The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
67
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structure length |
67
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Chain Sequence |
GSFTMPGLVDSNPAPPESQEKKPLKPCCACPETKKARDACIIEKGEEHCGHLIEAHKECMRALGFKI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A structural-dynamical characterization of human cox17
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Cytochrome c oxidase copper chaperone
|
| molecule tags |
Metal transport
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
15
|
| structure length |
67
|
| sequence length |
67
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-12-08 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF05051 | COX17 | Cytochrome C oxidase copper chaperone (COX17) |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | CytochromE C oxidase copper chaperone |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LQT A; 1Z2G A; 2HP8 A; 2LGQ A; 1U96 A; 2RNB A; 1U97 A; 2RN9 A; 1HP8 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1FXK A; 4PDM A; 3FAV B; 1RPR A; 3CCS V; 4J7K A; 1JFF B; 4FIP C; 1YI2 V; 5DM6 V; 3OTO B; 4NKG B; 3D8C A; 1VQM V; 4JI1 B; 4DV3 O; 2EJ7 A; 2LP7 A; 3DC6 A; 5FLX N; 2ZE8 A; 4DV5 B; 1OCC B; 3CYO A; 2EIN C; 4JYA B; 4H0L B; 4F6R B; 1NZ6 A; 2CTP A; 4TV9 A; 4JI6 B; 3BAB A; 3QVN A; 4NR1 A; 5CB4 A; 1DGS A; 4X89 A; 3QG5 A; 2YI9 A; 2ODM A; 3A0B Z; 1RFY A; 5FNV A; 2WLH A; 2DYS C; 1N33 O; 4P9O A; 1QBZ A; 4GKJ B; 4BAY A; 3K5N A; 5CBF A; 4JI0 O; 3LSS A; 4DXW A; 1WAZ A; 5H5N A; 1KD1 W; 3E83 A; 3SPG A; 1THZ A; 3L72 H; 3CCU V; 2QM8 A; 1XBL A; 2ITC C; 1YJ9 V; 3RT3 C; 4H44 B; 1BT8 A; 4JPR A; 3JAW A; 3FKS G; 4MVQ A; 1LUV A; 3AG4 C; 4X1Y B; 3WG7 B; 5LXT B; 5KHH A; 4TT3 G; 4O4J A; 5D5P A; 1CPY A; 1EN6 A; 4ZBM A; 1OJH A; 4CH6 A; 4GKK O; 3ZCC A; 3JAM N; 4TV8 A; 3RYF A; 4DR3 O; 1XL6 