The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
30
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sequence length |
76
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structure length |
64
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Chain Sequence |
NINKLKSSIESTNEAVVKLQETAEKTVYVLTALQDISSQISSMNQSLQQSKDYIKEAQKILDTV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Viral protein
|
| source organism |
Hendra virus
|
| publication title |
Crystal structures of Nipah and Hendra virus fusion core proteins
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Fusion glycoprotein F0,Fusion glycoprotein F0
|
| total genus |
30
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| structure length |
64
|
| sequence length |
76
|
| chains with identical sequence |
B, C
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-08-31 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | YojJ-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4NTY A; 4NYK A; 1WP7 A; 2L35 A; 4NTW A; 3N27 A; 4NTX A; 3IJ4 A; 1WP8 A; 2QTS A; 3S3X A; 2FB5 A; 4FZ1 A; 3S3W A; 4FZ0 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3O65 A; 2CH7 A; 3QO5 A; 4GYC B; 5JQG A; 5B3S C; 1KP2 A; 4B3M B; 3ZMV A; 3B4S A; 1Y4M A; 1W59 A; 2HP8 A; 1I7F A; 3HKC A; 1N4C A; 3M7M X; 2Y4T A; 1TVK A; 1CP9 A; 2XND G; 3K08 A; 3VQV A; 3CRA A; 1L1F A; 1Q6I A; 2QA4 V; 2Q7E A; 1M57 B; 2ZT9 B; 1U97 A; 3C3S A; 2HHH B; 1AP6 A; 2FML A; 4GX5 A; 4DUZ O; 3TCU A; 5B1O A; 3H1H H; 1SF9 A; 5LOV A; 4YIO A; 4PI2 A; 4B7K A; 2YDE A; 3A0H Z; 2AZ0 A; 2UUA O; 2ZE5 A; 3A8T A; 1JFF A; 5IWA B; 4DV4 O; 4EB6 A; 1B06 A; 4OXS A; 1NTM H; 4YY3 O; 3GWK C; 2XAS A; 5KHG A; 3ZRV A; 1S5H C; 4DRX B; 2ZQM A; 5C93 A; 2CAZ C; 3UKM A; 3JYC A; 1U96 A; 2UUA B; 4UVC A; 2Z0A A; 4MVS A; 3ZX6 A; 1H38 A; 1TA8 A; 4RO2 A; 4DV3 O; 2OCC B; 5JJE B; 4DV4 B; 1VQ4 V; 3CRC A; 3W7U A; 4MTO A; 2WWW A; 1LR1 A; 3OR7 C; 3JAL B; 1RM1 C; 2YXH A; 3CCR V; 1AJN A; 1ZUQ A; 3G4S V; 2KB1 A; 2D3O W; 1VQ9 V; 3B2E E; 1YJW V; 2Q69 A; 2QWQ B; 2JJ2 G; 1KKD A; 4R8C A; 4CZZ A; 