The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
|
sequence length |
56
|
structure length |
52
|
Chain Sequence |
DTYKLILNGKTLKGETTTEAVDATAEVFQYADNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
De novo protein
|
| publication title |
Comparison of design strategies for alpha-helix backbone modification in a protein tertiary fold.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
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| total genus |
12
|
| structure length |
52
|
| sequence length |
56
|
| chains with identical sequence |
B
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-01-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01378 | IgG_binding_B | B domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1IBX B; 2ON8 A; 1P7E A; 1JML A; 1GB1 A; 1IGC A; 1HZ6 A; 2EEL A; 1MI0 A; 4IOI E; 2QMT A; 2RPV A; 1UWX A; 4KGR A; 5BMI A; 2RMM A; 2LUM A; 2ZW1 A; 2J53 A; 2GI9 A; 1K52 A; 2KQ4 X; 1XCT L; 4HKZ E; 4WH4 A; 2LHD A; 2ONQ A; 2IGD A; 2JZP A; 1XF5 L; 2JU6 X; 1MHX A; 1MVK A; 1HZ5 A; 4KGS A; 5BMH A; 2I38 A; 1K51 A; 1P7F A; 1F2R I; 4GLS C; 4OZB A; 4OZC A; 1MHH E; 3FIL B; 4OZA A; 1GB4 A; 1MPE A; 1K50 A; 2PW9 A; 2N9K A; 2KWD A; 2KAC A; 4KGT A; 2J52 A; 3FIL A; 1FD6 A; 2IGG A; 1D4B A; 2ZW0 A; 5BMG A; 2QSD A; 1PGX A; 1YMH E; 1XCQ L; 2KDM A; 2LHE A; 5HHD G; 5HFY A; 1Q10 A; 5HG2 A; 1FCC C; 2GB1 A; 1IGD A; 1F2R C; 1EM7 A; 1FCL A; 2N9L A; 1PGB A; 5JXV A; 1QKZ A; 1ZXH A; 2IGH A; 4D2K A; 1C9F A; 2PLP A; 1KH0 A; 4HJG E; 1PGA A; 3GB1 A; 3MP9 A; 3UI3 A; 1YNT E; 1HEZ E; 5HI1 A; 2LGI A; 4IKG A; 1IBX A; 2I2Y A; 2JSV X; 2NMQ A; 2JWU A; 2K0P A; 2N7J A; 4MAC A; 2PTL A; 2KN4 A; 2JXT A; 2OED A; 3V3X A; 1K53 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4II2 B; 3WCQ A; 4IG7 B; 3PZ8 A; 2L7R A; 1WGY A; 1TIF A; 2HJ1 A; 3DWG C; 1J7B A; 5DPT A; 3U4E G; 2M19 A; 3AEE B; 1I4H A; 1EUV B; 3OJ4 B; 2LHD A; 1L0Y B; 3ZNG C; 3V6C B; 4KGS A; 1L6V A; 3KUD B; 4A90 A; 4IC7 B; 4S0R A; 1RFA A; 1K51 A; 1KFY B; 1FMA D; 3FIL B; 2YEP F; 2WXI