The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
23
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sequence length |
62
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structure length |
62
|
Chain Sequence |
LNTFYDVQQLLKTFGHIVYFGDRELEIEFMLDELKELYMNHMIEKEQWARAAAVLRKELEQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Hypothetical protein yqgQ
|
| publication title |
Structure of YqgQ protein from Bacillus subtilis, a conserved hypothetical protein.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Bacillus subtilis
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| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
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| total genus |
23
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| structure length |
62
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| sequence length |
62
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| chains with identical sequence |
B, C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-10-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | YqgQ-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2NN4 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3CX5 F; 3B4S A; 4JGS A; 4FZ0 A; 1TVK B; 3U11 A; 4JI5 B; 3ZN1 A; 4I0X A; 2ZIM A; 4U3J B; 4DW1 A; 1J5E B; 3N2G A; 1QLE C; 3R66 A; 2ARH A; 2OT5 A; 5LGN A; 4FVM A; 5JVD B; 3T4D A; 2ZE8 A; 1AI7 A; 4YJ2 B; 1NTM H; 1N32 O; 3AK2 A; 3UQ8 A; 4J11 A; 1GN6 A; 2ZKO A; 3BA8 A; 2QEX V; 4P2Z A; 5DN6 G; 2CTR A; 4JI6 B; 2WSS G; 4UCV A; 3N2K B; 2UUB B; 2ZR2 A; 1RSO A; 1NTK H; 4H0L B; 4JPR A; 2RQ6 A; 1QLE B; 4PA7 A; 4QE7 A; 4JI1 O; 1AI4 A; 1T5E A; 3O65 A; 4CH6 A; 3JAL B; 4XBF A; 1WB7 A; 4UVA A; 3OTF A; 3KG2 A; 2EIN B; 5HFL A; 4YY3 B; 2L35 A; 4DR3 B; 4JI3 O; 2RDC A; 1TUB B; 4CS4 A; 1QQC A; 5JJJ B; 2YXL A; 2Q7H A; 3RYH A; 4PD4 F; 4WFA V; 4MVO A; 3JAK B; 1Y6X A; 2QTS A; 