The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
47
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structure length |
47
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Chain Sequence |
EGQSDERALLDQLHTLLSNTDATGLEEIDRALGIPELVNQGQALEPK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Mutual synergistic folding in recruitment of CBP/p300 by p160 nuclear receptor coactivators.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Transcription
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| source organism |
Homo sapiens
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| molecule keywords |
nuclear receptor coactivator
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| total genus |
18
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| structure length |
47
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| sequence length |
47
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| ec nomenclature |
ec
2.3.1.48: Histone acetyltransferase. |
| pdb deposition date | 2001-11-06 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Nuclear receptor coactivator, Ncoa-type, interlocking domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1KBH A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5IY5 B; 2EIL B; 3F5T A; 4FFB A; 4J10 A; 1F23 A; 4FM0 A; 3M7M X; 4P9O A; 4X65 B; 2ZNJ A; 4W4L A; 3N2G A; 4ZHQ B; 4Z1M G; 1U97 A; 4YJ2 A; 1VQ6 V; 1ORQ C; 2BSK A; 1QHT A; 2IW5 A; 1WPB A; 3QG5 A; 3A8T A; 1O9G A; 4LH7 A; 1ZL8 A; 1V9P A; 2PF4 E; 1YF2 A; 1S3J A; 3F7Y C; 3LDC A; 2N05 A; 3THO A; 3B2E E; 3CME V; 1QQC A; 1IX9 A; 4RO2 A; 4LBE C; 1K7D A; 2XHB A; 2JGU A; 1OCZ C; 3K79 A; 4WBN A; 3RYF B; 4ZOL A; 4PDR A; 3ASO B; 4ABM A; 4A5U B; 5LOV A; 4RWU A; 1XUQ A; 3CCJ V; 1WP7 A; 4L8J A; 2DYS C; 5EIB D; 3H1H H; 2DQ3 A; 2ZE8 A; 5LMU B; 4MVQ A; 1QNM A; 3B09 A; 3OFN G; 2UUB O; 5LXT A; 4JYY A; 4MVU A; 4UXN A; 5D5Q A; 4FZ0 