The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
53
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sequence length |
231
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structure length |
231
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Chain Sequence |
IMPQHDQLHRYLFENFAVRGELVTVSETLQQILENHDYPQPVKNVLAELLVATSLLTATLKFDGDITVQLQGDGPMNLAVINGNNNQQMRGVARVQGEIPENADLKTLVGNGYVVITITPSEGERYQGVVGLEGDTLAADLEDYFMRSEELPTRLFIRTGDVDGKPAAGGMLLQVMPAQNAQQDDFDHLATLTETIKTEELLTLPANEVLWRLYHEEEVTVYDPQDVEFKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of monomeric hsp33
rcsb |
| molecule tags |
Chaperone
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| source organism |
Escherichia coli
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| molecule keywords |
33 kDa chaperonin
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| total genus |
53
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| structure length |
231
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| sequence length |
231
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-03-16 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | helix hairpin bin | ||
| Alpha Beta | 3-Layer(bab) Sandwich | Hsp33 domain | Hsp33 domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1VZY A; 3M7M X; 1HW7 A; 1VQ0 A; 1I7F A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1WPB A; 2CTR A; 2E5L B; 2JVD A; 1N8R W; 2IU3 A; 5KAI Z; 1PNL A; 4DV7 B; 3GVM A; 4DK1 A; 4Z1V A; 5EK0 A; 5JH7 A; 1R6K A; 3QF7 A; 2OIE A; 4LF6 O; 2Y69 C; 2ZE7 A; 3AK2 A; 1YDX A; 3SJB C; 3T4D A; 4X66 O; 3OMN B; 4WFF A; 3CCL V; 5LA6 A; 5B5E Z; 1W59 A; 1XMQ O; 2OWO A; 1HNW B; 2JDI G; 2WLI A; 2OCC C; 4EFE A; 1I08 A; 2XAS A; 1TUB B; 1BQZ A; 4DR7 O; 4UVC A; 4I50 A; 1UPG A; 3JAM N; 4OPH A; 2JIZ G; 4HYO A; 3ZN1 A; 3ASN B; 4YJ3 A; 1XNQ O; 2AZ0 A; 4DR6 O; 3RVZ A; 2Y4T A; 2ZCE A; 3RYC B; 4FLW A; 4DXW