The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
24
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sequence length |
80
|
structure length |
80
|
Chain Sequence |
GNGSTITFDELQGLVNSTVTQAILFGVRSGAAALTLIVVWITSRSRKTPIFIINQVSLFLIILHSALYFKYLLSNYSSVT
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of a double transmembrane fragment of a G-protein-coupled receptor in micelles.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Pheromone alpha factor receptor
|
| molecule tags |
Membrane protein
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| total genus |
24
|
| structure length |
80
|
| sequence length |
80
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-10-21 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Pheromone alpha factor receptor. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2K9P A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2Z3Y A; 3T1H O; 4UVB A; 3C3S A; 3ZRV A; 2A79 B; 3ABM B; 4I4T A; 1SES A; 4DV3 B; 3JAM N; 3UCS C; 4AQY O; 2EBO A; 4I50 B; 3TET A; 4WBN A; 1SQG A; 3K03 A; 5GTH Z; 4YJ3 A; 1OCO C; 2F23 A; 2Q67 A; 4I9Q A; 5IDJ A; 1H38 A; 4JV5 B; 2PF4 E; 4BWA A; 1R6K A; 2Y69 B; 3N2K A; 1Q6U A; 3MDS A; 4O2A B; 5EIB D; 3K0G A; 2QTO A; 4FPP A; 1B04 A; 5IT9 N; 1NR1 A; 1CP9 A; 3GWO A; 4DR5 O; 4ZKI A; 5E1A C; 4IHJ B; 4ZI7 A; 3FYE B; 1KUQ A; 3HKC B; 2OCH A; 4NXN O; 4CH4 A; 2Y0I A; 1EM1 A; 3QTC A; 3M99 B; 5KHI A; 5KUK A; 4UCV A; 3TXS A; 1L0L H; 3CCL V; 4DUZ B; 1NI8 A; 2DYS B; 1CPY A; 4LF6 B; 3Q4H A; 3K9A A; 3I5D A; 4GX0 A; 4DV2 B; 4EKW A; 1BGY H; 3GVM A; 1YTF B; 4TV9 A; 2ODM A; 1KEC A; 2JGD B; 4F6R B; 4WCE V; 1PNM A; 3T4Z A; 2DQ0 A; 3ICX A; 4UUJ C; 4GX2 A; 4GUN A; 3A2F A; 4DV5 B; 3BA8 A; 4JZ2 A; 2DQ3 A; 1FJG B; 1HNW B; 5LL6 Y; 2RMK B; 1NVP B; 3IJ4 A; 1IZ3 A; 4DR2 B; 1VQ7 V; 4QIW F; 4UB8 Z; 3RYF B; 5L3D A; 4DV1 B; 1S72 V; 3OEE G; 