1R6K A; 3GWO A; 3MAQ A; 5D5Q A; 1FXK C; 4P2Z A; 1DTO A; 2BOC C; 4TSF G; 1W0K G; 2W0F C; 4DV3 B; 5JH7 B; 1XI1 A; 4PA7 A; 1L0N H; 4J80 A; 5LXT B; 4YJ2 B; 2ZR3 A; 3P3P A; 3ABT A; 4BIZ A; 3OMN B; 2FL4 A; 3B8M A; 4H44 B; 2ADP A; 1VQL V; 3ZHT A; 3ASO C; 4LH6 A; 2QWN B; 5LP6 C; 1Q3E A; 4O2A A; 5C8Y A; 5IYZ A; 3CC2 V; 3RYH A; 4FZ1 A; 3JAT A; 1K4C C; 4TOI A; 2DYR C; 4LF9 O; 2X7R B; 1GK9 A; 3M99 B; 3VBB A; 4UVB A; 2HVK C; 3ZJZ A; 4PI0 A; 2VQF B; 3VOU A; 1OZ0 A; 3G71 V; 3ABU A; 2X6A A; 2PI4 A; 4K0K B; 3CXH F; 4B3T B; 3TXS A; 5H2F Z; 3ZHQ A; 1SQX H; 5B3S B; 1YJN V; 3CX5 F; 2UXX A; 1QNM A; 5LMU B; 4MVR A; 4QIW F; 2ZKO A; 2YC0 A; 3W7X A; 3UCS C; 3ZN1 A; 4J9Z B; 3ML0 A; 4YXW G; 4AIL C; 4LF9 B; 4KFM A; 3JAW A; 1NBM G; 3ETD A; 4IYI A; 4UCR A; 4CC5 A; 2Q73 A; 3CPW U; 1L0L H; 1QR8 A; 1YXB A; 2PI5 A; 4J7Z A; 1Y66 A; 1S5J A; 3AEI A; 1RFY A; 2YXY A; 5BZB A; 1NS1 A; 4NB5 A; 1SKV A; 4HBN A; 1HNX O; 2D2C B; 2YIB D; 4O4L B; 1JPX A; 2IH1 C; 2FKX A; 3A0B Z; 4XDJ A; 2QE7 G; 1ARO P; 3LUT B; 1AI7 A; 1FS0 G; 3RYF A; 3U0Z A; 4FPP A; 5KMG A; 1H2K A; 4Z1M G; 5LGT A; 3NXS A; 2RMK B; 4Q20 A; 1XDC A; 5JVD A; 1YZB A; 3BA9 A; 3BVO A; 2XAJ A; 4LFB O; 3OTF A; 4KHP O; 2LGQ A; 1XBL A; 2IJJ A; 3D3I A; 4TUY B; 3SYQ A; 5GTI Z; 4LF4 B; 1SER A; 1KU9 A; 5EK0 A; 4LBE C; 1HNX B; 2WLK A; 4DR6 O; 1IBM B; 4LC1 A; 2OTJ V; 2GDS A; 5LA6 B; 3SJQ C; 4EEQ A; 1KP3 A; 3JAS A; 2VWJ A; 4JV5 O; 1K7D A; 1RM1 B; 2Y0P A; 3BAA A; 3BPZ A; 5LYJ B; 2AHZ A; 4E4E A; 4DV1 B; 1RPO A; 4QPJ A; 3JD3 A; 3APO A; 5JCO C; 2E3C A; 1NVP B; 1TUB B; 4GKJ O; 1AB3 A; 1Q6U A; 5D5P A; 4JI3 B; 1LUW A; 2LQT A; 4JI7 O; 2JRI A; 1MMM A; 5IYC O; 1FXK B; 5IJ0 A; 1M90 W; 4DR6 B; 5A9G A; 1N36 O; 3FYI B; 4DV5 B; 1GAX A; 1I0H A; 4JI8 O; 1DLB A; 4O4H B; 4GT1 A; 4LP8 A; 2QKS A; 1ENV A; 1YVW A; 1ZLZ A; 2HJD A; 1XIL A; 1N32 O; 5KHK A; 3OT7 A; 1E1R G; 3SJA C; 4C7U A; 5LMN O; 3ASO B; 2IJH A; 4MVQ A; 4B08 A; 3RYC A; 5LP6 B; 4MSW C; 3C90 A; 5KX5 B; 2GV9 A; 1P7G A; 2UXC B; 1XRE A; 3JCU Z; 2HVJ C; 4WBN A; 4DUY O; 5K1X A; 2OYQ A; 3EHB B; 3VQW A; 5BR8 B; 3I56 V; 2Q0O C; 1BL8 A; 1WPB