A; 2E6X A; 2WU5 B; 2BYT A; 2PW9 A; 1TBE A; 4A3O A; 1ZKH A; 1SJE D; 1TS5 A; 3MJ5 A; 4JL9 A; 3OG5 A; 3NOB A; 3BY4 B; 4OVU A; 1V5O A; 2FE8 A; 3RNE C; 2AQ3 B; 2O2V A; 4ZYS A; 3EGR A; 3KQ4 A; 2DLB A; 4RM8 A; 2ICI A; 3E9S A; 4WWP A; 3CSF A; 2AYO B; 2LMC A; 5FR6 A; 2DEN B; 4J3O D; 1WR6 E; 3H7P B; 1OQR A; 4BKT A; 1GUA B; 1P1A A; 3GS2 A; 2KO3 A; 4X57 B; 3P4S B; 2BS2 B; 4TV3 A; 4ARC A; 1P0R A; 1KRH A; 1C4P A; 1RLF A; 5E6P A; 1ENF A; 1FEH A; 3DCG A; 4BOZ B; 1UGJ A; 2I2Y A; 3BZD B; 1KOT A; 1J7C A; 1P98 A; 2MX2 A; 2PTL A; 2OED A; 2DWQ A; 4TKN A; 4NJC A; 2ZCC A; 1FXA A; 2K1F A; 2NS5 A; 2IBI B; 2V9H A; 2RGF A; 1WJN A; 3RCZ A; 1QF6 A; 3UF8 A; 1WRI A; 3V6E B; 4KZC A; 1V6E A; 1WSP A; 2WDV B; 1WGD A; 2FCS A; 3IT6 B; 1JRP A; 5D3I B; 4TSS A; 4NPN A; 3LXF A; 1N63 A; 3VFK A; 3WAL A; 1ESF A; 1E10 A; 2C60 A; 4GLS C; 1P7F A; 1TKG A; 4P7I A; 2KN5 A; 3RZW C; 1WI0 A; 3T9L A; 4L1B A; 3DVN V; 4NJ7 A; 4ZRI A; 1AN8 A; 2KWD A; 3RMK C; 2JPH A; 2KAC A; 4ITK A; 1FPY A; 3ONS A; 1SE2 A; 3DQV A; 1TZO A; 3X23 A; 3ZNI D; 5CX3 A; 1WXS A; 4B9K A; 5HHD G; 2M0A A; 3U30 A; 4JGH B; 2G4S A; 2XN9 C; 4WAF A; 2W3R A; 3OWE B; 2D10 A; 4GXB A; 1HXY D; 2MCN B; 3ZTD A; 1CZP A; 3PRE A; 2N9E B; 3RYT A; 1T6B X; 3BK1 A; 2Y5P A; 4W9K A; 4AQ7 A; 2JY6 A; 1SIF A; 3ZNZ B; 4WWM A; 3PZ7 A; 5JHA A; 3CMM B; 3TL5 A; 1SJH D; 3VR9 B; 1U4A A; 3L54 A; 2DYB A; 2WLB A; 1VD2 A; 3HRD D; 3R66 C; 5LNK 1; 1IYF A; 1WM2 A; 3N3K B; 2KN4 A; 3MC0 B; 2N7D A; 3K9O B; 2DZM A; 1KJT A; 4JQW C; 5GMV A; 2JZ3 B; 1PFD A; 3HK0 A; 3RNB C; 4RGT A; 2L0T A; 2O6V B; 3APF A; 1YX5 B; 1L7Y A; 2ZW1 A; 1K52 A; 1XCT L; 4GDL A; 2ONQ A; 1RWS A; 2JZP A; 3MTN B; 3EFU A; 4LCD E; 2I38 A; 2BPS A; 3O65 B; 2ZPY A; 3H1U A; 2KHW B; 4M02 A; 4OZA A; 5LLI A; 3UIP B; 1WXQ A; 1KTK A; 3BII D; 4RF1 A; 1NYR A; 2O2V B; 1XO3 A; 2N9K A; 1NBF C; 2HTM E; 2KWV B; 2BYE A; 3I5J C; 2WXQ A; 1QIL A; 2JXX A; 3ML9 A; 3APD A; 2X38 A; 1PGX A; 4EZK A; 3V60 A; 4R3D A; 1EF1 A; 2LHE A; 3BYT B; 4MEL A; 1YIW A; 2YLM A; 2VZK D; 2MBH A; 5D94 A; 3ZXR A; 3M63 B; 2WWZ A; 1AW7 