The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
17
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sequence length |
42
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structure length |
42
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Chain Sequence |
MKHLSDELLIESYFKAKELNLSPEFIELIEKEIQRRSLTHKI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
How to switch off a histidine kinase: crystal structure of Geobacillus stearothermophilus KinB with the inhibitor Sda
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Transferase/transferase inhibitor
|
| source organism |
Geobacillus stearothermophilus
|
| molecule keywords |
Sporulation kinase B
|
| total genus |
17
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| structure length |
42
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| sequence length |
42
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-05-09 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Sporulation inhibitor A |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1PV0 A; 3D36 C; #chains in the Genus database with same CATH topology 3OUF A; 1JQ0 A; 2Y0P A; 4NXM O; 2ZE5 A; 4UUJ C; 2WLK A; 4DV0 B; 3IFX A; 5JJJ B; 1XI1 A; 4DV3 B; 1GM9 A; 2N05 A; 2F4V O; 2A9H A; 3W7S A; 4LF7 B; 1NVP D; 1Q6H A; 1NTK H; 4DV2 O; 3JAS B; 4OPA A; 4I5S A; 3F7Y C; 4NXN O; 4UVC A; 5A2Q N; 1M90 W; 1SER A; 1BZK A; 1THZ A; 1K73 W; 4BAY A; 4X64 B; 1XEQ A; 4JGS A; 2Q0O C; 3OUS A; 2RMK B; 2Y69 C; 4FMT A; 1YHQ V; 3OGC C; 1YDX A; 4MVR A; 2P6J A; 5J9P C; 2ODM A; 3DC5 A; 3LDD A; 1TUB B; 5EYP B; 3CP1 A; 3OMI B; 1Y74 A; 3ZRS A; 1ZSP A; 1SES A; 2N74 A; 3E35 A; 2R9I A; 5GON B; 3U10 A; 3RBZ A; 1I94 B; 1RSO B; 4DXW A; 5LMU B; 5KMG B; 4J80 A; 3OTO O; 2OTL V; 3QO7 A; 1Y66 A; 1E79 G; 2EIJ C; 2IU0 A; 1G6U A; 3KCX A; 2BTO A; 2V7Q G; 2ILM A; 2Q5Z A; 4DW0 A; 4GX2 A; 3QO8 A; 3LSS A; 4JI6 B; 3B77 A; 