1MG1 A; 1H2K A; 2OT5 A; 1XNQ B; 5BZB A; 2NN4 A; 1YJW V; 2QWQ B; 3FB6 C; 1NJI W; 2XT9 A; 2VS0 A; 4HNA A; 3CCR V; 4KXR A; 3P30 A; 2M7W A; 4TWK A; 2BSK B; 3CYO A; 4UVC A; 1M57 C; 3U10 A; 1XUQ A; 4JI2 O; 4B7E A; 1GRJ A; 3RYI A; 4O4J B; 5ITZ B; 4GKK B; 4J9Z B; 4DO2 A; 3MHS C; 5KAF Z; 4X1K B; 1SC5 B; 4PA3 A; 4K8X A; 1SQF A; 1Y67 A; 1YZB A; 1K5Q A; 3ABL C; 3IAY A; 4OXS A; 1WNS A; 3K9S A; 1I94 O; 4JYY A; 3K57 A; 1OCC C; 5BMV B; 1BS3 A; 1KP2 A; 1GN3 A; 4ZIB A; 5LMU O; 3LNM B; 5EBM C; 5C8Y B; 2MW2 B; 4PD4 F; 2RQ6 A; 4MTF A; 3A8T A; 3UO3 A; 4J41 A; 2R70 A; 4DV0 O; 3K08 A; 2Q69 A; 1BQZ A; 4ZHQ B; 5FNV B; 1GM9 A; 4XDK A; 2P7T C; 4IYI A; 3X2Q C; 1W2B U; 3SJB C; 4X62 O; 3H1J H; 1I7F A; 1G4Y B; 3D36 A; 1X59 A; 1SA0 A; 3SYO A; 1PL0 A; 5KHG A; 3TGU H; 2CTW A; 3RW0 A; 1YVW A; 5CB4 B; 1VQL V; 4B7K A; 2P6J A; 2PGG A; 5C93 A; 1TVK A; 2OCC B; 3IGA C; 3OUS A; 2N05 A; 2EIJ B; 4BIU A; 2PYL A; 4HBN A; 2OYQ A; 4E2L A; 3JAS B; 4U3J B; 4UXN A; 4J10 A; 1Q81 W; 3ZRX A; 4UFZ A; 3RYC A; 1KD1 W; 3OTO O; 4EFE A; 1S5H C; 3OAA G; 4QGP A; 2QM7 A; 2NR5 A; 2V1D A; 3JSL A; 4BW9 A; 2CUG A; 3RYH A; 1FXK C; 4MVR A; 2GDS A; 2ITD C; 3RBZ A; 1BZK A; 1I5Y A; 3H1L H; 1AI6 A; 4KHP B; 2NLJ C; 3SJA C; 1MZF A; 1XRE A; 5B1B B; 2HLD G; 3L9D A; 4FFB A; 1R3I C; 2H8P C; 2Y4U A; 4P2Z A; 2B5U A; 3JAL A; 2Q6A A; 5IY5 B; 3G4S V; 2DWD C; 3B8M A; 1M56 B; 5CA0 A; 2QGN A; 3H01 A; 2YS8 A; 4J7K A; 5EBW C; 3SYC A; 5KMG A; 4JI7 B; 5B1O A; 1P84 F; 3J80 N; 2LGW A; 2LFR A; 3T1H B; 2WLI B; 4U7N A; 3E8B A; 1BMF G; 3BPZ A; 1VF5 B; 2OIE A; 4R7C A; 2KG7 A; 5IJ0 A; 4AQY B; 1OHH G; 2YXY A; 3HKB B; 3JAR A; 4X1I A; 1VQ8 V; 1ZX3 A; 3UT5 A; 1IUR A; 5IJ9 A; 4PA9 A; 2ILM A; 2CH7 B; 5D5P A; 3QNE A; 3OM3 B; 2YUA A; 3ETE A; 2YI8 A; 2ZE6 A; 4F6E A; 3G67 A; 3KKY A; 4U3F H; 2XAG A; 3E8G A; 1A32 A; 2RN9 A; 1SQQ H; 3M8A A; 2EIM C; 1THZ A; 3CRC A; 5IE9 A; 4NXN B; 3UO2 A; 