A; 3IAY A; 2BSK A; 4P2Z A; 1N0N A; 2Q5Z A; 1VQ9 V; 3CPW U; 1NVP D; 5L3C A; 4B3S B; 1B04 A; 5LP6 B; 3ZRW A; 2FYU H; 3JYC A; 1DK1 A; 5EIB C; 3KKY A; 3K08 A; 2F93 B; 5LGT A; 3AG1 C; 2GBO A; 2ZXW C; 2DMX A; 2QSA A; 1FXK C; 1AP6 A; 1Q5O A; 4L8J A; 1KP3 A; 5LMU O; 1ZL8 A; 4FM1 A; 4DV2 B; 1MG1 A; 1OHH G; 4JTA B; 4X9Q A; 3QNE A; 3NXS A; 3ABT A; 4LWS A; 1AR5 A; 1K97 A; 3ASO C; 5BY1 A; 3E2E A; 1H2M A; 4MVO A; 3LDE A; 4JI3 B; 5L3G A; 2FB5 A; 2KSD A; 3N2K B; 4UCU A; 3JD2 A; 5GTH Z; 2DOS A; 1G1X B; 1SQF A; 2M6Y A; 4H37 A; 3ZRV A; 1GM7 A; 3CCQ V; 1R6K A; 4A5U B; 1M1K W; 4B3T B; 4KUM A; 4ABM A; 3T2M A; 5J2T B; 1D5N A; 3L74 H; 1BQZ A; 1ZSP A; 1WPB A; 4U3F H; 5LOV A; 4DV6 B; 4JV5 B; 3ZMU A; 1QVF U; 5KHG A; 1KKD A; 2Z5U A; 3OAA G; 1SQB H; 1X4T A; 5H9C A; 4MTX A; 4G2K A; 4MSW C; 1IUR A; 3K03 A; 1XMO O; 2AXT Z; 1OCR C; 2EZO A; 1PD3 A; 1JOY A; 2PYJ A; 3R66 A; 1MMM A; 4DR4 O; 2YC0 A; 2CGN A; 3I5D A; 1EZV H; 4BR6 A; 3H1J H; 4IT5 A; 3BEH A; 4X64 B; 2RDC A; 3LSQ A; 4IIJ A; 4QNH B; 4KHP O; 5A2Q N; 5B1B C; 1EFR G; 2UUA O; 4J80 A; 4UXN A; 4DV3 B; 2HP8 A; 2PF4 E; 4GT1 A; 3RYI A; 5ITZ A; 3QO7 A; 1N0J A; 3AG7 A; 2DE0 X; 3M7M X; 4IHJ B; 3ZMZ A; 1W0K G; 2Q7H A; 1BMF G; 5KMG B; 1PP9 H; 1ROP A; 3LUT B; 4P30 A; 2PI5 A; 2KG7 B; 2X7R B; 4PJ0 Z; 4X1K A; 3STL C; 3CCE V; 1KYO F; 4I0X B; 1HNW O; 4E4E A; 2IJJ A; 1YSC A; 3P32 A; 3VQX A; 1GM9 A; 1AJN A; 1VF6 A; 4DW0 A; 1NR1 A; 4GYC B; 1L1F A; 4PDV A; 5CB4 B; 4JI0 B; 4QPK A; 1NU1 H; 3L73 H; 2XOK G; 5EIB D; 1AVM A; 3ABL B; 4O4H A; 4JF3 A; 1IBK O; 4YJ2 B; 4DR2 O; 2E3C A; 1SER A; 3CCM V; 2QWQ B; 2P22 C; 3CCV V; 3HB3 B; 2H8P C; 4YIO A; 2JK5 C; 1H2K A; 2JVD A; 1AI4 A; 5LBQ A; 3QO5 A; 2UXD O; 2Y0P A; 2WAM A; 4PA3 A; 1JMK C; 4U3J A; 4R8C A; 4BIZ A; 2BTQ A; 3AG2 C; 2Y4U A; 4WFG A; 1KB9 F; 1MNG A; 1B3Q A; 1NH2 B; 1Y76 A; 1H2L A; 4GKK B; 4UCR A; 4DR3 B; 1Z5V A; 1YTF D; 1GK9 A; 5LHG A; 2AW9 A; 