The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
21
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sequence length |
66
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structure length |
66
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Chain Sequence |
KETGYYDVLGVKPDASDNELKKAYRKMALKFHPDKNPDGAEQFKQISQAYEVLSDEKKRQIYDQGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Chaperone
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| source organism |
Caenorhabditis elegans
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| publication title |
X-ray crystal structure of J-domain of dnj-12 from Caenorhabditis elegans.
rcsb |
| molecule keywords |
Hypothetical protein dnj-12
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| total genus |
21
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| structure length |
66
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| sequence length |
66
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-12-20 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00226 | DnaJ | DnaJ domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DN9 A; 1GH6 A; 4RWU A; 2QWQ B; 2CUG A; 1FAF A; 2YS8 A; 1BQ0 A; 2GUZ B; 4J7Z A; 2Y4U A; 2DMX A; 2CTR A; 2QSA A; 2OCH A; 2CTP A; 1N4C A; 3UO3 A; 3APO A; 1HDJ A; 4IT5 A; 2QWO B; 1XBL A; 2QWP B; 2Y4T A; 2KQX A; 2PF4 E; 1NZ6 A; 3UO2 A; 2CTQ A; 1WJZ A; 2QWN B; 2N04 A; 2L6L A; 3UCS C; 2LGW A; 2YUA A; 2QWR B; 2LO1 A; 3BVO A; 2EJ7 A; 3APQ A; 3AG7 A; 2N05 A; 1BQZ A; 2M6Y A; 1FPO A; 2CTW A; 2GUZ A; 1IUR A; 4J80 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3JSN A; 2YS8 A; 4L8J A; 4O4J B; 4CZZ A; 1F4N A; 2F93 B; 1Q81 W; 1YIJ V; 2W0F C; 1KQS U; 3JSL A; 4I50 B; 4J7J A; 2G38 A; 2EJR A; 4DR4 B; 2Y0I A; 4DV2 B; 2A9H A; 2NLJ C; 3RYC A; 4FJC C; 2EJ7 A; 4CC6 A; 2QJ1 A; 2CTW A; 2XAJ A; 4JTC B; 1BHB A; 4UCS A; 3CCJ V; 3OTO O; 2BTO A; 1VQ6 V; 1TVK A; 4LF6 B; 2IH1 C; 2QM4 A; 4GX5 A; 1HP8 A; 5CA0 B; 1SQG A; 1R73 A; 2H3O A; 3WB0 A; 1GRJ A; 4D7S A; 1V55 B; 4JI1 B; 1XDC A; 3T4Z A; 3TET A; 2P4K A; 1XNQ B; 4F6R B; 2NN4 