The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
44
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structure length |
44
|
Chain Sequence |
b'EALKILNNIRTLRAQARECTLETLEEMLEKLEVVVNERREEESA'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A Three-protein Charge Zipper Stabilizes a Complex Modulating Bacterial Gene Silencing.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Hemolysin expression-modulating protein Hha
|
| source organism |
Escherichia coli k-12
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| molecule tags |
Dna binding protein
|
| total genus |
15
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| structure length |
44
|
| sequence length |
44
|
| chains with identical sequence |
C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2014-10-24 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | H-NS histone-like proteins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3NR7 A; 1OV9 A; 1LR1 A; 2MW2 B; 1NI8 A; 4ICG A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3T1H O; 4B3R B; 1N33 O; 3E22 A; 2N74 A; 3T1H B; 2RN9 A; 1R3J C; 2ZR2 A; 1N33 B; 4N21 A; 4B3S O; 4GT1 A; 4B3S B; 1NS1 A; 2ZIN A; 4MW8 A; 3RYI A; 2IU3 A; 5CB4 B; 2R72 A; 3K5L A; 1BCC H; 5KHG A; 1BGY H; 4KXR A; 4WFE A; 5LGT A; 1N0J A; 1QU7 A; 5HFL A; 2CH7 B; 4B08 A; 1THZ A; 3WFV A; 4MVZ A; 1SQQ H; 5D5P A; 2D2C B; 4MTF A; 1SES A; 2CGO A; 1PNM A; 3OUS A; 1RFY A; 1QHT A; 1I7F A; 1Y74 B; 1HNW O; 1HNW B; 1VAR A; 4J11 A; 4DV6 O; 4DV6 B; 1VF6 C; 2D3O W; 3F5W C; 4P9P A; 1VQN V; 4MSW C; 1FXK C; 1SRY A; 3ABM B; 2QWO B; 1DTO A; 1LNQ A; 3N2K A; 1IVS A; 1NH2 B; 1K97 A; 1S0V A; 2FKX A; 3E8F A; 1VQ4 V; 1XL6 A; 4IYI A; 2ZXW B; 4JAV A; 1NTZ H; 1XI1 A; 1QNM A; 3TET A; 5H9C A; 1BHB A; 4PD4 F; 2YEV B; 2E3C A; 4GKK O; 2EJ7 A; 4GKK B; 3PJS K; 4ZI7 B; 1Q3E A; 4DUY O; 3K5N A; 1W0K G; 5CA3 A; 4DUY B; 1P4R A; 