A; 2ETN A; 2GTS A; 1WLE A; 2QM8 A; 4RAI A; 1VIB A; 2FB5 A; 3J7A U; 3WB0 A; 5GON A; 3JAT A; 4JI0 B; 2AZ0 A; 2ZM6 O; 2YXL A; 3ZHT A; 1AJN A; 4BR6 A; 5LGN A; 3N27 A; 4TT3 G; 1K92 A; 2HVJ C; 2KG7 B; 2LW1 A; 3G6B A; 1U96 A; 3K57 A; 3DSQ A; 1FJG O; 3LNN A; 1JX9 A; 1MZE A; 3CJH B; 1TVK B; 4BAY A; 4B3S O; 3B8M A; 5IJ0 A; 5CMU A; 3UCS C; 1YDX A; 4J7J A; 4K3A A; 5B5E Z; 2WPD G; 3W7S A; 2DYR B; 2EX3 A; 2OYQ A; 2H8P C; 1GM7 A; 3JSN A; 4X1Y A; 4DXW A; 2P7T C; 3NXS A; 3WFV A; 1IZ3 A; 4QJF B; 2EIJ B; 3ABL B; 1WNS A; 2UXB O; 4K35 A; 4XDL A; 4TSF G; 2A9H A; 5HFL A; 3E8F A; 3DGE A; 1QLN A; 3HKB B; 3H1J H; 2ZDI C; 3RYH A; 1AI7 A; 1DK1 A; 3AG7 A; 4OX9 O; 4LCU C; 4DRX B; 1BGY H; 1H2K A; 4DUY B; 1D5A A; 2YDE A; 2D2C B; 4I9W A; 4MTG A; 2ITD C; 2R70 A; 1NR7 A; 4HNA A; 2GV9 A; 4JPR A; 5LHH A; 2QM7 A; 5B3S B; 1ZTE A; 4MTX A; 2DMX A; 5J9P C; 4JI3 B; 5H2F Z; 1Y76 A; 3UQ8 A; 3OEH G; 1NI8 A; 2JGD B; 4KFM A; 1I0H A; 1NVP B; 2JEU A; 4QIW F; 3OW2 U; 3OGI B; 1K97 A; 1Z5W A; 3RYF A; 2Q8V A; 2EIN B; 2HHH B; 3OR6 C; 1TGO A; 3ZHR A; 1VMG A; 4JAV A; 2G38 A; 4JAS A; 3OR7 C; 4KHP O; 5JJJ B; 2RMK B; 2JVD A; 1SZT A; 3JAL A; 3F5W C; 4FLX A; 1EN4 A; 2W6I G; 1FPO A; 3HKE B; 1XMO O; 4LF7 O; 2HJF C; 3N2K A; 4C7U A; 2QWQ B; 3QO7 A; 3JAK B; 2Q68 A; 1FXK B; 1Y74 A; 3LDD A; 3T1H B; 4DV4 B; 2EUL A; 3VOU A; 1HR0 B; 4UV8 A; 2HJD A; 5BY1 A; 3W7W A; 1M9N A; 4DR2 B; 4O4J B; 4TV8 B; 3RT3 C; 2KG7 A; 2JIZ G; 4JGS A; 1OHH G; 2Y4U A; 2VQE B; 1AI6 A; 3T4D A; 2HKO A; 4PDM A; 5B1N A; 1NH2 B; 5KX5 B; 4FM2 A; 1TVK A; 1MAB G; 4I0X B; 1BHA A; 3QTC A; 3OD4 A; 2CGO A; 3ZJZ A; 1N32 B; 4NKG B; 1ZX3 A; 3FD9 A; 1LNQ A; 3GVM A; 1YIT V; 4LFB O; 5IE9 A; 2QE7 G; 4H0L B; 3SYC A; 2AXT Z; 4X1K A; 5LMN B; 3CRR A; 2B5U A; 3D3Q A; 3PN1 A; 2H94 A; 3HKB A; 1KP2 A; 1R6T A; 3B4S A; 2QSA A; 1M1K W; 2FML A; 2Q5Z A; 3CCM V; 4I9Q A; 1NJI W; 5EIB C; 2VRZ A; 5C8Y B; 4DR4 O; 1NTM H; 5K1P A; 1JA8 A; 1M56 C; 4HZ3 A; 3ZMT A; 1VF6 C; 