The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
MQYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWCYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Rotameric preferences of a protein spin label at edge-strand beta-sheet sites.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
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| molecule tags |
Immune system
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| source organism |
Streptococcus sp. group g
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| total genus |
15
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-05-22 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1MI0 A; 1P7E A; 2N9L A; 2J53 A; 2JWU A; 1K52 A; 1HZ5 A; 5HI1 A; 1HEZ E; 3MP9 A; 4KGT A; 3FIL B; 1MVK A; 1YMH E; 1ZXH A; 4HKZ E; 2QMT A; 1IBX B; 4HJG E; 2GB1 A; 2JXT A; 2ON8 A; 2RMM A; 1XF5 L; 2ZW1 A; 5BMI A; 1JML A; 4OZA A; 4KGR A; 2QSD A; 1KH0 A; 1PGA A; 1F2R I; 2KDM A; 2KWD A; 2KN4 A; 1EM7 A; 1IGC A; 4MAC A; 2J52 A; 2PW9 A; 1IGD A; 3V3X A; 2JU6 X; 2JZP A; 2NMQ A; 2N7J A; 2IGH A; 5BMH A; 1D4B A; 1FCL A; 2I38 A; 2RPV A; 1GB4 A; 1GB1 A; 1MHH E; 2OED A; 1MPE A; 1MHX A; 5BMG A; 2IGD A; 5HG2 A; 2ZW0 A; 3FIL A; 2K0P A; 2LGI A; 2PTL A; 2I2Y A; 2KAC A; 4OZB A; 1P7F A; 5JXV A; 1PGB A; 1QKZ A; 1C9F A; 2LHE A; 2KQ4 X; 2EEL A; 2LUM A; 3UI3 A; 1HZ6 A; 2N9K A; 1K50 A; 1FD6 A; 4WH4 A; 4D2K A; 2GI9 A; 1K51 A; 4OZC A; 5HHD G; 2JSV X; 1XCT L; 1YNT E; 1FCC C; 1Q10 A; 1UWX A; 3GB1 A; 4GLS C; 1F2R C; 4IKG A; 1IBX A; 2ONQ A; 4KGS A; 4IOI E; 2LHD A; 5HFY A; 1PGX A; 1K53 A; 2PLP A; 2IGG A; 1XCQ L; #chains in the Genus database with same CATH topology 2BTE A; 4S17 A; 2R2Q A; 4JGH B; 1KLV A; 1SGH A; 1HEZ E; 5BO4 B; 3P1M A; 4DQO C; 5BYQ A; 1SE9 A; 2DAJ A; 1KLU D; 4A3O A; 3AEB B; 4WWN A; 3ZNH B; 3R7Q A; 1V5O A; 2DX5 B; 4CQN A; 4FJV B; 4GOC A; 1WZ3 A; 2QC8 A; 4B0M A; 4C4V A; 2NPT B; 2LVO A; 1E7U A; 4KGR A; 1VZ6 A; 2KX0 A; 2NTT A; 1Z5S B; 2FNJ B; 2LVQ A; 1HTO A; 4HVB A; 1F2R I; 1E5W