4AQY O; 1R6K A; 5BMV B; 4ZHQ B; 4AQY B; 4B7E A; 1B6Q A; 1FPO A; 3IC9 A; 5L3F A; 5KAI Z; 2CTR A; 2F43 G; 1MG1 A; 3GVM A; 3CCU V; 2WPD G; 2RDC A; 2XHB A; 4OX9 O; 2YXH A; 4OX9 B; 2P90 A; 1K73 W; 4DV2 O; 3LSQ A; 1JVM A; 3CCJ V; 4DV2 B; 2ZT9 B; 1ZL8 B; 3ETE A; 1YTF B; 3A0B Z; 4KP4 A; 5EBM C; 2CTQ A; 3MAQ A; 2Y69 C; 5HFM A; 5JJN B; 5DN6 G; 4O4L B; 3ASN C; 3C90 A; 1F51 A; 5KMG B; 3QO5 A; 3E35 A; 5BY1 A; 3A0H Z; 4JYY A; 1XHX A; 4PI0 A; 1Q82 W; 3K5M A; 4QGP A; 3DXR B; 4NTX A; 3T4D A; 1NR7 A; 2DJV A; 3IGA C; 3RW0 A; 5KHH A; 4XDL A; 5LA6 A; 2QTS A; 5JCO A; 3BHP A; 3FD9 A; 1F7Y A; 4DR7 O; 1R6N A; 3BCC H; 4ICG A; 4DR7 B; 1CXZ B; 1QQC A; 3OTO O; 2EIK C; 2ZDI C; 2PI4 A; 3FB6 C; 2ZIM A; 3OTO B; 2DYS C; 1AP5 A; 1NH2 D; 2ZCE A; 4LR3 A; 5EYP A; 4I4T B; 1DF4 A; 2IH1 C; 5EZY B; 1M56 B; 4R6Z A; 5LMN O; 4F4L A; 5JQG A; 1NR1 A; 2VQF O; 5LMN B; 3HKB A; 3SYQ A; 2W0X A; 1ZAU A; 2VQF B; 5IT9 N; 4MVQ A; 4PA4 A; 1IXM A; 2QKC A; 2P22 C; 1G8M A; 1SQF A; 2WSS G; 3OD4 A; 3TXQ A; 2PUS A; 2IW5 A; 1MSD A; 2Q4P A; 4I0X A; 4K0K O; 1XQ8 A; 4K0K B; 3LNM B; 4JAS A; 4DR6 O; 3FYI B; 3ZMV A; 2W6I G; 4DR6 B; 1VEW A; 4KUM A; 3BAA A; 3BRC A; 3DC5 A; 5J2T B; 4UV8 A; 3D3I A; 4WFB V; 1K5S A; 2M7W A; 2UXD O; 5B1B C; 2UXD B; 1WA8 A; 3U10 A; 4PEL A; 4B3T O; 2VQE O; 1S5H C; 4TUY B; 4B3T B; 4LCU C; 2VQE B; 2YDE A; 1US6 A; 3LSS A; 4MW3 A; 1AI5 A; 1YCI A; 1FYJ A; 1SET A; 1K7D A; 4EFB A; 5LGN A; 4XBF A; 2BSK B; 2JGD A; 3ZHR A; 1XNR O; 1XNQ O; 1YIJ V; 4PA9 A; 3K57 A; 1XNR B; 1XNQ B; 5IYD O; 3G71 V; 4CBC A; 3L73 H; 4RUE A; 1KUQ A; 3ICX A; 5TIS Z; 2DE0 X; 1SC5 B; 3CCS V; 1VIB A; 4N23 A; 4CS3 A; 4J80 A; 2X6C A; 5KAF Z; 5H5N A; 4PHZ A; 3X2Q C; 5EC2 C; 3JAR B; 1K3E A; 2HVK C; 3LUT B; 4LH7 A; 3H1H H; 3OTF A; 2JGU A; 4BAY A; 1MMM A; 1SS3 A; 3APQ A; 4LF4 O; 5GTI Z; 1IZ3 A; 1AR4 A; 1FFX A; 3K0D A; 4LF4 B; 2ARH A; 3K5O A; 3GB7 C; 5LOV B; 1KP2 A; 2BTQ B; 3STL