The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
77
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structure length |
77
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Chain Sequence |
AKQDYYEILGVSKTAEEREIRKAYKRLAMKYHPDRNQGDKEAEAKFKEIKEAYEVLTDSQKRAAYDQYGHAAFEQGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The influence of C-terminal extension on the structure of the "J-domain" in E. coli DnaJ.
pubmed rcsb |
| molecule keywords |
DNAJ
|
| molecule tags |
Chaperone
|
| source organism |
Escherichia coli
|
| total genus |
10
|
| structure length |
77
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| sequence length |
77
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1998-08-20 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00226 | DnaJ | DnaJ domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3APQ A; 3APO A; 3UCS C; 2Y4U A; 2CUG A; 1N4C A; 1FPO A; 1NZ6 A; 3BVO A; 2OCH A; 3UO2 A; 1BQ0 A; 2KQX A; 2CTR A; 2YUA A; 2LGW A; 1XBL A; 2EJ7 A; 2QWR B; 1FAF A; 1HDJ A; 2LO1 A; 4RWU A; 1WJZ A; 2Y4T A; 4IT5 A; 2QWQ B; 2L6L A; 2QWP B; 2M6Y A; 2N05 A; 2N04 A; 2YS8 A; 2CTW A; 2QWO B; 2PF4 E; 1GH6 A; 4J80 A; 2QWN B; 2CTP A; 2DMX A; 2GUZ A; 2QSA A; 1IUR A; 1BQZ A; 2DN9 A; 2CTQ A; 2GUZ B; 3UO3 A; 3AG7 A; 4J7Z A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2BSK B; 2Q0A A; 3AG3 C; 2IW5 A; 4AIL C; 1M9N A; 5JJJ B; 3T1Y B; 1R3J C; 2EZP A; 3STL C; 4BWA A; 2YIB A; 4L8J A; 4JYA O; 5LMU O; 1CPY A; 3C3T A; 3J80 N; 2NR5 A; 2ZNI A; 4WFB V; 3JSL A; 1EZJ A; 4O4L A; 5KHJ A; 3KCY A; 3N2G B; 1RSO A; 1JFF A; 1KKD A; 3RWR D; 1FYJ A; 5KUM A; 1QHT A; 1BHA A; 4UUJ C; 2Y4U A; 2IU3 A; 2HKO A; 4PEL A; 1TAE A; 5IYB O; 3ZRW B; 3ZHV A; 3AK1 A; 4JI3 O; 2MW2 B; 3WB2 A; 4MVS A; 1PM9 A; 1XI1 A; 2CE4 A; 1GN3 A; 3K06 A; 1PNM A; 4CH6 A; 4F6R B; 1G4Y B; 3T1H B; 4QE9 A; 1US6 A; 1L0L H; 3AG4 B; 1IBK O; 1HNW O; 4DR2 O; 3UM7 A; 1JOY A; 3G4S V; 2OIE A; 1AJN A; 5CMU A; 5CB4 A; 4LF6 O; 1I5X A; 4MVM A; 3ABM C; 3JAR B; 4CC6 A; 2JJ2 G; 2F66 C; 4JV5 B; 1Q3E A; 