The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
16
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sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
MQYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWCYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Rotameric preferences of a protein spin label at edge-strand beta-sheet sites.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
|
| molecule tags |
Immune system
|
| source organism |
Streptococcus sp. group g
|
| total genus |
16
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-05-22 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1HEZ E; 1JML A; 2KWD A; 2GI9 A; 1IGC A; 1XF5 L; 2KQ4 X; 3V3X A; 2J52 A; 2RMM A; 2JZP A; 2NMQ A; 1GB4 A; 1K51 A; 5HHD G; 1YNT E; 2LUM A; 2JXT A; 1MVK A; 4GLS C; 4WH4 A; 1MHX A; 1P7F A; 1EM7 A; 2JU6 X; 2I2Y A; 2IGD A; 4KGT A; 1K53 A; 1IBX B; 1PGX A; 1K52 A; 2N9K A; 2N7J A; 3FIL B; 1MHH E; 5HG2 A; 4IOI E; 1F2R I; 2ONQ A; 2IGG A; 2IGH A; 2PLP A; 2J53 A; 1ZXH A; 2LHD A; 2LHE A; 2K0P A; 4HKZ E; 2N9L A; 1UWX A; 1MPE A; 2ON8 A; 1IGD A; 2ZW0 A; 2KN4 A; 2JSV X; 1FCC C; 1FD6 A; 2OED A; 2LGI A; 1P7E A; 1XCQ L; 4KGS A; 4OZA A; 1D4B A; 4HJG E; 3MP9 A; 5BMI A; 4MAC A; 1FCL A; 4KGR A; 5BMH A; 4IKG A; 5HFY A; 1IBX A; 4OZC A; 1Q10 A; 2GB1 A; 1MI0 A; 1F2R C; 5BMG A; 2JWU A; 3UI3 A; 5HI1 A; 2RPV A; 1C9F A; 1HZ6 A; 1KH0 A; 1XCT L; 2QMT A; 1GB1 A; 2PTL A; 4D2K A; 2EEL A; 1PGB A; 2KDM A; 2PW9 A; 1PGA A; 2I38 A; 3FIL A; 1QKZ A; 5JXV A; 2QSD A; 1YMH E; 1HZ5 A; 2KAC A; 3GB1 A; 4OZB A; 2ZW1 A; 1K50 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1HEZ E; 1OEY J; 1XQQ A; 3JSV A; 5L95 C; 4XZ4 A; 1Y56 A; 4YT0 B; 3GZN B; 1SIJ A; 2ZCC A; 1PYW D; 2JUO A; 1TS5 A; 5AUK A; 3AE2 B; 3R2I A; 5DPT A; 2JZ3 B; 5JHB A; 4WH4 A; 1P7F A; 2K8B A; 2JPH A; 3SD5 A; 2IGD A; 4DDG D; 1NEK B; 1H8C A; 2IGG A; 1HTQ A; 2V0G A; 3L16 A; 3DOW A; 2Y3A A; 2MA9 B; 2E6X A; 3A1Q A; 3URY A; 5EE1 A; 2WXO A; 2DEN B; 2JY6 A; 3OWE B; 1NI3 A; 2NPT A; 