The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
94
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structure length |
94
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Chain Sequence |
GSSGSSGMALEQTLKKDWYSILGADPSANMSDLKQKYQKLILLYHPDKQSADVPAGTMEECMQKFIEIDQAWKILGNEETKKKYDLQRSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Chaperone
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| source organism |
Mus musculus
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| publication title |
Soluiotn structure of J-domain of mouse DnaJ like protein
rcsb |
| molecule keywords |
1700030A21Rik protein
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| total genus |
14
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| structure length |
94
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| sequence length |
94
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-05-29 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2GUZ B; 2LO1 A; 2Y4T A; 2YS8 A; 4J7Z A; 2QWR B; 2LGW A; 1GH6 A; 2GUZ A; 1NZ6 A; 3BVO A; 1BQ0 A; 1WJZ A; 2KQX A; 2OCH A; 2Y4U A; 3UO2 A; 4RWU A; 2QWQ B; 1XBL A; 1IUR A; 2QWO B; 2N04 A; 3APO A; 3APQ A; 1FPO A; 2CTR A; 1N4C A; 2QSA A; 3UO3 A; 2QWN B; 1FAF A; 1BQZ A; 2EJ7 A; 2L6L A; 4J80 A; 2CTQ A; 2M6Y A; 2CUG A; 3AG7 A; 2DN9 A; 3UCS C; 2QWP B; 2YUA A; 2CTW A; 4IT5 A; 2PF4 E; 2DMX A; 1HDJ A; 2N05 A; 2CTP A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2IU0 A; 2ZKO A; 4J9Y B; 2RMK B; 3B09 A; 2WLK A; 2XAJ A; 3ZN1 A; 2F4V O; 5C8Y B; 3TXS A; 1YDX A; 2BOB C; 3HKD A; 1L1F A; 4JF3 A; 4DR3 B; 2IH1 C; 4LF4 O; 5JH7 A; 4TSF G; 1VAR A; 1Y66 A; 2UU9 B; 3JAT A; 1JFF B; 2JJ2 G; 5LBQ A; 2ADP A; 1DTO A; 1XNR B; 2AZ0 A; 4YJ2 A; 3E35 A; 3ABL B; 2W6J G; 3TCU A; 3JAW A; 3C90 A; 5IYZ B; 2BSK B; 2PUS A; 4LC1 A; 4GX2 A; 4YY3 B; 4ASU G; 3BEH A; 3JSL A; 5JCO C; 1QVF U; 1BQZ A; 2YIB A; 2ZDI A; 1BT8 A; 2G38 A; 1XRE A; 4EFE A; 2WLH A; 4UUJ C; 5KHG A; 3GWO A; 2Q7G A; 1VF6 A; 5JVD A; 4L8J A; 1M1K W; 2EIK B; 2FL4 A; 5IWA B; 5CB4 B; 2PZS A; 1AJQ A; 3OT7 