The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
|
sequence length |
44
|
structure length |
44
|
Chain Sequence |
EALKILNNIRTLRAQARECTLETLEEMLEKLEVVVNERREEESA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Dna binding protein
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| molecule keywords |
DNA-binding protein H-NS
|
| publication title |
Structural Insights into the Regulation of Foreign Genes in Salmonella by the Hha/H-NS Complex.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium str. lt2
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| total genus |
12
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| structure length |
44
|
| sequence length |
44
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-12-10 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | H-NS histone-like proteins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1LR1 A; 4ICG A; 3NR7 A; 1NI8 A; 1OV9 A; 2MW2 B; #chains in the Genus database with same CATH topology 4ASU G; 1TVK B; 2EZP A; 1H2N A; 1PP9 H; 2RCV A; 2X0L A; 4CC5 A; 1XHZ A; 1YEW A; 4GKK B; 1Y66 A; 4JI2 O; 1BS3 A; 2UUB O; 2JS3 A; 2DQ0 A; 3IFX A; 3AG3 C; 4JI4 B; 1BQZ A; 1GN2 A; 1QU7 A; 3H1L H; 1KD1 W; 1S72 V; 2KSD A; 2PGG A; 2YID A; 2JDI G; 2XT9 A; 3AK3 A; 4W4L A; 4A5U B; 5LOV A; 2UXC B; 1AB3 A; 2XAJ A; 4TV8 B; 1AR5 A; 3DXR B; 2HLD G; 1PD3 A; 2V7Q G; 5IYZ B; 4B3M B; 5LXT B; 1Y67 A; 4X20 A; 2YUA A; 4UCO A; 4X1Y B; 4AQY O; 3ABK C; 5KUK A; 3VOU A; 4RUF A; 2EBO A; 4LWS B; 5DN6 G; 1QR8 A; 5BMV B; 2Z5U A; 4JAV A; 4JI5 O; 4JI7 B; 3RN4 A; 2Q6A A; 1RSO B; 2JIZ G; 2OCC B; 2XOK G; 5IT9 N; 1XMO O; 5B1A C; 3W7S A; 1M57 B; 4JYY A; 1N0J A; 1S77 D; 2ZNJ A; 5CB4 B; 2OTJ V; 3AG7 A; 1FJG O; 1JPX A; 1KU9 A; 1R6T A; 3OFN G; 1I08 A; 3UKM A; 3CCS V; 1SET A; 4K0K B; 2DOS A; 1Q6U A; 3KG2 A; 3LSS A; 4DR1 O; 3JSL A; 1LUV A; 3ZMZ A; 3GWK C; 2IM9 A; 4DUZ O; 3ZX6 A; 1I7F A; 1NVP D; 4I5S A; 4FPP A; 2YI8 A; 1M9N A; 5L3G A; 1AVM A; 2Q68 A; 2JGD A; 4J7K A; 4DR5 B; 2YEV A; 3T1H B; 1AI5 A; 3TET A; 4HZ3 A; 2M7W A; 2AHZ A; 5H9C A; 2QJ1 A; 4O4J B; 2EIK C; 2YXY A; 4FM2 A; 2CTP A; 2AZ2 A; 4K35 A; 4MVQ A; 1GO3 F; 4DR6 B; 5IJ9 A; 1XOU A; 1N4C A; 3OGI B; 2OTL V; 1MZE A; 2WLH A; 2JVD A; 1DLB A; 4JI1 O; 4DRX B; 4I9W A; 1GRJ A; 3SPC A; 4ZI7 A; 3BEH A; 3ZBH A; 4B7E A; 1YZB A; 4WFH A; 4FLY A; 2E5L O; 2DW4 A; 2F95 B; 1WA8 B; 5B5E Z; 2Y48 A; 3K5M A; 3KZI Z; 2HJD A; 4JTA B; 3QF7 A; 4DR7 B; 4E2L A; 1G4Y B; 1Q86 W; 2XHB A; 4AHC A; 2Y69 C; 2BTQ A; 3CCE V; 3OR6 C; 4MT8 A; 4FLU A; 2P67 A; 2RNB A; 2WLI A; 5CA0 B; 2ZNI A; 5IY5 B; 4B3R O; 3JAM N; 2Y4U A; 2EIM C; 5CN0 A; 3RYI B; 4QNH B; 4JI6 B; 3SPJ A; 2ATK C; 1QLN A; 4UVC A; 4LF6 B; 1B6Q A; 5L3E A; 2LW7 A; 4GLX A; 2QA4 V; 5BR8 B; 1VQ5 V; 2JRI A; 2WLL B; 1NH2 D; 2Q0A A; 4GKJ B; 1AP6 A; 3ZRW A; 1P49 A; 4LF7 B; 1IBL B; 5LA6 A; 3ABL B; 5H2F Z; 1VEW A; 2OCH A; 2YSU B; 5J2U B; 1R6N A; 4X65 B; 3FB7 C; 4O2A A; 1W0J G; 4ZHQ A; 3UO2 A; 1J5E O; 2CTW A; 2CGN A; 4H13 B; 1YCI A; 3D36 A; 3EXA A; 4I0X B; 4B3S B; 1N8R W; 2R9I A; 4PA3 A; 5LGN A; 2UXX A; 1JJ2 U; 5LGU A; 3OM3 B; 2AZ0 A; 4JYA B; 2UXD B; 4LF5 O; 4MTF A; 2DN9 A; 5LYJ A; 3BFR A; 4DV3 O; 2ZXW B; 3ABU A; 3SYO A; 5FNV A; 1FYJ A; 4NXM O; 3JYC A; 3FAV A; 3SYC A; 4MSW C; 4MTG A; 5K1P A; 4WFF A; 3K08 A; 1R1B A; 4X1K A; 2XTA A; 4EB6 B; 3I5D A; 4LP8 A; 2IJI A; 1DGS A; 1SQG A; 1UFI A; 1US6 A; 2H3O A; 2QM8 A; 1IZ3 A; 3TJT A; 5EBM C; 5LGT A; 1N34 B; 1XRE A; 2JGU A; 2V4D A; 4YJ3 B; 2RN9 A; 1RM1 B; 1ZAU A; 1QNM A; 3G4S V; 5FPR A; 1KKC A; 1Y4M A; 1JCH A; 5EBW C; 1XL4 A; 4DR2 B; 4CS4 A; 2UXB B; 1EFR G; 1AJN A; 4H44 B; 1YJW V; 3N27 A; 4P30 A; 3K57 A; 1VIB A; 3CEI A; 3OTF A; 1HNW B; 2P4V A; 5GW7 A; 1ZLZ A; 1R3L C; 3UO3 A; 2P7T C; 4PA7 A; 3RVZ A; 4LF9 B; 1Q8I A; 4KHP B; 4JAS A; 3AG4 C; 4ICG A; 4FLV A; 3J80 N; 2UU9 O; 2F66 C; 1K3E A; 1GM7 A; 1KP3 A; 3G6B A; 4DW1 A; 4CH5 A; 3JAK A; 3X2Q B; 5LL6 Y; 1Q43 A; 4FIP C; 2Q8V A; 1BCC H; 2YI9 A; 1GM8 A; 3CC7 V; 5EYP B; 1O9G A; 3HR0 A; 2ADP A; 1N0N A; 1AI4 A; 3CJH A; 4U3J A; 2PI5 A; 3C90 A; 3RYH B; 3D36 C; 3ZJZ A; 4TWK A; 3P3N A; 1BE3 H; 1L8D A; 1VQP V; 2W0F C; 3O9O A; 2EIJ C; 