3STZ C; 2FTK A; 3OMI B; 1BS3 A; 4G28 B; 5EYP A; 2EZP A; 4WBN B; 1ZUQ A; 3THO A; 4TV8 B; 3K59 A; 3RYF B; 2BSK B; 2EJR A; 3IC9 A; 2XHB A; 4EFE A; 2MK3 A; 2Q68 A; 2LFR A; 3CRC A; 4UCO A; 1KQS U; 1I08 A; 3TGU H; 2YIB D; 4JI5 O; 4CS4 A; 1RM1 C; 3ZRW B; 1S0V A; 4PA6 A; 4LF5 O; 2JGU A; 2QKA A; 4LF6 B; 4DUZ O; 5LMU B; 3FAV A; 2JIZ G; 1R3L C; 1ZLZ A; 1JFF A; 1WB8 A; 3JAT B; 3L70 H; 5KHJ A; 1L0L H; 3G80 A; 1EBO A; 3AG3 C; 2NN4 A; 3ZMV A; 4FZ1 A; 1IXB A; 3HKC B; 2UUB O; 3E89 A; 3HPL C; 4F6R A; 4LWS B; 3EFF K; 1BQ0 A; 3GWK C; 3BY6 A; 1WN7 A; 1QCE A; 5GTI Z; 1TAE A; 2Q8V A; 4HAM A; 2IJK A; 3ABM C; 4PV1 B; 4X65 O; 3JCU Z; 1J5E O; 5LGU A; 4DV4 O; 4UFZ A; 2ZCE A; 1QR9 A; 3IJ4 A; 3CMA V; 1BSM A; 1AI6 A; 4QIW F; 1MOF A; 4GCZ A; 3H9V A; 3UQ8 A; 4YJ3 B; 4JAU A; 1K7D A; 1GM8 A; 2IH3 C; 1NR7 A; 1XMO B; 3OEH G; 2NLJ C; 2ITD C; 4CS3 A; 1XNR O; 2PI4 A; 1Y67 A; 4DR4 B; 5E1A C; 1IXM A; 4PI0 A; 1LR1 A; 3AK1 A; 4K35 A; 4RAI A; 5LXT A; 4KHP B; 3MHH C; 1ZX3 A; 2PYL A; 1N34 B; 3EHB B; 4ZIB A; 4F6E A; 4LF4 B; 2YID A; 4IIJ B; 1W0J G; 2OCC C; 3T1C A; 2BOC C; 1HNX O; 4CH3 A; 5KHK A; 2DYR B; 3IC7 A; 5F2V O; 3AK3 A; 5FPR A; 1M90 W; 2ZM6 O; 1HNW B; 2HLD G; 1XEQ A; 5JCO A; 4BW9 A; 4J11 A; 5BZB A; 2VS0 A; 2F23 A; 4JYC A; 5FPO A; 1UPG A; 4X1K B; 5JJJ B; 5IWA O; 4B3S O; 3OW2 U; 1IBK B; 2F95 B; 3LDD A; 4MVM A; 4DR2 B; 3B2E E; 4PDL A; 2ADP A; 2LW7 A; 2AHZ A; 3RN4 A; 2DWD C; 5LYJ B; 2IM9 A; 3KCY A; 4U7N A; 5CA3 A; 4GX5 A; 2ZE7 A; 3K3W A; 3E8F A; 2QDO A; 1I5X A; 2WLI B; 4GUN A; 1F7Y A; 4LH7 A; 1NI8 A; 5EZY B; 1DTO A; 1PKX A; 5K1X A; 3N2K A; 4P9P A; 1N36 O; 2QWP B; 1K9M W; 1OCO B; 2RJZ A; 1QR8 A; 3SJC C; 1H38 A; 3OFN G; 3C3S A; 1G8M A; 1G6U A; 2R72 A; 4FPP A; 2EIL B; 1PL0 A; 5J2T A; 3ZRX A; 3B8M A; 4LFB O; 1B6Q A; 3E8H A; 2F43 G; 4LP8 A; 4WFH A; 4JI4 O; 3CRA A; 4B3T O; 1BL8 A; 2EX3 A; 4OX9 O; 2ZIN A; 1RPO A; 4WFE A; 3VQY A; 4DV6 O; 3B09 A; 