The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
24
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sequence length |
80
|
structure length |
80
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Chain Sequence |
GNGSTITFDELQGLVNSTVTQAILFGVRSGAAALTLIVVWITSRSRKTPIFIINQVSLFLIILHSALYFKYLLSNYSSVT
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Membrane protein
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| publication title |
Structure of a double transmembrane fragment of a G-protein-coupled receptor in micelles.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Pheromone alpha factor receptor
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| total genus |
24
|
| structure length |
80
|
| sequence length |
80
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-10-21 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Pheromone alpha factor receptor. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2K9P A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3HKB B; 3EFF K; 2JGD B; 4TV8 A; 5L3C A; 2F4V O; 1BGY H; 4N21 A; 4O4I B; 2Q68 A; 2Z0A A; 3CCJ V; 5KX5 A; 3X2Q C; 4FFB A; 4HNA A; 3HKD B; 3RYC B; 1IBK B; 1AP6 A; 2OIG A; 3JYC A; 3E83 A; 3DC5 A; 3JAS A; 3K04 A; 5CB4 B; 5H6R A; 1IZ3 A; 2L35 A; 2LP7 A; 1XMQ O; 3OTO B; 1QCE A; 2FB5 A; 3E22 A; 2IM9 A; 1K8A W; 2ZE7 A; 2HP8 A; 1TUB B; 2WLI B; 4KHP B; 2Q7G A; 4ZBM A; 4JPR A; 3HKE A; 1L8D A; 1NT2 B; 4BW9 A; 4X62 O; 3CXC U; 1YTF D; 2Q67 A; 2ZIN A; 2A79 B; 1K33 A; 1NH2 B; 3O65 A; 2X6A A; 2ADQ B; 4JI1 O; 3L72 H; 4J9Z B; 3B8N A; 1AVM A; 1HNZ O; 5IY5 B; 3N27 A; 4IYI A; 4LF4 O; 3QTC A; 4DR2 B; 4OPH A; 1K73 W; 1KEC A; 3K79 A; 3K0G A; 1MAB G; 4YXW G; 4FLT A; 4LF7 O; 2R72 A; 4MVZ A; 1THZ A; 5BZB A; 1KMI Z; 4LWS A; 1S77 D; 1M56 C; 1S0V A; 5EIB C; 1IBM B; 4PDV A; 2V7Q G; 5JQG B; 4W4K A; 4JI4 B; 2W6I G; 4FLV A; 1EM1 A; 3CE2 A; 