A; 3Q4H B; 4K8X A; 2DWE C; 1I0H A; 3CX5 F; 2GTA A; 3BRC A; 1SQX H; 3K5L A; 1J95 A; 1R3K C; 4X62 B; 2NN4 A; 4TWK A; 4H37 A; 3FB7 C; 5AG2 A; 1OCO B; 1NVP B; 4CS2 A; 1XMQ B; 2P67 A; 3VBB A; 3E8G A; 3ZRX A; 3TJT A; 1HNZ O; 1NU1 H; 2V7Q G; 4DK0 A; 3CWB H; 4C7U A; 1F4N A; 1Q6H A; 3JAK A; 2BTQ A; 3OE7 G; 4KHP O; 3B8N A; 5EBW C; 3UT5 A; 4B3S O; 1H8H G; 4B7E A; 1AR5 A; 2JGD A; 2WLN A; 3LNN A; 2C2A A; 4J80 A; 1K9M W; 5B1B B; 3DC6 A; 4IYH A; 5EC1 C; 5CA1 B; 2CAZ C; 4X20 B; 2GDS A; 2ZT9 B; 4QPJ A; 1R3J C; 3ZHU A; 1XOU A; 1AI7 A; 3HKE A; 4D7S A; 4PA6 A; 5GON A; 3SGI A; 1YTF B; 2YSU B; 4LNU A; 1DGS A; 4I0X B; 3ABT A; 1OCZ B; 1US6 A; 4MVM A; 5CA0 A; 4JV5 O; 1GH6 A; 2Q73 A; 5LMN O; 2EIK C; 5LXT B; 1QLN A; 4UV9 A; 4OX9 B; 3JAS A; 1GN4 A; 1N4C A; 5H9C A; 3VQW A; 2L6L A; 3OTO O; 1RSO A; 2M6Y A; 4UVB A; 4TT3 G; 1HNX B; 1MSD A; 1N33 O; 4MTX A; 5LOV B; 3FB5 C; 2ZR3 A; 4JI2 O; 1OCC B; 4EB6 A; 1R73 A; 2Y4U A; 3N27 A; 2PY5 A; 2UUA B; 3EFF K; 1SES A; 2IM9 A; 3ABU A; 3F7Y C; 4DV0 O; 2YEV A; 1K8A W; 2BOC C; 3JD2 A; 1R6K A; 1KP3 A; 2OCC C; 3ASO C; 3CC2 V; 2AGA A; 2ITD C; 4IIJ A; 2PF4 E; 1RPR A; 1N0J A; 3OFN G; 2DQ0 A; 2DWD C; 3RVZ A; 4LF7 O; 3B40 A; 3MD0 A; 1O9G A; 3SJB C; 2UUB B; 2Y0I A; 1K92 A; 4I50 A; 5IDJ A; 2KG7 B; 2HFE C; 3BAA A; 4H33 A; 5J2T B; 1BSM A; 4O4L A; 5IYD O; 1K73 W; 4YXW G; 2XHB A; 5IE9 A; 4JGS A; 2JS3 A; 2CE4 A; 5H6Q A; 5BXZ A; 1QHT A; 2JJ1 G; 4QGP A; 1GN6 A; 1ENV A; 1OZ0 A; 2IJH A; 3CSX A; 4YHH B; 3J80 N; 4FLU A; 3O65 A; 3HKD B; 3OMI B; 3L74 H; 1MSW D; 3CXC U; 3RW0 A; 2IBZ H; 2IJI A; 3ZJZ A; 4FJC C; 4U3F H; 3ICX A; 4DK1 A; 5JH7 B; 3T1C A; 5JWP A; 5J2U A; 3CCS V; 3JAT B; 4YJ2 B; 2YS8 A; 1D2D A; 5IYC O; 2UXB O; 4XDK A; 3CEI A; 5BY1 A; 3JAW B; 2IH3 C; 2RDC A; 3RGB A; 2F93 B; 3K3W A; 2XAG A; 4ZBM A; 3WB0 A; 4D6T H; 3APQ A; 5DN6 G; 2QR4 A; 4FLV A; 1EZV H; 3W7U A; 2WPD G; 1M5I A; 3K9S A; 1S3J A; 4B3M B; 3FB6 C; 2Y0P A; 2HJD A; 4JI0 O; 4DUZ B; 5JVD B; 4WFH A; 1LNQ A; 4LH6 A; 1R3I C; 3ETD A; 3IGA C; 4HBN A; 2EJR A; 2VQF O; 1TUB A; 2ADQ B; 2VQE B; 4B3R B; 3D3Q A; 4QJF B; 1QBZ A; 2IW5 A; 