1IBK B; 3RYC B; 3RT3 C; 5IYB O; 3E35 A; 2DE0 X; 2HR3 A; 1KB9 F; 4UCU A; 1MMM A; 4DR7 B; 4LF5 O; 4YHH B; 4DW0 A; 2D3O W; 4DR2 O; 4X1I A; 5LMN B; 1AJN A; 3JAT B; 3SGI A; 5F2V O; 4YIO A; 4LR3 A; 4P9P A; 3OGI B; 1NZ6 A; 4PA3 A; 1NT2 B; 2HFE C; 3FAV B; 5LMU O; 1OV9 A; 1H2N A; 3H1J H; 5BR8 O; 2F1M A; 4BAY A; 3P3P A; 3N2G B; 4AIL C; 1NVP B; 1B06 A; 2JJ2 G; 3CE2 A; 2UXB O; 3TET A; 4MTX A; 3G4S V; 2DQ3 A; 2OYQ A; 1IX9 A; 3FKS G; 5CA1 A; 2FKX A; 1Q7Y W; 2VQE O; 1BMF G; 3SPG A; 4LWS B; 2HKO A; 3ZRW A; 5BY1 A; 4JI4 B; 4OXS A; 1HNX O; 3SJC C; 1VMG A; 2XAQ A; 1RSO B; 2KB1 A; 3ZMT A; 4CH3 A; 4N23 A; 4PDL A; 3OE7 G; 1JA8 A; 4DK0 A; 5EK0 A; 1ZL8 B; 4J9Z B; 3BAA A; 2AZ2 A; 4U7N A; 2V4D A; 1LUV A; 3K59 A; 2WLN A; 5LHI A; 1ZUQ A; 3AG7 A; 3DC5 A; 4LNU A; 4G2K A; 4TV8 B; 1XRE A; 4PI2 A; 4GCZ A; 3PN1 A; 3ZRV A; 4O4L A; 4ZHQ A; 3IAY A; 5CBH A; 3U0Z A; 1I0H A; 4E4E A; 4I50 A; 2DWE C; 1W0J G; 4X1I B; 3DTU B; 4LF8 O; 2YID A; 2JGD A; 4LF7 O; 1SQG A; 5C93 A; 4R8C A; 2P7T C; 4TWK A; 2XAJ A; 4WFB V; 1I5Y A; 5EZY A; 4FLZ A; 3ICX A; 1VQ5 V; 3RVY A; 5BMV A; 2F93 B; 2E3C A; 1JQ0 A; 4MVU A; 5J9P C; 5J2U A; 1YEW A; 2MK3 A; 3HR0 A; 2ADP A; 1FFX A; 5B66 Z; 2XAG A; 5EIB D; 3CCS V; 1KEC A; 5CA1 B; 1N32 B; 4MVZ A; 4BW5 A; 3LSU A; 5B1O A; 2CUG A; 4Q20 A; 3ZRW B; 2W6I G; 4P30 A; 1MSD A; 3L74 H; 3TXQ A; 2RMK B; 2DYR C; 2QWQ B; 3KCX A; 1QNM A; 1GN2 A; 2EIK B; 1R1B A; 4JZG A; 4YJ3 B; 4JI1 B; 4LF9 O; 3J7A U; 3CPW U; 1XHX A; 3IFX A; 1PKX A; 3ABL C; 1G8M A; 4KHP B; 5IJ0 B; 1KC8 W; 5EBL C; 2IJJ A; 4JI3 B; 2W0X A; 3CCE V; 1JCH A; 1K4D C; 3CRR A; 1OCZ C; 4L8J A; 3I5D A; 1CPY A; 1AIL A; 2Y4T A; 3BVO A; 2DYR B; 3SPH A; 4O4L B; 3CRA A; 3EFF K; 2YIB D; 4ZHQ B; 3K5N A; 4LF5 B; 3ABL B; 4K3A A; 5KHH A; 1K97 A; 2E74 B; 2N05 A; 4DR2 B; 4B3M O; 5L3E A; 2HG5 C; 2JGD B; 4IGG A; 3QNE A; 5J2T B; 3WFV A; 5GW7 A; 5B5E Z; 3RBZ A; 1OCZ B; 4DR1 O; 5BR8 B; 4BWA A; 5EZY B; 4Z2W A; 1OCC C; 1AR5 A; 