The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
35
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sequence length |
105
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structure length |
105
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Chain Sequence |
b'GPLGSEEIKNIDAKIRKWSSGKSGNIRSLLSTLQYILWSGSGWKPVPLMDMIEGNAVRKSYQRALLILHPDKLQQKGASANQKYMAEKVFELLQEAWDHFNTLGP'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystallographic and functional analyses of J-domain of JAC1 essential for chloroplast photorelocation movement in Arabidopsis thaliana
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Putative uncharacterized protein F9E10.5
|
| source organism |
Arabidopsis thaliana
|
| molecule tags |
Plant protein
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| total genus |
35
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| structure length |
105
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| sequence length |
105
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-03-24 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2Y4U A; 4J80 A; 2YS8 A; 2CTR A; 1NZ6 A; 2M6Y A; 2N04 A; 2N05 A; 4J7Z A; 1FAF A; 2GUZ A; 2CTP A; 2GUZ B; 2KQX A; 1BQ0 A; 3UO2 A; 3APQ A; 1IUR A; 2QWP B; 3APO A; 2QWN B; 2CTQ A; 2QWR B; 2EJ7 A; 3AG7 A; 2QWO B; 3UCS C; 2LO1 A; 1N4C A; 2L6L A; 2YUA A; 3BVO A; 2QSA A; 2Y4T A; 1WJZ A; 1GH6 A; 2DMX A; 2OCH A; 3UO3 A; 1XBL A; 2DN9 A; 2CTW A; 2QWQ B; 1BQZ A; 4IT5 A; 2CUG A; 2LGW A; 4RWU A; 2PF4 E; 1FPO A; 1HDJ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3MHH C; 3T2M A; 5CN0 A; 1WN7 A; 5LOV A; 4QE9 A; 1MNG A; 1HP8 A; 1HR0 B; 5LP6 A; 2X7R B; 2EIK C; 3AG3 C; 1XMO B; 2A7W A; 1OCC C; 3VOU A; 4TV9 B; 2QA4 V; 4DXW A; 3ETQ A; 1GN2 A; 2FB5 A; 2DYR B; 3WG7 C; 4EB6 A; 3K9S A; 1L1F A; 4X1I B; 1S3J A; 1THZ A; 2QM4 A; 4JI8 O; 4JAA A; 3TXQ A; 4DV1 B; 1N0N A; 2DOS A; 5KUK A; 1NVP B; 1RSO A; 4ZIB A; 3KKY A; 2VQE O; 1OCO C; 4TV9 A; 4FM1 A; 3ABM B; 1WP8 A; 2HVJ C; 3G6B A; 1N36 O; 2BOC C; 1XMQ B; 3KCY A; 2Y69 B; 4BR6 A; 3LNM B; 1R3I C; 2CH7 B; 4WFE A; 1S0V A; 2PGG A; 5LGU A; 5LP6 C; 2JEX A; 1Y6X A; 4X20 B; 1JR9 A; 2W0F C; 3K03 A; 1K34 A; 3K08 A; 1Y4M A; 3ZMU A; 3W7W A; 2KB1 A; 5CA3 A; 3T1C A; 1YHQ V; 4JF3 A; 1KB9 F; 3K0G A; 3L70 H; 2CH7 A; 1ZL8 A; 1H8H G; 4XDJ A; 3SR2 C; 4DYL A; 4LF5 O; 