The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
24
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sequence length |
80
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structure length |
80
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Chain Sequence |
GNGSTITFDELQGLVNSTVTQAILFGVRSGAAALTLIVVWITSRSRKTPIFIINQVSLFLIILHSALYFKYLLSNYSSVT
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Pheromone alpha factor receptor
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| publication title |
Structure of a double transmembrane fragment of a G-protein-coupled receptor in micelles.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| molecule tags |
Membrane protein
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| total genus |
24
|
| structure length |
80
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| sequence length |
80
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-10-21 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Pheromone alpha factor receptor. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2K9P A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4BW9 A; 2P90 A; 4H37 A; 4R7C A; 1GM8 A; 3RBZ A; 4MTO A; 3STZ C; 2HR3 A; 2YID A; 1FXK A; 1DF4 A; 1ZL8 B; 3WB0 A; 4R6Z A; 4UVA A; 3CE2 A; 1BGY H; 5FL7 G; 4GZR B; 5CA3 A; 4IHJ B; 1MZE A; 1WB7 A; 1O9H A; 2DQ3 A; 5EIB D; 3RW0 A; 2BTQ A; 1IVS A; 1N33 O; 1IBK O; 3A8T A; 1VQ7 V; 4DRX A; 4X8A A; 3QNE A; 3TXS A; 4MVQ A; 3Q4H B; 1EM1 A; 2YXH A; 5CA1 A; 3CCE V; 1SQF A; 1WB8 A; 1PL0 A; 4KFM A; 2PI4 A; 5CB4 B; 3RVY A; 1K3E A; 2UUB B; 3LSS A; 3BAA A; 2X6A A; 4I55 A; 1HNZ O; 3AG2 C; 4X65 O; 1N4C A; 2WSS G; 3ZS8 C; 4DR5 B; 1FFX A; 4PA4 A; 4J7Z A; 5B1N A; 3ASN B; 3T4Z A; 1H2G A; 3E8H A; 1WNS A; 5B1B B; 2IH3 C; 3BA9 A; 3BFR A; 4DV3 O; 2LP7 A; 3ABL C; 1BT8 A; 1NVP B; 4O4J B; 1ZLZ A; 2X7R B; 1XHX A; 1Q7Y W; 2QM7 A; 2WLH A; 5GON