The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
30
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sequence length |
82
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structure length |
82
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Chain Sequence |
VPATRILLLVLAVIIYGTAGFHFIEGESWTVSLYWTFVTIAAVGYGDYSPHTPLGMYFTCTLIVLGIGTFAVAVERLLEFLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Calcium-gated potassium channel mthK
|
| publication title |
Tuning the ion selectivity of tetrameric cation channels by changing the number of ion binding sites.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Methanothermobacter thermautotrophicus
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| molecule tags |
Membrane protein
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| total genus |
30
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| structure length |
82
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| sequence length |
82
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-09-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Helix Hairpins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3AG3 C; 3F7Y C; 3ABK C; 3ASO C; 4H33 A; 2Q67 A; 2EIL C; 1V55 C; 2X6C A; 3E8G A; 2A79 B; 4HYO A; 4XDL A; 3WG7 C; 3LUT B; 3X2Q C; 3LDC A; 4RUF A; 2Q68 A; 4MVZ A; 4QE9 A; 1QLE C; 4KFM A; 4X89 A; 2DWD C; 2WLM A; 4LBE C; 4JTA B; 4PA3 A; 4WFG A; 5EBW C; 3STZ C; 4F4L A; 3T2M A; 3SPG A; 3TET A; 4ZBM A; 2NLJ C; 2WLH A; 2WLN A; 3OR6 C; 3K04 A; 4GX1 A; 4MTO A; 5EC1 C; 3SPC A; 4MS2 A; 2DWE C; 4RAI A; 3SPH A; 1K4C C; 4G27 B; 2YEV A; 4OXS A; 3FB7 C; 3STL C; 3KG2 A; 1K4D C; 2Y69 C; 2Q6A A; 4G28 B; 2EIK C; 2WLI B; 3FB6 C; 4LP8 A; 2QKS A; 2R9R B; 4MVO A; 1G4Y B; 2HG5 C; 3OGC C; 2QTO A; 3AG4 C; 4JTC B; 4PDL A; 3OR7 C; 3SYA A; 3E8F A; 3K0G A; 5EK0 A; 4MVQ A; 2BOB C; 3LDD A; 4H37 A; 1OCO C; 2DYR C; 2HJF C; 1P7B A; 5B1B C; 1KKD A; 3ZRS A; 2DYS C; 4MVR A; 3ABL C; 4PDV A; 2K1E A; 4PA6 A; 2HVJ C; 4X88 A; 3K06 A; 3FB5 C; 4J9Y B; 1XL6 A; 2WLL B; 3F7V C; 5CBG A; 1J95 A; 3ABM C; 1R3L C; 5CBH A; 4WFE