3NR7 A; 2YXH A; 3G6E V; 4JI5 B; 4MW3 A; 3CP1 A; 4LF5 B; 1VQP V; 4EKW A; 1AP5 A; 4N23 A; 3ABK C; 4DUZ B; 1R3J C; 4LH6 A; 3K58 A; 1QQC A; 2CUG A; 5IY5 B; 1K3E A; 3WG7 C; 1U96 A; 2W6I G; 1MSD A; 2Q6A A; 2QWR B; 4LR3 A; 1MSW D; 3BPZ A; 4KL1 A; 2Q0O C; 2RMK B; 4ZOL B; 2UXB O; 4O4I B; 2X6C A; 3DC5 A; 4X64 O; 1DLB A; 2YIC A; 4C7U A; 2UUB B; 4IHJ A; 5HFM A; 1H2S B; 4WF9 V; 5KMG A; 1H2N A; 1L8D A; 5B3S C; 2KG7 A; 4LF8 O; 1QLN A; 5H6Q A; 3A0R A; 3HKE B; 4CC5 A; 4I0X A; 5E79 Z; 4I9W A; 2VRZ A; 4X65 B; 5LP6 C; 1FXH A; 1J5E B; 2CTW A; 3VQW A; 4RWU A; 4H13 B; 1X59 A; 2HVK C; 4UV9 A; 4DV4 B; 2A06 H; 1S3J A; 2XAG A; 5EC2 C; 5LMN O; 1SS3 A; 4I4T B; 3ABU A; 4YJ2 A; 2NNU A; 3SPJ A; 4ICG A; 4IL6 Z; 5B1A B; 4CH5 A; 3KCX A; 5JVD B; 2Y0I A; 3TXS A; 2BTO A; 4FJC C; 4QGP A; 3SPI A; 3RVY A; 4MT8 A; 1XNR B; 2HG5 C; 1NBM G; 3FX7 A; 4X62 O; 1RSO B; 1YCI A; 1XI1 A; 1AR1 B; 4Z1V A; 2R9R B; 4PEL A; 3G71 V; 4DO2 A; 1SKV A; 1XL4 A; 1MZE A; 3EXA A; 3ICX A; 2B1I A; 5H6R A; 1Y66 A; 1S5L Z; 1P7B A; 2KB1 A; 5HFL A; 2YIA A; 4IGG A; 2ZDI A; 2Q0A A; 2D3O W; 4W4L A; 4UVB A; 1NVP B; 1V9P A; 1E79 G; 1SES A; 1GN6 A; 1HNX B; 1GAX A; 5GW7 A; 2HEP A; 2Y4T A; 3K5L A; 4FLX A; 4WBN A; 2K1E A; 5JH7 B; 4RO2 A; 3P3N A; 4X8A A; 2ZM6 B; 1XHX A; 2FL4 A; 3M8A A; 1GH6 A; 3T4Z A; 1US6 A; 5IWA B; 4LF7 B; 3JD1 A; 2QWN B; 3A0H Z; 5DEC A; 2JRI A; 2EIJ B; 3D36 A; 1R3I C; 4JTD B; 4QE9 A; 1R6T A; 4TOI A; 4WCE V; 3T1H O; 1AJP A; 3RYH A; 3U10 A; 3CJH B; 4B3M O; 3ML0 A; 3MD0 A; 3CWB H; 2G38 A; 4LF6 O; 4FLT A; 3JAT A; 4QE7 A; 3JD4 A; 1VQK V; 2Y48 A; 3ZRS A; 3U11 A; 3HKC A; 5IJ0 A; 4FLY A; 4LCU C; 1QNM A; 5LHH A; 3HR0 A; 3UO3 A; 1UFI A; 2IJH A; 4B08 A; 1N36 B; 3O65 A; 1MAB G; 2DYS B; 4Q20 A; 2PZS A; 4YHH O; 4H33 A; 2OT5 A; 2OCH A; 1XDC A; 4YY3 B; 4CZZ A; 1NJI W; 3E8G A; 4ZHQ A; 1VF5 B; 4J41 A; 3W7S A; 4NYK A; 4X66 O; 4LFB B; 3G67 A; 1JA8 A; 1TUB A; 1TVK B; 1JJ2 U; 