3DXR A; 4OX9 O; 2N04 A; 3LSU A; 1XNR O; 5KX5 A; 4FLW A; 3SPH A; 1XI1 A; 1YXB A; 1R3K C; 4K3A A; 1S5L Z; 1HWY A; 4DW1 A; 4X8A A; 1YEW A; 4PJ0 Z; 2B9Z A; 2ZT9 B; 3TK1 A; 1NKD A; 2LW7 A; 2A0L A; 3WFV A; 4Q20 A; 1QU7 A; 1NTZ H; 2UXC O; 1JFF A; 4AHC A; 2ZXW B; 1HP8 A; 4GCZ A; 1R6T A; 1KC8 W; 4O4L B; 3CS5 A; 3APO A; 2CAZ C; 2W0X A; 4HYO A; 2HJF C; 2WLM A; 1VMG A; 4UVA A; 2A3Q A; 2EIL C; 4PDL A; 5B66 Z; 2PTM A; 3FAV A; 4DV2 O; 2IH1 C; 2Q5Z A; 3S3W A; 2W6I G; 1KBH A; 4J7J A; 4PA6 A; 2QEX V; 2EIN C; 5JQG B; 3ZHT A; 4LFC O; 1G6U A; 5B1A C; 2G38 A; 2H3O A; 4I5S A; 1HNX O; 1JJ2 U; 2JJ2 G; 3T4D A; 2ZDI A; 3VOU A; 4UCU A; 5EIB C; 1QLE B; 4DV5 O; 1R1B A; 4F4L A; 4X1Y B; 4PHZ A; 5JWP A; 4R6Z A; 2AHZ A; 4FK5 C; 3A0B Z; 4LF9 O; 4DR2 O; 5B3S B; 1BQ0 A; 2IJI A; 4N23 A; 5LA6 B; 3K5N A; 4C7U A; 4JI2 B; 1AVM A; 1Y74 A; 1PPJ H; 5LHH A; 1R3J C; 4X20 A; 3WU2 Z; 1WA8 B; 3AG7 A; 1PP9 H; 1EN5 A; 2IU3 A; 4MVU A; 1KP3 A; 4DXW A; 4UB6 Z; 3K0D A; 3FD9 A; 4OGQ B; 4JI6 O; 1T5E A; 2QE7 G; 3F5T A; 3P32 A; 1VQ5 V; 4LNU B; 4GKK O; 3PN1 A; 5LMU B; 4YIP A; 1XMO B; 4LF4 O; 2QWN B; 1TUB B; 3ASN C; 1VQ6 V; 1MSW D; 3JAT A; 5DM6 V; 1PNL A; 4DV0 B; 5LP6 C; 2PI5 A; 1K7D A; 4DR6 O; 2D3O W; 3EFF K; 3A0R A; 2CTQ A; 2HKO A; 1VQ4 V; 1XL6 A; 2HVJ C; 1IBL O; 5EZY A; 3BA9 A; 4H37 A; 1OCR B; 4X62 B; 1ZLZ A; 4UCT A; 4O2B A; 4MTG A; 1UJW B; 2ZIM A; 3C90 A; 4I0X B; 4YJ2 A; 1MA1 A; 1N4C A; 1SKV A; 1Q5O A; 1V54 B; 3N2G B; 5JH7 A; 1GK9 A; 3AG1 C; 2ARH A; 5CA1 B; 4JTD B; 1HNZ O; 1JCH A; 1OCZ B; 1X4T A; 3ETQ A; 1FKA O; 3ABM C; 3KCY A; 5H2F Z; 3OTO B; 2XAJ A; 4LBE C; 2P90 A; 3CC2 V; 1U96 A; 3W7X A; 1IBK O; 1WAZ A; 1IVS A; 2Q7G A; 3OD4 A; 3FX7 A; 3M7M X; 5CBG A; 3CC4 V; 2WPD G; 1F4M A; 3STZ C; 5KLV H; 4FLX A; 4WFB V; 3N27 A; 5KHH A; 4JAS A; 3RGB A; 1DF4 A; 4MTO A; 3K58 A; 5GON A; 2YIC A; 1QQC A; 1ZL8 A; 2DN9 A; 2EZO A; 2KB1 A; 1RPR A; 3ETD