A; 3E8H A; 2IH3 C; 3AG2 C; 4CBC A; 1S5H C; 4JTD B; 4MW3 A; 4PDM A; 2HFE C; 4DXW A; 5B3S C; 5BZB A; 3SYP A; 3K08 A; 3SYO A; 4MW8 A; 2WLI A; 2P7T C; 4I9W A; 3JYC A; 2WLJ A; 2EIM C; 3LDE A; 3AG1 C; 4MTF A; 2A0L A; 4RO2 A; 3RW0 A; 1LNQ A; 3VOU A; 3IFX A; 3EFF K; 3SYQ A; 3K0D A; 1XL4 A; 3SPJ A; 4QNH B; 1R3J C; 4MTG A; 4P30 A; 1OCZ C; 3IGA C; 4R7C A; 5EC2 C; 1BL8 A; 1R3K C; 2H8P C; 3RBZ A; 3K03 A; 4UUJ C; 5EBL C; 3BEH A; 4MVM A; 3E89 A; 2ATK C; 3FB8 C; 2ZD9 A; 3E8B A; 4PA9 A; 4QE7 A; 5EBM C; 3SPI A; 4PA4 A; 1OCC C; 3PJS K; 4PA7 A; 4GX2 A; 4GX0 A; 4PDR A; 2WLL A; 3UM7 A; 5IY5 C; 3OUF A; 2WLK A; 2AHZ A; 3E86 A; 4RUE A; 4WFF A; 4LCU C; 1ORQ C; 2EIJ C; 4J9Z B; 5B1A C; 3SYC A; 3SJQ C; 3OUS A; 3T1C A; 4BW5 A; 4EKW A; 3LNM B; 4R6Z A; 4R50 A; 3T4Z A; 1M56 C; 5CBF A; 4P2Z A; 2A9H A; 2OCC C; 2X6B A; 2EIN C; 1OCR C; 4R8C A; 2HVK C; 4P9P A; 5KUM A; 3TCU A; 4TWK A; 2BOC C; 2JK5 C; 4WFH A; 3ZJZ A; 3ASN C; 4HZ3 A; 1JVM A; 2ITD C; 2IH1 C; 2KB1 A; 3R65 A; 1R3I C; 4MSW C; 5KUK A; 1M57 C; 3F5W C; 4XDJ A; 4X8A A; 4P9O A; 4XDK A; 4MVU A; 5J9P C; 3HPL C; 2ITC C; 3GB7 C; 2W0F C; 2Q69 A; 2X6A A; 4MVS A; 1V54 C; 3RVZ A; 3UKM A; 3RVY A; 2AHY A; 2ZXW C; 3E83 A; 1ZWI C; 3T4D A; 5E1A C; 4GX5 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1N33 O; 2EIL B; 1XMO O; 3C3T A; 5KX5 B; 1M9N A; 2X6C A; 3CCU V; 1ENV A; 3T1H B; 4X66 B; 2F23 A; 1YIT V; 2WLM A; 3FX7 A; 3STZ C; 1GO3 F; 4AI8 A; 1KQS U; 3ETD A; 4DV1 O; 1YDX A; 2PGG A; 2WLN A; 3OR6 C; 3SPC A; 5EC1 C; 2DWE C; 1VEW A; 2YEV A; 2XTA A; 4WF9 V; 2P90 A; 2F4V O; 1HNW O; 1YF2 A; 2GUZ B; 3AG1 B; 2VQE O; 2W0X A; 4IYI A; 2UXB B; 2QE7 G; 2XAF A; 4NXM B; 3OMA B; 4PD4 F; 1KKD A; 5CA0 B; 3J80 N; 2P22 C; 5CB4 A; 1IBM B; 2OCC B; 4DR6 B; 5C8Y B; 2GUZ A; 4TUY B; 4OX9 O; 1NR1 A; 3ASN B; 5A2Q N; 1AB3 A; 3ZMS A; 1SC5 B; 1VF5 B; 4X65 O; 3CRA A; 5H5N A; 4Z1M G; 5EBM C; 3E8B A; 4UB8 Z; 3IJ4 A; 3SPI A; 3PJS K; 5CA0 A; 5IY5 C; 3H1J H; 4X1K B; 3K5O A; 1VQP V; 2WWW A; 4RWU A; 2LGQ A; 5C8Y A; 1THZ A; 4R6Z A; 5CBF A; 4IGG A; 4F6E A; 5L3F A; 5KA6 A; 4P9P A; 3TGU H; 2F43 G; 2QWR B; 4DV0 B; 2ZIO A; 1AP6 A; 3RYC B; 4TQD