The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
35
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sequence length |
95
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structure length |
95
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Chain Sequence |
TTQIEVGPGATNATINFEAGILECYERFSWQRALDYPGQDRLHRLKRKLESRIKTHNKSEPENKRMSLEERKAIGVKMMKVLLFMDPSAGIEGFE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural basis for the sequence-specific recognition of human ISG15 by the NS1 protein of influenza B virus.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Non-structural protein 1
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| molecule tags |
Viral protein/antiviral protein
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| source organism |
Influenza b virus
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| total genus |
35
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| structure length |
95
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| sequence length |
95
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-06-09 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | S15/NS1, RNA-binding |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5IWA O; 5BXZ A; 4DV4 O; 4LF5 O; 1AIL A; 4DV2 O; 1G1X B; 1XMO O; 4DV5 O; 3J7A U; 4NXN O; 1J5E O; 2FKX A; 4NXM O; 3OTO O; 1HNX O; 4DV6 O; 1A32 A; 4OPH A; 4A5U B; 4JI3 O; 4DUY O; 2UUC O; 4K0K O; 4DV0 O; 2F4V O; 2DJV A; 4DUZ O; 4DV3 O; 4YHH O; 5IT9 N; 1XMQ O; 4KHP O; 3T1H O; 4GKK O; 4JI5 O; 3F5T A; 2N74 A; 3J80 N; 2UXC O; 4JI7 O; 1FYJ A; 4DR3 O; 4X64 O; 2Z0A A; 1HNW O; 4LFA O; 1X59 A; 4JI6 O; 2UXB O; 1IBL O; 5H5N A; 4DR4 O; 4JI4 O; 1N34 O; 1XNR O; 4B3S O; 4JI2 O; 3RT3 C; 4OX9 O; 1XNQ O; 5LMN O; 4LF4 O; 1IBK O; 2VQF O; 1FKA O; 4DR1 O; 4DV1 O; 3J81 N; 1D2D A; 1AB3 A; 2AGA A; 4JI1 O; 4JI0 O; 1HR0 O; 5A2Q N; 4JI8 O; 5BY1 A; 1FJG O; 4JV5 O; 2LW7 A; 4LFC O; 4X62 O; 1DK1 A; 1YZB A; 4DR7 O; 2JRI A; 1R1B A; 3SDL A; 1N36 O; 1R6T A; 2UU9 O; 1KUQ A; 4DV7 O; 3O65 A; 4X65 O; 4OPA A; 2UUB O; 1HNZ O; 1I94 O; 4DR6 O; 1F7Y A; 2UXD O; 2ZM6 O; 5FLX