4CH4 A; 3P3N A; 4DR6 O; 3QO8 A; 1QU7 A; 1AR1 B; 3OFN G; 1NTZ H; 2GHY A; 4PDM A; 4TOI A; 4B3M O; 1OZ0 A; 3NXS A; 1SRY A; 3DC6 A; 3G80 A; 1PNK A; 4LF5 O; 5LHI A; 1EBO A; 1JPX A; 5CA0 A; 1VQL V; 4ZHQ B; 5LMN B; 4J7K A; 4PDV A; 1JJO A; 1FFX B; 1GKF A; 1XL6 A; 2EIJ B; 3W7X A; 4FLX A; 4WFA V; 4NKG B; 1H2L A; 1V9P A; 2JGD A; 3ASN B; 2JJ1 G; 1CEZ A; 1MSD A; 3H1L H; 3M7M X; 1SER A; 1TUB A; 1Y6X A; 4LFC B; 3LSU A; 4X62 O; 3MDS A; 4Q6G A; 3WG7 C; 2DWD C; 5H2F Z; 4WBN A; 2B9Z A; 4KUM A; 1VQ4 V; 2Q9L A; 4TQF A; 5IYC O; 2QGN A; 1W59 A; 2CK3 G; 2XAJ A; 2OIG A; 4MVZ A; 5K1P A; 4DRX A; 3CRC A; 5H5N A; 1FAF A; 4OGQ B; 3O65 A; 1IX9 A; 4X1I B; 3OMN B; 3ZMS A; 5IYD O; 3CX5 F; 5LP6 B; 1N33 B; 5BR8 O; 2Y0I A; 1M93 A; 3E35 A; 4ZOL A; 1H2M A; 4PA3 A; 3H01 A; 1QR9 A; 4MVR A; 4DV7 O; 2P67 A; 1GM8 A; 3K5N A; 4J9Y B; 3CME V; 2PGG A; 2N04 A; 2IU0 A; 3CRM A; 1DLB A; 4TUY B; 3CYO A; 3CCV V; 3D36 C; 3T1C A; 3BA8 A; 3RYI A; 5ITZ A; 4LF4 B; 5C93 A; 2JRI A; 3F7Y C; 1XHZ A; 1KYO F; 4CS2 A; 4LFA O; 2JGU A; 5KX5 A; 1Y67 A; 4NXM B; 5TIS Z; 3SYQ A; 1TUE B; 5JJE B; 2ITC C; 4MTG A; 4PDR A; 3VQX A; 3CCM V; 5JVD A; 1HNZ O; 2Y4T A; 3HKD A; 5B3S B; 2E3C A; 5C8Y B; 2EX3 A; 2FTK A; 4Z2W A; 1VMG A; 3ZHT A; 4UXN A; 4AI8 A; 5L3E A; 3TJT A; 1XNQ B; 4IYI A; 1N34 B; 2X7R B; 4O2B A; 5L3G A; 5L3B A; 3JCU Z; 2E5L O; 3IC7 A; 5J2T A; 5CBH A; 2CTP A; 5LHG A; 3ZMT A; 4TV9 A; 1CXZ B; 1HR0 O; 5EYP B; 1KQS U; 5LP6 C; 2YXL A; 2UXX A; 5FL7 G; 1H2N A; 2F1M A; 4FPP A; 4J7J A; 3K58 A; 2L6L A; 2B1I A; 4UCT A; 1IXB A; 3E8F A; 1THZ A; 2PF4 E; 1GH6 A; 4I7Z B; 4G28 B; 5D5P A; 1X59 A; 1F4N A; 1BT8 A; 3RT3 C; 4UCO A; 4PJ0 Z; 3SYO A; 2C2A A; 4KHP O; 3MD0 A; 4UCS A; 1K33 A; 4ICG A; 5B3S C; 1VQM V; 1B3Q A; 4O2A A; 4DV2 O; 2BTQ A; 3E86 A; 4P9O A; 2DN9 A; 3CRR A; 4WFF A; 2YSU B; 1JA8 A; 4I55 A; 1FXK B; 4X1Y B; 4OPA A; 5KMG A; 1V54 C; 2BOB C; 3P30 A; 4XDJ A; 4GCZ A; 4X64 B; 1QR8 A; 4UFZ A; 2HG5 C; 3FAV B; 2WLI B; 4PHZ A; 5FPO A; 3VQW A; 3CC7 V; 4J80 A; 1XOU A; 2HVK C; 4UCR A; 2WLL B; 2WPD G; 3AG2 C; 3K08 A; 1AP5 A; 4KL1 A; 2Y48 