2QTS A; 1MZF A; 5F2V O; 1VAR A; 2BTQ B; 3SPI A; 2X6B A; 1H2N A; 2QTO A; 3DC6 A; 1XI1 A; 1Q90 D; 4W4K A; 2Q4P A; 4UCU A; 3WU2 Z; 2LFR A; 1OV9 A; 2ILM A; 5BR8 O; 2PY5 A; 3DXR A; 2Q9L A; 2XAF A; 3RBZ A; 1F51 A; 2X6C A; 1L8D A; 1SQV H; 5KHK A; 3VQW A; 3CCU V; 3FYI B; 5KLV H; 1J5E O; 3JAW A; 5JVD A; 4LWS A; 3IC7 A; 1AP5 A; 5IT9 N; 1H2S B; 2UUB B; 4F6E A; 4MW8 A; 4I50 A; 4WFH A; 2Y69 C; 4K0K O; 3SYQ A; 2HLD G; 1R6N A; 4R50 A; 4Z2W A; 3EXA A; 4P30 A; 1HW7 A; 3ZRS A; 3AK3 A; 1K34 A; 4B3R O; 1YJW V; 5EBL C; 5J2T A; 2X7R B; 5LA6 B; 2YI8 A; 4DV6 O; 4K8Z A; 2EZP A; 2XAS A; 3JD4 A; 4LF6 B; 4ASU G; 3ABK C; 3M99 B; 1FJG B; 3D36 A; 3CC2 V; 2GUZ B; 3D8C A; 1DF4 A; 1GN4 A; 4DR3 O; 1DLB A; 4FLZ A; 4L87 A; 1JFF B; 2JS5 A; 5LBQ A; 3CXH F; 4B3S B; 4LNU A; 1SES A; 2CTP A; 3AG4 B; 3BRC A; 4CS2 A; 4NXN O; 5A2Q N; 4G2K A; 1JCH A; 3L72 H; 3ABM C; 1BQ0 A; 3AG1 B; 4UVA A; 1V54 B; 4J9Y B; 1UPG A; 2EIK B; 4JTA B; 4O4H B; 3TGU H; 1OCC C; 5CA3 A; 3WB2 A; 4RUF A; 4LF4 O; 4JYB A; 3HKC A; 3CYO A; 3L73 H; 4FFB B; 5CN0 A; 4WF9 V; 1IUR A; 1GO3 F; 3G71 V; 4LF5 B; 2A7W A; 4I5S A; 4OX9 B; 3N2G B; 2ZIO A; 3CCV V; 4B3M B; 3JCZ A; 4HAM A; 5C8Y A; 2YS8 A; 4MVR A; 4YJ2 B; 2ITC C; 5JCO A; 2BSK B; 2KSD A; 4BIZ A; 2E75 B; 1ZL8 B; 5B1A C; 1QVF U; 2WSS G; 3W7U A; 2YXH A; 3HB3 B; 3B8N A; 1JMK C; 1Q6H A; 2N04 A; 2LQT A; 3ZBH A; 3SPC A; 3K04 A; 4WBN B; 4ZOL B; 2ZXW B; 5CA0 A; 5LOV B; 1GAX A; 2WLI A; 3ZHU A; 4AI8 A; 4XBF A; 4UVC A; 4X89 A; 5LXT B; 4GKJ O; 4XDK A; 1YCI A; 2XAQ A; 1YZB A; 2E74 B; 5CA1 A; 4JF3 A; 1QVG U; 1R3L C; 1XMO B; 5GON B; 3U10 A; 3JAT B; 4GUN A; 2GDS A; 1KYO F; 4DV5 O; 1WN7 A; 4NR1 A; 1RSO A; 1W2B U; 5KAI Z; 3IFX A; 3RVY A; 3TXS A; 3J81 N; 1FFT B; 2PUS A; 4QE7 A; 4FIP C; 3UT5 A; 3TJT A; 1E1Q G; 3K08 A; 1BCC H; 4Q6G A; 1M5I A; 2AHZ A; 4UUJ C; 4O4L A; 2A3Q A; 2JDI G; 3OM3 B; 4E2L A; 3JCU Z; 3BPZ A; 1QR8 A; 2QM4 A; 3MHH C; 2GUZ A; 3JAR A; 1EN6 A; 4R8C A; 2JS3 A; 5IJ0 B; 