A; 5B1A B; 4K3A A; 1AR1 B; 3J80 N; 1EZV H; 3A8T A; 4P9P A; 3THO A; 3ZN0 A; 4JV5 B; 1P84 F; 1EFR G; 1M90 W; 4BIU A; 4B3R B; 4QPK A; 4RQF A; 1ZX3 A; 2XAG A; 5KUK A; 3WG7 C; 3JCU Z; 3R66 A; 5FL7 G; 2EIL C; 1H2K A; 1MG1 A; 3N2K B; 2ZE8 A; 1RM1 B; 2P06 A; 1G6U A; 1NTZ H; 4PEL A; 1XEQ A; 2E3C A; 1YHQ V; 1JFF A; 1R3J C; 3Q4H B; 4I0X B; 3L9D A; 4IIJ A; 3ZHR A; 1QLN A; 1SQF A; 3WU2 Z; 4DV5 B; 1R6T A; 4JI2 O; 1M93 A; 3AG2 C; 4LF4 O; 3M7M X; 3AG3 B; 4ZIB A; 4D7T A; 2P4V A; 2XTA A; 3RBZ A; 1H2M A; 2FKX A; 4I9W A; 2NR5 A; 1OCZ C; 2Q69 A; 2A0L A; 1MSW D; 4R7C A; 1R3L C; 2HJF C; 4JI4 O; 3TK1 A; 3FB5 C; 4DV1 O; 2QWN B; 2MW2 B; 3K9A A; 2GDS A; 1K97 A; 3CB2 A; 1QQC A; 4JI5 B; 3CCE V; 5H5N A; 3TXS A; 4B3S O; 4ASU G; 1THZ A; 2CH7 A; 2Q73 A; 4GKJ O; 3HPL C; 1S5L Z; 4MT8 A; 3K5L A; 1XNR B; 2E5L O; 1YEW A; 4NVP A; 1US6 A; 3ZMZ A; 4DV7 O; 3D3I A; 4FLX A; 1I0H A; 1HDJ A; 1UJW B; 3W7S A; 3MHS C; 3JD4 A; 3FYI B; 3RFR A; 2YXL A; 1P7B A; 1HNW O; 3LNM B; 3FKS G; 1XHZ A; 4FIP C; 3APO A; 1H8H G; 3D8C A; 1SQG A; 1N33 O; 4PDR A; 4BW9 A; 1AIL A; 4W4L A; 3SPI A; 2NLJ C; 2EJR A; 4YJ2 B; 2DN9 A; 5B1N A; 4FMT A; 3CHX A; 2OCH A; 4TUY A; 4XDJ A; 5D5P A; 3STL C; 3B8N A; 2RJZ A; 2IH3 C; 1JVM A; 5ITZ B; 4L8J A; 3ZRX A; 5H2F Z; 2JGD A; 5C8Y B; 1K3E A; 1XI1 A; 4BIZ A; 4ZOL A; 4LFC B; 2P5O A; 3E22 B; 4PDM A; 1K34 A; 4JV5 O; 2QWR B; 2AGA A; 1T5E A; 2IJH A; 2JEU A; 1KUQ A; 2YI8 A; 3ETE A; 5LHI A; 3G4S V; 1VP7 A; 1S3J A; 1ZAU A; 4LH6 A; 4O4H B; 1SQV H; 4MVU A; 5CA1 B; 4K8Z A; 2XOK G; 2ZD9 A; 1YJW V; 1BQ0 A; 2PGG A; 2WA4 A; 4JYC A; 1N34 B; 2RQ6 A; 3DSQ A; 1D5N A; 2VQE B; 1IBL B; 5JJN B; 4MTX A; 1K7D A; 1VIB A; 4PA4 A; 3AG1 C; 2ZR3 A; 1VF6 C; 4E4E A; 3UO3 A; 2P6J A; 2BTQ B; 1GRJ A; 1VQ6 V; 3ZRS A; 4DO2 A; 3LDD A; 1NVP D; 1OZ0 A; 3DXR B; 3RYF A; 3RN4 A; 1M56 C; 2HVK C; 2XAH A; 4DV5 O; 5F2V O; 1B3Q A; 3MAQ A; 1LUV A; 1DGS A; 2GTS A; 5EZY A; 2RMK B; 4I4T A; 2BTO A; 3RVY A; 5J2U B; 4CS4 A; 