The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
44
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structure length |
44
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Chain Sequence |
EALKILNNIRTLRAQARECTLETLEEMLEKLEVVVNERREEESA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Dna binding protein
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| source organism |
Escherichia coli k-12
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| publication title |
A Three-protein Charge Zipper Stabilizes a Complex Modulating Bacterial Gene Silencing.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Hemolysin expression-modulating protein Hha
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| total genus |
15
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| structure length |
44
|
| sequence length |
44
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| chains with identical sequence |
C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2014-10-24 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | H-NS histone-like proteins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4ICG A; 1LR1 A; 2MW2 B; 1OV9 A; 3NR7 A; 1NI8 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1RSO B; 2QDO A; 4K0K O; 4UB6 Z; 4B3R B; 2QWN B; 4XDL A; 1J5E B; 2LJ2 A; 4DV3 B; 2QE7 G; 5GW7 A; 3T4D A; 1V54 B; 4DR5 B; 1JVM A; 5EYP A; 1N33 B; 4FLW A; 3OM3 B; 5LA6 A; 1ENV A; 1H2L A; 1Y74 A; 1PKX A; 2RCV A; 1Q3E A; 4B3T B; 4B3M B; 1MA1 A; 2DJV A; 4AQY O; 1QNM A; 3A2F A; 4DXW A; 3CRC A; 3JCZ A; 5EBM C; 4JI3 O; 3K06 A; 3MAQ A; 2UU9 O; 3EHB B; 5K1X A; 3ZMS A; 2BOC C; 1MZF A; 1OCO B; 3J80 N; 1YEW A; 3CCL V; 4DV4 B; 3A8T A; 1NTM H; 5EYP B; 2QR4 A; 5LA6 B; 2UUC B; 1Y74 B; 3G4S V; 2JEU A; 1R6T A; 1WPX A; 5CMU A; 1XIL A; 2MW2 B; 1AP6 A; 3WG7 B; 3K03 A; 2W6I G; 3B09 A; 4F6E A; 1N8R W; 4FLY A; 1FJG B; 2Q0A A; 3SGI A; 3BY6 