C; 3THO A; 1T5E A; 2Y0P A; 3SPH A; 1Q6I A; 5B1O A; 3CJH B; 1IBL O; 3ABL B; 4BW5 A; 1IBL B; 4G28 B; 5EIB C; 1DK1 A; 3CHX A; 2EIN C; 3GWK C; 4NTY A; 1CP9 A; 4PDM A; 4TOI A; 2LW7 A; 4H44 B; 4TV8 A; 4GX2 A; 4O2B B; 1PM9 A; 2UXN A; 3SDL A; 5B1N A; 2XAJ A; 1W59 A; 2HG5 C; 2XT9 A; 2H3O A; 5CA0 B; 1V55 C; 5ITZ B; 3CCL V; 4UV9 A; 5D5Q A; 3L72 H; 1I0H A; 4BIZ A; 3K58 A; 5LP6 B; 3NXS A; 1JFF B; 3LDE A; 1B3Q A; 3JAK A; 2ZDI A; 3SPJ A; 4CH4 A; 3RYH A; 1BL8 A; 1L0N H; 3IFX A; 2R70 A; 4UVC A; 2P06 A; 3ASO B; 4O4H A; 2ILM A; 1B04 A; 4H33 A; 1XIL A; 1FJG O; 4PA7 A; 1QR8 A; 4DR4 O; 3BAB A; 1FJG B; 4DR4 B; 1COW G; 3BY6 A; 2NLJ C; 1AI6 A; 3OMN B; 5FPO A; 4WCE V; 3OT7 A; 2W0F C; 1KEC A; 1LUV A; 2JS3 A; 1JCH A; 2ZD9 A; 3D36 A; 4J9Y B; 4J7K A; 2UXC O; 1YI2 V; 2UXC B; 4MTX A; 2Q8V A; 4TV9 A; 5L3C A; 2GUZ A; 3H1K H; 3G6B A; 4RQE A; 1W0J G; 1GAX A; 4UB6 Z; 1U97 A; 2JRI A; 3JSN A; 1YF2 A; 2Q73 A; 2BOB C; 3HKC B; 1XUQ A; 3UKM A; 4K8X A; 4WBN B; 2K1E A; 5GON A; 4YJ3 B; 1XBL A; 1V54 B; 4F6R A; 2P4V A; 2HKO A; 1GN6 A; 5JVD B; 1H2L A; 4RO2 A; 1M57 B; 2FB5 A; 1M4U A; 5IYZ A; 2F66 C; 1GH6 A; 2JDI G; 1SQX H; 4PI2 A; 4FLT A; 5E79 Z; 3N2G A; 1YXB A; 4G2K A; 4X65 O; 4GKJ O; 1OV9 A; 1X4T A; 4X65 B; 1RSO A; 4GKJ B; 4K35 A; 3AG4 B; 3B8M A; 2EJR A; 1OCC B; 4O2A A; 3T1Y O; 3JAW A; 1VQL V; 2GTS A; 3T1Y B; 3J80 N; 5IJ9 A; 4IT5 A; 3JSL A; 3CEI A; 4YJ2 B; 2XND G; 4GX1 A; 4LBE C; 3U11 A; 4F6E A; 1EN5 A; 1NZ6 A; 1K4C C; 2OIE A; 3K9S A; 2ZE6 A; 4JV5 O; 1IUR A; 4I55 B; 4JV5 B; 1S3J A; 2EIJ C; 2JS5 A; 3M7M X; 5IWA O; 2CTW A; 3RYF A; 5IWA B; 1XMO O; 3WU2 Z; 3ZMZ A; 1XMO B; 5B3S B; 3CRC A; 1SQG A; 2E76 B; 4JTA B; 3QVN A; 3JD0 A; 1YJ9 V; 2E5L O; 1UJW B; 3K08 A; 3ZX6 A; 2E5L B; 4I9W A; 3E8B A; 4DRX A; 3L75 H; 4WFG A; 4FJC C; 4GX0 A; 2WLL B; 1GMG A; 3RN4 A; 4PV1 B; 2IJK A; 2EZP A; 3K3W A; 1Z5V A; 2F4V O; 3AG3 C; 3W7S A; 2F4V B; 5LHI A; 3A8T A; 1IXB