1XEQ A; 3DTU B; 5KHH A; 4JI0 B; 4DR1 B; 1Z2G A; 2WA4 A; 1BHA A; 1WPB A; 3TXQ A; 1I08 A; 4LF6 O; 3ABK B; 4GKJ B; 2UUC B; 5B1A B; 2OIE A; 5EIB D; 3A0B Z; 2UUA B; 1XDC A; 1N36 B; 3T1H B; 1R3J C; 1V54 B; 1R6K A; 5EZY B; 1PPJ H; 3OT7 A; 1DF4 A; 3GWO A; 2XAS A; 1BQZ A; 1QHT A; 4DV0 B; 2FL4 A; 1P84 F; 4NXN B; 4NXM O; 4X66 O; 1SET A; 2ZIM A; 1K5S A; 2QJ1 A; 4EKW A; 2Q0O C; 5BMV A; 3VQX A; 5IT9 N; 2ZNI A; 4WFA V; 3CP1 A; 1XI1 A; 3CC2 V; 1GK9 A; 1M9N A; 1YJN V; 1K3E A; 3FB6 C; 3R65 A; 4LF5 B; 4I50 B; 5JJE B; 3L74 H; 1BL8 A; 3S3X A; 3VBB A; 1NR7 A; 4CH5 A; 3B4S A; 3JAT A; 4U3J B; 1HR0 O; 2DE0 X; 2PGG A; 1OCR B; 4U3F H; 2PY5 A; 3D3Q A; 1MOF A; 2Q6A A; 1ZL8 A; 1RPO A; 3ZMT A; 1SA0 B; 4EFE A; 1O9H A; 5IE9 A; 5LMN B; 3IAY A; 5IWA O; 5LGT A; 4PA9 A; 4TV8 B; 2AHY A; 3D8C A; 1N8R W; 3UM7 A; 4CC5 A; 1N33 B; 4BIO A; 4JYB A; 1KBH A; 1VP7 A; 5ITZ B; 4JTC B; 4BIU A; 5KX5 B; 4HNA B; 4XBF A; 1DTO A; 2F23 A; 2JJ1 G; 1Y76 B; 5GW7 A; 5K1X A; 2VRZ A; 4QE9 A; 3IGA C; 1A32 A; 3JAS B; 4LCU C; 1QLN A; 4X1K A; 4X1Y A; 4FJC C; 4B3T B; 1XL6 A; 3WG7 B; 3SDL A; 4YJ2 A; 1YJ9 V; 4IIJ A; 2F66 C; 3G6B A; 3E8B A; 1EZV H; 1P7G A; 3ETE A; 2Y0I A; 4UVB A; 4JI8 O; 3E22 B; 1FYJ A; 2MW2 B; 2P5O A; 3ZBH A; 3HKE B; 4JI3 B; 2N05 A; 3QVN A; 2DQ3 A; 1F4N A; 4YIP A; 5EC2 C; 2A0L A; 4OPA A; 2HJF C; 2CTR A; 4P2Z A; 4GUN A; 1GRJ A; 4P30 A; 1NVP B; 3GVM A; 5JCO A; 3KZI Z; 5KLV H; 5DEC A; 5LBQ A; 4Q20 A; 4PHZ A; 3WB0 A; 5CA3 A; 1Q6H A; 3ZHV A; 2QM4 A; 4BR6 A; 5KA6 A; 4FLU A; 4J10 A; 5LMU O; 3OEH G; 1FKA O; 2L6L A; 2IJK A; 4UCT A; 2LO1 A; 3UCS C; 5KMG B; 2JGU A; 1K92 A; 3CCS V; 1I5Y A; 2QDO A; 5B5E Z; 2PUS A; 4BIZ A; 4UFZ A; 2JIZ G; 4W4L A; 2PI4 A; 3FYI B; 1XMQ B; 1RP3 B; 2F1M A; 1BZK A; 3OTF A; 4RQE A; 2ZQM A; 4I4T A; 2V4D A; 2Z3Y A; 2X6B A; 2F93 B; 3C3S A; 1WLE A; 4B3M B; 3HKC A; 2QKS A; 3ZRW A; 3ZED A; 2CTP A; 2VWK A; 3LSS A; 4C7U A; 1AIL A; 4LR3 A; 