2LGI A; 3DBH I; 1T0Y A; 2HTM E; 2GBJ A; 1LQB A; 4P1C C; 2DZJ A; 3NZU A; 3GE8 C; 3Q3M C; 4IC7 B; 4YTM B; 1R7S A; 2K22 A; 3MHS D; 4IWQ A; 1V8C A; 2INP E; 2AX5 A; 2CJN A; 2AQ2 B; 5JH5 C; 1CK1 A; 3U4E G; 1Z2M A; 4PT5 A; 4C4V A; 1VCB A; 4H2A A; 2C60 A; 2X8X X; 1YX6 B; 2SEB D; 1DOI A; 4TUU A; 1F0Z A; 4BKT A; 5E6N A; 3MC9 A; 3ZNZ B; 2J0M A; 3NG0 A; 3OLM D; 4LDT D; 2KAJ A; 1UWM A; 2WXQ A; 4ZYS A; 3EFU A; 2LUE A; 4KX6 B; 2WDV B; 4W9G A; 3AEF B; 1JQ4 A; 5JXV A; 4JPS A; 1R4N I; 2RDH A; 3H1U A; 1B1Z A; 4ICU A; 4F8C B; 3BVZ A; 5KHQ A; 4GB9 A; 3PRM B; 4HPP A; 2DWQ A; 4LTU A; 3C19 A; 2J52 A; 4FA6 A; 3U2S C; 2NS5 A; 5DPS A; 4W9J A; 2CS4 A; 5AEK B; 4P6V F; 3PT2 B; 2VZK B; 2NBU A; 3AEG B; 4YSZ B; 2AQ3 B; 3R66 C; 2IYD B; 3W1S C; 5HG2 A; 3CF6 E; 3DWM A; 1WY8 A; 1TS3 A; 2WX1 A; 3VAW A; 4A90 A; 4GDK A; 4MGI E; 3JSV B; 3OAW A; 1WX8 A; 3Q14 C; 4C80 A; 4DHZ B; 3DBS A; 2IPK D; 4K3B A; 4DQO C; 1L5P A; 1R4M B; 1KOT A; 2KN5 A; 1LXD A; 3ZO5 B; 2M56 B; 2IO2 B; 4K7W A; 2O6V B; 4I6N B; 3VH4 B; 3L4P A; 4HJG E; 4A9A A; 3D32 A; 3KQ4 A; 2HE7 A; 1SSN A; 3Q3N C; 2OHF A; 4IDI A; 3ZRF A; 1VD2 A; 2JVC A; 2HD5 B; 2LGY A; 3DVG X; 4HVB A; 4A6Q A; 1YJ1 A; 2N0S B; 2CHW A; 5CX3 A; 1WX7 A; 1ZDX A; 1YIW A; 3A1Q B; 1A70 A; 4RCO A; 2E3T A; 2VZK D; 3N30 A; 3DBH B; 3B9J A; 2BBC A; 2NPT B; 4HPL B; 4BOS C; 3L08 A; 3U8Z A; 2LFI A; 1TKG A; 2L76 A; 2EKI A; 4RFB A; 1SBB B; 3AB5 A; 4WJQ A; 3UIP B; 2W54 A; 4MH8 A; 4CYE A; 1HZ5 A; 4LNN A; 4OZB A; 1XEE A; 3A33 B; 5D3D A; 3VTV A; 3FAH A; 1N60 A; 1SJH D; 1E7P B; 2IO1 B; 1C78 A; 4C4V B; 2NCN A; 1GOZ A; 2D5G A; 2O6V D; 2JZP A; 2YEP B; 3R8B A; 1SB3 C; 3AEB B; 1RYJ A; 3WAN A; 4JWS C; 2V4L A; 3MHZ A; 1QOA A; 5C2T B; 3UIO B; 1VR9 A; 4KGT A; 1JRP A; 3ZVV A; 5DCN A; 3P42 A; 2KMA A; 1FFV A; 1HTO A; 1SE9 A; 3AE1 B; 2MJD A; 4II3 B; 2PE9 A; 2K9X A; 2KQS A; 3BWU D; 3WAL A; 3DQV A; 4E74 A; 1OGW A; 2GLS A; 2N9L A; 2MBB B; 5CTR C; 2B3A A; 1YN5 A; 3OJ4 B; 3DBR I; 4WJP A; 3E9S A; 4II2 B; 4B95 A; 2PEA A; 3NVW A; 3W9C B; 4JLC A; 1I7H A; 