The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
|
sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
MQYKLILNGKTLKGCTTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Rotameric preferences of a protein spin label at edge-strand beta-sheet sites.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Immune system
|
| source organism |
Streptococcus sp. group g
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| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
|
| total genus |
14
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
|
| chains with identical sequence |
B, C, D, E, F, G, H
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-05-22 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4KGS A; 4OZB A; 1Q10 A; 5HHD G; 2JWU A; 5HG2 A; 1IBX B; 5JXV A; 1FCL A; 1IGC A; 2RMM A; 1PGX A; 1MHX A; 2LHD A; 2KN4 A; 1IBX A; 1HZ6 A; 2PTL A; 1K52 A; 2EEL A; 5BMG A; 2JZP A; 4KGR A; 2OED A; 2KDM A; 2QMT A; 1GB4 A; 1YNT E; 4MAC A; 1XCT L; 2ZW1 A; 2I38 A; 1EM7 A; 1P7F A; 1MI0 A; 2JU6 X; 1K50 A; 2QSD A; 5BMI A; 5BMH A; 4GLS C; 1UWX A; 1ZXH A; 1F2R C; 2JXT A; 4HKZ E; 2J52 A; 1QKZ A; 2PLP A; 1F2R I; 2JSV X; 2IGH A; 1FD6 A; 2I2Y A; 2RPV A; 3FIL B; 3GB1 A; 1C9F A; 2IGD A; 1IGD A; 1PGA A; 1XCQ L; 2KAC A; 2K0P A; 2N9L A; 2IGG A; 1JML A; 1PGB A; 2NMQ A; 2ON8 A; 4OZC A; 1MPE A; 2LGI A; 1GB1 A; 1KH0 A; 1YMH E; 1FCC C; 4IKG A; 2J53 A; 2ZW0 A; 2N7J A; 2LHE A; 1K51 A; 5HFY A; 4KGT A; 2GI9 A; 2N9K A; 2LUM A; 5HI1 A; 4WH4 A; 4OZA A; 3UI3 A; 1HZ5 A; 2KWD A; 4HJG E; 3MP9 A; 2GB1 A; 4IOI E; 3FIL A; 4D2K A; 3V3X A; 1P7E A; 1HEZ E; 1XF5 L; 2ONQ A; 1D4B A; 1MHH E; 2KQ4 X; 1MVK A; 1K53 A; 2PW9 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2IJ0 A; 4H2A A; 4OVV A; 4BKS A; 1NDD A; 1LGR A; 4NZL B; 5DPT A; 1VJK A; 2WX1 A; 1NYQ A; 1V6E A; 2DYO A; 1QZE A; 1D5M C; 5LXI B; 2WU5 B; 5CX3 A; 4IUM B; 2G9H D; 3R7R A; 4MSQ B; 4LDT D; 2EEL A; 1YJI A; 2AEH A; 2MBO A; 4XWT A; 1V97 A; 4MGZ E; 5D6J B; 2BS2 B; 4DXA B; 3H7S A; 2KX0 A; 1P7F A; 