1QQC A; 4MTF A; 4J80 A; 4HYO A; 1X59 A; 3PN1 A; 5IYB O; 3UO2 A; 2X6C A; 1GM7 A; 4IGG A; 1CP9 A; 4X64 O; 5B3S C; 5D5Q A; 3K08 A; 2CTW A; 2QWR B; 1DLB A; 5J2T A; 1HP8 A; 4TV9 A; 3RYH A; 3BHP A; 1JJO A; 1O9G A; 2H3O A; 5EC1 C; 3ABL C; 2QTS A; 2OWO A; 1V55 B; 1ZUQ A; 1SQF A; 2ETN A; 1IBK O; 3SYP A; 3H01 A; 2EIJ C; 4CBC A; 3RBZ A; 5IYD O; 5E79 Z; 5JJN B; 3ZJZ A; 4OXS A; 3U11 A; 3K5L A; 4MSW C; 1HW7 A; 4X9Q A; 5CA1 B; 3OTO O; 5C93 A; 3SPC A; 3F5W C; 1ZL8 B; 4E4E A; 1D5N A; 4KHP O; 5GTI Z; 4JZ2 A; 3E8H A; 3KKY A; 5EYP A; 2EIL C; 4LF6 B; 3K5M A; 3ZIA G; 1XNQ B; 3HB3 B; 5LP6 A; 4TWK A; 4GLX A; 2WAM A; 5FNV A; 3AG3 C; 1R3I C; 4BW5 A; 3UQ8 A; 2CUG A; 2VWJ A; 3STL C; 1NTZ H; 2ZR2 A; 4FK5 C; 2GDS A; 1XMO B; 1GAX A; 4X1K B; 1UPG A; 3W7U A; 4DR2 O; 1Q8I A; 3FYE B; 4IIJ B; 4EB6 A; 3ABU A; 1QNM A; 3SYO A; 3P3N A; 2YC0 A; 1W59 A; 5JH7 A; 3QG5 A; 4R7C A; 3U10 A; 4DR3 B; 4FFK A; 3K5O A; 2QWP B; 3W7S A; 1FAF A; 4FM1 A; 2K9P A; 3FD9 A; 3PJS K; 5GON B; 1XQ8 A; 2YUA A; 2XHB A; 2R9R B; 2EIM C; 1IBM O; 3D36 A; 1TUE B; 4X1I A; 4TSF G; 5IWA B; 1ARO P; 1N0J A; 2H8P C; 2ZCE A; 1PM9 A; 4JI0 O; 1M93 A; 1KB9 F; 4DR1 O; 2Q7H A; 2G38 A; 4GKJ O; 4MTG A; 5HFM A; 2UUC O; 4R50 A; 3ZHQ A; 1LUW A; 2P6J A; 2UUA O; 3QO7 A; 3JAM N; 3T1H O; 5D5P A; 2BE3 A; 3K06 A; 1T5E A; 1R3K C; 1KKC A; 3BFR A; 3CHX A; 3M99 B; 4DV0 O; 2ITC C; 3ZMU A; 1GM8 A; 4NXN O; 4J7Z A; 5KAF Z; 3QO5 A; 4QE7 A; 4JI8 B; 4ZHQ A; 1G6U A; 3WB2 A; 2DN9 A; 3HKC B; 2PZS A; 3CC4 V; 2ATK C; 2JK5 C; 4MW8 A; 4I5S A; 1Q7Y W; 4NB5 A; 4UCU A; 2C2A A; 4I55 A; 2HR3 A; 3ASO B; 4I0X B; 2W0X A; 3FAV A; 2D2C B; 4JI2 B; 1IXM A; 3A8T A; 5J2T B; 5LMN O; 4JAV A; 3C3T A; 5JJJ B; 4O4H A; 4TV9 B; 3RYH B; 1US6 A; 1MA1 A; 2Q69 A; 3AG2 B; 4LF9 O; 1OCC B; 5EBM C; 1NTM H; 1N33 O; 2WWW A; 4NTW A; 4LFA B; 2ZIO A; 2ODM A; 1XL4 A; 2KKW A; 4O2A A; 2DYR C; 5K1P A; 3SYC A; 4AIL C; 2IH1 C; 4CS2 A; 4FLY A; 