3J81 N; 1PV0 A; 3E8F A; 3IGA C; 4U3J B; 4I9Q A; 3ZRW B; 3R66 A; 3G80 A; 1M57 B; 5CMU A; 1NR1 A; 2ZDI A; 2LQT A; 4WFB V; 3G6E V; 1IBM O; 2HG5 C; 4DV7 B; 3CSX A; 4FLU A; 2DYS C; 4JI0 B; 1LNQ A; 3P32 A; 3K06 A; 3SJA C; 1CP9 A; 2EZO A; 1V54 C; 3FYI B; 2R9A A; 5KHH A; 1L1F A; 1ZLZ A; 1HR0 B; 3L70 H; 4GLX A; 1F51 A; 4DV3 O; 1GO3 F; 3P30 A; 5EC2 C; 4LF7 O; 3HKD A; 4GZR B; 2GTS A; 3CC7 V; 4PA6 A; 5L3C A; 4IL6 Z; 4MS2 A; 1SC5 B; 2EIL B; 5LHI A; 5KHG A; 4JYA O; 4LF9 B; 2KQX A; 1AP6 A; 1SA0 B; 5FPR A; 5EIB D; 3CWB H; 3CRQ A; 3M8A A; 1PKX A; 3SR2 C; 4D6T H; 3UO2 A; 5IT9 N; 4OX9 O; 2LW7 A; 3KG2 A; 1SQB H; 2CUG A; 1Q86 W; 1RFY A; 4BW5 A; 2Q6A A; 3K5N A; 4WFE A; 1SQF A; 1SS3 A; 2OIG A; 5LMU O; 1VQ8 V; 4Z1M G; 1FXK B; 1H2N A; 4O4L B; 4JYY A; 1I0H A; 3BY6 A; 3L74 H; 1BHA A; 3CXH F; 3C90 A; 1IBL O; 1URF A; 3ZMS A; 4JI6 O; 3OD4 A; 4ZHQ A; 4DR5 B; 5KAI Z; 1FXH A; 1IDS A; 4OGQ B; 2ZE7 A; 4JAA A; 4KFM A; 3AG2 C; 5LGT A; 3HKE B; 2HJF C; 2IBZ H; 2P22 C; 4X66 O; 2F1M A; 2Y4U A; 4B7E A; 4BIZ A; 4WBN B; 3U11 A; 4I50 B; 4J7Z A; 2IJJ A; 4JI3 B; 3JAM N; 2IW5 A; 3JAT B; 2DE0 X; 4DV7 O; 4MVM A; 2LFR A; 2LGQ A; 1AI6 A; 1I5X A; 4JI0 O; 3EXA A; 2CE4 A; 2CGN A; 1V55 B; 1YSC A; 4GX5 A; 4WF9 V; 4UCT A; 4RAI A; 3K5O A; 3CCE V; 3ABM C; 3RYH A; 1HR0 O; 1K3E A; 3IJ4 A; 4BIU A; 4LNU B; 4P30 A; 2ARH A; 2N04 A; 5FNV B; 1JA8 A; 1OJH A; 3K08 A; 3E22 A; 3RVZ A; 4DR6 B; 3SYC A; 2QSA A; 2RJZ A; 4FFK A; 5IY5 B; 4JTC B; 5J2T B; 4LFA B; 3SPC A; 2VWK A; 3Q4H B; 2QM8 A; 2F93 B; 5KUK A; 2Q7G A; 3CMA V; 2DW4 A; 3JSL A; 4H0L B; 4KL1 A; 4UXN A; 3OMA B; 3VBB A; 1R6T A; 4K35 A; 4RWU A; 1ZTE A; 3W7W A; 3AG3 C; 4AI8 A; 4A5U B; 2JJ1 G; 1JJ2 U; 5JH7 A; 1VQL V; 4MVO A; 4KXR A; 1BCC H; 3LNN A; 1N34 B; 2LJ2 A; 1BS3 A; 1D5N A; 1RM1 B; 1XOU A; 3B09 A; 3E89 A; 1JX9 A; 4JTA B; 2OWO A; 3FB6 C; 3B4S A; 2IJI A; 2OCC B; 5CB4 B; 1U96 A; 5CA1 B; 4FK5 C; 1AJN A; 2Q67 A; 3H1L H; 1N32 B; 