2JT4 B; 4XYC A; 4IWQ A; 2KTR A; 3AEB B; 3HHM A; 1M94 A; 5BYS A; 3HM6 X; 3NG0 A; 4FBJ B; 3HUI A; 1L4D B; 2H88 B; 4G3X B; 1ACC A; 4KIK A; 2JXT A; 2D07 B; 3L17 A; 5FK9 C; 2KVR A; 3BY4 B; 3IBE A; 2LZ6 A; 3PLU A; 1I4Q A; 4KKI A; 4II2 B; 1OQR A; 1TT5 B; 4GN1 A; 4F1S A; 1AN8 A; 1CMX B; 2GLS A; 2KOX A; 2MCN B; 4DDI D; 3C0R B; 1N61 A; 2INP E; 3AEG B; 2K9X A; 1L2N A; 3I57 A; 1LXD A; 1FCC C; 3AE9 B; 2N0S B; 3N1Y C; 1P3Q U; 2D3B A; 2WNM A; 4KZC A; 1I4G A; 1VLB A; 4JIO U; 3VR8 B; 4LCD E; 1P7E A; 1UZX B; 2CHX A; 1WSP A; 4WAA A; 4WUR A; 2WXO A; 3IVF A; 3VUX A; 4M0W A; 4YTP B; 2KFK B; 1T3Q A; 2W3S A; 1WRI A; 2BGF A; 4IC7 B; 2MLB A; 2ASQ A; 3Q6B A; 4EUT A; 3BK1 A; 4NQL B; 3A1Q B; 2Z0D B; 3H7P A; 1PGX A; 1P9D U; 1E8X A; 4JWU C; 1XLO A; 1FFV A; 1TTN A; 2J4X A; 2XN9 C; 3LXF A; 4KZ0 A; 2MRP A; 2I38 A; 1JWA D; 2WDR B; 2Z0E B; 4REZ A; 3ZNI D; 2BS3 B; 1WZ0 A; 5BMI A; 3UF8 A; 1WJ6 A; 2LVP A; 3U2S C; 3AB5 A; 1ZKH A; 3DDC B; 3OLM D; 4HKZ E; 2KN5 A; 3B9J A; 1GPX A; 3L16 A; 2PLP A; 2E6X A; 3LB8 C; 4GDK B; 5BO4 B; 3V05 A; 1E10 A; 1FD6 A; 3ZXR A; 1CQV A; 3DHI C; 1WZ3 A; 3AED B; 5G5H A; 1UH6 A; 3GS2 A; 1F77 A; 1JML A; 1TS4 A; 2LUE A; 1E6E B; 2WXF A; 3VAW A; 4S17 A; 3T3O A; 3PPA A; 1L5P A; 4EKU A; 2DHZ A; 1WRD B; 2MQJ A; 4C56 C; 1FXT B; 2DAJ A; 2LUM A; 1DGJ A; 3LDZ E; 2I1J A; 2GB1 A; 2WHI A; 1U4A A; 2K3U A; 3BK2 A; 4YTN B; 4ZOH C; 4KKJ A; 3DBH B; 1CJE A; 4W9L A; 2G3Q B; 1R4N B; 5KHO A; 4RFB A; 3DVN U; 3DVG X; 5HG2 A; 3RYT A; 4RF1 A; 2MSE D; 4ZRK A; 3AU4 A; 2JX5 A; 4W9D A; 1P1A A; 4M8M A; 3AE6 B; 4BKG A; 3W2D A; 1YIW A; 1D3Z A; 3SD5 A; 1K52 A; 1L7Y A; 4NJC A; 4KVG B; 1KM7 A; 3Q2A C; 4TUU A; 3IT4 B; 4WJN A; 4A8X C; 3Q8B A; 1GB4 A; 3AE8 B; 2AL6 A; 2G1E A; 5JHB A; 5FR3 A; 4FAD A; 3AE5 B; 1WI0 A; 3Q8C A; 4W9H A; 1JRO A; 3CF6 E; 1V80 A; 1XT9 B; 2DAF A; 3CST A; 3L4P A; 1TY0 A; 1ZOY B; 2D11 A; 2EKE C; 2BQQ A; 2DX5 B; 2KDF B; 4EEW A; 3GOE A; 1WWT A; 3ENE A; 3LYY A; 2CHW A; 1NBF C; 2FUH B; 2WXL A; 1XO3 A; 3VFK A; 3KLS X; 5I4D A; 5CTR C; 1KLV A; 1IGD A; 1N62 A; 2C7N