4B3T O; 5LYJ A; 4JV5 B; 4YY3 B; 2LGQ A; 5CBG A; 5C8Y A; 5LGU A; 1W2B U; 2ZDI A; 5IY5 C; 4KP4 A; 3OEE G; 4EEQ A; 3ETG A; 2YID A; 1DK1 A; 4FM2 A; 1TGO A; 4U7N A; 3CCU V; 2XAH A; 3ZS8 C; 4JI3 O; 5KHJ A; 1WPX A; 2PYJ A; 2ZE8 A; 1NH2 D; 2GV9 A; 4TT3 G; 5EBL C; 1VQP V; 5LP6 B; 3RW0 A; 4JAU A; 5FNV B; 1NU1 H; 1VQK V; 1M4U A; 1Q90 D; 1VQ9 V; 3JD0 A; 3H1K H; 3H1L H; 4JTD B; 3CMA V; 4LC1 A; 1MSW D; 4BWA A; 3ZMS A; 3K59 A; 4BAY A; 4JGS A; 2R9A A; 4I7Z B; 2Z5U A; 4GX0 A; 1K9M W; 1VF6 C; 1B3Q A; 3ABK C; 4EB6 B; 1BMF G; 3OMN B; 3CRM A; 5B1A C; 3ZMZ A; 3F5T A; 4JTA B; 1IBL B; 5JH7 B; 4LFC B; 1FXK B; 1FFX B; 2QWO B; 4UCV A; 1ORQ C; 1FS0 G; 3AG4 C; 4R6Z A; 1XHX A; 3CCM V; 4AQY O; 4FLX A; 1V54 C; 2PF4 E; 3SYA A; 1RM1 B; 2QA4 V; 3B8M A; 2VQE B; 2UU9 B; 3I5D A; 3BY6 A; 3DXR A; 4B3M O; 2IW5 A; 4X1I B; 1GN2 A; 3LSQ A; 4CZZ A; 3ZHT A; 3CEI A; 1QLE B; 2ZE5 A; 1LR1 A; 2ZT9 B; 1Q6U A; 1EN4 A; 4GKK O; 3E2E A; 4H13 B; 4IHJ A; 1OV9 A; 1OCO B; 4MVU A; 1Q81 W; 2AHZ A; 3A0H Z; 2V1D A; 4FM0 A; 4CH4 A; 4WCE V; 4MW3 A; 1YIJ V; 4DW0 A; 1OCR C; 3P32 A; 2BOB C; 2HEP A; 1AB3 A; 1DGS A; 5IJ9 B; 2A06 H; 2BTO A; 5LXT B; 3GWK C; 2RCV A; 3ZN0 A; 5CBF A; 4FLW A; 5IJ0 A; 2CGN A; 4K8X A; 5A9G A; 2RQ6 A; 4GCZ A; 1OJH A; 4ZHQ B; 2QSA A; 1GN3 A; 4LNU B; 1RFY A; 2M7W A; 4CS4 A; 2YXL A; 1Z5W A; 4DV1 B; 2UXD B; 4LH6 A; 3FAV B; 4JAS A; 4ZOL A; 3N2K A; 4P9P A; 1TA8 A; 2WLK A; 3CB2 A; 2EIN C; 4O4H B; 3L71 H; 5DM6 V; 5CN0 A; 1XNQ O; 3CC7 V; 2EX3 A; 2OCC C; 1ZAU A; 1YJW V; 1QU7 A; 3JD2 A; 1I0H A; 2FYU H; 3ZRV A; 1WA8 A; 2GHY A; 3X2Q B; 3M8A A; 3ZRX A; 1XMO O; 4O2A B; 3B2E E; 2P06 A; 4DR5 B; 3OW2 U; 2XND G; 4TUY A; 3GB7 C; 1PKX A; 5A2Q N; 1J95 A; 3J80 N; 5KUK A; 1H2K A; 4Q6G A; 2A7W A; 5C8Y B; 1JCH A; 4FMT A; 5KHG A; 2ZM6 B; 1I94 B; 2DWD C; 3K3W A; 1Y74 A; 3RGB A; 1GO3 F; 2GTS A; 4DRX A; 2E5L B; 3EVK A; 4DR3 O; 3CCL V; 1NVP D; 1R1B A; 3RYI A; 3AK1 A; 2OTL