The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
30
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sequence length |
92
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structure length |
92
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Chain Sequence |
DPEKLKILEWIEGKERNIRALLSTMHTVLWAGETKWKPVGMADLVTPEQVKKVYRKAVLVVHPCKATGQPYEQYAKMIFMELNDAWSEFENQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Heat shock cognate 71 kDa protein
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| publication title |
Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Bos taurus
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| molecule tags |
Chaperone
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| total genus |
30
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| structure length |
92
|
| sequence length |
92
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| ec nomenclature |
ec
3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase. |
| pdb deposition date | 2007-08-10 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LO1 A; 4RWU A; 1N4C A; 2Y4U A; 3APQ A; 2QWP B; 2YS8 A; 3UCS C; 2QWQ B; 2PF4 E; 4J7Z A; 2CTQ A; 2KQX A; 2DN9 A; 3APO A; 3AG7 A; 3BVO A; 1NZ6 A; 2EJ7 A; 2M6Y A; 3UO3 A; 2CTW A; 2GUZ A; 2QWR B; 2YUA A; 2Y4T A; 1GH6 A; 2CTP A; 4J80 A; 2GUZ B; 1FPO A; 2L6L A; 4IT5 A; 3UO2 A; 2QWN B; 1BQZ A; 2OCH A; 1FAF A; 2QSA A; 1BQ0 A; 1XBL A; 2LGW A; 2CTR A; 1HDJ A; 1WJZ A; 2DMX A; 1IUR A; 2QWO B; 2N05 A; 2N04 A; 2CUG A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1KKD A; 3JCZ A; 4TOI A; 3CCS V; 2R9A A; 1Q6H A; 1G4Y B; 3E22 B; 1DK1 A; 5JH7 B; 1YJ9 V; 2WA4 A; 4X1I B; 5IYC O; 3OMN B; 2HG5 C; 5FNV B; 3A0R A; 1E1Q G; 4MSW C; 4E4E A; 1WA8 A; 4ZI7 A; 2ZE8 A; 4YXW G; 1Q5O A; 2EBO A; 4DXW A; 4MVO A; 3ZHS A; 3VOU A; 5CBG A; 4O4J A; 3ZHV A; 1GN4 A; 4UFZ A; 1SZT A; 4TV8 A; 1WB8 A; 1IZ3 A; 1VQN V; 1NVP B; 2EIL C; 4D6T H; 1QLE B; 4AQY O; 4DV6 B; 3KZI Z; 2WLM A; 3CP1 A; 4DV4 B; 4LR3 A; 1R6T A; 3O65 A; 3D36 A; 2M7W A; 3I5D A; 3TXQ A; 4B3T B; 1TVK B; 4X20 A; 2UUA