1URF A; 2ODM A; 2UUC O; 1Y74 A; 5LYJ A; 4GX1 A; 3P3P A; 2LW7 A; 1H8E G; 1XHX A; 2K1E A; 5KX5 B; 3BA8 A; 4IHJ A; 4X65 O; 1V54 B; 1WLE A; 2M7W A; 3QNE A; 5EBM C; 3OR7 C; 3SPJ A; 2WLM A; 2DQ3 A; 1I08 A; 4MW8 A; 4J9Z B; 5C8Y A; 1SZT A; 3G71 V; 4U7O A; 4K0K B; 1RP3 B; 2HP8 A; 4FLX A; 2D3O W; 4PJ0 Z; 4CH4 A; 4NB5 A; 4NXM B; 4LF9 B; 4O4I A; 1AIL A; 4DUY B; 3UT5 B; 2VWK A; 1YSC A; 2EIL B; 2JGD B; 1AJN A; 1IBK O; 2B1G A; 2CK3 G; 2PGG A; 1J5E B; 3ZRW A; 4DV2 O; 3W7S A; 4BAY A; 2IJJ A; 5H6R A; 3B2E E; 4WFB V; 1Z5V A; 3RVY A; 3HKE B; 5GON B; 3L71 H; 1YVW A; 4WCE V; 1QU7 A; 2XTA A; 4LNU B; 2ZDI C; 4F6R A; 4WFA V; 3STL C; 1IBM B; 4QE9 A; 4DR3 O; 1BMF G; 2QE7 G; 5CA0 B; 1VF6 C; 3CRR A; 2PYL A; 2QWR B; 1GO3 F; 2UU9 O; 5EIB D; 1XQ8 A; 1K5Q A; 1XNR O; 4JI5 B; 1NKD A; 2ILM A; 3JAS B; 1B04 A; 1Q5O A; 3WU2 Z; 2N04 A; 1FXK C; 3J81 N; 4O2A B; 4X88 A; 1PL0 A; 1Y6X A; 1RSO B; 2Q4P A; 1XL4 A; 2HR3 A; 2ZNI A; 4YY3 O; 3CYO A; 4IL6 Z; 1IVS A; 2CTW A; 3WG7 B; 1V54 C; 3VQX A; 1FD9 A; 1SQV H; 2P5O A; 2QKA A; 1ZAU A; 1Z5W A; 2Q7H A; 3I5D A; 1BQ0 A; 1MAB G; 2LP7 A; 3H1K H; 3QTC A; 4MTF A; 3CRM A; 4UV8 A; 2ZE8 A; 4ABM A; 3BCC H; 2YEV B; 1FXV A; 1FPO A; 2CTR A; 2QSA A; 1VQK V; 4BIZ A; 2OWO A; 2ZXW B; 5L3B A; 2CUG A; 4J7J A; 3WB1 A; 1NS1 A; 4IIJ B; 1FFT B; 3JD3 A; 4GLX A; 5JJE B; 1I5Y A; 3OAA G; 2MW2 B; 3BPZ A; 1Q90 D; 1BL8 A; 4JTC B; 2QA4 V; 5BZB A; 1XL6 A; 4I50 B; 2UXD B; 2EIL C; 4X62 O; 3ETQ A; 4JAV A; 4O4L B; 4JZ2 A; 4MSW C; 2ZIN A; 1M56 B; 4LFB B; 2EIN B; 2L35 A; 4MW3 A; 1XMQ O; 4LF8 B; 4W4K A; 4CH3 A; 3A2F A; 3P30 A; 5KHJ A; 2JIZ G; 4PI0 A; 2HLD G; 4FM0 A; 1JJ2 U; 1OCR C; 3IC7 A; 1WJZ A; 3L73 H; 2QJ1 A; 2EIJ C; 4TUY A; 4DR6 B; 5LGN A; 3FAV A; 3B8M A; 3M8A A; 5J2U B; 1JR9 A; 4AQY B; 4DV1 O; 3E83 A; 1WPB A; 3ABK B; 3OUS A; 4NTX A; 3RFR A; 1CEZ A; 2YUA A; 4FLZ A; 3ZED A; 4UXN A; 3CC4 V; 1QR8 A; 3FKS G; 1CP9 A; 4FLY A; 1E1Q G; 5LHG A; 1IX9 A; 3ZCC A; 1Q6U A; 1S77 D; 2K9P A; 4IGG A; 3U11 A; 3WG7 C; 4H0L B; 3EXA A; 2DYS B; 3RWR D; 4NKG B; 5FNV A; 2Y4T A; 3AK2 A; 4K3A A; 3OMA B; 1SER A; 3DSQ A; 3AG1 C; 1TUB