A; 3TK1 A; 2WWW A; 3ZRW B; 2DW4 A; 3CYO A; 1SQX H; 2P4V A; 1B6Q A; 1VQ5 V; 4DR2 B; 4DV4 O; 5GON B; 1PNK A; 3D36 A; 5LYJ B; 1WB8 A; 4X1Y B; 4X1I A; 3JAM N; 2HJD A; 1ARO P; 3K0G A; 1H2K A; 2VWJ A; 4KL1 A; 5LOV A; 1QLE C; 3UQ8 A; 4X64 O; 5KUK A; 2WSS G; 3AG7 A; 3ZHU A; 3H1K H; 1SZX A; 1IXM A; 1DK1 A; 1EM1 A; 2RMK B; 3RYF A; 3RYI A; 3AK3 A; 2AZ0 A; 4H0L B; 2Q8V A; 3OEH G; 4F6E A; 4FIP C; 1KB9 F; 1P84 F; 4R6Z A; 2WLJ A; 1U97 A; 2WA3 A; 3ICX A; 2QKS A; 1PM9 A; 1VMG A; 5BZB A; 1B3Q A; 4BIU A; 4TV9 B; 1A32 A; 2UUB B; 2V7Q G; 2YI8 A; 2YIB A; 2UXX A; 5LXT A; 4HNA B; 1K5S A; 3DTU B; 2PZS A; 2LFS A; 1XBL A; 1SRY A; 3L74 H; 1ROP A; 4DV3 O; 4J41 A; 4H33 A; 1URF A; 1SZT A; 2EBO A; 3BHP A; 2F66 C; 3H1I H; 1AR5 A; 4DUY B; 1JOY A; 1SA0 A; 2DOS A; 1BE3 H; 2ZM6 B; 2GUZ B; 2ZDI C; 2HR3 A; 4LBE C; 5KUM A; 1I94 O; 3F5W C; 2ZNJ A; 4BR6 A; 2Z5U A; 5J2U B; 1OCO B; 4JI6 B; 1IZ3 A; 2K1E A; 2GV9 A; 3VQX A; 2XUM A; 3RYH A; 1HR0 O; 4TWK A; 2NNU A; 1K3E A; 2ZE5 A; 3I5D A; 2Q9L A; 5C8Y A; 1GAX A; 4DO2 A; 1E79 G; 4I0X A; 5B1N A; 1F7Y A; 3L71 H; 5B5E Z; 2AXT Z; 1F51 A; 1XQ8 A; 1IXB A; 3VQW A; 1XMO B; 1D2D A; 1KMI Z; 1R6N A; 2V4D A; 4JYA B; 5LHI A; 1Y67 A; 4LFC O; 3FAV A; 3CP1 A; 3BVO A; 1H38 A; 3ABK C; 5KHH A; 3CCQ V; 3SJC C; 3FX7 A; 1COW G; 1NQT A; 3D8C A; 4K3A A; 4OPH A; 1VQL V; 1L0L H; 1NR7 A; 1KYO F; 3SDL A; 5KHK A; 2WLI B; 1HDJ A; 2FL4 A; 4KHP O; 1R3J C; 1S0V A; 3CCM V; 2ZIM A; 4JI2 B; 4XDK A; 3K0D A; 3E8G A; 5EZY B; 1BZK A; 1M4U A; 2X7R B; 4DV6 B; 1Q86 W; 3K59 A; 4FM2 A; 3H1J H; 4YIP A; 3HKC B; 1SQB H; 5F2V O; 1PP9 H; 3OT7 A; 1LUW A; 4X9Q A; 5IYD O; 5IYZ B; 2X0L A; 2ZQM A; 4J10 A; 3JAR B; 1M93 A; 5JQG A; 3G67 A; 5IE9 A; 2DN9 A; 5B1B C; 1FXK C; 1XRE A; 3DXR B; 4QIW F; 1W0J G; 2B5U A; 5EC1 C; 4DR3 B; 1R3K C; 1H8E G; 5ITZ B; 1K97 A; 5B3S B; 1FXV A; 3Q4H A; 2XHB A; 4ZBM A; 2JVD A; 4J9Y B; 5LA6 B; 4JI8 O; 4J9Z B; 3E89 A; 1THZ A; 1XL6 A; 2Z0A A; 4PD4 F; 4PDR A; 1DF4 A; 1SET A; 3E22 B; 4AQY B; 3ABM C; 1AIL A; 3N2K B; 3RBZ A; 4O4I A; 3STL C; 4CBC A; 2EIM B; 3DC5 A; 2R9I A; 1KKD A; 4XDL A; 4J7K A; 2EIL C; 1IX9 A; 3MAQ A; 4FLZ A; 1NBM G; 