A; 2AHZ A; 4BIU A; 2OCC C; 3MD0 A; 3O65 A; 4LH7 A; 3K79 A; 1S72 V; 4XDJ A; 3OTF A; 2QM8 A; 2W0F C; 2AZ0 A; 3OFN G; 1W0K G; 1YJW V; 1PV0 A; 2K1E A; 4TV9 A; 2P4K A; 4DRX A; 4U7N A; 4WFE A; 2DYS B; 3AK2 A; 3UO2 A; 4P9O A; 2C2A A; 3FB7 C; 4DUY O; 5IYD O; 4X20 A; 3QO8 A; 5GTH Z; 3THO A; 2M7W A; 1FXK C; 2Q67 A; 3CRQ A; 1HNX O; 1YF2 A; 4MVQ A; 3FFQ A; 3SR2 C; 1B6Q A; 1GN6 A; 5C8Y A; 4JAV A; 3H1I H; 4ZKI A; 1VF7 A; 4TV9 B; 2ADP A; 5H9C A; 1K9M W; 1HR0 O; 4DRX B; 5B1O A; 1VMG A; 4JGS A; 2UXC O; 1DF5 A; 2B5U A; 3OD4 A; 3DGE A; 1EFR G; 4X20 B; 1DGS A; 2QKC A; 1GKF A; 5K1P A; 2PTM A; 4UCR A; 1G4Y B; 1Y67 A; 1RP3 B; 2VQF O; 5LHI A; 1PM9 A; 3K57 A; 4MVZ A; 4CC5 A; 2QKA A; 1GN2 A; 2LW1 A; 4KUM A; 4EKW A; 1K92 A; 3CCS V; 1Z2G A; 5C8Y B; 4DV7 O; 1NBM G; 3SJA C; 4YHH B; 1WB8 A; 4NTW A; 1R6N A; 4DR2 B; 3CHX A; 4FZ0 A; 1JPX A; 2AW9 A; 4NTX A; 2IU3 A; 1ZX3 A; 4YIP A; 4BW5 A; 4X62 B; 4X66 B; 2Q8V A; 1N36 B; 3ZHU A; 2EUL A; 4IYI A; 5IYB O; 3M99 B; 1VQK V; 1SES A; 4GCZ A; 1K33 A; 4KL1 A; 2OYQ A; 3JD3 A; 1IZ3 A; 3P30 A; 2EIJ B; 1XMQ B; 4FM1 A; 3ABL C; 3E2E A; 2OCC B; 3BAA A; 1GMG A; 4I50 A; 2Q0O C; 2ZM6 O; 2ZR2 A; 3N2K A; 1JFF A; 1SQF A; 2JIZ G; 2XT9 A; 1F51 A; 3U0Z A; 4FLU A; 1VF5 B; 1V55 C; 1XOU A; 2P7T C; 4NYK A; 4O4J A; 5CA0 A; 1HNZ B; 1BGY H; 4PHZ A; 1NTZ H; 4LR3 A; 1XMO B; 2F66 C; 4CZZ A; 4DR4 B; 2W0X A; 3ZHT A; 2XAQ A; 1SZX A; 1ORQ C; 4DV6 O; 1B3Q A; 4LF9 O; 2E5L B; 4I50 B; 5LHH A; 2WLL A; 1J5E O; 3N2K B; 4DV3 O; 1JFF B; 4ASU G; 1KBH A; 1L1F A; 4DR5 O; 1RFY A; 1XL4 A; 3IC9 A; 3I5D A; 1NR7 A; 2JJ1 G; 4X9Q A; 1EM1 A; 2QM4 A; 4O4J B; 4RO2 A; 1JJ2 U; 3L9D A; 5CA0 B; 4UCO A; 1YTF B; 1M93 A; 2V1D A; 1VP7 A; 4HAM A; 2VQE O; 1F23 A; 2X6B A; 3BCC H; 4MS2 A; 3HKC A; 4X1K A; 5CB4 A; 3RYI A; 2G38 A; 4JI7 B; 2WLL B; 3SYQ A; 2HKO A; 2FML A; 2IJI A; 1YIJ V; 1H2S B; 4UV9 A; 4OPH A; 2FYU H; 4LFC O; 2P5O A; 4CS4 A; 4FVM A; 2ZKO A; 3JAW A; 3G6E V; 4L87 A; 2F93 