B; 2AHZ A; 4J11 A; 3TK1 A; 5FPO A; 3T1H B; 4X1I A; 5IJ0 A; 2QWO B; 1QR9 A; 1ZX3 A; 3QG5 A; 4DV4 B; 2ZXW C; 1Y74 B; 4OX9 O; 2QGN A; 5LYJ B; 2PI4 A; 4GX5 A; 4RUE A; 5B1N A; 3VQV A; 1S5J A; 3OGC C; 1KP2 A; 1BCC H; 2WA3 A; 4IHJ B; 1G8M A; 1VIB A; 3SYO A; 1HNX O; 4UCT A; 4OXS A; 3FYI B; 2X6C A; 4F6E A; 1FS0 G; 3W7X A; 5KLV H; 1N0N A; 1XI1 A; 1JCH A; 4DYL A; 4KP4 A; 3A0B Z; 2WLJ A; 3E8H A; 2UUA O; 1M56 C; 2PTM A; 2WAM A; 1QVG U; 3ZRS A; 1BHB A; 3ZMT A; 1X4T A; 4LFA B; 1SZX A; 1FJG O; 5GTH Z; 3MAQ A; 4O4I B; 1WA8 A; 2R9A A; 3UO2 A; 1HNW O; 4YIO A; 4PDL A; 5DM6 V; 5K1X A; 2UUB O; 3UM7 A; 2XAF A; 4B3T B; 3K57 A; 1HWY A; 3SYC A; 3ZRW B; 3S3W A; 1KKC A; 1JX9 A; 4XBF A; 4KXR A; 1WP8 A; 4H13 B; 2FTK A; 2IU3 A; 3RYI A; 2GUZ A; 1FKA O; 2KQX A; 3JCZ A; 2A0L A; 4YHH O; 1VQ5 V; 2CGO A; 4CBC A; 5EYP A; 1QQC A; 4F6R B; 2QM4 A; 2H94 A; 2QM8 A; 1GN2 A; 4PV1 B; 4WFF A; 3FD9 A; 4GYC B; 1WAZ A; 4BR6 A; 3ZHS A; 3SJQ C; 5KHK A; 4DV6 B; 2EZO A; 5KX5 A; 1H2L A; 2Q67 A; 1KB9 F; 4PDV A; 3WFV A; 2AHY A; 3JAM N; 4DR4 B; 2GHY A; 5B1A B; 1IXB A; 5B3S C; 3ZMU A; 1G6U A; 2KSD A; 5EZY A; 1NQT A; 4EEQ A; 4JI3 B; 4UCV A; 4DV7 B; 4R7C A; 1Q43 A; 4B3M O; 3IAY A; 4I9Q A; 1VQ7 V; 1PNL A; 2XND G; 3S3X A; 1GM9 A; 2QKC A; 2YDE A; 1IUR A; 1L0N H; 4JAA A; 1UFI A; 2QWN B; 5LA6 A; 1COW G; 1H2M A; 4GKK O; 3G6B A; 4LFC B; 2E5L B; 3ABL C; 3DGE A; 2AW9 A; 1AB3 A; 1JVM A; 2Q9L A; 4UB6 Z; 4GKJ O; 1B6Q A; 1EFR G; 2OIE A; 2A79 B; 1MZE A; 3OW2 U; 2EZP A; 3T4D A; 2V1D A; 4XDL A; 1WN7 A; 5A2Q N; 1FYJ A; 2OT5 A; 1NR7 A; 1VF7 A; 3K5O A; 1JA8 A; 5CN0 A; 5E79 Z; 4YJ3 A; 4K0K O; 1AI5 A; 3W7T A; 1AJP A; 4O4J A; 1SQG A; 1VMG A; 4TUY B; 4PD4 F; 1MMM A; 4DR1 B; 2A3Q A; 2YIC A; 3FAV B; 3E22 A; 5L3F A; 3KG2 A; 4LF9 O; 2R70 A; 1SKV A; 4TOI A; 3UO3 A; 5LHI A; 3HB3 B; 2Y69 B; 2BE3 A; 4O2A A; 1GKF A; 1ZWI C; 5IT9 N; 3E89 A; 2ZM6 O; 4PDR A; 2HJF C; 5B5E Z; 4JI7 O; 1OCO C; 4XDJ A; 5B1A C; 4DW0 A; 4FFB A; 4ZOL A; 4X66 O; 3H01 A; 1I94 O; 1H2S B; 3HR0 A; 5FNV B; 3JAR A; 5CA3 A; 1IBM O; 4GX0 A; 5L3C A; 4NR1 A; 4FZ0 A; 1Q7Y W; 2RCV A; 2OCH A; 3RYH