9K A; 2MJD A; 2JZP A; 2WXG A; 3R7R A; 5BO4 B; 1V8C A; 1WGK A; 3Q14 C; 1WX9 A; 2QMT A; 4R3D A; 4WJN A; 3U30 A; 3DBH I; 4ZRK A; 2K5P A; 1AAR A; 4TQ0 A; 1T0Q C; 2V0G A; 2JRH A; 4BZA A; 5DCN A; 4WAA A; 4E71 A; 3MFG A; 3AEF B; 2BS2 B; 1JWS D; 3DQV A; 4LCD E; 1ET9 A; 4O1N A; 4TSS A; 3OG5 A; 2QDF A; 2BKF A; 3ONS A; 5IP4 D; 1EUV B; 3RN9 C; 4S0R A; 1T6B X; 2RPQ A; 1U4A A; 2JQR B; 3EA6 A; 4B0E A; 1D5M C; 1C3T A; 1YJJ A; 3H1U A; 4OZB A; 1C76 A; 2RDG A; 4CYE A; 1FNW A; 5G5G A; 2LAS A; 1Q0W B; 4KVG B; 1R4N B; 1UF0 A; 1IBX B; 1FMA D; 1T0Y A; 5HG2 A; 1UGJ A; 1D3Z A; 2NPT A; 5BMG A; 1N6Z A; 5AEK B; 4NPN A; 2LFI A; 1D5X C; 1G6J A; 5E6J A; 3H7P B; 3QAR A; 1Y8R C; 3EC8 A; 3H9D A; 5C2T B; 4E74 A; 1K53 A; 1R7S A; 3VHT C; 3BII D; 1F77 A; 4LNO A; 3H6N A; 4M8N A; 1VD2 A; 1DYQ A; 3AEB B; 3RFZ B; 3KUZ A; 3TEW A; 3ZXR A; 2K1F A; 3QC8 B; 3CF6 E; 1QLB B; 3T9L A; 2W3R A; 4EZK A; 4WJO A; 2O6V D; 2J53 A; 4XDC A; 1WZ3 A; 2M19 A; 1GPX A; 5TR5 A; 2QC8 A; 3MC9 A; 2FUH B; 3BVZ A; 1GB4 A; 5D2M B; 3BWU D; 4BAX A; 1XLN A; 2EEL A; 3QJZ A; 2K8H A; 3IAM 1; 2ZW0 A; 2KX3 A; 3V61 A; 4ITK A; 2D11 A; 3PO0 A; 4PYZ A; 1WR6 E; 3P4R B; 3ZLZ A; 4HWI B; 4AJY B; 4YSY B; 2IGD A; 1IGD A; 5L95 C; 3ZNH B; 1HEZ E; 4I6L B; 3M95 A; 2JPH A; 1UD7 A; 5CHV C; 2FCM A; 1E8Y A; 1MFW A; 3FC4 A; 3ZJU A; 2QIL A; 2C60 A; 2CR5 A; 1C78 A; 1UUP A; 2IPK D; 2WYQ A; 1JWA D; 2ZPN A; 2XK5 A; 3ZQ4 A; 4RF0 A; 2H88 B; 4ZOH C; 3IT6 B; 1WJU A; 1E10 A; 4MGK E; 1HZ5 A; 4AOF A; 2I1J A; 1QKZ A; 1R4M I; 2WS3 B; 2JXT A; 1KM7 A; 4YL8 A; 2K0P A; 2W55 A; 2V4I B; 4G0N B; 4MEM A; 4MM3 A; 2ACZ B; 3WIM A; 3HHM A; 4N58 A; 3PVL A; 4XWW A; 1GAQ B; 2BQQ A; 3AED B; 3JW0 X; 3AE5 B; 4IM2 A; 3BIN A; 1KRH A; 3EUB 2; 1Q5W B; 3DHH C; 2BS4 B; 1TS2 A; 4IG7 B; 2J0M A; 3AMZ A; 4REZ A; 3OJ4 B; 2WXJ A; 2V9H A; 4I6N B; 1PYW D; 3RNA C; 2GB1 A; 4LNK A; 2YEP B; 3UQB A; 2BS3 B; 3U2S C; 1V86 A; 1CJE A; 3U8Z A; 3R2T A; 1WX7 A; 4OVZ A; 3UIN B; 4ZHO A; 2KQ7 A; 1OFF A; 5BMI A; 1NYQ A; 1NDD A; 1CK1 A; 3UQA A; 4FLH A; 1DOI A; 4TQ1 A; 2ZEQ A; 5LXH A; 1GNU A; 5IAA C; 2MBB B; 3MHZ A; 1M94 A; 3TJP A; 1SGH A; 3T8M A; 4BOZ B; 1ZUD 2; 1SJE D; 1FO4 A; 3HVD A; 3FKY A; 1WYW B; 3ZXV A; 3L17 A; 4AWJ A; 1DOY A; 3OWE B; 4BOS C; 2G45 B; 1F52 A; 1E9M A; 2LI5 A; 2RPV A; 2WGS A; 2IYD B; 1TS4 A; 2JU6 X; 1WWT A; 1PGX A; 3B0A A; 4HPM B; 5IN7 