A; 4GU2 A; 2C5L C; 1WRD B; 3APC A; 3Q8A A; 3D32 A; 5AZF A; 5CHV C; 3T3N A; 1NI3 A; 3OAW A; 2LJ5 A; 1QZE A; 4AJW A; 1JW9 D; 2E3T A; 1VJK A; 1TJE A; 3BVG A; 1XLP A; 2MP2 A; 2AQ3 B; 4I6L B; 1JWU D; 2KVZ A; 4G11 A; 1Y8R C; 2IO2 B; 4GDL B; 5BYS A; 2FCM A; 2R2O A; 4W9F A; 3TEW A; 3WIM A; 1PGB A; 1QKZ A; 1WYG A; 2LXC A; 3DHG C; 4FJY A; 3VXW A; 4DHJ B; 1MJD A; 5G5H A; 3T3O A; 4PYZ A; 4NJC A; 4P6V F; 3W5U B; 2SEB D; 5C1Z A; 2REX A; 3UGB B; 4GDK A; 3HIZ A; 2N9K A; 3KWV A; 4IC7 B; 2IY1 B; 4W9J A; 4ARI A; 3FC4 A; 4GMV A; 3J9C A; 1SJH D; 1ACC A; 5HHD G; 1XCT L; 3PT2 B; 2RR9 A; 3NG0 A; 3WCQ A; 2BYV E; 1PGX A; 2RGF A; 3BWU D; 5AUK A; 3PZ7 A; 4PT5 A; 4XWW A; 1XQQ A; 2IPK D; 3BIN A; 2WXJ A; 2NBV B; 4HRS A; 1GJZ A; 3KUC B; 1TS4 A; 2C7M B; 2MJ3 A; 1XD3 B; 1KRH A; 2DZM A; 2MCN B; 3VTU A; 5D3I B; 4A9A A; 4OVZ A; 1NEK B; 2MBH A; 4GN1 A; 3C8Y A; 2I1K A; 1V8C A; 4YT0 B; 2IYD B; 1XXG A; 2BS3 B; 2M56 B; 2J0M A; 1F1H A; 4GXB A; 3P63 A; 2OHF A; 2Y5B B; 1TS3 A; 4G3X B; 4JWS C; 2DEN B; 2EMS A; 1PDX A; 1WE6 A; 2MX2 A; 2J52 A; 3A9J B; 4MGI E; 1FIQ A; 5J2R A; 1F77 A; 4W9D A; 2N7J A; 1JAL A; 2M8S A; 2K8C A; 1WGH A; 1GUA B; 2N7E A; 2MEK A; 1WH3 A; 4BKS D; 3A1Q B; 1WX9 A; 5EE9 A; 4KKI A; 1L7Y A; 1OQR A; 1RAX A; 3BZD B; 2W55 A; 2KC1 A; 3FKY A; 2KFK B; 2B76 B; 1SBB B; 2JUO A; 1QLB B; 3ZYY X; 4E71 A; 3IBE A; 1I4G A; 1NEN B; 4E3C A; 1V1P B; 2WXQ A; 4CO7 A; 4JE3 B; 4OZC A; 4TUU A; 2W3R A; 3Q3N C; 2PE9 A; 4KZ0 A; 2M0X A; 4AOF A; 2AL6 A; 1IBX A; 1FO4 A; 3AE4 B; 3U8Z A; 3QHT A; 3VRB B; 3PSE B; 3IAM 1; 3O13 A; 1P7E A; 2MRP A; 1QOF A; 4BBN C; 4HK2 A; 4J6I A; 1FEH A; 4EOY A; 1HZ5 A; 3H7S A; 2WU2 B; 4WAA A; 1V97 A; 1IPG A; 4URK A; 1X1M A; 1UNS A; 2KFJ A; 4N6E B; 3DCG A; 1L0X B; 1H4R A; 1L0Y B; 4ANV A; 2BGF A; 1HA5 A; 1WX8 A; 2KZR A; 4WQM A; 3C0R B; 3N30 A; 2PKO A; 3TBL D; 2LD9 A; 3APF A; 4REZ A; 3ZJU A; 3ZJT A; 4DK5 A; 2WXK A; 3MFG A; 1WR6 E; 2PW9 A; 2KNB A; 3AE8 B; 1UUP A; 1KOT A; 1FFU A; 1EO6 A; 2X38 A; 3MJW A; 2Z0E B; 1FCL A; 2MBE A; 4JPS A; 4ARC A; 1MG4 