A; 4L87 A; 3ABK B; 4DV7 B; 4B3M B; 4G27 B; 2HR3 A; 3ZRS A; 2UXB O; 4LWS B; 4CH6 A; 3OR7 C; 4ZOL B; 2UXX A; 5DN6 G; 1FFX A; 4K35 A; 3F5W C; 4XDL A; 5D5Q A; 1AI4 A; 4QPJ A; 3OT7 A; 2DYS C; 2RCV A; 2F1M A; 4QPK A; 2E76 B; 1OJH A; 3FKS G; 3IC9 A; 5L3E A; 1V55 B; 1RPO A; 3G71 V; 4RQF A; 1R3L C; 1BCC H; 4WFA V; 2UUA O; 4JYA O; 4GT1 A; 2KKW A; 3CRQ A; 5J2T B; 4QJF B; 2IJJ A; 4UV9 A; 2BCC H; 3AK3 A; 5HFL A; 3LDD A; 2JRI A; 2RNB A; 3CCJ V; 2PUS A; 5JJE B; 1LUV A; 1NU1 H; 2L35 A; 4BIO A; 1LR1 A; 1K4D C; 2ZR2 A; 4XBF A; 4OX9 B; 1XNR B; 5DEC A; 4WFH A; 4FM0 A; 2WLL A; 3G6B A; 4CZZ A; 2JIZ G; 2HP8 A; 4CS3 A; 1ZAU A; 4Z2W A; 1MZE A; 1Z2G A; 3E8H A; 2X7R B; 3CCE V; 3ASO C; 1URF A; 1N36 B; 2UXC B; 1H2N A; 1FPO A; 4KL1 A; 4LH7 A; 2DOS A; 2ETN A; 3HKE A; 3RT3 C; 2WAM A; 5IYZ A; 5KHJ A; 4X64 O; 5JVD B; 3O65 A; 4IYH A; 1GO3 F; 1K4C C; 1R73 A; 2R9A A; 2L6L A; 4JF3 A; 3AG2 C; 1IXM A; 1YIJ V; 3K79 A; 2PY5 A; 2GHY A; 3I56 V; 4I55 B; 3ZED A; 2QWP B; 5LOV A; 2BTQ A; 1WP7 A; 4LFC B; 4O4I B; 3E22 A; 1XDC A; 2EIK B; 1YSC A; 1HNX B; 3R66 A; 2XOK G; 1GN4 A; 1S5J A; 3OGI B; 5LP6 A; 4DUY O; 4W4K A; 4TUY A; 3L72 H; 2HHH B; 4YIO A; 1NH2 D; 3JD1 A; 3ZN0 A; 4IIJ A; 1EZV H; 3JAW B; 3I55 V; 4LF9 B; 1Q7Y W; 4R50 A; 5FPO A; 1P4R A; 3STL C; 4BW5 A; 5DED A; 3LSQ A; 4EB6 A; 3F7Y C; 2BTO A; 1ARO P; 1Y76 B; 2QKC A; 2ZR3 A; 4MSW C; 2EIJ C; 2AZ0 A; 2H94 A; 4W4L A; 3SPI A; 3BAA A; 4I50 A; 4JI6 B; 3JD2 A; 4TQD A; 3CD6 V; 2Q73 A; 2P67 A; 5E79 Z; 1KMI Z; 4GX1 A; 4J80 A; 2YEV B; 4LF4 B; 1KKD A; 1EZJ A; 4JI3 O; 1DGS A; 4Z1M G; 3CP1 A; 4O2A A; 5EBL C; 3W7T A; 2ZIO A; 3MAQ A; 2HEP A; 3K5M A; 4DR7 O; 2QJ1 A; 5B1B C; 2JS3 A; 4DR6 B; 1IDS A; 2P5O A; 4JPR A; 3EVK A; 2JDI G; 5KA5 A; 4IHJ A; 1H8E G; 4Q6G A; 5IY5 C; 1IBL B; 4JI5 O; 1KU9 A; 3HKC A; 3PJS K; 3SPG A; 1FFT B; 3CHX A; 5LXT B; 1M9N A; 1XMO O; 1M56 C; 3B40 A; 3RVZ A; 2E75 B; 