1OJH A; 4EEQ A; 4X65 B; 5L3B A; 5EK0 A; 2E5L B; 4DR6 O; 1EZJ A; 4X62 O; 5LP6 C; 2DWE C; 2EIK C; 3ZHQ A; 4UCO A; 3J81 N; 1KU9 A; 1OCC C; 2QE7 G; 3CD6 V; 1XIL A; 2WPD G; 1X4T A; 1TGO A; 3RYC B; 2VQE O; 3K57 A; 4MVM A; 4U7N A; 1LNQ A; 4CH4 A; 2LFR A; 3IGA C; 5DN6 G; 1TVK B; 1DGS A; 1I5X A; 1Q6H A; 3T1C A; 2LGQ A; 5GTH Z; 3K9S A; 3RWR D; 1QR8 A; 4FVM A; 4BIO A; 3SJA C; 2ODM A; 3CCS V; 2A3Q A; 1M57 B; 4J42 A; 4JPR A; 2HVK C; 1HNW B; 1R3I C; 3OMA B; 3LSQ A; 1DF5 A; 4JTD B; 4DV1 B; 1N34 O; 4X1I B; 1AI4 A; 4DV7 O; 3SYC A; 3E8B A; 1JQ0 A; 1K73 W; 3U10 A; 5BY1 A; 5IJ9 A; 5LOV B; 3ZHV A; 2XND G; 2QTS A; 1R3L C; 4ZHQ A; 2QR4 A; 1L1F A; 5LYJ A; 2DYR B; 3AG1 C; 5IY5 B; 1V9P A; 2PUS A; 1N4C A; 5IT9 N; 3MHS C; 1XNR O; 3RYF B; 1RPR A; 3RYI B; 3P3N A; 4PDL A; 4EFE A; 1S77 D; 5C93 A; 2A06 H; 2LO1 A; 5E1A C; 1XEQ A; 3E35 A; 4LFA O; 3BEH A; 4WCE V; 1OCR C; 4R8C A; 1TAE A; 4JI7 O; 1VQ7 V; 2Q69 A; 2IU0 A; 3ASO B; 4MS2 A; 2CGO A; 2F1M A; 1QQC A; 1EN6 A; 3A2F A; 3F5T A; 3ZHT A; 3JAT A; 5LXT B; 5H2F Z; 1N33 B; 5IY5 C; 2DYS B; 1M5I A; 1M56 C; 3CCV V; 1NS1 A; 1ZL8 B; 1XI1 A; 5A2Q N; 4FK5 C; 1QLN A; 4NTW A; 4YY3 O; 4HNA A; 1FD9 A; 4X1K A; 1SA0 B; 4TQD A; 2RNB A; 5KHJ A; 3CC7 V; 4AI8 A; 1XL4 A; 1FKA O; 1YCI A; 1VQN V; 2ZR2 A; 3B40 A; 2VQF O; 1LR1 A; 2N04 A; 5FL7 G; 4JI0 O; 2QWR B; 4WFA V; 5LBQ A; 3GWO A; 2OTJ V; 1Y6X A; 4DR1 B; 4JI3 O; 4O4H A; 3BA9 A; 1XHZ A; 2Q5Z A; 1IBK O; 3RYH B; 1L0N H; 2JJ1 G; 5C8Y B; 2GSM B; 5KX5 A; 4KFM A; 4B3T B; 2GTA A; 2GHY A; 2UXB O; 4I0X B; 1H2L A; 2BSK B; 1RM1 C; 2ZKO A; 1UJW B; 1S76 D; 1HWY A; 3H1H H; 1HNZ B; 3CXH F; 3K03 A; 2X6A A; 1AJP A; 3ETG A; 1KEC A; 2ADP A; 3FAV B; 3W7S A; 1GH6 A; 3MDS A; 4GX0 A; 3JD3 A; 2HHH B; 4DRX A; 1YSC A; 1SES A; 5LMU O; 3GVM A; 2E74 B; 4YHH O; 2JK5 C; 5KAI Z; 3IC9 A; 2PYJ A; 1QCE A; 3BPZ A; 4JI4 B; 1BCC H; 3B2E E; 4X8A A; 5KHI A; 4B08 A; 2UUC B; 3CC2 V; 4J80 A; 3OMI B; 4DYL A; 3OGC C; 1OCZ C; 3HKE A; 1VF5 B; 3T1Y O; 1HNX B; 2OYQ A; 4LF4 O; 4B3S O; 5IYC O; 4DUZ O; 3CS5 A; 5LGN A; 5JJE B; 2LGW A; 2DQ0 A; 2EZP A; 4MT8 A; 1CPY A; 3H9V A; 2JEX A; 3CE2 A; 1KKC A; 3N27 A; 3CXC