1QU7 A; 2H8P C; 1YJN V; 2V1D A; 1YTF D; 1L0N H; 3RGB A; 2XAH A; 3CRM A; 1XL4 A; 2QWQ B; 2PYJ A; 2EIN B; 2CTR A; 5L3G A; 2R70 A; 4QNH B; 5CN0 A; 1H2L A; 3CCV V; 1Z5V A; 2ZXW C; 1ROP A; 2XUM A; 4K0K B; 3K5M A; 1ZAU A; 4O2A B; 4TWK A; 4N23 A; 1YXB A; 1KKC A; 5LP6 A; 1YIT V; 1Z2G A; 1Y4M A; 1PPJ H; 3UCS C; 4DR6 O; 1SQX H; 3SDL A; 2Z0A A; 1V9P A; 4CS4 A; 5IDJ A; 2ADQ B; 3BAB A; 1J95 A; 3AG1 C; 2ZD9 A; 3JAW A; 2EJ7 A; 4LFA O; 4MW8 A; 1XNR O; 5LL6 Y; 2XHB A; 1OV9 A; 5B3S C; 1OCR B; 1YI2 V; 4XBF A; 1MOF A; 1YF2 A; 3ZS8 C; 1JMK C; 3M99 B; 4PDR A; 3KCY A; 1GKF A; 1BL8 A; 5CBF A; 4UCR A; 4DR2 B; 2ZNJ A; 1LUW A; 1HNX B; 3GB7 C; 4MTG A; 1JJO A; 4UCS A; 4TQD A; 2G38 A; 3UQ8 A; 2YXY A; 5EBW C; 2QEX V; 1N34 O; 4W4K A; 2Q9L A; 4PA3 A; 1P7G A; 3LDC A; 2EIK C; 4QIW F; 2O57 A; 5JWP A; 1KBH A; 3CHX A; 4PI2 A; 3OW2 U; 3D3Q A; 2JGU A; 2YUA A; 3A0R A; 4UVA A; 4I0X A; 1IVS A; 3ZRV A; 2AW9 A; 4CBC A; 5B1B B; 1MMM A; 1HNW B; 4FZ1 A; 4CH6 A; 1CEZ A; 1PNM A; 2DJV A; 5GTI Z; 3T1H B; 4K0K O; 1TUE B; 1TAE A; 4FJC C; 2JGD B; 4F6E A; 3SYQ A; 3A2F A; 3CJH A; 2HJD A; 4J7K A; 1BQ0 A; 2DN9 A; 4RO2 A; 4YIO A; 4J41 A; 1Q90 D; 3S3W A; 1SZT A; 3KKY A; 1PL0 A; 4MVU A; 5KUM A; 1SZX A; 4CZZ A; 2YXH A; 3P3N A; 3JAL B; 1B04 A; 3ZIA G; 5KHJ A; 2DMX A; 1Q3E A; 4TV9 B; 4KP4 A; 2CTW A; 3LDE A; 1I08 A; 2XAJ A; 4UV8 A; 5B1A C; 2UXX A; 4DR2 O; 1IZ3 A; 4I55 B; 2ZKO A; 1AR5 A; 4DV2 B; 4F6R A; 3LSU A; 4HAM A; 3M7M X; 5C93 A; 1QLN A; 2ZIM A; 1K9M W; 2VRZ A; 1NVP B; 4X1K A; 3K5L A; 4YJ3 B; 5IJ0 A; 3C3T A; 1N0J A; 3HKC B; 5KLV H; 2OYQ A; 5AG2 A; 3OR7 C; 1YEW A; 1COW G; 3F7V C; 1SQV H; 1K5Q A; 4X9Q A; 2QTO A; 2UUA B; 1J5E O; 1HDJ A; 1L8D A; 4Z1V A; 2PF4 E; 2HR3 A; 3IAY A; 1P49 A; 4FLV A; 3D36 A; 4IHJ A; 3N2K A; 4LF4 B; 3H1I H; 4IIJ B; 4ZOL B; 2YID A; 2W0F C; 3OTO B; 1VQ5 V; 1VIB A; 4UVB A; 4UCV A; 3ML0 A; 1DTO A; 3FD9 A; 4G27 B; 1HNW O; 4PHZ A; 2GBO A; 1F4M A; 2AXT Z; 