A; 4H13 B; 1N8R W; 4JI4 O; 1M93 A; 4FVM A; 3RFR A; 2P5O A; 4JI4 B; 2Z3Y A; 3QNE A; 2BOC C; 3RYC B; 4NKG B; 4PJ0 Z; 1ZSP A; 4IIJ A; 4X64 O; 2OYQ A; 5LMU O; 1J95 A; 1E1Q G; 4JI1 O; 4X64 B; 5LMU B; 1EN6 A; 3UM7 A; 2IBZ H; 4O4J B; 4JI1 B; 2LGQ A; 3ETD A; 4Z1V A; 2E75 B; 1HR0 O; 1TUB A; 2A79 B; 1HR0 B; 3HKE B; 4B7K A; 4ZOL A; 2UUB O; 2WLJ A; 2UUB B; 1O9G A; 4MVU A; 4DR3 O; 1KP3 A; 1TVK B; 3ABK C; 4O4I B; 4DR3 B; 3CYO A; 5KX5 A; 1S77 D; 4X88 A; 1FXH A; 2QDO A; 1FXK B; 4QJF B; 1FAF A; 2YIC A; 3CS5 A; 1MA1 A; 2UUC O; 2ETN A; 4PDL A; 2UUC B; 1K8A W; 4HNA A; 4X1I A; 1NT2 B; 5AG2 A; 3H1J H; 5KA5 A; 2BCC H; 1Q6H A; 5JCO C; 5KLV H; 2YIB A; 1UPG A; 2UUA O; 1SQP H; 5J2U B; 2UUA B; 1H2N A; 3LSU A; 1EFR G; 3VQX A; 1Z5W A; 5B1A B; 3ZRV A; 1XRE A; 1AVM A; 3CRQ A; 5FLX N; 3ZMT A; 1Y76 A; 2H94 A; 4Z1M G; 3JAS A; 1NBM G; 3CE2 A; 3C3T A; 4GCZ A; 2ZR3 A; 3L70 H; 2Y4T A; 3KG2 A; 4J9Z B; 4LF5 O; 4DYL A; 4ZKI A; 4LF5 B; 5F2V O; 3T4Z A; 3E8H A; 2AGA A; 1WP8 A; 1H8E G; 4UCR A; 5LXT A; 1I5X A; 1VQ6 V; 3FAV B; 3OMI B; 5FNV B; 2QSA A; 4DV7 O; 4AI8 A; 4WFF A; 4DV7 B; 2WLN A; 3S3X A; 2RJZ A; 1TA8 A; 1VQK V; 3OW2 U; 4AIL C; 3IC7 A; 4UCV A; 5KA6 A; 3FYE B; 1G1X B; 2Y69 B; 1Q7Y W; 4FPP A; 3ZN0 A; 2EIM C; 3ASN B; 3ETG A; 4XDK A; 2YXL A; 1AI4 A; 5KUM A; 3TXS A; 3P3N A; 3ZBH A; 4CS4 A; 4L87 A; 3OGI B; 4KFM A; 5IY5 C; 3K59 A; 4LH6 A; 1IBK O; 1BZK A; 4EKW A; 4X1Y A; 3CCR V; 1IBK B; 3VQV A; 3OMA B; 1AR5 A; 2DW4 A; 2ZIO A; 2F95 B; 1H2G A; 1KKC A; 4MVR A; 4FLX A; 2XOK G; 2A7W A; 2ZM6 O; 2DYS B; 4J7Z A; 2ZM6 B; 3STZ C; 5DED A; 1J5E O; 1J5E B; 2ATK C; 2FTK A; 1CEZ A; 4X66 O; 2NN4 A; 1SA0 A; 3W7T A; 4X66 B; 2VWJ A; 2LO1 A; 4B3M O; 2DYR B; 3DGE A; 1JQ0 A; 4B3M B; 2EZO A; 4XDJ A; 1HW7 A; 1D5A A; 3VOU A; 5CBF A; 3B77 A; 3CME V; 1GRJ A; 3SPG A; 2GDS A; 2YXY A; 1NTK H; 4I9Q A; 4UCO A; 3ZHT A; 3WB0 A; 1XOU A; 4BIU A; 3CRA A; 2KG7 B; 4G27 B; 