A; 3SJB C; 2ILM A; 4MVZ A; 1S76 D; 4DV4 B; 2EIJ B; 4UCS A; 2UXD O; 3QTC A; 5EYP B; 2CGN A; 4WBN B; 4F4L A; 1EN5 A; 1RM1 C; 3ZMV A; 1DK1 A; 1MAB G; 1TA8 A; 3E35 A; 4FPP A; 5J2U A; 4JI5 O; 3ZN0 A; 4ASU G; 2Q68 A; 3H1J H; 3PJS K; 4PDR A; 1IXM A; 5BXZ A; 5L3E A; 1GN4 A; 2EIK B; 4LWS B; 1VMG A; 2B9Z A; 1NT2 B; 1OCR B; 4O2A B; 1YF2 A; 3I56 V; 1OCC B; 4I50 A; 5CA0 A; 4X1Y A; 2E75 B; 3CC7 V; 3J80 N; 2ODM A; 4U3J B; 1LUV A; 1N36 B; 1FJG B; 1GTO A; 1Z2G A; 2FKX A; 2JDI G; 2G38 A; 1L1F A; 1ZAU A; 3DTU B; 1AJP A; 4ZBM A; 4DV1 O; 4I0X B; 2X6C A; 5KX5 B; 1TUB B; 2ARH A; 4JI8 O; 4JYB A; 4DR3 B; 3ZRW B; 4DUZ O; 4K0K O; 1WN7 A; 5EBW C; 5LGT A; 4QGP A; 1S77 D; 3SPJ A; 5JJJ B; 2RMK B; 3ZHU A; 1GAX A; 1JMK C; 5LMU B; 2OIE A; 4AIL C; 1VQL V; 1KP3 A; 4MVO A; 3B40 A; 5L3D A; 2R9R B; 4XDK A; 3JD0 A; 1F4N A; 1US6 A; 1XI1 A; 1H38 A; 4DV5 O; 4GX5 A; 3HKB B; 3OEH G; 4EKW A; 1XL6 A; 3ZMS A; 4X64 O; 5BMV A; 5KMG A; 3HPL C; 2X6B A; 3TET A; 2OIG A; 2ZE7 A; 1WA8 A; 2JGD B; 4HNA A; 1XMO B; 4LF6 O; 4NXM O; 4YJ3 B; 4O4I B; 3K57 A; 4XDL A; 2ETN A; 3E8G A; 1JX9 A; 4D6T H; 2Y0I A; 3UT5 A; 5KHI A; 3FB6 C; 1JVM A; 2ZXW B; 2DQ0 A; 1KEC A; 4D7T A; 3D36 C; 5DED A; 4I9Q A; 4HAM A; 2JIZ G; 3SJQ C; 1HWY A; 4GKK O; 1KKC A; 1S72 V; 5KHK A; 1EBO A; 4B3R B; 4L8J A; 1WPX A; 3EFF K; 1KB9 F; 1U97 A; 3J7A U; 2WLM A; 2IJJ A; 4B7E A; 3X2Q B; 4ZHQ B; 4MTF A; 4P9P A; 2EJR A; 4B7K A; 3OR7 C; 5FLX N; 2R72 A; 2EJ7 A; 3SDL A; 3LNN A; 1WPB A; 1XBL A; 2CUG A; 3DXR B; 2UUB O; 4JAV A; 1ROP A; 3AG1 B; 4IYI A; 2HLD G; 1NR7 A; 4MVS A; 4TOI A; 2Z0A A; 4X20 A; 2MK3 A; 2FL4 A; 2W6I G; 1JA8 A; 3H1H H; 1ENV A; 4E4E A; 1YIJ V; 1ZL8 A; 4G28 B; 4DR2 B; 1M9N A; 2LJ2 A; 4DW0 A; 1WAZ A; 1GO3 F; 4LFB B; 3OTO B; 4I4T B; 2B1I A; 4PDM A; 1GN2 A; 4F6R B; 5CBG A; 3R65 A; 1MNG A; 1F23 A; 3L72 H; 3JAL B; 4NVP A; 3K9A A; 3ML0 A; 2XT9 A; 1PNL A; 4B3M B; 1NQT A; 3GVM A; 2VWK A; 2WA4 A; 1GRJ A; 2BSK A; 