N; 2ZKO A; 5LMU O; 4DR2 O; 4YY3 O; 4B3R O; 3T1Y O; 4JYA O; 3JAM N; 1IBM O; 4LF6 O; 4GKJ O; 1N32 O; 4B3T O; 1XEQ A; 2HHH O; 4DR5 O; 4LF7 O; 3M8A A; 3R66 A; 1NS1 A; 2E5L O; 4LFB O; 5BR8 O; 4LF8 O; 1N33 O; 4X66 O; 2DOS A; 4LF9 O; 5LL6 Y; 2UUA O; 4B3M O; 4AQY O; 2VQE O; #chains in the Genus database with same CATH topology 3F7V C; 1H2L A; 4DK1 A; 5CA0 B; 2AZ2 A; 3UQ8 A; 1R3K C; 4TV8 B; 3JD2 A; 2OIG A; 4YY3 B; 4LCU C; 4OPH A; 5LOV B; 3UT5 B; 1Q3E A; 1WP8 A; 4DUY O; 1GM8 A; 1VMG A; 3FB6 C; 3TXS A; 5L3G A; 2F4V O; 1AJN A; 4HYO A; 3OT7 A; 1J5E B; 2EX3 A; 2ODM A; 1SQG A; 5J2T B; 2P90 A; 4GX1 A; 1TUB B; 3LSQ A; 3K79 A; 4FIP C; 5LBQ A; 1WNS A; 1BHB A; 4PD4 F; 1I5X A; 1ZTE A; 2Y48 A; 3BPZ A; 4I0X B; 5DEC A; 5C93 A; 2OIE A; 1VQ6 V; 4U7O A; 1KP2 A; 3JAR A; 4LR3 A; 3ZBH A; 1LR1 A; 4XDJ A; 4KL1 A; 2VWJ A; 1KQS U; 3RFR A; 4GX2 A; 4JI0 O; 3A8T A; 2JDI G; 5KHK A; 1YZB A; 1RM1 B; 5IJ0 B; 3CCV V; 1XIL A; 2YIB A; 3JAL A; 1VQ4 V; 1KEC A; 3VBB A; 3D3I A; 1GH6 A; 2ZIN A; 2ZIO A; 1S0V A; 3MDS A; 1FJG B; 1RPR A; 2EBO A; 2WA4 A; 2JK5 C; 1YSC A; 1IBL B; 4G27 B; 4MVM A; 1SER A; 3TET A; 1PPJ H; 5GON B; 2AHY A; 4GKJ O; 3JCZ A; 3WG7 C; 1NQT A; 4JF3 A; 4DR1 B; 3GWO A; 3JAT A; 1URF A; 3ZHU A; 5LP6 C; 2IJJ A; 3K57 A; 3FAV A; 1M5I A; 2ZE8 A; 4MTX A; 2PI4 A; 2QWQ B; 5C8Y B; 4RAI A; 5EZY B; 4TSF G; 3EVK A; 3E8B A; 2FYU H; 5JWP A; 1R6K A; 4LH6 A; 1AP6 A; 1H2N A; 4NXN O; 2Q7G A; 3AG3 B; 4LF9 B; 2YUA A; 1BZK A; 4AQY B; 1NJI W; 4DV6 O; 3RVY A; 3C3T A; 5B1A B; 1I5Y A; 1JMK C; 4IT5 A; 4FLZ A; 3UO2 A; 2R9I A; 3MD0 A; 1K8A W; 1EN5 A; 2DJV A; 4WBN A; 4PDL A; 3OM3 B; 3K08 A; 3F5T A; 4X1K A; 4H37 A; 2UXB O; 4LF8 B; 1AP5 A; 5JQG B; 4DK0 A; 3T1H B; 1QCE A; 3CS5 A; 1XUQ A; 2ADQ B; 1M93 A; 4FM1 A; 5LMN O; 2ZCE A; 4UB8 Z; 1FKA O; 4FZ0 A; 1VQK V; 2B1G A; 4OGQ B; 5B1N A; 4X1Y A; 2CAZ C; 2HP8 A; 2AXT Z; 2DQ3 A; 1D5A A; 5L3E A; 2ILM A; 4JZ2 A; 4DO2 A; 3SPJ A; 1N36 O; 2NN4 A; 2JJ2 G; 1R6T A; 4FFK A; 3HKE B; 1KUQ A; 1QVG U; 4J80 A; 2OTJ V; 2V1D A; 5GTI Z; 1B06 A; 1V9P A; 5IYZ B; 2RNB A; 4B3R O; 1GAX A; 1XHX A; 4DV7 B; 2EJ7 A; 4WFB V; 4MVS A; 1NR7 A; 5E1A C; 3N27 A; 3T4D A; 3EXA