A; 2ZNJ A; 4LWS B; 2FB5 A; 3QVN A; 4FM0 A; 1DF5 A; 4YHH O; 1IBL O; 5JQG B; 2GDS A; 4PV1 B; 4I9W A; 2HEP A; 2OTJ V; 3K5M A; 5IY5 C; 3K5O A; 1K7D A; 3JAT B; 1QLE C; 4I4T A; 5BMV A; 4FLV A; 4TQD A; 3PJS K; 2Y0P A; 2GSM B; 5IT9 N; 1KD1 W; 4LF7 O; 4JYB A; 2QKA A; 3WFV A; 4YJ3 A; 1KBH A; 2UU9 B; 3CD6 V; 3E22 B; 3CCL V; 3B40 A; 4NXN B; 3KKY A; 4DV6 B; 4DW1 A; 5LA6 A; 1OCO C; 3CJH B; 2FYU H; 4UVA A; 3RYH A; 3FYI B; 1GMG A; 1MZE A; 1Q6I A; 2LQT A; 1FXK C; 5JCO C; 1AVM A; 3HKB B; 4HAM A; 4TSF G; 2HVJ C; 2DJV A; 1TVK B; 2IH1 C; 1N32 B; 3OT7 A; 3UQ8 A; 2V1D A; 5IJ9 B; 4HZ3 A; 5CN0 A; 1MZF A; 4X1K A; 4B3R O; 1XQ8 A; 2RDC A; 5KA6 A; 1SQF A; 2OT5 A; 3K03 A; 2DOS A; 3K57 A; 3U11 A; 4EFB A; 1SET A; 1T5E A; 1ROP A; 5H9C A; 1NBM G; 3B77 A; 4Q20 A; 1L0N H; 4MS2 A; 4P2Z A; 2LGW A; 1HDJ A; 5EBM C; 1M56 B; 1F51 A; 3RN4 A; 4DR4 O; 2R70 A; 2ZIN A; 4X20 A; 3MAQ A; 4X66 O; 1KEC A; 5A9G A; 4I5S A; 2EBO A; 1UFI A; 2AXT Z; 2Q4P A; 4QIW F; 2Z5U A; 3DGE A; 5GW7 A; 1KU9 A; 3HPL C; 1GO3 F; 2DW4 A; 2DQ0 A; 1NVP D; 1PL4 A; 1AP6 A; 4LNU B; 2F4V O; 1Y4M A; 4E4E A; 1Y74 A; 3AK2 A; 4ZI7 A; 3SYA A; 4JI2 O; 1SZT A; 4FMT A; 3CC4 V; 3WB0 A; 1NJI W; 2RMK B; 2Q68 A; 1K3E A; 1W0J G; 5IYZ B; 4JI5 O; 2HFE C; 4QPJ A; 4OXS A; 1BS3 A; 4PA7 A; 1SQQ H; 3UKM A; 1Q81 W; 2AZ2 A; 1JVM A; 3RYF B; 3JD2 A; 4FIP C; 1SZX A; 4UVB A; 2YDE A; 1N0J A; 3AG3 B; 2YIB D; 1RP3 B; 3R66 A; 4DR7 O; 3LUT B; 2ETN A; 1PV0 A; 3LDC A; 3ZIA G; 4JI8 O; 2JS5 A; 3RBZ A; 5IDJ A; 2W6J G; 3T4Z A; 3IFX A; 2QJ1 A; 4B3S O; 4HNA B; 2ZE7 A; 3TXS A; 5KHI A; 2OWO A; 2BCC H; 4NYK A; 3UT5 B; 5DEC A; 4A5U B; 4JI6 B; 4FLY A; 1YJN V; 2ZE6 A; 2A0L A; 2XAS A; 4AQY B; 1RPO A; 2X6A A; 3JAL A; 2VS0 A; 2KB1 A; 4NR1 A; 2IM9 A; 5LGT A; 4FLU A; 3OEH G; 4FK5 C; 1BSM A; 5B66 Z; 2YC0 A; 4RQF A; 3T1Y O; 4GT1 A; 2QTS A; 3IGA C; 4CS3 A; 1E1Q G; 2E75 B; 4LFB O; 4JZG A; 5B1N A; 5DED A; 4DR5 O; 2GUZ B; 5H6Q A; 2YID A; 3BA9 A; 4YIO A; 2EIK C; 1R3K C; 3ZHS A; 4GKJ O; 4DYL A; 2A79 B; 2ZD9 A; 5LYJ B; 2KSD A; 2F93 B; 1URF A; 3RFR A; 1IBM O; 1AJQ A; 3CCE V; 3ABM B; 