2KLG A; 1YJJ A; 1EWC A; 5BMI A; 4J6I A; 2N9P C; 2YLM A; 5HFY A; 4R3D A; 1TKY A; 4GDK B; 3SEB A; 3L17 A; 2L0F A; 3LJ3 A; 3HUI A; 2G4S A; 1OEY A; 2JYT A; 4NNJ B; 1C4A A; 3PZ8 A; 1KH0 A; 4N58 A; 4LJO B; 3DPD A; 1JW9 D; 2EEL A; 1PQS A; 1ZE3 D; 2WNM A; 3ML9 A; 3ZQ4 A; 3Q3O C; 2BF8 B; 4MEL A; 1DGJ A; 1FXT B; 3TL5 A; 4K7U A; 4M8N A; 3A9K A; 1YMH E; 3X23 A; 1SE3 A; 5G5G A; 1FXA A; 2KHW B; 1WYW B; 2UWQ A; 4KDL B; 1SF0 A; 3RNB C; 2DAJ A; 2KXJ A; 4HRO A; 4X57 B; 3V61 A; 3PRP B; 3ML8 A; 1SEB D; 3HK0 A; 4UDU C; 1FPY A; 1MHX A; 3AE3 B; 1TBE A; 2K1F A; 1BML C; 1J7B A; 1V1O A; 1K52 A; 2XNA C; 2MCN B; 1L4D B; 4C56 C; 2O2V A; 1V86 A; 2KAN A; 4EEW A; 2QJL A; 4MJS A; 1WGK A; 3ZNG C; 1WJU A; 2PLP A; 2KJR A; 4W9L A; 3RNC C; 3DBL B; 4ANW A; 2C5L C; 4ANU A; 3L0W B; 4WWP A; 3IXS A; 2RGF A; 1U4A A; 3PSE B; 3NZ3 A; 1P7E A; 3B08 A; 2BS4 B; 3NVV A; 3Q8A A; 4HWI B; 1QQR A; 1E8X A; 5BYS A; 2XK5 A; 5EE0 A; 2ACZ B; 4BAX A; 2DZM A; 3Q8F A; 1UD7 A; 4BVU C; 1WZ3 A; 2L7R A; 2W55 A; 1MI0 A; 2BYF A; 1F2R C; 4GXB A; 4XDC A; 4GMV A; 1UF0 A; 4TSS A; 4C7Z A; 2AWT A; 3ZLZ A; 2QMT A; 5AZF A; 3PZ7 A; 1UBI A; 4IWP A; 2NBW B; 1SE2 A; 1UEL A; 4FAD A; 3NS8 A; 3IAM 1; 3ZGZ A; 2I1J A; 3NZS A; 1FO4 A; 2Z8L A; 2KQ7 A; 1N63 A; 1WI0 A; 3PO0 A; 2PVG C; 3PTF C; 4US9 A; 3UQB A; 4EKU A; 4FJV B; 3BIN A; 2FCQ A; 5DPR A; 2G3Q B; 2M0A A; 4EZL A; 5LXI B; 3GZN I; 3QJZ A; 3V3X A; 4B9K A; 1YD8 U; 2RMM A; 1E90 A; 3QWZ B; 1DOX A; 2RPQ A; 2WXI A; 3B2F A; 2KC1 A; 3EHV A; 2L32 A; 3X0W A; 2LD9 A; 3PV1 A; 4TV3 A; 3AE6 B; 3A9K B; 1WJ4 A; 4M01 A; 2WXM A; 4OVZ A; 2KFK A; 2LGD A; 4KZ0 A; 2KWC A; 4WWN A; 2LEK A; 2LHD A; 4S0R A; 1OTR B; 2HDE A; 3NOB A; 3RNF C; 4B0M A; 2KX3 A; 2LJ5 A; 3AEA B; 3GP7 A; 3H7S A; 1WR6 E; 2UU7 A; 1J7A A; 3PPA A; 2AQ1 B; 1ROE A; 3P4Q B; 1WIA A; 1P0R A; 2LXC A; 2O2V B; 3EUB 2; 2V4I B; 1ET9 A; 4MJS B; 4PS7 A; 3SR6 A; 3RCZ A; 2KYW A; 3B2G A; 2WGS A; 2AYO B; 2ZEQ A; 1FNV A; 5GXG B; 2LXA A; 2LRU A; 2D2Q A; 3DHI C; 4QAY A; 2CHZ A; 4FXC A; 4US8 A; 3L10 B; 3VUY A; 