A; 1Q5W B; 4HRO A; 4N58 A; 3A9J A; 5AZF A; 3KYC D; 5L95 C; 1N6Z A; 4E74 A; 1Y56 A; 2Z0E B; 4B95 A; 2WXN A; 1ZE3 D; 1OEY J; 4IM3 A; 3VRA B; 5FK9 C; 4JX1 C; 1FO4 A; 2PMV A; 5HI1 A; 2ZNV C; 1V1P B; 4IKG A; 4FN2 A; 1IBX A; 3QC8 B; 4HCN B; 2NMQ A; 5J2R A; 4K3C A; 2LVP A; 3L16 A; 1E8Z A; 3ZQ4 A; 4HK2 A; 2N9P C; 2IO0 B; 2HJ8 A; 1VCB A; 1K53 A; 4LJO B; 4LNI A; 2L76 A; 3V62 A; 3AU4 A; 1C4C A; 1UWM A; 2N0S B; 2D3G A; 4HXD A; 3Q3F A; 4YL8 A; 4IWP A; 2QIL A; 1FRR A; 2Z0D B; 1JRU A; 4HPM B; 3PHX B; 1OTR B; 1WXA A; 4L23 A; 4ZRQ A; 3ZJU A; 1SF0 A; 3PS6 A; 2IJ0 A; 1ZDX A; 3RT3 B; 2GBM A; 1L0X B; 1E8X A; 1WXV A; 3QAR A; 3RI7 C; 2JYE A; 2KJH B; 2KJ6 A; 1YX6 B; 2ZPN A; 1IPG A; 1T0Q C; 3QQ8 B; 2J52 A; 1GJZ A; 2FBW B; 1UEL A; 4BFR A; 3AB5 A; 3AMZ A; 3QWZ B; 1RFK A; 4NQL B; 3WAM A; 4LDT B; 4YTP B; 2PKO A; 1Q0W B; 5HFY A; 1G6J A; 4F7Z A; 2DX5 B; 3R3M A; 3IG3 A; 2AWT A; 4E71 A; 5JZE B; 4HEA 1; 4AP4 C; 3AED B; 4MM3 A; 2FCN A; 1VR9 A; 2JQR B; 1C9F A; 4HJK A; 2WDT B; 2GBR A; 4LTU A; 4M8M A; 3VR8 B; 1NI3 A; 3P4Q B; 1GC6 A; 4LNF A; 2K0P A; 5CHV C; 1F77 A; 3ZJV A; 1UBQ A; 1KM7 A; 3DVG Y; 3R7Q A; 2BTE A; 1K8R B; 4W9H A; 4KIK A; 4ARI A; 1LGR A; 4B0M A; 3QJZ A; 4GDL B; 2MA9 B; 2EEL A; 1AYF A; 2A4Z A; 1MI0 A; 2D3A A; 1J8C A; 3TEW A; 3NRZ A; 1WJ4 A; 3MC9 A; 4K7W A; 1ZUD 2; 2KWU B; 1UWX A; 2TSS A; 5E6J A; 3SD5 A; 4DHZ B; 1M94 A; 2IO2 B; 3NVV A; 4W9L A; 4II3 B; 1RRB A; 3B2G A; 1GNU A; 1XF5 L; 3ZO5 B; 5IO9 A; 4N9F 4; 5GXG B; 2BQQ A; 4S17 A; 5EE9 A; 1E7V A; 3HVD A; 2AEH A; 1R4N B; 4WAA A; 2C7H A; 2KAN A; 2XBB C; 5EE1 A; 3NUH B; 1SE9 A; 4EE2 A; 1I4G A; 2KFJ A; 4W9C A; 2AQ2 B; 1JRO A; 2PEA A; 3QX1 A; 1YJI A; 2CHX A; 5G2N A; 3GE3 C; 3AEF B; 2XEW A; 4GDK A; 4LNN A; 1YD8 U; 1ET6 A; 1YN3 A; 4QAY A; 5JXV A; 2MJ3 A; 2CKH B; 4MJS B; 2K9X A; 1ZXH A; 2QIE B; 2W54 A; 3TEZ A; 5J18 A; 1MG4 A; 2K5P A; 2Y5C A; 1JQ4 A; 1TY2 A; 1V81 A; 1KH0 A; 3I9V 1; 2W3S A; 2KC1 A; 3GB1 A; 4YSY B; 1T5X D; 4PYU A; 4ZHP A; 2GLS A; 2ACZ B; 2N9X A; 3SHQ A; 1WZ3 A; 1OQQ A; 2NPT B; 3UI3 A; 1OQY A; 1WRD B; 