4O2A A; 2LGQ A; 4DR2 B; 2F1M A; 2E74 B; 4ZI7 B; 1HR0 B; 2Y0P A; 3SR2 C; 2A9H A; 3RYH B; 2CGO A; 3CWB H; 1JQ0 A; 1S5J A; 5HFM A; 2EIK C; 2WLJ A; 3P32 A; 2ZE5 A; 4QE7 A; 5IT9 N; 3VQX A; 1XNR O; 4KUM A; 1VMG A; 1XUQ A; 2Z3Y A; 4J10 A; 1OCO C; 2FL4 A; 1Q90 D; 4IT5 A; 2CDY A; 3VQV A; 3RYI B; 4PDV A; 2Q4P A; 4TQF A; 1Y67 A; 3D36 A; 3K08 A; 2H8P C; 3U11 A; 1R3K C; 2DMX A; 1F23 A; 4O4L A; 2R72 A; 4UFZ A; 5JJE B; 5GTI Z; 2GHY A; 4QGP A; 1AI5 A; 1YSC A; 1OCO B; 1D5A A; 3ZRW A; 1QCE A; 1YXB A; 3ZBH A; 1WAZ A; 2HLD G; 1QVG U; 3L75 H; 5J2T A; 1AI4 A; 3NR7 A; 2RCV A; 1KB9 F; 4J9Z B; 2FTK A; 3H1K H; 4LFC O; 1E1Q G; 5KHK A; 2UUC B; 3QO7 A; 1RFY A; 4FZ1 A; 1MOF A; 4MSW C; 3BA9 A; 5BMV A; 3CJH A; 5IJ0 B; 1NH2 B; 2ZQM A; 3TJT A; 4FFB A; 3JD2 A; 3F7V C; 3JYC A; 1AI7 A; 1IBL O; 2VQE O; 4R8C A; 1OCR C; 5KX5 B; 4DW1 A; 1RSO B; 2FYU H; 3HKC A; 3EFF K; 3FB8 C; 2LP7 A; 4UB8 Z; 1F51 A; 1NZ6 A; 4O2B B; 1BL8 A; 5L3B A; 2EIM C; 1PP9 H; 2BSK B; 5IYC O; 4JYB A; 3CCQ V; 4MTG A; 4F6R B; 5CBG A; 1FXK B; 3IC9 A; 4PA6 A; 4LFB B; 4FJC C; 2R9I A; 1E79 G; 3ABM B; 3MDS A; 2AZ2 A; 1KQS U; 1A32 A; 4JZ2 A; 1KD1 W; 1JA8 A; 1OCR B; 3K59 A; 4I7Z B; 2H94 A; 1YJ9 V; 2Z5U A; 4FLT A; 2UXN A; 5CA0 A; 2EZO A; 5EIB C; 5EBW C; 4PDL A; 2XND G; 2EIM B; 2WAM A; 2QDO A; 4TV9 B; 5JVD B; 1M4U A; 4NYK A; 3CRA A; 3M8A A; 4X65 O; 4FLV A; 3DC5 A; 4CH4 A; 4JF3 A; 4PV1 B; 2R70 A; 1JCH A; 1YTF B; 3QG5 A; 2QM8 A; 1P7G A; 1Q8I A; 1RP3 B; 5HFL A; 3BVO A; 1K5Q A; 3CCU V; 3ZED A; 2D3O W; 1N0J A; 3G71 V; 3CS5 A; 4ZBM A; 3K5O A; 1FXV A; 4IGG A; 2YI9 A; 1L0N H; 4O4I B; 1OV9 A; 5GW7 A; 3BHP A; 5CN0 A; 3OAA G; 4PD4 F; 4QE9 A; 3E35 A; 3OTO B; 4AI8 A; 2AHZ A; 2JEX A; 5FNV B; 4DUY B; 2LFS A; 2W0X A; 5IWA B; 2HHH B; 3B40 A; 5IY5 B; 1FFX B; 1D2D A; 5KMG B; 2CTW A; 1TA8 A; 2GSM B; 3OE7 G; 3UT5 A; 5LGU A; 3ETG A; 1MZF A; 4MVZ A; 2UUC O; 1TUB A; 1SS3 A; 3CRQ A; 1HNZ B; 1YIJ V; 1QR8 A; 2W6I G; 4CS2 A; 2X6B A; 3ZJZ A; 4YIO