The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
50
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structure length |
50
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Chain Sequence |
DEAQFKECYDTCHKECSDKGNGFTFCEMKCDTDCSVKDVKEKLENYKPKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
NMR Solution Structure of Ole e 6, a Major Allergen from Olive Tree Pollen.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Pollen allergen Ole e 6
|
| molecule tags |
Allergen
|
| source organism |
Olea europaea
|
| total genus |
14
|
| structure length |
50
|
| sequence length |
50
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-03-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF09253 | Ole-e-6 | Pollen allergen ole e 6 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Pollen allergen ole e 6 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SS3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2Z0A A; 3C3T A; 1O9G A; 1BL8 A; 1VF6 A; 3RW0 A; 4RUE A; 2DYR C; 1WNS A; 3A0B Z; 3FD9 A; 2CTP A; 5IJ0 B; 3T2M A; 3CS5 A; 2GHY A; 3CE2 A; 3STL C; 3MD0 A; 2PF4 E; 3OGI B; 4YHH B; 1G4Y B; 1Q8I A; 4KHP O; 4U7N A; 3SJQ C; 5LMU B; 1YI2 V; 2ZE5 A; 3JD3 A; 1XQ8 A; 2ATK C; 1R73 A; 1YSC A; 2P4V A; 1K8A W; 3K08 A; 5IYZ B; 1N0J A; 1XNR O; 4X65 O; 3CX5 F; 3D8C A; 4YIO A; 2QR4 A; 2P6J A; 1VQ4 V; 2JJ2 G; 4JAS A; 3ZCC A; 3JSN A; 1FPO A; 3QO7 A; 4AI8 A; 3HKB A; 5KHI A; 2BSK B; 5J2U A; 2HHH B; 2RJZ A; 3BAB A; 5EK0 A; 4PDM A; 2UXB B; 2DWE C; 5IWA O; 1S3J A; 1N33 B; 1XMO B; 5IE9 A; 1AR1 B; 3QO5 A; 4CS2 A; 5CBF A; 2EZP A; 2ZQM A; 3H1J H; 3WFV A; 2UXN A; 4LR3 A; 1QLN A; 1JCH A; 1SC5 B; 2V7Q G; 4JI0 O; 3X2Q C; 4DR3 B; 4FM0 A; 4GKK O; 1SQF A; 1RM1 B; 4CC6 A; 3E8B A; 5L3G A; 4DUZ B; 5CA1 A; 1AJQ A; 1SRY A; 1BE3 H; 1NR7 A; 3FB8 C; 3JCU Z; 1LR1 A; 2DW4 A; 4PEL A; 1H2G A; 1HW7 A; 2CK3 G; 4X20 