B; 2LW7 A; 2R70 A; 1AR5 A; 1JQ0 A; 4H13 B; 3CRA A; 3H1J H; 4X65 B; 3OT7 A; 5JQG B; 4DR5 B; 1W0J G; 2DOS A; 4LF4 B; 2FTK A; 3R65 A; 4O2B B; 3SPI A; 3H1H H; 1V55 B; 2RCV A; 1SQQ H; 2QWO B; 2ZE5 A; 1K34 A; 4I50 A; 1JR9 A; 3QO5 A; 2EIK B; 4N23 A; 4X8A A; 3JAT A; 2P5O A; 5EZY A; 2BE3 A; 1GN6 A; 1QLN A; 4UCR A; 4UB8 Z; 5EIB C; 3OD4 A; 1VQ5 V; 1QQC A; 4JI1 O; 4FPP A; 2IM9 A; 5KHG A; 3RYC B; 4QNH B; 4H44 B; 1Z2G A; 4YJ2 A; 3ASO B; 1S72 V; 4LFC B; 2QM4 A; 1AJN A; 1E1R G; 3GVM A; 2LQT A; 2WLL A; 3FD9 A; 4MS2 A; 2UXD O; 2P7T C; 1GKF A; 4TV9 A; 1EN4 A; 1WPX A; 4Q20 A; 3CRR A; 4CZZ A; 2V7Q G; 4I7Z B; 1Q82 W; 5LYJ B; 2R9R B; 2D2C B; 4NYK A; 2YIB D; 3CB2 A; 1IX9 A; 2YIB A; 5LMU O; 4FM0 A; 1H2G A; 3FAV A; 3O9O A; 4RQE A; 2JGD B; 1OHH G; 4DUY O; 1FXK C; 2Z3Y A; 4PV1 B; 3CCQ V; 1N36 B; 1NH2 B; 1R3I C; 1FPO A; 5CBF A; 2OCH A; 1HP8 A; 1NQT A; 3SPJ A; 1AI7 A; 1N32 B; 3JYC A; 3K57 A; 2BCC H; 1ENV A; 3J7A U; 3BVO A; 5IYD O; 4JGS A; 2VS0 A; 2EJR A; 3IJ4 A; 1AI6 A; 3ZMT A; 2DYR C; 1COW G; 5L3E A; 4UCV A; 2GTS A; 2Q73 A; 3OAA G; 4WBN B; 5KAF Z; 1YIT V; 4LF7 B; 2CGN A; 1WA8 B; 2Q8V A; 4YHH B; 2OTJ V; 2DYS B; 1HNW O; 5L3G A; 1BHB A; 3G80 A; 2CTQ A; 5KMG A; 4TSF G; 5A9G A; 5IJ0 B; 4PA6 A; 3ICX A; 4D7T A; 1NTK H; 3FFQ A; 1ROP A; 3RFR A; 2IJJ A; 2UXC O; 3HKD A; 4NVP A; 2Q7H A; 3WB1 A; 3W7T A; 4LWS A; 4EKW A; 5C93 A; 3ZRW B; 3FB7 C; 3QG5 A; 4F6R B; 3A2F A; 1IBL B; 1PNM A; 4L8J A; 4X20 B; 1G6U A; 2AGA A; 3STL C; 2LFS A; 2ADP A; 4X1Y A; 1IBM O; 4HZ3 A; 5L3D A; 4DW0 A; 3T1Y O; 4NXM O; 3IC7 A; 4I9W A; 4OPH A; 1Q7Y W; 1BQ0 A; 3SYO A; 3GWO A; 4FM2 A; 4GT1 A; 3FB5 C; 2QA4 V; 1KP2 A; 3CRC A; 4JI8 B; 1RPR A; 1GN3 A; 1WN7 A; 1VQO V; 3BFR A; 3JD0 A; 2PF4 E; 2KQX A; 4JI7 B; 4BAY A; 2QR4 A; 4OPA A; 1FD9 A; 4YIO A; 5IY5 C; 3F7Y C; 3ZCC A; 1ZSP A; 2EZO A; 1SER A; 4MTX A; 3EXA A; 2WSS G; 1Q3E A; 4EFB A; 4TQD A; 1MAB G; 4PJ0 Z; 3BA9 A; 5KA5 A; 1ZAU A; 1FXH A; 3RYH B; 1K7D A; 5C8Y B; 4A5U B; 2WAM A; 4QE7 A; 2ATK C; 2A0L A; 1YSC A; 1RM1 C; 2UU9 B; 1P49 A; 4WFB V; 2ZM6 O; 1ZTE A; 2KSD A; 3WB0 A; 1WPB A; 3RYI B; 3JAR A; 4JV5 B; 3OEE G; 2YSU