A; 3F7Y C; 4XDK A; 1P49 A; 3RN4 A; 1F23 A; 2OIE A; 5CBG A; 5H6Q A; 1OCC C; 2AZ2 A; 1QU7 A; 4J41 A; 5EBW C; 3SPI A; 1X59 A; 3K0D A; 4X65 O; 3ABL C; 1ZL8 B; 4JI6 B; 1N8R W; 1WNS A; 3B8N A; 1FKA O; 1J5E O; 3N27 A; 4DUY B; 3BHP A; 4DW0 A; 2R70 A; 4UB6 Z; 4JAS A; 2HR3 A; 3OGC C; 4O4J A; 3FB7 C; 4I50 A; 5E1A C; 1KYO F; 4DR3 O; 1AP5 A; 3FYE B; 4BAY A; 4FFK A; 2ZXW C; 1WB8 A; 2N74 A; 3RFR A; 3TJT A; 1WJZ A; 4JI1 O; 5L3F A; 4L87 A; 1NVP D; 2PGG A; 3H1K H; 2WLL A; 1Z2G A; 4LFA O; 4X1I B; 2GHY A; 1SES A; 2PYL A; 3CHX A; 4IIJ A; 2X6C A; 1F7Y A; 1XMO O; 4MTG A; 1RPR A; 1E79 G; 2UU9 B; 2DMX A; 2A06 H; 3ZMS A; 4RUF A; 3AG7 A; 1SA0 A; 1LNQ A; 2RQ6 A; 1XNR B; 1PL4 A; 2WLI B; 2P22 C; 3ETG A; 4LNU B; 4NYK A; 2NR5 A; 2P67 A; 3K03 A; 2DQ0 A; 4JI1 B; 3N2G A; 2UXN A; 2P4V A; 4LFA B; 2YEV B; 2UXB B; 5ITZ B; 4A5U B; 1AR4 A; 3LDD A; 2Q9L A; 4FIP C; 1M93 A; 1MZF A; 2Q8V A; 3AG1 C; 4X66 O; 2CE4 A; 1CXZ B; 4RAI A; 1IBK O; 1F4N A; 1VQN V; 4J11 A; 1S72 V; 4ZI7 B; 3FB5 C; 3ASN C; 2Y69 C; 2GUZ B; 3ZBH A; 4LF8 B; 2EIJ C; 1F4M A; 3AK1 A; 5CB4 A; 1OCZ C; 3STL C; 3SGI A; 3DXR A; 2QJ1 A; 5IJ9 B; 1B3Q A; 3CJH A; 1GKF A; 3KCX A; 5E79 Z; 4OX9 B; 1VQO V; 2KSD A; 2KQX A; 1SZT A; 2V7Q G; 1US6 A; 1JVM A; 1P4R A; 1V54 C; 4GCZ A; 4DK0 A; 2Y4U A; 3OAA G; 3K5L A; 3JD4 A; 3QVN A; 5BXZ A; 4P9O A; 3S3X A; 4OGQ B; 3RBZ A; 4DR5 O; 1QLE B; 4N23 A; 3D36 C; 1AI5 A; 1B6Q A; 3J81 N; 3OEE G; 2EUL A; 2UUC O; 1DF5 A; 4NVP A; 5K1P A; 4YHH O; 1M56 C; 2WPD G; 2ZIO A; 1SQF A; 3K59 A; 1XMQ O; 1WA8 B; 3K3W A; 1NH2 B; 4NXN O; 3CC4 V; 4L8J A; 1K3E A; 4MTF A; 2QGN A; 1S3J A; 4XBF A; 5HFL A; 2DN9 A; 2CK3 G; 2VRZ A; 4I55 B; 1M5I A; 1Q5O A; 3HKC B; 3LSQ A; 5AG2 A; 2P90 A; 4LF7 O; 3OMI B; 1TVK B; 2ZXW B; 3K79 A; 3K9A A; 3T4Z A; 3BCC H; 3ETQ A; 4RWU A; 3HR0 A; 5J2T A; 4NTX A; 4B3M O; 1E1Q G; 5J2U A; 1RSO A; 3H01 A; 3CCS V; 2BSK B; 4U3F H; 4MT8 A; 3H1I H; 2AXT Z; 1K33 A; 1N0N A; 1NKD A; 1S5L Z; 1R6N A; 2Z5U A; 3B09 A; 3CMA V; 2V4D A; 3ZRW A; 2HHH O; 4O4I B; 1Y67 A; 4X89 A; 5EYP B; 1QVF U; 1SQQ H; 4HNA B; 3OE7 G; 1AR1 B; 3E86 A; 2HFE C; 1Z5V A; 