5GON A; 2D2C B; 2RCV A; 4JI1 B; 5LHH A; 5EBL C; 4O4I A; 4JTA B; 4O4H B; 3T1H O; 4CS4 A; 3STZ C; 2K9P A; 2JK5 C; 3F7V C; 2NN4 A; 4IIJ B; 4I50 A; 2JEX A; 5K1X A; 2V4D A; 3G6B A; 4J10 A; 5JJN B; 3CWB H; 3JD0 A; 1FJG B; 3K59 A; 2XAG A; 2ZM6 B; 2QDO A; 4LC1 A; 1Q6H A; 3HR0 A; 2ITD C; 3ZHR A; 3SJB C; 3CCJ V; 1NTK H; 4R6Z A; 4IYH A; 2NNU A; 3K5L A; 4JYY A; 4N21 A; 2ZE5 A; 5FNV B; 3H1H H; 2HR3 A; 4U7O A; 1WPX A; 2QTO A; 2DE0 X; 1Y76 A; 3CS5 A; 5LMN O; 4K0K B; 4J41 A; 3HKC B; 2FKX A; 2WLK A; 1NI8 A; 3WG7 B; 5EZY A; 2CTQ A; 4B3T O; 3W7W A; 5A2Q N; 1LNQ A; 1ZSP A; 2VWJ A; 3ZRS A; 1D5N A; 2AHY A; 1SES A; 1WB8 A; 4OX9 B; 1ZL8 B; 2WWW A; 1Z5W A; 4UB8 Z; 2CH7 B; 4I0X A; 4GX2 A; 2KKW A; 1OHH G; 4BIU A; 3R65 A; 4X88 A; 1XMO O; 3JAK A; 3CCQ V; 4LFC O; 4DUZ B; 3ETG A; 3OMI B; 1WA8 A; 1P4R A; 4FFB A; 4GX5 A; 5GTI Z; 4JYA B; 1I08 A; 2BOC C; 3DXR B; 4N23 A; 3FX7 A; 1NR7 A; 2IJK A; 2PUS A; 4KXR A; 5LXT B; 2GTA A; 4ASU G; 5J2U B; 1OCR C; 1J5E O; 2BSK A; 2ZXW B; 1N33 O; 3O9O A; 2E76 B; 1JCH A; 1O9G A; 4H13 B; 3RYC B; 4WFG A; 2X6B A; 1ARO P; 1U96 A; 2N74 A; 4LH6 A; 1Y66 A; 3CP1 A; 2A3Q A; 2N05 A; 3P3P A; 2P5O A; 3N2G A; 4TV8 B; 1AR5 A; 1BE3 H; 1PD3 A; 4LF4 O; 2UUB B; 3ASO C; 5LL6 Y; 1SF9 A; 1Q6U A; 4LBE C; 3ZRW A; 2PI5 A; 4NXM O; 1PP9 H; 2LP7 A; 1BGY H; 4QE7 A; 3EXA A; 4XDL A; 4F6R A; 3FKS G; 1SQX H; 4FZ1 A; 4J11 A; 4DR1 B; 2QWO B; 1GM9 A; 2QSA A; 1BQZ A; 5L3D A; 1P7G A; 1SS3 A; 3OD4 A; 1KMI Z; 4D6T H; 1PKX A; 4LF5 B; 2ZKO A; 3VQV A; 1GM7 A; 4PI2 A; 2XHB A; 4X65 B; 1VQ5 V; 1XNQ O; 1K34 A; 1S5L Z; 1Q5O A; 1P49 A; 3JAR A; 4W4K A; 1ZX3 A; 1N34 O; 5BXZ A; 3H9V A; 1YJW V; 1FXV A; 1M57 C; 4RUE A; 4MTF A; 1IUR A; 4DV4 B; 4TT3 G; 4JI7 B; 4ABM A; 2F43 G; 5B1B C; 4Z1V A; 1N36 O; 2W0F C; 2ZXW C; 3ICX A; 4MTX A; 1RM1 C; 1K4C C; 4JI4 B; 1P7B A; 3B2E E; 1VAR A; 4ZHQ A; 2YIA A; 1SQB H; 4LF8 O; 1PPJ H; 5DN6 G; 1VF6 A; 1EN4 A; 3J81 N; 2Q0O C; 1FFX A; 3CHX A; 2OYQ A; 2PYL A; 3DSQ A; 2EIL B; 4TWK A; 1SA0 B; 1L8D A; 2UXC O; 1V54 B; 4IHJ B; 3ML0 A; 4LF9 O; 4IL6 Z; 4YY3 B; 3BAB A; 1GK9 A; 2X6C