A; 1KBH A; 5GON B; 1XDC A; 2ZKO A; 1JJO A; 2Q0A A; 2KQX A; 1FYJ A; 4GLX A; 2V7Q G; 4MW3 A; 4DV2 O; 1KP2 A; 3L70 H; 3W7X A; 4ICG A; 3LUT B; 1SQB H; 4HAM A; 5IYD O; 5JJJ B; 3FB6 C; 1IZ3 A; 4DR3 B; 3SJQ C; 3T4Z A; 1DLB A; 4DV1 B; 1PV0 A; 4O4J B; 4AIL C; 3HKD B; 3D3Q A; 3OT7 A; 2ZDI C; 1Q6I A; 1WA8 A; 2P90 A; 4A5U B; 2CAZ C; 1AJP A; 1DTO A; 2ZNI A; 3N2K A; 2UXX A; 1SKV A; 1B6Q A; 3A0H Z; 3LDC A; 3HB3 B; 4JAU A; 1QLE B; 4X8A A; 3X2Q B; 4LNU B; 3Q4H A; 4I0X A; 4B3T B; 4YXW G; 1K92 A; 3C3T A; 3SJC C; 1NTM H; 3BRC A; 1SQP H; 1O9G A; 3ETD A; 3ASO C; 1IDS A; 1MZE A; 1F4M A; 1GM8 A; 2WLL A; 4LFA B; 2F66 C; 3OR7 C; 5GTH Z; 4FLZ A; 2EIN C; 2WLN A; 1UFI A; 4JGS A; 1N33 B; 2QKA A; 3STZ C; 4DR4 B; 4X1Y B; 4AQY O; 5CMU A; 3ZHQ A; 3CC4 V; 1XOU A; 3P30 A; 2VWJ A; 5E1A C; 1I5Y A; 3ABT A; 1SRY A; 5FPO A; 2Y69 B; 3W7W A; 3BAB A; 1KC8 W; 3CYO A; 4KL1 A; 2V4D A; 2ADP A; 3CP1 A; 2KKW A; 5EBL C; 4UCR A; 2OCC B; 3OTO O; 1ORQ C; 4DUY O; 1I5X A; 4X1K B; 4LF7 O; 4OXS A; 5IWA O; 2HHH O; 4G2K A; 1VQ0 A; 1H8E G; 1ZL8 B; 4J80 A; 3ICX A; 5B3S C; 3OTF A; 4X64 B; 3RW0 A; 3IFX A; 2EX3 A; 4JI8 O; 3CXC U; 4X20 B; 5LOV B; 2WLH A; 1GM9 A; 1HNZ O; 3ABU A; 4YJ2 A; 4MVM A; 1BMF G; 1VQ8 V; 1PL0 A; 4JZG A; 2LO1 A; 4DUZ B; 3JAT B; 3ZX6 A; 1GN3 A; 5ITZ A; 4NTY A; 1WPX A; 5C8Y A; 3ZMT A; 2GTA A; 3WG7 B; 3HKE A; 2YIB D; 3K79 A; 5B1B C; 2EIL B; 1YI2 V; 1L0L H; 3E22 A; 1FKA O; 4DV3 B; 1KKD A; 4MTF A; 4DR3 O; 1KU9 A; 2Y48 A; 2PTM A; 1ZUQ A; 2IJK A; 4GCZ A; 5KA6 A; 4LBE C; 4I9Q A; 1LR1 A; 4GX2 A; 5EC1 C; 2XAQ A; 5KHI A; 3T1H B; 2OIG A; 3JAW A; 1EZJ A; 5LA6 B; 5JQG B; 1XIL A; 2YID A; 1MA1 A; 3KCY A; 3EVK A; 3JD0 A; 1NH2 D; 2UUA B; 3AG2 B; 4PA9 A; 4Z2W A; 2UUB B; 3WFV A; 1QVF U; 1V55 C; 3OFN G; 4TOI A; 3NXS A; 2BTQ A; 1AR4 A; 3IAY A; 1NKD A; 1OCZ B; 2IM9 A; 2DW4 A; 4B3T O; 2XUM A; 1FAF A; 1Z5V A; 3UM7 A; 3F5T A; 4YJ3 B; 3DXR A; 4Q20 A; 4UUJ C; 1PNM A; 4JTD B; 5H6R A; 1W0J G; 3CRM A; 1H2G A; 