B; 3B4S A; 3ASO C; 1G8M A; 3SPC A; 1HWY A; 3I55 V; 1FJG O; 2P22 C; 3HKC B; 2DYR B; 4X1K B; 3SYC A; 4GYC B; 5CB4 B; 1WPB A; 4LP8 A; 2HHH O; 3RYI B; 2WSS G; 1W2B U; 2A0L A; 1SS3 A; 3RFR A; 1VQ5 V; 2IW5 A; 3JAR A; 1YJN V; 3ABL B; 3BEH A; 4LNU A; 4WFH A; 1AR4 A; 2ZNJ A; 4WBN A; 3JAW B; 3K08 A; 3FB6 C; 1IDS A; 3LSU A; 3IGA C; 1FFX A; 1FD9 A; 1H38 A; 4G2K A; 3SPH A; 5KLV H; 3OAA G; 1V55 B; 4DR3 B; 3CP1 A; 3QO7 A; 2IJK A; 3BHP A; 1EN5 A; 1VQM V; 2A9H A; 2QKS A; 3JAR B; 3TET A; 1XRE A; 4MT8 A; 3BPZ A; 4BWA A; 1P7B A; 4LNU B; 5KAI Z; 4AHC A; 3G67 A; 4WBN B; 1YIT V; 1UJW B; 4O4I A; 4N21 A; 3U10 A; 1HDJ A; 1BS3 A; 4I4T A; 1FFX B; 1RM1 C; 2VWJ A; 5J2U A; 3CWB H; 3ETD A; 4Q6G A; 2DWD C; 5IJ0 A; 4TT3 G; 1M5I A; 3KCY A; 3JCU Z; 1URF A; 1US6 A; 4JYA O; 1HNW B; 4CH5 A; 1UFI A; 2YIB A; 1AJN A; 4DR2 O; 3CEI A; 1ZTE A; 4JAU A; 3TCU A; 1NZ6 A; 1MSD A; 2RNB A; 2H8P C; 4X62 O; 5IYC O; 1Q6U A; 4O4I B; 2LGQ A; 1N4C A; 1GM7 A; 1N36 O; 2XTA A; 3E8H A; 4I4T B; 4FFB A; 4JPR A; 2IU0 A; 4J42 A; 5J2U B; 4CH4 A; 1E1R G; 5IJ0 B; 2A7W A; 3H1K H; 1IVS A; 1N0J A; 4TV8 A; 2XND G; 4K3A A; 3ASO B; 2D3O W; 3K5L A; 3S3W A; 2V4D A; 1XMQ O; 2IJJ A; 4GX5 A; 3K0D A; 3ZN0 A; 4JI5 B; 1SF9 A; 3ZHQ A; 3CC2 V; 1FPO A; 2Q6A A; 4E2L A; 4PDR A; 3STZ C; 1TUE B; 3E89 A; 4P2Z A; 1WAZ A; 4MVO A; 1N34 B; 2YXY A; 5B1B B; 4FFB B; 3RW0 A; 4E4E A; 4DW1 A; 1AR5 A; 2Y4T A; 3UCS C; 5DN6 G; 4B7K A; 3OE7 G; 2QSA A; 2YS8 A; 1Q6H A; 2HVK C; 4TV8 B; 1XMO O; 3L73 H; 1I94 B; 1KMI Z; 1D2D A; 1KP2 A; 3M7M X; 3W7T A; 4ZBM A; 4LFA B; 2QA4 V; 4J7Z A; 2VRZ A; 2E5L O; 4BR6 A; 2AZ2 A; 1TUB A; 4PD4 F; 1P49 A; 1P7G A; 4DV2 B; 1Q81 W; 1SRY A; 3SYO A; 4JV5 B; 3OGC C; 3HB3 B; 4JZ2 A; 5IT9 N; 1R1B A; 1IX9 A; 1O9G A; 3ZS8 C; 3CRA A; 1ROP A; 1V54 C; 4AI8 A; 1AI7 A; 1BL8 A; 1QQC A; 5LP6 A; 1RM1 B; 2UXD B; 3A0R A; 3JD2 A; 1IXB A; 2A79 B; 4PJ0 Z; 5KHG A; 4X64 O; 2UUA O; 4JI7 O; 3HKD A; 1TUB B; 3UQ8 A; 5H5N A; 1BSM