B; 3E8G A; 3BAB A; 5CBH A; 1S5L Z; 4K35 A; 2E74 B; 1XL4 A; 2ZR2 A; 3ZRV A; 2ZE7 A; 4K8Z A; 1QBZ A; 3ZHQ A; 1QNM A; 2EIK C; 2DW4 A; 4RAI A; 3MAQ A; 5DED A; 1YJN V; 4BIO A; 1SES A; 4TWK A; 1A32 A; 3AG3 C; 4JYY A; 1MOF A; 3N2K A; 1E79 G; 5CN0 A; 2F43 G; 4Z1V A; 4DV7 B; 3CMA V; 1MZF A; 3B09 A; 2E75 B; 3EHB B; 1Q86 W; 4KUM A; 4O4I A; 1SQV H; 4LBE C; 4DR1 O; 3ASO C; 3LDC A; 1MG1 A; 1UPG A; 4J7Z A; 1VQ8 V; 1K33 A; 4GKJ B; 3UO3 A; 3LSS A; 3T2M A; 2FML A; 1RSO B; 4GCZ A; 3M99 B; 2HP8 A; 3ABL B; 2PI5 A; 4DV0 B; 2IJI A; 1US6 A; 1K9M W; 2CK3 G; 1JVM A; 2UUB O; 3CX5 F; 2XAJ A; 4U7O A; 4B3R O; 2Q68 A; 4TT3 G; 3RYF A; 4JI3 O; 2W0X A; 1N34 O; 3HKC B; 2YEV A; 3K9S A; 4DR2 B; 4MVU A; 4JI0 B; 4KL1 A; 1KU9 A; 1VP7 A; 1RFY A; 3JAS A; 1VF6 C; 4GKK O; 3JAW A; 1YHQ V; 1DTO A; 5GON B; 2EIJ C; 4AHC A; 2ARH A; 5CA0 B; 1OCC B; 5LOV A; 4GZR B; 5LHG A; 2DQ0 A; 5IJ9 A; 1YTF B; 3JD3 A; 3JCU Z; 4LH7 A; 2WLN A; 2EIL B; 3OTO B; 1DF5 A; 4ZOL B; 1FAF A; 1DF4 A; 1I7F A; 3NR7 A; 1J5E O; 3OUF A; 2VRZ A; 3A0H Z; 4U3J B; 2BTQ A; 1NT2 B; 4O4H A; 2F66 C; 4B08 A; 3J80 N; 4XDL A; 1M57 C; 4X64 O; 1P4R A; 2KB1 A; 4O4L B; 2HFE C; 1IBK B; 5FPR A; 2A7W A; 2YDE A; 4WF9 V; 1MSW D; 3WG7 C; 2P90 A; 2X7R B; 4Z2W A; 2YID A; 4LFB O; 4J7J A; 3LDE A; 4DV3 O; 1JMK C; 2LGQ A; 4FLT A; 2L35 A; 4JI2 B; 4JI5 O; 5BR8 B; 3ZHT A; 4DV1 B; 4LF9 O; 2DJV A; 1URF A; 4UV9 A; 1N0J A; 2WA3 A; 2A79 B; 4DV5 O; 5J2U A; 2ILM A; 1Y74 B; 4F6E A; 1Y4M A; 5GTI Z; 3D36 C; 3OFN G; 4X66 O; 1MA1 A; 2A3Q A; 4B3M B; 1B04 A; 1XDC A; 4P9O A; 2ZXW B; 1VQ9 V; 2VWK A; 1UFI A; 4R50 A; 4AIL C; 2BOB C; 3JAR B; 3K06 A; 5CA1 A; 1SZX A; 3K03 A; 1BT8 A; 4DK0 A; 5EBL C; 3JAK B; 4R8C A; 1CXZ B; 4DV2 O; 1EZV H; 1XMO O; 3HKB B; 3W7U A; 5L3C A; 4RQF A; 1QCE A; 4DR7 O; 2QWR B; 3T1H O; 2O57 A; 1JX9 A; 3JAL A; 1WAZ A; 3SPC A; 2Q69 A; 5AG2 A; 1FS0 G; 2Q0A A; 4FZ1 A; 3SYC A; 1R3K C; 4JTD B; 1AP5 A; 2HEP A; 1EBO A; 4RUE A; 4JYC A; 3CCV V; 5K1X A; 1LUW A; 2ZNJ A; 1FXK B; 5IYB O; 4FVM A; 4LF5 B; 4X62 B; 2EIN C; 2B5U A; 2EJ7 A; 3SYQ A; 1H2N A; 3AK3 A; 5B5E Z; 4PD4 F; 4UCO A; 3LNM B; 1I5Y A; 4XBF A; 1K5Q