1YTF B; 4YHH B; 3C3S A; 1SA0 A; 1MZF A; 2WSS G; 2WLK A; 3T2M A; 2HEP A; 4JI3 B; 3T1Y B; 3OMA B; 4JI0 O; 1Y76 B; 4DXW A; 1ZL8 B; 5JCO A; 1K5Q A; 5LHG A; 4OPH A; 1G8M A; 4XDL A; 3D3Q A; 2BCC H; 2RMK B; 4X9Q A; 1JFF B; 1Z2G A; 3K5L A; 1Q6I A; 3DXR A; 1ZSP A; 3RGB A; 3QTC A; 3U11 A; 5IYZ A; 1VF7 A; 1VF5 B; 1N33 B; 5LXT A; 2BSK B; 3ZMU A; 4UCV A; 1E79 G; 1XNQ B; 3HKE B; 2ZR2 A; 3K03 A; 4LWS A; 5BMV A; 1SZT A; 1FFX B; 3MD0 A; 3OR7 C; 1RSO A; 1HNZ O; 4LBE C; 4DR3 O; 5JJN B; 1Q7Y W; 2EX3 A; 1VAR A; 4CS3 A; 2UUC O; 4UB6 Z; 3JAT B; 2K9P A; 3CHX A; 3SGI A; 4PI0 A; 1VP7 A; 3JAR B; 2ZM6 B; 1VQ6 V; 1DTO A; 2ZE6 A; 4JI8 O; 2LGW A; 1QLE B; 3N2G B; 1CXZ B; 2VQE B; 4QE9 A; 4F6E A; 1K33 A; 2YIC A; 4O4L B; 1V54 C; 3KCX A; 1K4D C; 4FLT A; 4NTX A; 3M7M X; 2XAQ A; 4LH6 A; 4NR1 A; 4BAY A; 4DV7 O; 4LH7 A; 4DV0 B; 1HR0 O; 1NR1 A; 4UXN A; 2MK3 A; 4KXR A; 4CH3 A; 4AI8 A; 4LF4 O; 4O4J A; 3TXS A; 1KP2 A; 1KQS U; 3CXH F; 4CS2 A; 2VWJ A; 1FAF A; 3OMI B; 1IBM O; 5D5Q A; 4TV9 B; 4DV6 B; 4HAM A; 1SQP H; 4X66 O; 1XMQ B; 1BQ0 A; 2QWO B; 3CCR V; 4DUY B; 4DRX A; 5JCO C; 3ASN B; 4O4H B; 2H8P C; 2F93 B; 2A06 H; 1YJ9 V; 4OX9 O; 1CP9 A; 3W7T A; 3CRR A; 5KA5 A; 3DC5 A; 4ZKI A; 2Q7E A; 1WA8 A; 2WA4 A; 1P84 F; 1NS1 A; 5B1B B; 2R70 A; 4P2Z A; 1D5A A; 1D2D A; 3EVK A; 2GUZ B; 1MA1 A; 5HFM A; 1M56 C; 1HP8 A; 2DYR C; 2AW9 A; 1UPG A; 3W7U A; 5CA0 A; 5IWA O; 3KKY A; 4ZBM A; 1EBO A; 4QE7 A; 3RYI A; 1M57 C; 1JQ0 A; 3OTO O; 1H2G A; 4TT3 G; 3CE2 A; 3T4Z A; 4PDR A; 3HKD B; 4EFB A; 1IX9 A; 1ENV A; 1KKD A; 2QWR B; 3UQ8 A; 3ZN1 A; 4TQF A; 4LFA B; 1NJI W; 1QCE A; 2UXN A; 1F7Y A; 3ML0 A; 3QO5 A; 2GTS A; 1IBK B; 3SJA C; 4X62 B; 2WLL A; 2Q7H A; 4IYI A; 3ZRX A; 4NTW A; 3RYF B; 4WFG A; 5J2U A; 4KP4 A; 1ROP A; 5EK0 A; 1THZ A; 3STZ C; 2MW2 B; 4JI4 O; 1N32 B; 2P22 C; 4DR4 B; 2B1G A; 2ITD C; 4CC6 A; 4NYK A; 5A2Q N; 1U96 A; 4I50 B; 4Q20 A; 4I0X A; 5B1O A; 3Q4H A; 1SF9 A; 3P3P A; 5LMU B; 4R8C A; 1NTK H; 4XDJ A; 1Q90 D; 1LR1 A; 5FPO A; 1NQT A; 2EZO A; 3J7A U; 2UXC O; 1NBM G; 4JYB A; 3ETE A; 5LHI A; 4HYO A; 4IT5 A; 3WB1 A; 2F43 