A; 2OED A; 1E7P B; 1N62 A; 1F9J A; 4KSL C; 4YSX B; 1XLN A; 3DBR B; 3ECI A; 1T3Q A; 4A20 A; 5FK9 C; 1OTR B; 2LHE A; 5JZE B; 1KJT A; 2LGS A; 4EE2 A; 3VUY A; 4JL9 A; 4MEM A; 2LRW A; 4EZK A; 4M0W A; 2D3B A; 4IM0 A; 3RN9 C; 1N63 A; 5IKC M; 3Q69 A; 1FXT B; 1GOZ A; 4EFO A; 1K8R B; 4C00 A; 1WXA A; 2JXX A; 2WGS A; 4HEA 1; 2XK5 A; 1WE7 A; 1J19 A; 3EGR A; 3DHI C; 2YEP B; 2CJN A; 2ONQ A; 4KGS A; 1SJE D; 1I4X A; 4IOI E; 4KIK A; 1FMA D; 3RD2 A; 1YJI A; 1VDV A; 3Q8F A; 2EMT A; 3ZDT A; 4ICV A; 4KX6 B; 3S2A A; 1TBE A; 5IOI A; 5G5G A; 2AWT A; 4KGT A; 2CHW A; 4EZJ A; 1BT0 A; 1ZXH A; 2D07 B; 4TSS A; 4MJS B; 1L4D B; 2GBM A; 4HJG E; 1N5W A; 2K25 A; 5IO9 A; 4XDD A; 3WAM A; 1STE A; 3JVZ X; 1AN8 A; 4BAX A; 2PE6 B; 4HLE A; 2GMI C; 5IN7 A; 2KO3 A; 2MH7 A; 3Q3F A; 2FIF A; 4NJ7 A; 3U4E G; 2E6X A; 2NR2 A; 4XYC A; 3ETR A; 4MM3 B; 3KH0 A; 3DVN V; 1QT9 A; 2O6V A; 2WHI A; 4LNF A; 2PMV A; 3V3X A; 2XNA C; 2JZP A; 1JCK B; 4OW0 A; 4ZYS A; 4RM8 A; 5TR5 A; 2K6Q A; 4A6Q A; 3TEY A; 3ZUN A; 4C4V B; 1JWS D; 1GB1 A; 3DBR I; 1V1O A; 2K8B A; 2DZK A; 1YN5 A; 4L23 A; 1MHX A; 1TZO A; 3V61 A; 2I2Y A; 2INP E; 3M3J A; 1FNU A; 1IP9 A; 1ZW7 A; 1TKE A; 2BW2 A; 2Q5W D; 1S3S G; 5AEK B; 1YX5 B; 3RT3 B; 2Y3A A; 1V81 A; 4RFB A; 2LMC A; 4FAD A; 2WDV B; 4JX1 C; 3AM9 A; 2W3S A; 2W54 A; 4FHJ A; 2IO3 B; 3QIJ A; 5E6J A; 4GLS C; 1WJ6 A; 2OOB B; 4FUL A; 5AZG A; 1WMH B; 4AS1 A; 3QA8 A; 3L08 A; 4MGZ E; 1QQR A; 4AP4 C; 5EDS A; 4W9G A; 3VRA B; 3MHZ A; 4TQ1 A; 1GC7 A; 4W9L A; 3FIL B; 1EF1 A; 3PO0 A; 3T9L A; 3DBL B; 1JWM D; 2LI5 A; 4NAW B; 3N1Y C; 2CR5 A; 2C7N B; 4FHK A; 4HJK A; 1LQB A; 2L1A A; 4HCP B; 3BYT B; 3GE3 C; 4M01 A; 4A55 A; 1JML A; 2WXL A; 2WXG A; 4DXG A; 5LXI B; 4TKN A; 3EFU A; 3EC8 A; 2KDI A; 1HQR D; 5FKA C; 4NNJ B; 3RUL A; 2OJW A; 4NQL B; 3PLV A; 2MJD A; 3ZNG C; 1KLG D; 1VD2 A; 4NAM A; 3WAN A; 1LO5 D; 1E10 A; 1I7H A; 1YX6 B; 1WFY A; 4J3O D; 3X0W A; 3JSV A; 3L10 B; 2LGD A; 2LGI A; 2BT6 A; 4L1B A; 5KHO A; 2A4Z A; 3SEB A; 1P7F A; 1D5X C; 3GP7 A; 4LCD E; 2K6D B; 4XC2 A; 1WXS A; 