A; 4AQY B; 5CB4 A; 3H01 A; 5EC2 C; 5KHI A; 1PD3 A; 2XAF A; 4WFE A; 1AVM A; 1N33 B; 1TAE A; 5B1N A; 5GW7 A; 3G6B A; 1GK9 A; 4OXS A; 3UT5 B; 4C7U A; 2OYQ A; 1SQX H; 3SPH A; 2AZ2 A; 3CRM A; 2DYR B; 2B1I A; 1U96 A; 2YEV B; 1S76 D; 2LW1 A; 3MDS A; 1M90 W; 1PKX A; 1OZ0 A; 1FFT B; 4JAU A; 4NR1 A; 4ABM A; 5BY1 A; 1VIB A; 1R3J C; 2CH7 B; 2DN9 A; 3ZIA G; 4I0X B; 3P32 A; 5D5Q A; 4JI1 B; 2WPD G; 4DR3 O; 1PM9 A; 1YI2 V; 4L87 A; 2ZDI A; 3B8N A; 2NLJ C; 4CS4 A; 3ABL C; 3H1K H; 3C90 A; 1K8A W; 4J10 A; 4J41 A; 1FFX B; 4RWU A; 1KEC A; 4ZKI A; 1NTZ H; 3AEI A; 4OX9 O; 2OTL V; 3AK2 A; 5LXT A; 2FKX A; 3L71 H; 4FM1 A; 3OMA B; 2E76 B; 4QIW F; 2GUZ A; 2UXD B; 2QTO A; 3UQ8 A; 1CPY A; 1W0K G; 3CJH A; 1NKD A; 2DE0 X; 1HNX B; 4JZ2 A; 1IVS A; 3ABM C; 5LGN A; 4PA4 A; 4K0K O; 1PL0 A; 5J2U B; 3X2Q C; 5LMU B; 1JFF A; 4BIZ A; 1L0N H; 4TQF A; 1HWY A; 5BMV B; 4PDM A; 1OCC C; 1QU7 A; 3E2E A; 2GHY A; 1VQ6 V; 2IJK A; 5IY5 B; 4JF3 A; 4DUY B; 4X1K A; 4LF6 B; 3L74 H; 1SA0 A; 2RNB A; 2UXB O; 2ZNI A; 4UCS A; 2DMX A; 1NU1 H; 4LH6 A; 4JZG A; 4GX2 A; 2CUG A; 3QNE A; 1HR0 O; 4I55 B; 1GAX A; 5DN6 G; 2QKS A; 1F51 A; 2FYU H; 1RM1 B; 3RN4 A; 4H0L B; 2VWJ A; 1Q90 D; 1XI1 A; 1Q81 W; 2YUA A; 2A9H A; 5IE9 A; 4YIP A; 1BQZ A; 1QVG U; 3SPG A; 2HVJ C; 2GSM B; 2LP7 A; 5JJN B; 5J9P C; 5H2F Z; 5ITZ A; 3TJT A; 1Y76 A; 2UXX A; 4FLV A; 1HNW B; 2Z5U A; 4B3S B; 4NTY A; 2AZ0 A; 3AG3 B; 3RWR D; 2XT9 A; 4IIJ B; 2BSK B; 4YJ3 A; 3ZRS A; 3RVY A; 1I94 O; 2UXC B; 4JAV A; 2ZXW C; 2VQF O; 3T1C A; 3OM3 B; 4PA9 A; 2P4K A; 1VQK V; 4PI2 A; 5F2V O; 3FB8 C; 3QO8 A; 4R6Z A; 5BZB A; 3DXR A; 1S77 D; 1IBM B; 4YY3 B; 1M56 C; 4CH5 A; 2Q7E A; 3T1Y B; 4NXM B; 1O9G A; 3QTC A; 3ZMZ A; 4G28 B; 1F23 A; 1F7Y A; 4I4T B; 1GN2 A; 2OCC C; 3D3Q A; 3Q4H A; 2HLD G; 2IBZ H; 4G27 B; 4FFB B; 2F23 A; 2OIG A; 2W6J G; 1MNG A; 2QWN B; 3B40 A; 2QSA A; 3PJS K; 2EIJ B; 2YIA A; 3TXS A; 5LMN B; 2CDY A; 2YXH A; 1G1X B; 4EB6 B; 1OJH A; 2RJZ A; 1VQ4 V; 4IL6 Z; 5EYP A; 4UCU A; 4MTF A; 5LXT B; 1F4M A; 1K5S A; 3IC9 A; 2Y69 C; 1FJG B; 1KQS U; 4DV6 O; 4EFE A; 3TCU A; 4MVZ A; 3GB7 C; 3CJH B; 4FLZ A; 1M57 B; 4FZ0 A; 