The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
33
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sequence length |
103
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structure length |
94
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Chain Sequence |
MEAKTMKDMQKEVDAYIGQFKEGYFSPLAMMARLTEEMGELAREVNHYYGERSIEEELGDVLFVMICMANSLNIDLETAHNIVMNKFNTRDKDR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Nucleotide pyrophosphohydrolase
|
| publication title |
Crystal structure of the Bacillus-conserved MazG protein, a nucleotide pyrophosphohydrolase.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Bacillus cereus
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| molecule tags |
Hydrolase
|
| total genus |
33
|
| structure length |
94
|
| sequence length |
103
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| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-02-25 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | MazG-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2OIE A; 3CRA A; 2Q9L A; 2GTA A; 2YXH A; 2A3Q A; 2OIG A; 3CRC A; 1YVW A; 5IE9 A; 1YXB A; 2A7W A; 1Y6X A; 2Q5Z A; 2P06 A; 1VMG A; 4QGP A; 2Q73 A; 2Q4P A; 3C90 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4RO2 A; 1AJQ A; 2OCH A; 3RW0 A; 2ZNJ A; 1BS3 A; 4DR2 B; 5DM6 V; 1GMG A; 4K0K B; 4LWS A; 2A79 B; 2QTS A; 4X1I A; 4EB6 A; 5CN0 A; 5KHJ A; 2EIM B; 1XMQ B; 2XHB A; 1XBL A; 3WB2 A; 3EHB B; 4Z1V A; 2YEV B; 1VQ9 V; 3E35 A; 1K5S A; 3OUS A; 1D2D A; 1NR7 A; 3SPC A; 2ZE8 A; 4KXR A; 4B7E A; 4LF4 B; 1P7B A; 3WU2 Z; 1FPO A; 2XAJ A; 1WN7 A; 2GUZ A; 4ZOL B; 5KHI A; 3K5O A; 2AHY A; 1JMK C; 3IJ4 A; 1VF6 A; 1TUB B; 1F4M A; 4O4J A; 5CA0 A; 2EIN B; 3K0D A; 4UV9 A; 3CRA A; 3ZED A; 1VQ5 V; 2Q0A A; 2Y4T A; 1JJ2 U; 1ZWI C; 1K8A W; 1T5E A; 2YXY A; 2QSA A; 4LF5 B; 3NR7 A; 4LP8 A; 5B1A B; 3T4D A; 3K04 A; 1GN2 A; 1WB8 A; 1AI4 A; 2QR4 A; 3ABK B; 4MW8 A; 2EIL B; 3JD3 A; 1L8D A; 3TJT A; 3HKC A; 2HG5 C; 2Q9L A; 4RWU A; 3WG7 C; 4YJ3 B; 4E4E A; 4UVC A; 2HJF C; 4OX9 O; 3ABL B; 5BMV B; 1K73 W; 2A9H A; 4U7N