A; 2IH1 C; 4JV5 O; 4C7U A; 4X8A A; 4XDK A; 1PL4 A; 2UXN A; 2BTO A; 1H2K A; 5J9P C; 2L35 A; 5C93 A; 3QTC A; 1XQ8 A; 3JAL B; 2QKA A; 4X1K A; 2OT5 A; 4TOI A; 2QM7 A; 3LSS A; 4DR2 O; 2UXX A; 3B40 A; 4NXN B; 3L74 H; 1V55 C; 1XHZ A; 4DV7 B; 2HLD G; 3RYC A; 3CWB H; 2YI9 A; 4AQY O; 1FXK B; 3T2M A; 4JI2 O; 4FM0 A; 3ZMV A; 5L3C A; 2GSM B; 2NLJ C; 1I7F A; 2PF4 E; 5LMU B; 3JAL A; 1OJH A; 3MHH C; 2XND G; 3DC5 A; 4UCU A; 2YIC A; 1H8E G; 2Q7E A; 4L8J A; 4LP8 A; 2IJI A; 4MVO A; 4YJ2 A; 5LHH A; 1S5J A; 3CCM V; 3ZMU A; 3JD2 A; 3LDD A; 1EN4 A; 4PDV A; 2HVJ C; 4DUY B; 5IJ0 B; 4LFB O; 3SJA C; 2WLL B; 4WFE A; 3CJH B; 1GN4 A; 3E2E A; 2XOK G; 3QVN A; 2QR4 A; 4D7T A; 2QA4 V; 3AG1 C; 1EN6 A; 1PL0 A; 4PJ0 Z; 1JMK C; 1XL4 A; 4RQE A; 3JAR B; 2CUG A; 3K5M A; 5LMN O; 3JCU Z; 1H2S B; 2FTK A; 2IJK A; 2EJR A; 5IJ0 A; 2BE3 A; 2WLL A; 4JI4 B; 2QWN B; 1KYO F; 3K59 A; 1IZ3 A; 4R50 A; 1FFX B; 3ZRV A; 2OCC C; 2X6B A; 3FD9 A; 5IDJ A; 1RSO B; 2YDE A; 1URF A; 3D3I A; 2ZIN A; 3ASN C; 3R65 A; 4FM1 A; 4KUM A; 5L3B A; 1K5S A; 4YHH B; 1Y4M A; 3CCQ V; 1Y6X A; 1YXB A; 4JYY A; 1W0K G; 1NT2 B; 1R73 A; 2Q69 A; 5EIB D; 1YTF D; 5GON A; 1DK1 A; 1FFX A; 5LHI A; 3ABK B; 2P67 A; 2QWO B; 1RSO A; 2PTM A; 3O65 A; 2QWP B; 4I7Z B; 4JYA O; 4FJC C; 1XIL A; 4UCO A; 3SPG A; 5DED A; 1MZE A; 5BR8 B; 3SDL A; 4JI6 O; 1QLN A; 5H9C A; 2Q7G A; 5KHI A; 3OTF A; 4MVQ A; 4LFC O; 3CCS V; 4WFA V; 1W59 A; 1YJW V; 1KU9 A; 4EB6 B; 5IYC O; 1I94 B; 2YIA A; 5CMU A; 3E22 B; 5B66 Z; 2E76 B; 4KXR A; 3TXS A; 2Z3Y A; 2YXY A; 4UCT A; 3L72 H; 2UUC B; 3Q4H A; 3K5L A; 1VQ4 V; 1JCH A; 1YIJ V; 4JAU A; 2EIM C; 3ZX6 A; 2OTL V; 4B3R O; 2EZO A; 2IW5 A; 1SQG A; 3ZHV A; 3ICX A; 4JAS A; 3E22 A; 2AXT Z; 2P6J A; 5B1A C; 3M7M X; 4BW5 A; 2A9H A; 2UXD O; 2XAJ A; 1Y76 B; 5KUM A; 2H94 A; 3CD6 V; 1M57 B; 4DK0 A; 3ZHR A; 4B3T B; 1N36 O; 2HKO A; 3ETQ A; 2M6Y A; 5HFL A; 3T4D A; 1VQL V; 2O57 A; 4NKG B; 5JVD B; 1Y76 A; 1TUB A; 5K1X A; 4XDL A; 4NVP A; 4QE9 A; 5FLX N; 1PM9 A; 1OZ0 A; 2JJ1 G; 2GBO A; 2CTQ A; 5A9G A; 4Q6G A; 4DK1 A; 3N2K B; 1XDC A; 3FYE B; 1G8M A; 5J2T B; 4FLV A; 3NR7 A; 1NS1 A; 1XBL A; 5JVD A; 4CH3 A; 2XAH