G; 2RDC A; 1S5H C; 2Q9L A; 1XIL A; 4B3M O; 2M6Y A; 2WLN A; 4DV2 B; 2BE3 A; 3A0B Z; 1F51 A; 1PV0 A; 4RUE A; 5L3C A; 1YSC A; 3IC9 A; 4GX2 A; 5FLX N; 5IJ0 B; 3CCM V; 3ICX A; 4EB6 A; 3JD4 A; 3CRA A; 3VQY A; 1YVW A; 4Q6G A; 2NLJ C; 3SYQ A; 1MG1 A; 1DK1 A; 4YJ3 A; 4JZ2 A; 2R72 A; 4JI2 B; 3F5W C; 4K3A A; 3LSQ A; 1BHA A; 2UUB B; 5KAF Z; 5IY5 C; 2CK3 G; 3IJ4 A; 5HFL A; 1OV9 A; 3L70 H; 2A3Q A; 1AJQ A; 3ZHT A; 4K0K O; 4ZOL B; 4UV9 A; 2QEX V; 2PTM A; 2RJZ A; 2B5U A; 3IAY A; 5EIB D; 2IH3 C; 4PHZ A; 1AR4 A; 2IBZ H; 2YS8 A; 1GN3 A; 1PM9 A; 1Q6H A; 4OXS A; 2EJR A; 3H1K H; 1Q5O A; 1HWY A; 1V55 B; 1WNS A; 4IGG A; 4K8Z A; 1OCZ C; 5KX5 B; 5CBH A; 5ITZ B; 4TSF G; 4DK1 A; 4MVS A; 3T1H O; 2FL4 A; 1I94 O; 4UCU A; 5KHH A; 2A79 B; 2ITC C; 3W7W A; 2Y0P A; 1P7G A; 2HG5 C; 3OAA G; 3ABL C; 3NXS A; 1SC5 B; 3K0G A; 2EUL A; 3SPH A; 4TQD A; 4JZG A; 4DR6 O; 5EYP A; 1NKD A; 1BMF G; 4YIO A; 4MTO A; 3L73 H; 4G27 B; 3RYH A; 4LFB B; 3SDL A; 4FM0 A; 3L75 H; 1TA8 A; 2A7W A; 1WLE A; 2B1I A; 2AGA A; 4JV5 O; 1FS0 G; 1YI2 V; 1ZWI C; 2DYS B; 2ZE8 A; 5L3B A; 3L72 H; 3CC2 V; 3JAS A; 2DWD C; 2PF4 E; 4CH4 A; 3N2K B; 1GKF A; 2F4V B; 5BZB A; 1Q3E A; 1XUQ A; 2GV9 A; 2XAG A; 1CEZ A; 2V1D A; 1K8A W; 1RFY A; 3JSN A; 2CTQ A; 2LW1 A; 4RQF A; 5IYB O; 1G1X B; 2W0X A; 2HJF C; 3B8M A; 3JAL B; 1Y76 A; 1ORQ C; 3ZHR A; 2Q7G A; 1MSW D; 1H8H G; 1GN4 A; 3AG3 B; 4JI6 O; 3BRC A; 3WFV A; 2EIL C; 2P6J A; 4YY3 O; 3SJB C; 2X6B A; 2XAF A; 1RM1 C; 1KMI Z; 5J2T B; 3F5T A; 2BSK A; 1COW G; 2W6J G; 1N36 O; 1B04 A; 3CWB H; 1FFT B; 1ZTE A; 3EHB B; 2A0L A; 4FZ0 A; 4XDK A; 3LSU A; 5BR8 O; 1FXH A; 1GTO A; 2ZCE A; 3S3X A; 1FFX A; 3K9A A; 5KMG B; 4D6T H; 4LF8 B; 2E5L B; 1SQF A; 4IYH A; 2KKW A; 4HBN A; 4GKJ O; 4J7J A; 1WP7 A; 1Y74 B; 1SER A; 4LF7 O; 4YJ2 B; 3ZED A; 4CZZ A; 2L35 A; 3K59 A; 3JAT A; 4DV1 B; 3JAR A; 1MOF A; 3X2Q C; 1X59 A; 1FXK B; 5JWP A; 3DSQ A; 3N2G A; 5JVD B; 3BCC H; 5KHI A; 2OWO A; 4W4K A; 4I7Z B; 3VQX A; 5JJE B; 3ZMT A; 1AJP A; 5KHJ A; 4G28 B; 2YIB D; 3H1J H; 4UFZ A; 4JYA O; 2UXD O; 3J81 N; 4DW0 A; 5BY1 A; 4WFE A; 4PA6 A; 1QQC A; 4JTC B; 3G80 A; 3BHP A; 4LFC O; 1GH6 A; 3JCZ A; 5CA1 A; 2LO1 A; 4ZIB A; 3ZHQ A; 3GWO A; 4F6R B; 4DK0 A; 2PY5 A; 4TV9 A; 1IDS A; 4X8A A; 3ZS8 C; 4O4H A; 4AIL C; 2CTR A; 1PPJ H; 2HVK C; 1IVS A; 4FFB B; 1J5E B; 2OIG A; 3NR7 A; 1EM1 A; 3ZHS A; 2ETN A; 1B06 A; 2NNU A; 4X64 O; 2UXB O; 2BOC C; 1EZJ A; 4IHJ A; 1BZK A; 3HKC B; 1FD9 A; 5IE9 A; 2Q5Z A; 5B66 Z; 1AP5 A; 2VQF B; 4LF9 O; 1G6U A; 1K9M W; 4KHP O; 3CCL V; 1TUB A; 2ADQ B; 5JQG B; 2DMX A; 1K7D A; 1QBZ A; 1YIT V; 4NXM B; 3CMA V; 2X7R B; 4N21 A; 1H2M A; 3I55 V; 3CME V; 2Y69 B; 3ABM C; 2OIE A; 3HB3 B; 2IJH A; 3SR2 C; 1I5X A; 1Z5W A; 3JD3 A; 5A9G A; 4ABM A; 3K04 A; 4NKG B; 3HKD A; 1QLE C; 3BA9 A; 4MW3 A; 3DGE A; 2B9Z A; 4IL6 Z; 1ZUQ A; 4R50 A; 2QE7 G; 2P4K A; 4O2B B; 2LQT A; 4I55 A; 5EIB C; 1OCO C; 1Y6X A; 1SQQ H; 5C8Y B; 4XBF A; 4WBN B; 4MS2 A; 3RYF A; 4YHH O; 3FYE B; 1PNL A; 2FTK A; 2LJ2 A; 2ZIO A; 4BWA A; 4J9Z B; 4TUY B; 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3THO A; 1HNX O; 1H38 A; 2CUG A; 2FKX A; 1VMG A; 1E1Q G; 1MSD A; 1XNR B; 3H1I H; 2Z0A A; 3N2K A; 2LGQ A; 4UCT A; 1VQ4 V; 3CCQ V; 2ZD9 A; 1MNG A; 4BW9 A; 1S0V A; 3QVN A; 4CH6 A; 1NVP B; 4B3T B; 1BL8 A; 3CXC U; 1ZX3 A; 3ASO B; 3JAL A; 3FB6 C; 3APO A; 1AI7 A; 4BR6 A; 2Q69 A; 4B08 A; 4FK5 C; 3SJC C; 2DWE C; 2ZQM A; 1M1K W; 2ZR3 A; 2X6A A; 1P7B A; 1SS3 A; 3CD6 V; 3K5N A; 3FFQ A; 1T5E A; 4JYC A; 5J2T A; 3STL C; 3ZMS A; 3H01 A; 5KAI Z; 5H5N A; 4EKW A; 3CP1 A; 3E35 A; 2OCC C; 4LFA O; 2GBO A; 4J80 A; 5CMU A; 4OX9 B; 1VQL V; 1SZX A; 3FKS G; 1IBK O; 3RFR A; 5KMG A; 1TAE A; 4X62 O; 1YF2 A; 1V55 C; 1AI6 A; 1Y74 A; 1I5Y A; 4X89 A; 4NVP A; 5L3F A; 2ZE5 A; 2QTS A; 5E1A C; 5H6R A; 3WG7 B; 2KB1 A; 4I4T B; 2Z3Y A; 2KG7 B; 3ETG A; 4J10 A; 5LMN O; 4UB8 Z; 4DV5 B; 1YTF D; 2Q4P A; 1N32 O; 1FXK A; 1PNK A; 3M8A A; 5LP6 B; 5JVD A; 2EIN B; 2O57 A; 3SJQ C; 1VF6 C; 3JAK B; 3RBZ A; 4GKK O; 2LFR A; 4IIJ B; 1R3I C; 3OTO B; 2AXT Z; 4R6Z A; 1Q81 W; 4MTX A; 1K97 A; 3GB7 C; 3TXQ A; 3G71 V; 4DO2 A; 1XI1 A; 1DF5 A; 4DV2 O; 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