3F7V C; 1AR5 A; 3FX7 A; 3L71 H; 2VQF O; 3LUT B; 1JJO A; 3HKD A; 1N0J A; 3STZ C; 1YTF B; 2Q0A A; 2NNU A; 4X1Y B; 5KHH A; 4JYA B; 5B1O A; 3UM7 A; 4LFC O; 4JI8 O; 3H9V A; 2CTR A; 2OIG A; 3KZI Z; 1SQF A; 3HR0 A; 3A0R A; 1N0N A; 2QA4 V; 1NZ6 A; 1B3Q A; 1OJH A; 1MMM A; 3ABU A; 3AG2 C; 1HNW O; 4GKK B; 1GN3 A; 3RYH B; 4DR1 B; 1S5L Z; 4FLV A; 4IYI A; 4YIO A; 1Q8I A; 2CTQ A; 1QBZ A; 1PKX A; 2V1D A; 2Z0A A; 3OTF A; 1SF9 A; 4LFA B; 3SGI A; 3CCE V; 1Q86 W; 2L35 A; 4IYH A; 4QE9 A; 5C93 A; 4WCE V; 4HNA B; 1PP9 H; 3L70 H; 4UCO A; 2RDC A; 4JI1 O; 4HBN A; 2YIA A; 4O4I B; 5BR8 B; 2WLM A; 4JAA A; 1QLE B; 1Y76 B; 1VP7 A; 3E83 A; 3K5N A; 4WFG A; 1VF5 B; 1XBL A; 2UUC O; 5IWA O; 1NVP D; 1TAE A; 1XMQ O; 2EIM C; 4MS2 A; 3RVZ A; 1J5E B; 3CB2 A; 4LF9 O; 3IC9 A; 3BFR A; 4JZG A; 4X88 A; 3BAA A; 3KG2 A; 2C2A A; 2FKX A; 1YXB A; 4ICG A; 1SC5 B; 2A79 B; 2DOS A; 1KB9 F; 1VQM V; 4K0K B; 3ASN C; 2P06 A; 3JAL B; 3X2Q B; 4DV0 B; 2IJK A; 1XHX A; 2HG5 C; 5EBM C; 5FNV A; 4WFF A; 2RQ6 A; 3N2K B; 2ZIM A; 2LO1 A; 4PEL A; 5IY5 C; 1MSW D; 1HNX B; 1N33 O; 4BWA A; 4DV6 B; 1Y74 B; 2R9A A; 4KXR A; 1XQ8 A; 2JJ1 G; 3AG3 B; 2Q7G A; 1E79 G; 2V7Q G; 4X1I A; 1KU9 A; 3G4S V; 4DR5 O; 1V55 B; 4QPK A; 4DR3 B; 1M57 C; 1VQP V; 4EKW A; 2IH3 C; 1KEC A; 1N34 O; 2W0X A; 1G8M A; 2VS0 A; 4F6R A; 5BZB A; 4DV7 O; 4JI5 O; 4NXN B; 1PNL A; 3K0G A; 1IBL B; 1FD9 A; 1IXB A; 4JI6 O; 4D7S A; 4MW3 A; 1GKF A; 3JD2 A; 5CBH A; 3T2M A; 3CD6 V; 4DR7 O; 3BAB A; 3RYC A; 1Q6U A; 4JI7 B; 4RQF A; 1Q3E A; 2EJ7 A; 3ZHQ A; 4GX5 A; 1S77 D; 1FXV A; 1K5S A; 1Q81 W; 2PZS A; 4ZBM A; 1ARO P; 4JTD B; 3RFR A; 1Z2G A; 3JAM N; 4X1K B; 4LF4 B; 4JI2 B; 1FFX A; 2RNB A; 2IJI A; 3FFQ A; 3JAS B; 1CP9 A; 1R3I C; 5EC1 C; 3CE2 A; 5KMG A; 4X62 O; 3ASO C; 4P9P A; 2EZO A; 1Q5O A; 5IYZ B; 2RCV A; 4H44 B; 5JH7 A; 1ZSP A; 2JEX A; 2P4V A; 1AR1 B; 4DO2 A; 4NXM O; 3CCL V; 2Q73 A; 5FPR A; 3P3N A; 1XNR B; 3RGB A; 2F4V B; 2WLN A; 1Q6I A; 4DV3 O; 2CGN A; 