2KQ4 X; 1F0Z A; 4X57 B; 2M17 A; 5G55 A; 1LXD A; 3EA6 A; 2CHZ A; 4WWP A; 5J17 A; 4BVU C; 3VQI A; 3W1S C; 2O2V A; 1WY8 A; 2PIA A; 1T5X D; 4GIV A; 4RNA A; 2IO1 B; 2EKE C; 3A9K B; 5HFY A; 1P1A A; 3DVG Y; 1FRD A; 1FPY A; 2N9X A; 2DNF A; 2LGY A; 3P4R B; 1WGR A; 4FJZ A; 3AV8 A; 1QIL A; 3ONS A; 3DBL I; 3PPA A; 1EUV B; 4M8N A; 1C3T A; 2L3Z A; 3QQ8 B; 4DDG D; 1J7C A; 3TEZ A; 1IBX B; 2JQR B; 2WDQ B; 3H8H A; 3HRD D; 5LNK 1; 1WF9 A; 1AYF A; 2BVC A; 3AH7 A; 4WWM A; 5T8I A; 3IT4 B; 3Q8E A; 3CF6 E; 2D5G A; 5EE0 A; 1C77 A; 5KHQ A; 3ZO5 B; 1DYQ A; 1OGW A; 2VRR B; 4HPM B; 1GAQ B; 3N1X C; 4BKS A; 1NYR A; 2MW5 A; 2KLC A; 2JZ3 B; 1WRI A; 3NVZ A; 2NMQ A; 2IZV B; 1L6V A; 1Q0W B; 5JHA A; 1QF6 A; 4W9K A; 2DYM A; 1YOV B; 3ML9 A; 1V6E A; 2K0P A; 1XEE A; 5JXV A; 1JRU A; 4US9 A; 1TKG A; 1NYQ A; 3DWG C; 3AE2 B; 2VH2 A; 4KVG B; 2N1W A; 3UI3 A; 2BS4 B; 2RD0 A; 1I35 A; 3URY A; 1UWM A; 3I3T B; 1V80 A; 1LFD A; 1V5T A; 2G4D B; 2WDR B; 5J18 A; 4AJY B; 2CU3 A; 1YNT E; 3QAQ A; 3H9D A; 5DPS A; 1CZP A; 4OHJ A; 2KVR A; 3BYY B; 4M00 A; 4M0W B; 1SIF A; 3ZVV A; 2LEK A; 2SAK A; 5DPR A; 2GLS A; 4A8X C; 2IY0 B; 2V3N A; 3VAW A; 1WSP A; 1YMH E; 2GRI A; 3AE1 B; 2KYW A; 5MPO A; 2YEP F; 4RGN A; 3H7P B; 4LJO B; 4ZDV A; 3IVF A; 4DXF A; 2BWE S; 3QWZ B; 3U30 A; 1H8C A; 1FXI A; 3E9S A; 4C80 A; 1XF5 L; 4XX5 A; 1GNU A; 3SFE B; 2HTM E; 5I4D A; 3H6N A; 1SIJ A; 2WNM A; 4BKT A; 4F1S A; 1E90 A; 3HM3 A; 3OJ3 A; 2KWD A; 3O65 B; 3NOB A; 2K8H A; 3MHS D; 3HVZ A; 3KYC D; 4GGQ A; 2D11 A; 3KQ4 A; 3RNE C; 1C4P A; 3NVW A; 1C1Y B; 4KZC A; 3PZD A; 3Q3O C; 1V86 A; 2ICI A; 2FCN A; 2FE8 A; 2XBB C; 1D6E C; 2VZK D; 4G0N B; 2ZZP B; 1ZP0 B; 1BUI C; 1T0Y A; 2NS5 A; 3PHX B; 5HG2 A; 3OG5 A; 3VTW A; 3ZIM A; 2WWZ A; 4KDI C; 1RFA A; 3A4R A; 2JF5 A; 3ZKJ C; 5L95 C; 4I6P A; 3NVV A; 2D10 A; 2MLB A; 3DBS A; 1DOX A; 3PRP B; 2KTR A; 3I63 C; 3U52 E; 4ANW A; 3RNF C; 1RM6 C; 3UQA A; 4WH4 A; 2CU1 A; 4LK0 M; 1Q10 A; 4LDT B; 1SXT A; 4A3P A; 1GG3 A; 4IG7 B; 3CIR B; 2LHD A; 1SF0 A; 3W2D A; 2KQS A; 3B1L X; 1XCQ L; 