2QKA A; 1OCZ B; 5LL6 Y; 3OEE G; 2OCH A; 5JH7 B; 1VQK V; 2A06 H; 1OZ0 A; 4GX0 A; 2DYR C; 4MVO A; 1MZE A; 4DV4 O; 3OTF A; 2E76 B; 1KYO F; 4UV9 A; 3D3I A; 1MA1 A; 4O4L B; 3T4Z A; 1ORQ C; 1VQ6 V; 2Q7G A; 4NTW A; 5AG2 A; 2B5U A; 1EZJ A; 5J9P C; 5DEC A; 4I9W A; 2CGO A; 5LBQ A; 1O9G A; 2R70 A; 3AG1 B; 3S3X A; 2LFR A; 4DV3 B; 4OGQ B; 1SS3 A; 2Y69 C; 3RGB A; 1SA0 A; 3ZHR A; 4W4L A; 3WU2 Z; 1M90 W; 4QE7 A; 3H1J H; 4UCR A; 2A9H A; 4P9P A; 4JI4 B; 4HBN A; 5J2U A; 4IHJ A; 4ZOL B; 4QPK A; 4D7T A; 1SKV A; 4X66 O; 2OT5 A; 3QF7 A; 5LMU O; 1XNR B; 1M1K W; 4NXM B; 1DTO A; 4MTX A; 2GTA A; 1CEZ A; 3ZN1 A; 1YVW A; 2AW9 A; 1D5N A; 2V4D A; 3RYF B; 4PA7 A; 3DC5 A; 1N34 B; 3T1Y O; 1FXH A; 1K92 A; 3CCV V; 3E89 A; 2EIN C; 5B3S C; 2DQ0 A; 2CTR A; 4CH4 A; 1XRE A; 2YEV B; 1N33 O; 4BIO A; 5B1B B; 1D5A A; 1Q81 W; 4CH3 A; 1K5Q A; 4LF9 B; 3HKC B; 2QM8 A; 1HNX B; 1H2N A; 4LWS B; 3B4S A; 4JTD B; 2BSK A; 4FZ1 A; 1VP7 A; 4L87 A; 4J10 A; 3S3W A; 4KHP O; 1GM8 A; 3P3N A; 4DK0 A; 1XI1 A; 4G27 B; 3AG1 C; 4O2A B; 2R72 A; 2YEV A; 3WB0 A; 3LDD A; 3LSU A; 5EBL C; 3A0R A; 4ABM A; 1XNQ B; 4DR5 O; 4LFA B; 4F6E A; 5DN6 G; 3HKC A; 2ILM A; 3AK1 A; 4YHH O; 4Q20 A; 4I0X B; 3UO3 A; 2JRI A; 4LWS A; 4UCS A; 3JAS B; 1TUB B; 1NZ6 A; 2PUS A; 1FJG O; 2PI4 A; 4O2A A; 4DR6 O; 4BW5 A; 2GV9 A; 5B1A B; 4FM0 A; 2UXB B; 4H33 A; 4ZBM A; 2LP7 A; 1ZLZ A; 3BA8 A; 1GAX A; 2RJZ A; 5KLV H; 2P22 C; 4J7J A; 2JS3 A; 2YIB A; 5B1N A; 5IE9 A; 1D2D A; 1QNM A; 3JAS A; 5BY1 A; 1E79 G; 3OMA B; 1FPO A; 2QEX V; 2N04 A; 2AXT Z; 3N2G B; 5KHG A; 1JOY A; 4NXN O; 5B66 Z; 3K5O A; 1HNW B; 1E1Q G; 3WFV A; 5BR8 O; 5FL7 G; 3IC9 A; 1Y67 A; 1AR5 A; 3CEI A; 3B8N A; 1JX9 A; 1NJI W; 1URF A; 2VRZ A; 1J5E O; 4IYI A; 3JD3 A; 4O4H B; 5LXT A; 5DED A; 3AG2 B; 2O57 A; 3N2G A; 2GDS A; 4X62 B; 3ZHT A; 3CC4 V; 3OW2 U; 2V7Q G; 4U3F H; 2H3O A; 2JJ2 G; 2DW4 A; 4I7Z B; 4JZG A; 3K57 A; 2QWQ B; 4JV5 B; 3QTC A; 2WLL A; 4CS3 A; 5CMU A; 2RMK B; 3TET A; 3RYI A; 4O4H A; 3RN4 A; 1IBM O; 4FVM A; 5LGT A; 3ZBH A; 4G28 B; 2WPD G; 4PDR A; 5IY5 B; 2HR3 A; 1XUQ A; 5B1A C; 3MD0 A; 4YY3 O; 2IJJ A; 4K8X A; 1JJ2 U; 2EBO A; 2N74 A; 3J80 N; 1RFY A; 4LH6 A; 1VQ5 V; 4JI0 B; 2IU3 A; 3B8M A; 3QVN A; 3JD4 A; 4PHZ A; 5HFL A; 3HKE B; 3JD1 A; 4Z2W A; 2Z5U A; 1SES A; 1RM1 B; 2E75 B; 1YZB A; 4PJ0 Z; 3K5L A; 4K0K B; 1WPB A; 2QWO B; 1BE3 H; 5K1P A; 3W7U A; 5A9G A; 3O65 A; 1E1R