1VQM V; 1GN6 A; 2QWR B; 2XAF A; 3DXR A; 4B7K A; 5KHI A; 2B5U A; 4CH5 A; 5CA3 A; 1XNQ O; 5IYC O; 3T1H O; 3CS5 A; 2E76 B; 2CK3 G; 5CA0 B; 2JK5 C; 1M56 C; 5H5N A; 2FTK A; 5TIS Z; 3K59 A; 1YCI A; 3J80 N; 3STZ C; 2XOK G; 1GN4 A; 3ETD A; 2Y69 B; 1N4C A; 1S3J A; 1G4Y B; 4X20 A; 1K92 A; 1RP3 B; 3A8T A; 1K4D C; 2XTA A; 4E4E A; 3N2G B; 2ZQM A; 4DR3 B; 4DRX B; 1K5S A; 4ZBM A; 1ZUQ A; 1AI4 A; 2ZIN A; 4OPH A; 2B9Z A; 5BZB A; 1NH2 D; 5BR8 B; 2ZE8 A; 1K7D A; 4LC1 A; 1EN4 A; 2ZDI C; 2P5O A; 2YIB A; 3RYI B; 4ASU G; 5EZY B; 1P4R A; 2EIJ B; 2QM7 A; 2FML A; 2Y4T A; 3W7X A; 3OAA G; 4JYA B; 3FFQ A; 4CC6 A; 1RPR A; 1XL6 A; 2B1G A; 1YJ9 V; 3ABT A; 3ZHT A; 4L87 A; 5A9G A; 1X59 A; 1TGO A; 1VF5 B; 5LYJ A; 4OX9 B; 5HFL A; 3RN4 A; 1SET A; 3MDS A; 3ZRX A; 4CH3 A; 4JV5 B; 2M7W A; 2UUA O; 3WFV A; 5GTH Z; 2ATK C; 4LH6 A; 4ZI7 A; 2PY5 A; 4TV8 B; 3RYF B; 4O4J A; 2DYS B; 4Q20 A; 1PD3 A; 4LF4 O; 4F4L A; 1V54 B; 3BAA A; 4HNA B; 5LBQ A; 1GAX A; 4WFH A; 4NTX A; 3ETQ A; 2DQ3 A; 4IYI A; 1VQO V; 2WAM A; 2FYU H; 4NTW A; 1MA1 A; 1G1X B; 1IBL B; 2A0L A; 1MG1 A; 1AB3 A; 3TK1 A; 2E74 B; 1CXZ B; 4CH4 A; 1W0J G; 4GCZ A; 2GV9 A; 2XND G; 5D5P A; 4X66 B; 3APO A; 2NNU A; 1UJW B; 5H2F Z; 5EIB C; 2H94 A; 5B1N A; 1XHX A; 2W6J G; 1R1B A; 3K9A A; 2A79 B; 4R50 A; 2GHY A; 4FFB A; 3E86 A; 1L0L H; 2QWN B; 3KZI Z; 4Q6G A; 4DR3 O; 4L8J A; 4PA4 A; 1K33 A; 1T5E A; 3FB8 C; 3T4D A; 3HKB A; 3CC2 V; 1NR7 A; 4YJ2 A; 3UT5 A; 5DED A; 2EJR A; 2YI8 A; 3ETG A; 5JVD B; 5C8Y B; 5BR8 O; 1WPX A; 1NBM G; 4X1I B; 1TVK A; 1MNG A; 3JCU Z; 2CH7 A; 2M6Y A; 4EEQ A; 2PGG A; 3PJS K; 1N8R W; 5J2U B; 3K0D A; 2EIM C; 2CDY A; 3E2E A; 1IBK B; 4FIP C; 4FLZ A; 4KHP O; 1US6 A; 3QG5 A; 3AG2 B; 5KA5 A; 1HP8 A; 3L9D A; 1SRY A; 1I5Y A; 5B5E Z; 4O2B B; 2MW2 B; 4O4I B; 1NT2 B; 4PA7 A; 1O9H A; 1HNZ B; 1VQ4 V; 4JV5 O; 4JTD B; 3VQW A; 1W2B U; 2ZR3 A; 2YIC A; 1BHB A; 1E1Q G; 1PNL A; 1OCC C; 1N36 B; 1XMO O; 3LSQ A; 2FL4 