3QO8 A; 5BMV B; 1SRY A; 5GON A; 1PM9 A; 1JMK C; 1FXV A; 3K5M A; 2UXB B; 1FFX B; 3CXC U; 3EHB B; 1SKV A; 3CXH F; 4YXW G; 3VQX A; 4JV5 O; 2VQE B; 1ARO P; 3QF7 A; 2HJF C; 1HNX B; 2WA3 A; 3RYF A; 1YCI A; 3APQ A; 1OCC B; 3BCC H; 3HKD B; 4HZ3 A; 3CEI A; 5BZB A; 1K5S A; 5IY5 C; 3P3N A; 1SQQ H; 2JK5 C; 2YDE A; 2X7R B; 4TT3 G; 1QCE A; 1SQX H; 2JJ1 G; 2PI4 A; 1YZB A; 4DV0 O; 1TGO A; 1Q6U A; 3L72 H; 1YXB A; 1EN6 A; 3LUT B; 3H1L H; 2NR5 A; 1PL4 A; 3ZHV A; 2FB5 A; 4I7Z B; 5JQG A; 5LGT A; 1S5H C; 3E89 A; 4J80 A; 5KAI Z; 4JTD B; 1DGS A; 3CB2 A; 1Y74 A; 2HVJ C; 3T1Y O; 4WF9 V; 5IY5 B; 4DUZ O; 4CC6 A; 3D8C A; 2JEU A; 3ASO C; 1NJI W; 2ZCE A; 4RQF A; 4LF8 B; 3K79 A; 3WU2 Z; 4QPJ A; 4LF7 B; 4DV5 B; 2EIJ C; 1XNR O; 5A9G A; 4GX0 A; 4ASU G; 3GVM A; 4I5S A; 3ZRS A; 3IGA C; 1UPG A; 3ETE A; 1V54 C; 4I9W A; 5GON B; 4H33 A; 1F51 A; 2Z3Y A; 4X1Y A; 2W0F C; 3ASO B; 2EJR A; 2AW9 A; 2WLI A; 4EB6 B; 4FFB A; 3UKM A; 2F4V O; 2UXN A; 2EIJ B; 3W7X A; 2QM7 A; 1U97 A; 3BY6 A; 2YXY A; 2WLL A; 1FXK B; 1XDC A; 3RYF B; 1QBZ A; 1FS0 G; 5EYP A; 1V54 B; 3ZHS A; 3ZIA G; 4LF9 B; 1VQN V; 1R3K C; 1KU9 A; 4NYK A; 5E79 Z; 4FLY A; 1VIB A; 3J81 N; 2Y4U A; 4JYY A; 4QJF B; 2JDI G; 4TUY A; 1VQP V; 2YIC A; 3BPZ A; 2VWK A; 4H44 B; 1GAX A; 2QE7 G; 2XND G; 1SQF A; 3UO3 A; 4GKK O; 5IDJ A; 1OJH A; 2BCC H; 1OCR C; 4FZ1 A; 1GK9 A; 1EBO A; 5JQG B; 4DV2 O; 2QGN A; 5CA0 A; 3K08 A; 2FL4 A; 2ATK C; 4RUF A; 1FYJ A; 2WWW A; 1Y74 B; 1EM1 A; 5IYZ A; 1MZE A; 3BAB A; 1PD3 A; 4B3T O; 1ZTE A; 4PV1 B; 2H94 A; 4X62 O; 4B3M B; 4UCT A; 1XL6 A; 1KP2 A; 2IJH A; 4DR1 B; 4JYC A; 1G6U A; 1OCR B; 2GV9 A; 2PZS A; 1I7F A; 1EZJ A; 4GUN A; 4MW3 A; 2ZD9 A; 3B09 A; 1R73 A; 1D2D A; 2Q8V A; 4ZKI A; 1PP9 H; 1OCO C; 2WLK A; 2WLI B; 4JV5 B; 3JCU Z; 4FFB B; 2ZDI A; 4LFA O; 2XAF A; 1WN7 A; 4O2A B; 3VQY A; 2UXC O; 3JAW A; 2WLL B; 3SYP A; 3CSX A; 3NR7 A; 1GTO A; 1IZ3 A; 5JJE B; 1P4R A; 3JCZ A; 5L3F A; 1AVM A; 3RN4 A; 1AB3 A; 4AQY