4CC5 A; 4HNA B; 5JCO A; 1ZWI C; 4IHJ B; 5L3D A; 4KXR A; 4LFA O; 4LCU C; 3ZMV A; 1PNK A; 3ZMU A; 3ZS8 C; 5J2U A; 2HKO A; 3ZHS A; 1TUE B; 4DR4 O; 1IUR A; 3ZHV A; 3SYC A; 1V55 B; 1SQQ H; 4JI0 O; 3OUS A; 1AP6 A; 3AEI A; 4I55 B; 5LBQ A; 3L71 H; 1F4N A; 1V54 C; 1M57 C; 5DN6 G; 4NTX A; 5C93 A; 1Y66 A; 2QSA A; 1NI8 A; 2EZP A; 1Q6H A; 3W7T A; 2YS8 A; 1XL6 A; 5EBM C; 1VQ7 V; 2Q8V A; 3WB2 A; 1U97 A; 1ZSP A; 4QPJ A; 3SYP A; 1R6N A; 2KG7 B; 5IYZ A; 4W4K A; 1JFF B; 1M9N A; 1JMK C; 5KHG A; 1GN2 A; 3RYI A; 5LXT A; 1YTF D; 1NTK H; 2A79 B; 3A2F A; 4FM0 A; 4EB6 B; 2YXH A; 3FYE B; 3BFR A; 4I5S A; 4JPR A; 1M57 B; 4X64 O; 2HG5 C; 3JD1 A; 2W0F C; 5BR8 B; 4WFA V; 2DQ0 A; 2ITD C; 5K1P A; 1Q82 W; 2FB5 A; 2DOS A; 3ABK C; 4LR3 A; 4DR5 B; 1Y76 B; 4ZHQ B; 2Q68 A; 1DF5 A; 5LYJ A; 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3JAL A; 2W6J G; 5H9C A; 4UVB A; 3ML0 A; 4MVR A; 5LHG A; 4WFE A; 3IGA C; 2Y0I A; 5KHJ A; 1NR1 A; 4NXM B; 3H01 A; 5EZY B; 5BR8 O; 4DV2 B; 1FXH A; 4O4I A; 4H13 B; 2JGU A; 1S76 D; 3D36 C; 2Q5Z A; 4DR5 O; 3B8M A; 2QWQ B; 3UQ8 A; 5EYP B; 1B06 A; 5TIS Z; 5IJ9 B; 4XDK A; 2DQ3 A; 2Q0O C; 3J81 N; 5B1O A; 4TQD A; 2EBO A; 4P9O A; 1FFX A; 2K1E A; 3KCX A; 4TT3 G; 3OUF A; 1W0K G; 1HP8 A; 2LJ2 A; 4JI6 O; 4FPP A; 1OHH G; 1TVK A; 4PI0 A; 4RWU A; 2QKS A; 4JYA B; 2X0L A; 5LHH A; 5KA5 A; 2ZIO A; 3LDE A; 3JAS B; 1PL4 A; 2LGW A; 1PPJ H; 4B7E A; 4BW5 A; 4TV8 B; 1SQX H; 1H38 A; 3SPG A; 5CB4 B; 1BHA A; 1AP5 A; 1Q43 A; 1WNS A; 4BIO A; 1IBK O; 2YIC A; 2IU0 A; 3CEI A; 3E86 A; 1NJI W; 4LF9 O; 1KEC A; 4JAS A; 1SA0 B; 1AVM A; 1VAR A; 4AQY B; 4O4J A; 1IBM O; 1NQT A; 3JAK A; 3B2E E; 5L3G A; 5J2T B; 4UV8 A; 1VQ5 V; 3CRC A; 2XAJ A; 1NT2 B; 4AHC A; 2XT9 A; 4CH5 A; 1HWY A; 2P4K A; 3ZRV A; 2EUL A; 4DV0 B; 3CCJ V; 2N04 A; 1N32 B; 4PJ0 Z; 3BY6 A; 4TWK A; 2PYJ A; 2QA4 V; 2JS3 A; 4P2Z A; 3CJH B; 4GT1 A; 4DW0 A; 2OT5 A; 1Z5W A; 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