A; 1PKX A; 2PI5 A; 2ZR3 A; 3JAM N; 5FPR A; 2ZKO A; 4LWS B; 5IJ9 B; 2W0X A; 4ABM A; 2QM7 A; 1XQ8 A; 4JTA B; 4X8A A; 2PI4 A; 5JVD A; 4UCT A; 5LYJ B; 2Q6A A; 4JI5 O; 4QPJ A; 4O4H A; 2YUA A; 5IJ0 A; 1HNZ B; 3UT5 A; 2FTK A; 4BAY A; 4PA7 A; 2IU3 A; 3P3N A; 1QNM A; 4MVQ A; 2MK3 A; 1BT8 A; 1H2L A; 4DUZ B; 3LSU A; 1VMG A; 2ZQM A; 1LNQ A; 2ZD9 A; 5CB4 A; 5EBL C; 4WFB V; 5KHG A; 1XDC A; 3T4Z A; 4JYB A; 3OR6 C; 3JD1 A; 3ZS8 C; 1EZV H; 4AI8 A; 2GBO A; 4JAS A; 2CH7 B; 2IBZ H; 2WLH A; 1IBK B; 2E74 B; 3E8B A; 2H8P C; 4U3F H; 3ABM B; 4PI0 A; 1XL6 A; 1AI7 A; 2B1I A; 4B3R O; 4FFK A; 5IE9 A; 4TSF G; 4UUJ C; 2HVJ C; 2JJ2 G; 1THZ A; 2AXT Z; 4FLU A; 2Q8V A; 4PA3 A; 3ZRX A; 3OEE G; 1GH6 A; 3E2E A; 3H1I H; 1I94 B; 2WA3 A; 5J9P C; 3BHP A; 4I0X A; 3HKE A; 1D5N A; 5KUK A; 4MW3 A; 4G28 B; 3K5M A; 4ASU G; 4JI7 B; 4JI4 B; 5IWA O; 5H9C A; 4A5U B; 1AI6 A; 4H44 B; 2N04 A; 4LH6 A; 4NXN O; 2CGO A; 1QLE B; 3L73 H; 3OTO O; 1GK9 A; 5HFL A; 3VQW A; 5B1O A; 2X6B A; 1RSO B; 4MT8 A; 3JAW A; 5FLX N; 4J80 A; 1AJN A; 5KUM A; 1BMF G; 1J95 A; 3N27 A; 4CC5 A; 1XEQ A; 2Q7G A; 3SYP A; 1P49 A; 1L1F A; 4MS2 A; 1FJG O; 4BIU A; 1H38 A; 5BR8 O; 2K1E A; 1N32 B; 2F1M A; 3FB7 C; 2JJ1 G; 2YDE A; 2E5L O; 2XUM A; 4BIO A; 3B4S A; 3ZHV A; 1KU9 A; 4KP4 A; 4X1Y B; 2F66 C; 4JI1 B; 5JCO C; 1H2S B; 4WFH A; 5LMU B; 3O65 A; 4R7C A; 4UCO A; 2HHH B; 4H37 A; 1X59 A; 3MAQ A; 1YIT V; 4X89 A; 4DRX A; 1S5J A; 3CME V; 1M56 B; 1SA0 A; 1BHB A; 1PNK A; 2DMX A; 4NR1 A; 4FVM A; 2ZNI A; 2P5O A; 4X88 A; 2EIN C; 3B2E E; 3F7Y C; 4DR7 B; 2AZ0 A; 5D5Q A; 2UXB O; 5FNV A; 1XMO B; 4O4I A; 4DV2 B; 2IJJ A; 4Z1M G; 1N36 O; 5CA3 A; 5LGU A; 2UU9 B; 2IW5 A; 3T1C A; 3ZHU A; 2CTW A; 2LW7 A; 2YIC A; 1WA8 B; 3RYI A; 4LF6 O; 2EIL C; 4X66 B; 3STZ C; 4UVB A; 1O9G A; 2QKS A; 1TA8 A; 1FD9 A; 3NXS A; 2KG7 B; 4FFB B; 1XHZ A; 3ABL C; 2P6J A; 4ICG A; 1RFY A; 1M5I A; 3G71 V; 3JAL A; 5J2U A; 3CCJ V; 4JI2 B; 4R8C A; 3KKY A; 4DW0 A; 2XAG A; 2QE7 G; 3AK3 A; 1CXZ B; 1XRE A; 3TGU H; 3F5T A; 5K1P A; 4ZHQ B; 4K0K O; 2Q69 A; 1PD3 A; 3T1H O; 4BWA A; 3APO A; 2P4V A; 3CRC A; 4LF8 O; 3AG1 C; 1JFF A; 4J9Z B; 5LL6 Y; 3Q4H A; 2MW2 B; 3ML0 A; 1F23 A; 2Q4P A; 1CP9 A; 5IY5 B; 2PY5 A; 2WLL B; 3D3I A; 3FD9 A; 1KB9 F; 1KBH A; 2RDC A; 2JIZ G; 4K35 A; 4CS2 A; 1QR8 A; 3CJH B; 1BQZ A; 1VF6 C; 3BAB A; 3LNM B; 5EZY A; 1RM1 C; 1NT2 B; 3ABM C; 3VQX A; 4O4L B; 4UCU A; 4H13 B; 2E3C A; 1IUR A; 2RCV A; 3ZN0 A; 3IGA C; 2QKA A; 4H0L B; 4TWK A; 3CCS V; 3OAA G; 5EYP A; 1K92 A; 2RMK B; 4F4L A; 5F2V O; 3A0B Z; 4D6T H; 5LA6 A; 1V55 C; 1P84 F; 4AQY B; 3AG7 A; 4DUY B; 2D3O W; 3CPW U; 1VQO V; 2AZ2 A; 3U11 A; 3J81 N; 1SET A; 1Y76 B; 3H1L H; 4J10 A; 5EBW C; 2CTP A; 3HKD B; 4DV5 B; 5H2F Z; 2XND G; 2DYS B; 1XI1 A; 1DK1 A; 1VP7 A; 3ZMV A; 1TVK B; 3JAR B; 5E79 Z; 4JI6 B; 2QWR B; 2K9P A; 1GKF A; 3PN1 A; 5J2T B; 1IDS A; 1M90 W; 4JI8 B; 4Q6G A; 4LFC O; 2XAS A; 1GN3 A; 1Q5O A; 3ABU A; 2XAH A; 2ZIO A; 3H1J H; 3CCQ V; 1YIJ V; 4EFE A; 4LFB O; 4DR1 B; 3E8G A; 2C2A A; 1FXH A; 2WLI A; 4UXN A; 2BCC H; 1SS3 A; 1HNZ O; 1GRJ A; 1Q43 A; 4MVR A; 3OM3 B; 4BW9 A; 4JV5 B; 4JI3 O; 4MVS A; 2UUA B; 2OWO A; 2LP7 A; 4P9P A; 3HB3 B; 1M56 C; 5JWP A; 3OT7 A; 4TUY A; 4TV9 B; 2ILM A; 3JAS A; 2YSU B; 3QVN A; 1EZJ A; 1AI5 A; 1Q6I A; 4UCR A; 1VQL V; 4DO2 A; 4LC1 A; 3W7U A; 2ITD C; 4J7Z A; 2WLN A; 1R6N A; 3N2G B; 3F5W C; 4B3M O; 1KD1 W; 3OE7 G; 4YHH B; 3ZHT A; 3RYH A; 3ASO C; 3EXA A; 1I94 O; 4W4L A; 2ATK C; 3PJS K; 1N34 O; 2ADP A; 4ZI7 B; 1FYJ A; 2JDI G; 3L70 H; 1XNQ O; 4QNH B; 2P22 C; 1S0V A; 3SPJ A; 3GB7 C; 1AJP A; 4NTY A; 3I55 V; 4LF7 B; 1FFX A; 1B04 A; 3BFR A; 4NB5 A; 3SJC C; 3BPZ A; 4HYO A; 2YC0 A; 1JJO A; 4LF9 B; 2FYU H; 3OD4 A; 3SJB C; 1H2N A; 1MNG A; 2XT9 A; 4PEL A; 4HNA B; 1HW7 A; 4IIJ B; 5TIS Z; 2R9A A; 4J7K A; 3ZMZ A; 3C3T A; 1YVW A; 1K34 A; 2YEV A; 3HR0 A; 1B06 A; 1NTZ H; 3CYO A; 3LDE A; 4BIZ A; 5JCO A; 2CDY A; 2Z0A A; 2LFS A; 1FXV A; 1YZB A; 1VF5 B; 3CE2 A; 2W6J G; 5H5N A; 1Q6H A; 2WWW A; 5EK0 A; 4J11 A; 3TXS A; 3BA9 A; 4ZOL A; 2Y48 A; 5CBH A; 4GKK B; 2Q7E A; 1OCZ C; 1KKC A; 1P4R A; 4DR5 B; 4X65 O; 4IL6 Z; 1TUB A; 2A0L A; 2L6L A; 4X20 B; 5LMN O; 3TCU A; 5EC1 C; 2ZM6 B; 2IH3 C; 2QA4 V; 1XIL A; 4DR7 O; 1WP7 A; 3W7W A; 4CS3 A; 5KHK A; 3SPG