A; 4FM2 A; 4LF4 B; 1P84 F; 4X1I B; 2P90 A; 2JDI G; 4WFE A; 5IJ0 B; 5K1P A; 1IDS A; 1NT2 B; 1OJH A; 4JI5 O; 2X6A A; 3JD0 A; 2QEX V; 5B1B C; 2CH7 A; 2P7T C; 4U3J A; 3OD4 A; 4CZZ A; 3EHB B; 3D36 A; 3K5M A; 1S5L Z; 2WWW A; 1NVP D; 3E86 A; 1YXB A; 5LGT A; 1VF5 B; 3E8B A; 4DV3 O; 3EVK A; 3LSU A; 1NH2 B; 1VQO V; 4E4E A; 4P9P A; 3A0R A; 1T5E A; 1WP7 A; 2JVD A; 1OHH G; 3AG7 A; 5LMU O; 1OCZ C; 3K0G A; 4OPH A; 1ZSP A; 2LGW A; 5FPR A; 4FLW A; 1WA8 B; 2ZE6 A; 3DXR A; 1NTK H; 1XNQ B; 4JPR A; 2EBO A; 2OTL V; 2WLL A; 3R66 A; 4UVA A; 1QCE A; 2X7R B; 3ZHT A; 1SQB H; 1XMO O; 3CS5 A; 5JCO A; 3ZBH A; 4DR5 B; 3ETG A; 2VRZ A; 4QE7 A; 1IBL B; 1SF9 A; 3LDD A; 2Q6A A; 1EM1 A; 3JD1 A; 3RYI B; 2GUZ B; 4LFB O; 1OCC C; 2YI9 A; 1YTF D; 4LF8 O; 1L0L H; 1HR0 O; 4HNA A; 3RBZ A; 1KD1 W; 3C3T A; 4QNH B; 5EYP B; 1S72 V; 3CJH A; 1RPO A; 3ML0 A; 4DR6 O; 1VQ8 V; 4FZ1 A; 1G4Y B; 3G80 A; 4AQY O; 4A5U B; 1N32 B; 2OTJ V; 1M4U A; 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2GSM B; 4FIP C; 5IWA O; 2DN9 A; 2ZR2 A; 4G28 B; 1G1X B; 2HG5 C; 3JAR B; 4MVZ A; 1F7Y A; 1K5S A; 4Z2W A; 1TAE A; 5CBG A; 2Z3Y A; 3N2G A; 4R6Z A; 1K4D C; 3RYH B; 4DV6 O; 1JQ0 A; 2BTO A; 3K79 A; 2ZCE A; 2RN9 A; 5GTI Z; 4I7Z B; 3ABM C; 3ZHR A; 4CS3 A; 2UXB B; 4FMT A; 2CH7 B; 3THO A; 4U3J B; 1PV0 A; 4PA3 A; 3IFX A; 4DR4 O; 4NTY A; 5CMU A; 2Q8V A; 3BVO A; 4JAS A; 4P2Z A; 1H2K A; 3H1L H; 1XIL A; 3MHS C; 2ETN A; 4WF9 V; 4UCS A; 4ZHQ A; 2WLI A; 3CCE V; 3CCR V; 2F95 B; 1ZL8 A; 2XOK G; 3UKM A; 2VWJ A; 1KKD A; 5IJ9 A; 3UCS C; 2HVK C; 3M99 B; 4QPK A; 4RAI A; 3HKB A; 4R50 A; 2ZIM A; 1GAX A; 5TIS Z; 2VQF B; 3OR6 C; 4DO2 A; 3DXR B; 2A7W A; 1JOY A; 4K35 A; 4JI1 B; 1JPX A; 3H9V A; 5L3G A; 2E5L O; 3CPW U; 3G67 A; 2ATK C; 4O4H A; 2WLL B; 5BMV A; 1TUE B; 3SPH A; 2YI8 A; 3SYA A; 3OGI B; 1U97 A; 2B9Z A; 2E3C A; 1BZK A; 2QDO A; 5CBF A; 1W2B U; 1RM1 C; 4GUN A; 1EN6 A; 4J41 A; 2F66 C; 1YJN V; 3AG4 C; 4HNA B; 4MVR A; 4TV8 A; 2ITC C; 4RQF A; 4K8Z A; 3ASN C; 5C93 A; 2RQ6 A; 4MTG A; 3CJH B; 4YIP A; 1ORQ C; 2P4V A; 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