4PI2 A; 2CK3 G; 4O4I A; 3DXR B; 1K73 W; 2DN9 A; 3EHB B; 2NR5 A; 1K4C C; 3QF7 A; 1VQ4 V; 3ZHV A; 4CH5 A; 5L3C A; 5CB4 B; 2QDO A; 5KHG A; 4X64 O; 3SJB C; 1BL8 A; 2PTM A; 2Y0P A; 1Q7Y W; 4CC5 A; 4JI4 B; 1XL6 A; 2ODM A; 1WB7 A; 3UO2 A; 2Z5U A; 3JAW B; 3OTO O; 5JVD B; 4LWS B; 2PGG A; 1AB3 A; 3SJQ C; 4YJ3 A; 4GKJ B; 3E35 A; 4J9Z B; 4YY3 O; 1SKV A; 4I50 B; 2YIB D; 1RP3 B; 3K5O A; 4NTX A; 5D5P A; 5B66 Z; 1BHB A; 2EIJ C; 2ZCE A; 2GBO A; 5LGT A; 4DV5 B; 3E8H A; 5B1B C; 2ZDI A; 5J2T B; 1O9H A; 1XOU A; 3CP1 A; 1GN6 A; 4DW0 A; 4R6Z A; 1F4M A; 2A0L A; 2AZ2 A; 1WB8 A; 4G27 B; 2EBO A; 1TA8 A; 1W0K G; 1GMG A; 5AG2 A; 5DM6 V; 2R72 A; 4FMT A; 4LF8 O; 4PDV A; 1JPX A; 4LNU B; 4FZ1 A; 5IJ9 A; 2ADQ B; 1IBK O; 5EZY A; 1N36 O; 1IBM B; 3RW0 A; 1G1X B; 5BMV B; 4IIJ B; 3MDS A; 2YI9 A; 4JI8 B; 1TUB A; 1XEQ A; 1HWY A; 5LL6 Y; 2EJR A; 3JSL A; 4F4L A; 2IJJ A; 3I55 V; 3ZMV A; 2HEP A; 3HKC B; 3FB5 C; 3CCS V; 4J42 A; 4N23 A; 3ZMZ A; 1HNW B; 1Q43 A; 3JAS A; 4RQE A; 2QEX V; 3ETE A; 1SQQ H; 2CTW A; 2EIN C; 3ZMU A; 3OUS A; 3CEI A; 3OE7 G; 5IYZ A; 3CMA V; 2VWK A; 1EZV H; 2W0F C; 3CWB H; 4CH3 A; 2BE3 A; 2XUM A; 2XTA A; 2RN9 A; 3L74 H; 3K9A A; 5E1A C; 4U7O A; 1YVW A; 3CRC A; 3FAV A; 1MNG A; 3G6E V; 4JI1 B; 3TK1 A; 1P49 A; 2JJ2 G; 3B40 A; 4DR6 O; 4X65 O; 3U11 A; 3E8B A; 3EFF K; 1FXK C; 4MSW C; 1MA1 A; 1BMF G; 3RN4 A; 4J80 A; 5IWA B; 3CC7 V; 1P4R A; 1FAF A; 1EFR G; 5CB4 A; 2OCH A; 4E4E A; 4EFE A; 4LF9 B; 1H2L A; 5CA0 B; 3ABM B; 4GT1 A; 2YID A; 1NBM G; 2WLI B; 1I7F A; 1QCE A; 5EC2 C; 2WLJ A; 1VQO V; 3ZRX A; 3E2E A; 2CDY A; 3GWK C; 1VQ5 V; 1JR9 A; 2IH1 C; 1H2M A; 3VQY A; 2PYL A; 4J7K A; 4K8X A; 5CA1 B; 5IDJ A; 3K5L A; 1OCR B; 2ZM6 B; 4BW5 A; 1WAZ A; 2DWE C; 1RSO B; 3ZRW A; 3Q4H B; 4CC6 A; 1H8E G; 3UT5 B; 3ZHS A; 1R73 A; 3T1Y O; 3SPG A; 2B9Z A; 2X6A A; 4HYO A; 4DR5 B; 4O4L B; 2AW9 A; 4O2A A; 4U7N A; 1VF6 A; 4OGQ B; 3LDE A; 1NTK H; 2OTJ V; 1N34 B; 3JAR B; 5LP6 C; 3K0D A; 2F93 B; 1NR1 