A; 1Y6X A; 4LF8 O; 1G1X B; 5LXT A; 3DSQ A; 4DV5 B; 1S0V A; 5IWA B; 1BCC H; 4YY3 B; 3SYP A; 1Q90 D; 1SKV A; 5LP6 B; 1PNK A; 3D3Q A; 3GWK C; 3C90 A; 1IBK O; 2CTQ A; 5JVD A; 4YJ3 A; 1XDC A; 2ZIN A; 1NH2 D; 4DO2 A; 1NR1 A; 3OR6 C; 3HKD B; 2EIL C; 3FAV A; 1IBL O; 1L0L H; 5BR8 O; 4UXN A; 4OGQ B; 5LXT B; 1F4M A; 1YXB A; 1D5A A; 1VQ8 V; 3L71 H; 3OMA B; 4R50 A; 4LF7 B; 3CME V; 4QIW F; 3FYI B; 1IBM B; 1M9N A; 3H1H H; 1LNQ A; 1BQZ A; 5JVD B; 4YJ3 B; 2HJD A; 2WLJ A; 1FS0 G; 4NR1 A; 4X88 A; 3GVM A; 3E8G A; 1KD1 W; 2V7Q G; 2D2C B; 4JF3 A; 3ASN C; 1ZUQ A; 3G80 A; 4DYL A; 3FAV B; 4JYY A; 4LF5 B; 4JI1 B; 4YJ2 A; 1T5E A; 5HFM A; 3RYC A; 3ABT A; 5EC1 C; 1VAR A; 4IHJ A; 2UXB O; 3WB2 A; 4UCS A; 4WFG A; 1SQQ H; 2HJF C; 2NR5 A; 2ZT9 B; 4JI2 O; 4J7J A; 4TQD A; 1JCH A; 5IE9 A; 1U96 A; 1IXM A; 1I5X A; 2Z0A A; 2E3C A; 3R66 A; 2DQ3 A; 1QVG U; 4NXM O; 1GK9 A; 3JAL A; 3HKE A; 3CYO A; 4UFZ A; 3BRC A; 3I56 V; 4HZ3 A; 2Q73 A; 4YJ2 B; 4FIP C; 3RYC B; 2Q7E A; 1E79 G; 1KUQ A; 1KU9 A; 4R8C A; 4IHJ B; 1DLB A; 4FPP A; 3D36 C; 1FYJ A; 4CBC A; 3VQV A; 4H44 B; 4KHP B; 2LW7 A; 3ZHV A; 4QE9 A; 1VQP V; 3ZMZ A; 3ML0 A; 1BHB A; 2EIN C; 4MVU A; 3JAL B; 4LFB O; 3HKE B; 2IJH A; 3H1L H; 1H2M A; 5L3F A; 2HLD G; 2H94 A; 5JJN B; 2JGD A; 2EJR A; 2KSD A; 3C3S A; 2ZIM A; 2EIJ C; 3JD4 A; 1R73 A; 1XHX A; 2BTO A; 2EIL B; 1NJI W; 4CC6 A; 1QCE A; 3ZX6 A; 4WCE V; 1XQ8 A; 2P90 A; 3TXS A; 2ZE6 A; 3KG2 A; 2VS0 A; 1BMF G; 4IT5 A; 3OUS A; 1ARO P; 4QJF B; 3X2Q B; 2HP8 A; 4JI6 B; 1XI1 A; 1I94 O; 2JK5 C; 2JGD B; 2IBZ H; 4GX1 A; 1F4N A; 3CPW U; 4DV1 O; 1GN3 A; 2F4V O; 2LO1 A; 3ASN B; 5J2T A; 1AI6 A; 2ADQ B; 2DOS A; 4GX0 A; 2X6C A; 2R70 A; 3EVK A; 3T4Z A; 4O2A A; 4D7T A; 4A5U B; 1PL4 A; 2QWP B; 2CUG A; 5JH7 A; 2UXN A; 3D36 A; 2KQX A; 4FLV A; 3AG1 C; 5LYJ A; 3K5M A; 2YXL A; 2UXD O; 4KXR A; 2LQT A; 4QPJ A; 2WLM A; 1L0N H; 5D5P A; 2OTJ V; 2JRI A; 2N05 A; 4MTO A; 4MTX A; 5J2T B; 2JJ2 G; 1XNQ O; 3OT7 