The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
|
sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
MQYKLILNGKTLKGCTTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Rotameric preferences of a protein spin label at edge-strand beta-sheet sites.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Immune system
|
| source organism |
Streptococcus sp. group g
|
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
|
| total genus |
14
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
|
| chains with identical sequence |
B, C, D, E, F, G, H
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-05-22 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4GLS C; 2ZW0 A; 2RMM A; 1C9F A; 1HZ6 A; 1PGA A; 1PGB A; 2KWD A; 1K52 A; 1IGC A; 1MHH E; 5HI1 A; 1MVK A; 3MP9 A; 1FD6 A; 3UI3 A; 1MHX A; 3GB1 A; 2QMT A; 5BMI A; 2OED A; 4WH4 A; 1HZ5 A; 4OZB A; 2JZP A; 5HHD G; 2I38 A; 3FIL B; 2PW9 A; 1EM7 A; 4KGT A; 1JML A; 2ON8 A; 1K51 A; 1KH0 A; 1MI0 A; 2KQ4 X; 2NMQ A; 2LHE A; 4KGS A; 2N7J A; 1XF5 L; 2I2Y A; 2LGI A; 2QSD A; 1XCQ L; 2JSV X; 4KGR A; 2PLP A; 1ZXH A; 2ONQ A; 2JXT A; 5BMH A; 2KN4 A; 1P7E A; 3V3X A; 5HFY A; 1D4B A; 1XCT L; 1MPE A; 4OZC A; 4OZA A; 1IBX B; 2IGG A; 2RPV A; 1K53 A; 1YNT E; 5HG2 A; 1PGX A; 3FIL A; 1UWX A; 1P7F A; 2PTL A; 2GB1 A; 2ZW1 A; 2IGH A; 5JXV A; 2LUM A; 1K50 A; 4HJG E; 2N9L A; 1F2R I; 2LHD A; 1HEZ E; 1YMH E; 4IOI E; 4MAC A; 4HKZ E; 2J53 A; 1F2R C; 2J52 A; 2KDM A; 1Q10 A; 1FCL A; 1IBX A; 2IGD A; 5BMG A; 2K0P A; 2EEL A; 4D2K A; 2N9K A; 1IGD A; 1GB1 A; 2GI9 A; 2JU6 X; 1FCC C; 1QKZ A; 1GB4 A; 4IKG A; 2JWU A; 2KAC A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1TYG B; 1WIA A; 2TSS A; 4YXD B; 2VZK B; 3SD5 A; 3AE6 B; 1XT9 B; 4J6I A; 2M56 B; 2KJH B; 2WXP A; 1SXT A; 4NNJ B; 2WXJ A; 1WR6 E; 1V86 A; 2I38 A; 1M94 A; 2JY6 A; 1JWU D; 1F0Z A; 2R61 A; 1TZO A; 2NCN A; 2JX5 A; 3TL5 A; 2KQ4 X; 2FCQ A; 1DOI A; 3B08 A; 3MHS D; 3PLU A; 4C7Z A; 1LFD A; 3NHE B; 4ARC A; 2D10 A; 2JRH A; 1D6E C; 3AE1 B; 