5BR8 O; 3FKS G; 5BR8 B; 1ENV A; 3ZHV A; 3JAL A; 2C2A A; 2KQX A; 4KHP O; 4UFZ A; 5EC1 C; 1VQ9 V; 4LF6 O; 4KHP B; 3FB8 C; 3T1C A; 3ZJZ A; 4E2L A; 1D5N A; 4LF6 B; 3ZS8 C; 5IJ0 A; 3OEH G; 3EFF K; 3JAT B; 1GK9 A; 2QEX V; 4UVB A; 3R66 A; 5B5E Z; 3OR7 C; 1L1F A; 1JR9 A; 1KKD A; 1WAZ A; 1GM9 A; 3CC2 V; 1JA8 A; 4AHC A; 1YEW A; 3QTC A; 1AJP A; 4X89 A; 4NR1 A; 4FFB B; 5EK0 A; 3BA9 A; 4DR1 O; 4OGQ B; 4DR1 B; 3UT5 B; 3CWB H; 2Y4U A; 1IX9 A; 5C93 A; 2ZE7 A; 1Q90 D; 4LWS B; 3X2Q B; 4ASU G; 1OCZ C; 2DMX A; 1BSM A; 4I7Z B; 4HBN A; 4J10 A; 3ABM C; 2ADQ B; 4K3A A; 2QM4 A; 3LDD A; 4UXN A; 3C3S A; 1YHQ V; 1MZF A; 4J41 A; 4IHJ A; 1V9P A; 1TAE A; 3WG7 C; 4JI6 O; 1QVG U; 4JI6 B; 3VQW A; 4U3F H; 4KL1 A; 2O57 A; 3D36 C; 3SJA C; 3Q4H A; 3JYC A; 3H01 A; 4JTD B; 3SJC C; 5JJE B; 2YS8 A; 3ETQ A; 1R73 A; 5CA1 B; 4QE7 A; 2QTO A; 3SYA A; 5LYJ A; 2WAM A; 1EBO A; 2DWE C; 1W2B U; 1SZT A; 2GTA A; 1X59 A; 3JD2 A; 2PI5 A; 1TUE B; 3RT3 C; 4EB6 A; 4BR6 A; 3IAY A; 3CXH F; 4RQF A; 4TSF G; 4UUJ C; 4LNU A; 1RM1 B; 2QGN A; 1MNG A; 3HKD A; 4CC5 A; 1JMK C; 1F4M A; 3K79 A; 1V55 B; 1JX9 A; 3ZCC A; 2HP8 A; 4X1K B; 2XAS A; 1L0L H; 1D2D A; 2GBO A; 2Z0A A; 3ZRW A; 4JGS A; 1FS0 G; 4HYO A; 4EFE A; 5C8Y B; 2ODM A; 5H2F Z; 4I50 B; 5IDJ A; 4QPJ A; 4JAA A; 2WLI A; 4X20 A; 4YHH O; 4YHH B; 2Q5Z A; 3DC6 A; 4JPR A; 3ZIA G; 3H1L H; 2DWD C; 1HWY A; 4U3J B; 1FD9 A; 3JD1 A; 3OM3 B; 3UQ8 A; 5L3E A; 4OPA A; 2R9A A; 3D8C A; 3AK3 A; 2A3Q A; 2YUA A; 5CB4 A; 1Q5O A; 2OCC C; 3F7Y C; 3ZHQ A; 1K9M W; 2ZNJ A; 4IGG A; 1XEQ A; 4IYH A; 3E22 B; 2B1G A; 1Q6U A; 3M8A A; 3SYC A; 3ZMU A; 5DM6 V; 5EIB D; 1S76 D; 5EBL C; 2CH7 A; 3RYI B; 3FB5 C; 3SPI A; 3MDS A; 1RPO A; 3P3P A; 1GM7 A; 1P7G A; 2ZE8 A; 3B4S A; 3FFQ A; 1FFT B; 3QF7 A; 2VWK A; 1Y74 A; 1NU1 H; 3G4S V; 2QWN B; 1F4N A; 2PGG A; 3K04 A; 3OUF A; 3CC7 V; 4JF3 A; 2AHY A; 4FLY A; 2HHH O; 1K33 A; 1GN4 A; 2HHH B; 4R8C A; 1VF7 A; 