A; 2OTL V; 1GN4 A; 3W7T A; 1KP2 A; 4DV2 O; 1PL4 A; 3H1H H; 5KAI Z; 3CC7 V; 4PDM A; 5BXZ A; 4PDR A; 4YJ3 A; 1XNR O; 1M9N A; 4O2B B; 2VQE B; 5BMV A; 1N0N A; 3SGI A; 2DYS C; 3ETQ A; 4UCS A; 4HZ3 A; 1YDX A; 3AG2 B; 3THO A; 2ZIM A; 3CRR A; 5IJ9 A; 2PF4 E; 1Z2G A; 1RPR A; 2ZE6 A; 3R66 A; 2LFR A; 2YXL A; 5LYJ A; 3UM7 A; 1ZLZ A; 1IVS A; 5B3S B; 2ETN A; 1NTK H; 1OCR B; 2F95 B; 2ITC C; 3QO7 A; 5L3F A; 3J80 N; 1GO3 F; 5DED A; 4G2K A; 2QWN B; 4PJ0 Z; 1RP3 B; 4RUF A; 4CH5 A; 4JYA O; 4WF9 V; 4I55 B; 4GZR B; 1HDJ A; 1WNS A; 2JRI A; 1SZX A; 4B08 A; 3HKB B; 2P06 A; 1SRY A; 2YS8 A; 2CH7 A; 1OHH G; 2OT5 A; 2OIE A; 1SQF A; 2ZCE A; 3P3P A; 3AG4 B; 2GTA A; 3L74 H; 1ZTE A; 4C7U A; 5JJJ B; 4MVM A; 3P30 A; 1H2G A; 1Q8I A; 5GON B; 3G67 A; 3ZIA G; 2X0L A; 3RWR D; 3OEH G; 5LBQ A; 4JAV A; 3RYF B; 1US6 A; 1AP6 A; 1KYO F; 1HR0 B; 4AQY O; 3CX5 F; 4KFM A; 4I9Q A; 3CP1 A; 1L0N H; 4G27 B; 4PD4 F; 4B3S B; 3M8A A; 1RSO A; 3OR7 C; 1OZ0 A; 3KZI Z; 4UB8 Z; 1YHQ V; 4OGQ B; 4DV4 B; 3FYE B; 3TXQ A; 3WB0 A; 2IJI A; 1G8M A; 2KKW A; 4JI6 O; 4NTW A; 2AW9 A; 5ITZ B; 2BTO A; 3E86 A; 4LFA B; 1SQV H; 3M7M X; 1AR4 A; 4UB6 Z; 1JOY A; 4DV6 B; 4U3J B; 3CCM V; 2ZT9 B; 2ZDI C; 3K0G A; 1HNX B; 4B7K A; 4X1Y A; 3ZRW B; 3BA8 A; 2ARH A; 5C8Y B; 2WLM A; 2WPD G; 5LHH A; 3I56 V; 3TET A; 2Q7H A; 1N8R W; 1SKV A; 4MVU A; 1VQ4 V; 5EBM C; 4DR1 O; 3A8T A; 5B1B B; 4WFG A; 3CC2 V; 4WBN B; 1D5A A; 1JVM A; 4KL1 A; 4I50 B; 4MTO A; 4TQD A; 3L72 H; 3CXH F; 4DR6 O; 5LP6 B; 2EIK B; 1ZAU A; 3SYQ A; 4JV5 O; 3G6B A; 1IBL B; 2XAF A; 3AG3 B; 4FLZ A; 3T1Y B; 3K5L A; 2V1D A; 3B8M A; 4GKJ B; 2HKO A; 1VAR A; 5JH7 B; 1F4N A; 3L9D A; 5DEC A; 3VOU A; 3DXR B; 2GTS A; 2G38 A; 3RT3 C; 4YY3 B; 3FKS G; 3ETG A; 3DC5 A; 4YHH O; 1GAX A; 1WJZ A; 2RQ6 A; 3W7X A; 3E22 B; 1WA8 A; 5CBF A; 1MZF A; 1ZUQ A; 1N33 B; 3JCZ A; 2UXC B; 2AHZ A; 2KG7 A; 4IYH A; 3RN4 A; 4FFB A; 1KUQ A; 1UJW B; 1LUW A; 3E8H A; 4JTD B; 2OIG A; 3VQV A; 4DR4 B; 4DV3 B; 4LF7 O; 4HBN A; 2ZXW B; 3AG2 C; 3GWK C; 3OTF A; 4DYL A; 1DGS A; 1JR9 A; 2HEP A; 4I4T B; 4TT3 G; 2BSK B; 1IXB A; 1SQP H; 3ZMS A; 4ZHQ A; 2UUB B; 2EIM