A; 4LNU B; 1NTK H; 5KAF Z; 4JGS A; 2ZM6 B; 4BWA A; 4GCZ A; 4JI1 B; 4X88 A; 4QPK A; 2UXC O; 4B3M O; 3BPZ A; 4YIP A; 3CCR V; 4JI8 O; 4O4H B; 1S5H C; 1MG1 A; 2WPD G; 1OCR B; 4OGQ B; 5BZB A; 3K3W A; 1WNS A; 5KMG A; 4O4L B; 3OT7 A; 1BMF G; 3CXH F; 1SA0 B; 4LNU A; 3A8T A; 4UVA A; 2AW9 A; 3CS5 A; 3IAY A; 3BFR A; 4QE7 A; 1XHX A; 1QR8 A; 4GX0 A; 3OTO B; 4WFF A; 1Y66 A; 2XUM A; 3OUS A; 4O4H A; 1RPO A; 4J42 A; 3RYH B; 1FJG B; 3U11 A; 3T1Y O; 4DV6 O; 4O4L A; 2GTS A; 2JGU A; 1M4U A; 2WA4 A; 2X0L A; 2QGN A; 1SA0 A; 3ZJZ A; 5GW7 A; 2ZR2 A; 5L3E A; 2CTW A; 2UUB O; 4PEL A; 2CH7 B; 2Y4U A; 4B3S O; 4JI7 O; 3MHS C; 4CH6 A; 2R9I A; 5CN0 A; 4DRX B; 3AG4 B; 1KMI Z; 5CA1 B; 3RYH A; 2ZNI A; 2OYQ A; 2ZIM A; 5GTH Z; 1N8R W; 4Z2W A; 2KQX A; 1CXZ B; 1Q7Y W; 1Z5W A; 4DW0 A; 4X1Y B; 2CH7 A; 2DN9 A; 3I55 V; 4LF6 O; 4DV3 O; 3K04 A; 3SPH A; 1IX9 A; 4DRX A; 3FB7 C; 4O4I B; 4X1I B; 4G28 B; 5CA1 A; 3JD0 A; 1N33 B; 2QTO A; 4JTC B; 1XMO B; 1M1K W; 1GK9 A; 2LP7 A; 3CMA V; 4X1Y A; 1XUQ A; 3KCX A; 3ZHT A; 1R3L C; 3JSL A; 2XT9 A; 2F4V B; 2ARH A; 4X62 O; 3KCY A; 1BGY H; 5LGT A; 4MW3 A; 4O4I A; 4LF5 O; 1Q90 D; 1GAX A; 4X1I A; 1SQX H; 2GTA A; 1DF5 A; 2VQE B; 1DGS A; 1N32 O; 3S3X A; 1J5E B; 1ROP A; 1L0L H; 1PNK A; 4UCR A; 1SQQ H; 3CCV V; 4IYH A; 4UUJ C; 1NR7 A; 1H38 A; 4PA4 A; 1V54 B; 2GV9 A; 3HKC B; 4GX2 A; 1QLE B; 3K5N A; 3E86 A; 1E79 G; 2QEX V; 1ORQ C; 5IYZ B; 1NH2 B; 4OX9 B; 1GN6 A; 1OCR C; 2VWK A; 2BOC C; 1S5L Z; 3CC2 V; 2A06 H; 2H3O A; 1NZ6 A; 3N2G B; 2XAG A; 2ITD C; 4DUZ B; 1Q6U A; 3B09 A; 1DF4 A; 5EYP B; 4F6R A; 1AR4 A; 3HKC A; 1UFI A; 3LSU A; 4E2L A; 5IYZ A; 4FK5 C; 2LQT A; 2JDI G; 1Y74 A; 4GX5 A; 3UT5 B; 4YY3 O; 4LF8 O; 2G38 A; 3QG5 A; 3N2G A; 4JV5 B; 4JI5 O; 1QR9 A; 4RAI A; 1ARO P; 3ZMT A; 1K4D C; 4D7S A; 1JOY A; 2RJZ A; 4DR1 O; 1HP8 A; 2WLI B; 3AEI A; 4W4K A; 2HP8 A; 3AG4 C; 3UT5 A; 4PDL A; 4AHC A; 3SYA A; 4J80 A; 4ICG A; 5LHG A; 3E8F A; 4AQY B; 1RFY A; 1JJO A; 2DW4 A; 5JWP A; 2Y48 A; 3D8C A; 4JZG A; 1PNL A; 1BS3 A; 4LFA O; 4DR7 B; 4EFE A; 5CB4 B; 1H2L A; 2LJ2 A; 3BCC H; 5B3S C; 3SJC C; 3CB2 A; 4LH7 A; 2WLI A; 4I9W A; 1WP8 A; 4RO2 A; 3HKD B; 