A; 5TIS Z; 3W7W A; 3SPI A; 2UUB O; 4DR6 B; 1G6U A; 4O2A B; 4LCU C; 3AK3 A; 2YIC A; 1J95 A; 4LF4 O; 2EJ7 A; 2ODM A; 5JH7 B; 2RDC A; 2NLJ C; 3CMA V; 3RVZ A; 5LYJ B; 1FKA O; 4W4L A; 1N0N A; 3ABK C; 1KKC A; 3KKY A; 2EIN B; 1S5J A; 5JCO A; 2DYR C; 4GZR B; 1R3K C; 1M90 W; 4N23 A; 3E35 A; 3ZHS A; 3UM7 A; 1HW7 A; 1SQP H; 1Q8I A; 5KUK A; 4U3F H; 2UXX A; 1I08 A; 2DWE C; 2JGU A; 1PP9 H; 4GLX A; 4BAY A; 4ZOL A; 3E22 A; 3LSS A; 2Y69 C; 4DK1 A; 2YUA A; 3D8C A; 4CH6 A; 2QJ1 A; 1KQS U; 1ZAU A; 1JQ0 A; 4HBN A; 3VBB A; 4JI1 O; 4NXN B; 3K3W A; 1JJO A; 1WB7 A; 1V9P A; 2OIE A; 1OZ0 A; 3CRM A; 2NN4 A; 4NKG B; 3P3N A; 4B3R O; 4GKK B; 1K5S A; 1AB3 A; 4ZOL B; 4NVP A; 1YSC A; 2R9I A; 1I7F A; 3LDC A; 4TUY A; 2KG7 A; 3E22 B; 1OCR B; 1NI8 A; 1R3J C; 2L35 A; 2XAF A; 4UVB A; 1MNG A; 4G28 B; 2CTP A; 3JYC A; 1N33 O; 3IC7 A; 1VQ9 V; 3AG1 B; 2AGA A; 1QHT A; 4MVS A; 1Q86 W; 2CGO A; 4B3T O; 4B3M O; 2Y48 A; 1CPY A; 1FXH A; 3B8N A; 3OTO B; 1Q6I A; 1Q43 A; 4WFA V; 5L3C A; 1AR1 B; 3IFX A; 2HG5 C; 3R65 A; 1VQO V; 3UT5 A; 5E79 Z; 5E1A C; 2DN9 A; 1WJZ A; 4TUY B; 2KG7 B; 4EFE A; 3K04 A; 4B3S B; 3CB2 A; 5KUM A; 3JD0 A; 4DV4 O; 4JI4 B; 2EZP A; 2CGN A; 1K8A W; 2UUC O; 4DR7 B; 2Q69 A; 1HP8 A; 4JTD B; 2QEX V; 3ABK B; 1SC5 B; 1EZJ A; 2CTW A; 2X7R B; 1ZLZ A; 1Q5O A; 3ZMV A; 4FZ1 A; 2CTR A; 3DC6 A; 5EIB C; 2WPD G; 3CCQ V; 3UT5 B; 4FMT A; 4PDL A; 1K5Q A; 2PUS A; 4UCV A; 2BCC H; 5KHH A; 5B1B C; 1LUW A; 2CK3 G; 4K8X A; 3SJB C; 3RVY A; 2E75 B; 2Y69 B; 1OCZ C; 1H2G A; 2E74 B; 3ZRS A; 4GX2 A; 5D5Q A; 4ZIB A; 3ETQ A; 2WLK A; 5L3G A; 3ZRV A; 2NNU A; 3JAK A; 3H01 A; 2WLN A; 3PJS K; 4X65 B; 4W4K A; 1CP9 A; 3RYH A; 1QVF U; 3F5W C; 4R7C A; 3QF7 A; 3T1H B; 4K35 A; 3JD1 A; 2W6J G; 2X6A A; 4MTF A; 2PY5 A; 1KP3 A; 2ZR3 A; 1A32 A; 3AEI A; 3JAK B; 4ABM A; 4PA4 A; 1I0H A; 1JR9 A; 1PNM A; 4YHH O; 1YTF D; 5EC2 C; 4NTY A; 4K0K B; 3RYH B; 4IGG A; 2F95 B; 3ZRX A; 1MSW D; 2IH1 C; 3FB5 C; 3RT3 C; 3P3P