1B3Q A; 1M1K W; 3OE7 G; 4RO2 A; 5J9P C; 1GAX A; 4NYK A; 2ZDI C; 5IYB O; 1YJN V; 2WLJ A; 2GUZ B; 1HNZ B; 2ZE5 A; 4WF9 V; 4ICG A; 4JI1 O; 5LYJ B; 2XAF A; 3FB7 C; 3WG7 B; 2IH3 C; 5J2U B; 4K0K O; 1EBO A; 2P06 A; 2JGD A; 4F6R A; 1YTF D; 1IBK B; 2N74 A; 2Q0A A; 3TXQ A; 3MD0 A; 1SZX A; 3SYP A; 3W7W A; 1RM1 C; 4LC1 A; 1Q8I A; 3IC7 A; 1D5A A; 2UU9 O; 2KSD A; 2R72 A; 1AIL A; 2V4D A; 3VQV A; 1XQ8 A; 3OTF A; 5IYD O; 1N0J A; 3VQW A; 3CCV V; 2Q7H A; 5CN0 A; 2AXT Z; 1NVP D; 1RSO B; 4XDJ A; 2W0F C; 3LUT B; 3RYF A; 5K1X A; 3JD0 A; 2GTA A; 1YJ9 V; 1MSD A; 1M57 B; 3OMA B; 2UXB B; 4B08 A; 3K5O A; 1PKX A; 3ZMS A; 5JJN B; 1FXV A; 4PA4 A; 1JQ0 A; 1VIB A; 2BSK A; 5EK0 A; 4NTY A; 2QSA A; 2YIA A; 4D6T H; 4KUM A; 3HB3 B; 2ZE8 A; 2ZXW C; 4O4J A; 5ITZ A; 3ZBH A; 4DV7 O; 4B3M O; 1P49 A; 3WB2 A; 3KG2 A; 4JI8 O; 2K9P A; 4X1K A; 3ZHR A; 1YIT V; 2UUA B; 1YCI A; 4JYA B; 1FXH A; 3ZN1 A; 4IT5 A; 2QWO B; 1E1R G; 3OGC C; 5BMV A; 1HR0 O; 5C8Y A; 3E89 A; 1S0V A; 3DC5 A; 3X2Q B; 1WPB A; 2ZD9 A; 4NXM B; 1H2L A; 3OMN B; 4H0L B; 1QLE C; 1ZUQ A; 5FNV A; 3RFR A; 3TJT A; 4ZHQ A; 5BR8 O; 2WLH A; 4DV4 O; 1KQS U; 4CS2 A; 1AR4 A; 2DYR B; 2EX3 A; 3CME V; 4FLZ A; 5B3S C; 1JPX A; 4DRX B; 3K04 A; 3ZIA G; 1GN6 A; 3CJH B; 5CB4 A; 3ZRW B; 2MK3 A; 1SET A; 4O4H B; 4X64 B; 3U11 A; 1K97 A; 3EXA A; 4P9P A; 2CK3 G; 3JAK B; 2VQF O; 1GTO A; 1FXK B; 4RAI A; 3JAS A; 3K3W A; 4U3J A; 3H1H H; 4AI8 A; 1N36 O; 1BT8 A; 2DMX A; 4G28 B; 4DR4 O; 4CBC A; 1K3E A; 1N32 O; 3CMA V; 1WB8 A; 4JI4 B; 2DW4 A; 1M4U A; 4TV8 B; 1BE3 H; 2VQE O; 4DUY B; 1VF6 A; 4X65 O; 3CCQ V; 2ZM6 B; 3H1K H; 3B2E E; 4B3T O; 3ZS8 C; 3WB0 A; 2Z5U A; 2QDO A; 4MVZ A; 5EC2 C; 4DK1 A; 1OCR C; 1PD3 A; 2Q4P A; 1XL4 A; 1NR7 A; 3AG4 B; 3ZHQ A; 1V54 C; 2W6J G; 1YDX A; 2WLI A; 1H2M A; 2HHH O; 2JGU A; 1Z5W A; 3SDL A; 1L0N H; 2OTL V; 2CE4 A; 4U7O A; 4NB5 A; 4BR6 A; 4MVM A; 2OWO A; 1E1Q G; 3HKB A; 