A; 1MSW D; 1MAB G; 3SYP A; 1DTO A; 2ZR3 A; 1N34 B; 3FX7 A; 4FFK A; 2YS8 A; 4LP8 A; 5LOV A; 4UB6 Z; 4BR6 A; 3SYC A; 4DR7 O; 1Y66 A; 3BA9 A; 2AXT Z; 2Q0O C; 1YJ9 V; 4JI3 O; 1KKD A; 5AG2 A; 1YTF D; 4UVC A; 4MW8 A; 4EKW A; 1HNZ B; 4DRX B; 1R6N A; 4UCS A; 1XIL A; 4DV4 B; 4J41 A; 5LYJ A; 1SKV A; 1CP9 A; 3KG2 A; 3AG3 B; 4E2L A; 2VQF B; 4I9Q A; 4NTX A; 4Q20 A; 2UXC O; 2PUS A; 2FB5 A; 4NKG B; 3ZMS A; 2JEX A; 3ZJZ A; 4LFC B; 3K5M A; 2HG5 C; 2O57 A; 1FYJ A; 3WB0 A; 2E75 B; 2GDS A; 4I7Z B; 2PY5 A; 1AI4 A; 4K35 A; 5BY1 A; 1Q43 A; 2HFE C; 3CCJ V; 4PDV A; 2NR5 A; 2Q6A A; 4LFB O; 3UKM A; 4O4J B; 4PV1 B; 1XNQ O; 3SPI A; 2YDE A; 4R50 A; 1H2M A; 2YXY A; 2Q68 A; 1L0L H; 2CH7 B; 5IYC O; 5H6Q A; 2UU9 B; 2OIE A; 5LHI A; 4ICG A; 4AQY B; 2DN9 A; 3K9A A; 5J2T B; 3ZRX A; 3DGE A; 5B1A B; 4OPH A; 5LA6 A; 2CUG A; 3CC7 V; 3KCY A; 5C8Y B; 1SZX A; 1VF5 B; 3H01 A; 4FJC C; 4YJ2 B; 4GX0 A; 1BCC H; 1RM1 C; 2MK3 A; 2Q4P A; 3VQX A; 4JI4 B; 3GB7 C; 1F23 A; 1QLE B; 3JAK A; 1IBM B; 1OCZ B; 1YTF B; 4CBC A; 1WN7 A; 2F4V O; 4Z1M G; 1H2S B; 1TA8 A; 5TIS Z; 2XAH A; 2OCC C; 1DLB A; 4ZOL B; 1R6K A; 4EFE A; 4MT8 A; 4NR1 A; 3ZMZ A; 1BMF G; 4DR1 O; 4B3R O; 2E3C A; 3NXS A; 1S0V A; 3S3W A; 3RYC B; 1QU7 A; 2QSA A; 5KA5 A; 2ZR2 A; 4JYY A; 1ZTE A; 3P3P A; 1M93 A; 2AGA A; 2B1G A; 1N4C A; 1AI7 A; 2OT5 A; 3DC5 A; 3N27 A; 3OM3 B; 1W59 A; 3OFN G; 3B4S A; 4O2A B; 2QM8 A; 2F1M A; 5IJ9 B; 4O4L B; 1K73 W; 2ZIO A; 4DV1 O; 5CA0 B; 5ITZ A; 4DV2 B; 1I5X A; 3CWB H; 1QHT A; 1IXB A; 3DXR B; 2W0F C; 1F7Y A; 1NR1 A; 4QIW F; 4AHC A; 1V54 B; 4JV5 B; 1OCR C; 1XL4 A; 4KP4 A; 4PDL A; 2QKS A; 2QWN B; 3CHX A; 1GKF A; 1NH2 B; 1SQG A; 1XRE A; 3ZX6 A; 2N74 A; 4NB5 A; 1N32 B; 5BZB A; 1D5N A; 1FFX A; 4NXN B; 1Y6X A; 5LGU A; 5H9C A; 3RYH B; 1M56 C; 2JIZ G; 2R70 A; 2QWO B; 5LBQ A; 2VWK A; 3DSQ A; 2H94 A; 3KZI Z; 4J7J A; 4MTO A; 4AIL C; 2P06 A; 1KQS U; 1EZJ A; 3HKE A; 