O; 1I94 O; 2CAZ C; 4U3J A; 1Z5W A; 3FYE B; 3A8T A; 1AI6 A; 1KMI Z; 1Q6I A; 4DV0 B; 3QO7 A; 5B1A C; 1FKA O; 1VAR A; 3IC9 A; 5KHG A; 2QR4 A; 4JAV A; 3BFR A; 2WA4 A; 4BIU A; 1GM8 A; 1LR1 A; 2LGQ A; 5CB4 B; 4F6R B; 3KKY A; 1K73 W; 3N2K A; 1Z2G A; 2A0L A; 4HAM A; 1QLN A; 3ZMS A; 5IYZ B; 3QO5 A; 3T1Y B; 4PI0 A; 4DUZ B; 5KHJ A; 4B3R O; 1A32 A; 2F66 C; 1YTF D; 1H38 A; 3E2E A; 2ZDI C; 4JTA B; 1K3E A; 1XNR B; 5B1A B; 5CBF A; 4G28 B; 1BL8 A; 5EC1 C; 3ZMZ A; 1Y76 A; 4JI8 O; 4PHZ A; 1X4T A; 1TUB A; 2GHY A; 3L70 H; 2EZO A; 2IU3 A; 4DV4 O; 3P32 A; 3D36 A; 1GN4 A; 2DMX A; 4QNH B; 1HP8 A; 3T2M A; 3JAK A; 1PNK A; 2QSA A; 3MHH C; 1XQ8 A; 1JVM A; 1SES A; 4ICG A; 3RYC A; 2BSK A; 2E76 B; 4IT5 A; 3F5W C; 2F4V B; 4FJC C; 1P7B A; 2R9A A; 5EBM C; 3JAW B; 1YJN V; 4WFG A; 3SYO A; 1YSC A; 2B9Z A; 4TV9 B; 2FML A; 4MS2 A; 3B8N A; 2EJ7 A; 4QE9 A; 3E8F A; 3FAV A; 3ZN0 A; 3K57 A; 3L71 H; 1H2K A; 4FM0 A; 3OEE G; 2P4V A; 2Q0O C; 3P30 A; 2ZE6 A; 3OEH G; 1S5J A; 2Q67 A; 1KUQ A; 2CTQ A; 2B1I A; 4E2L A; 5LA6 A; 3T1H O; 4GKK B; 2EIN C; 4LWS A; 4DV2 B; 1AR4 A; 1RP3 B; 3EXA A; 3C3S A; 2IM9 A; 3D36 C; 3SJA C; 4LFB O; 4LFC O; 4B3T B; 3A0B Z; 2IJI A; 4X62 B; 4KUM A; 3HKE B; 3UO2 A; 1E1R G; 3S3W A; 3THO A; 1ZL8 A; 4A5U B; 3FFQ A; 5IE9 A; 4TQD A; 2M7W A; 4MTO A; 1BQZ A; 1Y76 B; 2UXX A; 3JAR B; 4AHC A; 2DN9 A; 1D5N A; 3ABK C; 3SYQ A; 2OCH A; 2QDO A; 2VS0 A; 5BXZ A; 3CJH B; 4I55 A; 2BTQ B; 4TV8 A; 4JTC B; 2BSK B; 4RAI A; 4LFA B; 4DV6 O; 2UXC B; 1K33 A; 2KSD A; 3LNN A; 4UCS A; 3CRC A; 1L0L H; 3CMA V; 4W4K A; 2CK3 G; 5ITZ B; 2ZE7 A; 3E83 A; 3ABK B; 3ZHR A; 3G6E V; 1K8A W; 1LNQ A; 3CC4 V; 4EFB A; 2AHZ A; 2YUA A; 1EN4 A; 4FMT A; 4AQY B; 4MTF A; 1THZ A; 1MZF A; 3SJB C; 1ZAU A; 1F7Y A; 1XOU A; 3R65 A; 5JH7 A; 3MDS A; 3SR2 C; 1AR1 B; 5LA6 B; 1K4C C; 5TIS Z; 2IU0 A; 1COW G; 1GRJ A; 3RGB A; 4H37 A; 3HKB B; 2WAM A; 3JD3 A; 1BQ0 A; 4GX5 A; 4B3R B; 1JJ2 U; 4UV8 A; 4YJ3 A; 1ZSP A; 2NNU