A; 1COW G; 4P30 A; 2QWN B; 5BR8 B; 1QLN A; 2FL4 A; 2CGN A; 3AG2 B; 5L3C A; 1I94 B; 4FLW A; 1ZUQ A; 5JWP A; 4DV5 B; 3TXQ A; 2Z0A A; 4JTD B; 4DV0 O; 3OW2 U; 4X1I A; 1XHX A; 3W7U A; 4X64 O; 2QWP B; 5IY5 B; 1YJ9 V; 1QLE B; 1SC5 B; 5LP6 A; 4LFA B; 1R6N A; 1S0V A; 1Q86 W; 1MA1 A; 1GAX A; 1YTF D; 4O4J B; 2NLJ C; 5B5E Z; 2HHH B; 1GN2 A; 1AI5 A; 3EHB B; 3CCU V; 2ADQ B; 4EFE A; 2EJ7 A; 3T4D A; 3JYC A; 3GB7 C; 4GX1 A; 4JAA A; 2RQ6 A; 4TUY A; 3ABK C; 1S3J A; 1OCO B; 4JPR A; 1K4D C; 2EIL C; 1XMQ B; 2QE7 G; 5FPR A; 3P32 A; 4DR3 B; 3Q4H B; 1YCI A; 2P4V A; 1AI7 A; 3HKE B; 1NTM H; 2YUA A; 1YXB A; 3L73 H; 3G71 V; 3JAW B; 3SPH A; 5KUK A; 2XUM A; 5C8Y A; 2R9R B; 4WFH A; 2YS8 A; 4NXN O; 1S77 D; 4U3J B; 2IBZ H; 2H94 A; 4DK1 A; 3BFR A; 1KKC A; 2K1E A; 4GKK O; 2WAM A; 4XBF A; 3SPG A; 2ODM A; 4GLX A; 1N32 O; 2DWE C; 5EYP A; 5CA1 B; 3OGC C; 3CMA V; 3ABL C; 2A9H A; 4LCU C; 3RGB A; 2VQF B; 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2EIK B; 3ZHU A; 1DGS A; 3DTU B; 4CC5 A; 2WLH A; 4AQY O; 3ZHQ A; 3OR7 C; 1J95 A; 3E22 A; 4UVC A; 3ZBH A; 5IWA B; 4DV1 O; 2ZR2 A; 4JAV A; 4YJ2 B; 1YVW A; 2WLN A; 3JD3 A; 4UCV A; 3CJH A; 4WFE A; 3L72 H; 4FLT A; 2XAH A; 4AHC A; 3ZCC A; 5CBG A; 1BMF G; 2GBO A; 1XNR O; 4J7Z A; 1WAZ A; 5KHK A; 4J9Z B; 3APQ A; 1UJW B; 3HKB A; 4NB5 A; 4L87 A; 1V55 C; 5EIB C; 1TVK A; 2ILM A; 3L70 H; 1FXH A; 3RVZ A; 3ZN0 A; 4DV3 O; 4FLZ A; 4DR4 B; 5IJ9 A; 2XTA A; 2ZR3 A; 4JAU A; 1NH2 D; 4MVU A; 2WSS G; 1MSW D; 2QM7 A; 2EIN C; 2HJD A; 4O4L B; 1HNX O; 4FZ0 A; 1RSO B; 1EM1 A; 4JI1 O; 1JFF B; 3UCS C; 1F7Y A; 4D7T A; 2XAF A; 3QF7 A; 2GV9 A; 4KP4 A; 1YEW A; 4K35 A; 4QJF B; 3M99 B; 3LDD A; 4Z1M G; 1S72 V; 1FJG O; 5LGN A; 2ZM6 O; 4F6E A; 1YSC A; 1AJP A; 2UUA B; 1WP7 A; 3X2Q C; 3AG7 A; 4JI0 B; 3AG1 C; 2Q7G A; 3B4S A; 1NKD A; 3ZED A; 1KP3 A; 2ZDI A; 4JI5 B; 3U10 A; 1E79 G; 2H3O A; 4R8C A; 2ZIM A; 3SR2 C; 5CB4 B; 3I55 V; 3K9S A; 4D7S A; 4G27 B; 3JAM N; 2E74 B; 1Q82 W; 2HLD G; 2IJJ A; 4LNU A; 2QWQ B; 2EIM C; 1W2B U; 2A06 H; 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