A; 3K03 A; 3PN1 A; 1IZ3 A; 1JPX A; 1YJ9 V; 4DR5 O; 4LF7 O; 1NS1 A; 3ZMT A; 3VQW A; 1BHA A; 3K5O A; 4YXW G; 2WAM A; 5J2U A; 3STL C; 3OW2 U; 1VQ7 V; 5H9C A; 4W4L A; 5IWA O; 3ZRS A; 3ZS8 C; 4IGG A; 1I94 B; 4DR6 B; 1EZJ A; 4LFB B; 3JSL A; 5LHH A; 3OFN G; 1S5L Z; 4H44 B; 5KMG A; 4CC5 A; 5CMU A; 1AI6 A; 4QNH B; 3CCQ V; 4DV0 O; 4X20 B; 1PNM A; 1K92 A; 3L70 H; 3HKC A; 2HVJ C; 4EB6 B; 4LBE C; 3SJC C; 3SJB C; 3DTU B; 1BS3 A; 4RWU A; 3FD9 A; 1KBH A; 2YIC A; 3RVZ A; 3SPI A; 4TV9 A; 5KA5 A; 4YHH B; 2R70 A; 4X66 B; 4KHP B; 1XNR O; 1K73 W; 4B3S O; 4JI5 B; 4GUN A; 4ZOL A; 2WLL A; 4GT1 A; 3KZI Z; 4U3F H; 4GZR B; 4JI6 B; 1J95 A; 3TCU A; 4DR4 B; 3A2F A; 4JI4 B; 1DTO A; 4TQD A; 1Q6U A; 4Q6G A; 1IDS A; 1E1R G; 1YVW A; 4Z2W A; 1AR4 A; 4DV1 B; 4JYY A; 1HNZ O; 3OR6 C; 1SQX H; 3ZHQ A; 3E22 B; 4ZI7 A; 4PDV A; 1OCZ C; 4JYC A; 4C7U A; 3KCY A; 3D36 A; 4RUE A; 4MTO A; 1GRJ A; 3G4S V; 2Q5Z A; 2EZP A; 1N32 O; 5LA6 B; 3OMA B; 1XOU A; 3SYC A; 5IE9 A; 4B3T O; 2W0F C; 4O4J A; 5JCO C; 2Y0P A; 3CMA V; 1XL6 A; 4TWK A; 2YXY A; 2HG5 C; 4FLY A; 5EBL C; 2E5L O; 2IJH A; 1WPB A; 1GN3 A; 4X9Q A; 4J7Z A; 4DYL A; 2UUA O; 3GVM A; 2HHH B; 1AIL A; 5ITZ A; 2Q0O C; 4DV4 O; 1WAZ A; 4PHZ A; 3JAW B; 3KKY A; 3JAK B; 4E2L A; 3IC9 A; 3TGU H; 1BSM A; 2KB1 A; 3AG1 B; 3ETE A; 2H3O A; 1QLN A; 3FB5 C; 2LQT A; 1SA0 A; 3Q4H B; 3RN4 A; 3K58 A; 1I0H A; 1MAB G; 5EBW C; 4YJ3 B; 3WG7 B; 4KUM A; 2WLM A; 5JH7 A; 1HWY A; 4WFE A; 1GN6 A; 1DF4 A; 4O4I B; 2N74 A; 2NR5 A; 4HBN A; 4I55 B; 3FX7 A; 2CE4 A; 1ZX3 A; 1VIB A; 4GKK B; 5KAI Z; 3SPC A; 2L35 A; 4DR3 B; 1MZF A; 2JGD B; 4B7K A; 1KD1 W; 1W59 A; 1D2D A; 3L74 H; 2WA3 A; 1SQP H; 4TT3 G; 2EIN B; 2EUL A; 3JCU Z; 4AIL C; 1XDC A; 2A79 B; 2WLK A; 3ZMZ A; 3U0Z A; 3K5M A; 4DR7 O; 1IBK B; 2ZE6 A; 3AG2 C; 1NVP D; 4R7C A; 2LJ2 A; 4Q20 A; 1Q5O A; 2IH3 C; 2IH1 C; 3ASO C; 2UU9 B; 4UV9 A; 4MVQ A; 4JYA O; 5BMV A; 1Q6H A; 2DQ0 A; 2HVK C; 2N04 A; 4X65 B; 3OUS A; 2UXD B; 3ZHR A; 5E79 Z; 5DED A; 1VF5 B; 2CH7 A; 5A9G A; 5FL7 G; 3B09 A; 2AHZ A; 3CD6 V; 1E79 G; 1N33 O; 1K7D A; 3SYP A; 1M9N A; 5L3B A; 1K97 A; 3HKB A; 2Q7H A; 4MTG A; 2VQE O; 4CS4 A; 4DV5 O; 1R3J C; 4J7J