3L75 H; 4ASU G; 3BY6 A; 4JZG A; 3R65 A; 2X6C A; 1E79 G; 3OEH G; 2AW9 A; 4KFM A; 2F95 B; 2CH7 A; 3SR2 C; 1NBM G; 4LFB O; 1Q3E A; 2FB5 A; 1YHQ V; 1ROP A; 3HKD B; 1H2G A; 4JI3 B; 2QR4 A; 3ZMT A; 5L3G A; 4IL6 Z; 2O57 A; 4DR7 B; 5FL7 G; 2QKS A; 4GKJ B; 4D7S A; 1H8H G; 2JVD A; 3D3I A; 5EYP B; 4FVM A; 4JI5 B; 3ABU A; 1BL8 A; 1XEQ A; 2AHY A; 2ZKO A; 1Y66 A; 2P4V A; 3ABK C; 4RQE A; 4X66 O; 4FZ1 A; 3HPL C; 2XHB A; 4PA7 A; 2JK5 C; 5L3C A; 1XBL A; 1O9G A; 4FM2 A; 4JI1 B; 2LGQ A; 4K0K B; 1J5E O; 2QM4 A; 1M93 A; 2E3C A; 3JCU Z; 5B1N A; 1K5S A; 4I4T B; 2UUC O; 4O4L A; 1WPX A; 3CXH F; 1KYO F; 2DJV A; 1TAE A; 2WLN A; 1KB9 F; 3JSN A; 1JA8 A; 1QR8 A; 1I5X A; 4WFG A; 3LDE A; 4WBN B; 3ML0 A; 3AK2 A; 4YJ3 B; 4I7Z B; 2UU9 B; 4JAV A; 1SER A; 2E5L B; 2PI4 A; 2EUL A; 2Q7E A; 3CE2 A; 5IWA O; 1XHX A; 2FYU H; 2C2A A; 3N2K B; 5EC1 C; 2VWK A; 2QTS A; 1M90 W; 5JQG A; 1JOY A; 4CC6 A; 1XIL A; 4LF7 O; 4RUF A; 2Y69 C; 1WN7 A; 1NTM H; 4ZI7 B; 1QCE A; 3CSX A; 4X1Y A; 3AG3 B; 2EZP A; 3H1I H; 1K73 W; 3CWB H; 1JVM A; 4GLX A; 5LHG A; 2ADP A; 5LA6 A; 1UFI A; 1ZSP A; 4JI8 B; 3B09 A; 3SPJ A; 2GV9 A; 1WA8 A; 3Q4H B; 5BY1 A; 5A2Q N; 1Z5V A; 4JTA B; 3DGE A; 5KA6 A; 4TV9 B; 2P22 C; 3ZX6 A; 1SQB H; 1HDJ A; 3RVY A; 3JD4 A; 4H44 B; 1K34 A; 3BFR A; 1AI5 A; 4E4E A; 4OPH A; 4LNU A; 1HR0 B; 1U97 A; 2FML A; 3RN4 A; 5F2V O; 2CTP A; 1F23 A; 1TUB A; 1W0J G; 1NTK H; 3UQ8 A; 3T1Y B; 2Y48 A; 3L71 H; 3DSQ A; 1IBM B; 4DR3 O; 4J7Z A; 5L3F A; 1EFR G; 4IGG A; 5BR8 B; 2BOB C; 3BAB A; 4JAA A; 4DV4 B; 3D8C A; 3NXS A; 1LUW A; 1MOF A; 3W7U A; 4UCS A; 4LR3 A; 2Q0O C; 2IJK A; 2Y0P A; 4I0X A; 4NR1 A; 2LO1 A; 4HNA B; 4AIL C; 3N2G A; 1TGO A; 1K92 A; 3T2M A; 3ZHU A; 4NXM O; 3AEI A; 5CA1 A; 1QVF U; 2VQF B; 2WSS G; 3RYI B; 1VQK V; 1RFY A; 2P4K A; 1SQX H; 1WJZ A; 2D2C B; 5H6R A; 1HW7 A; 1PM9 A; 3L73 H; 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