A; 1NH2 B; 1WLE A; 4DUY O; 4J7J A; 4EKW A; 3ZHT A; 1FJG O; 4Z1V A; 1VP7 A; 5IJ0 A; 2QKS A; 4JI8 B; 4X64 O; 1R6N A; 4DV4 B; 4I9Q A; 1Y67 A; 4X20 A; 4I55 B; 3ETD A; 2YI9 A; 4B7K A; 3JD4 A; 2JIZ G; 3K0D A; 3H01 A; 1F4M A; 4GX2 A; 4FPP A; 1P84 F; 5DED A; 1L8D A; 3LNM B; 2VWJ A; 2Z5U A; 4X8A A; 3TK1 A; 3AG4 C; 5J2T A; 1SET A; 5KX5 B; 1YF2 A; 3OMI B; 5LYJ A; 5HFM A; 4NXN O; 2EIK C; 2X6A A; 5KHI A; 1PNL A; 4HYO A; 5JCO A; 3TXS A; 3AG1 C; 1JR9 A; 5JH7 B; 4UB6 Z; 1VQL V; 2PGG A; 1XUQ A; 2ILM A; 3QVN A; 3T1H B; 1JFF B; 1AJP A; 1AP5 A; 1JPX A; 1GH6 A; 1N0J A; 3G71 V; 3AG4 B; 1K5Q A; 3B8M A; 2RN9 A; 3BA9 A; 4HNA A; 3OUS A; 4LFB B; 4LFC B; 3DXR B; 1F23 A; 3T1C A; 2IW5 A; 3HKD A; 3VQV A; 3ABM B; 3AG1 B; 1FPO A; 2ZIO A; 2X0L A; 2JS5 A; 1ORQ C; 3M7M X; 2Y48 A; 4LBE C; 5LOV B; 3OW2 U; 2PF4 E; 3CP1 A; 2ZNI A; 4WBN B; 1X59 A; 1QVF U; 3F7Y C; 4U3F H; 4X20 B; 3H1K H; 5JCO C; 2X6C A; 1NKD A; 1VEW A; 3L75 H; 4X66 O; 1K92 A; 2Q73 A; 3SDL A; 5EBW C; 4DV6 B; 3B2E E; 3MAQ A; 4DV7 O; 1BHB A; 1EFR G; 2A06 H; 4JF3 A; 3RWR D; 2Y69 C; 1FFT B; 5LYJ B; 3HB3 B; 1SC5 B; 2XOK G; 3E8B A; 5LMU B; 2HLD G; 3CCQ V; 2QTO A; 4J10 A; 3G80 A; 1VQ4 V; 1YIJ V; 1EZV H; 3ZX6 A; 3JD1 A; 2E75 B; 2ITC C; 4O2B A; 4MVQ A; 1AJQ A; 4GYC B; 3G67 A; 4L87 A; 4EB6 A; 2PYL A; 5FNV B; 2Y69 B; 4UCR A; 3SPI A; 2BE3 A; 3SPC A; 1S72 V; 1KQS U; 4Q6G A; 4HNA B; 3GB7 C; 3QTC A; 1FXK A; 1S76 D; 2XUM A; 3RFR A; 1ENV A; 4P9O A; 4DRX A; 2QM8 A; 1Q90 D; 3BRC A; 3JD0 A; 2PTM A; 4DK1 A; 1PPJ H; 1FJG B; 2BOC C; 1HR0 O; 5L3D A; 2LJ2 A; 1M5I A; 4C7U A; 4X64 B; 1VQ9 V; 3VQW A; 3X2Q C; 1YJW V; 2ZIN A; 1TUE B; 3Q4H B; 3ZRX A; 4FM1 A; 4CC5 A; 5IWA O; 4JI0 O; 3ABU A; 1BCC H; 2LFR A; 3H9V A; 1IDS A; 4GX1 A; 2QKC A; 2QKA A; 2XHB A; 3LDE A; 4FM2 A; 3IJ4 A; 1IXM A; 4MSW C; 2RCV A; 4DV1 O; 4OX9 O; 4BW9 A; 2EIM C; 3K04 A; 4TQF A; 4UUJ C; 4LCU C; 3JSN A; 3MD0 A; 3X2Q B; 1WP7 A; 3GWK C; 2YIA A; 2AZ0 A; 1FXK C; 4NXN