U; 2EUL A; 2ZCE A; 1G6U A; 5JQG B; 4J7Z A; 4EFB A; 2QSA A; 5LGU A; 1H2S B; 2Q68 A; 4DR5 O; 4NXN O; 3OFN G; 5GTI Z; 2X6C A; 5IJ0 A; 3Q4H B; 1EN4 A; 3AG4 B; 2KSD A; 4ZI7 A; 4P9O A; 4GKJ O; 2L35 A; 3VQV A; 5HFL A; 5KA5 A; 2MK3 A; 2LQT A; 5E79 Z; 1MNG A; 3HR0 A; 3C90 A; 3WG7 B; 4I5S A; 2IJI A; 2WLH A; 1N32 O; 3E22 A; 4CH6 A; 4K0K O; 3LSS A; 1YTF B; 2L6L A; 1GM7 A; 5DED A; 1BQZ A; 1MZF A; 4FM0 A; 1K7D A; 3AG2 B; 1Z5V A; 4TV8 A; 3W7T A; 1JVM A; 3ZX6 A; 4YXW G; 1V54 B; 4FLY A; 1TUE B; 3UKM A; 1GMG A; 2JIZ G; 2PF4 E; 3ABL B; 1FFT B; 3ETQ A; 1S5J A; 4GYC B; 5B66 Z; 3SYQ A; 3DSQ A; 5LMN B; 1HW7 A; 2K9P A; 3K3W A; 4WFH A; 1NH2 D; 4YIO A; 2UUA O; 2WLN A; 3ZIA G; 4WFB V; 1J5E B; 1K4C C; 4C7U A; 1IBL O; 3RGB A; 2X6B A; 4DV5 B; 4O2A A; 3CEI A; 2JJ2 G; 4L87 A; 1XMQ B; 1M90 W; 1YIT V; 5IJ9 B; 4IHJ B; 3U11 A; 3VQY A; 3SPH A; 1FYJ A; 4JAS A; 3JD0 A; 1IDS A; 4LFA B; 4NXM B; 4ZHQ B; 4DXW A; 4RAI A; 1JCH A; 4U3F H; 3ASN B; 3TJT A; 5D5Q A; 2ZIN A; 5L3C A; 1IBM B; 2YUA A; 1AR1 B; 1NI8 A; 5JCO A; 2V1D A; 4NB5 A; 1V55 C; 4DK0 A; 3CX5 F; 5K1P A; 3L72 H; 3B77 A; 1AP6 A; 1WPB A; 2P7T C; 3UO3 A; 4UVB A; 2QEX V; 1ENV A; 3ZHS A; 3JAT B; 4UUJ C; 2IH3 C; 4U7O A; 1Y76 A; 4JI5 O; 3PJS K; 5EC2 C; 5CB4 A; 2UXD O; 1FFX A; 2VRZ A; 3AG3 B; 1AI7 A; 4B3R O; 3HKB A; 4HZ3 A; 1KUQ A; 2DJV A; 4EKW A; 2H8P C; 4NR1 A; 3ETD A; 3JCU Z; 4X1K B; 5H6Q A; 3ZED A; 3UO2 A; 4LFB B; 1ZL8 A; 3KKY A; 2XOK G; 2JS3 A; 4IGG A; 5JWP A; 4LF7 O; 2ZIO A; 3VOU A; 2F95 B; 3ZBH A; 5LL6 Y; 3T1H O; 3A8T A; 5B1A B; 4GT1 A; 4I9W A; 1I7F A; 4PDV A; 4O4H B; 5CBG A; 4MVQ A; 3TGU H; 5KX5 B; 3SYP A; 2CGN A; 3K5O A; 4WBN A; 4GKK B; 2XAG A; 1O9H A; 5BR8 O; 4D7T A; 1P4R A; 1D5A A; 1I5Y A; 3OMN B; 2YIB D; 4OPA A; 1FJG O; 1DTO A; 3UT5 A; 3X2Q B; 4FZ0 A; 1Y4M A; 4UV9 A; 3SPC A; 1SKV A; 1Z2G A; 2Y4U A; 3BCC H; 4GCZ A; 2BSK A; 2ATK C; 1BGY H; 4IL6 Z; 2IBZ H; 4UFZ A; 4DRX B; 3N2G A; 1NZ6 A; 3SGI A; 1AI5 A; 3ETE A; 3HPL C; 2Q6A A; 1Q8I A; 1VF6 A; 5FNV B; 1OCO C; 1K8A W; 3ML0 A; 2UU9 B; 3EVK A; 4LF9 O; 2ITC C; 5FPR A; 2LW7 A; 1N36 O; 2D3O W; 4JYY A; 4I55 A; 4PA9 A; 5TIS Z; 1KD1 W; 3BAA A; 