4RUE A; 3UKM A; 4JI4 B; 3ZED A; 4OX9 B; 1XNQ O; 3H1I H; 2E76 B; 2W0F C; 4YJ3 A; 1Q8I A; 3HKB A; 2ZD9 A; 4DW1 A; 4AIL C; 3VQV A; 1KUQ A; 3UM7 A; 3AG4 B; 4TUY A; 4HNA B; 3QO8 A; 4I5S A; 4I50 B; 3EVK A; 2ZNJ A; 2V1D A; 4AQY O; 3ASN B; 1Q7Y W; 2ZDI C; 4K0K O; 2UXB B; 3O9O A; 1E1Q G; 1NQT A; 2GHY A; 3Q4H B; 2V7Q G; 4X1I B; 2P6J A; 5KAF Z; 3H1K H; 1N34 O; 1VQ4 V; 4LF4 O; 4J10 A; 4LF8 B; 2P7T C; 3BAA A; 2YXL A; 2VQE O; 3R65 A; 2CAZ C; 3D3I A; 2ARH A; 5KUM A; 1S72 V; 1PPJ H; 2VWJ A; 2BOB C; 3X2Q C; 3T1Y O; 1S77 D; 2UUC B; 3K04 A; 5LMN B; 3GB7 C; 3F7V C; 4OPA A; 2CK3 G; 4XDL A; 3SYA A; 3D36 C; 2H3O A; 1YDX A; 1Q6I A; 4JI8 B; 5LYJ A; 1CXZ B; 2JGD B; 3ASO B; 3BHP A; 4LNU B; 4DV7 O; 3APO A; 5LA6 B; 3SDL A; 2ZR2 A; 4X62 B; 1ARO P; 1RP3 B; 2WLI A; 3QTC A; 1M57 B; 3AK2 A; 1SRY A; 4XDK A; 1Z2G A; 2Y69 B; 1IBM O; 1IX9 A; 1FJG B; 5EZY A; 2DJV A; 2B1G A; 3S3X A; 1XHZ A; 1VQL V; 1K92 A; 3BVO A; 3TCU A; 4FFB A; 1M5I A; 2ZNI A; 3OMA B; 1SF9 A; 4FMT A; 3I56 V; 5CN0 A; 2QTS A; 4BWA A; 4GLX A; 4FLV A; 4I7Z B; 3DTU B; 1KBH A; 5EBM C; 1MA1 A; 2FML A; 3LSU A; 2GDS A; 1DF5 A; 3WU2 Z; 3MDS A; 1URF A; 1O9G A; 1QLE B; 1K73 W; 4UUJ C; 3ZN1 A; 4RUF A; 1TGO A; 3SJQ C; 3F7Y C; 4RQF A; 4FM0 A; 2Z3Y A; 2A79 B; 3ETQ A; 1KMI Z; 5KA5 A; 3T1H B; 4OPH A; 2A3Q A; 2F66 C; 1HW7 A; 3CHX A; 3JAK B; 1W2B U; 5GON B; 1YJW V; 2N05 A; 4B3M B; 4DR5 O; 3J81 N; 2YXY A; 3SYO A; 1K4C C; 1ORQ C; 3RYH B; 3ZHV A; 4JI7 O; 4ZOL A; 1Q6H A; 1DF4 A; 4O4I A; 2LJ2 A; 5EK0 A; 3MAQ A; 4MTG A; 2UXC O; 3CRQ A; 1AB3 A; 2V4D A; 3J7A U; 2H94 A; 4MVR A; 4TQF A; 2DYR C; 2CTR A; 1IBL O; 1Q6U A; 2WWW A; 4YHH B; 1S5J A; 3HKE A; 5IJ0 B; 1BHA A; 3K5O A; 1XQ8 A; 1PNL A; 1Y74 B; 2JJ2 G; 4J9Z B; 2QEX V; 5IDJ A; 2PY5 A; 1ZTE A; 1NTM H; 4X66 B; 1F4M A; 4JI2 O; 4I4T A; 2HHH O; 1Q3E A; 1K8A W; 4ZHQ B; 1M56 B; 2OIE A; 4MVZ A; 1VF6 C; 1XNQ B; 2JEX A; 3E86 A; 4MTO A; 4DK1 A; 5JVD