B; 1BZK A; 1M57 B; 1R3L C; 4JI2 O; 2OIG A; 4NB5 A; 4J42 A; 5FPR A; 3OD4 A; 3OFN G; 3OR7 C; 4IHJ B; 5KAF Z; 2ZE5 A; 2H3O A; 4O2B B; 2GUZ A; 1H2S B; 2XT9 A; 2LW7 A; 3T4Z A; 2EIM B; 4FK5 C; 1U96 A; 1Q3E A; 3WB0 A; 3GWO A; 5IJ9 B; 4O2A A; 3LSQ A; 1IUR A; 1HDJ A; 4RO2 A; 2YS8 A; 5IYD O; 4ZI7 A; 1M90 W; 4DRX B; 1HNW O; 4FLU A; 3AEI A; 2YEV B; 3ETQ A; 4K8Z A; 1MNG A; 1NR7 A; 1LUW A; 5LGU A; 4IIJ A; 3RYI B; 1N34 O; 4RWU A; 3ZHU A; 3QG5 A; 2JEX A; 4JAS A; 5CMU A; 1K9M W; 3ZED A; 4DXW A; 4XDK A; 4UVB A; 3OR6 C; 3CME V; 1YTF B; 1HWY A; 1SA0 B; 1W59 A; 2N04 A; 4X66 B; 5CB4 A; 4F6R A; 3K0G A; 4PA6 A; 1WPX A; 3H1I H; 3OTO O; 4DV7 B; 1OHH G; 2Q6A A; 2AXT Z; 4U7O A; 2FTK A; 1Q5O A; 2MW2 B; 1SZX A; 4R6Z A; 3N27 A; 1VF6 A; 2LFS A; 2VQF O; 4X9Q A; 4MVM A; 2Q7E A; 2Q5Z A; 1QR8 A; 5B1B B; 2LGW A; 3LDC A; 5LXT B; 2R9R B; 5FL7 G; 1JOY A; 3K9A A; 3HKC A; 4I4T B; 2GUZ B; 4FLV A; 4CS2 A; 3LSS A; 4ZBM A; 1R6K A; 4IYI A; 1Q8I A; 3A0H Z; 3JSL A; 5IT9 N; 1HW7 A; 1KBH A; 2PYJ A; 2AHY A; 4TV9 A; 1UJW B; 4ZI7 B; 2BTO A; 4GLX A; 1DTO A; 1ZWI C; 1H8H G; 4IIJ B; 3W7T A; 4UCO A; 1HR0 B; 4J7K A; 4DR7 O; 1GKF A; 3CRQ A; 2R9I A; 3F7V C; 3FB5 C; 4JAU A; 1VF6 C; 2A79 B; 4GKJ O; 1AP6 A; 3IC7 A; 5IWA B; 4JI0 B; 3E8G A; 3K06 A; 5LBQ A; 3G6B A; 1N36 O; 1Q81 W; 4DV1 B; 5D5P A; 2K9P A; 4OX9 B; 4DO2 A; 1I5X A; 5LP6 B; 2ETN A; 2Y0I A; 3HKE A; 2GSM B; 1MA1 A; 4D7S A; 4K0K O; 2HP8 A; 1RFY A; 1VQ8 V; 5CBG A; 4F6E A; 5FLX N; 3AG2 B; 2OIE A; 2XAS A; 3EVK A; 3ML0 A; 3JAR A; 1E79 G; 4JI2 B; 1NBM G; 1TA8 A; 4LF4 O; 4NTW A; 2P67 A; 3B40 A; 3VOU A; 3FB6 C; 2K1E A; 3E86 A; 3CJH A; 2BTQ A; 2LQT A; 3HKC B; 3FX7 A; 1CEZ A; 1K34 A; 1VQ7 V; 1Q86 W; 2QM4 A; 3AK1 A; 4PEL A; 2UU9 O; 2KQX A; 1WJZ A; 1YDX A; 1KP3 A; 1M1K W; 1BT8 A; 4HBN A; 3OT7 A; 1NI8 A; 4TSF G; 4NR1 A; 4DYL A; 5D5Q A; 5ITZ A; 2P5O A; 2M6Y A; 1HNW B; 3JAS A; 2G38 A; 2OTL V; 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