A; 3IJ4 A; 1Z5W A; 1FAF A; 4PI2 A; 1K97 A; 2CAZ C; 5KHI A; 4JI0 B; 4X66 O; 4J9Y B; 5LP6 C; 2HVJ C; 2H3O A; 4G27 B; 1VQ6 V; 4WFF A; 2F43 G; 3STL C; 3J7A U; 3QVN A; 4I0X A; 3F7V C; 3W7X A; 1GN4 A; 1F7Y A; 2KB1 A; 4AQY B; 3U11 A; 4TWK A; 2YC0 A; 4JI3 B; 4MVM A; 2YI9 A; 3SJC C; 1GRJ A; 2UU9 B; 4CH3 A; 5JJE B; 2EX3 A; 2YEV A; 2RMK B; 4MSW C; 1WLE A; 3ABU A; 4JAA A; 1WN7 A; 2WAM A; 2Y0P A; 3LUT B; 4I0X B; 1OCZ B; 1K34 A; 1HNZ O; 1GM8 A; 4B08 A; 1BZK A; 1ZWI C; 2XAS A; 3C3T A; 4DR4 O; 2DW4 A; 3L72 H; 3DXR A; 1NVP B; 4GKK O; 3MHH C; 4FJC C; 5CA1 A; 4PDM A; 1K4D C; 2YEV B; 4ICG A; 2ZE8 A; 2LFR A; 3W7S A; 3ZRW A; 4FFK A; 2AXT Z; 1YVW A; 4PDV A; 2CDY A; 1YJ9 V; 2WLI A; 2PZS A; 4DUY B; 2P06 A; 4ZI7 A; 2ILM A; 1UPG A; 5KAF Z; 4QGP A; 4QPK A; 1XL6 A; 1X4T A; 3GB7 C; 3ZHR A; 1JOY A; 3DXR B; 2E76 B; 1PL0 A; 5CA1 B; 2PGG A; 4Z1V A; 5IJ9 A; 3AG7 A; 2Q7H A; 3SJQ C; 3TGU H; 1MG1 A; 1ZSP A; 3ZRW B; 1M1K W; 1HR0 B; 3CJH A; 4JI4 O; 2UXC B; 2WLI B; 2DQ0 A; 4DV0 B; 4ZI7 B; 3B2E E; 2JEX A; 2BOB C; 1KB9 F; 4AIL C; 2IM9 A; 4J41 A; 4I55 A; 4EFB A; 3LSQ A; 3CCR V; 4BIZ A; 1EN4 A; 4GKJ B; 2N04 A; 2MK3 A; 5IJ9 B; 3ZIA G; 4K8Z A; 3TJT A; 4CS2 A; 4WF9 V; 2YIB D; 4CS3 A; 3CX5 F; 3CJH B; 4H33 A; 1XHZ A; 4X89 A; 1L8D A; 3ZMT A; 4ZHQ A; 3T1Y B; 2JS5 A; 3X2Q C; 2LFS A; 4TOI A; 4DR3 O; 4L8J A; 4UCT A; 4I55 B; 2IH3 C; 1XNR B; 2XHB A; 4RUF A; 2JVD A; 5A2Q N; 4PEL A; 5KX5 A; 4GUN A; 4J10 A; 4X65 O; 1R3L C; 2Q68 A; 2PI5 A; 3N2G A; 1B06 A; 1FXV A; 4UVC A; 3VOU A; 5EBW C; 1AIL A; 4MTG A; 3CE2 A; 2ZM6 B; 4I9Q A; 4KP4 A; 1LUV A; 3T1H O; 5KHJ A; 2YIA A; 1VQ4 V; 5IYZ A; 4TQF A; 3RYF A; 4EB6 A; 4ZHQ B; 4BW9 A; 2BE3 A; 3K9S A; 1Y66 A; 4LF6 B; 5A9G A; 1XUQ A; 5FLX N; 5KA6 A; 5BZB A; 4KFM A; 5KX5 B; 1PPJ H; 1HNW O; 1K73 W; 1VQ7 V; 1R3I C; 1NU1 H; 1RPR A; 3N2G B; 4DV6 B; 2O57 A; 4LF9 B; 1GTO A; 3ETG A; 2B9Z A; 2A3Q A; 4U7O A; 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