3NR7 A; 3F7Y C; 4X1I B; 3CCL V; 1D5A A; 5IY5 C; 1OCZ C; 2ZXW B; 3BA8 A; 1SQB H; 3OT7 A; 4FFB B; 2GSM B; 2WLM A; 2F23 A; 4N23 A; 1Y76 A; 2WLL A; 2QA4 V; 5CBH A; 4DR6 O; 3SDL A; 4H44 B; 1H8H G; 3CJH B; 1Q86 W; 3B8N A; 4OGQ B; 3CCM V; 1GMG A; 2Z5U A; 3J7A U; 3GWK C; 1COW G; 5JJN B; 1AB3 A; 4HNA B; 4B3T O; 3OR6 C; 2RNB A; 1BQ0 A; 1KBH A; 3L70 H; 2DWD C; 4L87 A; 5JCO A; 1GN6 A; 5K1X A; 1QR9 A; 4U3J B; 5LMN B; 1SA0 B; 3TCU A; 4PA4 A; 4O4J A; 1PL0 A; 4YXW G; 4LF5 B; 4JI8 B; 2ZT9 B; 2ZE7 A; 1MOF A; 2LW1 A; 4YHH O; 1E1R G; 1IBK B; 1VQM V; 4B7E A; 4X9Q A; 3E8H A; 3UT5 B; 1JFF B; 4GUN A; 4JI2 B; 5C8Y A; 1TVK A; 3F5W C; 4WFF A; 2OWO A; 1SER A; 2BTQ B; 3FYE B; 1TGO A; 4I9W A; 2ADP A; 2RQ6 A; 3MDS A; 4QPJ A; 4W4K A; 4O2B B; 5A9G A; 2VS0 A; 1YJN V; 2CE4 A; 2HHH O; 2K1E A; 2WPD G; 1K34 A; 1PV0 A; 2UXB O; 1VP7 A; 2WAM A; 2LJ2 A; 2CTR A; 3JAL B; 4G28 B; 1N33 O; 1XMO O; 2Y48 A; 3AK1 A; 5J9P C; 4ZOL A; 4P9P A; 4FK5 C; 4FZ0 A; 1GH6 A; 2LFS A; 2DYR B; 3JAS A; 2FML A; 2PGG A; 3HB3 B; 5H2F Z; 3UO3 A; 5BR8 B; 4DR3 O; 4JI5 B; 3SGI A; 2QM7 A; 4GYC B; 2OYQ A; 4FLW A; 3K06 A; 4UCV A; 4DUZ O; 4TUY B; 5LL6 Y; 5LHH A; 1JPX A; 3VQW A; 3APO A; 3SJC C; 5KUK A; 4LC1 A; 1GM8 A; 1N34 O; 2Q5Z A; 4U7O A; 3STZ C; 1FXK B; 1Z5V A; 4JYC A; 1VQ6 V; 4KFM A; 1YCI A; 4IYH A; 2DYS C; 4O2A A; 4YJ3 A; 3WB1 A; 5IYD O; 4JAU A; 4IIJ B; 1YJW V; 4O4L A; 1US6 A; 2IJH A; 4ZHQ A; 4HYO A; 3CCQ V; 5KHK A; 1VQL V; 3M7M X; 1K7D A; 3SYO A; 3K79 A; 1MMM A; 1X59 A; 1HNZ O; 2ITD C; 3DXR A; 3ABU A; 4J42 A; 4JTA B; 2DQ3 A; 1IDS A; 2HEP A; 3UCS C; 2BOB C; 5EZY B; 5EC2 C; 1GN3 A; 1Z2G A; 1GRJ A; 2EIN C; 3D3Q A; 1BZK A; 2VQF O; 2XUM A; 2JVD A; 3BCC H; 3LSU A; 4PA6 A; 2Y0I A; 4LF6 O; 3X2Q B; 1SES A; 1K9M W; 4UCU A; 3IC7 A; 4MW3 A; 4DV5 B; 1B3Q A; 4LFC O; 1G1X B; 3RGB A; 1VQ9 V; 3ZN0 A; 4D7T A; 3W7U A; 5B3S C; 5BMV A; 1ZUQ A; 1Q6I A; 2X6A A; 3LNN A; 4BW9 