3VVW B; 4DXG A; 2LJI A; 3W5U B; 2JZ3 B; 1IYF A; 5BMH A; 3OLM D; 4KKI A; 4CQN A; 3V3X A; 5GXG B; 1ZP0 B; 1V1O A; 3VR9 B; 4OZA A; 1EF5 A; 1NYR A; 3ZDT A; 1HQR D; 1YNT E; 4A6Q A; 1PGX A; 4J3O D; 2PTL A; 2L8J A; 4OW0 A; 1VZ6 A; 4ZDV A; 1N5W A; 3B1L X; 2BW2 A; 1L0X B; 4HDO A; 5DCN A; 4ASW C; 4W9D A; 1YMH E; 5BO4 B; 5LNK 1; 1XO3 A; 2PE6 B; 4JWU C; 1E5W A; 2JRI B; 1V6E A; 4WQM A; 1FCL A; 2ZZP B; 3KYD D; 4TKN A; 2WNM A; 1WJU A; 3ZJV A; 3DWG C; 3GZN B; 2L00 B; 3RNB C; 3NS1 A; 2QJL A; 2V3P A; 3MHZ A; 1N5X A; 1GB1 A; 1HA5 A; 2RDH A; 1SE4 A; 2KJ6 A; 3M95 A; 3UQB A; 2YEP F; 2DEN B; 2DX5 B; 2QHO A; 2WYQ A; 4GLS C; 2K8H A; 1WH3 A; 2J42 A; 4HCN B; 3AED B; 1WRD B; 2WXQ A; 5J2R A; 3ML8 A; 2WU5 B; 1AN8 A; 5IN7 A; 1R4N B; 1WR1 A; 1WGD A; 2KQ7 A; 3MC9 A; 1YQ3 B; 3DVG X; 2IYD B; 4BOS C; 3Q8C A; 2MW5 A; 2ZCB A; 1ZDV A; 1XLN A; 3R66 C; 3L10 B; 2KMM A; 2WS3 B; 3NRZ A; 1VRA B; 4F7Z A; 4JE3 B; 4KKJ A; 2MCN B; 1P98 A; 1SE3 A; 2WXR A; 3R7R A; 4AOF A; 1U4A A; 4GDL A; 4H2A A; 2KAN A; 2HTM E; 3AE8 B; 1SSN A; 4PS8 A; 5AUK A; 2MWS B; 2Z0D B; 4RFB A; 2GBN A; 4GU2 A; 2N4F A; 3BVG A; 3DDC B; 1QOA A; 1E8X A; 1D5X C; 4S0R A; 2IDY A; 1ENF A; 4N59 A; 4RGT A; 1TS5 A; 3UIN B; 3CST A; 4KSK C; 4WIP A; 1IGD A; 4B95 A; 2WDR B; 3PHW B; 4HPP A; 4MH0 E; 4B9K A; 5FR3 A; 2L76 A; 3OAW A; 2QEJ C; 2EMS A; 4IDI A; 4HVB A; 3B9J A; 4GDK B; 4ACF A; 4DHJ B; 4YTP B; 2MQJ A; 4YWG G; 1YQB A; 2KFK A; 4B6W A; 1DOY A; 4DQO C; 1MFW A; 3H9D A; 2GRI A; 3TEY A; 1MHX A; 4N58 A; 3IAS 1; 4Q2J A; 2L0F A; 4A20 A; 3ZIM A; 2GLS A; 5DPT A; 3DBR I; 1J8C A; 3QJZ A; 4HRO A; 1JW9 D; 1ZGU B; 1WX9 A; 2Y5C A; 1WYW B; 2L7R A; 3DVN V; 1ZXH A; 2DYB A; 2H88 B; 3EFU A; 1F77 A; 1WJ6 A; 4AJY B; 3TIX A; 3Q3O C; 4EEW A; 1K53 A; 2O2V B; 2BBC A; 2MP2 B; 3IT6 B; 3R2T A; 4ZRK A; 3SR6 A; 3GE8 C; 3NOB A; 5AEK B; 1C3T A; 2ZW1 A; 3APF A; 2UWQ A; 1ZPS A; 1FFU A; 3RD2 A; 5D7G A; 2W3S A; 3HVZ A; 1F2R I; 3E56 A; 5IP4 D; 1NEK B; 1ESF A; 3L16 A; 3N20 C; 3UIP B; 1TTN A; 1NYQ A; 4TSS A; 2K22 A; 4WJO A; 3NG0 A; 4MGY E; 4WJQ A; 4GN1 A; 4ITK A; 3PZ8 A; 4TUU A; 1IUE A; 2L0T A; 1MG4 A; 2AL3 A; 2Z0E B; 2O6V A; 1MG8 A; 1AW7 A; 3ALB A; 4JWS C; 1T0S C; 5LXH A; 1AYF A; 3Q3F A; 2GBM A; 4IWO A; 2FCM A; 4CHK A; 2I1J A; 2MJE A; 3SU8 X; 1LM8 B; 3M3J A; 1SIJ A; 1KLV A; 2XEW A; 1M4V A; 4K7U A; 2NVU I; 5EE9 A; 2INN E; 2INC C; 2YVC A; 1UH6 A; 4P16 A; 5E6J A; 3ZJU A; 1J19 A; 2RMM A; 5D2M B; 2DYM A; 3AE9 B; 5AZH A; 1ET6 A; 3BYY B; 1EU3 A; 3MP9 A; 1I4X A; 4ANU A; 4M00 A; 3WAL A; 3TEW A; 4NJC A; 4WJN A; 2V4L A; 2FIF A; 2MBB B; 1SF0 A; 3BY4 B; 2DZM A; 2LMC A; 2LXC A; 4K3B A; 3VXW A; 1GG3 A; 2W3R A; 1E7P B; 2LVP A; 2KO3 A; 3H8H A; 4C4V A; 3NY5 A; 1CJE A; 2XNA C; 1L4Z B; 2NMQ A; 4YSZ B; 2LHE A; 1SEB D; 3ZXV A; 2LGI A; 2E3T A; 2JSV X; 5IA7 A; 1JAL A; 1WX7 A; 1ZOY B; 2KN5 A; 1V2Y A; 2KT7 A; 5HFY A; 1KFY B; 3PPA A; 4OZC A; 2C5L C; 1Z5S B; 5JHA A; 4C56 C; 2BYV E; 4IC7 B; 1T0Y A; 3SDL C; 3Q8E A; 5C1Z A; 3ONS A; 1WZ3 A; 4BVU C; 5JXV A; 2L32 A; 3MTN B; 2MJD A; 2R2O A; 1HEZ E; 3P63 A; 1UGJ A; 4EE2 A; 3PGE A; 4HKZ E; 3AE4 B; 1YX5 B; 3S2A A; 1I4R A; 2DWQ A; 1V80 A; 1SIF A; 2K9X A; 2LJ5 A; 2XK5 B; 2KC2 A; 2KFJ A; 3DHG C; 3TEZ A; 1V9J A; 2ZCC A; 5FK9 C; 2KOX A; 4US9 A; 4YTM B; 1KOT A; 4ZRQ A; 3VRA B; 3NVZ A; 2MBH A; 3AV8 A; 2EMT A; 4GB9 A; 4ANW A; 2BF8 B; 2BS4 B; 1IPG A; 1SJE D; 1KLU D; 4WUR A; 1J0G A; 2MHJ A; 4I6P A; 5DPW A; 3EHV A; 4OVU A; 2KWC A; 1WI0 A; 1E90 A; 1MVK A; 3AU4 A; 3FKY A; 4RGO S; 4XC2 A; 3QAQ A; 1FRD A; 4W9G A; 2NBU A; 2JYE A; 3DCG A; 3SFE B; 1QOB A; 4LDT D; 4G50 A; 3A4R A; 1YJ1 A; 1TGZ B; 2WDQ B; 1I4Q A; 3BIN A; 1KH0 A; 2KYW A; 4NAM A; 2C9W B; 4BZA A; 4KGR A; 4TQ1 A; 2PLP A; 1TY0 A; 3P1M A; 2L52 A; 1XQQ A; 1Q5W B; 1T0R C; 2I1K A; 4MT5 A; 2BWF A; 3ZLZ A; 4URK A; 4W9F A; 5BYS A; 2O6V D; 4GSW A; 3U52 E; 1C4P A; 3RN9 C; 1P7F A; 1D5Z C; 1YJI A; 4RGN A; 4I6L B; 2DLB A; 2MRP A; 4TMA B; 3Q14 C; 4HJG E; 4PT5 A; 1N6Z A; 4C7Y A; 1LO5 D; 1UGM A; 5H8Y E; 4IOI E; 1WF9 A; 3R7Q A; 5AZG A; 1PQS A; 3ZNZ B; 1F2R C; 3J9C A; 4LNN A; 4PYU A; 2N7E A; 1FNV A; 4A90 A; 2BT6 