4H0L B; 1KP2 A; 1K92 A; 1YXB A; 1NTZ H; 3O9O A; 5IYD O; 1QCE A; 2WLN A; 1L0N H; 4X1I A; 1IX9 A; 4GX0 A; 1QNM A; 4H44 B; 1VQ6 V; 4JI4 O; 1NH2 D; 3TXQ A; 1SQV H; 1DF5 A; 2CK3 G; 4NTY A; 1FXH A; 2P06 A; 3RGB A; 3B77 A; 2ZR3 A; 1VF7 A; 1WP7 A; 1SA0 B; 3SJA C; 2KQX A; 1S5H C; 1FJG O; 3I5D A; 4Q20 A; 2ZNJ A; 5LXT B; 1BHA A; 1FFT B; 2RCV A; 4KXR A; 4KP4 A; 2ADP A; 5A2Q N; 4PDV A; 2HVK C; 2OWO A; 5EYP A; 2QM8 A; 3M7M X; 3RWR D; 4DXW A; 1RPO A; 3OE7 G; 1R1B A; 4DR3 O; 3CMA V; 5B3S C; 5JCO A; 1W0J G; 4TSF G; 1XUQ A; 4XBF A; 5LMU O; 4DR7 B; 1R6N A; 2YIB A; 4PHZ A; 2XND G; 4MTX A; 1P49 A; 4IIJ B; 4CC5 A; 1HNX O; 2EIK C; 3AG2 B; 1OZ0 A; 2LFR A; 3NXS A; 2UXN A; 1UPG A; 1VQO V; 1TUE B; 2YIA A; 1TGO A; 2JJ2 G; 2IU3 A; 2LW1 A; 2NLJ C; 4ICG A; 1XMO O; 3JD2 A; 4FJC C; 3N27 A; 3EVK A; 4JI0 B; 2Z5U A; 4WF9 V; 1IUR A; 1N34 B; 3BVO A; 3MHS C; 3UO2 A; 4I0X A; 1Q6H A; 2ITD C; 1N33 B; 2Q7G A; 1KD1 W; 3RYC B; 4K8Z A; 3ABT A; 3UCS C; 3ZRW A; 3GWO A; 5H6Q A; 4ZIB A; 3FYI B; 1JPX A; 4B3R O; 1J95 A; 3CD6 V; 3CCV V; 2FB5 A; 4H33 A; 1KYO F; 4CH3 A; 1CEZ A; 1H2M A; 3AK2 A; 1KU9 A; 3K0G A; 4DK0 A; 1VQM V; 4FM0 A; 4FLV A; 1HNZ B; 5IDJ A; 1MZF A; 1J5E O; 3LUT B; 4DV7 B; 1PPJ H; 5E79 Z; 3B09 A; 3CSX A; 4LFC B; 1SQP H; 1NKD A; 2UU9 B; 2W0F C; 2JS3 A; 4N21 A; 1S5J A; 3ABK C; 2QE7 G; 4X62 O; 4DR2 O; 2WLL B; 2ZXW C; 1P4R A; 2P5O A; 3KZI Z; 4LFB O; 5IJ0 A; 4P9O A; 2CE4 A; 3OTO O; 2Q6A A; 3E8F A; 1NTK H; 3ETD A; 4JGS A; 4LFA O; 1VF5 B; 2UXD B; 1FAF A; 3ZHS A; 4YJ2 B; 3ZRX A; 4B3M O; 1H2S B; 1VAR A; 4AHC A; 5LHG A; 5K1P A; 2Y4T A; 3AK1 A; 3CRA A; 3X2Q C; 4JI5 B; 1JCH A; 1M57 C; 3TK1 A; 1QR9 A; 3TGU H; 2OT5 A; 3ASO B; 1Y4M A; 1H2N A; 2LFS A; 2EIN B; 2XTA A; 4I9W A; 2R9I A; 5GTH Z; 3AG1 C; 4NTX A; 2ITC C; 1TVK B; 3JAW B; 3W7S A; 1G8M A; 4A5U B; 2Q7E A; 3ZHR A; 1M4U A; 4FFK A; 1H8H G; 1OCO B; 3FB5 C; 1R73 A; 2XAJ A; 4I4T A; 2BCC H; 4EEQ A; 5LGU A; 1V54 B; 4F6R