3HKE B; 2N74 A; 1T5E A; 3M7M X; 5AG2 A; 2WLL B; 1YJ9 V; 3QG5 A; 3TXQ A; 2P22 C; 1DLB A; 1EN5 A; 2QGN A; 3CWB H; 2A7W A; 4B3M O; 2KB1 A; 1WB7 A; 2QM8 A; 2RQ6 A; 1VQM V; 1W0K G; 1PV0 A; 2Q0O C; 2WAM A; 4WF9 V; 5H6R A; 2F4V B; 4ZKI A; 3WB1 A; 3BFR A; 4R50 A; 2NR5 A; 4QE7 A; 5JVD B; 4DV0 O; 1AP5 A; 3ZN0 A; 4AIL C; 3O9O A; 5IJ0 B; 1UPG A; 1B06 A; 2CE4 A; 3BA8 A; 1ORQ C; 1Y66 A; 4ZI7 B; 2OCC B; 1US6 A; 5L3D A; 4LF8 O; 2RCV A; 2Z3Y A; 2GDS A; 4OX9 O; 4LNU B; 1K5Q A; 5IWA O; 2VWK A; 2Y4T A; 1SQV H; 3QO5 A; 2UXC O; 2OWO A; 2ARH A; 3JD1 A; 3K04 A; 2RDC A; 4IIJ A; 3CCR V; 5KLV H; 1W59 A; 2Q0A A; 4FMT A; 1JJ2 U; 3L73 H; 1FAF A; 2A79 B; 1AB3 A; 3K5N A; 2ADQ B; 2OCC C; 3I56 V; 1CXZ B; 4TV8 B; 1N8R W; 3OTO B; 1QBZ A; 4JV5 O; 1D5N A; 4O4L A; 2BTQ A; 1G1X B; 5B3S C; 2AZ2 A; 3STZ C; 5H5N A; 2XT9 A; 1F4M A; 5DEC A; 4MTO A; 4TUY A; 5CA3 A; 2Q7G A; 2YEV A; 3B8M A; 4IYI A; 4P30 A; 2R72 A; 1M1K W; 4ZOL A; 2EIM C; 4LF5 O; 4DV4 B; 4E2L A; 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2ETN A; 3AK1 A; 3WB2 A; 4HBN A; 4WFG A; 3OE7 G; 1KBH A; 3UT5 B; 1BHA A; 2LW1 A; 4UCT A; 4YJ2 A; 3CSX A; 1N36 B; 2XAS A; 3FD9 A; 4FLU A; 2UUB O; 3IFX A; 2YXY A; 3N2G B; 4UB8 Z; 4KHP B; 4UCR A; 2EIN B; 4O2B A; 2QWQ B; 1GM9 A; 1YVW A; 4B3M B; 4N23 A; 3ABU A; 4I55 B; 1WNS A; 3FKS G; 4FFB B; 2BCC H; 2HJF C; 4G27 B; 4PV1 B; 3ZMU A; 1QU7 A; 5JH7 A; 4OXS A; 5FNV A; 3ZRX A; 3OM3 B; 2ZM6 O; 1YHQ V; 1PKX A; 4Z1M G; 2Q67 A; 3CB2 A; 1H2M A; 1VQP V; 3TXS A; 1XOU A; 3CCU V; 5J9P C; 3CCL V; 2R70 A; 1FXH A; 2WLL A; 4KP4 A; 3I55 V; 1VF6 C; 4JI6 O; 5CBF A; 2QA4 V; 1YJN V; 3HKD A; 3OR7 C; 3SYO A; 3JAW B; 3E8F A; 1NTM H; 1ZSP A; 3B8N A; 2QWN B; 3T2M A; 4JI8 B; 4UV8 A; 1IUR A; 1BSM A; 1S72 V; 1XMO O; 2HP8 A; 3S3W A; 4JF3 A; 5EIB C; 2CH7 A; 3AEI A; 4JYA O; 3ZMS A; 4PI0 A; 4PA7 A; 4TQF A; 5JVD A; 4I4T A; 3OW2 U; 1FXK A; 2H94 A; 3LNN A; 3ZMV A; 3UCS C; 1NU1 H; 4QPK A; 4DR6 B; 2PGG A; 4X62 B; 3KCY A; 4MW8 A; 4JZG A; 1Z5W A; 4IIJ B; 1MA1 A; 2AGA A; 4LNU A; 1PPJ H; 1AJQ A; 1G4Y B; 1NTZ H; 3L75 H; 4DK1 A; 1AI6 A; 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