A; 1TUB B; 3FYI B; 3BA8 A; 3K5M A; 1COW G; 4WFA V; 1LUW A; 1RSO A; 1PL4 A; 1JR9 A; 3HKB B; 3ZS8 C; 3CSX A; 1CP9 A; 4AQY B; 2P4K A; 3OR6 C; 3UCS C; 3I55 V; 4TUY B; 1EN4 A; 2PTM A; 1PV0 A; 3WB1 A; 4O2A B; 1F51 A; 1P4R A; 1YXB A; 1OCO C; 4K0K B; 1PM9 A; 4K8Z A; 1EM1 A; 2LGQ A; 3IGA C; 3N27 A; 1XUQ A; 1PNK A; 3FFQ A; 1KP2 A; 3B4S A; 2RQ6 A; 4EEQ A; 2IU3 A; 2WLL A; 4BW5 A; 4UV8 A; 2EIL C; 1CEZ A; 2WPD G; 1S5H C; 2VQE B; 2GSM B; 5JH7 A; 1LNQ A; 5L3E A; 1NKD A; 1N32 O; 1FFX A; 4FZ0 A; 4UCV A; 1FS0 G; 2HVJ C; 4KFM A; 1JPX A; 1YIJ V; 3CB2 A; 2Q7G A; 2KKW A; 3T1Y B; 4PI2 A; 2DW4 A; 1M93 A; 2X0L A; 4HYO A; 2UU9 B; 1KU9 A; 4DUY B; 1K5Q A; 4LF7 O; 3CCR V; 1WP8 A; 5L3D A; 4DV7 B; 4D7S A; 2DN9 A; 3B8N A; 3LDC A; 4GZR B; 5IY5 C; 1GRJ A; 3CJH A; 2XAS A; 2EIK C; 1E1R G; 3VBB A; 1Y4M A; 2WLK A; 2ZR3 A; 3JD3 A; 2AHY A; 3K0G A; 3W7X A; 5DN6 G; 3CCL V; 1Z5W A; 2QE7 G; 1H8E G; 2WLJ A; 1IBM B; 4ZI7 B; 3A8T A; 3OE7 G; 4NXM O; 4W4K A; 5CBG A; 3B77 A; 2WLM A; 2B5U A; 5IYD O; 1OCC C; 3OUS A; 3TJT A; 4DR7 O; 1N4C A; 2JDI G; 3A2F A; 4FFB B; 4Q6G A; 5KHI A; 3U0Z A; 3OT7 A; 3UT5 B; 1TVK A; 3RFR A; 4YY3 O; 2ZIM A; 1L0N H; 1XRE A; 2P4V A; 3ZX6 A; 3C3T A; 5B1A C; 2DWE C; 3BRC A; 2XT9 A; 3VOU A; 2R9A A; 1B06 A; 1M9N A; 3OTF A; 1V54 B; 1FPO A; 4K8X A; 1OCZ B; 3JD0 A; 4HZ3 A; 2P06 A; 1H2G A; 4HNA A; 3RBZ A; 4I50 A; 2P90 A; 1VP7 A; 2D2C B; 1VQN V; 4LF9 O; 1JQ0 A; 4DR5 B; 4O4L B; 4MVU A; 1O9H A; 5BXZ A; 3DGE A; 3DSQ A; 5CA1 B; 2HJD A; 1SA0 A; 3OGI B; 3OMN B; 1TA8 A; 4JI7 B; 3W7W A; 3Q4H A; 4WFF A; 4J42 A; 2UXC B; 4X1I A; 1YVW A; 1EZJ A; 3SPC A; 5KX5 B; 1OV9 A; 3LNN A; 3PJS K; 3S3W A; 3CC4 V; 1IBL B; 3BA9 A; 3JAS B; 3W7U A; 2E5L O; 4D7T A; 5IYZ B; 3CRM A; 2QGN A; 1KEC A; 4DR1 O; 4TWK A; 3OR7 C; 4CC6 A; 3CC2 V; 1V55 B; 1HP8 A; 4JI2 B; 3OM3 B; 4J7J A; 5JCO C; 4GX1 A; 2EIJ C; 2HHH B; 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