A; 1GM9 A; 1NVP D; 1L8D A; 4LF9 B; 2EIK C; 4O4I A; 2XAS A; 1UFI A; 2WLK A; 3ICX A; 4R6Z A; 3QVN A; 1JR9 A; 4JI1 B; 2A9H A; 1YHQ V; 1FD9 A; 3ETG A; 2IU0 A; 2EJR A; 5H6R A; 4X1I A; 3ZHU A; 2UUA B; 3IJ4 A; 3L75 H; 1M5I A; 4B3M B; 1Y67 A; 2UU9 O; 3K3W A; 4FFB A; 2IJJ A; 1WP8 A; 3QF7 A; 3JAT B; 4WF9 V; 5FLX N; 1EZV H; 3CJH A; 2P90 A; 1V55 C; 2GBO A; 3RFR A; 1WAZ A; 4R7C A; 1AP6 A; 5JWP A; 3SR2 C; 2FKX A; 4JI4 O; 4HNA A; 4XDK A; 5EYP B; 3HKC A; 4FM1 A; 1IBM O; 3RYI B; 4MVS A; 2WA3 A; 2LW7 A; 4FLY A; 1PNM A; 4U3J A; 5LXT B; 1KUQ A; 1SA0 A; 1FXK C; 1W0J G; 1Q82 W; 1GN2 A; 3ZMU A; 2OIG A; 3JAR B; 5DEC A; 1XHX A; 4WFH A; 1XBL A; 4FIP C; 3N2K B; 4I0X B; 4DV3 B; 3BAA A; 4NXM B; 5HFM A; 4JPR A; 4RWU A; 3ZBH A; 4DV7 B; 1AJN A; 3UT5 A; 3ZRV A; 1R3K C; 4RUF A; 4EFB A; 3K5O A; 4DR2 B; 2G38 A; 4CH3 A; 3CMA V; 2BTQ A; 2W6J G; 4KXR A; 3APQ A; 5L3B A; 2ZM6 B; 4MVQ A; 4BIU A; 3K57 A; 1XDC A; 2YIB D; 2F93 B; 3IAY A; 2NNU A; 1YDX A; 2E74 B; 4PA7 A; 4CC5 A; 4B3S B; 5L3C A; 1Q7Y W; 5D5P A; 4I55 A; 1HDJ A; 4DV0 B; 3G71 V; 1UJW B; 3JAM N; 3PN1 A; 4GLX A; 4DV2 O; 4P9O A; 2KSD A; 3W7S A; 1VMG A; 5GON B; 3G6B A; 4QPK A; 4H33 A; 2XTA A; 1NQT A; 2QKA A; 1OHH G; 3K5N A; 2OCC B; 4FLT A; 4JV5 O; 2VQE B; 1RFY A; 1B04 A; 4I4T B; 4TUY A; 4DYL A; 1FAF A; 3D36 C; 4BWA A; 2KG7 A; 3ABT A; 1WPB A; 2JGU A; 4B08 A; 1N32 O; 4NXN O; 1FXV A; 1J5E B; 2CDY A; 2WLJ A; 3O65 A; 4WBN B; 2ZIM A; 3JCZ A; 1OJH A; 5CA3 A; 2X0L A; 1JJO A; 1XEQ A; 2GTS A; 2M6Y A; 2A7W A; 3A0R A; 1I5Y A; 3ZRS A; 3Q4H B; 4H37 A; 4XDL A; 1PM9 A; 1URF A; 2DMX A; 1PL4 A; 4JF3 A; 3CXC U; 1KKC A; 2N04 A; 2OTJ V; 5EZY A; 1RP3 B; 2GTA A; 4PI2 A; 4X62 B; 2IBZ H; 2X6C A; 3ZED A; 1BS3 A; 2IU3 A; 1P84 F; 3E83 A; 2WLH A; 1LNQ A; 2HJF C; 2YIC A; 4HAM A; 3ZHV A; 4JYA B; 1JA8 A; 1OCR B; 1N8R W; 2FTK A; 1VQ8 V; 4KL1 A; 3T1H B; 2B9Z A; 1FJG B; 1K3E A; 2ZD9 A; 1P7B A; 5JJE B; 1VQO