A; 4WWN A; 1PFD A; 1XLP A; 1L0Y B; 2M17 A; 4NY0 A; 2KLG A; 2M19 A; 3KUZ A; 2DZI A; 2IY0 B; 4MEL A; 2SAK A; 2RSU A; 1WMH A; 2L83 A; 2M0X A; 1T5X D; 2D11 A; 3WAM A; 3M63 B; 4HCP B; 3IVF A; 3NZU A; 1ZKH A; 3HRD D; 1Q1O A; 2KXJ A; 1HZ6 A; 2VZK D; 1WE7 A; 1IGC A; 1WJ4 A; 1L7Y A; 2VH2 A; 1XXG A; 4HRS A; 1WYG A; 1GC6 A; 5TR5 A; 3W2D A; 3ABV B; 3ZQ4 A; 2E6X A; 3NZ3 A; 3O13 A; 3ZW3 A; 1D3Z A; 1I4H A; 4F8C B; 3PRE A; 1DOX A; 1YJJ A; 1FO4 A; 3L17 A; 3V6E B; 2M0A A; 3VH3 B; 2GBK A; 1WGR A; 1VZ8 A; 4GDK A; 4HPM B; 1FIQ A; 3JSV B; 3RPF C; 3IHP C; 4BKS D; 1FFV A; 1EWY C; 4MJS B; 2QSD A; 5G5G A; 2AEH A; 2KVZ A; 3PO0 A; 1EO6 A; 4FJZ A; 4GGQ A; 2B3A A; 3QA8 A; 1FM0 D; 3TEX A; 1QOF A; 3CWI A; 3NUH B; 1N60 A; 5JHB A; 1BXT A; 4N9F 4; 2BTE A; 1P9D U; 1E0Z A; 2Y3A A; 1VLB A; 1NI2 A; 4JPS A; 4NQL B; 5IO9 A; 4A3O A; 2WX1 A; 1ACC A; 2N9P C; 4YT0 B; 2M4N A; 2SEB D; 4AUQ C; 3OJ3 A; 2ZJD A; 2RPQ A; 4NZL B; 3GP7 A; 3FC4 A; 1C76 A; 2C60 A; 3PRP B; 3EUB 2; 1Z2M A; 3N1X C; 5D3D A; 4HWI B; 3L0W B; 1ZXI A; 4OVV A; 1OEY J; 1HE8 A; 2DNF A; 2O2V A; 3FAH A; 2MP2 A; 1UEL A; 5CX3 A; 2PIA A; 4K7W A; 3HM6 X; 3NVV A; 3V05 A; 4HDQ A; 3T3N A; 1UD7 A; 1ET9 A; 3QIJ A; 3WAP A; 4M0W B; 3ZNH B; 1ROE A; 2KAC A; 3RUI B; 1NDD A; 1PGA A; 2KX3 A; 4RF0 A; 1K52 A; 2KKC A; 1MHH E; 2INP E; 1C4A A; 1WFY A; 1WRI A; 3DVG Y; 2D3G A; 3UI3 A; 3DBR B; 4US8 A; 3CMM B; 4RH6 A; 2YLM A; 5G5H A; 4KIK B; 4NAW B; 3T8M A; 2LRU A; 3QWZ B; 5HHD G; 4MSQ B; 4CO7 A; 1J7A A; 3KYC D; 2ZPY A; 4II2 B; 4AP4 C; 1UWM A; 2J0K A; 3Q3M C; 3EEC A; 3P4Q B; 4REZ A; 2CU1 A; 3AUL A; 2FUG 1; 3MJW A; 3TSS A; 4E3C A; 2KDF B; 2KZR A; 1AAR A; 2JXX A; 1TY2 A; 1XCQ L; 2NR2 A; 4JLC A; 3PVL A; 2KHW B; 2JXT A; 2Q5W D; 1IBX B; 2FE8 A; 2PPH A; 1VD2 A; 3Q2A C; 5J17 A; 1YN3 A; 5I4D A; 1VCB A; 1WM2 A; 1OQR A; 2IBI B; 1JCK B; 5EE0 A; 1YN5 A; 3LYY A; 2NBV B; 4MGZ E; 3KUD B; 3C19 A; 3I57 A; 4LTU A; 1T6B X; 2LGS A; 3VHT C; 2W54 A; 1T0Q C; 5TSS A; 1C79 A; 3AU5 A; 2X38 A; 2RDB C; 1QQR A; 2XN9 C; 4ZRP A; 2L05 A; 2LFI A; 2JYT A; 