A; 3FYE B; 4JI5 B; 4DV7 B; 4DK0 A; 2CH7 A; 4JV5 O; 3BY6 A; 2UUA O; 4UV9 A; 4TQD A; 3HKD B; 1YTF D; 1XNQ O; 4OPA A; 4DR7 B; 3BA8 A; 1NU1 H; 1THZ A; 3UO3 A; 5BMV A; 4IIJ A; 3TCU A; 4G28 B; 1PD3 A; 2RJZ A; 3K9S A; 2YEV A; 2E5L O; 2Q69 A; 1L0N H; 3GWO A; 4P2Z A; 2UXB B; 1KBH A; 2NLJ C; 1JQ0 A; 4X20 A; 1Y66 A; 1F7Y A; 5L3F A; 4AIL C; 2KKW A; 4GLX A; 2PYJ A; 4FK5 C; 2YC0 A; 1IVS A; 5KHI A; 3VBB A; 2E3C A; 5LHI A; 4NXM B; 1AJP A; 4NVP A; 2F1M A; 4Z1V A; 1MG1 A; 3CRQ A; 4RUE A; 1KD1 W; 1AVM A; 2WLH A; 4UCV A; 1R3K C; 3C90 A; 3K3W A; 4DV3 B; 4R7C A; 3A0B Z; 1H38 A; 5LGU A; 1GRJ A; 3ICX A; 4GYC B; 2LGW A; 2QKC A; 3HPL C; 4DUY O; 3T4Z A; 4X9Q A; 4X64 B; 1PL0 A; 2WLL A; 2AGA A; 2L6L A; 4GZR B; 2ZE6 A; 3SJC C; 2OCC B; 1GM8 A; 3OTO B; 2ADP A; 2QGN A; 3AG4 C; 4WFE A; 1AI5 A; 4JAU A; 2Q7H A; 2IU3 A; 4JZ2 A; 4JI3 O; 4KHP B; 4YY3 B; 3AG1 C; 1OCO B; 2F43 G; 3S3X A; 3ETG A; 1V54 C; 3ABT A; 3QNE A; 1JVM A; 1LUW A; 3SPJ A; 5GTI Z; 4IHJ A; 2F66 C; 5TIS Z; 4MTF A; 2EIK C; 2IM9 A; 3AG2 B; 5FNV B; 1GTO A; 2ZIN A; 1FKA O; 4LF7 B; 2GHY A; 3E22 B; 4TV9 B; 3VQV A; 2MW2 B; 2QJ1 A; 3Q4H A; 4PA9 A; 2FL4 A; 4AQY O; 4X1I B; 4UCS A; 4TWK A; 1RM1 C; 4FLW A; 1K9M W; 4LF8 B; 2MK3 A; 4F6R B; 1R3J C; 2JRI A; 3ETQ A; 2LGQ A; 1IBK B; 3ETD A; 2YUA A; 2OT5 A; 4PI0 A; 5DED A; 1HR0 O; 3WG7 C; 1R6K A; 3RYC B; 1EN5 A; 2Z3Y A; 2V4D A; 2DJV A; 2QWR B; 3G67 A; 1OCZ B; 1P7G A; 3JD3 A; 3LSU A; 4LFB B; 2VQE O; 5LYJ A; 5FLX N; 4EEQ A; 2Q7E A; 2UXN A; 1Y67 A; 1FFX B; 4PA3 A; 1VQL V; 1PM9 A; 4KL1 A; 5H6R A; 2UXD O; 3O9O A; 3TXQ A; 5KMG B; 2DYS B; 4GX0 A; 3SDL A; 1K33 A; 1ZUQ A; 5JH7 B; 3ASN B; 1K4D C; 1NQT A; 2P67 A; 2Q6A A; 2BCC H; 4DUZ O; 3FB6 C; 4ZI7 B; 4DR4 B; 3OMI B; 5EYP A; 2O57 A; 3R66 A; 1GK9 A; 1BQZ A; 1S5J A; 5LMN O; 2M7W A; 5BXZ A; 4FM1 A; 1HP8 A; 2QWN B; 4H13 B; 2Q0O C; 1KKC A; 4DR6 B; 4FFK A; 3FKS G; 3ZCC A; 1CPY A; 2HP8 A; 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