A; 4PI0 A; 1Z5W A; 4D7S A; 3HKE B; 5B5E Z; 4GT1 A; 5IYB O; 2PGG A; 1CXZ B; 1JFF A; 3VQV A; 4TQD A; 5CMU A; 1TAE A; 5LA6 A; 3BY6 A; 4IYH A; 1R6T A; 2F43 G; 5KLV H; 5IE9 A; 2HJD A; 1Q8I A; 4MSW C; 5B1A C; 1V55 C; 1IDS A; 5CN0 A; 4J80 A; 5BR8 B; 4WFG A; 4X88 A; 5IYZ B; 4PD4 F; 4DV5 B; 1BQZ A; 1FXV A; 4DR7 O; 3O65 A; 4O2B A; 1XNQ B; 2WLI A; 4WFH A; 5LBQ A; 4Z1M G; 4JZG A; 3QO7 A; 4OGQ B; 4ZOL B; 4LF6 B; 4NTW A; 1SA0 A; 1Y76 B; 4HYO A; 2DYS B; 3CJH B; 4JTC B; 1Y74 B; 5H9C A; 3WFV A; 4BR6 A; 3BEH A; 2F1M A; 4HZ3 A; 3RYI B; 4JI0 O; 4GKK B; 3F5T A; 5JVD B; 2MW2 B; 1N34 O; 2VS0 A; 1N32 B; 3AG7 A; 2UXX A; 1HW7 A; 1N0J A; 2IW5 A; 2IH1 C; 2VQE B; 4UCU A; 3A2F A; 2HP8 A; 3EHB B; 1ORQ C; 3QO8 A; 3VQX A; 4YIO A; 2Q67 A; 2ZCE A; 3FB8 C; 3SPC A; 2IU0 A; 2FML A; 1XIL A; 3CPW U; 5EC2 C; 2CGO A; 3AEI A; 4TUY B; 5GW7 A; 5LOV A; 1UFI A; 5LHI A; 4DV7 O; 4JTD B; 2XAQ A; 4K8X A; 1QBZ A; 3U0Z A; 1P84 F; 4LFC O; 1P7B A; 2UU9 O; 2LGW A; 2F95 B; 3DC6 A; 5L3C A; 4LBE C; 5ITZ A; 1I08 A; 5EK0 A; 5JQG B; 1DGS A; 2XAH A; 4JYY A; 2JRI A; 5JJE B; 2YUA A; 2PY5 A; 4PA3 A; 4NR1 A; 1K8A W; 1GM7 A; 4RQF A; 1FS0 G; 1IXB A; 1VP7 A; 4UUJ C; 5B3S B; 4JI2 B; 1GK9 A; 1XMQ B; 5LP6 C; 4JAA A; 3OGC C; 3MHH C; 1E1R G; 2H94 A; 4JI4 B; 4JI3 B; 4ZI7 A; 4I5S A; 3EXA A; 1QQC A; 1I94 O; 1NZ6 A; 4MVR A; 2WLK A; 2W6J G; 2YSU B; 3BPZ A; 4KUM A; 3RFR A; 1NI8 A; 4EB6 B; 3B8M A; 3CCM V; 1K5S A; 5EIB C; 2DOS A; 2F66 C; 2GBO A; 2V7Q G; 1VQ4 V; 4JI1 B; 5EZY B; 4LR3 A; 4NB5 A; 2E76 B; 2A79 B; 1GKF A; 1AR4 A; 2R70 A; 1YTF D; 3RYF B; 2CDY A; 1URF A; 1DTO A; 4MS2 A; 3DSQ A; 5FNV B; 4PA7 A; 3RYH B; 2QEX V; 5GTI Z; 1SZT A; 4CH4 A; 2F4V O; 1NH2 B; 4DR4 O; 4YJ2 A; 4W4K A; 1W0K G; 4UCT A; 2DWD C; 5C8Y A; 3CXC U; 3CX5 F; 4GUN A; 4PDL A; 5FPR A; 3N2K A; 2QM4 A; 4BW5 A; 1N8R W; 2VWJ A; 2XHB A; 3AG4 C; 4PJ0 Z; 3ASO C; 1AP6 A; 2NNU A; 1HNX B; 2EIN C; 5BR8 O; 1Q43 A; 1XNQ O; 3ZBH A; 2VQF B; 2L6L