V; 4I50 B; 2CTW A; 1RSO A; 3BEH A; 3RT3 C; 3SPG A; 4I5S A; 4LNU B; 2AZ2 A; 5KLV H; 1R3J C; 5LMN O; 1M56 B; 1S77 D; 2PZS A; 4LF5 O; 4D7S A; 1NT2 B; 4LWS A; 3B09 A; 4J9Z B; 3E22 B; 2XAQ A; 2JJ1 G; 3BFR A; 2Q7G A; 1NI8 A; 2D3O W; 4HZ3 A; 1O9H A; 5JVD B; 2W6I G; 1JVM A; 4MSW C; 4FVM A; 3JAT A; 1WB7 A; 3CSX A; 4JI2 O; 3W7X A; 5IY5 B; 3C3S A; 3J81 N; 4F6R B; 1SQQ H; 1I94 O; 2Y0P A; 5IJ0 A; 4LCU C; 5EYP A; 2QWP B; 3RYI A; 4IGG A; 1FXH A; 3EHB B; 1SF9 A; 4KHP B; 3WG7 C; 2Y69 C; 3OUF A; 2R9R B; 1ZL8 B; 4E4E A; 5KX5 B; 4LH7 A; 5CMU A; 5JQG B; 5LXT A; 1MZF A; 3RVY A; 3ZMT A; 1G8M A; 4QGP A; 1BHA A; 3ZMV A; 1FS0 G; 5IYZ A; 2D2C B; 4TQF A; 2QGN A; 3FKS G; 1DF5 A; 3N2K A; 4I0X A; 2P67 A; 1OCO B; 4MVM A; 4JI5 O; 1ZWI C; 3B2E E; 4X88 A; 4DR4 B; 3K5L A; 2ZE8 A; 1R3L C; 2BSK A; 4RQE A; 2JDI G; 3VOU A; 3M8A A; 3ASO C; 4DV6 B; 2E5L B; 3C90 A; 2ZE6 A; 4TQD A; 4EB6 B; 3H9V A; 3HKD B; 3FB7 C; 1H2K A; 3OD4 A; 1W0K G; 2QWQ B; 3DTU B; 5B66 Z; 1VEW A; 2M7W A; 5KMG B; 2DJV A; 1IBL O; 3H1L H; 3L74 H; 1UPG A; 3T4Z A; 3MAQ A; 1E1Q G; 4P30 A; 4HBN A; 2KQX A; 3K58 A; 4NVP A; 2BOC C; 1H2L A; 4GZR B; 4MVO A; 3R66 A; 1VIB A; 2HR3 A; 4OX9 B; 4X64 O; 5EC1 C; 3JD0 A; 4I4T A; 3ETE A; 2EZO A; 2QE7 G; 3B40 A; 3OE7 G; 3FYI B; 4DV5 O; 1Q6U A; 3AK3 A; 2VRZ A; 3EXA A; 1TAE A; 4DRX A; 2F95 B; 4F4L A; 5B1B B; 1AI5 A; 1SZT A; 4LF9 O; 3OUS A; 1YEW A; 3JAW B; 4WBN A; 1HNW B; 4TV9 B; 3E86 A; 4NTY A; 4JI1 O; 2R9I A; 2DYS B; 3Q4H A; 4P2Z A; 2UUC B; 3BRC A; 2UUA O; 4B3M O; 2XAJ A; 4PA3 A; 1PKX A; 2BE3 A; 4FM2 A; 4ZIB A; 3OEH G; 1TUB B; 5HFL A; 2F66 C; 3OTO B; 2PI4 A; 1HR0 B; 4NTW A; 1XMQ B; 4IT5 A; 3VBB A; 1OCC C; 1I0H A; 2PYL A; 2H3O A; 2OCH A; 4UVA A; 1THZ A; 2JK5 C; 2ZDI C; 3IC9 A; 1OCO C; 2EIJ C; 1B6Q A; 2YIB A; 2WA4 A; 2Q7E A; 2EIN B; 3K0G A; 2VWJ A; 3SPJ A; 2E76 B; 1KP2 A; 2CH7 A; 1SET A; 5LMU O; 2EJ7 A; 2YID A; 3I5D A; 5KHG A; 