4FXC A; 2LGI A; 1XQQ A; 3V05 A; 1VJK A; 1FM0 D; 3TJP A; 2N7J A; 3L17 A; 4IM0 A; 1UF0 A; 5IP4 D; 4BVU C; 4B6W A; 2VH1 A; 2IPK D; 1P7E A; 1BML C; 4A8X C; 4C56 C; 2QMT A; 1HA5 A; 2MBQ A; 1HTQ A; 3A9K A; 3WAO A; 3RNG C; 4PT5 A; 2V3N A; 1C3T A; 4N6E B; 4I6P A; 3C19 A; 1ZOY B; 3IAM 1; 4ZRP A; 4G0N B; 3MHZ A; 1HZ5 A; 1GOZ A; 4ACF A; 3MHS D; 2HE7 A; 3NJT A; 3BYY B; 3O13 A; 3URY A; 3GE8 C; 3CST A; 3P4P B; 3RZF A; 3ZKJ C; 2JYT A; 2IZV B; 5E6O A; 4HPP A; 1KF6 B; 4AS1 A; 4FJV B; 4JIO U; 2ZVO A; 2IGG A; 2KTR A; 2KX3 A; 4TQ0 A; 3KYD D; 3DHI C; 2Z8L A; 4MM3 B; 3PSE B; 5D7G A; 1L4D B; 1QLB B; 2FAZ A; 1GPX A; 2PIA A; 1Q10 A; 4P1C C; 3ENE A; 4C4V A; 2HDE A; 4ZRK A; 1VLB A; 3M95 A; 2CHW A; 3ZNH B; 3KW5 B; 3RPF C; 1WGG A; 4D2K A; 1ZPS A; 2RDB C; 3RD2 A; 3MP9 A; 3AEA B; 3BVG A; 3EEC A; 3R2I A; 3DOW A; 3GP7 A; 4ZOH C; 3VUX A; 1XT9 B; 4W9J A; 4CO7 A; 1NI2 A; 1TS4 A; 3GZN B; 5AZH A; 3U7D A; 1WR1 A; 4K3B A; 1SSN A; 2N7E A; 1XLQ A; 4MGY E; 1YN4 A; 2GBJ A; 3A4R A; 2LJ5 A; 1ZXI A; 4Q2J A; 2LXC A; 1NYQ A; 3DVG X; 4DHJ B; 1R4N I; 4IDI A; 3X0W A; 2V1Y A; 2KK8 A; 2LGX A; 3ECI A; 1N62 A; 3U8Z A; 5BMI A; 3ALB A; 4C80 A; 2M0X A; 2Z59 B; 3BVM A; 1MHX A; 1T0R C; 2W9N A; 2CU1 A; 1BUI C; 4YTN B; 1T3Q A; 3KLS X; 2IY1 B; 4E3C A; 3EUB 2; 5D3D A; 4N59 A; 3IBE A; 4WJQ A; 5DPS A; 3VDZ A; 4YSZ B; 4M00 A; 4GDK B; 4NAM A; 3NY5 A; 1FNW A; 3Q8E A; 2BKF A; 3DHG C; 2KYW A; 3ETR A; 4MGI E; 5G55 A; 3ZUN A; 1N5X A; 2LRU A; 1FIQ A; 3IT4 B; 1FCC C; 1IGD A; 1UZX B; 2OJR A; 1MG8 A; 1QKZ A; 1QOG A; 2QC8 A; 3PGE A; 2QEJ C; 1J7A A; 1C76 A; 1SIJ A; 2BW2 A; 1E8Y A; 1VZ8 A; 3TSS A; 3W5V B; 2ZZP B; 1I4Q A; 4FBJ B; 1PGA A; 4K81 A; 3DBR B; 3DVN U; 4KDL B; 5MPO A; 2G3Q B; 1JWB D; 3CIR B; 2Y3A A; 2GBK A; 3EC8 A; 4YTM B; 2KQS A; 2L32 A; 2CHZ A; 5E6N A; 2INN E; 2K8C A; 3AEG B; 4YXD B; 3A33 B; 1TZ1 A; 3SEB A; 2FIF A; 1FXI A; 3I57 A; 2AL3 A; 2WGS A; 1TS2 A; 3RFZ B; 3AE7 B; 3MC8 A; 2RPV A; 3NZ3 A; 3DBH B; 2V3S A; 2WXM A; 1ZW7 A; 2MRP A; 4NJ6 A; 4WWO A; 4FAD A; 5AUI A; 2KJR A; 3AE5 B; 1AAR A; 2KC2 A; 