1I4H A; 2KX0 A; 1Q0W B; 2WXK A; 3R7Q A; 4CQN A; 4L2Y A; 4G50 A; 4WAF A; 2GOW A; 1IYF A; 4RNA A; 2W9N A; 3P2B A; 3N1X C; 2MEK A; 4NAW A; 4TQ1 A; 2MWS B; 4XDD A; 1V5T A; 3BK2 A; 2D3A A; 1UNS A; 5EE3 A; 2C7M B; 1C4P A; 2DYO A; 1RFA A; 3ZXR A; 1MVK A; 3AE9 B; 3HIZ A; 4XWW A; 4GSW A; 2L52 A; 1C76 A; 3NJT A; 4IG7 B; 4OVV A; 4BKG A; 2N9K A; 1P1A A; 1P98 A; 2WXG A; 2L00 B; 2J53 A; 2V3S A; 4RM8 A; 2XEW A; 5LNK 1; 1I4R A; 1WWT A; 2K0P A; 4K81 A; 2KC2 A; 2JRH A; 1WGH A; 1VJK A; 5KHO A; 1KLU D; 2EMT A; 1NBF C; 1R4M I; 3UF8 A; 3QCA A; 2ZW0 A; 2KN4 A; 3SFE B; 2LI5 A; 3ZUN A; 1JAL A; 3IVF A; 3LXF A; 2WYQ A; 2LJI A; 1N5X A; 4DWF A; 2KO3 A; 2WDT B; 4WJN A; 1E8Y A; 1KF6 B; 1L0V B; 5IA7 A; 3VUW A; 3AE7 B; 4WIP A; 2KFK B; 1N6Z A; 5G2N A; 4S17 A; 1WRD B; 3BII D; 4WUR A; 4J3O D; 1WSP A; 2FCM A; 4A20 A; 4NPN A; 3AED B; 2N9X A; 2PTL A; 3R3M A; 1FXI A; 1TY0 A; 3VRA B; 4GU2 A; 5E6P A; 3QA8 A; 4G3X B; 3DVN V; 1P9D U; 2KNB A; 5AZG A; 4GOC A; 1Z5S B; 4AOF A; 2QSD A; 3TIX A; 3M95 A; 2FUG 1; 2R61 A; 1D5Z C; 1TYG B; 2IO3 B; 2K5P A; 3B1L X; 4GDL A; 1STE A; 3NY5 A; 3WAP A; 2RR9 A; 3PRZ A; 3VTW A; 4URK A; 4EUT A; 4HCN B; 1M4V A; 1E8W A; 2BWF A; 2PPH A; 3Q8E A; 2BQQ A; 4NJ7 A; 2I1K A; 2ZNV B; 4MH0 E; 2NTS A; 2K8H A; 3CIR B; 1WGD A; 3TMP B; 3AEE B; 3KH0 A; 3UGB B; 4EOY A; 4K3C A; 2L8J A; 1MHH E; 3TSS A; 3M3J A; 1WXA A; 4DXA B; 2ONQ A; 1F77 A; 4NAW B; 4DDI D; 3HM3 A; 2ZCB A; 3A9J A; 5D2M B; 5C3J B; 4ZYN A; 1CZP A; 4ICV A; 3UQA A; 5J2R A; 2KDF B; 4PYZ A; 1KTK A; 5IP4 D; 4JL9 A; 3W2D A; 3DVN U; 1SXT A; 4Q2J A; 3PRE A; 2VRR B; 3AEC B; 1WYG A; 1HA5 A; 4LLG M; 1CQV A; 3MP9 A; 2DX5 B; 3VRB B; 3ZKJ C; 4DXF A; 2BYT A; 3ZIM A; 4XYC A; 2BWE S; 1MG4 A; 4OW0 A; 4KKI A; 1FMA D; 4KV2 A; 2FAZ A; 2N1V A; 2PE6 B; 1ZPS A; 4BKS D; 2WU5 B; 5LLI A; 1IUE A; 1HE8 A; 4PYU A; 3KUZ A; 4C00 A; 1JWU D; 4CHK A; 2N4F A; 3RFZ B; 2WXL A; 4A3P A; 2KD0 A; 2UYZ B; 3ZJU A; 1PGA A; 2KWV B; 1UGJ A; 3FIL A; 3HVD A; 4RGO S; 4KGR A; 4B6W A; 3I9V 1; 1JML A; 4LCD E; 2V9H A; 2QHO A; 