3BHP A; 3JD3 A; 1P7G A; 1IDS A; 2DJV A; 4R7C A; 1T5E A; 4IT5 A; 1AI5 A; 2VQF B; 4LFB B; 1BCC H; 4D6T H; 2WLK A; 1NU1 H; 1U97 A; 1BSM A; 4J9Z B; 3L75 H; 3S3W A; 4B08 A; 5IYD O; 1XNQ B; 3X2Q B; 3HKD A; 3H1L H; 3CRC A; 5LMN B; 5KUK A; 1R3I C; 1YJN V; 3MAQ A; 4UCV A; 1QVG U; 4DV2 O; 2ILM A; 1H2G A; 3GB7 C; 1FXV A; 3ABU A; 2EIK B; 1V54 C; 1FPO A; 1QLE C; 2R9A A; 4U7O A; 2ZE7 A; 4H33 A; 1K97 A; 2E75 B; 5ITZ A; 4LF7 O; 3LUT B; 3OMN B; 1YSC A; 4PA3 A; 2OIE A; 4F4L A; 3ABM B; 4DR5 O; 4FM2 A; 4OXS A; 2EZP A; 1NKD A; 3CSX A; 3UCS C; 4YJ2 B; 3DTU B; 1OCZ B; 4OPA A; 3P30 A; 1N34 O; 1GKF A; 2E74 B; 5IWA O; 1GH6 A; 4JYA B; 2K1E A; 3OE7 G; 1UPG A; 4O2A B; 3BVO A; 4GLX A; 2ETN A; 2YS8 A; 4JI3 O; 3L9D A; 4JI6 B; 3K08 A; 2EIM B; 5LYJ B; 1GM9 A; 3RW0 A; 1VF7 A; 3M8A A; 3IGA C; 4LFC B; 1U96 A; 2Q7H A; 1F7Y A; 4U3J A; 3BEH A; 2ATK C; 1EBO A; 2L6L A; 5B1A B; 3UM7 A; 4YJ3 A; 4O2A A; 5EZY B; 3G6B A; 1AR1 B; 3T1C A; 1VQO V; 2JEX A; 4EKW A; 1SES A; 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4CH5 A; 1XNR O; 4PDR A; 5IE9 A; 4JI8 B; 1XRE A; 2EIJ C; 4DV4 O; 2Q9L A; 3T4Z A; 3JD4 A; 4X9Q A; 5KHG A; 2CAZ C; 4R8C A; 3BA9 A; 3TCU A; 4TWK A; 1D5A A; 4IIJ A; 1W0J G; 1JQ0 A; 2Z5U A; 2UUA B; 2GHY A; 4LF9 O; 2B1G A; 5LGN A; 2PZS A; 4DUY O; 4DR4 O; 2NN4 A; 1KB9 F; 4IHJ B; 2W0F C; 1GMG A; 2X6A A; 1S77 D; 2Q5Z A; 2RMK B; 3RVY A; 1BHB A; 2LW7 A; 3STL C; 3T1Y B; 4TQF A; 4DV6 B; 1D5N A; 1TUB B; 5B1B B; 2UUB B; 3H1K H; 2HJD A; 4KFM A; 4JI7 B; 1XMQ O; 2WA3 A; 4UXN A; 4DV5 O; 3AG2 B; 1N4C A; 4IHJ A; 4TT3 G; 2N04 A; 2Q6A A; 4J11 A; 1H2M A; 1K33 A; 5CA3 A; 3APO A; 4H13 B; 1WAZ A; 3H9V A; 4X20 A; 1E1R G; 1SET A; 2BOB C; 2HHH O; 5H6R A; 4LF6 B; 4YHH O; 2PYJ A; 2CK3 G; 3F5T A; 4DV3 B; 4HNA B; 2R72 A; 1L1F A; 3K06 A; 1BHA A; 1M5I A; 3K79 A; 3SR2 C; 2ZR3 A; 2XHB A; 4DO2 A; 4UFZ A; 3QO7 A; 1ZAU A; 1RM1 C; 1CEZ A; 1NQT A; 2NNU A; 3RFR A; 5KMG B; 1VF6 A; 4MTF A; 3EFF K; 5F2V O; 1MMM A; 1DTO A; 3WU2 Z; 1H8H G; 5EC2 C; 2H8P C; 1CPY A; 2C2A A; 4HNA A; 2R70 A; 1OCC C; 4Q20 A; 1JR9 A; 3OD4 A; 3FAV A; 3JAS B; 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