3P42 A; 2G9H D; 1T0Y A; 4UDU C; 5G5H A; 1EWY C; 3R2T A; 1C78 A; 1MHH E; 1GC7 A; 4RGO S; 2NCN A; 2J4X A; 4DK5 A; 2KTR B; 2M4N A; 1D5M C; 4EFO A; 1YOV B; 4KSK C; 5LXI B; 2D3B A; 4XDC A; 2DBY A; 4EOY A; 4EZJ A; 1JAL A; 4H2A A; 2PE9 A; 1D4B A; 1TJE A; 4DXA B; 1XLO A; 2HD5 B; 3GZN I; 2FUH B; 3N20 C; 2JUO A; 1WFY A; 2FCM A; 4XX5 A; 1EM7 A; 2ZCB A; 3RNF C; 5IN7 A; 1CK1 A; 1FCL A; 4TQ1 A; 5IAA C; 2WDQ B; 3N1X C; 5KHO A; 2CJO A; 2LWP A; 4BKG A; 3P2B A; 2LJI A; 2KKC A; 3BWU D; 1ROE A; 3Q8A A; 2DZI A; 4A55 A; 5KHQ A; 2KT7 A; 2OHF A; 3KUZ A; 1E9M A; 4GB9 A; 2KOX A; 3ZRF A; 1Y8R C; 1HEZ E; 4P6V F; 1DOI A; 3I3T B; 4LK0 M; 1QQR A; 5EE3 A; 2LVQ A; 2N1W A; 1B1Z A; 4US8 A; 2A5U A; 2JZZ A; 3BK2 A; 1WGR A; 4RGN A; 4USA A; 3ABV B; 2UYZ B; 4NZL B; 4DXF A; 1UUP A; 1GB1 A; 2WXR A; 3W5U B; 4NAW A; 3T3O A; 1WGH A; 4LNK A; 4KGR A; 2BVC A; 4WJN A; 2E3T A; 4O1N A; 4URK A; 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4YT0 B; 1C79 A; 5TR5 A; 3VTW A; 4RGM A; 1DOY A; 3U52 E; 1C1Y B; 2V0G A; 2LUE A; 3H7P A; 3PRZ A; 2MBO A; 3DHH C; 4M0W A; 2R2O A; 3TMP B; 1JWM D; 5C2T B; 4WQM A; 3VTV A; 2PPH A; 1I42 A; 2IND C; 1L2N A; 2LGY A; 2INP E; 1KLG D; 1WH3 A; 2MBE A; 3IFW B; 1S1Q B; 2WYQ A; 4GMV A; 2IGH A; 2LFI A; 1E0Z A; 5DCN A; 4G50 A; 4CYE A; 3APC A; 4A6Q A; 4A9A A; 2W82 A; 1UBI A; 1S3S G; 2MQJ A; 1STE A; 2VZK B; 4BZA A; 1WE6 A; 3A9J B; 1EF5 A; 3QA8 A; 4RCO A; 3SDL C; 3KWV A; 1CQV A; 4BKS D; 2GBN A; 3L0W B; 3P1M A; 1EWC A; 3Q8B A; 4BKS A; 2JVC A; 4G3X B; 2L1A A; 2WX0 A; 2KMM A; 4AOF A; 4MH0 E; 1IBX B; 2J0K A; 4W9F A; 1E7U A; 2WXK A; 1OGW A; 2J0M A; 1JML A; 1ZDV A; 2KZR A; 1N61 A; 2DYO A; 4XE0 A; 1V80 A; 3AU5 A; 3NVW A; 2KFK A; 5IA7 A; 2IYD B; 4A20 A; 4KSL C; 4LLG M; 2MHJ A; 4WJP A; 4WQO B; 1MFW A; 2RDG A; 4HKZ E; 2D11 A; 2NVU I; 2KD0 A; 3DDC B; 2ZVN A; 2C7M B; 3CWI A; 4XWT A; 3A1Q B; 4BOS C; 2WU2 B; 2DZJ A; 4IM2 A; 4ZDV A; 3FKY A; 2LGD A; 3OJ3 A; 4RFB A; 2BGF A; 4HVB A; 1YQB A; 4TUU A; 3N9Y C; 2B3A A; 1HE8 A; 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