B; 2K0P A; 2MBE A; 4M0W B; 4HCN B; 1ZXI A; 5C23 A; 1PGB A; 1TS2 A; 2G4S A; 4W9E A; 2QDF A; 3HVD A; 3BVM A; 1JWM D; 2UU7 A; 1FRD A; 2J53 A; 3OJ3 A; 1QF6 A; 2V4L A; 4HDQ A; 1EWY C; 2GBN A; 3KYD D; 1V49 A; 2R2O A; 2GI9 A; 2CU3 A; 1C78 A; 4MGY E; 4GU2 A; 4J6I A; 2BYT A; 2WDV B; 4X57 B; 1WFY A; 3AE4 B; 2LJI A; 2RPQ A; 1ESF A; 4HDO A; 5BYR A; 1DOI A; 3UIP B; 2HJ1 A; 4C7Y A; 2M1M A; 1ZDX A; 3Q8F A; 4HK2 A; 1LQB A; 1LFD A; 1PYW D; 1ZPS A; 3MHS D; 4EOY A; 2DZI A; 2RR9 A; 1I4X A; 2LRW A; 3AV8 A; 4EFO A; 1WJN A; 1HTO A; 1NI3 A; 2LHD A; 5D3D A; 2FIF A; 5D7G A; 3R7Q A; 2KQ7 A; 3HRD D; 3HK0 A; 2RGF A; 3NJT A; 4G11 A; 5J17 A; 2TSS A; 1UEL A; 3VTV A; 2ZW1 A; 4NJ6 A; 1EM7 A; 2KJH B; 1NYR A; 2G4D B; 2KTF A; 3RZW C; 3BIN A; 1YN4 A; 3RNG C; 4ZRJ A; 5AUI A; 3DWM A; 2IYD B; 3PTF C; 4ZDV A; 2N1V A; 2FCN A; 5IO9 A; 5J2R A; 4W9C A; 2DYM A; 1UWX A; 4KV2 A; 2EMS A; 3WAM A; 4JLC A; 3TEZ A; 5CHF A; 1Y56 A; 2X38 A; 2LWP A; 2BPS A; 2V0G A; 1UNS A; 1R7S A; 4K1R B; 2QCZ A; 4RCO A; 2NCN A; 2FBW B; 3BYY B; 1AAR A; 3JVZ X; 3PHW B; 4WIP A; 3N3K B; 1KH0 A; 4ZRP A; 1D5Z C; 1VCB A; 2Y5P A; 3NZ3 A; 4GB9 A; 3CMM B; 4NPN A; 1P98 A; 3W5V B; 4MM3 A; 4WJO A; 2V1Y A; 3B1L X; 4IG7 B; 4HEA 1; 3RCZ A; 3RNA C; 1R4M I; 3KWL A; 1V5O A; 2BT6 A; 3V6E B; 1XD3 B; 4D2K A; 3T8M A; 1HEZ E; 1SGH A; 3NRZ A; 4NJ7 A; 4LJP B; 1D4B A; 3VR9 B; 1J7A A; 2KDB A; 3X23 A; 3PRE A; 2KMM A; 5H8Y E; 4F8C B; 4C4V B; 3W1Y A; 2VH1 A; 2RDH A; 3RUL A; 3ZKJ C; 3R3M A; 4GGQ A; 1S3S G; 4GIV A; 5L95 C; 2KN4 A; 3PT2 B; 1Z2M A; 1YN3 A; 3VRB B; 1KRH A; 5AEK B; 4I6L B; 3RD2 A; 2OED A; 1R4N I; 3ZJT A; 4AUQ C; 1CK1 A; 3PHX B; 3W1S A; 3DBR I; 1SB3 C; 1E9M A; 1HQR D; 4ITK A; 2IY1 B; 2KWV B; 3AU5 A; 2VH2 A; 3GZN B; 3L54 A; 4XDC A; 1C3T A; 3P2B A; 1TKY A; 5IOI A; 4ICV A; 4LNN A; 4TSS A; 5T8I A; 4W9G A; 3PSE B; 1JWB D; 3N9Y C; 4XGA B; 3QQ8 B; 2KD0 A; 3ZRF A; 1F9J A; 1TGZ B; 1VZ8 A; 3KUD B; 4Q2J A; 3TMP B; 1TIF A; 3V6C B; 3EFU A; 4A55 A; 4HWI B; 3D32 A; 5GXG B; 4IKG A; 2QC8 A; 4NAW A; 4ZRI A; 2JWZ A; 4BAX A; 4MH0 E; 