2X0L A; 4DXW A; 1EN6 A; 3L9D A; 4YJ3 B; 3CS5 A; 5KAF Z; 4AQY B; 2R9I A; 5H9C A; 2UUB O; 4DV7 B; 4TQD A; 4JI0 B; 3ABK C; 4X64 O; 2LFS A; 2JGD B; 3HKE A; 3G80 A; 4HAM A; 5IWA O; 2FTK A; 4FLT A; 3L73 H; 4LF5 B; 3OD4 A; 3AG1 B; 1FFX B; 2IM9 A; 1I94 O; 4WFB V; 2W6I G; 3SPH A; 4JZG A; 1Y76 B; 3JCZ A; 1O9G A; 1BHA A; 1VF7 A; 3ASN B; 2Y69 B; 1GN3 A; 2EIJ B; 3H1L H; 2FB5 A; 3E2E A; 2LFR A; 3JD2 A; 3HPL C; 2JEX A; 2UUB B; 1UJW B; 5GON A; 5CBH A; 4X64 B; 2XAQ A; 4MW3 A; 3TET A; 1NH2 D; 2DQ3 A; 2QM4 A; 5IY5 C; 1BZK A; 1G1X B; 4PV1 B; 2HG5 C; 1I94 B; 1AVM A; 3QO8 A; 3LDC A; 4X88 A; 1PV0 A; 1FYJ A; 3DC6 A; 3IC7 A; 1V54 B; 2E5L B; 1OCR C; 4YIP A; 2XAF A; 5EIB D; 1URF A; 3OW2 U; 1YCI A; 3L74 H; 2BTQ A; 1R3J C; 2YI8 A; 1H2N A; 1S77 D; 1AR5 A; 3O9O A; 1VF6 A; 4BIU A; 4TT3 G; 1DK1 A; 1FJG B; 3E89 A; 3K57 A; 2CUG A; 4I9Q A; 1GM7 A; 4WF9 V; 2QM7 A; 2ETN A; 3ZRX A; 2G38 A; 2WLM A; 3Q4H B; 4B3S B; 4H13 B; 1K73 W; 2QM8 A; 2C2A A; 3OUF A; 2IU0 A; 2VQE B; 4I4T B; 4DW1 A; 1K8A W; 1FAF A; 4LWS B; 3KCY A; 1JOY A; 3RWR D; 3WB1 A; 2Q0A A; 5TIS Z; 1AJQ A; 2EIK C; 1EZJ A; 4RQF A; 2ZCE A; 2ZE8 A; 2VQF O; 3K58 A; 1YJ9 V; 2W0X A; 4UFZ A; 4D7T A; 4K0K O; 3FX7 A; 3J80 N; 1WP8 A; 5DED A; 3RYI A; 1XHZ A; 4B3T O; 2KG7 A; 1COW G; 5CA0 B; 2EIL C; 2ZNJ A; 5LMU O; 5EBM C; 3ZED A; 4JTA B; 2ZM6 B; 1H2G A; 1IVS A; 1VAR A; 3CE2 A; 4JPR A; 2KKW A; 3DC5 A; 3S3W A; 1AJP A; 1NT2 B; 2ZDI A; 4I0X B; 3G6E V; 2WLH A; 4X8A A; 1GN2 A; 2BTO A; 1G4Y B; 2EIM C; 2EJR A; 4JI4 B; 3SDL A; 1O9H A; 2YIB A; 2CDY A; 3JAL A; 1YI2 V; 4MS2 A; 3CXC U; 2RNB A; 3UO3 A; 5IE9 A; 1SC5 B; 4PDR A; 5GTH Z; 1ZX3 A; 4FVM A; 3UO2 A; 3ZHU A; 1ORQ C; 3CCM V; 4IGG A; 4FFB B; 3A2F A; 4J7J A; 2Q6A A; 1THZ A; 5KHI A; 3ZHS A; 3GB7 C; 4DK1 A; 3QG5 A; 2QWR B; 2F66 C; 2XOK G; 1V55 C; 3SJC C; 2BE3 A; 4XDL A; 1FD9 A; 5JH7 A; 1VQ7 V; 2MW2 B; 3CSX A; 4P9P A; 3ZS8 C; 1WLE A; 4LF4 O; 2F93 B; 4UCT A; 3CME V; 5LXT A; 4YJ2 A; 4U3J B; 1KB9 F; 5B1B C; 3RW0 A; 3ZIA G; 1IBM O; 4IL6 Z; 1EM1 A; 1WN7 A; 1EFR G; 4KXR A; 4JYY A; 2Q67 A; 3ZRS A; 5IY5 B; 3BFR A; 2RDC A; 4LCU C; 3SPG