G; 4F6R B; 2UUB B; 3U11 A; 4CZZ A; 4UFZ A; 4TWK A; 4I55 A; 1TGO A; 2Y0P A; 4H0L B; 4GZR B; 2GUZ A; 3AG2 C; 1XDC A; 1PPJ H; 5IWA O; 3CC7 V; 4EFB A; 4AIL C; 1BL8 A; 3AG7 A; 4PI0 A; 1NTM H; 4LF7 B; 1TUE B; 4JYY A; 3STL C; 4F6R A; 1VQ8 V; 5L3E A; 1XBL A; 3K04 A; 1G6U A; 2A0L A; 3B2E E; 3X2Q C; 1BQZ A; 3VQY A; 4O4I A; 3K58 A; 4PDV A; 3ZMV A; 1YDX A; 1GN6 A; 1FFX B; 3UO2 A; 1NVP D; 1V54 B; 3C3S A; 3LSQ A; 2QWN B; 4B7K A; 2RDC A; 5EZY A; 3C3T A; 4H37 A; 1OHH G; 3ZRS A; 1WB7 A; 4JPR A; 5JWP A; 3FAV B; 1W0J G; 2PI5 A; 3JD2 A; 2ZCE A; 2F4V B; 1VF6 C; 2QKS A; 1AJN A; 1RM1 C; 1FFX A; 3FD9 A; 3I5D A; 1WNS A; 2R9R B; 2IM9 A; 4YJ3 A; 1W59 A; 2LO1 A; 4U7N A; 5H9C A; 1M57 B; 4N23 A; 2DMX A; 2RNB A; 5H2F Z; 5KHK A; 4JYA O; 5C8Y B; 3K59 A; 3CRQ A; 4J9Y B; 2BTQ B; 2XHB A; 3CRA A; 3LSS A; 1SQF A; 4JI3 B; 3ASN B; 2YDE A; 4WFH A; 3RFR A; 1S72 V; 1U96 A; 3E35 A; 1Q5O A; 3IAY A; 4NVP A; 1KC8 W; 4P2Z A; 3RYH A; 5C8Y A; 2LGW A; 3U10 A; 1HR0 O; 3CPW U; 2BTQ A; 2G38 A; 3CRM A; 5EIB C; 1XMO O; 1V54 C; 1PNK A; 5GTI Z; 4J7K A; 1Q86 W; 1KD1 W; 1LUV A; 1V9P A; 3G6E V; 2EIK B; 2Y0I A; 3AG3 B; 4GT1 A; 4DV1 O; 1OCC B; 1JQ0 A; 3WG7 B; 4IYH A; 1JMK C; 4MVZ A; 1XL4 A; 3GWK C; 4A5U B; 4X8A A; 1CP9 A; 1I0H A; 1R3L C; 2L35 A; 3GVM A; 2IJI A; 3W7T A; 2VQF O; 1V55 C; 2EIL C; 4MT8 A; 1M57 C; 1IZ3 A; 2QE7 G; 1XMQ O; 1IDS A; 1OCO B; 1ZAU A; 2P90 A; 2WLL B; 5JCO A; 3FYI B; 4NR1 A; 1F23 A; 2XAF A; 4RQF A; 3ASN C; 3CX5 F; 5LOV B; 4QNH B; 1CXZ B; 4I5S A; 4NYK A; 1AP5 A; 2L6L A; 1DK1 A; 5A2Q N; 5LHG A; 2X6C A; 5GW7 A; 4JTA B; 4EB6 B; 3ZMT A; 1KEC A; 4UCT A; 2JVD A; 2YSU B; 2HVK C; 3Q4H A; 4P30 A; 4B3M B; 1NH2 B; 5FPO A; 1RSO B; 2JIZ G; 2ZNJ A; 2WLJ A; 5JJE B; 3RW0 A; 2IH1 C; 1MMM A; 2Q0A A; 3K5M A; 5JCO C; 2ZR3 A; 1K9M W; 1QVF U; 2P4K A; 1YSC A; 4Q6G A; 4JI7 O; 3OTO B; 3CCE V; 3B77 A; 4FFB B; 2YIB D; 3JAW A; 2KKW A; 2B9Z A; 1G8M A; 2B1I A; 2MW2 B; 4DV3 O; 3R66 A; 3BPZ A; 4JI5 B; 4LFC B; 3A0H Z; 1SER A; 1IX9 A; 3CXH F; 4KXR A; 4I4T A; 4JI4 O; 4LF8 O; 2JEU A; 2DWE C; 2GHY A; 1ZTE A; 1ZL8 B; 3O9O A; 4MW8 A; 4FFB A; 2YUA A; 3BVO A; 3SPI A; 2X0L A; 1XNR O; 4NXM O; 4GUN A; 4D6T H; 3ETG A; 1HNZ B; 3CCU V; 2D2C B; 5D5Q A; 3SYO A; 1UPG A; 4R7C A; 1N34 O; 1NBM G; 3ZIA G; 1SZX A; 4ZI7 B; 1Q3E A; 2GSM B; 2UU9 B; 3M7M X; 2OYQ A; 1SC5 B; 4KUM A; 1WJZ A; 1AIL A; 1COW G; 1Q6I A; 1YEW A; 2CE4 A; 2XAJ A; 4X64 B; 3ABU A; 3TGU H; 5DM6 V; 2UUA B; 3L71 H; 4JI6 O; 4FIP C; 4MSW C; 1H38 A; 3SYQ A; 2R9I A; 1BS3 A; 2EIN B; 3RYC B; 5B3S B; 4LF9 O; 2HHH B; 1OV9 A; 3ICX A; 1HNX O; 1EN4 A; 1GM9 A; 4GKK B; 3N27 A; 1VQP V; 1AI7 A; 1K97 A; 3CHX A; 4ZI7 A; 1FXV A; 2Q9L A; 3UKM A; 1SA0 B; 3UQ8 A; 3JSL A; 1JVM A; 1XEQ A; 1AR1 B; 2GTS A; 4UV8 A; 4X1Y B; 5J2U B; 4IHJ B; 1XNQ O; 3RYC A; 1AB3 A; 4H44 B; 4DV5 B; 1QLE C; 3ABL B; 4OX9 B; 3AK3 A; 4QIW F; 5KMG A; 4G2K A; 5CBH A; 2XAQ A; 3ASO C; 3EXA A; 2Q5Z A; 1O9H A; 1PV0 A; 4CS2 A; 1YXB A; 1TVK A; 1SET A; 1BT8 A; 3BAA A; 2ZNI A; 1FD9 A; 4X1Y A; 3I56 V; 3QO5 A; 2WSS G; 3MAQ A; 4JGS A; 1H2K A; 2UXB O; 1G1X B; 2ZE5 A; 5LGN A; 4BIU A; 3ETE A; 2VS0 A; 2X6A A; 4D7S A; 4B3T B; 4ICG A; 5KA6 A; 1GM7 A; 5BXZ A; 5L3B A; 1NR7 A; 2EJR A; 4PDM A; 2F1M A; 4JYC A; 1N4C A; 3HKB A; 2IBZ H; 4NKG B; 1KU9 A; 1N36 B; 1WPX A; 1NKD A; 1B6Q A; 5LA6 B; 1QR9 A; 1HNW O; 2BSK B; 4DR1 B; 2A79 B; 3P30 A; 5LYJ A; 3LUT B; 3RVZ A; 4UVA A; 1QQC A; 4J42 A; 3SPG A; 4AI8 A; 1BMF G; 4DV7 O; 1W2B U; 2Y4T A; 4HAM A; 3BCC H; 4J41 A; 5LA6 A; 3J81 N; 3OE7 G; 2AHY A; 2Q7E A; 5JQG B; 5BMV B; 5GTH Z; 2F93 B; 5EIB D; 4DRX B; 4LF5 B; 5B5E Z; 2ITD C; 3CB2 A; 3ABL C; 2B1G A; 2WAM A; 1H2M A; 4K35 A; 4DR3 B; 1SQV H; 2Q68 A; 4IL6 Z; 1GRJ A; 2PY5 A; 1I08 A; 2IJH A; 2FYU H; 4PA9 A; 1NTK H; 1Y76 B; 3VQX A; 1KKC A; 5JQG A; 5BMV A; 2CUG A; 4DRX A; 1GKF A; 2M6Y A; 4JI1 B; 1IVS A; 4RUF A; 5H6R A; 4GX1 A; 4TOI A; 1PP9 H; 4JI0 O; 5E79 Z; 1SQX H; 3CRC A; 4DR7 O; 4QJF B; 1OCR C; 1M9N A; 3JD0 A; 2WLM A; 5EBM C; 3CRR A; 4C7U A; 2GBO A; 1R6K A; 5CBF A; 1Y76 A; 3ZMZ A; 4LC1 A; 1SQB H; 4ZHQ B; 3K5N A; 1FS0 G; 2PYL A; 3U0Z A; 5LXT B; 3GB7 C; 1P49 A; 3SPH A; 1XHZ A; 3IC7 A; 3BA9 A; 4H13 B; 2Q6A A; 3BEH A; 3BFR A; 4KL1 A; 4YJ2 B; 1PL0 A; 4X66 B; 3NR7 A; 4EFE A; 1YJN V; 4DR4 B; 2K9P A; 1N8R W; 1IBK B; 2CGN A; 1ZSP A; 1Z2G A; 1G4Y B; 4JTC B; 3IJ4 A; 4FMT A; 3QG5 A; 3E8H A; 2WLI B; 4ZHQ A; 4LF7 O; 3CD6 V; 4X65 B; 2HLD G; 3FB5 C; 3RYI B; 2P4V A; 3IGA C; 3T1Y B; 1JFF A; 4BIZ A; 3CCM V; 1VQM V; 4YJ2 A; 4DV2 B; 4AQY B; 4DUY B; 1I5X A; 1AI5 A; 4LF4 B; 4NB5 A; 1N33 B; 1GN4 A; 1US6 A; 3WB1 A; 2CTW A; 4QPJ A; 3VQW A; 3QNE A; 3X2Q B; 1IXM A; 1WA8 B; 4FLW A; 2WLI A; 3CJH B; 1HDJ A; 1SQG A; 2CK3 G; 1BHA A; 4OPA A; 3APQ A; 5LHI A; 3CCR V; 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