3N1X C; 1IP9 A; 1JWU D; 3RNF C; 2OOB B; 2RSU A; 5E6J A; 4LNI A; 3RNC C; 2AX5 A; 2INC C; 1SJE D; 2CKH B; 4IOI E; 4BOZ B; 3IHP C; 1D6E C; 3V60 A; 4IWP A; 1MHH E; 2AYO B; 4B95 A; 5IN7 A; 3M95 A; 1K53 A; 1YD8 U; 3ML9 A; 1OGW A; 3PLV A; 4TKN A; 3WAL A; 4K7S A; 1NVI D; 2RMM A; 3ZJU A; 2PEA A; 4BBN F; 3PS6 A; 1TYG B; 2L00 B; 5JZE B; 4DBG A; 3PGE A; 4N59 A; 4YT0 B; 4NY0 A; 2KQS A; 1RWS A; 2Y5C A; 2DZJ A; 4WWM A; 3FC4 A; 1UBI A; 3Q14 C; 3EHV A; 4KDI C; 1WH3 A; 1XQQ A; 4ARI A; 1V9J A; 4MM3 B; 2MJE A; 3AM9 A; 1HTQ A; 1YOV B; 1VRA B; 1ZXH A; 4NQK E; 5C1Z A; 4N58 A; 4K7W A; 2KX3 A; 1E8Y A; 2AQ1 B; 1V1P A; 2L0F A; 5E6N A; 4AWJ A; 4W9K A; 1JWS D; 1C4C A; 3UQA A; 1C9F A; 5LLI A; 2IGD A; 2A4Z A; 1JAL A; 2N9X A; 3M62 B; 2PMV A; 2NMQ A; 4USA A; 2LGI A; 5L83 A; 2KT7 A; 4FJZ A; 1WXM A; 2PJH A; 1SIF A; 4WWO A; 1KJT A; 2Y3A A; 5BYQ A; 1K51 A; 1RYJ A; 1DOX A; 3Q69 A; 4PS3 A; 1XEE A; 4K7U A; 4HJG E; 2XK5 A; 3RNE C; 3MP9 A; 4FHK A; 4ANW A; 4OVU A; 2N9P C; 3NS1 A; 2LXC A; 1JQ4 A; 1YX6 B; 1B1Z A; 2PW9 A; 2WXI A; 2ZEQ A; 1MFW A; 3S2A A; 2ZJD A; 4DHZ B; 1ENF A; 4MJS A; 4HXD A; 1VZ6 A; 2UWQ A; 1ET9 A; 1E5W A; 3QAQ A; 3IT6 B; 2RD0 A; 4ACF A; 3N32 A; 2GBR A; 2KZR A; 4PS8 A; 3HM3 A; 4RGM A; 3VDZ A; 1IBX A; 3NVV A; 2PTL A; 3AXC A; 4GDL A; 1DYQ A; 3VTU A; 3QCA A; 2JZ3 B; 3APF A; 4OW0 A; 1XLP A; 1I35 A; 3KYC D; 4MDK E; 4RH6 A; 2M56 B; 4I6N B; 2YLM A; 5JHA A; 2MP2 A; 3QWZ B; 1WGR A; 2N4F A; 5AZF A; 2QSD A; 2G45 B; 3B2G A; 1L4Z B; 4NAW B; 1UGM A; 4GLS C; 2O2V A; 4AQ7 A; 1T0Y A; 1F2R C; 3I5J C; 3BYT B; 3DOW A; 3URY A; 1F2R I; 3TEW A; 1YQ3 B; 2FCS A; 1JW9 D; 2MBB B; 1ROE A; 2XEW A; 1JRP A; 1FM0 D; 2DBY A; 1WYW B; 2WU2 B; 2OJR A; 2BBC A; 1PFD A; 1N6Z A; 2MWS B; 3H6N A; 3GZN I; 1Y8R C; 5C2T B; 4RGT A; 2BTE A; 2K25 A; 4IM3 A; 2L32 A; 3Q3M C; 2L05 A; 1I42 A; 4ASW C; 3FAH A; 3ZQ4 A; 2KJ6 A; 4KGT A; 1I4H A; 1QQR A; 3TL5 A; 3R2I A; 1BUI C; 1R4M B; 1WMH A; 4BZA A; 3ALB A; 4FHJ A; 2KLG A; 4LNF A; 2CHZ A; 2WXH A; 3P4P B; 4CHK A; 1RM6 C; 3RFZ B; 2K5P A; 3RMK C; 2REX A; 2MBH