V; 2DYS B; 2NR5 A; 4DR6 B; 1E79 G; 3RVY A; 1HWY A; 1VQ8 V; 1PNK A; 1K5Q A; 1VMG A; 2WLH A; 3AG1 C; 4B3S B; 3L75 H; 4QIW F; 4LF9 B; 3RYF A; 1SER A; 3HPL C; 1G1X B; 2IU3 A; 2WLL A; 1BS3 A; 4I9Q A; 4D7T A; 4UCS A; 2DJV A; 3ZX6 A; 2IJI A; 2BTQ A; 3WU2 Z; 4FFB B; 4X20 A; 1B6Q A; 2BSK A; 5B1O A; 2EJR A; 3G4S V; 2AW9 A; 2LQT A; 2JEX A; 1WP7 A; 1I7F A; 2IJJ A; 1R3L C; 3CX5 F; 3BCC H; 2W0F C; 2P4V A; 3OGI B; 3ABT A; 3SPG A; 2QR4 A; 1MZE A; 4UCO A; 3OM3 B; 4PI0 A; 1YDX A; 3E8F A; 2WLJ A; 3J7A U; 3OE7 G; 4UV9 A; 3N2G A; 5J2U A; 3DXR B; 4JAA A; 4L87 A; 1YCI A; 3BA9 A; 1YI2 V; 3JAL A; 3SJA C; 1V55 C; 2H94 A; 4X65 B; 1YHQ V; 1KUQ A; 2M6Y A; 4IHJ B; 3APQ A; 2ZNJ A; 3Q4H A; 1R6T A; 2KSD A; 2GUZ A; 1X4T A; 2E76 B; 3L73 H; 4NR1 A; 1M1K W; 2PTM A; 1RPR A; 1KU9 A; 1WN7 A; 4RQF A; 2KG7 A; 4YIO A; 4JI2 O; 2OT5 A; 4LH7 A; 3THO A; 4O2B A; 1WB8 A; 4X89 A; 1VQ5 V; 1HNW B; 4UUJ C; 1R6N A; 4LFA O; 3LNN A; 4QJF B; 1NTK H; 1BE3 H; 2Y48 A; 3QO8 A; 1EZJ A; 4AQY B; 1PNL A; 1NKD A; 4LWS B; 5LOV A; 3TJT A; 1YSC A; 3A0R A; 1Z5V A; 2HJD A; 1Q86 W; 4JV5 O; 4YY3 O; 1NZ6 A; 3OD4 A; 2LFS A; 3W7W A; 2UXN A; 3G71 V; 4QGP A; 3VQW A; 4PV1 B; 3HR0 A; 3JAR A; 4ZOL B; 4PI2 A; 3N2K B; 1XUQ A; 3RFR A; 4GKK B; 1L0L H; 2RJZ A; 4LF8 B; 3K57 A; 4Z1V A; 1CXZ B; 1VEW A; 2R70 A; 2X0L A; 3IFX A; 1JPX A; 4PA3 A; 3OR6 C; 1WP8 A; 1G8M A; 4P9O A; 3STZ C; 4ZI7 A; 3H1J H; 1MNG A; 1KP2 A; 2W6J G; 3ZHS A; 4TUY B; 1JQ0 A; 1H2M A; 5BMV B; 2QM7 A; 2FML A; 3ETD A; 2YIB D; 4GT1 A; 5IYZ A; 1ROP A; 4MVR A; 4K0K B; 2LJ2 A; 3UT5 A; 4MTO A; 4OX9 B; 3B77 A; 4O4J A; 1IBL O; 4LFC O; 1Y74 B; 2DQ0 A; 2LGW A; 4DRX B; 1BCC H; 3JAT B; 1QVG U; 1B06 A; 2XUM A; 4FZ1 A; 2CAZ C; 1P49 A; 4JYA B; 3IC7 A; 3JD4 A; 1MZF A; 1VIB A; 1GM9 A; 1AR4 A; 2VQE O; 2UU9 O; 1PL0 A; 3OR7 C; 3KCY A; 1U97 A; 3RN4 A; 3TXS A; 2XT9 A; 2IH3 C; 4CS3 A; 3K9A A; 1Y67 A; 1JFF A; 4QNH B; 3RYF B; 1VQN V; 4F6R