4B3T O; 4ZI7 B; 1XNQ O; 3S3W A; 1X4T A; 1K4D C; 3FX7 A; 2UUA O; 3WG7 B; 3K0G A; 1JFF B; 4O4J B; 1H38 A; 1AP6 A; 2IH3 C; 4DRX A; 2QWQ B; 4X65 O; 2ZQM A; 5DM6 V; 1K3E A; 4TV8 B; 4LF4 O; 5KA6 A; 4FLU A; 1X59 A; 1L8D A; 1IXM A; 2X6B A; 2YXL A; 4FLW A; 3CC2 V; 3AG2 B; 5IYZ A; 1TUB A; 5LA6 A; 3U0Z A; 5CMU A; 1VF5 B; 4KFM A; 1Z5V A; 4GX5 A; 4UUJ C; 2H8P C; 3UM7 A; 1SET A; 2LGW A; 3K5N A; 4LFC O; 1YVW A; 4MW8 A; 3SGI A; 2QE7 G; 3RVZ A; 4J9Z B; 4I50 B; 1VEW A; 2E5L O; 2Q5Z A; 4B3R B; 1OCR B; 1SC5 B; 3W7W A; 4UXN A; 1N8R W; 5KHJ A; 1Q43 A; 2X0L A; 3JAT B; 5EZY B; 5KLV H; 1N34 B; 3BRC A; 5EK0 A; 2UUC B; 1TA8 A; 3BHP A; 4LCU C; 2JGU A; 1NI8 A; 1JOY A; 4MVR A; 1LR1 A; 2PTM A; 3ETE A; 3ZMU A; 2KKW A; 2K1E A; 4GKK B; 1WNS A; 1KUQ A; 4YJ2 B; 3FYE B; 4HNA A; 3JD4 A; 2AHY A; 2GDS A; 2Q7G A; 3CCJ V; 1CP9 A; 2EIN B; 4GX0 A; 2XAG A; 3CSX A; 2WLL B; 3DXR B; 3K59 A; 4O2A A; 4RUF A; 5IDJ A; 3N27 A; 5B1B C; 4TV9 B; 2GBO A; 2XHB A; 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3AG2 C; 1L1F A; 1XNR O; 2Y4U A; 5HFL A; 3E22 A; 2X6A A; 3RT3 C; 3WU2 Z; 4KXR A; 3DTU B; 3IGA C; 5JH7 A; 5FL7 G; 1AR4 A; 3P30 A; 4LF8 B; 1S5J A; 1SS3 A; 3H1L H; 3SYA A; 4R7C A; 1B06 A; 4O2A B; 5FNV A; 5L3B A; 2OIE A; 1ARO P; 2QDO A; 1SRY A; 1XRE A; 4JI6 O; 5D5P A; 1BE3 H; 1B3Q A; 1BL8 A; 1XMQ O; 4DW1 A; 2EUL A; 4MW3 A; 4FLY A; 4OX9 B; 4GKJ O; 2PZS A; 3AG7 A; 1OCR C; 1LUV A; 1NVP D; 4PI0 A; 3ABU A; 1FXV A; 1M56 B; 2EIM B; 2Z0A A; 1ZUQ A; 4JAA A; 1UJW B; 2AW9 A; 3VQV A; 4CH3 A; 1I08 A; 3E8F A; 3E83 A; 2ADQ B; 3LSU A; 3STZ C; 1XBL A; 3N2K B; 2CTR A; 3JAM N; 1ORQ C; 1KD1 W; 3KCX A; 1TVK A; 3P3N A; 2C2A A; 5TIS Z; 2ITD C; 4K0K B; 4O4I B; 3EVK A; 2OCC B; 4W4K A; 1SQF A; 5JQG A; 3CS5 A; 4IYH A; 1IXB A; 1J95 A; 4JI0 O; 1CEZ A; 4DO2 A; 4O2B A; 1I5X A; 2YXY A; 5L3F A; 2UXB B; 2W6I G; 4B7E A; 1R6N A; 5H6Q A; 2PYJ A; 1Y6X A; 1GM7 A; 3KCY A; 2K9P A; 1FYJ A; 1AR1 B; 3UCS C; 3H9V A; 3K5L A; 3CPW U; 2Y69 B; 3CYO A; 3RYF B; 3ZMV A; 3D8C A; 1S3J A; 4LFA O; 3RYC A; 3BY6 A; 3DSQ A; 3JAS B; 3JAW B; 4BIU A; 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