A; 3H9D A; 3JW0 X; 4DQO C; 5JXV A; 4PYU A; 1TKG A; 2NBV B; 2W54 A; 4RF0 A; 4LJO B; 2QHO A; 1V5T A; 3OG5 A; 2WXM A; 1FEH A; 4MH8 A; 4BVU C; 1N63 A; 2JXX A; 1RAX A; 2GRI A; 2KTR B; 3NVW A; 3GE8 C; 3ONS A; 1RRB A; 3SHQ A; 3ZRC A; 1RLF A; 5DCN A; 1BT0 A; 3MC0 B; 1QLB B; 3DBR B; 4KIK B; 3UIN B; 2KHW B; 2BW2 A; 2HJ8 A; 2DZM A; 2MJD A; 4CO7 A; 2QJL A; 1C76 A; 1QT9 A; 4EZJ A; 4XC2 A; 3ZNG C; 1KOT A; 2M0A A; 4ANX A; 3WA0 A; 3IXS A; 3GB1 A; 2CS4 A; 4JE3 B; 3EEC A; 2AQ2 B; 2M8S A; 1L0Y B; 2QEJ C; 1S1Q B; 1E90 A; 5TSS A; 4BKT A; 1E0Z A; 3DBL B; 3VUY A; 1UF0 A; 2C5L C; 4GOC A; 1WR6 E; 3E56 A; 1TS5 A; 4GMV A; 5EE1 A; 4ICU A; 4RNA A; 3A9J A; 4YSX B; 3Q8A A; 2DEN B; 1T5X D; 4DXF A; 4GDL B; 2LAS A; 4WH4 A; 1SBB B; 1K8R B; 2L52 A; 4KSK C; 3PRZ A; 2ZNV B; 5MPO A; 2K8H A; 3U4E G; 4TQ1 A; 4B6W A; 2KQ4 X; 2YVC A; 2IO2 B; 2ZVO A; 3H7P B; 4WQM A; 4HPP A; 4B0E A; 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4DHJ B; 3W5U B; 1WM2 A; 3A4S C; 4TV3 A; 3SEB A; 4W9F A; 2MJ3 A; 4HPL B; 4US8 A; 3IAM 1; 4L1B A; 2NTT A; 1LM8 B; 3GP7 A; 2IGH A; 1ZP0 B; 2RPV A; 1GJZ A; 4AOF A; 1TS3 A; 2A5U A; 3DWG C; 2IBI B; 3B0A A; 2MA9 B; 3RNB C; 2KXJ A; 4BKS D; 3NUH B; 1WX8 A; 2C9W B; 3ZDM C; 1A70 A; 2LVO A; 4K81 A; 3ZGZ A; 4PS7 A; 3KH0 A; 3BVZ A; 4NAM A; 1TZ1 A; 2V4I B; 1HA5 A; 2VRR B; 1C79 A; 1WJU A; 2M19 A; 1UBQ A; 2LHE A; 5D3I B; 2ZPN A; 3N30 A; 1QIL A; 5CHW A; 3WAN A; 1GAQ B; 2C7M B; 3P42 A; 3P4Q B; 1F0Z A; 4OZA A; 3UI3 A; 3A9K A; 4GSW A; 4ZYS A; 3NS8 A; 2WLB A; 3DBL I; 3FIL A; 3V3X A; 1OEY A; 2N7D A; 5JH5 C; 1ET6 A; 2ONQ A; 2XBB C; 4L23 A; 2KC1 A; 1PDX A; 4XWW A; 5CHV C; 3P63 A; 4YXD B; 3Q3N C; 1WIA A; 2NS5 A; 1AYF A; 3TIX A; 4B9K A; 3PZ7 A; 2V3N A; 1ZGU B; 2KFK A; 4A20 A; 4KX6 B; 1GG3 A; 1MG8 A; 3H1U A; 1AW7 A; 1PQS A; 2IPK D; 3A1Q A; 1X1M A; 2DWQ A; 2KDM A; 4ZYN A; 1I7H A; 1WGD A; 3NY5 A; 3ZIM A; 1J0G A; 3MFG A; 3DHG C; 2OJW A; 4MEL A; 2N1W A; 1L6V A; 1WF9 A; 1QOA A; 1RFA A; 2L0T A; 2WX0 A; 1K50 A; 2VZK B; 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