1WMH B; 2QC8 A; 4L23 A; 2B76 B; 2EKI A; 3HHM A; 2FCN A; 2KLC A; 1E7U A; 1HTQ A; 1FRR A; 2WDV B; 3MFG A; 2LRW A; 2MJ3 A; 2QDF A; 3LB8 C; 4DHJ D; 2CS4 A; 2XK5 A; 3PHX B; 4LNK A; 2QMT A; 4LNF A; 3RZW C; 1EF1 A; 4EZJ A; 4JX1 C; 2K39 A; 4DXA B; 1XEE A; 4AJW A; 3P4R B; 3A9K B; 2WXF A; 4TV3 A; 1H4R A; 2HJ1 A; 5FKA C; 2DZJ A; 1MI0 A; 3ETR A; 2V1Y A; 1B1Z A; 2I2Y A; 3U7Z A; 1V81 A; 1UUP A; 2G45 B; 3ML9 A; 3ZRF A; 3ZNG C; 3QK0 A; 2LZ6 A; 1KJT A; 2LAS A; 2LWP A; 3PTF C; 2L3Z A; 2LGX A; 3JVZ X; 5JH5 C; 1GAQ B; 2REX A; 1GUA B; 4XE0 A; 1S3S G; 4ZYN A; 1YOV B; 2MLB A; 4MAC A; 1LGR A; 1UZX B; 3W1S A; 4EUT A; 3TBL D; 1V1P B; 2W82 A; 3DOW A; 3AEG B; 2AQ1 B; 2BYF A; 4K1R B; 2J0J A; 4L2Y A; 3VUX A; 1JWA D; 3VH4 B; 3W1S C; 3AE3 B; 3QAR A; 5CHW A; 3N30 A; 1L2N A; 4IM2 A; 1J7B A; 1VDV A; 5GMV A; 3LXF A; 2IPK D; 2BYT A; 1KLG D; 4NPN A; 1E10 A; 3C0R B; 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1PGB A; 3B2F A; 4ZRJ A; 3ZDM C; 4GIV A; 3IG3 A; 2LVQ A; 3VFK A; 4FN2 A; 3IFW B; 5EE3 A; 4CYE A; 2A5U A; 1QIL A; 3H6N A; 3DBL I; 3TUO A; 2KDE B; 2AWT A; 3VUY A; 5D3I B; 4XGA B; 2LUE A; 4WQO B; 4M0W A; 3H1U A; 1E7V A; 4YSY B; 3RT3 B; 3I63 C; 1JRU A; 4WJP A; 2DAF A; 1RYJ A; 2D3A A; 4WWM A; 1EUV B; 2M1M A; 4ANV A; 4G11 A; 4HJK A; 1FXT B; 1I7H A; 2NPT B; 1RAX A; 4KIK A; 4NAW A; 2KTR B; 3M62 B; 1I42 A; 1XLO A; 1KF6 B; 4ZHP A; 2CJO A; 1BT0 A; 5IKC M; 1QZE A; 4IUM B; 3BK1 A; 1V97 A; 3KWL A; 4LK0 M; 4MM3 B; 2LHD A; 1V5T A; 3K9O B; 1IP9 A; 4NJ6 A; 2V0G A; 4FJV B; 2AL6 A; 3OJ4 B; 2J53 A; 1RWS A; 4AS1 A; 3VRB B; 1OTR B; 3BYT B; 2K1F A; 4JQW C; 3Q3N C; 3HM3 A; 3X23 A; 4IW0 A; 1IBX A; 4RF1 A; 2PEA A; 1OGW A; 4YSX B; 4W9C A; 2BWE S; 3AXC A; 4FJY A; 3NS8 A; 4E74 A; 2EKE C; 3IBE A; 4M8N A; 5H92 C; 2MA9 B; 2FAZ A; 3VTV A; 2CU3 A; 2ASQ A; 3PRM B; 4YTN B; 3PV1 A; 3W5V B; 4TQ0 A; 4O1N A; 4ZHO A; 2AQ2 B; 1RFA A; 4F1S A; 1SJH D; 3ZXR A; 1C78 A; 3Q69 A; 4R3D A; 4EZK A; 3BII D; 3VDZ A; 3ZTD A; 1WSP A; 3DHH C; 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