A; 5BR8 B; 2ZDI A; 2ZIM A; 4I7Z B; 4BW5 A; 4GX5 A; 5KHG A; 4FVM A; 3OTO O; 1HNX O; 5KX5 A; 1GM7 A; 4PI2 A; 1Y76 A; 2OTL V; 2OYQ A; 5IT9 N; 3NR7 A; 5FPO A; 1XMQ O; 4TUY A; 1Q6I A; 3ZHT A; 2P06 A; 3CRA A; 4DUY B; 3ZMU A; 4EFB A; 4LFA O; 2CTQ A; 1XQ8 A; 2XUM A; 4MVO A; 4JI2 O; 3L75 H; 3F5W C; 5BMV B; 4JGS A; 2GUZ A; 4DV2 B; 4DW0 A; 3N2G B; 2LP7 A; 4MTF A; 2ITD C; 2Q73 A; 3B2E E; 3IJ4 A; 2X6A A; 1R1B A; 3AG4 C; 2P4V A; 2JEU A; 5B3S B; 1V55 C; 4JI0 B; 2GTS A; 2LGW A; 2XAJ A; 1R6N A; 5CA0 A; 3B8M A; 3B4S A; 2RCV A; 4TV8 A; 1R73 A; 4KP4 A; 5LGU A; 2KSD A; 5LOV A; 3UT5 A; 1JJ2 U; 2PI5 A; 3JAM N; 2P22 C; 4O2B B; 2Q0A A; 5D5Q A; 3VQV A; 1FFX B; 3AK2 A; 4FFB B; 1FD9 A; 5J2T A; 4DRX A; 1TUB A; 4RUF A; 1QLE C; 4CH3 A; 1NBM G; 1YTF D; 1CP9 A; 4I0X A; 2QGN A; 3ETD A; 4Z1V A; 2DE0 X; 3SYO A; 4WFA V; 3ZRW B; 5BZB A; 4MW8 A; 4P9O A; 1RFY A; 1RPO A; 4JAV A; 2BSK B; 1OCZ B; 1XI1 A; 1A32 A; 2PGG A; 3BA9 A; 1YJN V; 3LNN A; 2F93 B; 3RBZ A; 5IJ0 A; 2F23 A; 1FAF A; 1VQO V; 1H8H G; 4FK5 C; 4NXN B; 1D5N A; 3K9A A; 3RYH B; 4DV6 B; 2UXC O; 4UVA A; 2XND G; 3ICX A; 5EK0 A; 1X59 A; 2ZXW B; 4IHJ B; 4J41 A; 2LFS A; 1JFF B; 5H5N A; 1ZSP A; 1OCC C; 1JCH A; 3VQX A; 2CTR A; 5GON A; 1XNQ O; 4K8Z A; 1R3L C; 1SC5 B; 2EIK B; 3DSQ A; 3JD3 A; 3ETQ A; 1PNK A; 4PJ0 Z; 1I7F A; 2UXB B; 1SET A; 3OMI B; 4DRX B; 4YJ2 B; 3LDD A; 2KKW A; 2P6J A; 5LMN B; 2CGO A; 4LWS B; 4QE7 A; 4P30 A; 1VQM V; 5CBF A; 5C8Y A; 5JJN B; 5EZY A; 3O65 A; 4DXW A; 4CH4 A; 1WB7 A; 2UUB O; 4BIZ A; 4WF9 V; 2QWP B; 4LNU A; 1BE3 H; 4PA4 A; 4AI8 A; 1N36 B; 5DN6 G; 2QEX V; 4RQF A; 1FXH A; 2Z3Y A; 1SKV A; 1IBM O; 2IU0 A; 3E8G A; 5CB4 A; 3FB7 C; 2QWN B; 3G6B A; 3G67 A; 1Y74 A; 4B3R B; 2XAF A; 4N23 A; 4X89 A; 3BVO A; 1L0L H; 5JQG A; 2QDO A; 2E75 B; 3CRC A; 2EZO A; 4F6E A; 1MNG A; 4DR5 B; 4LF7 B; 5B1B C; 1ZAU A; 5LHG A; 3GWK C; 3AK3 A; 1VQN V; 5KA6 A; 2YSU B; 4I4T B; 4NVP A; 1UFI A; 1ZWI C; 3QO8 A; 2IJK A; 3ASO B; 2NNU A; 2WLI B; 1P4R A; 4I9W A; 1TAE A; 1FXK C; 2Y4T A; 1NR1 A; 4X1I B; 5IYB O; 3HKE A; 2GHY A; 4I9Q A; 3CHX A; 4B08 A; 4D6T H; 3G6E V; 4JAU A; 1YHQ V; 2XT9 A; 4JI7 O; 4G2K A; 3C90 A; 1HNW O; 4X64 O; 5IYZ A; 4U3J B; 2YXH A; 4DV0 B; 3LSU A; 3R65 A; 4PA7 A; 4LNU B; 2HJD A; 3P30 A; 3QTC A; 3WFV A; 1AI4 A; 4NYK A; 1AJP A; 5CB4 B; 3BFR A; 1T5E A; 1XBL A; 4JI8 O; 1XNR B; 1Y74 B; 2C2A A; 1MA1 A; 4TQF A; 1SQF A; 3W7U A; 1G6U A; 3I56 V; 4HNA B; 2XAH A; 2WPD G; 1LUV A; 5EYP B; 4GCZ A; 1Y66 A; 3CE2 A; 4YY3 O; 4PA9 A; 1TA8 A; 1GN4 A; 2B9Z A; 5KUK A; 4F6R B; 4BWA A; 4X20 A; 2AW9 A; 3ASN C; 1VEW A; 1NVP B; 4JTA B; 3APO A; 4EB6 A; 2ZE7 A; 3K04 A; 3ML0 A; 2DN9 A; 2VQF B; 3CRM A; 2D2C B; 4ZHQ B; 3R66 A; 2QM8 A; 4MVZ A; 3P32 A; 3RWR D; 2ZNI A; 4ICG A; 3ZCC A; 1N32 B; 1G4Y B; 4B3T B; 1VF6 A; 4B3M O; 2NLJ C; 3OGC C; 3AG4 B; 2ARH A; 4FLW A; 2E5L B; 1K4C C; 3J7A U; 3CXH F; 2FKX A; 1Y4M A; 1P84 F; 3CCS V; 2EIJ C; 4DV4 B; 1JR9 A; 1NKD A; 3BA8 A; 2EIM B; 1ZUQ A; 2LFR A; 4IYH A; 2YC0 A; 1YXB A; 1G8M A; 3L9D A; 3JSN A; 1H2S B; 3E22 A; 3U10 A; 2Z0A A; 4I50 B; 5HFL A; 2DWD C; 1IBL O; 2IW5 A; 2BCC H; 3CX5 F; 4UCU A; 3LSS A; 5LA6 A; 4LP8 A; 4UVC A; 3E2E A; 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3ZX6 A; 4LFA B; 1AB3 A; 3UM7 A; 4NXM B; 2X6C A; 1H2M A; 4J42 A; 4NB5 A; 3OUF A; 2JRI A; 1F4M A; 2HKO A; 2P7T C; 1P49 A; 5LP6 B; 2M6Y A; 5KHI A; 1FXK B; 3T2M A; 2LW1 A; 4DUZ B; 1N0N A; 2ZE5 A; 1I94 O; 4DR6 O; 2ZM6 O; 4UCO A; 1BMF G; 3CCU V; 2ZKO A; 1GO3 F; 5LMU O; 2JEX A; 3QG5 A; 1YIJ V; 1B6Q A; 2YIB D; 2W0X A; 1EN6 A; 4CH6 A; 4FJC C; 1VQ5 V; 3CJH B; 2Q7E A; 2DYR C; 1WA8 B; 2BTO A; 1K3E A; 4J9Y B; 1Q43 A; 1RM1 C; 3F7Y C; 2QM4 A; 1OV9 A; 4JAS A; 3LNM B; 3H9V A; 4X66 O; 3ZRV A; 3KG2 A; 1L1F A; 1NTM H; 1YF2 A; 1ENV A; 3OD4 A; 1M90 W; 4AHC A; 1XL4 A; 3N2G A; 2PF4 E; 2N05 A; 3U11 A; 2V4D A; 1PM9 A; 5CBG A; 2QWR B; 4UCS A; 1B3Q A; 3SR2 C; 1IXM A; 3BCC H; 1PL4 A; 1Y6X A; 3E8H A; 4FLT A; 1KB9 F; 2UUC O; 1AJQ A; 1PD3 A; 1JX9 A; 4H33 A; 3WB1 A; 4Z1M G; 4NR1 A; 1FYJ A; 1OJH A; 5JVD B; 3VOU A; 4IIJ A; 2HR3 A; 5GW7 A; 2KQX A; 1N34 O; 4ZBM A; 4O2B A; 1FFX A; 4B7E A; 2UXC B; 3DXR B; 4FFB A; 4HZ3 A; 1N0J A; 4UB6 Z; 2ZT9 B; 1S77 D; 3N2K B; 1Q8I A; 2QE7 G; 4NTW A; 1ARO P; 2YI8 A; 3DC6 A; 4JV5 O; 1TVK B; 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