A; 4WFF A; 2ZE6 A; 2DW4 A; 4PV1 B; 3ZCC A; 4R50 A; 2GUZ B; 1CPY A; 2A0L A; 3CB2 A; 5JWP A; 2PYL A; 5LYJ A; 4UCR A; 1OCO C; 2ZD9 A; 3ABK B; 5LMN B; 2XAS A; 3D36 A; 4R8C A; 1CP9 A; 1V54 C; 3SYQ A; 1QHT A; 1FD9 A; 3CEI A; 3N2G A; 3PN1 A; 1N32 O; 4CZZ A; 5KHH A; 2BOB C; 3CXH F; 3CCJ V; 1LNQ A; 4LNU B; 1UJW B; 3U11 A; 3QO5 A; 2VQE O; 3OTF A; 1KC8 W; 3JAS B; 4BIO A; 3K0D A; 2YS8 A; 1D2D A; 4FZ0 A; 4TV8 A; 1NU1 H; 1M57 B; 3E22 B; 5IYZ A; 3W7W A; 1J5E B; 3MAQ A; 1AJN A; 1OV9 A; 2GV9 A; 1BQ0 A; 4LF7 B; 3ZMZ A; 1EZV H; 3K5N A; 4ZOL A; 3NR7 A; 4DO2 A; 3W7U A; 5KAF Z; 2B5U A; 1AP5 A; 4G27 B; 2B1G A; 1KBH A; 2CH7 B; 3CJH A; 2DYS C; 2Q7H A; 4X62 B; 3IJ4 A; 1Q82 W; 2KG7 B; 2ZQM A; 3BCC H; 4LF9 O; 3RYI A; 1RP3 B; 2Z3Y A; 3CCL V; 4IHJ A; 2FTK A; 2Y4U A; 3UO3 A; 4GX1 A; 4LFA B; 3U10 A; 4O4L B; 4JYA B; 4LP8 A; 3ABU A; 1JQ0 A; 3WG7 C; 4RQE A; 3H1I H; 1AI6 A; 1Q90 D; 2YIB D; 1MOF A; 1JR9 A; 3Q4H A; 3K79 A; 1XL4 A; 4JI2 O; 1XMQ O; 5B1A B; 1V55 B; 3IC7 A; 5EC1 C; 1MSD A; 4DV2 O; 3JSN A; 5CB4 A; 4JI3 O; 4FFB B; 1VQP V; 3CP1 A; 4FK5 C; 1VF6 C; 4U7N A; 3KG2 A; 2EUL A; 3HKD B; 1G4Y B; 2ZIN A; 3LDE A; 4DR6 O; 4PEL A; 1BHB A; 3OMI B; 1YI2 V; 3HKC B; 5HFM A; 2UXC O; 5JQG A; 4MW8 A; 1IBM O; 4O4J A; 1WP8 A; 2YIC A; 3OT7 A; 4JI1 O; 1I5X A; 2FYU H; 1ZSP A; 3THO A; 3T1Y B; 2XAG A; 4X9Q A; 4LCU C; 5LHH A; 1NS1 A; 4MT8 A; 3SYC A; 5LL6 Y; 2OCH A; 3K5O A; 4QIW F; 1SER A; 3B4S A; 1XRE A; 2HFE C; 3ZMU A; 2DN9 A; 1Q86 W; 1S5L Z; 5C93 A; 4WBN A; 5JH7 B; 2Y69 C; 2Y0P A; 3SJC C; 2BOC C; 4UV8 A; 3JYC A; 3CME V; 3K08 A; 3APO A; 4JTA B; 1B3Q A; 3OR6 C; 1QU7 A; 3JAT B; 3STL C; 1JOY A; 1Y67 A; 2AZ0 A; 2P7T C; 2PYJ A; 3K06 A; 4FLW A; 2P6J A; 4DV6 B; 3UKM A; 4LWS A; 2VRZ A; 4DRX B; 4G2K A; 4O2A A; 4EB6 A; 5BZB A; 3G6E V; 2VQF O; 2KKW A; 4TT3 G; 2LO1 A; 1QR8 A; 2M6Y A; 1IBL B; 1HNW O; 4ZKI A; 4J42 A; 5H6R A; 4U3J A; 2EBO A; 3RYF A; 3VQW A; 4YXW G; 2A3Q A; 4JF3 A; 