1SER A; 1F23 A; 2YI8 A; 5GTH Z; 2WWW A; 4GUN A; 3K06 A; 3JCZ A; 3K0G A; 2XAQ A; 2H8P C; 4YIP A; 4DR2 O; 1SF9 A; 1NTM H; 1OJH A; 4DR2 B; 1AJQ A; 3G80 A; 2GV9 A; 2YEV A; 2A0L A; 1XDC A; 2F93 B; 3N2K B; 5FPR A; 1E1R G; 3EXA A; 2EIJ B; 5IYC O; 2CDY A; 3SYP A; 2RNB A; 4MVS A; 3SJQ C; 4ZI7 A; 3KCY A; 4LFA O; 5IYB O; 4LFA B; 3ZHU A; 5BMV A; 4ZHQ A; 3VBB A; 3I56 V; 2Z5U A; 4D7T A; 2YID A; 4HAM A; 1HDJ A; 2YI9 A; 2Q68 A; 2LFR A; 2YIB D; 2LJ2 A; 4JI3 O; 4FZ1 A; 1KC8 W; 2OTJ V; 4JI3 B; 2AZ0 A; 4FFK A; 4LFB O; 1YVW A; 4CZZ A; 4LFB B; 2PYL A; 2CGN A; 2CUG A; 1QLN A; 3P32 A; 1ZL8 A; 3RVZ A; 2P4K A; 5K1X A; 3JAM N; 4JYC A; 3P30 A; 1Y66 A; 4CS2 A; 2Q7G A; 4O4L A; 5L3B A; 3KZI Z; 4FK5 C; 4JI8 O; 2BE3 A; 3MHS C; 1OCO C; 5KMG A; 4JI8 B; 4OXS A; 1OCR C; 1AB3 A; 1O9H A; 1M1K W; 3DXR A; 3MD0 A; 2UXB O; 2UXB B; 1NVP B; 1JJ2 U; 1WP7 A; 1KMI Z; 1NQT A; 2V1D A; 2OIG A; 4WFH A; 1JJO A; 3CCV V; 1PPJ H; 1S5J A; 2DQ0 A; 5J9P C; 4CH6 A; 2K9P A; 1YDX A; 2YIA A; 4I4T A; 5LA6 B; 5EZY A; 1WPX A; 2ZNI A; 1XL4 A; 1WN7 A; 1E79 G; 2X7R B; 4P9O A; 4MTO A; 2OCH A; 5LBQ A; 2IJJ A; 5EYP B; 3CMA V; 1K34 A; 2R9R B; 4WF9 V; 5JQG B; 4W4L A; 2F1M A; 3CCE V; 1H2K A; 3HKB B; 4X8A A; 4FLU A; 3JD4 A; 5J2T A; 3CCQ V; 2KKW A; 3SR2 C; 4PDR A; 5H6R A; 2X6A A; 1XMQ O; 1ZWI C; 3CB2 A; 4MTG A; 4I0X B; 1XMQ B; 4TUY A; 1VMG A; 1WJZ A; 4P30 A; 1R6T A; 2P67 A; 5A2Q N; 2G38 A; 1FXV A; 2BSK A; 4JAU A; 2N04 A; 1WA8 B; 2EX3 A; 3BPZ A; 2EIL C; 5KUK A; 4PA6 A; 1HP8 A; 1PV0 A; 2DQ3 A; 5IY5 B; 3AG1 C; 3JAR A; 1NVP D; 2CK3 G; 2JGD B; 3AG4 C; 3ZRS A; 4UVA A; 4NXM O; 2YSU B; 3UO3 A; 4NXM B; 1VF5 B; 4JYB A; 1AR1 B; 4RUF A; 4DW0 A; 1BQ0 A; 2B5U A; 4K8Z A; 2Q69 A; 2QR4 A; 4X9Q A; 4TQF A; 3R65 A; 5LOV A; 4MS2 A; 5JH7 A; 2BTQ A; 2QM7 A; 3CJH A; 3M99 B; 1DLB A; 4NXN O; 1QVF U; 1YJW V; 3UO2 A; 5CBH A; 4JI0 O; 4H37 A; 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