3K9O B; 1FFV A; 1CMX B; 1QOA A; 1SE3 A; 3AE6 B; 3M95 A; 5HI1 A; 1C4C A; 3DVG X; 4B0E A; 3KUD B; 1UGM A; 1NDD A; 2MA9 B; 4XE0 A; 2QHO A; 3Q8C A; 4YTM B; 2ZNV C; 4FBJ B; 2J0J A; 1P3Q U; 2JXT A; 5H92 C; 3CSF A; 3WAP A; 2V4I B; 2N9E B; 1E8Y A; 2MBO A; 2KOX A; 4NPN A; 2KTF A; 2WX1 A; 1RRB A; 2XEW A; 1I42 A; 3T8M A; 3DVN U; 1N6Z A; 2K39 A; 2FCS A; 4AWJ A; 1I4P A; 2QSD A; 4LNK A; 2LWP A; 4IWQ A; 5AUI A; 2B3A A; 2FBW B; 4II3 B; 1JRP A; 3VDZ A; 4PYU A; 3U2S C; 1C4A A; 3ZRF A; 1ZE3 D; 2BYE A; 2DAF A; 3N32 A; 1ROE A; 2RPV A; 1NVI D; 3UQB A; 1WZ0 A; 3V6E B; 2J7Q B; 1SSN A; 1WI0 A; 3WA0 A; 2HTH A; 2KAC A; 1D3Z A; 3RZW C; 3NUH B; 3TSS A; 2ZNV B; 3I5J C; 3RUI B; 1J7A A; 4K3B A; 1P98 A; 3MC0 B; 3QJZ A; 3DBH B; 1UH6 A; 1E6E B; 2NCN A; 1VZ8 A; 3SD5 A; 1J8C A; 4K1R B; 1B1Z A; 2NPT A; 1G6J A; 3U7Z A; 1IUE A; 4IDI A; 3AE3 B; 3V62 A; 3BVZ A; 2L05 A; 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3GZN B; 2PJH A; 3BVM A; 1WXM A; 2W9N A; 2MP2 B; 3VVW B; 3W1Y A; 2J53 A; 1ET6 A; 1JRO A; 3CMM B; 4ZRQ A; 3BII D; 3ZXV A; 3A1Q A; 1MVK A; 4I6N B; 1VZ7 A; 2UYZ B; 1NBF C; 4DHZ B; 1M94 A; 2NBU A; 3Q14 C; 4DBG A; 2ON8 A; 3H1U A; 4B9K A; 3AXC A; 2KJ6 A; 4BKG A; 3SR6 A; 4GDK B; 2Z8L A; 4US8 A; 1V1P A; 4DHZ E; 2KWU B; 2CS4 A; 3P4P B; 1EM7 A; 2JY6 A; 3SHQ A; 4MGY E; 1UGJ A; 4HXD A; 2JRI B; 2INN E; 3TMP B; 1L4Z B; 1GB4 A; 2BS2 B; 2Z0D B; 1N60 A; 3RPF C; 2ZVN A; 5LXH A; 2Z59 B; 2KLG A; 3QK0 A; 3P2B A; 5CX3 A; 1UF0 A; 2JX5 A; 5GXG B; 4WJP A; 1TT5 B; 4ZHP A; 2LFI A; 4P16 A; 1C79 A; 3VR9 B; 1ZKH A; 2H89 B; 1WM2 A; 3NY5 A; 1Z2M A; 1HZ6 A; 5LLI A; 3PS6 A; 2KC2 A; 3NHE B; 3R7R A; 3GOE A; 2JSV X; 3GZN I; 2QCZ A; 1RLF A; 5C2T B; 4RGT A; 2KN5 A; 5GMV A; 3ZJV A; 4BZA A; 2WYQ A; 4KSK C; 3W9C B; 2BYF A; 2ZVO A; 5JHB A; 2HD5 B; 2MBQ A; 2JYE A; 3GE8 C; 4P1B C; 3AUL A; 4ZRP A; 1YIW A; 2OJR A; 1TTN A; 3NZ3 A; 1YQ3 B; 1A70 A; 3DOW A; 3HHM A; 1XT9 B; 2LJI A; 1SE2 A; 4WQO B; 2N4F A; 1JWB D; 1KFY B; 4FN2 A; 1P0R A; 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