A; 5IYZ B; 1KP3 A; 2WSS G; 1KB9 F; 2QDO A; 3JAS A; 3ABM B; 1XQ8 A; 2YDE A; 5LOV B; 3FAV B; 3T2M A; 2Y48 A; 4UCU A; 1KKD A; 3VQY A; 3VQX A; 2DYR C; 5HFM A; 4PA9 A; 3AEI A; 1AIL A; 2ZR2 A; 4UCO A; 1VQ7 V; 4EB6 A; 3GWO A; 3H01 A; 1NZ6 A; 3WB2 A; 3H1K H; 4J10 A; 4BIO A; 1TUB A; 4GX1 A; 1P7B A; 4LH7 A; 5EYP A; 2GUZ B; 1M1K W; 5GON A; 3BA8 A; 1M4U A; 1RSO A; 2UUC O; 1IUR A; 5KMG A; 1YTF B; 3FX7 A; 1DGS A; 2IH3 C; 2YEV B; 1H8E G; 1FKA O; 3RYC B; 1MZE A; 1Y76 B; 1VQ6 V; 4GKK B; 2LFS A; 4U3J A; 4LWS B; 3AG3 B; 4CS3 A; 3WG7 C; 3B40 A; 3ZRW A; 1DLB A; 1M5I A; 1VQN V; 2PI5 A; 1RPO A; 1EN5 A; 4YHH B; 4ZIB A; 3H1H H; 3AG4 C; 1DF5 A; 1WPB A; 1YVW A; 3ICX A; 4Z2W A; 3FYE B; 1IBK O; 4DV1 O; 4YY3 B; 1NKD A; 1S5L Z; 1XNR B; 3X2Q C; 4UB8 Z; 2YXL A; 4GT1 A; 5LP6 C; 1YIJ V; 3SPH A; 4O4H B; 1HNZ O; 1VF6 A; 2ITC C; 3JD2 A; 2DWE C; 3ASO C; 2NN4 A; 2V4D A; 4J11 A; 1FFT B; 4TUY B; 4DK1 A; 1SQQ H; 4GX0 A; 2QA4 V; 4JI2 B; 2H3O A; 1ZX3 A; 1N36 O; 4FVM A; 3ABL C; 4X88 A; 3UM7 A; 5CBH A; 1V55 C; 2ZXW B; 3ZMU A; 4DO2 A; 5KHK A; 4MSW C; 3EFF K; 3JAR B; 2KG7 B; 1WNS A; 5BXZ A; 3CEI A; 3ZMV A; 1JVM A; 2Z5U A; 4X1Y B; 3ABK C; 3NR7 A; 1H2K A; 4NKG B; 1XHZ A; 4P9P A; 4XDL A; 3AG1 B; 1JFF B; 2YIA A; 2AHZ A; 5D5Q A; 2WLI B; 3CCU V; 1FD9 A; 3AG7 A; 1WP7 A; 5B3S B; 1BT8 A; 1FXK A; 4XDJ A; 4O4L A; 1AVM A; 3SYO A; 3TXQ A; 3D8C A; 5GW7 A; 1KYO F; 3WU2 Z; 2PYL A; 4GKK O; 1S76 D; 3LNM B; 4R8C A; 4NR1 A; 2ZCE A; 5KX5 B; 4JI7 O; 3FKS G; 3HKE A; 5EK0 A; 4LF6 B; 3N27 A; 5H6R A; 3JD4 A; 4WBN A; 3AK1 A; 2HLD G; 5FLX N; 2E5L B; 2RDC A; 4I50 A; 2EIK B; 5JQG B; 4C7U A; 1FFX B; 4YHH O; 3CCS V; 4R6Z A; 2AHY A; 4LR3 A; 2L6L A; 3F5W C; 2XT9 A; 5LXT B; 2BSK B; 3JAT A; 1IX9 A; 4YY3 O; 1JPX A; 3HB3 B; 1ZWI C; 3IC9 A; 1AR1 B; 5IJ9 B; 2KB1 A; 4PD4 F; 2X7R B; 4MVZ A; 3B8M A; 1ZL8 B; 3E83 A; 2WLN A; 3SYA A; 4LNU A; 3TJT A; 5FNV A; 4GUN A; 4JI2 O; 2X6B A; 2A7W A; 1B06 A; 5ITZ B; 3WB0 A; 4J9Y B; 5BMV B; 5K1X A; 3E8B A; 1NTZ H; 1EM1 A; 2HEP A; 3JD3 A; 1GH6 A; 2VQE O; 2NLJ C; 2IJH A; 3H9V A; 4DR7 O; 5J2T A; 4I4T B; 4FLY A; 1OCZ C; 1J5E B; 4QJF B; 4PI0 A; 1OCO C; 1H2G A; 3BHP A; 3OGI B; 1GTO A; 1AI7 A; 3BCC H; 5EBL C; 3OFN G; 2F23 A; 1WA8 A; 2X0L A; 2BTQ B; 3UKM A; 1LUV A; 4LCU C; 3OEH G; 2EUL A; 1KC8 W; 5B1A B; 3F5T A; 2BOC C; 3BRC A; 1Q43 A; 3D36 C; 3JAK B; 1XNQ B; 3ZN0 A; 4J9Z B; 2DQ0 A; 4RUF A; 1NU1 H; 2P90 A; 3H1J H; 5CB4 A; 5CA1 A; 3CME V; 4LF6 O; 1B3Q A; 1PP9 H; 4H13 B; 2JEX A; 2E5L O; 1R3L C; 3CD6 V; 3VQV A; 1QLE C; 4LFC O; 1Q6I A; 2OT5 A; 1QQC A; 2RQ6 A; 3OE7 G; 4DR1 O; 1QVF U; 1F7Y A; 1KU9 A; 1OHH G; 1KP2 A; 1FYJ A; 3CCR V; 4J7J A; 4FLX A; 2HFE C; 4U7N A; 4LBE C; 4O2A A; 3FB7 C; 3RW0 A; 3T1Y B; 2WLL A; 1NH2 B; 1S5H C; 2YI9 A; 3SPJ A; 4LP8 A; 4ABM A; 1P84 F; 4D7S A; 2EX3 A; 2IU3 A; 5L3D A; 2UXD B; 1Y74 B; 3AK3 A; 5B1O A; 3ZHU A; 4JPR A; 4TT3 G; 4DV6 B; 1XUQ A; 1M56 B; 4NB5 A; 4DV5 B; 4MTO A; 3OTF A; 4JYC A; 4RQF A; 1VQ9 V; 3B8N A; 2ZNI A; 5L3E A; 4GYC B; 3OMN B; 2RNB A; 4U3F H; 2ZM6 O; 2Q7E A; 4JI1 O; 2EZP A; 4AHC A; 1ENV A; 1W0K G; 2WA4 A; 4DUZ O; 4CC5 A; 3ASN C; 3I5D A; 2P7T C; 1GMG A; 2KSD A; 3HR0 A; 2Z3Y A; 4ZKI A; 1UFI A; 2IH1 C; 3QF7 A; 4DUY B; 4DYL A; 4MT8 A; 1N33 B; 2XAQ A; 2YIB D; 2P67 A; 4MW3 A; 3OM3 B; 1QCE A; 1M9N A; 4H33 A; 3I55 V; 3HPL C; 4AQY B; 1GN3 A; 1MZF A; 3CRA A; 3L73 H; 3ZX6 A; 2YSU B; 4YIP A; 1Q6U A; 3HKD B; 3R65 A; 3CCM V; 1R3J C; 1FPO A; 1KD1 W; 2K9P A; 2WLH A; 3QTC A; 3G67 A; 3T1C A; 3LUT B; 4FPP A; 1WB7 A; 1M93 A; 4G28 B; 4X62 B; 2UU9 B; 2JRI A; 5JCO A; 2ADP A; 3BPZ A; 2QM4 A; 2F43 G; 4K3A A; 2UXC B; 5LA6 A; 3G71 V; 1EBO A; 2WWW A; 2QKS A; 4PV1 B; 2QR4 A; 3ZMZ A; 3U0Z A; 3RVY A; 4DK0 A; 3T1Y O; 5EC1 C; 2JGD A; 1NS1 A; 3DSQ A; 2P4V A; 2VQF B; 3O9O A; 4H37 A; 1XBL A; 1R3I C; 2UXB O; 5CBG A; 3TXS A; 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