C; 1IBM B; 3AK1 A; 4RQF A; 5B3S C; 3JSL A; 4X1K B; 3MHH C; 4K3A A; 1OCR C; 5BZB A; 4BW5 A; 1F7Y A; 4DK1 A; 5AG2 A; 3LUT B; 3ASN B; 4E2L A; 5LOV A; 2ODM A; 1A32 A; 1KQS U; 1M4U A; 2WLL A; 3K06 A; 1SF9 A; 4JAA A; 3SYC A; 3BEH A; 3U0Z A; 4DV1 O; 3S3W A; 1MMM A; 2JGD B; 2VRZ A; 3CJH A; 5KMG B; 2UXD B; 5D5P A; 1K7D A; 1S76 D; 1GN6 A; 4DR5 O; 4O4L A; 4ZIB A; 3AG4 C; 3K57 A; 3K03 A; 4NTX A; 1SER A; 3ZHR A; 2ZR2 A; 3OGC C; 1Q3E A; 1G1X B; 3JYC A; 5B1A C; 2CK3 G; 2JEU A; 1TUE B; 3K79 A; 3WB1 A; 1ROP A; 1I08 A; 3X2Q B; 3UO3 A; 3ABK C; 3SPH A; 1NU1 H; 1W0K G; 2PZS A; 4FLT A; 4TQF A; 1Y76 A; 1F51 A; 2HP8 A; 1EM1 A; 1YSC A; 2VQF O; 3HKD A; 4DR3 O; 1BL8 A; 1MSW D; 2QKC A; 1AR1 B; 2GSM B; 4DXW A; 5GTH Z; 3CRQ A; 4DK0 A; 4UFZ A; 1TVK A; 2Z3Y A; 4DW1 A; 1NJI W; 3JAR A; 2VQE O; 3SYA A; 3BRC A; 5J2T A; 2EIJ B; 4DR2 O; 3STL C; 2IJH A; 4YXW G; 2IM9 A; 1K5Q A; 3A2F A; 3ZX6 A; 1Q90 D; 1CPY A; 4GUN A; 3CCE V; 1S77 D; 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1IBK O; 2PGG A; 4YJ2 B; 1QLN A; 4PA9 A; 2AGA A; 3UCS C; 4X20 A; 3ZJZ A; 2BE3 A; 4GKJ O; 3B40 A; 4B3R B; 4TOI A; 4NKG B; 2O57 A; 4XDL A; 4CC6 A; 3CWB H; 3L75 H; 4YY3 O; 2OYQ A; 4PV1 B; 4GX2 A; 4RQE A; 3ZRV A; 3BCC H; 3IC9 A; 3ZHS A; 5LXT B; 1ARO P; 4IHJ B; 3G80 A; 4JI7 O; 3K3W A; 4XBF A; 1JQ0 A; 3X2Q C; 4JI4 O; 1X4T A; 1I5Y A; 1VQ7 V; 5EIB D; 4O2B A; 1N33 O; 1OCO B; 4FLV A; 1VF7 A; 1K4C C; 2PUS A; 1QU7 A; 3WG7 B; 3OTO B; 1P7G A; 2UXX A; 5CMU A; 4MTX A; 3B8N A; 1KMI Z; 1DF5 A; 4DR4 O; 1Y66 A; 3OW2 U; 4JF3 A; 4OXS A; 4JYY A; 4LNU B; 1Z5W A; 4X64 B; 1N32 O; 3AK2 A; 1SQQ H; 3HPL C; 1VQ8 V; 5KA6 A; 1MOF A; 1NKD A; 3E8F A; 1IBM O; 5E1A C; 2F43 G; 2E5L B; 4X62 B; 1K97 A; 4JI1 O; 4I55 A; 5B5E Z; 5IYZ B; 2YIB D; 2PYJ A; 3JSN A; 1WB7 A; 3SYO A; 5LMU O; 5IY5 C; 1FFT B; 2HHH O; 1QR9 A; 2YXH A; 4J41 A; 4D7T A; 5K1X A; 2BOC C; 3HKB A; 5KHH A; 2DJV A; 4JYC A; 2HFE C; 1OV9 A; 4WFF A; 1WPB A; 2Q0O C; 1VQ6 V; 1XUQ A; 2DOS A; 2WAM A; 1QQC A; 5GON A; 4OPA A; 5JQG B; 1PNL A; 1NR1 A; 2LJ2 A; 3CMA V; 3RYF A; 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