A; 1OQR A; 4N9F 4; 2NPT B; 3VVW B; 1CMX B; 1BXT A; 1BML C; 3ZRC A; 2J0K A; 3DPD A; 1IGC A; 4JQW C; 5H92 C; 1XLQ A; 4OW0 A; 1KLU D; 1WXS A; 2KMC A; 2WXR A; 3ZUN A; 4RM9 A; 1VZ8 A; 4KIK A; 1KH0 A; 1F0Z A; 4IM3 A; 1FFU A; 1SEB D; 3RZW C; 3IT4 B; 4HVB A; 5HI1 A; 4RH6 A; 2LHD A; 4NQL B; 3AEE B; 1WF9 A; 2PKO A; 2KTR A; 1TIF A; 3ZJT A; 2KOX A; 4J6I A; 2WXM A; 3QIJ A; 4B95 A; 2NVU I; 1V6E A; 2QHO A; 3FAH A; 1E5W A; 3Q3F A; 1V80 A; 4MH0 E; 2K22 A; 1YJI A; 4AP4 C; 1HTQ A; 1WJ6 A; 3B1L X; 2W54 A; 2V3S A; 4W9E A; 4WWN A; 2WXP A; 4BKS A; 5BYS A; 1F2R C; 3W5U B; 1LXD A; 1UBQ A; 4M01 A; 2OED A; 2EMT A; 2ZPY A; 3I63 C; 2K3U A; 1XCQ L; 4HLE A; 5GMV A; 1WJ4 A; 2KWC A; 4GB9 A; 4JPS A; 3SFE B; 4LNI A; 1SBB B; 3HRD D; 1JWU D; 4EZL A; 3DBS A; 4GSW A; 1MJD A; 4W9D A; 2A4Z A; 2PVG C; 2WHI A; 3SFD B; 1TKY A; 4DXA B; 3GE3 C; 2GLS A; 5HFY A; 1H8C A; 1QIL A; 1VZ6 A; 4K7W A; 1OQY A; 1YN5 A; 4L2Y A; 4OZA A; 2ZCB A; 3S2A A; 2MW5 A; 4G3X B; 2QIE B; 3AE8 B; 5G55 A; 3VTU A; 2KHW B; 4MSM B; 1Y56 A; 2JSV X; 2EKE C; 2NCN A; 2MBQ A; 3KUC B; 2MA9 B; 3KH0 A; 2MRP A; 1PGB A; 1I4P A; 3NVZ A; 2JWZ A; 3RI7 C; 3V62 A; 2XK5 B; 2XNA C; 3DBH B; 4WJP A; 1XCT L; 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1WXM A; 3OAW A; 2KTR B; 3H8H A; 2HTM E; 1E8W A; 1Q10 A; 3A33 B; 1X1M A; 3SU8 X; 4XWT A; 4YTM B; 4IWP A; 1ESF A; 3VTV A; 4WIP A; 2G4D B; 3GB1 A; 3AE3 B; 5E6P A; 1FD6 A; 2XN9 C; 4XE0 A; 2ZJD A; 3ECI A; 1ENF A; 3I57 A; 3PRE A; 1E8X A; 1XF5 L; 2V3N A; 4S17 A; 2IGG A; 3IFW B; 2BYT A; 2PTL A; 3KWL A; 2QEJ C; 2WXQ A; 4ZYS A; 3M62 B; 5JZE B; 1R4M B; 2GBR A; 4FJZ A; 1IPG A; 3VUY A; 4B0M A; 3P1M A; 2L1A A; 2NR2 A; 4QAY A; 1ACC A; 1FNV A; 2JYT A; 4KX6 B; 2MEK A; 2CU3 A; 2J52 A; 3HM6 X; 3OJ3 A; 3ZDT A; 3RUL A; 4HKZ E; 1JML A; 3VTW A; 3DOW A; 3U4E G; 1SE3 A; 3LJ3 A; 2N9E B; 2DAF A; 1JRO A; 2K39 A; 4PS8 A; 2DAJ A; 3UIP B; 3APF A; 3R2I A; 3P63 A; 3Q3J A; 4HPL B; 4USA A; 5AZG A; 1WIA A; 2BF8 B; 2KDI A; 1WZ0 A; 4KZC A; 4NAM A; 5EE1 A; 4A3O A; 4W9I A; 4HDQ A; 3JYU A; 3RZF A; 5IA7 A; 4N59 A; 2KMM A; 4ZRJ A; 5D94 A; 1E7P B; 1FPY A; 2J4X A; 3RD2 A; 3A9K B; 3P4P B; 4LK0 M; 1MHH E; 3A4S C; 5KHO A; 3T3N A; 3NRZ A; 1S3S G; 1MHX A; 3B08 A; 1AN8 A; 2R2O A; 2Y3A A; 2SAK A; 1P7E A; 3PSE B; 1ZGU B; 3N9Y C; 2MCN B; 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