5FNV A; 3RYH A; 4GCZ A; 1M5I A; 4RO2 A; 3WB1 A; 5LMN O; 2RDC A; 3JAK B; 1VQ9 V; 4OPA A; 2XUM A; 1I0H A; 5KX5 A; 1W59 A; 3R66 A; 4X66 O; 1FFX B; 1TUB A; 1FPO A; 2W0X A; 1YIT V; 1K97 A; 1ZTE A; 1S0V A; 2YXY A; 3JCU Z; 4UB6 Z; 1LUW A; 3HR0 A; 4TWK A; 4FIP C; 4DW1 A; 5KUM A; 3K5M A; 5LP6 B; 1X4T A; 3C3T A; 1MA1 A; 5H5N A; 3HKB A; 5IWA O; 1YEW A; 3W7T A; 1RFY A; 4BAY A; 4LF7 O; 5IY5 C; 2JGD A; 2YI8 A; 4MVM A; 4YJ3 A; 4K35 A; 4O4I A; 1B6Q A; 1EZJ A; 3G67 A; 5CBF A; 5J2U B; 5KAI Z; 3JSL A; 2Q9L A; 4QPJ A; 4BIZ A; 1KQS U; 4JZ2 A; 3OUS A; 2OCC B; 3CS5 A; 1SQQ H; 4H13 B; 3OMA B; 3IFX A; 2QDO A; 4WFB V; 1SQX H; 3TJT A; 2F23 A; 3RT3 C; 4JYA O; 4MVU A; 3ZED A; 3JAM N; 3AG3 C; 4X1Y B; 5DN6 G; 3CCU V; 4FM2 A; 4QE7 A; 3D8C A; 3IGA C; 4ZHQ A; 2UUC B; 4EFE A; 2WAM A; 3E22 A; 4MTG A; 4LF4 B; 2K9P A; 4LH6 A; 3T1C A; 2P4V A; 4FLZ A; 4DV0 O; 4KHP O; 1I94 B; 3AG4 B; 2GTA A; 2JK5 C; 3P32 A; 4J11 A; 3ZIA G; 2QGN A; 3JCZ A; 5J9P C; 4CBC A; 4UCO A; 3DXR A; 3FD9 A; 3ZRV A; 1QVG U; 1XHZ A; 4TV9 B; 1RPR A; 2CH7 A; 2QR4 A; 2GHY A; 2PZS A; 3VBB A; 1GN3 A; 2ATK C; 2WLJ A; 1SES A; 1WJZ A; 3K03 A; 3VOU A; 3FFQ A; 1Q5O A; 4P2Z A; 1ARO P; 4NKG B; 1NJI W; 4OX9 B; 4YHH O; 2F4V B; 3T1Y O; 3ZHV A; 4O4L A; 2EIM B; 2ZDI C; 4LF8 O; 3KKY A; 5BMV B; 2AXT Z; 3JAL A; 5KMG B; 4DR4 B; 3MD0 A; 4CS3 A; 4LH7 A; 3OM3 B; 1EN4 A; 4HNA B; 2ZT9 B; 4UB8 Z; 1YCI A; 5HFL A; 2NR5 A; 1SQB H; 4XDJ A; 3B8N A; 4DR1 O; 3JAR B; 3UT5 B; 1H2K A; 1YSC A; 2JJ1 G; 4FZ1 A; 4CS2 A; 2BTO A; 2E5L B; 1VEW A; 2PF4 E; 1L0L H; 1YTF B; 3K5L A; 1YJN V; 2DJV A; 3JD3 A; 3UM7 A; 4DV6 O; 3ZRS A; 3W7X A; 2JEX A; 3E86 A; 2XAF A; 1F51 A; 1IBL O; 5E1A C; 4FLX A; 5LXT A; 5L3F A; 1U96 A; 4B08 A; 2AGA A; 1T5E A; 4X20 B; 2V4D A; 3WG7 B; 4MW3 A; 5JH7 A; 1E1Q G; 3MDS A; 1FXK C; 1R3K C; 1AI4 A; 1KKD A; 1HDJ A; 3L70 H; 5J2T B; 5L3G A; 4J41 A; 1G1X B; 4FLY A; 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