1YXB A; 5J2T A; 4LNU A; 5B3S B; 1TUE B; 1IX9 A; 4LF7 B; 3CRM A; 2AHZ A; 3E22 A; 4LBE C; 2EIK B; 4DK1 A; 1EBO A; 1DGS A; 2YIA A; 4DV3 O; 4YJ2 A; 5JVD A; 4NXM O; 3ZS8 C; 5DN6 G; 1K97 A; 2LQT A; 4DV7 O; 1NKD A; 4K0K B; 4UUJ C; 3CYO A; 2YXH A; 3W7W A; 4DR5 B; 1QNM A; 3ABK B; 3HKB B; 1WPX A; 4DR2 O; 5J2U B; 1KYO F; 2Y4T A; 4ZI7 B; 1JOY A; 5F2V O; 2ZM6 O; 2RDC A; 4J11 A; 4CH4 A; 3A0H Z; 3CRQ A; 1PNL A; 4UFZ A; 2XT9 A; 2AZ0 A; 1I7F A; 4JZ2 A; 4IHJ B; 1V55 B; 3CPW U; 5CN0 A; 1Z5W A; 2A0L A; 2GUZ B; 4YY3 B; 2EUL A; 4DV0 O; 5KX5 A; 4B3R B; 5JQG A; 1CPY A; 1EM1 A; 3RYC A; 2A79 B; 2Q69 A; 3O9O A; 4MVZ A; 2XHB A; 3UO2 A; 5L3D A; 3FAV B; 4L8J A; 1YIT V; 1KD1 W; 5B1B C; 1E79 G; 1M1K W; 3CEI A; 3RVZ A; 1K33 A; 3A8T A; 4WFA V; 4ZKI A; 4LF4 B; 1X4T A; 4UCT A; 4X1K B; 2F43 G; 5LP6 C; 4TSF G; 2VQE O; 4MTX A; 4RAI A; 4UVB A; 5IJ9 A; 2ZNJ A; 4GCZ A; 4J7K A; 1Y4M A; 2FYU H; 3CCR V; 2PYJ A; 1MSD A; 4D6T H; 1PD3 A; 1ZSP A; 5CA0 A; 1F4M A; 2XAG A; 5EIB C; 4DUY B; 4DV4 O; 4DW1 A; 3AG1 C; 4GX5 A; 4JTD B; 2YI9 A; 4RO2 A; 5LYJ B; 3I56 V; 2LP7 A; 2DOS A; 2QTO A; 2KB1 A; 4BW5 A; 5KMG A; 3VQV A; 1LUW A; 1R1B A; 2PTM A; 2V1D A; 1VF6 C; 2YXL A; 1NTM H; 3K59 A; 1IXM A; 3FFQ A; 1VQP V; 3EVK A; 1S76 D; 4J7Z A; 4TT3 G; 3UQ8 A; 1QCE A; 4CH6 A; 2EIL C; 2HLD G; 5KUM A; 4X66 B; 4PD4 F; 2WWW A; 1CEZ A; 3ZHS A; 4X62 O; 1QR8 A; 5JH7 B; 4OPA A; 3RYH A; 2UUB B; 1FFT B; 4QE7 A; 4QE9 A; 2YC0 A; 2IH3 C; 3A2F A; 4UCO A; 4JYA O; 1P4R A; 1H2N A; 2V4D A; 1K4D C; 1VQ7 V; 1I08 A; 1R3I C; 1N36 B; 3T1H O; 4GKJ B; 2P4K A; 3ABK C; 3OW2 U; 1AI6 A; 3H1I H; 2DQ0 A; 1OZ0 A; 2C2A A; 2BTO A; 3FB5 C; 3P32 A; 4AQY O; 1SQX H; 2HVJ C; 1KMI Z; 2N05 A; 3TXQ A; 4J80 A; 2CGO A; 5LA6 B; 3HR0 A; 2EIM C; 4FPP A; 4A5U B; 1TUB A; 1XOU A; 4UCR A; 4FLV A; 1MZE A; 3THO A; 1NZ6 A; 1MG1 A; 2HKO A; 1RPO A; 1YF2 A; 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