A; 4DV1 O; 4X1K B; 4DR7 B; 1VQM V; 4ZHQ A; 2B5U A; 5CMU A; 3TXQ A; 4TV8 A; 4FMT A; 1KC8 W; 4JI3 O; 2AHY A; 1OCR B; 3HKB B; 1Z5W A; 3WFV A; 2ZIN A; 4UCS A; 5CA1 B; 1QCE A; 3E8H A; 2WSS G; 5KLV H; 4DV5 O; 4F6R A; 4BW9 A; 4NTY A; 1XNQ B; 2ZNI A; 4J9Y B; 3SPC A; 3W7T A; 3X2Q C; 1VQ6 V; 2YUA A; 1YDX A; 4TV9 B; 1W0J G; 3FAV B; 4FM1 A; 3F5W C; 5FLX N; 4CC6 A; 4FLZ A; 4UCO A; 3AG3 C; 3JSN A; 3JD0 A; 2YIA A; 2YIC A; 3ZHV A; 5CBF A; 1KMI Z; 2UXC O; 5LHI A; 4U7N A; 2GTA A; 4IYH A; 3CD6 V; 3DTU B; 5BY1 A; 1SQP H; 3JAK B; 4O4L A; 4NXM B; 3ETE A; 5BR8 O; 5L3C A; 1YIJ V; 4WFA V; 3CCV V; 3FFQ A; 4O2B B; 2DYS C; 1IZ3 A; 2NNU A; 4HZ3 A; 3T1C A; 2E74 B; 4GUN A; 2F4V O; 1WPX A; 2EIL B; 2JJ1 G; 2OCH A; 3MHS C; 3DSQ A; 4UVA A; 3AG2 C; 1IBL B; 5EZY B; 1SS3 A; 4JI6 O; 2CGN A; 4JGS A; 4JI2 B; 2DE0 X; 4QE7 A; 2DYR B; 1MA1 A; 3OR6 C; 4GKK B; 3CCQ V; 2Z3Y A; 4QPK A; 4AI8 A; 2P4K A; 3OTO B; 2CTP A; 4FLW A; 3R65 A; 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3SPJ A; 3SR2 C; 4ZIB A; 5H5N A; 4DR2 B; 4EFB A; 4DR4 B; 2YXL A; 1Y74 A; 3CCE V; 4H0L B; 3HKD A; 5GW7 A; 1I08 A; 1T5E A; 4NR1 A; 4LFC O; 2JEU A; 1MOF A; 1P84 F; 4X1I A; 4JI5 B; 4GX0 A; 1Q81 W; 1QHT A; 3L71 H; 2WLJ A; 1JCH A; 1EZV H; 1HNW B; 3TGU H; 4UUJ C; 2ARH A; 2MK3 A; 1D5N A; 2WLI A; 1KEC A; 4P30 A; 1LUV A; 3T1Y B; 4BR6 A; 1OJH A; 2EIN C; 4LFC B; 4G28 B; 1Q6H A; 4CBC A; 2YEV A; 2Q68 A; 1OCC B; 3JAR B; 5ITZ A; 1BGY H; 4DO2 A; 5L3D A; 1EN5 A; 1YF2 A; 3ABL B; 2IBZ H; 5JCO A; 3E22 A; 1GRJ A; 4MVZ A; 3CYO A; 3CEI A; 3KKY A; 2CH7 B; 1SZX A; 5JQG B; 4X62 O; 3SJB C; 4ZOL A; 1S76 D; 1I5Y A; 2NN4 A; 1XL4 A; 3R66 A; 4B3R B; 2GUZ A; 3K0G A; 3OGI B; 1M9N A; 1HNZ B; 2A0L A; 5CN0 A; 4GX1 A; 2M6Y A; 3K9S A; 1GH6 A; 2OTL V; 5IJ9 A; 2A79 B; 2X6B A; 2JK5 C; 3U11 A; 3WU2 Z; 1YTF B; 3ZCC A; 4PD4 F; 2CTQ A; 4CS2 A; 1NR7 A; 1KQS U; 2ILM A; 1SQB H; 3K06 A; 3K5N A; 4LF6 O; 4X62 B; 3RVY A; 1GMG A; 4AQY O; 5LOV B; 1VMG A; 2B1I A; 4DV7 O; 4X1Y A; 5L3E A; 5LHG A; 1NU1 H; 4JI0 O; 3A0R A; 2B9Z A; 1JFF B; 4LF5 O; 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