A; 1NQT A; 5L3E A; 2Q73 A; 1E1Q G; 5AG2 A; 3ETQ A; 1JX9 A; 3EHB B; 2WLL B; 4DO2 A; 5LL6 Y; 3A2F A; 4G28 B; 4IL6 Z; 2JS5 A; 4MVS A; 2BSK B; 1VQ6 V; 1PV0 A; 1L1F A; 3ASO C; 2UXC O; 1M5I A; 3QNE A; 1M57 C; 4HZ3 A; 2UXB B; 3E89 A; 1N32 B; 3VQY A; 3G67 A; 4X1Y B; 2OTJ V; 4PEL A; 1BQ0 A; 2A3Q A; 1KP3 A; 1P7B A; 1SC5 B; 4H0L B; 2RMK B; 3JD3 A; 4YJ2 B; 3T1C A; 3K58 A; 4DUZ B; 3DC6 A; 1OCZ C; 5BY1 A; 1L0N H; 3N2G B; 5J2U B; 1OCC C; 2EZP A; 1GKF A; 1F7Y A; 4QPJ A; 4O4I A; 3APO A; 1N0N A; 3DSQ A; 4DV1 O; 2UXD O; 3Q4H B; 2GUZ B; 1URF A; 4UB6 Z; 5BR8 B; 4NTY A; 1VQM V; 1XNR O; 4YHH B; 3BPZ A; 4TOI A; 3MD0 A; 4DUY B; 4H37 A; 4O2B B; 1Y4M A; 2E75 B; 2ZXW C; 4PA4 A; 4WF9 V; 5LGN A; 1Y66 A; 2HKO A; 1K7D A; 5LP6 C; 4K35 A; 1HNX B; 4DR5 O; 4HBN A; 1JMK C; 4I4T B; 2EIJ B; 1HDJ A; 5KUM A; 1BHB A; 1SQQ H; 4X8A A; 5H5N A; 4LFB B; 2YSU B; 2ILM A; 2ZM6 O; 3ZRW B; 3G6E V; 1EBO A; 4WFG A; 1JJ2 U; 1I94 O; 2JJ2 G; 3CME V; 1NBM G; 4MVO A; 4UVC A; 3QF7 A; 2LW7 A; 5IDJ A; 4KFM A; 4K3A A; 1KYO F; 2E5L O; 1Q3E A; 3RVZ A; 1CEZ A; 1FXK C; 3H1H H; 4DR6 O; 3WB1 A; 5E1A C; 3BEH A; 3ASN B; 2ZR3 A; 1RM1 C; 2XAQ A; 1WJZ A; 3FFQ A; 3MAQ A; 3AG3 B; 4B3S O; 4ZI7 B; 4Z2W A; 4N23 A; 3ZN1 A; 1QLE C; 4JYY A; 4FZ0 A; 5JQG A; 1M90 W; 1ZLZ A; 4JI7 B; 4GX5 A; 2RDC A; 3CPW U; 5IYZ B; 2XAG A; 4WFB V; 1I5X A; 3UT5 B; 4HAM A; 4DV6 B; 1VF6 A; 3CCE V; 4LBE C; 3LDD A; 1D2D A; 3ZHR A; 1SRY A; 4L8J A; 5H9C A; 2ZE6 A; 3JAK A; 4AI8 A; 4MTX A; 1KQS U; 4PD4 F; 1FXV A; 1PP9 H; 1MSD A; 1FFT B; 5EYP B; 3F7Y C; 3T1Y O; 4X65 O; 5FLX N; 2DOS A; 5EBW C; 3I56 V; 4FVM A; 1JR9 A; 5CMU A; 4DV4 O; 1YIT V; 3OAA G; 2VQF B; 4DR4 B; 1VQL V; 2EIK B; 1W0K G; 4XDJ A; 4FIP C; 1N4C A; 2JDI G; 3B40 A; 3E35 A; 1GTO A; 4U3J A; 1FPO A; 3SGI A; 2HLD G; 3G80 A; 4H33 A; 3ABM B; 2Y4U A; 3I55 V; 1VF5 B; 2WSS G; 5IYC O; 1QR9 A; 2JRI A; 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