2NTT A; 1EF5 A; 3KUC B; 3AU5 A; 3EEC A; 2EMS A; 1L0Y B; 2QCZ A; 4N59 A; 2BYV E; 3ZXV A; 1GB4 A; 3I5J C; 1F52 A; 2FIF A; 1D5M C; 4FUL A; 1CMX B; 2JXT A; 1PUT A; 4AWJ A; 2DZK A; 4GLS C; 1EM7 A; 2M0X A; 1M94 A; 1K53 A; 2N7J A; 4FHJ A; 3Q3F A; 5FR6 A; 2Y5B B; 1AWD A; 2INC C; 4GDL B; 3DBL I; 4MSM B; 1V9J A; 4ZRJ A; 5MPO A; 3KYC D; 3AI5 A; 1FRD A; 2KMM A; 2KK8 A; 1WX9 A; 1WE6 A; 2CU1 A; 3H6N A; 4YXD B; 1JCK B; 2KFJ A; 3W1S A; 1K8R B; 1ZXI A; 1XO3 A; 2J4X A; 1XD3 B; 2C9W B; 2MBH A; 2PIA A; 3LB8 C; 5FKA C; 2H88 B; 4C7Y A; 4N9F 4; 4FJY A; 3OG5 A; 4K1R B; 5LXH A; 2W3R A; 3A9J B; 2D3G A; 1RWS A; 1WXS A; 4XWT A; 4ACF A; 2RDG A; 3LDZ E; 3P4S B; 1S3S G; 3ZDT A; 1OQY A; 4KVG B; 2GBR A; 3ZTD A; 4B0E A; 1GUA B; 4AJW A; 1WR1 A; 2N1W A; 3AUL A; 1GNU A; 4ANX A; 2J7Q B; 4XGA B; 1WJ6 A; 1I4X A; 2ZW1 A; 5HKH A; 1F9J A; 1T3Q A; 2AEH A; 3BYY B; 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2K8C A; 2DLB A; 2PVO D; 2QDF A; 3OJ3 A; 3W5U B; 1ZOY B; 2RD0 A; 2BGF A; 1QF6 A; 1C3T A; 3CST A; 2LUM A; 3N3K B; 1XLO A; 3Q8B A; 5IN7 A; 2I2Y A; 5IAA C; 1PFD A; 3WIM A; 2MLB A; 1VZ6 A; 2L0T A; 4ZOH C; 2Y5C A; 1T0S C; 3ZNI D; 2G9H D; 3QIJ A; 2LZ6 A; 2IJ0 A; 2YVC A; 1UWX A; 1WM2 A; 4REZ A; 5T8I A; 1V1P B; 3ALB A; 2C7N B; 2OED A; 3JW0 X; 1XCQ L; 1RM6 C; 3H9D A; 3I63 C; 2JT4 B; 4A3O A; 3TEZ A; 1E8Z A; 1FCL A; 1QT9 A; 1HQR D; 4LNI A; 4WQM A; 1NYR A; 1WMH A; 3MFG A; 1H4R A; 3BVM A; 1WF9 A; 4RF1 A; 5DPW A; 4CO7 A; 4W9F A; 2GBM A; 1ZGU B; 2BS2 B; 2WQY B; 1NI2 A; 2BB5 A; 1XT9 B; 3RMK C; 2JQR B; 1KLG D; 1E7U A; 4M8M A; 3RD2 A; 1QLB B; 2NVU I; 1HXY D; 4NQL B; 4BBN C; 4A55 A; 4ASW C; 1NVI D; 4JGH B; 3U7Z A; 3P4P B; 4XC2 A; 2BT6 A; 3LYY A; 1Q1O A; 3ENE A; 1WZ0 A; 4IM0 A; 1QOG A; 3MC8 A; 2K6Q A; 1SIF A; 4AP4 C; 4P1B C; 2NMQ A; 2MJ3 A; 1GJZ A; 3RI7 C; 3IT4 B; 1B9R A; 1YNT E; 1I4Q A; 3NS1 A; 2XK5 B; 2JRI B; 3VXW A; 5GMV A; 2ZJD A; 2V1Y A; 3SDL C; 5L83 A; 2GMI C; 4EFO A; 2WXN A; 1JWB D; 4ZDV A; 2IGH A; 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